Lyhyt yhteenveto Labqualityn bakteeriviljelykierroksilta 2014-2015 Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia
Bakteeriviljely 2014-2015 4 kierrosta/vuosi; 4 näytettä/kierros 2 pinta- ja 2 syvänäytettä/kierros 1 bakteeri, joille herkkyysmääritys/kierros Osallistujia Suomesta 20-22 laboratoriota Ulkomaisia osallistujia n. 40. Suomalaisten labrojen menestys on hyvä Ulkomaisten labrojen menestys on vaihteleva.
Bakteeriviljely 2014-2015 Parantamiskohteita Potilaan ja näytteen esitietoihin on syytä perehtyä paremmin ->viljelyn tarkempi suunnittelu. Riittävän pitkät inkubaatioajat, 2-> 7 vrk. Maljojen lukemisen osaamista ja selektiivisten maljojen käyttöä on syytä parantaa. Malttia ja huolellisuutta! Lajitunnistusmenetelmien kapasiteetti ja virhemahdollisuudet on tunnettava paremmin. Lukekaa palautteet tarkasti ja oppikaa niistä!
Esimerkki Bakteeriviljelykierroksen palautteen liitteestä. Miten vastaajien käyttämät lajitunnistusmenetelmät toimivat. Arvioikaa, miten labranne käyttämät menetelmät toimivat ja pitäkää havainnot mielessänne seuraavaa samanlaista tilannetta varten!!
Kliinisen perusbakteriologian nyky- ja tulevaisuuden näkymiä Markku Koskela, ylilääkäri, Nordlab Oulu, mikrobiologia
Menetelmävalinnat Nyt -> tulevaisuudessa Bakteerivärjäys ja bakteeriviljelyt Bakteeriantigeenitestit Bakteerispesifiset Nh-osoitukset Bakteerivärjäys ja bakteeriviljelyt Bakteeriantigeenitestit Bakteerispesifiset Nh-osoitukset Bakteerien vastaainetutkimukset Bakteerien vastaainetutkimukset täsmentyvät
Näytteestä monta eri tutkimusta ->laajat tutkimuspaneelit Yksittäiset bakteeri-, sieni-, virus- ja parasiittitutkimukset (Vi, Ag, NhO) Näytetyyppikohtaiset NhO-yhdistelmätutkimukset Veri(viljely)paneeli: >95% aih. Likvorpaneeli: keskushermostoinfektioita aih bakteerit, virukset ja sienet Ulostepaneeli: suolistoinf aih bakteerit,virukset ja parasiitit Nielunäytepaneeli: bakteerit ja virukset Imulima/ysköspaneeli: bakt virukset, sienet ja parasiitit
Bakteerien suora osoitus näytteestä Nyt Tulevaisuudessa Gram- ja Aovärjäys Gram- ja Aovärjäys Maldi-tofmenetelmät Bakteriantigeenitestit Bakteerien NhOtestit Bakteriantigeenitestit Bakteerien NhOtestit Maldi-tofmenetelmät
Tietyn ominaisuuden koodaavan bakteerin geenin osoitus suoraan näytteestä / bakteerista Vaarallisen virulenssimekanismin tunnistaminen C difficile: toksiinia tuottavan C difficilen osoitus ulosteesta -> C difficile-kannan geenianalyysi. S aureus: PLV- ym. virulenssigeenejä E coli: toksigeeniset kannat ulosteesta C diphtheriae: toksiinia tuottavan kannan os. Poikkeavan resistentit bakteerit meca-geeni ->MRSA vana, vanb-geenit ->VRE Kpc-geeni, yms. -> Gramneg bakt CPE-kannat Tulevaisuudessa mukana näytekohtaisissa NhO-paketeissa
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Nyt Keskussairaaloissa, yo-sairaaloissa ja isoissa yksityislaboratorioissa monipuolinen viljelytutkimusvalikoima, joku pikatesti ja Nho-tutkimus. Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Veriviljelyseulonta ->Posit jatkoviljely->herkkyysmääritykset paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa?? Lisänä veren?/veriviljelmän bakteerien ja sienten NhO-paketti. Likvorin bakteeriviljely ->Posit viljelmien jatkotukimukset paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa?? Lisäksi heti: pienlaitteella likvorin Nho-paketti ->tulos alle 1-2 tunnissa; päivystystutkimus: 7/24.
Esimerkki likvorin bakteeri-, virus- ja sienipatogeenien NhO-tutkimuksesta pienlaitteella Selkäydinnesteen NhO-tutkimuspaneeli pienlaitteella. Tutkimuksen kesto n. 1 tunti.
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Virtsanäytteen automaattiseulonta ->Seulontapositiivisten näytteiden kvant viljely ->lajitunnistus ja herkkyysmääritykset (paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa??) Nielunäytteen streptokokkiviljely ->Lajitunnistus. Tilalla: pienlaitteella nielunäytteen NhO-paketti (Str A, adenovirus, influenssa A ja B virukset, RSV, Mycoplasma pneumoniae, muita bakteereita ja viruksia). ->tulos alle 1-2 tunnissa; 7/24 päivystystutkimus ks:n päiv.labrassa vai päiv pkl:lla? / tk labrassa vai tk-päiv pkl:lla??/ lääkärin ja sh:n vo:lla?
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Emätineritteen B-streptokokkiviljely ->Lajitunnistus. Lisäksi: pienlaitteella B-streptokokin suora NhO-tunnistus ->tulos alle 1,5 tunnissa; 7/24 päivystystutkimus ks:n päiv.labrassa vai synnytysosastolla? Muita selkeästi kohdistettuja viljelytutkimuksia (Mm-HygVi, Fl-HiivaVi, yms.) ->Lajitunnistus suku jos tarpeen.
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Kudos-ja märkänäytteiden bakteeriviljelyt (Pu-BaktVi1 ja 2, Ex-BaktVi, Li-BaktVi; selektiiviset erikoisviljelyt) ->automatisoitu viljely- ja tutkimusrata oheistoimintoineen. Lisäksi: näytetyyppikohtaiset NhO-paketit (veri, likvori, hengitystienäyte, hygienianäyte, yms.) ->tulos alle 1-2 tunnissa Jatkuva näytteiden syöttöprosessi?
Esimerkki mikrobiologian automaatioradasta Kiestra lab automation
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Ulosteen bakteeri-, virus- ja parasiittitutkimukset Seulonta NhO-paketilla Ulosteen viljelytutkimukset vain tarvittaessa (bakt herkkyysmääritykset, tyypitykset, yms). Ulosteen parasiittien mikroskopointi referenssilabrassa. Vai NhO-seulonta pienlaitteella kaikissa keskussairaaloissa?
Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Sienitutkimukset yhdessä bakteeritutkimusten kanssa Silsasienet NhO-tutkimuksena Sieniviljelyt muutamassa hyvin varustetussa erikoislaboratoriossa.
Keskittämistä puoltaa Automaatio, automaatioratojen kehitys Parempi laatu ja dokumentointi (digikuvaus, yms). Suuret näytemäärät; jatkuva prosessointi. Työvoiman säästö; vältytään inhimillisiltä näytteen käsittelyvirheiltä Tulosten tulkinta ja vastaaminen asiantuntijoiden toimesta keskitetysti Huom! Kl mikrob erikoislääkärin ja sairaalamikrobiologin pitää osallistua tulosten tulkintaan. Sitä ei saa jättää yksin lh:n vastuulle!!! Tulkinta voidaan tehdä etänä sähköisesti! Edellytyksenä näytelogistiikan parantuminen ja näytteiden tutkiminen vuorotyönä. Rahallinen säästö
Hajauttamista puoltaa Näytteiden tutkiminen aloitettava välittömästi Veriviljely, likvoritutkimukset, virtsanäyteseulonta Yksittäiset pikatestit: S-PuumAb, U-StpnAg. Nieluviljely / StrAAg, yms. (korvataan NhO-paneeleissa) Päivystysluonteiseen työhön soveltuvat automaatit Ulosteen C difficile, nenänielun influenssa A&B virukset, ulosteen norovirus, fluorin B streptokokki Tulossa näytekohtaiset NhO-tutkimuspaneelit, joilla tunnistetaan näytteestä tunnissa 10-30 eri patogeenia.
Maailma muuttuu ja bakteerit automatisoituvat!