Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Virukset laaja lista

Transkriptio

1 1 (8) Merkintöjen selitys N:ro Nimet Lääkärin ilmoitus Mikrobin tunnus. Tunnus on luku väliltä 1000 _ 9999, lisäksi tunnukseen on liitetty kaksinumeroinen tarkistusosa. Tartuntatauti-ilmoituslomakkeeseen tunnus pyydetään merkitsemään kokonaisuudessaan, tarkistusosa mukaanlukien. Mikrobit luetellaan aakkostettuna sekä ensisijaisen nimen että ensisijaisen nimen synonyymien mukaan. Ensisijainen nimi on merkitty tunnuksen ja nimen väliin sijoitetulla plusmerkillä (+), ja sen yhteydessä luetellaan myös mikrobin kaikki vaihtoehtoiset nimet. Vaihtoehtoisten nimien kohdalla ilmoitetaan ensisijainen nimi. Lääkärin ilmoitusvelvollisuus mikrobin aiheuttamassa taudissa Koodit viittaavat allaolevaan kriteeriluetteloon, josta käy ilmi, millä tavoilla saadut löydökset laboratorio ilmoittaa tartuntatautirekisteriin Koodi kriteerin kuvaus 1 Viljelty verestä 2 Viljelty likvorista 3 Viljelty kliinisestä näytteestä 4 Mikrobin suora osoitus (esim. elektronimikroskopia, parasiittien mikroskopia, pimeäkenttämikroskopia) 5 Antigeenin osoitus verestä tai likvorista 6 Diagnostinen vasta-ainelöydös 7 DNA/RNA -osoitus verestä tai likvorista 8 Viljelty genitaalialueelta 9 Viljelty vastasyntyneeltä 10 Viljelty syvästä punktiosta tai leikkausnäytteestä 11 Viljelty ulosteesta 12 EIA-antigeeninosoitus varmistettuna blocking- tai FA-menetelmällä 13 DNA/RNA-osoitus 14 Positiivinen HAV-AbM (IgM-vasta-ainelöydös hepatiitti A -virukselle) 15 Positiivinen HBc-AbM (IgM-vasta-ainelöydös hepatiitti B -viruksen core-osalle) 16 Positiivinen HBsAg (hepatiitti B -viruksen pinta-antigeeni) Muu antigeenin osoitus (FA, TRFIA, EIA) 19 Viljely kliinisestä näytteestä (resistenssiominaisuus) 20 Toksiinin osoitus (antigeenin osoitus) 21 Viljelty ulosteesta ja toksiiniominaisuus Yhdistelyaikaväli Kantakokoelma Ominaisuudet Huomautukset lista Laaja listaus Aikaväli, jonka sisällä samasta henkilöstä tehdyt löydökset (ilmoitukset) yhdistyvät samaksi tapaukseksi, jos kyseessä ovat yhdisteltävät mikrobit. Mikrobin tautiluokka: yv (yleisvaarallinen), ilm (ilmoitettava) tai muu (muu rekisteröitävä) Mikrobin sisältyminen tartuntatautirekisterin kantakokoelmaan Mikrobiin mahdollisesti liitettyjä tartuntatautien rekisteröinnin kannalta tärkeitä ominaisuuksia (tyypit tms.) Mikrobiin mahdollisesti liitetyt huomautukset listaus kattaa mikrobinimikkeet pääsääntöisesti sukutasolla ja lisäksi lajitasolla, mikäli Suomessa on vuosien 1995 _ 2008 aikana ilmoitettu yksikin kyseisen suvun mikrobilöydös lajinimellä. Mikrobinimike sisältyy suppeaan listaan myös jos se on erikseen mainittu tartuntatautilaissa tai -asetuksessa. Laaja listaus sisältää suppean listan nimikkeiden lisäksi muut mahdolliset veri- tai likvorilöydökset sekä muut kliiniset merkittävät löydökset, jotka eivät kuitenkaan kuulu tartuntatautien ilmoitusjärjestelmän piiriin. Tartuntatautien mikrobinimikkeistöä ylläpitää Terveyden ja hyvinvoinnin laitoksen tartuntatautiseurannan ja - torjunnan osasto (info@tartuntatautirekisteri.fi), jonne mahdolliset muutosesitykset pyydetään osoittamaan.

2 Kaikki mikrobit Adenovirus Ominaisuudet: (1-42) 2 (8) ei ei 12kk muu 3, 6, 13 tai Astrovirus ei ei 3kk muu Calicivirus -> Kalikivirus ei ei 3kk muu Chikungunya virus ei ei 12kk muu 3, 6 tai 13 ei Coronavirus Koronavirus Coxsackie A virus Huom: Eri serotyyppejä, tunnistus immunologisesti tai sekvenssivertailun avulla. Ominaisuudet: (1-24) ulostelöydöksistä Coxsackie B virus Huom: Eri serotyyppejä, tunnistus immonologisesti tai sekvenssivertailun avulla. ulostelöydöksistä Cytomegalovirus Human herpesvirus 5, Sytomegalovirus ei ei 3kk muu 3, 4, 6, 13 tai ei 12kk muu 3 tai 6 ei 12kk muu 3 tai 6 ei ei 12kk muu 1, 2, 5 tai Dengue virus ei ei 12kk muu 6 tai Ebola virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 ei tai Echovirus ei 12kk muu 3 tai 6 Huom: Eri serotyyppejä, tunnistus immunologisesti tai sekvenssivertailun avulla. Ominaisuudet: (1-39) ulostelöydöksistä Enterovirus ei 12kk muu 3, 6 tai 13 Huom: Eri serotyyppejä, tunnistus immunologisesti tai sekvenssivertailun avulla. ulostelöydöksistä HIV -> Immuunikatovirus 50v ilm 3, 5, 6, 7, Ominaisuudet: TYYPPI1, TYYPPI2 13 tai HTLV -> Ihmisen T-lymfotrooppinen virus ei ei 50v muu 3, 6, 13 tai Hantavirus -> Puumalavirus ei ei 12kk muu 6 tai Hepatiitti A -virus 12kk yv 6 tai 13 Hepatitis A virus Hepatiitti B -virus ei 50v ilm 6, 13 tai 16 Hepatitis B virus Hepatiitti C -virus ei 50v ilm 6 tai 13 Hepatitis C virus Hepatiitti D -virus ei ei 50v muu 6 tai 13 Hepatitis Delta virus Huom: Esiintyy vain yhdessä hepatiitti B -viruksen kanssa Hepatiitti E -virus ei ei 12kk muu 6 tai 13 Hepatitis E virus Hepatitis A virus -> Hepatiitti A -virus 12kk yv 6 tai Hepatitis B virus -> Hepatiitti B -virus ei 50v ilm 6, 13 tai Hepatitis C virus -> Hepatiitti C -virus ei 50v ilm 6 tai Hepatitis Delta virus -> Hepatiitti D -virus ei ei 50v muu 6 tai 13 Huom: Esiintyy vain yhdessä hepatiitti B -viruksen kanssa Hepatitis E virus -> Hepatiitti E -virus ei ei 12kk muu 6 tai Herpes Simplex virus Yskänrokkovirus ei ei 12kk muu 1, 2, 5 tai 7

3 Kaikki mikrobit Human Immunodeficiency virus -> Immuunikatovirus Ominaisuudet: TYYPPI1, TYYPPI2 3 (8) 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Human T-cell leukemia virus -> Ihmisen T-lymfotrooppinen virus ei ei 50v muu 3, 6, 13 tai Human herpesvirus 3 -> Varicella-zoster virus ei ei 12kk muu 3, 4, 6, 13 tai Human herpesvirus 5 -> Cytomegalovirus ei ei 12kk muu 1, 2, 5 tai Ihmisen T-lymfotrooppinen virus ei ei 50v muu 3, 6, 13 tai HTLV, Human T-cell leukemia virus Immuunikatovirus 50v ilm 3, 5, 6, 7, HIV, Human Immunodeficiency virus Ominaisuudet: TYYPPI1, TYYPPI2 13 tai Influenssa A -virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Influenza A virus Ominaisuudet: HxNx, H1N1swl, H1N1v, H5N Influenssa B -virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Influenza B virus Influenssavirus ei ei 3kk muu Influenza virus Influenza A virus -> Influenssa A -virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Ominaisuudet: HxNx, H1N1swl, H1N1v, H5N Influenza B virus -> Influenssa B -virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Influenza virus -> Influenssavirus ei ei 3kk muu Japanese B encephalitis virus -> Japanin enkefaliittivirus ei ei 12kk muu 6 tai 13 ei Japanin enkefaliittivirus ei ei 12kk muu 6 tai 13 ei Japanese B encephalitis virus Kalikivirus ei ei 3kk muu 4 Calicivirus Keltakuumevirus ei 12kk yv 3, 6, 13 tai ei Yellow fever virus Koronavirus -> Coronavirus ei ei 3kk muu 3, 4, 6, 13 tai Lassa -virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 ei Lassa virus tai Lassa virus -> Lassa -virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 ei tai Marburg virus -> Marburgin virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 ei tai Marburgin virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 ei Marburg virus tai Measles virus -> Tuhkarokkovirus 12kk ilm 3, 6, 13 tai Mumps virus -> Sikotautivirus 12kk ilm 3, 6 tai Myyräkuumevirus -> Puumalavirus ei ei 12kk muu 6 tai Norovirus ei ei 3kk muu 4, 13 tai PPV -> Pieni pyöreä virus Huom: Sisältää astro- ja kalikivirukset, sekä muita määrittelemättömiä viruksia Parainfluenssavirus Parainfluenza virus Ominaisuudet: 1, 2, 3, 4a, 4b, Parainfluenza virus -> Parainfluenssavirus Ominaisuudet: 1, 2, 3, 4a, 4b, 4 ei ei 3kk muu 4 ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai

4 Kaikki mikrobit (8) Parvovirus ei ei 12kk muu 5, 6 tai Pieni pyöreä virus ei ei 3kk muu 4 PPV Huom: Sisältää astro- ja kalikivirukset, sekä muita määrittelemättömiä viruksia Pogostan tauti -virus ei ei 12kk muu 6 tai 13 Sindbis virus Poliovirus 12kk yv 3 tai 6 Huom: Eri tyyppejä. Ominaisuudet: 1, 2, 3, SL, rokotevirus, WT, villivirus, IM Kantakokoelma: Kanta ja näyte Puumalavirus ei ei 12kk muu 6 tai 13 Hantavirus, Myyräkuumevirus Puutiaisenkefaliittivirus ei ei 12kk ilm 6 tai 13 Tick-born encephalitis virus RS-virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Respiratory syncytial virus Rabies virus ei 12kk ilm 3, 4, 6, 13 Vesikauhuvirus tai Respiratory syncytial virus -> RS-virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Rhinovirus -> Rinovirus ei ei 3kk muu 3 tai Rinovirus ei ei 3kk muu 3 tai 13 Rhinovirus Rotavirus ei ei 3kk muu 4, 6, 13 tai Rubella virus -> Vihurirokkovirus 12kk ilm 6 tai SARS coronavirus -> SARS-virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 tai SARS-virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 SARS coronavirus tai Sapovirus ei ei 3kk muu 4, 13 tai ei Sapporo-like virus Sapporo-like virus -> Sapovirus ei ei 3kk muu 4, 13 tai ei Sikotautivirus 12kk ilm 3, 6 tai 13 Mumps virus Sindbis virus -> Pogostan tauti -virus ei ei 12kk muu 6 tai St. Louis -flavivirus ei ei 12kk muu 6 tai 7 ei St. Louis encephalitis virus St. Louis encephalitis virus -> St. Louis -flavivirus ei ei 12kk muu 6 tai 7 ei Sytomegalovirus -> Cytomegalovirus ei ei 12kk muu 1, 2, 5 tai Tick-born encephalitis virus -> Puutiaisenkefaliittivirus ei ei 12kk ilm 6 tai Tuhkarokkovirus 12kk ilm 3, 6, 13 tai Measles virus Varicella-zoster virus ei ei 12kk muu 3, 4, 6, 13 Human herpesvirus 3, Vesirokkovirus tai Variola virus -> Variola-virus ei 12kk yv Variola-virus ei 12kk yv Variola virus Vesikauhuvirus -> Rabies virus ei 12kk ilm 3, 4, 6, 13 tai Vesirokkovirus -> Varicella-zoster virus ei ei 12kk muu 3, 4, 6, 13 tai Vihurirokkovirus 12kk ilm 6 tai 13 Rubella virus West Nile -virus -> West Nile fever virus ei ei 50v muu 6 tai 13 ei West Nile fever virus West Nile -virus ei ei 50v muu 6 tai 13 ei

5 Kaikki mikrobit (8) Yellow fever virus -> Keltakuumevirus ei 12kk yv 3, 6, 13 tai ei Yskänrokkovirus -> Herpes Simplex virus ei ei 12kk muu 1, 2, 5 tai 7

6 6 (8) Tehdyt muutokset Ensisijaisen nimen muutos Hepatiitti C -virus ei 50v ilm 6 tai Puutiaisenkefaliittivirus ei ei 12kk ilm 6 tai RS-virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Kriteerimuutos Puutiaisenkefaliittivirus ei ei 12kk ilm 6 tai RS-virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Lisätty ominaisuuksia RS-virus ei ei 3kk muu 3, 6, 13 tai Tautiluokan muutos Hepatiitti C -virus ei 50v ilm 6 tai Coronavirus ei ei 3kk muu 3, 4, 6, 13 tai

7 Tehdyt lisäykset (8) Chikungunya virus ei ei 12kk muu 3, 6 tai 13 ei Coronavirus ei ei 3kk muu 3, 4, 6, 13 Koronavirus tai HIV-1 -> 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai HIV-2 -> 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Human Immunodeficiency virus 1 -> 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Human Immunodeficiency virus 2 -> 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Immuunikatovirus tyyppi 1 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Immuunikatovirus tyyppi 2 50v ilm 3, 5, 6, 7, 13 tai Influenssa A/H5N1 -virus ei 3kk yv 3, 6, 13 tai Influenssavirus -> Influenssavirus ei ei 3kk muu Influenssavirus ei ei 3kk muu Influenza virus Influenza virus -> Influenssavirus ei ei 3kk muu Influenza virus ei ei 3kk muu Influeza A/H5N1 virus -> ei 3kk yv 3, 6, 13 tai Koronavirus -> Coronavirus ei ei 3kk muu 3, 4, 6, 13 tai Rhinovirus -> Rinovirus ei ei 3kk muu 3 tai Rinovirus ei ei 3kk muu 3 tai 13 Rhinovirus SARS coronavirus -> SARS-virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 tai SARS-virus ei 12kk yv 3, 4, 6, 13 SARS coronavirus tai Sapovirus ei ei 3kk muu 4, 13 tai ei Sapporo-like virus Sapporo-like virus -> Sapovirus ei ei 3kk muu 4, 13 tai ei Variola virus -> Variola-virus ei 12kk yv Variola-virus ei 12kk yv Variola virus West Nile -virus -> West Nile fever virus ei ei 50v muu 6 tai 13 ei West Nile fever virus West Nile -virus ei ei 50v muu 6 tai 13 ei

8 Tehdyt poistot N:ro nimi poistettu Immuunikatovirus tyyppi Immuunikatovirus tyyppi Influenssa A/H5N1 -virus (8)