Kliinisen mikrobiologian laboratorion valmiudet suorittaa märkäbakteeriviljelyä

Transkriptio

1 Kliinisen mikrobiologian laboratorion valmiudet suorittaa märkäbakteeriviljelyä Yl Markku Koskela OYS / Mikrobiologian laboratorio (OML)

2 Perusvalmiudet Bakteerilaboratorio, jossa toimivat tilat: Näytteiden & lähetteiden vastaan ottamiselle Värjäyspreparaattien ja viljelyiden tekemiselle Inkubaattoreille, jääkaapeille, pakastimille Värjäysten suorittamista ja mikroskopointia varten Parityöskentelyyn viljelmien tulkintaa varten Jatkotutkimusten tekoa varten Elatusaineiden valmistusta & säilytystä varten Jätteiden säilytystä & hävitystä varten

3 Perusvalmiudet Bakteerilaboratorio, jossa toimiva(t): Laitteet: Kiertoilmalaminaari näytteiden käsittelyyn Vetokaappi värjäyksiä varten Hyvä valomikroskooppi ja (Uv-mikroskooppi) Inkubaattorit, myös anaerobikaappi, ja kylmälaitteet Puhelin- ja tietokoneyhteydet asiakkaisiin Elatusainemaljat ja -putket Hyvä VM, Rikas SM, CLED, PEA, StrVM Anaerobeja varten: Hyvä AnVM, selektiiviset maljat Bakteerien rikastusviljelyputki (BHI-putki, Tioputki ) Reagenssit ja välineet

4 Perusvalmiudet Bakteerilaboratorio, jossa toimiva(t): Työ- ja toimintaohjeet Laboratorion omaa toimintaa vastaavat ohjeet! Laadunvarmistusjärjestelmät Sisäinen ja ulkoinen laadunvarmistus! Labquality: Bakteeriviljely: aerobiviljely 2 näyt. anaerobiviljely 2 näyt. UKNEQAS: General Bacteriology 2 näyt & 1 herkk Sujuva Atk-järjestelmä!!

5 Perusvalmiudet Bakteerilaboratorio, jossa osaava henkilökunta: Nimetyt vastuuhenkilöt: El, Sm,Oh Sopivasti laboratoriohenkilökuntaa Jatkuva ja hyvä perehdytys Erityisesti panostettava: Osaamisen ylläpitämiseen ->täydennyskoulutus Työkiertoon -> joustavuus sesonkitilanteissa Loma- ja viikonloppuajan osaamiseen ->yhtä hyvin! Äkillisiin toimintamuutoksiin varautumiseen

6 Pintamärkäviljely: Pu-BaktVi 2 Yleisbakteeriviljely VM:lle ja SM:lle (& värj.) Pinnalliset ihon ja limakalvojen märkänäytteet märkivät ihoinfektiot korvamärät, poskiontelomärät, sik-märät palovamma-alueen kolonisaatiotutk näytteet Inkub 1->2-(4-7) vrk 5% CO 2 -kaapissa/pytyssä Vältettävä turhaa inkubaattorin ulkopuolella (työpöydällä) seisottamista Sauvaylikasvu ->alkuper näyte Cled, Pea

7 Pintamärkäviljely: Pu-BaktVi 2 Osattava tunnistaa silmämääräisesti: kokkipesäke / sauvapesäke ->tarvittaessa gram-värj beta-,alfa-hem.streptokokit, enterokokit stafylokokkipesäke, difteroidi, Bacillus, hiiva E.colin yms. näköinen sauva Oksidaasipositiivinen sauva:pseud.aeruginosa ym. Outo pesäke ->Gram-värjäys ->pv ja jatkot!! Osattava tehdä: tav bakt lajitunnistus & herkkyysmääritys C.albicansin lajitunnistus Toimitettava oudot näytteet ja mikrobikannat tukilaboratorion tutkittavaksi

8 Syvämärkäviljely: Pu-BaktVi 1 Yleisbakteeriviljely ja Gram- & (AO-)värjäys syvältä otetuista märkä- ja kudosnäytteistä Näytteen mukaan selektiivisiä viljelyitä Viljely ainakin:vm, SM, AnVM & Rikastusp. Inkub 1->2-7 vrk 5% CO 2 -kaapissa/pytyssä; anaerobiviljelmät anaerobisti Vältettävä turhaa inkubaattorin ulkopuolella (työpöydällä) seisottamista Varauduttava yllätyslöydöksiin!!

9 Syvämärkäviljely: Pu-BaktVi 1 Osattava tunnistaa silmämääräisesti: Tavalliset aerobit ja anaerobit ->jatkotutkimukset Osattava tehdä: tavallisten aerobien ja anaerobien lajitunnistus ja tarvittavat mikrobilääkeherkkyysmääritykset harvinaisten bakteerien alustava sukutason tunnistus (Eikenella, Kingella, F.tularensis-epäily; Nocardia-epäily, atyyp.mykobakteeriepäily, jne!) sienten tunnistus:c.albic/ ei C.alb; homesieni Toimitettava oudot näytteet ja mikrobikannat tukilaboratorion tutkittavaksi

10 Esimerkki Pu-BaktVi 2: Poskionteloerite kr sinuiittia sairastavalta naiselta, jolla pahanhajuinen hengitys Labquality:Bakteeriviljely 3/2003 näyte 10 Hajotusviljely vm:lle ja sm:lle, joilla kasvoi aerobisesti 1-2 vrk:ssa erittäin limaisia sauvapesäkkeitä Tunnistus vaatii: API20E, Vitek, tms.: Klebsiella ozoenae (joka aiheuttaa pahanhajuista hengitystä)

11 Esimerkki Pu-BaktVi 1: Pleuraeffuusio sädehoidon jälkeen keuhkosyöpäpotilaalla Labquality:Bakteeriviljely 3/2003 näyte 10 Hajotusviljely vm, sm, anveri; selektiivisiä elatusalustoja labran harkinnan mukaan Aerobiviljely: pieni, beta-hemol.streptokokki, joka reagoi A- streptokokki lateksilla, mutta ei S.pyogeneksen näk. >ApiID32Strep, Vitek ym: S.milleri Anaerobiviljelyssä 4-7 vrk:ssa anaerobi, itiötön, haarautuva gram-posit sauva >Actinomyces-laji (A.naeslundii? )

12 Yhteenveto Märkäbakteeriviljelyitä suorittavalla laboratoriolla pitää olla: Asianmukaiset tilat, laitteet,välineet Määritykset hallitseva henkilökunta Oikein kohdistettu sisäinen ja ulkoinen laadunvarmistus! Näyttö osaamisesta!!