Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 2/2013

Transkriptio

1 Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 2/2013 Kuvat ja teksti: Markku Koskela Mikrobiologian ylilääkäri NordLab Oulu Huom! Käyttäkää yläpalkin suurennusmahdollisuutta % pesäkekasvun yms. yksityiskohtia tarkastellessanne!!!!

2 Näyte 11/2013 Haavamärkä. Haavainfektio Syyrian pakolaisella Löydös: E coli, patogeeni Tehtävät: Bakteerin eristäminen, tunnistaminen ja mikrobilääke- herkkyysmääritys

3 Näyte 11/2013 Haavamärkä. Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. ->Harmaa, kiiltävä, kupera, tarkkarajainen, sauvamainen pesäke.

4 Näyte 11/2013 Haavamärkä. Gramnegatiivinen sauva Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. ->Harmaa, kiiltävä, kupera, tarkkarajainen, sauvamainen pesäke

5 Näyte 11/2013. E coli 1. API20E Escherichia coli (99,5 %) Oksidaasi + - +, + - -, - - +, - - +, + - +, + + +, Vitek V2C GN E. coli

6 Näyte 12/2013 Korvakäytävästä imetty välikorvaerite. Tärykalvon puhkaissut välikorvatulehdus 53-vuotiaalla potilaalla. Oletettu löydös: Streptococcus pneumoniae eli pneumokokki, patogeeni. Lisäksi korvakäytävän normaalia flooraa sisältäen: Staphylococcus lugdunensis, (lisäpatogeeni??) ja Micrococcus sp. Tehtävät: Bakteerien eristäminen ja tunnistaminen. Tulosten tulkinta

7 Näyte 12/2013 Välikorvaerite Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. ->1. Vihreitä, matalia, kraaterimaisia,alfa-hemolyyttisiä pesäkkeitä ->2. Pieniä pesäkkeitä. Monenkolaisia?

8 Näyte 12/2013 Välikorvaerite Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. ->1. Vihreitä, alfa-hemolyyttisiä pesäkkeitä ->2. Kellertäviä, matalia, kiiltäviä, beta-hemolysoivia pesäkkeitä ->3. Keltaisia, kuperia, kuivia pesäkkeitä

9 Näyte 12/2013 Välikorvaerite Viljely suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. ->1. Alfa-hemolyyttisiä pesäkkeitä. ->2. Kellertäviä, matalia, kiiltäviä pesäkkeitä. ->3. Keltaisia, kuivia, kuperia pesäkkeitä (muutamia)

10 Näyte 12/2013. (14/2011) Streptococcus pneumoniae Kraaterimaisia pneumokokkipesäkkeitä Optokiinille herkkä (kasvun estorengas) alfa-hemolyyttinen streptokokki eli pneumokokki. ( 1 vrk, 35 C) Grampositiivinen diplokokki

11 Näyte 12/2013. (3/2010) Staphylococcus lugdunensis Kasvu verimaljalla, 2 vrk, 35 C. Matalia, keltaisia, kiiltäviä ja hemolysoivia stafylokokkipesäkkeitä, jotka muistuttavat paljon S. aureus-pesäkkeitä. Grampositiivinen ryhmäkokki

12 Näyte 12/2013. (3/2010) Staphylococcus lugdunensis S.lugdunensis agglutinoituu stafylokokkilatex-testeillä kuten S.aureus, Staphaurex Remel Europe Ltd, UK Pasteurex TM Staph Plus, Bio-Rad, Ranska mutta S.lugdunensis ei koaguloi kanin plasmaa eli se on koagulaasinegatiivinen stafylokokki. Kanin plasman koagulaasi: S lugdun negat S aureus posit

13 Näyte 12/2013. (3/2010) Staphylococcus lugdunensis S aureus S lugdunensis Kasvu S aureuksen identifikaatiomaljalla (SAID, biomerieux, Ranska) 1 vrk:ssa, 35 C:ssa: S aureus vihreä ja S lugdunensis valkoisen harmaa

14 Näyte 12/2013. (3/2010) Staphylococcus lugdunensis 1. API20Staph: Staphylococcus lugdunensis ( 97 %) - + +, + + -, + - -, - + -, + - -, + - +, Vitek-2 GP Staphylococcus lugdunensis

15 Näyte 12/2013 (6/2011) Mikrokokki (Micrococcus sp.) Furatsolidonille resistentti Katalaasi posit Kasvu lampaan verimaljalla, 1 vrk, 35 C Keltaisia, kuivia, kuperia pesäkkeitä Grampositiivinen tetrakokki

16 Näyte 13/2013 Kudosnäyte 47-vuotiaan miehen tulehtuneesta vasemman reiden pistohaavasta. Työtapaturma rakennustyömaalla. Löydös: Clostridium novyi, patogeeni ja Corynebacterium jeikeium, lisäpatogeeni. Tehtävät: Bakteerin eristäminen ja tunnistaminen. Tuloksen tulkinta.

17 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Natiivinäytteen gramvärjäys 1 2 Näytteen gramvärjäyslöydökset: 1. Gampositiivista lyhyttä kokkisauvaa ja 2. pitkää, grampositiivista itiöllistä sauvaa (klostridi?)

18 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Aerobinen primaariviljely Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. -> 1. Pieniä, harmaan valkoisia pesäkkeitä

19 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Aerobinen primaariviljely Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. -> 1. Pieniä, harmaanvalkoisia pesäkkeitä.

20 Näyte 13/2013 (10/2011) Corynebacterium jeikeum Katalaasi+ (kuohuu) Oksidaasi neg (väritön) Aerobi verimaljakasvu, 2 vrk, 35 C. Pieniä, harmaan valkoisia (->kellertäviä), kiiltäviä, kuperia pesäkkeitä, jotka ovat katalaasipositiivisia. (Vrt. streptokokit ovat katalaasinegatiivisia!) Lyhyt, monimuotoinen grampositiivinen sauva

21 Näyte 13/2013 (10/2011) Corynebacterium jeikeum 1. RapID CB Plus Corynebacterium jeikeum (99,9%) Katalaasi + - +, - - -, - - -, + - -, - - -, + - -, + 1. Vitek-2 ANC Corynebacterium jeikeum

22 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Anaerobinen primaariviljely FAA-maljalle Anaerobikasvu anaerobiverimaljalla (FAA) 2 vrk, 35 C. Metronidatsolikiekon ympärillä on suuri estorengas ->anaerobeja! Pesäkkeet kasvavat tobramysiinikiekkoon kiinni Aerobimaljalla kasvanut bakteeri ei kasva anaerobimaljalla!

23 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Anaerobinen primaariviljely FAA-maljalle Anaerobikasvu FAA-maljalla 2 vrk, 35 C. Pesäkerykelmiä, joiden ympärillä voimakas betahemolyysivyöhyke ja sen ulkopuolella toinen ja kolmas, heikompi beta-hemolyysivyöhyke! ->Aerotoleranssitesti ja gramvärjäys

24 Näyte 13/2013 Kudosnäyte reidestä. Anaerobinen primaariviljely EYA-maljalle 2 1 Anaerobikasvu ja reaktiot EYA-maljalla 2-3 vrk, 35 C. Matalia, epätarkkarajaisia, leviäviä pesäkkeitä, joita 1. reunustaa helmeilevä lipaasireaktioreunus (Lipaasi+) 2. ympäröi vaalea samentuma, lesitinaasireaktio. (Lesitinaasi+)

25 Näyte 13/2013 Aerotoleranssitestit FAA-maljalta Verimalja: aerobi; suklaamalja: 5% CO 2, FAA: anaerobi 1. Vasen neljännes: Grampositiivinen itiötön sauva, joka kasvaa vain aerobisesti veri ja suklaamaljoilla. (Corynebacterium jeikeum). 2. Oikea neljännes: Grampositiivinen itiöllinen sauva, joka kasvaa vain anaerobisella verimaljalla (FAA-malja). Se on ehdottomasti anaerobi (Clostridium novyi).

26 Näyte 13/2013. Clostridium novyi Katalaasi negat. (Ei kuohu) Anaerobikasvu FAA-maljalla, 35 C, 3 vrk. Matala, leviävä pesäke, jonka ympärillä kolme erivahvuista beta-hemolyysivyöhykettä Pikaindoli negat. (Väritön)

27 Näyte 13/2013. Clostridium novyi Anaerobien identifikaatiotesti (AI) Kanamysiini S Vankomysiini S Kolistiini R Metronidatsoli S. Löydös sopii grampositiiviseksi anaerobiksi (vankomysiini S, kolistiini R). Koska se on myös grampositiivinen itiöllinen sauva, se sopii Clostridium-lajiksi. Grampositiivinen itiöllinen sauva (subterminaaliset itiöt, jotka näkyvät kuvassa heikosti)

28 Näyte 13/2013. Clostridium novyi 1. RapID ANA II Clostridium tetani (99 %), mutta indolireaktio on väärä posit. Maljalta indoli negat! Kun indoli negat -> Clostridium novyi (96%) - - -, - - -, - - -, + - -, - - +, (?) Lisäksi C tetani on lesitinaasinegatiivinen ja yleensä myös lipaasinegat.

29 Näyte 14/2013. CT-ohjattu biopsianäyte keski-ikäisen miehen tulehtuneesta lannerangan nikamasta. Löydös: Staphylococcus saccharolyticus, patogeeni. Tehtävät: Bakteerin eristäminen ja tunnistaminen. Tuloksen tulkinta.

30 Näyte 14/2013. CT-ohjattu biopsianäyte lannerangan nikamasta. Natiivinäytteen gramvärjäys Gramvärjäyslöydös: Grampositiivisia kokkeja

31 Näyte 14/2013. Biopsianäyte lannerangan nikamasta Näytteen aerobiviljely Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, 35 C, 7 vrk. -> Ei kasvua

32 Näyte 14/2013 Biopsianäyte lannerangan nikamasta. Näytteen anaerobiviljely FAA-maljalle Anaerobiviljely anaerobiverimaljalla (FAA) 2 vrk, 35 C. Metronidatsolikiekon ympärillä ei ole estorengasta, joten se ei ole todellinen anaerobi, vaikka se kasvaa vain anaerobisti! Bakteeri on herkkä tobramysiinille kuten monet aerobit ovat!

33 Näyte 14/2013 Aerotoleranssitestit FAA-maljalta Verimalja: aerobi; suklaamalja: 5% CO 2, FAA: anaerobi 1. Verimalja: Ei kasvua 2. Suklaamalja: Ei kasvua. 3. FAA-malja: Kasvaa valkoinen bakteeri

34 Näyte 14/2013. Staphylococcus saccharolyticus Katalaasi: posit (Kuohuu) Anaerobiverimaljakasvu (FAA) 2 vrk, 35 C, Valkoisia, matalia, kiiltäviä stafylokokkimaisia pesäkkeitä Pikaindoli: negat (Väritön)

35 Näyte 14/2013. Staphylococcus saccharolyticus Anaerobien identifikaatiotesti (AI): Kanamysiini S Vankomysiini S Kolistiini R. Metronidatsoli R. Löydös sopii grampositiiviseksi (vankomysiini S, kolistiini R) bakteeriksi. Keskikokoinen grampositiivinen kokki

36 Näyte 14/2013. Staphylococcus saccharolyticus 1. RapID ANA II: (Puuttuu luettelostakin) - - -, - - -, - - -, - - (+)/-, - - (+)/-, (+)/ Vitek V2C ANC Staphylococcus saccharolyticys

37 Auringon paistetta ja lämpimiä kesäpäiviä