Lyhyt yhteenveto Labqualityn bakteeriviljelykierroksilta Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia

Transkriptio

1 Lyhyt yhteenveto Labqualityn bakteeriviljelykierroksilta Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia

2 Bakteeriviljely kierrosta/vuosi; 4 näytettä/kierros 2 pinta- ja 2 syvänäytettä/kierros 1 bakteeri, joille herkkyysmääritys/kierros Osallistujia Suomesta laboratoriota Ulkomaisia osallistujia n. 40. Suomalaisten labrojen menestys on hyvä Ulkomaisten labrojen menestys on vaihteleva.

3 Bakteeriviljely Parantamiskohteita Potilaan ja näytteen esitietoihin on syytä perehtyä paremmin ->viljelyn tarkempi suunnittelu. Riittävän pitkät inkubaatioajat, 2-> 7 vrk. Maljojen lukemisen osaamista ja selektiivisten maljojen käyttöä on syytä parantaa. Malttia ja huolellisuutta! Lajitunnistusmenetelmien kapasiteetti ja virhemahdollisuudet on tunnettava paremmin. Lukekaa palautteet tarkasti ja oppikaa niistä!

4 Esimerkki Bakteeriviljelykierroksen palautteen liitteestä. Miten vastaajien käyttämät lajitunnistusmenetelmät toimivat. Arvioikaa, miten labranne käyttämät menetelmät toimivat ja pitäkää havainnot mielessänne seuraavaa samanlaista tilannetta varten!!

5 Kliinisen perusbakteriologian nyky- ja tulevaisuuden näkymiä Markku Koskela, ylilääkäri, Nordlab Oulu, mikrobiologia

6 Menetelmävalinnat Nyt -> tulevaisuudessa Bakteerivärjäys ja bakteeriviljelyt Bakteeriantigeenitestit Bakteerispesifiset Nh-osoitukset Bakteerivärjäys ja bakteeriviljelyt Bakteeriantigeenitestit Bakteerispesifiset Nh-osoitukset Bakteerien vastaainetutkimukset Bakteerien vastaainetutkimukset täsmentyvät

7 Näytteestä monta eri tutkimusta ->laajat tutkimuspaneelit Yksittäiset bakteeri-, sieni-, virus- ja parasiittitutkimukset (Vi, Ag, NhO) Näytetyyppikohtaiset NhO-yhdistelmätutkimukset Veri(viljely)paneeli: >95% aih. Likvorpaneeli: keskushermostoinfektioita aih bakteerit, virukset ja sienet Ulostepaneeli: suolistoinf aih bakteerit,virukset ja parasiitit Nielunäytepaneeli: bakteerit ja virukset Imulima/ysköspaneeli: bakt virukset, sienet ja parasiitit

8 Bakteerien suora osoitus näytteestä Nyt Tulevaisuudessa Gram- ja Aovärjäys Gram- ja Aovärjäys Maldi-tofmenetelmät Bakteriantigeenitestit Bakteerien NhOtestit Bakteriantigeenitestit Bakteerien NhOtestit Maldi-tofmenetelmät

9 Tietyn ominaisuuden koodaavan bakteerin geenin osoitus suoraan näytteestä / bakteerista Vaarallisen virulenssimekanismin tunnistaminen C difficile: toksiinia tuottavan C difficilen osoitus ulosteesta -> C difficile-kannan geenianalyysi. S aureus: PLV- ym. virulenssigeenejä E coli: toksigeeniset kannat ulosteesta C diphtheriae: toksiinia tuottavan kannan os. Poikkeavan resistentit bakteerit meca-geeni ->MRSA vana, vanb-geenit ->VRE Kpc-geeni, yms. -> Gramneg bakt CPE-kannat Tulevaisuudessa mukana näytekohtaisissa NhO-paketeissa

10 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Nyt Keskussairaaloissa, yo-sairaaloissa ja isoissa yksityislaboratorioissa monipuolinen viljelytutkimusvalikoima, joku pikatesti ja Nho-tutkimus. Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Veriviljelyseulonta ->Posit jatkoviljely->herkkyysmääritykset paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa?? Lisänä veren?/veriviljelmän bakteerien ja sienten NhO-paketti. Likvorin bakteeriviljely ->Posit viljelmien jatkotukimukset paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa?? Lisäksi heti: pienlaitteella likvorin Nho-paketti ->tulos alle 1-2 tunnissa; päivystystutkimus: 7/24.

11 Esimerkki likvorin bakteeri-, virus- ja sienipatogeenien NhO-tutkimuksesta pienlaitteella Selkäydinnesteen NhO-tutkimuspaneeli pienlaitteella. Tutkimuksen kesto n. 1 tunti.

12 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Virtsanäytteen automaattiseulonta ->Seulontapositiivisten näytteiden kvant viljely ->lajitunnistus ja herkkyysmääritykset (paikallisesti vai keskitetysti keskuslabrassa??) Nielunäytteen streptokokkiviljely ->Lajitunnistus. Tilalla: pienlaitteella nielunäytteen NhO-paketti (Str A, adenovirus, influenssa A ja B virukset, RSV, Mycoplasma pneumoniae, muita bakteereita ja viruksia). ->tulos alle 1-2 tunnissa; 7/24 päivystystutkimus ks:n päiv.labrassa vai päiv pkl:lla? / tk labrassa vai tk-päiv pkl:lla??/ lääkärin ja sh:n vo:lla?

13 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Keskussairaaloissa (ja joissakin aluesairaaloissa): Emätineritteen B-streptokokkiviljely ->Lajitunnistus. Lisäksi: pienlaitteella B-streptokokin suora NhO-tunnistus ->tulos alle 1,5 tunnissa; 7/24 päivystystutkimus ks:n päiv.labrassa vai synnytysosastolla? Muita selkeästi kohdistettuja viljelytutkimuksia (Mm-HygVi, Fl-HiivaVi, yms.) ->Lajitunnistus suku jos tarpeen.

14 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Kudos-ja märkänäytteiden bakteeriviljelyt (Pu-BaktVi1 ja 2, Ex-BaktVi, Li-BaktVi; selektiiviset erikoisviljelyt) ->automatisoitu viljely- ja tutkimusrata oheistoimintoineen. Lisäksi: näytetyyppikohtaiset NhO-paketit (veri, likvori, hengitystienäyte, hygienianäyte, yms.) ->tulos alle 1-2 tunnissa Jatkuva näytteiden syöttöprosessi?

15 Esimerkki mikrobiologian automaatioradasta Kiestra lab automation

16 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Ulosteen bakteeri-, virus- ja parasiittitutkimukset Seulonta NhO-paketilla Ulosteen viljelytutkimukset vain tarvittaessa (bakt herkkyysmääritykset, tyypitykset, yms). Ulosteen parasiittien mikroskopointi referenssilabrassa. Vai NhO-seulonta pienlaitteella kaikissa keskussairaaloissa?

17 Muutos perusbakteriologian laboratorion tutkimusvalikoimassa ja työnkuvassa Tulevaisuudessa Yo-sairaaloissa ja joissakin hyvin varustetuissa keskussairaaloissa ja yksityislaboratorioissa: Sienitutkimukset yhdessä bakteeritutkimusten kanssa Silsasienet NhO-tutkimuksena Sieniviljelyt muutamassa hyvin varustetussa erikoislaboratoriossa.

18 Keskittämistä puoltaa Automaatio, automaatioratojen kehitys Parempi laatu ja dokumentointi (digikuvaus, yms). Suuret näytemäärät; jatkuva prosessointi. Työvoiman säästö; vältytään inhimillisiltä näytteen käsittelyvirheiltä Tulosten tulkinta ja vastaaminen asiantuntijoiden toimesta keskitetysti Huom! Kl mikrob erikoislääkärin ja sairaalamikrobiologin pitää osallistua tulosten tulkintaan. Sitä ei saa jättää yksin lh:n vastuulle!!! Tulkinta voidaan tehdä etänä sähköisesti! Edellytyksenä näytelogistiikan parantuminen ja näytteiden tutkiminen vuorotyönä. Rahallinen säästö

19 Hajauttamista puoltaa Näytteiden tutkiminen aloitettava välittömästi Veriviljely, likvoritutkimukset, virtsanäyteseulonta Yksittäiset pikatestit: S-PuumAb, U-StpnAg. Nieluviljely / StrAAg, yms. (korvataan NhO-paneeleissa) Päivystysluonteiseen työhön soveltuvat automaatit Ulosteen C difficile, nenänielun influenssa A&B virukset, ulosteen norovirus, fluorin B streptokokki Tulossa näytekohtaiset NhO-tutkimuspaneelit, joilla tunnistetaan näytteestä tunnissa eri patogeenia.

20 Maailma muuttuu ja bakteerit automatisoituvat!