Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014

Transkriptio

1 Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014 Kuvat ja teksti: Markku Koskela Mikrobiologian ylilääkäri Nordlab Oulu Huom! Käyttäkää yläpalkin suurennusmahdollisuutta % pesäkekasvun yms. yksityiskohtia tarkastellessanne!!!!

2 Näyte 41/2014 Välikorvaerite. Mastoidiitti (kartiolisäkkeen tulehdus) toistuvia välikorvatulehduksia sairastaneella lapsella Löydös: Streptococcus pneumoniae, merkittävä patogeeni Tehtävät: Bakteerin eristäminen, tunnistaminen ja mikrobilääkeherkkyysmääritys

3 Näyte 41/2014 Välikorvaerite Kasvu lampaanverimaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. -> Alfa-hemolyyttinen streptokokki.

4 Näyte 41/2014 Välikorvaerite Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. -> Alfa-hemolyyttinen streptokokki.

5 Näyte 41/2014. Streptococcus pneumoniae Kasvu verimaljalla, 1-2 vrk, 35 C. Harmaita, limaisia (voimakkaasti kapselillisia), alfahemolyyttisiä pesäkkeitä, jotka ovat optokiinille herkkiä. Grampositiivinen diplokokki

6 Näyte 42/2014 Sidekalvoerite pikkulapsen oikeasta silmästä Oletettu löydös: Staphylococcus aureus, patogeeni. Haemophilus parainfluenzae, mahdollinen lisäpatogeeni. Tehtävät: Bakteerien eristäminen ja tunnistaminen. Tulosten tulkinta

7 Näyte 42/2014 Sidekalvoerite. 2 Kasvu lampaanverimaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1-2 vrk. 1. Keskikokoinen, keltainen, kiiltävä beta-hemolysoiva pesäke. 2. Hyvin pieni pesäke.

8 Näyte 42/2014 Sidekalvoerite. 1 vrk 2 vrk 1 2 Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 ja 2 vrk. 1. Matalia, keltaisia, kiiltäviä stafylokokkipesäkkeitä. 2. Pieniä, harmaita kuperia pesäkkeitä.

9 Näyte 42/2014 (1/2011). 1. Staphylococcus aureus S.aureus Koag neg stafylokokki + - Stafylokokkien latexagglutinaatiotesti Kasvu verimaljalla 35 C, 1 vrk. Matalia, kiiltäviä, kellertäviä ja betahemolysoivia S aureus-pesäkkeitä.

10 Näyte 42/2014 (2/2011). 2. Haemophilus parainfluenzae S aureus Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. H parainfluenzae Satelliittikoe+

11 Näyte 42/2014 (2/2011). 2. Haemophilus parainfluenzae 1 Hemofiilusten kasvufaktorit (X ja V): H parainfluenzae vaatii kasvaakseen maljalla vain V-faktorin. (Huom! H influenzae vaatii sekä X- että V-faktorin kasvakseen maljalla!!) Pieni, heikosti värjääntyvä ja monimuotoinen gramnegatiivinen sauva

12 Näyte 42/2014 (2/2011). 2. Haemophilus parainfluenzae 1. RapID NH 1363 Haemophilus parainfluenzae 99,9% + - -, + + -, - + +,

13 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta. Ärtynyt käden ruhjehaava kalanviljelylaitoksen työntekijällä. Löydökset: Vibrio parahaemolyticus, merkittävä patogeeni. Rahnella aquatilis, mahdollinen patogeeni. Tehtävät: Bakteerien eristäminen ja tunnistaminen. Tuloksen tulkinta.

14 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta 1 2 Oksidaasi + Kasvu lampaanverimaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. 1. Suuria harmaita, matalia, osin hemolysoivia pesäkkeitä. Oksidaasi Pieniä, kokkimaisia pesäkkeitä.

15 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta Oksidaasi + Kasvu lampaanverimaljalla, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. 1. Suuria kurttuisia pesäkkeitä. Oksidaasi Pieniä kokkimaisia pesäkkeitä. Oksidaasi -. Oksidaasi -

16 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta 1 2 Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. 1. Suuria, matalia sauvapesäkkeitä. Oksidaasi Pieniä, kokkimaisia pesäkkeitä. Oksidaasi -.

17 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta 1 2 Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, 35 C, 2 vrk. 1. Suurempi, kurttuinen pesäke. Oksidaasi Pienempi, harmaa, kiiltävä pesäke. Oksidaasi -.

18 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta 1 vrk 2 vrk Kasvu CLED-maljalla, 35 C, 1 ja 2 vrk. 2. Pieniä, hitaasti laktoosipositiivisia pesäkkeitä. Oksidaasi -.

19 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta 1 vrk 2 vrk Kasvu BBL Chromagar Orientation-maljalla, 35 C, 1 ja 2 vrk. 2. Pieniä kokkimaisia, tumman vihreitä pesäkkeitä. Oksidaasi -.

20 Näyte 43/ Vibrio parahaemolyticus Oksidaasi + Gramnegatiivisia sauvoja Kasvu verimaljalla 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. Kuperia, kiiltäviä pesäkkeitä. Oksidaasi +.

21 Näyte 43/ Vibrio parahaemolyticus Vibrio parahaemolyticus n sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: -/- 2) Indoli + (punainen) 3) liikkumaton (kasvu vain pistoviljelykohdassa) 4) sitraatti + (sininen) 5) urea + (punainen) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja keltainen (+)/ pohjassa ei kaasua (-). H 2 S- reaktio on negatiivinen (ei mustaa putkesssa).

22 Näyte 43/ Vibrio parahaemolyticus 1. API20 NE Vibrio parahaemolyticus 99,5% Oksidaasi + + +, - + -, + + +, - + +, + + +, - - +, Vitek-2 GN Vibrio parahaemolyticus 94%

23 Näyte 43/ Rahnella aquatilis Oksidaasi - Gramnegatiivisia sauvoja Kasvu verimaljalla 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. Pieniä, kuperia, vesipisaramaisia pesäkkeitä.

24 Näyte 43/ Rahnella aquatilis Rahnella aquatilis n sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: +/- (keltainen) 2) Indoli - (keltainen) 3) liikkumaton (kasvu vain pistoviljely-kohdassa) 4) sitraatti + (sininen) 5) urea - (keltainen) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja keltainen (+)/ pohjassa ei kaasua (-). H 2 S-reaktio on negatiivinen (ei mustaa putkesssa).

25 Näyte 43/ Rahnella aquatilis 1. API20E Rahnella aquatilis % + - -, - + -, - - -, + - +, + - +, + + +, Oksidaasi 2. Vitek-2 GN Rahnella aquatilis 96%

26 Näyte 43/2014 Sivelynäyte haavasta Anaerobiviljely anaerobiverimaljalla (FAA) 2-7 vrk, 35 C. Pieniä pesäkkeitä. Ei viitteitä anaerobeista.

27 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Sappirakon tulehdus 45-vuotiaalla liikemiehellä. Löydökset: Citrobacter werkmanii, Salmonella enterica (Salmonella ryhmä D, serotyyppi S Enteritidis) ja Clostridium ramosum, merkittäviä patogeeneja. Tehtävät: Bakteerien eristäminen ja tunnistaminen. Tuloksen tulkinta.

28 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Näytteen gramvärjäyslöydökset: Grampositiivisia itiöllisiä sauvoja ja gramnegatiivisia sauvoja

29 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Aerobi primaariviljely Kasvu lampaanverimaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. Vaaleanharmaita, kuperia, kiiltäviä sauvapesäkkeitä. Montako erilaista?

30 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Aerobi primaariviljely Kasvu suklaamaljalla, 5% CO 2, 35 C, 1 vrk. Suuria sauvapesäkkeitä. Montako erilaista?

31 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Aerobi primaariviljely 1 vrk 2 vrk Kasvu Cled-maljalla 35 C, 1 ja 2 vrk. Laktoosinegatiivisia sauvapesäkkeitä. Montako erilaista?

32 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Aerobi primaariviljely 2 vrk 1 vrk Kasvu BBL Chromagar Orientation-maljalla, 35 C, 1 ja 2 vrk. 1. Sinipunainen ->tumman violetti sauvapesäke. 2. Väritön sauvapesäke.

33 Näyte 44/ Citrobacter werkmanii Citrobacter werkmanii n sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: +/- (keltainen) 2) Indoli - (väritön) 3) liikkuva (koko putki samea 4) sitraatti + (sininen) 5) urea - (väritön) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja keltainen (+)/ pohjassa ei kaasua (-). H 2 S-reaktio on negatiivinen (ei mustaa putkesssa).

34 Näyte 43/ Citrobacter werkmanii 1. API20E Citrobacter youngae 99,8% Oksidaasi + + -, - + -, - - -, - - +, + - +, + - -, Vitek-2 GN Pantoea sp. 88% Serratia fonticola 98%

35 Näyte 44/ Salmonella sp Salmonella sp n sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: +/+ 2) Indoli - (väritön) 3) liikkuva (koko putki samea 4) sitraatti + (sininen) 5) urea - (väritön) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja keltainen (+)/ pohjassa kaasua (+). H 2 S-reaktio on positiivinen (putken keskisosa on musta).

36 Näyte 43/ Salmonella sp. 1. API20E Salmonella sp 89,4% Oksidaasi - + +, + + +, - - -, - - +, + - +, + - +, Vitek-2 GN Salmonella sp. 98%

37 Näyte 43/2014 Citrobacter werkmanii Gramnegatiivinen sauva Salmonella sp Gramnegatiivinen sauva

38 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Anaerobinen primaariviljely Anaerobiviljely anaerobiverimaljalla (FAA) 2 vrk, 35 C. Runsas kasvu Montako erilaista pesäkettä? Metronidatsolille ei selvää estorengasta. Huom! Pieniä pesäkkeitä tobramysiinikiekon estorenkaan sisällä! Anaerobeja!?

39 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Anaerobinen primaariviljely Anaerobiviljely anaerobiverimaljalla (FAA) 3 vrk, 35 C. Uusi löydös: 3. Pieni valkoisen harmaa, tarkkarajainen pesäke kaukana metronidatsolikiekosta (estorengasta on vaikea hahmottaa) ja tobramysiinikiekon vieressä. Anaerobi?! ->Puhdasviljely, gramvärjäys ja aerotoleranssitesti!

40 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Anaerobinen primaariviljely Anaerobikasvu BBE-maljalla 4 vrk, 35 C. Ei kasvua

41 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta Anaerobinen primaariviljely Anaerobikasvu EYA-maljalla 2-6 vrk, 35 C. Värittömiä pesäkkeitä

42 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Anaerobinen primaariviljely PEA-maljalle Anaerobikasvu PEA-maljalla, 2 vrk, 35 C. Epätarkkarajaisia pesäkkeitä ->Aerotoleranssitesti ja gramvärjäys!!

43 Näyte 44/2014 Märkää sappirakosta. Anaerobinen puhdasviljely PEA-maljalta Anaerobikasvu anaerobisella verimaljalla (FAA) 2 vrk, 35 C. 3. Keskikokoinen, vaalea, tarkkarajainen, kupera pesäke, joka on metronidatsolille herkkä ts anaerobi Gramvärjäys ja aerotoleranssi!

44 Näyte 44/2014 Aerotoleranssitestit FAA-maljalta Verimalja: aerobi; suklaamalja: 5% CO 2, FAA: anaerobi 1. Vasen yläneljännes: Gramnegatiivinen sauva, joka kasvaa yhtä hyvin kaikilla maljoilla. Se on aerobi ja fakultatiivisesti anaerobi. (Citrobacter werkmanii). 2. Oikea yläneljännes: Gramnegatiivinen sauva, joka kasvaa yhtä hyvin kaikilla maljoilla. Se on aerobi ja fakultatiivisesti anaerobi. (Salmonella spp). 3. Alapuolisko: Grampositiivinen itiöllinen sauva, joka kasvaa vain anaerobisesti. Se on ehdottomasti anaerobi. (Clostridium ramosum).

45 Näyte 44/ Clostridium ramosum Pikaindoli negat Katalaasi negat Grampositiivinen itiöllinen ja haaroittuva sauva Huom! Nimensä (ramosum) mukaan voimakkaasti haaroittuva rihmamainen ( klostridi ) sauva!

46 Näyte 44/ Clostridium ramosum Anaerobien identifikaatiotesti (A I): Kanamysiini S, vankomysiini S, kolistiini R sekä metronidatsoli S sopien grampositiiviseksi Clostridium-lajiksi.

47 Näyte 44/ Clostridium ramosum 1. RapID ANA II Clostridium ramosum (99,9 %) - + -, - + +, - - +, - - -, - - -, - - -

48 Leppoisaa sydäntalvea