Bakteerivasta-ainetestin validointi Millainen käyttö odotettavissa? -Diagnoosin teko? seulontatesti vai varmistustesti? yksi näyte parinäytteet -Hoidon seuranta? sarjanäytteet
Mikä on etsityn taudin insidenssi väestössä? Sisältääkö otos normaaliväestöstä taudin jo sairastaneita henkilöitä? Voidaanko normaaliaineistosta karsia nämä jo sairastaneet pois? Millä perusteilla? Jos tauti on harvinainen, niin onko todennäköistä, että kliinikko osaisi asettaa potilaan kohdatessaan tämän diagnoosin millään muulla kriteerillä? Paljonko on alidiagnostiikkaa? Vaikuttaa testin sensitiivisyyden ja spesifisyyden laskentaan, jos vain tyypillisimmät tapaukset osataan luokitella oikein kliinisin tai patologisin perustein.
Validoinnin kulku 1. Testin hajonnan mittaaminen (CV%). Jos hajonta ei ole hallinnassa, ei lisätyöllä voida paljonkaan parantaa tuloksia. Metodi on ensin hiottava päätöksenteon kannalta riittävän pieneen hajontaan. 2. Normaaliaineiston mittaus ja valikoitu sarja oikeita potilaita. Tarkastellaan jakaumaa: Vasta-ainepitoisuudet ovat yleensä vinosti jakautuneita. Silloin tunnusluvut on parempi laskea geometrisestä keskiarvosta eli datat muunnetaan logaritmisiksi.
Keskiarvon ja keskipoikkeaman laskenta normaaleista. +2 SD raja on käyttökelpoinen seulontatestissä, jota seuraa jatkossa varmistus. +2 SD raja voi olla käyttökelpoinen myös, jos tauti ei ole leimaava ja hoito on jokseenkin vaaraton tai kliininen diagnoosi voidaan epäilyn herättyä tehdä melko hyvällä varmuudella. +3SD rajan käyttö tarpeen, jos laboratoriodiagnoosin tulee olla edes kohtuullisenkin tarkka ilman jatkotutkimuksia.
Tulosten havainnollistaminen Esimerkiksi: Lasketaan aineiston tulokset etäisyytenä normaaliaineiston keskiarvosta käyttäen mittayksikkönä keskipoikkeamaa. -Vähennetään kunkin näytetuloksen logaritmista keskiarvon logaritmi ja jaetaan tulos logaritmisen aineiston keskihajontaarvolla.
Etäisyysarvoja keskihajonta-yksikköinä on helppo käyttää arvioitaessa tuloksen jakaumaa. Jos laskenta meni oikein, saadaan sataa näytettä kohti noin 5 tulosta, jotka ovat joko yli tai alle 2.0 SD-yksikköä.
A. Frey et al. / Journal of Immunological Methods 221 (1998) 35-41
SD-yksikköjen laskenta 16-kesŠ-04 Count Count Count-apu Log-SD Log-SD SD-yksikkšero Dil IgG-TyMu Log-IgA-Ent -Blank keskiarvoon Blank 1125 3.051 14.712 0.000 Stand TyMu 1/2003 500 29246 4.466 21.534 6.822 2.780 Stand 1500 13723 4.137 19.949 5.238 1.195 Stand 4500 6673 3.824 18.440 3.728-0.314 Stand 13500 2780 3.444 16.606 1.894-2.148 Stand 40500 1759 3.245 15.648 0.936-3.106 Stand 121500 1311 3.118 15.032 0.320-3.722 NHS-pooli 500 8971 3.953 19.059 4.348 0.305 Pos-kontrol 500 9526 3.979 19.185 4.473 0.431 1 500 5158 3.712 3.712 17.900 3.189-0.854 2 500 7125 3.853 3.853 18.577 3.865-0.177 3 500 5188 3.715 3.715 17.913 3.201-0.841 4 500 6498 3.813 3.813 18.384 3.672-0.370 5 500 6273 3.797 3.797 18.310 3.599-0.444 6 500 5408 3.733 3.733 18.000 3.288-0.754 7 500 12245 4.088 4.088 19.711 4.999 0.957 8 500 6517 3.814 3.814 18.390 3.678-0.364 9 500 5581 3.747 3.747 18.065 3.354-0.689 10 500 4116 3.614 3.614 17.428 2.716-1.326 11 500 7288 3.863 3.863 18.624 3.913-0.130 12 500 7972 3.902 3.902 18.812 4.100 0.058 13 500 9097 3.959 3.959 19.089 4.377 0.335 14 500 7542 3.877 3.877 18.696 3.984-0.058 15 500 11057 4.044 4.044 19.497 4.785 0.743 16 500 6010 3.779 3.779 18.221 3.509-0.533 17 500 13775 4.139 4.139 19.957 5.246 1.203 18 500 5359 3.729 3.729 17.980 3.269-0.774 19 500 7895 3.897 3.897 18.792 4.080 0.038 Labq 357 500 37408 4.573 4.573 22.049 7.338 3.295 20 500 10751 4.031 4.031 19.438 4.727 0.684 Labq 358 500 21995 4.342 20.937 6.226 2.183 NHS-pooli 500 10083 4.004 19.304 4.592 0.550
Alkuperäistulokset Salmonellavasta-aineet TR-FIA 20.7.2004 RV 1/500 laimennetut nšytteet ENT-IgA ENT-IgM ENT-IgG tymuiga tymuigm tymuigg 1 NHS/rut 588 138 1024 288 847 597 2 03su1056 3285 328 1082 1946 03su1830 4954 1239 3 spr/nhs.m11 1208 265 350 478 881 223 4 12 483 76 624 49 302 444 5 13 854 99 989 353 848 562 6 14 1035 293 1169 305 758 346 7 15 1056 82 810 435 161 369 8 16 392 76 574 142 222 243 9 17 953 79 527 425 463 285 10 18 626 53 638 394 206 316 11 19 802 187 813 757 2230 2147 12 20 830 127 1415 298 192 306 13 21 1920 123 851 728 1157 410 14 22 1408 139 2298 490 410 1171 15 23 1190 67 640 401 398 280 16 24 1666 63 935 716 322 355 17 nhs.fm34 1113 81 831 536 218 376 18 35 1056 630 584 367 430 287 19 36 1070 85 1306 518 134 653 20 37 258 135 679 114 413 133 21 38 318 125 993 118 904 576 22 39 369 82 627 231 235 305 23 40 2029 250 1499 724 1348 734 24 41 963 315 1087 605 3571 472 25 42 728 72 678 394 1189 399 1 NHS/rut 691 131 1112 242 694 483 2 03su1056 3667 331 1091 1999 03su1830 3586 1164 3 spr/nhs.fm 43 905 166 804 223 1027 282 4 44 831 207 2283 297 1248 767 5 45 381 97 734 196 254 388 6 46 645 118 884 207 334 319 7 47 1106 1121 1299 472 1934 406 8 48 1055 384 2250 422 3793 799 9 49 924 89 1341 276 296 476 10 50 607 144 164 233 1758 253 11 nhs.m.25 1094 299 OUT 295 1413 456 12 26 940 343 4505 373 873 966 13 27 1107 76 676 477 277 325 14 28 3554 80 3474 2426 257 791 15 29 1034 149 995 456 602 597 16 30 1564 116 3137 659 369 878 17 31 1826 86 164 635 299 565 18 32 495 260 693 230 281 345 19 33 667 64 1534 227 295 542 20 34 1162 67 1449 692 697 718 21 35 1157 76 978 664 616 624 22 36 1420 80 2725 789 141 634 23 37 410 17 1745 253 124 463 24 39 537 109 1173 187 535 431 25 40 534 74 671 784 753 824
Logaritmit Log ENT-IgA ENT-IgM ENT-IgG tymuiga tymuigm tymuigg NHS/rut 2.770 2.140 3.010 2.459 2.928 2.776 03su1056 3.517 2.516 3.034 3.289 03su1830 3.695 3.093 spr/nhs.m11 3.082 2.423 2.544 2.679 2.945 2.348 12 2.684 1.879 2.795 1.690 2.481 2.647 13 2.931 1.996 2.995 2.548 2.928 2.750 14 3.015 2.468 3.068 2.484 2.879 2.539 15 3.024 1.915 2.909 2.638 2.208 2.567 16 2.593 1.883 2.759 2.152 2.347 2.386 17 2.979 1.898 2.722 2.628 2.666 2.455 18 2.796 1.727 2.805 2.595 2.315 2.500 19 2.904 2.272 2.910 2.879 3.348 3.332 20 2.919 2.102 3.151 2.474 2.284 2.486 21 3.283 2.089 2.930 2.862 3.063 2.613 22 3.149 2.144 3.361 2.690 2.613 3.069 23 3.075 1.825 2.806 2.603 2.600 2.447 24 3.222 1.801 2.971 2.855 2.508 2.550 nhs.fm34 3.047 1.911 2.919 2.729 2.338 2.575 35 3.024 2.799 2.766 2.565 2.633 2.458 36 3.029 1.928 3.116 2.714 2.127 2.815 37 2.412 2.130 2.832 2.057 2.616 2.124 38 2.503 2.095 2.997 2.072 2.956 2.760 39 2.567 1.913 2.797 2.364 2.371 2.484 40 3.307 2.399 3.176 2.860 3.130 2.866 41 2.983 2.499 3.036 2.782 3.553 2.674 42 2.862 1.859 2.831 2.595 3.075 2.601 NHS/rut 2.840 2.118 3.046 2.384 2.841 2.684 03su1056 3.564 2.520 3.038 3.301 03su1830 3.555 3.066 spr/nhs.fm 43 2.956 2.220 2.905 2.348 3.011 2.450 44 2.919 2.316 3.358 2.473 3.096 2.885 45 2.581 1.985 2.866 2.292 2.405 2.589 46 2.810 2.071 2.946 2.316 2.524 2.504 47 3.044 3.049 3.114 2.674 3.287 2.609 48 3.023 2.585 3.352 2.625 3.579 2.903 49 2.965 1.951 3.127 2.441 2.471 2.678 50 2.783 2.157 2.215 2.367 3.245 2.403 nhs.m.25 3.039 2.475 2.470 3.150 2.659 26 2.973 2.536 3.654 2.572 2.941 2.985 27 3.044 1.880 2.830 2.679 2.442 2.512 28 3.551 1.900 3.541 3.385 2.409 2.898 29 3.014 2.174 2.998 2.659 2.780 2.776 30 3.194 2.063 3.497 2.819 2.567 2.943 31 3.261 1.937 2.215 2.803 2.476 2.752 32 2.695 2.414 2.841 2.362 2.448 2.538 33 2.824 1.806 3.186 2.356 2.470 2.734 34 3.065 1.828 3.161 2.840 2.843 2.856 35 3.064 1.880 2.990 2.822 2.790 2.795 36 3.152 1.904 3.435 2.897 2.148 2.802 37 2.613 1.225 3.242 2.403 2.092 2.666 39 2.730 2.037 3.069 2.272 2.728 2.634 40 2.728 1.870 2.826 2.894 2.877 2.916
Poikkeamat normaaliaineistossa SD-etŠisyys geometrisestš keskiarvosta ENT-IgA ENT-IgM ENT-IgG tymuiga tymuigm tymuigg NHS/rut -0.67 0.20 0.49-0.28 0.61 0.66 03su1056 2.43 1.57 1.63 1.56 03su1830 4.32 1.93 spr/nhs.m11 0.63 1.23-2.11 0.45 0.66-1.05 12-1.02-0.75-0.71-2.85-0.56 0.15 13 0.01-0.32 0.41 0.01 0.61 0.56 14 0.35 1.40 0.82-0.20 0.48-0.29 15 0.39-0.62-0.07 0.31-1.28-0.17 16-1.40-0.74-0.91-1.31-0.92-0.90 17 0.20-0.68-1.12 0.28-0.08-0.62 18-0.56-1.31-0.65 0.17-1.00-0.44 19-0.11 0.68-0.07 1.12 1.72 2.89 20-0.05 0.06 1.28-0.23-1.08-0.50 21 1.47 0.02 0.05 1.06 0.97 0.01 22 0.91 0.22 2.46 0.49-0.22 1.83 23 0.60-0.95-0.64 0.20-0.25-0.66 24 1.21-1.04 0.27 1.04-0.49-0.24 nhs.fm34 0.48-0.64-0.01 0.62-0.94-0.14 35 0.39 2.61-0.87 0.07-0.16-0.61 36 0.41-0.57 1.09 0.57-1.49 0.82 37-2.15 0.16-0.50-1.63-0.21-1.95 38-1.77 0.04 0.42-1.58 0.69 0.60 39-1.51-0.63-0.69-0.60-0.85-0.51 40 1.57 1.15 1.42 1.05 1.14 1.02 41 0.22 1.51 0.64 0.79 2.25 0.25 42-0.28-0.83-0.50 0.17 1.00-0.04 NHS/rut -0.53 0.05-0.04-0.79 0.29-0.19 03su1056 2.72 1.17 1.62 1.51 03su1830 1.34 2.07 spr/nhs.fm 43-0.01 0.34-0.43-0.92 0.74-1.58 44-0.17 0.60 0.81-0.46 0.97 0.99 45-1.69-0.31-0.54-1.13-0.86-0.76 46-0.66-0.07-0.32-1.04-0.54-1.26 47 0.38 2.64 0.14 0.28 1.47-0.64 48 0.29 1.35 0.79 0.10 2.24 1.10 49 0.03-0.41 0.18-0.58-0.68-0.23 50-0.78 0.16-2.31-0.85 1.36-1.86 nhs.m.25 0.36 1.05-8.35-0.48 1.11-0.34 26 0.07 1.21 1.61-0.10 0.56 1.59 27 0.39-0.61-0.63 0.29-0.76-1.21 28 2.66-0.55 1.31 2.90-0.85 1.07 29 0.25 0.21-0.18 0.22 0.13 0.35 30 1.06-0.10 1.18 0.81-0.43 1.34 31 1.36-0.45-2.31 0.75-0.67 0.21 32-1.18 0.88-0.60-0.87-0.74-1.06 33-0.60-0.81 0.34-0.89-0.69 0.10 34 0.48-0.75 0.27 0.89 0.30 0.82 35 0.47-0.61-0.20 0.82 0.16 0.46 36 0.87-0.54 1.02 1.10-1.54 0.50 37-1.54-2.42 0.49-0.72-1.68-0.30 39-1.02-0.17 0.02-1.21 0.00-0.49 40-1.03-0.63-0.64 1.09 0.39 1.18
Numerusarvot, taso normalisoitu haluttuun +2SD ylärajalukemaan Tasokorjattu tulos ENT-IgA ENT-IgM ENT-IgG tymuiga tymuigm tymuigg NHS/rut 911 1288 2151 827 1186 1854 03su1056 5087 3059 3107 2724 03su1830 10413 3849 spr/nhs.m11 1871 2470 736 1372 1233 693 12 747 706 1311 141 423 1379 13 1322 925 2079 1014 1187 1746 14 1603 2737 2458 876 1061 1075 15 1636 767 1703 1249 226 1146 16 607 712 1206 408 311 755 17 1476 738 1107 1220 648 885 18 969 497 1341 1131 289 982 19 1242 1744 1708 2174 3122 6669 20 1285 1180 2974 856 269 951 21 2974 1146 1789 2090 1619 1274 22 2181 1300 4831 1407 574 3637 23 1842 624 1346 1151 557 870 24 2580 590 1965 2056 451 1103 nhs.fm34 1724 759 1746 1539 305 1168 35 1636 5871 1227 1054 602 892 36 1657 791 2745 1487 188 2028 37 400 1259 1426 327 578 413 38 493 1161 2087 339 1265 1789 39 572 764 1318 663 329 947 40 3143 2336 3151 2079 1887 2280 41 1491 2939 2285 1737 4999 1466 42 1128 674 1425 1131 1665 1239 NHS/rut 1090 796 712 700 904 1704 03su1056 5782 2006 0 3155 2605 0 03su1830 0 0 2297 0 0 4106 spr/nhs.fm 43 1426 1007 515 645 1338 995 44 1310 1256 1462 859 1626 2705 45 601 586 470 567 331 1369 46 1017 715 566 599 435 1125 47 1744 6794 832 1365 2521 1432 48 1664 2330 1441 1220 4944 2818 49 1457 541 859 798 385 1679 50 957 871 105 674 2292 892 nhs.m.25 1726 1811 853 1842 1608 26 1483 2082 2885 1079 1138 3407 27 1746 460 433 1379 360 1146 28 5605 482 2225 7015 334 2790 29 1630 905 637 1318 785 2106 30 2466 701 2009 1905 481 3097 31 2879 524 105 1836 390 1993 32 781 1574 444 665 366 1217 33 1052 388 982 656 385 1912 34 1832 408 928 2001 908 2533 35 1825 460 626 1920 803 2201 36 2239 486 1745 2281 183 2236 37 647 102 1118 732 161 1633 39 847 660 751 541 697 1520 40 842 449 429 2267 981 2907
Lisää normaaliaineistoa varmennukseksi ENTERITIDIS TYPHIMURIUM SPR IgA IgM IgG IgA IgM IgG N 11 722 84 1967 177 213 319 N nro 17 hylštty. IgA tasot niin matalat. N 12 505 121 2218 113 855 439 N 13 541 207 2273 168 340 302 Keskiarvo 878.5333 214.6444 1803.889 253.4444 501.1333 355.0667 N 14 509 276 2010 170 976 250 SD 384.2379 179.0474 930.2725 127.8809 351.9223 174.1536 N 15 956 343 1159 249 606 286-3SD -274.181-322.498-986.929-130.198-554.634-167.394 N 16 462 186 1029 275 842 215-2SD 110.0574-143.45-56.6562-2.31736-202.711 6.759488 N 18 1326 471 1488 197 707 255 +2SD 1647.009 572.7392 3664.434 509.2062 1204.978 703.3738 N 19 448 136 1423 93 227 208 +3SD 2031.247 751.7866 4594.706 637.0872 1556.9 877.5274 N 20 826 102 3469 285 279 688 Numerukset N 21 651 206 1057 147 1867 193 Keskiarvo N 22 1061 1088 2024 251 998 290 SD N 23 596 174 1322 225 474 199-3SD N 24 353 117 1711 54 183 244-2SD N 25 829 207 1487 173 426 241 +2SD N 26 683 128 1215 132 332 190 +3SD N 27 544 83 1398 131 225 233 N 28 1127 116 2950 342 530 357 NHS-pooli k 743 141 1768 225 332 356 N 29 1350 180 1404 392 385 219 N 30 417 424 3300 78 870 315 N 31 1183 284 1562 298 895 416 N 32 638 129 1200 140 279 204 N 33 975 306 2134 169 727 507 M 11 1125 346 1128 363 490 268 M 12 435 115 1368 128 298 336 M 13 918 118 1454 355 518 481 M 14 1264 439 2074 317 490 413 M 15 1128 109 1404 348 168 374 M 16 605 101 1310 149 270 271 M 17 1451 101 1355 347 358 267 M 18 691 62 1114 269 204 361 M 19 697 242 1160 574 1426 1074 M 20 829 155 1379 339 234 272 M 21 1217 184 1722 329 686 390 M 22 1223 210 3484 395 392 788 M 23 755 92 965 169 278 199 M 24 1129 86 1428 349 267 293 M 25 1170 355 1421 256 804 341 M 26 812 559 6133 267 622 740 M 27 907 93 1065 330 217 299 M 28 2405 76 2725 697 215 327 M 29 1016 196 1387 319 471 485 M 30 1168 157 2360 351 249 376 M 31 1073 109 1274 270 228 353 M 32 449 321 1267 142 233 332 M 33 365 65 2398 83 197 368 NHS 709 135 1771 212 309 305 777 147 1765 238 355 407 pos 1056 2625 460 528 1199 2205 452 535 1388 pos 1830 3738 830 3194 1354 3194 1354
Lisätty normaaliaineisto tasokorjattuna pooliseerumin avulla Titteri +2SD-rajaksi 4000 asetettuna ENTERITIDIS TYPHIMURIUM SPR IgA IgM IgG IgA IgM IgG N 11 1529 551 2170 1085 613 1794 N 12 1070 793 2447 693 2460 2469 N 13 1146 1357 2508 1030 978 1698 N 14 1078 1809 2218 1042 2808 1406 N 15 2025 2249 1279 1527 1744 1608 N 16 979 1219 1135 1686 2423 1209 N 18 2809 3088 1642 1208 2034 1434 N 19 949 892 1570 570 653 1170 N 20 1750 669 3828 1748 803 3869 N 21 1379 1351 1166 901 5372 1085 N 22 2247 7133 2233 1539 2871 1631 N 23 1262 1141 1459 1380 1364 1119 N 24 748 767 1888 331 527 1372 N 25 1756 1357 1641 1061 1226 1355 N 26 1447 839 1341 809 955 1068 N 27 1152 544 1542 803 647 1310 N 28 2387 760 3255 2097 1525 2008 N 29 2859 1180 1549 2404 1108 1232 N 30 883 2780 3641 478 2503 1771 N 31 2506 1862 1723 1827 2575 2339 N 32 1351 846 1324 858 803 1147 N 33 2065 2006 2355 1036 2092 2851 M 11 2383 2268 1245 2226 1410 1507 M 12 921 754 1509 785 857 1890 M 13 1944 774 1604 2177 1490 2705 M 14 2677 2878 2288 1944 1410 2323 M 15 2389 715 1549 2134 483 2103 M 16 1281 662 1445 914 777 1524 M 17 3073 662 1495 2128 1030 1501 M 18 1464 406 1229 1649 587 2030 M 19 1476 1587 1280 3520 4103 6040 M 20 1756 1016 1522 2079 673 1530 M 21 2578 1206 1900 2017 1974 2193 M 22 2590 1377 3844 2422 1128 4431 M 23 1599 603 1065 1036 800 1119 M 24 2391 564 1576 2140 768 1648 M 25 2478 2327 1568 1570 2313 1918 M 26 1720 3665 6767 1637 1790 4161 M 27 1921 610 1175 2024 624 1681 M 28 5094 498 3007 4274 619 1839 M 29 2152 1285 1530 1956 1355 2727 M 30 2474 1029 2604 2152 716 2114 M 31 2273 715 1406 1656 656 1985 M 32 951 2104 1398 871 670 1867 M 33 773 426 2646 509 567 2069 NHS 1502 885 1954 1300 889 1715 1646 964 1947 1459 1021 2289 pos 1056 5560 3016 0 3238 3450 0 4670 2963 0 3281 3993 0 pos 1830 0 0 4124 0 0 4668 0 0 3524 0 0 7614 0 0 3524 0 0 7614
Intra-assay toistettavuus Eu-salmonella intra assay 23.9.2000 näyte 1 = 03su 1843 1:4 titte ri 29481 näyte 2 = 04su 2154 37033 Ent-G näyte 1 Ent-G näyte 2 pvm tulos tulos 20.9.2000 7255 35787 7392 38696 7358 37022 7504 37743 7018 34506 7299 35177 7500 38076 7546 39979 7302 35212 7547 35722 7352 39443 Me a n 7370,27 37033,00 SD 156,49 1877,83 CV% 2,12 5,07 Mean - SD 7213,78 35155,17 Mean + SD 7526,77 38910,83 Mean - 2SD 7057,283 33277,34 Mean + 2SD 7683,262 40788,66 Mean - 3SD 6900,79 31399,51 Mean + 3SD 7839,76 42666,49 Tavoite alue
CV% ja näytteen vasta-ainepitoisuus Salmonella - FIA ag-levyjen sšilyvyys VŠliajat pšiviš Log Aritmeettinen ag kouttaus 3 3 3 7 14 keskiarvo keskihajonta CV% keskiarvo keskihajonta CV% levyn pesu 0 8 15 0 0 sarjan aloitus nšyte inc log-arvot 1 2 3 4 5 Ent-IgA nhs rut 2.926 2.939 3.157 3.046 2.839 2.982 0.123 4.121 991 292 29.47 nhs rut 2.960 3.012 3.152 2.973 2.797 2.979 0.127 4.259 985 285 28.94 pos. 1056 3.288 3.313 3.349 3.614 3.667 3.446 0.180 5.211 2998 1278 42.64 pos. 1056 3.371 3.432 3.308 3.631 3.518 3.452 0.126 3.656 2931 883 30.12 pos. 1830 pos. 1830 nhs m.32 2.401 1.991 2.507 2.500 2.274 2.335 0.214 9.158 235 94 39.93 nhs m.32 2.668 3.151 2.428 2.480 2.236 2.593 0.348 13.429 525 509 97.06 nhs fm.40 2.611 1.708 2.542 1.944 2.281 2.217 0.387 17.443 217 157 72.25 nhs fm.40 2.483 3.161 2.428 2.663 2.704 2.688 0.289 10.756 597 487 81.45 nhs fm.34 3.059 3.069 3.155 3.344 2.848 3.095 0.179 5.788 1331 554 41.61 nhs fm.35 3.170 3.282 3.200 3.216 2.881 3.150 0.156 4.941 1477 431 29.20 nhs fm.36 2.866 2.970 2.963 2.986 2.621 2.881 0.153 5.307 795 229 28.87 nhs fm.37 2.246 2.508 2.430 2.647 2.037 2.374 0.237 10.004 264 130 49.23 nhs fm.38 2.320 1.954 2.348 2.215 2.137 2.195 0.159 7.237 165 54 32.87 nhs fm.39 2.375 1.732 2.425 1.732 2.167 2.086 0.337 16.164 152 99 65.51 nhs fm.40 2.498 1.732 2.592 1.845 2.389 2.211 0.395 17.839 215 149 69.31 nhs fm.41 2.511 1.732 2.686 1.732 2.617 2.256 0.482 21.355 266 202 75.86 nhs fm.42 2.833 2.373 2.809 1.881 2.606 2.500 0.393 15.710 408 260 63.65 03su 1843 1:4 3.524 3.528 3.677 3.536 3.402 3.533 0.097 2.757 3484 800 22.97 04su 848 2.431 2.360 2.524 2.391 2.281 2.397 0.090 3.737 254 53 20.94 04su 847 3.198 3.042 3.248 2.996 3.039 3.105 0.111 3.576 1307 345 26.38 04su 849 2.829 2.822 2.906 3.057 2.775 2.878 0.111 3.853 776 218 28.08 04su 2154 3.455 3.270 3.600 3.321 3.442 3.417 0.129 3.764 2710 826 30.47 04su 2155 2.688 2.671 2.735 2.780 2.559 2.686 0.083 3.090 493 90 18.20 03su 4098 2.877 2.880 2.794 2.906 2.622 2.816 0.116 4.121 671 157 23.33 03su 4096 3.302 3.559 3.965 3.588 3.805 3.644 0.253 6.943 5019 2821 56.21
CV% riippuvuus vasta-ainekonsentraatiosta Enteritidis IgM aritmeettinen 100,00 90,00 80,00 70,00 60,00 CV% 50,00 Sarja1 40,00 30,00 20,00 10,00 0,00 0 200 400 600 800 1000 1200 Tulos
Enteritidis IgA-vasta-aineet ja konjugaatin konsentraatio
Toiminta-alue ja konjugaatin konsentraatio TYMU IgA 3X count 600000 500000 400000 300000 200000 100000 0 N 62,5 250 1000 4000 16000 64000 laim
Toiminta-alue ja konjugaatin konsentraatio 200000 150000 TYMU IgG 3X N count 100000 50000 0 62,5 250 1000 4000 16000 64000 laim
Toiminta-alue ja konjugaatin konsentraatio count 300000 250000 200000 150000 100000 50000 0 TYMU IgM 3X N 62,5 250 1000 4000 16000 64000 laim
Lineaarisuustesti 230704 ENT IgA ENT IgM ENT IgG TYPH IgA TYPH IgM TYPH IgG 1 NHS/R 384 32 1081 311 111 531 2 posko 1893 518 5952 1787 2236 1304 3 NHS40fm 491 414 2464 583 1295 1013 4 NHS32M 429 389 1379 580 256 574 5 ent1/03 1:2 >13353 > 5058 22296 > 4770 7644 4008 6 ent1/03 1:10 6912 819 9230 2117 1366 878 7 ent2/03 1:2 >13353 > 5058 37175 > 4770 2990 2280 8 ent2/03 1:10 4605 533 5560 1520 582 735 9 ty2/03 N 2571 721 1988 2814 4575 1381 10 ty2/03 1:5 777 352 1097 1119 1313 660 11 ty1/04 N 672 266 2784 2006 6308 3324 12 ty1/04!:3 337 OUT 1374 658 2255 1347 13 03su1843 250 >13353 > 5058 24373 > 4770 >12102 14880 14 03su1843 500 11863 1664 13721 > 4770 11603 8656 15 03su1843 1000 4175 879 7888 > 4770 6721 3028 16 03su1843 2000 1783 567 5283 3257 3161 1724 17 03su1843 4000 779 408 2055 1087 1650 866 18 03su1843 8000 322 291 1077 531 678 531 19 03su1843 16000 170 82 764 255 405 387 20 03su1843 32000 102 OUT 340 169 208 176 21 03su1843 64000 <55,00 OUT <165,0 74 97 <67,60 22 NHS40fm 521 394 2289 575 1156 1046 23 NHS32M 702 456 1505 516 305 706 24 posko 2071 525 5996 1797 2206 1345 25 NHS/R 400 OUT 937 342 109 1284
Lineaarisuus Enteritidis IgA 14000 12000 10000 Tulos 8000 6000 4000 2000 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2,5 log esilaimennuskerroin
Lineaarisuus Enteritidis IgM 5000 4500 4000 3500 3000 Tulos 2500 2000 1500 1000 500 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2 log esilaimennuskerroin
Lineaarisuus Enteritidis IgG 30000 25000 20000 Tulos 15000 10000 5000 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2 log esilaimennus
Lineaarisuus Typhimurium IgA 14000 12000 10000 Tulos 8000 6000 4000 2000 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2 log esilaimennus
Lineaarisuus Typhimurium IgM 16000 14000 12000 10000 Tulos 8000 6000 4000 2000 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2 log esilaimennus
Lineaarisuus Typhimurium IgG 14000 12000 10000 Tulos 8000 6000 4000 2000 0-0,5 0 0,5 1 1,5 2 2 log esilaimennus
Antigeenilla päällystettyjen levyjen säilyvyys Salmonella - FIA ag-levyjen sšilyvyys 24.9.2004 ag kouttaus 3.9.2004 3.9.2004 3.9.2004 7.9.2004 7.9.2004 levyn pesu 6.9.2004 6.9.2004 6.9.2004 14.9.2004 21.9.2004 sarjan aloitus 6.9.2004 14.9.2004 21.9.2004 14.9.2004 21.9.2004 nšyte inc O/N 2h O/N 2h O/N 1 2 3 4 5 Ent-IgA nhs rut 844 869 1437 1113 690 nhs rut 911 1029 1418 940 627 pos. 1056 1942 2057 2234 4115 4643 pos. 1056 2352 2705 2034 4271 3294 pos. 1830 pos. 1830 nhs m.32 252 98 321 316 188 nhs m.32 466 1416 268 302 172 nhs fm.40 408 51 348 88 191 nhs fm.40 304 1449 268 460 506 nhs fm.34 1145 1171 1429 2206 705 nhs fm.35 1480 1915 1585 1645 761 nhs fm.36 734 933 919 969 418 nhs fm.37 176 322 269 444 109 nhs fm.38 209 90 223 164 137 nhs fm.39 237 <55 266 <55 147 nhs fm.40 315 <55 391 70 245 nhs fm.41 324 <55 485 <55 414 nhs fm.42 681 236 644 76 404 03su 1843 1:4 3343 3369 4750 3434 2523 04su 848 270 229 334 246 191 04su 847 1576 1102 1771 991 1093 04su 849 675 663 805 1141 595 04su 2154 2850 1863 3977 2093 2765 04su 2155 487 469 543 602 362 03su 4098 753 758 622 805 419 03su 4096 2004 3620 9219 3876 6376
Logaritmin ottoon tarvitaan alle tai yli skaalan olevien tulosten koodaus Alle ja yli arvot muunnettuina 1 2 3 4 5 Ent-IgA 844 869 1437 1113 690 911 1029 1418 940 627 1942 2057 2234 4115 4643 2352 2705 2034 4271 3294 252 98 321 316 188 466 1416 268 302 172 408 51 348 88 191 304 1449 268 460 506 1145 1171 1429 2206 705 1480 1915 1585 1645 761 734 933 919 969 418 176 322 269 444 109 209 90 223 164 137 237 54 266 54 147 315 54 391 70 245 324 54 485 54 414 681 236 644 76 404 3343 3369 4750 3434 2523 270 229 334 246 191 1576 1102 1771 991 1093 675 663 805 1141 595 2850 1863 3977 2093 2765 487 469 543 602 362 753 758 622 805 419 2004 3620 9219 3876 6376
Seerumin inkubaatioaika levyllä Typhimurium IgG inkubaatioaika y = 1,1852x + 16,341 R 2 = 0,9566 12000 10000 8000 2h 6000 4000 2000 0 0 2000 4000 6000 8000 10000 O/N
Interassay toistettavuus -kesken, koska käytettävät olosuhteet vasta saatu kasaan EntIgA EntIgM EntIgG TymuIgA TymuIgM TymuIgG 03su1056 3571 328 920 1877 3666 331 1091 1999 2625 460 527 1199 2205 452 535 1388 2812 373 629 1900 1893 525 1787 2236 2071 518 1797 2206 1853 446 419 1739 20904 tuore levy O/N 2000 411 484 1393 20904 tuore levy 2h 1942 570 596 1722 60904 sšil 1 O/N 2352 576 629 1772 869 188 558 2212 140904 sšil 2 2h 1029 221 503 2214 1437 184 321 1551 210904 sšil 3 O/N 1418 188 264 1511 1113 288 666 2121 140904 sšil 4 2h 940 255 694 2337 690 305 323 1658 210904 sšil 5 O/N 627 265 294 1539 3606 800 547 2204 210904 tuore levy O/N
Viljelypositiiviset näytteet ta-aineet TR-FIA LPS-antigeenit bakt.viljely Ottoaika vrk pos viljelyn O-antigeeni H-antigeeni H-antigeeni jälkeen faasi 1 faasi 2 S. Paratyphi A 0 1,2,12 a [1.5] S. Enteritidis 1 1,9,12 g,m [1,7] S. Rissen 3 6,7,14 f,g --- S. Panama 9 1,9,12 l,v 1,5 S. Enteritidis 27 1,9,12 g,m [1,7] S. Typhi 1 (veriviljely) 9,12 d --- S. Paratyphi B 1 (veriviljely) 1,4,[5],12 b 1,2 S. Typhi 2 (veriviljely) 9,12 d --- S. Typhi 3 (veriviljely) 9,12 d --- C. jejuni 0 C. jejuni 1 C. jejuni 1 C. jejuni 1 C. jejuni 2 C. jejuni 10 C. jejuni 13 yer.va posit. yer.va posit. yer.va posit. yer.va posit. yer.va posit. yer.va posit.
Viljelypositiiviset näytteet Ent-IgA Ent IgM Ent IgG Tymu IgA Tymu IgM Tymu IgG 4002 1034 2654 3183 910 2557 3630 1079 2164 2952 950 3167 5343 2533 3131 2665 0 6645 3977 9746 13738 6410 35644 18546 10378 38502 8900 20526 23733 3955 20140 1724 3362 325 1442 1206 588 38502 28726 5262 31721 18546 2274 6952 28386 24937 3109 10597 27491 4097 11830 8725 717 1896 19892 5588 1550 9447 5873 1851 10636 38502 15454 9058 23733 2769 6964 22422 21462 7431 2331 1638 2331 1249 886 1832 643 512 1399 1381 755 605 747 564 585 3082 602 3119 2316 1638 1191 649 2329 1431 284 1934 1069 1563 1215 223 643 883 455 2203 3658 1201 1435 5690 1219 1234 636 1213 687 656 1004 1834 403 2099 1225 346 2532 1027 931 1038 658 497 871 862 647 787 785 322 936 2892 977 1662 1569 708 1736 3627 3328 5111 5291 1517 4336 1494 1590 1478 852 912 1589
Viljelypositiiviset näytteet: modifioitu Widal Widal agglutinaatio (huoneenlämpö!) O:4,5,12 O:9,12 O:6,7 H:d H:b H:i H:1,2 H:g,m H:a 2500 1280 160 1280 <160 1280 <160 1280 160 Salmonella 1280 2500 <80 2500 <160 320 <160 1280 <160 160 <80 <80 <160 <160 <160 <160 <160 <160 3200 100000 160 100000 320 1280 1280 50000 <160 1280 2500 <80 2500 <160 640 <160 2500 <160 80 640 <80 2500 <160 <160 <160 640 <160 640 160 80 1280 160 160 <160 320 <160 640 10000 <80 5000 <160 160 <160 2500 <160 320 5000 <80 5000 <160 160 <160 2500 <160 160 <80 <80 <160 640 2500 320 160 --- Campylobacter <80 80 <80 640 <160 <160 320 160 <160 320 <80 <80 <160 640 <160 320 160 --- 320 160 <80 160 <160 <160 160 2000 --- 80 80 <80 <160 <160 320 160 4000 --- 320 320 160 640 160 320 320 320 <160 <80 <80 <80 2500 <160 <160 320 <160 <160 160 <80 80 160 <160 <160 <160 <160 <160 Yersinia <80 <80 <80 <160 <160 <160 <160 1280 <160 80 <80 160 <160 <160 <160 320 <160 <160 <80 <80 <80 <160 <160 160 <160 <160 <160 80 <80 80 160 <160 <160 <160 <160 <160 160 <80 160 320 <160 <160 <160 <160 <160
Sensitiivisyyden laskenta -Tarvitaan riittävän iso aineisto viljelypositiivisia tapauksia, joista on kattava serologisen näytteen otto. Onnistuu vain prospektiivisessa tutkimusprojektissa. Veriviljelypositiivisten tapausten koonti erityisen työlästä. Sensitiivisyys siksi puuttuu eikä positiivista tai negatiivista ennustearvoakaan siksi voida laskea, saatikka ROC-käyrää.
Kliininen epidemiologia Jyrki Elo, Esa Läärä, Pertti Happonen Diagnostisen testin arviointi ja tulkinta I - sensitiivisyys ja spesifisyys
Yleispätevän mittayksikön luonti? Lähinnä toteutumista on konjugaatin kiinnittymistehon määritys rekombinanttivasta-aineilla, joissa yksi tietty vasta-aineen variaabeliosa on kiinnitetty humaanivastaaineiden eri luokkiin ja alaluokkiin. Esimerkkinä anti-nip. Tämä ei tiettävästi ole vielä kaupallisesti saatavilla. -Jos olisi kaupallinen, niin reagenssin sitoutumiselle non-amplifioivassa määrityksessä tai entsyymikineettisessä määrityksessä voitaisin saada massavastine käytetyn immunoglobuliinin määrästä.