Annika Rökman. sovellusasiantuntija, FT, sairaalegeneetikko, datanomi

Transkriptio

1 Annika Rökman sovellusasiantuntija, FT, sairaalegeneetikko, datanomi

2 Oma taustani FM genetiikka 1998 sairaalageneetikko 2004 FT Perinnöllisestä eturauhassyövästä 2004 Finaksen teknisenä arvioijana vuodesta vuoden kokemus eri kliinisistä laboratoriosta 4 eri laboratoriota (Laboratoriokeskus, Tykslab, Suomen Terveystalon Keskuslaboratorio, Medix laboratoriot) datanomi 2011 Mylabissa syyskuusta 2011 lähtien sivu 2

3 Mylab yleistä (1/2) Yhtiö perustettu vuonna 1987 Toimitusjohtaja Esa Soini Pääpaikka Tampere Toimistot Tampereella ja Helsingissä n. 80 työntekijää Laboratorioasiantuntijat: sovellusasiantuntijat konsultit Aiemmat tuotteet Multilab, Weblab Clinical ja Samba sivu 3

4 Mylab yleistä (2/2) Uusia tuotteita Carein ja Weblab: kokonaistietopalvelu, jossa integroidaan koko laboratorion toiminta käyttöönotto aloitettu Tykslabissa Loimaalla kemian/hematologian automaatio-osuudella muut osiot yhdistetään tuotteeseen asteittain sivu 4

5 Laboratorioiden tulevaisuudesta manuaalinen vs. automaatio synnynnäinen vs. somaattinen uudet tutkimukset uudet menetelmät keskittäminen vs. vieritestaus henkilökohtainen lääketiede täsmälääkkeet tulevaisuuden tarpeet: esim. koko genomin sekvensointi rajanveto tietopalvelun ja analyysiohjelmien välillä erikoisalojen raja-aitojen madaltuminen sivu 5

6 Erikoisalojen sulautuminen Patologia Mikrobiologia Kemia Integroitu laboratorio Hematologia Genetiikka Tulevaisuudessa kyse on enemmän siitä, millä menetelmällä/laitteella tutkimus tehdään, ei niinkään erikoisalasta sivu 6

7 Laboratorioprosessi Yhteiset vs. erityisvaatimukset Erityisvaatimukset Yhteiset Yhteiset Arkistointi Tutkimus -tilaus Näytteenotto Saapunut Laboratorioprosessi Tutkimus -tulos Poikkeamat Liitteet Kanta -arkisto Automatisoidut raportit Automaattivastaukset: - Tulosmuotoiset - Lausuntomuotoiset - Faksi/kirjevastaukset - Tartuntatauti-ilmoitukset - Syöpätauti-ilmoitukset - Synnynnäiset poikkeamailmoitukset Strukturoidut vastaukset/hakusanat sivu 7

8 Tietopalvelun tavoitteet yksinkertaisuus käytettävyys uusi tapa ajatella laboratorioprosessien tukeminen ja ohjaaminen laboratorion erikoisalojen yhteistyö yleiset vaatimukset vs. erityisvaatimukset yksi tietopalvelu, jossa kaikkien vaatimukset yhdistettynä palvelee mm. henkilöstön logistiikkaa tulevaisuuden tarpeisiin varautuminen Tavoitteet saavutetaan tiiviissä yhteistyössä asiakkaan kanssa! sivu 8

9 Tulevaisuuden tarpeisiin varautuminen sivu 9

10 Asiakasvaatimusten määrittäminen (genetiikka) - 6 vierailua genetiikan laboratorioissa: 1) Huslab 2) Yhtyneet Medix laboratoriot 3) Tykslab 4) Turun yliopisto 5) Islab 6) Oyslab 75% kattavuus kliinissä genetiikan laboratoriossa - tavoite: - selvittää mitä tietojärjestelmää käytetään - miten tietojärjestelmää käytetään - tulevaisuuden tarpeet sivu 10

11 Huomioon otettavia asioita tutkimusten pyytämisen ohjaaminen tuotannon ohjaus tilojen reaaliaikainen seuranta laboratorioprosessien tukeminen tiedon/näytteiden etsiminen tuloksen perusteella strukturoidut vastausmallit Biopankit Kantahanke lausuntojen muodostuksen mahdollisimman pitkälle viety automatisointi isojen tiedostojen hallinnointi ja arkistointi sivu 11

12 Esimerkki genetiikasta 1. Näytteenotto tieto näytteenotosta laboratorioon, varautuminen näytteen tuloon 2. Näyte sapuu laboratorioon saapunut kirjaus 3. Kun tietty määrä näytteitä, joista on tulossa DNA eristys, on kertynyt tietopalvelu ilmoittaa, että esim. 48 näytteen automaattinen eristys, voidaan tehdä 4. Eristyksen jälkeen mitataan tarvittaessa DNA:n pitoisuus/puhtaus Nanodropilla, mittaustulos tallentuu automaattisesti tietopalveluun. 5. Esikäsittely kuitataan valmistuneeksi, koko sarja tunnistetaan yhdellä viivakoodilla. 6. Järjestelmästä pystyy reaaliaikaisesti katsomaan kuinka monta näytettä on missäkin vaiheessa tai odottaa mitäkin tutkimusta tuotannonohjaus. 7. Jos kyse on jatkuvasti tehtävästä tutkimuksesta, tutkimus alkaa näytteestä välittömästi. Tutkimus kuitataan viivakoodilla aloitetuksi. 8. Jos kyse on harvemmin tehtävistä tutkimuksista, tietopalvelu suosittelee näytteiden kiireellisyyden, näytteiden määrän, ottopäivämäärän sekä tutkimuksen läpimenoajan mukaan mikä tutkimus kannattaa tehdä. Tutkimus kuitataan viivakoodeilla aloitetuksi. 9. Tutkimustulos muodostetaan pitkälti automaattisesti erilaisten sääntöjen perusteella tutkimustuloksesta. 10. Tutkimus kuittautuu valmiiksi, kun tulos hyväksytään. 11. Näytteiden arkistointi ja hakusanojen syöttö. Näytteitä/Tuloksia voidaan myöhemmin etsiä hakusanojen perusteella. Esim1. B-Trombot: Lausunto muodostetaan usean eri erikoisalan tutkimustulosten perusteella. Esim2. B-VarfaD: Lausunto muodostetaan automaattisesti usean eri pistemutaation tulosten perusteella. Tietopalvelu suosittelee myös varfariinilääkityksen aloitusannosta tuloksen perusteella. - Automaattiset lausunnot, joissa liitetään numeerisia tuloksia ennalta määriteltyihin kohtiin lausuntotekstissä. Lausuntojen tarkistus ennen hyväksymistä sivu 12

13 Esimerkki hematologiasta Virtaussytometriset tutkimukset - Virtaussytometriset tutkimukset koostuvat antigeenipaneeleista. Lähetteen tietojen perusteella päätetään mikä paneeli näytteestä tehdään. Valinta tehdään potilaan taudin perusteella. Tietopalvelussa on valmiina yleisimmät käytettävät vasta-ainepaneelit. a) Jäännöstautitutkimukset - Paneelin tulos koostuu mittalaitteelta saatavista analysoiduista tuloksista sekä niidne perusteella lasketuista lukuarvoista - Tulosten syöttölomake - Määritys koostuu useammasta rinnakkaisesta analyysistä ja käyttäjällä on mahdollista lisätä uusia mittauskertoja, yksittäisiä mittauskertoja pitää voida poistaa laskennasta - Lausuntoon lasketaan automaattisesti esim. mittauskertojen MRD tulosten keskiarvo ja keskihajonta - Mittalaitteelta saatava PDF raportti tallennetaan näytteelle liitetiedostoksi. b) Hematologinen markkeritutkimus - Jokaisesta paneeliin liittyvästä vasta-aineesta määritetään solumääriä, joiden perusteella tehdään tuloksen tulkinta positiiviseksi tai negatiiviseksi. - Määritys voidaan tehdä samasta näytteestä käyttäen samoja tai eri paneeleita. - Laskennat kohdistuvat aina vain kuitenkin yhteen määrityskertaan. - Tulokseen voidaan lisätä kommentti esim. kuvaamaan reaktion vahvuutta - Lausuntoa syötettäessä joko strukturoidut vastauspohjat tai hakusanojen syöttö näytteiden/tulosten haku näiden perusteella - Automaattiset lausunnot, joissa liitetään numeerisia tuloksia ennalta määriteltyihin kohtiin lausuntotekstissä lausuntojen tarkistus ennen hyväksymistä. sivu 13

14 Weblabin tiekartta Weblab 1.4 Weblab 1.5 Weblab 1.6 Weblab 1.7 Kliininen kemia ja hematologiaa Laiteliitännät Laadunvalvonta Autoverifiointi Multilabintegraatio Patologia Järjestelmä- ja saarakelaiteliitännät Automaatiolinjastojen ohjaus Näytteenotto Näytelogistiikka Näytetunnisteet Mikrobiologia Ulkoinen tietoliikenne (HL7 jne.) Tilastointi, raportointi, laskutus Ensimmäiset hoitoyksikön toiminnot Hoitoyksikön toiminnot Genetiikan toimintoja Hematologian toimintoja sivu 14

15 Kiitos! sivu 15