EURL-AR WORKHOP , Lyngby, Tanska

Samankaltaiset tiedostot
Resistenssiseuranta elintarvikeketjussa

Mikrobilääkeresistenssin seuranta Suomessa ja tilanne muuhun Eurooppaan nähden

Laajakirjoisia beetalaktamaaseja tuottavat bakteerit ja MRSA - Uudet ilmoitettavat eläintaudit

Mikrobilääkeresistenssi Pohjois-Savon sairaanhoitopiirissä 2017

Mikrobilääkeresistenssin esiintyminen sianlihan tuotantoketjussa

VERTAILULABORATORIOTOIMINTA

Campylobacter jejunin antibioottiresistenssi Suomessa

MIKROBILÄÄKERESISTENSSITILANNE 2014

Antibioottiresistenssitilanne Varsinais-Suomessa 2018

Antibioottiresistenssitilanne Varsinais-Suomessa 2017

Mikrobilääkeresistenssi Pohjois-Savon sairaanhoitopiirissä 2018

KYSRES Herkkyysmääritysstandardi: Kuopion aluelaboratorio, Kliininen mikrobiologia

gramnegatiiviset sauvat

Antibioottiresistenssitilanne Varsinais-Suomessa Kaisu Rantakokko-Jalava

Kierrospalaute: Moniresistenttien bakteerien seulonta

Mikrobilääkeresistenssi Pohjois-Savossa 2016

Kierrospalautteita: herkkyysmääritykset. Antti Nissinen, FT Keski-Suomen keskussairaala

ESBL-, AmpC- ja karbapenemaasituoton tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmillä

Antibioottiresistenssitilanne Varsinais-Suomessa 2013

Mikrobilääkeresistenssi Suomessa. Miika Bergman LL, FM, erikoistutkija Mikrobilääkeresistenssiyksikkö (TAMI)

VITEK2 -käyttökokemuksia

KYSRES Herkkyysmääritysstandardi:

Ovatko MDR-mikrobit samanlaisia?

Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla / / Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla 2016 JKauranen

ESBL-, AmpC- ja karbapenemaasituoton tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmillä

Mikrobilääkeresistenssitilastot

Ituepidemia ja VTEC -tutkimukset elintarvikkeista. Saija Hallanvuo Mikrobiologian tutkimusyksikkö

HUSRES HERKKYYSTILASTOT 2018

Moniresistenttien mikrobien nimeäminen ja lyhenteet Jari Jalava, FT

Moniresistentit mikrobit MRSA, ESBL, CPE ja VRE. Alueellinen koulutus Mikrobiologi Terhi Tuhkalainen

Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla / / Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla 2017 JKauranen

Moniresistentit mikrobit MRSA, ESBL, CPE ja VRE. Alueellinen koulutus Mikrobiologi Terhi Tuhkalainen

Antibioottiresistenssitilanne Varsinais-Suomessa 2009

ESBL-tuoton varmistaminen kiekkoherkkyysmenetelmällä

Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla / / Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla 2015 JKauranen

Bakteerien mikrobilääkeresistenssi Suomessa

Kokogenomisekvensointi (WGS)

Labquality-päivät OVATKO MONIRESISTENTIT BAKTEERIT KURISSA? Antti Hakanen Tartuntatautiseurannan ja -torjunnan osasto (TATO)

Koagulaasipositiivisten stafylokokkien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriotoiminnasta Standardisointiasiat

Maa- ja metsätalousministeriön asetus broilereiden kampylobakteerivalvonnasta

Moniresistenttibakteerit ympärillämme. Antti Väänänen Osastonylilääkäri LSHP

KYSRES Herkkyysmääritysstandardi: Kuopion aluelaboratorio, Kliininen mikrobiologia

Siirtyminen EUCASTstandardiin-mikä. Jari Kauranen erikoistuva lääkäri OYS/mikrobiologian lab.

Resistenttien bakteerien

Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla / / Antibioottiresistenssitilanne Pohjoispohjanmaalla 2012 J Kauranen

HUSRES HERKKYYSTILASTOT 2017

EURL-CAMPYLOBACTER 13TH WORKSHOP. 1. päivä. MATKAKERTOMUS Maria Aarnio Mikrobiologian tutkimusyksikkö

Vierasainevalvontaprosessi. OSA: 1 Elintarvikkeiden kasvinsuojeluainejäämävalvontaohjelma

Moniresistentit bakteerit

Suositus karbapenemaaseja tuottavien gramnegatiivisten sauvabakteerien laboratoriodiagnostiikasta ja kantajuusseulonnoista

THL:n laboratoriopohjainen seuranta ja kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat,

Kuolioinen suolistotulehdus kalkkunoilla -projektin kuulumisia. Päivikki Perko-Mäkelä Erikoistutkija, ELT Evira, Seinäjoki

ESBL-E.coli, linjaus OYS ERVA:lla. Niina Kerttula infektiolääkäri OYS

Vertailulaboratorion tietoisku. Tuula Pirhonen Tutkimus- ja laboratorio-osasto Evira

Moniresistenttien bakteereiden aiheuttamat infektiot sairaalassa

Phoenix Automated Microbiology System. Terhi Miikkulainen-Lahti HUSLAB

Mitä lainsäädäntö sanoo vasikoiden lääkitsemisestä?

VESIMIKROBIOLOGIA Ajankohtaista laboratoriorintamalla Workshop yhteenveto

Karbapenemaasin tuottajien epidemiologiaa. Jari Jalava, FT

UHKAAKO ANTIBIOOTTIEN TEHOTTOMUUS (ANTIBIOOTTIRESISTENSSI)? ANTTI NISSINEN FT, KLIINISEN MIKROBIOLOGIAN DOSENTTI

Mikrobien monilääkeresistenssi. Jari Jalava, FT

Bakteerien mikrobilääkeherkkyys Suomessa

Siipikarjan terveys- ja hyvinvointipäivä Ikaalinen Terveydenhuoltoeläinlääkäri Hannele Nauholz

Ajankohtaista referenssilaboratoriosta. Marjaana Hakkinen Evira, Elintarvike- ja rehumikrobiologian laboratoriojaosto

Ajankohtaista laboratorionäytteistä

KYSRES Kuopion aluelaboratorio, Kliininen mikrobiologia

Moniresistenttien mikrobien näytteenotto

Suositus ESBL:ää ja plasmidivälitteistä AmpC-β-laktamaasia tuottavien bakteerien diagnostiikasta

Ohje moniresistenttien bakteerien diagnostiikasta Toteaminen, resistenssimekanismit ja kantajuusseulonnat

ESBL kantajuus Suomessa kliinisen tutkimuksen satoa

Mikrobilääkejäämien toteaminen maidosta Delvotest SP-NT - testillä

Mitä mikrobilääkkeiden kulutusluvut kertovat? Antibioottipäivä Katariina Kivilahti-Mäntylä

Mikrobilääkeresistenssitilanne Suomessa ja maailmalla

Zoonoosibakteerien mikrobilääkeresistenssi Anna-Liisa Myllyniemi Evira Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö

Mikrobilääkeresistenssitilanne Pohjois-Pohjanmaalla / / Antibioottiresistenssitilanne Pohjoispohjanmaalla 2013 J Kauranen

Elatusaineiden laadunvarmistus esimerkki tulkinnasta ISOstandardimenetelmässä

Mikrobiologisten menetelmien uudistukset vuonna 2017

MRSA-kantojen seulonta rikastusten ja selektiivisen kiinteän kasvatusalustan avulla

Näytetiedonsiirto laboratorioista viranomaisjärjestelmiin. Taija Rissanen

KROMOGEENISET MALJAT, PERIAATE, TAUSTA. Pauliina Kärpänoja Laaduntarkkailupäivät 2007

VERTAILULABORATORIOTOIMINTA Evira 3484/liite 2/versio 8

Kosketusvarotoimet vai eristys onko terminologialla väliä? JA Sairaanhoitopiirin uudet ohjeet ESBL-potilaiden hoitoon

joulukuussa. SANCOssa oli tapahtunut organisaatiomuutoksia ja Kostenzer esitteli uuden kaavion.

Mittausepävarmuuden laskeminen ISO mukaisesti. Esimerkki: Campylobacter

Campylobacter jejuni/coli/lari bakteerien osoittaminen ja tunnistaminen.

Matkakertomus Henry Kuronen. EURL-Salmonella workshop XVII, , Chalkida, Kreikka

LUONNOS/ Kansallinen mikrobilääkeresistenssin torjunnan toimenpidesuunnitelma - toimenpiteet eläinten lääkinnässä ja elintarvikeketjussa

akkr MMM 21/EEO/2001 Lihantarkastus. Salmonella, toteaminen akkr ISO :2017 Eläinperäiset näytteet, ympäristöhygienianäytteet

evira-3484-liite-2-sir-tulkintarajat.xlsx kiekossa S I R AMINOGLYKOSIDIT Enterobacteriacae, Pseudomonas aeruginosa 10 mg

Valtuuskunnille toimitetaan oheisena asiakirja D043211/04.

EVO-hankkeet. Salmonella kasviksissa ( hankkeen tulokset) Listeria lihavalmisteissa ( )

Jäteveden ja purkuvesistön mikrobitutkimukset kesällä 2016

Menetelmien ja Laitteiden laadunvarmistus: Osa laboratorion jokapäiväistä toimintaa

OMAVALVONTANÄYTTEENOTTOKYSELY KALA-ALAN LAITOSTEN VALVOJILLE

Mikrobikriteeriasetusohjeiden uudistus. Riina Tolvanen, Evira

KLIINISET AUDITOINNIT JA AKKREDITOINTITOIMINTA. Tuija Sinervo FINAS-akkreditointipalvelu

Salmonellariskin hallinta tuontirehuissa toimijan näkökulmasta. Stina Hakulin,

KANNATTAAKO MONIRESISTENTTIEN MIKROBIEN SEULONTA? HYGIENIAHOITAJA JAANA-MARIJA LEHTINEN HUS MOBIILIYKSIKKÖ

Koulutus ensisaapumistoimijoille Eläinperäisten elintarvikkeiden tuonti EU:sta Kirsi Sarkkinen

Transkriptio:

EURL-AR WORKHOP 2016 Aika: Järjestäjä: 14.-15.4.15, Lyngby, Tanska DTU food (EURL-AR) EU:n antibioottiresistenssireferenssilaboratorion järjestämään vuosittaiseen workshopiin osallistui asiantuntijoita 32 maasta sekä edustajat EFSA:sta, Euroopan komissiosta, ECDC:stä, FVO:sta ja FVE:stä. Rene Hendriksen (EURL-AR) kertoi aloituspuheenvuorossaan EU-antibioottiresistenssireferenssilaboratorion (EURL-AR) viimeisimmät kuulumiset. Esitys oli pitkälti sama kuin vuoden 2015 marraskuussa EFSA:ssa pidetty esitys, jossa hän kertoi EURL:n yhteistyökumppani- ja asiantuntijaverkostotahoista sekä EURL:n tärkeimmästä tehtävästä, vertailulaboratoriotoiminnasta, johon kuuluu mm. kansallisten laboratorioiden ohjaaminen ja maavierailut, vertailututkimuskierrosten järjestäminen, kantakokoelman ylläpito sekä netin välityksellä toimiva Coursera-koulutusjärjestelmä. Javier Tellechea-Vertiz (FVO, EC) kertoi Komission viisivuotissuunnitelman (5 year Action Plan) tavoitteiden etenemisestä ja joistain saavutuksista, joita tällä saralla on tehty, kuten hallitun mlkäytön ohjeistus (20105/C299/04), animal health law, resistenssiseurannan vahvistaminen (harmonoitu seurantaohjelma 2013/652/EU, JIACRA, ESVAC-yhteistyö). Lisäksi hän kertoi lyhyesti resistenssiseurannan FVO-auditoinneista, jotka alkoivat vuonna 2015. Vuoden 2016 loppuun mennessä auditointi on tehty yhteensä 8 maassa. Auditoinneissa auditoijina on ollut myös eri maista kutsuttuja asiantuntijoita. Auditoinnin yhteenveto havaintoineen, hyvine kokemuksineen ja käytäntöineen julkaistaan vuoden 2017 alkupuolella. Jatkosuunnitelmaa (mahdollisista) seuraavista auditoinneista ei vielä ole. Pierre-Alexandre Beloeil EFSAsta kertoi vuoden 2014 EU-resistenssiraportin (EU summary report, EUSR) päätuloksista ja vuoden 2015 datan raportoinnin aikataulusta. EUSR 2014 julkaistiin aiotusta aikataulustaan hieman myöhemmin, jotta mukaan saatiin myös kolistiiniresistenssitulosten varmistukset sekä näiden tulosten analyysi. EMA on päivittämässä suosituksia kolistiinin käytöstä todettujen kolistiiniresistenssilöydösten takia. Vuoden 2015 resistenssiaineistossa esiintyvien mielenkiintoisten ja erikoisten fenotyyppien varmistuksia tullaan jälleen tekemään raportointikauden päättymisen jälkeen: EFSA ja EURL valitsevat kesäkuussa 2016 150-200 isolaattia, jotka pyydetään lähettämään Tanskaan EURL-laboratorioon feno- ja genotyyppistä varmistusta varten. EURL:n fenotyyppitulokset saatavilla syyskuussa 2016 ja WGS-tulokset marraskuussa 2016. Lisäksi Pierre-Alexandre kertoi EFSA:n järjestämistä koulutuksista koskien raportointia, web-koulutusta edelleen mahdollista saada. Vuoden 2015 datan raportointi: alkoi 1.4. päättyy 31.5. taulukot tarkistettavaksi 3.6. Feedback letter 13.6. data lukitaan 4.7. Vuoden 2015 EQAS-tuloksia esittelivät eri maiden asiantuntijat. Vuonna 2015 kaikki laboratoriot onnistuivat E. coli ja salmonellakierroksilla, kaikilla tuloksia oikein vähintään 95 %. Salmonelloista yhden kannan imipeneemi ja E. coli -kannoista yhden kannan meropeneemi aiheuttivat eniten virhetuloksia. Pääasiassa ESBL/AmpC-kannat tulkittiin oikein, eniten haasteita OXA-48:n

tunnistamisessa. Epäiltiin osin myös, että yksi E. coli OXA-48 -kanta ei olisi ollut kuljetuksen aikana pysynyt stabiilina. Enterokokkien tunnistus ei tuottanut ongelmia, mutta kolmessa tapauksessa herkkyystulosten määrittämisessä virheitä esiintyi niin merkittävästi, että tulokset jouduttiin poistamaan raportista; antibiootit olivat tigesykliini (kanta 9.3), daptomysiini (kanta 9.4) ja kinupristiini-dalfopristiini (Q/D, kanta 9.4). Tigesykliini ja daptomysiini ovat ns. uusia antibiootteja resistenssiseurannassa. Mielenkiintoista oli kuulla Latvian NRL:n kokemuksia VetMIC-paneelilla tehtyjen enterokokkikantojen liian korkeista ampisilliinituloksista, koska samainen antibiootti aiheutti AMBIssakin vuoden 2015 kierroksella ongelmia. Syyksi AMBIssa epäiltiin liian vanhoja paneeleja (kolmen vuoden käyttöikä oli juuri tulossa umpeen), joten lienee mahdollista, että ampisilliini ei säily paneeleissa niin kauan tarpeeksi stabiilina. Stafylokokeilla vääriä tuloksia esiintyi eniten Q/D:lla, klindamysiinillä, erytromysiinillä ja trimetopriimillä. Kampylobakteereilla yhden kannan tetrasykliinimääritys tuotti myös niin paljon virhetuloksia, että se jouduttiin poistamaan raportista. Tuloksista keskusteltaessa esiin nousi gram-positiivisten bakteerien tailing effect: joidenkin antibiootien (Cli, Ery, Chl, Lz, Tet) kohdalla herkkyyspaneelin luku voi olla vaikeaa, jos testibakteerin kasvu ei täysin inhiboidu missään pitoisuudessa tai kasvu heikkenee vähitellen. CLSI M07-A10 antaa ohjeita tulosten lukemiseen (s. 30-31). EQAS-kierroksiin tuli vuonna 2015 mukaan ESBL/AmpC-bakteerien eristys matriisista (naudanliha ja sian umpisuolen sisältö). Umpisuolinäytteet osoittautuivat haastavammaksi matriisiksi, myös järjestäjille, sillä kaikki ympätyt kannat eivät säilyneet näytteissä. Lisäksi yksi luonnollisesti kontaminoitunut näyte aiheutti hyvin paljon virhenegatiivia tuloksia. Kuitenkin ensimmäiseksi kierrokseksi tulokset olivat kutakuinkin hyviä: negatiivista näytteistä 97,7 % oli oikein, positiivisista näytteistä tyypillistä kasvua (joka varmistettiin E. coli -bakteeriksi) maljalla oli 82,1 % tapauksista (yhteensä kaikki näytteet huomioiden maljatuloksista oikein oli 87,9 %). Suurin osa poikkeamista osui luonnollisesti kontaminoituneen näytteen (M-1.8) kohdalle (myös AMBI). Kierroksella ei kuitenkaan arvioitu eristettyjen E. coli -kantojen herkkyystuloksia, joten em. prosentit eivät täysin vastaa onnistumista ESBL/AmpC-bakteerien eristämisessä ja tunnistamisessa (jotkin labrat olivat eristäneet E. colin, mutta herkkyystulokset olivat hyvin poikkeavat odotetusta). Herkkyystuloksissa huomattiin ongelmia eniten ertapeneemin kanssa. Tosin ertapeneemi on hyvin herkkä antamaan vääriä positiivisia. Toisaalta, ko. antibiootin tarkoitus onkin ennemmin olla seulonta-antibiootti kuin osoittaa kannan karbapenemaasituottoa. Javier Tellechea-Vertiz kertoi FVO-auditoinneista. Tärkeitä auditoinnissa seurattavia kohteita ovat: teurastamonäytteenotto: stratifikaatio, satunnaistaminen, näytteenoton ohjeistus, teuraserät ja niiden valikoituminen näytteitä tutkivat laboratoriot, menetelmien akkreditointi isolaattien valinta salmonellavalvontaohjelmasta ja Reg. 2073/2005:n mukaisen näytteenoton kantojen sisällyttäminen resistenssiseurantaan elintarvikenäytteenotto: stratifikaatio, näytteenottoon valikoidut kauppaketjut laboratorion menestyminen vertailututkimuksissa käytetyt menetelmät ja miten mahdollisesti poikkeavat standardeista tai EURL:n ohjeesta, muutosten validointi laadunvarmistusmenettelyt, mm. pipetit, laitteet, käytetyt agarit jne. raportointi: kantojen varmistus, isolation date, kuka raportoi ja kenelle, raportoijan uskottavuus ml. tekstiosioiden raportoiminen, tulosten välittäminen myös teurastamoille miten maa käyttää saatua tietoa hyväkseen

Havaittuja ongelmia: satunnaistaminen, 48 h sääntö tutkimuksen aloittamisesta, 2073/2005-näytteet, menetelmään tehtyjen muutosten validointi Annette Nygaard (Tanskan NRL) kertoi kokemuksista FVO-auditoinnista. Seuraavia asioita Tanska joutui parantamaan: laadunvarmistus ohjeista poikkeaminen (esim. ennen herkkyystestausta kannat olivat kasvaneet >24 h validointi puutteellinen) teknisten ja tutkijoiden koulutussuunnitelma vertailututkimusten poikkeamien käsittely resistenssitulosten analyysit, trendit, lähdeanalyysi Vasiliki Christodoulou (Kyproksen NRL) kertoi EURL:n tekemästä maavierailusta. Parannusehdotukset, joita EURL teki, liittyivät mm. laitteiden ja pipettien toimivuuden varmistamiseen ja laadunhallintaan, yleiseen laboratorion laadunvarmistukseen standardien mukaisesti, toimivien laboratoriotilojen käytännön asioihin (siivous, henkilökulku jne) sekä tulosten tulkintaan. BREAK-OUT GROUPS: Ensimmäisen päivän päätteeksi keskusteltiin resistenssiseurannan kokemuksista ja toimintatavoista, pohjana oli EURL:n laatima kysymyslomake: 1. FBO-näytteet salmonelloilla: yksityisten labrojen eristämät salmonellat on monissa maissa vaikea saada mukaan, ilmeistä ratkaisua ei ole 2. 48 h aikarajoitus näytteen tutkimisen aloittamisessa: ei toteudu kaikilla jäsenmailla, osa työskentelee myös lauantaisin. Viikon viimeisinä päivinä (to-pe) ei usein oteta näytteitä (joissain maissa salmonellapositiiviset erät teurastetaan viikon lopulla), vaikutusta herkkyystuloksiin ei pidetty kovin merkittävänä, mutta toki sillä saattaa joissain maissa olla merkitystä. 3. Herkkyystestaus yli 24 h viljelmistä: ilmeisesti ei yleisesti tehdä vanhemmista, Tanska oli validoinut ja käytti jopa 3 vrkn:n ikäisiä viljelmiä, mutta FVO:n mielestä validointi ei ollut riittävä. 4. Enterokokkien ja kampylobakteerien tunnistusmenetelmien harmonisointi: ei katsottu tarpeelliseksi. 5. MacConkey+CTX-maljojen validointi: EURL:n: ohjeen mukaisesti malja tulisi validoida ennen jokaisen erän käyttöönottoa. Ilmeisesti suurin osa labroista käyttää maljoja viikon ja testaa erän vain kertaalleen, epäselväksi jäi tehtiinkö testaus yleensä ennen näytteiden tutkimista vai ei. 6-7. AMR in public health sector, yhteistyö: hyvin harvalla maalla yhteisraportteja humaanipuolen kanssa. Yhteistyötä muulla tavoin enemmän. 8. Genotyyppinen varmistus: moni maa varmistaa erityisesti salmonella- ja E. coli -kantoja myös genotyyppisesti mielenkiintoisten resistenssigeenien varalta. Yhteistyötä humaanipuolen välillä. 9. Miten uusi res-seuranta on muuttanut toimintatapoja: taustadataa joudutaan keräämään paikallislabroista, ohjeistusta on tehty paikallistasolla, menetelmiin on tullut muutoksia, kansallisena vertailulabrana toimiminen vahvistunut, tiedonkeruutapoja on jouduttu kehittämään 10. Mitkä asiat toisivat lisäarvoa res-seurannalle: tuontielintarv., muut eläinlajit (kuten kalat), tilatason näytteenotto, lemmikit

Rene Hendriksen (EURL-AR) kertoi EFSA:n referenssitestauksesta (reference testing) eli varmistustesteistä, joita tehtiin erikoisten fenotyyppien varmistamiseksi. EFSA valitsee kannat. Varmistusta halutaan tehdä, jotta EUSR:ssa julkaistavat tulokset olisivat mahdollisimman luotettavia. Aina tehdään kantojen luovutussopimus jäsenmaan ja EURL:n välillä. Kantoja valitaan sekä fenotyyppistä että genotyyppistä varmistusta varten, WGS:iin valitaan lopulta noin 100 kantaa. Kantojen varmistustulokset luovutetaan myös EFSA:lle ja EC:lle. EURL ei julkaise tuloksia. Vuoden 2014 kannoista saatua genomidataa toivotaan voivan hyödyntää mm. ENGAGEprojektissa. Beatriz Guerra (EFSA) kertoi ESBL/AmpC- ja karbapenemaasia tuottavien bakteerien fenotyyppien määrittämisen kriteereistä, joita EUSR:ssa käytetään. Raportoinnissa ja kantojen jatkotutkimuksiin valitsemisessa tulee käyttää ECOFFeja. Esim. E. coli ECOFFit ovat kefotaksiimille >0,25 ja keftatsiiimille >0,5 (meropeneemi >0,12). EUSR:ssa kantojen luokittelemiseen käytetään kuitenkin EUCASTin seulontarajoja (E. coli kefotaksiimi ja keftatsidiimi >1, meropeneemi >0,12). Esimerkiksi, jos E. coli -kannan MIC-arvo kefotaksiimille on 0,5 (sekä herkkä myös kefoksitiinille ja karbapeneemeille), kanta tulkitaan muuksi fenotyypiksi. Kefepiimiä ei enää käytetä tulosten tulkinnassa lainkaan. Lina Cavaco (EURL-AR) kertoi projektista, jossa selvitettiin temosilliinin raja-arvoa. Mukana oli myös kaksi muuta laboratoriota. Temosilliinia käytetään joissain maissa ihmisten lääkinnässä. OXA-48-kannat ovat tyypillisesti tälle antibiootille R. Tällä hetkellä raportoinnissa käytetään arvoa >32. Projektissa testattiin 112 E. coli - ja 104 salmonellakantaa. E. coli ATCC 25922:n MIC-arvot osuivat välille 8 32. Yleisesti ottaen ESBL/AmpC-kannoilla MIC-arvot olivat korkeintaan 32 ja OXA-ryhmän kannoilla >32. Muilla kuin OXA-ryhmän CPE-kannoilla arvoja vaihtelivat suuresti. Tulokset tullaan luovuttamaan EUCAST:n käyttöön. Lina Cavaco ja Michel Rapallini (Alankomaat) kertoivat tigesykliiniherkkyyden testaamisen haasteista. Tigesykliinin on huomatty EQAS-vertailumittauskierroksilla antavan joskus liian korkeita MIC-arvoja, erityisesti enterokokeilla. Poikkeamien syitä selviteltiin aluksi herkkyyspaneeli- ja liemierätietoja vertailemalla (EURL, jotkin NRL:t). Näistä ei löytynyt selitystä, joten muita mahdollisia selityksiä ovat: paneelien altistuminen valolle ja ilmalle (oksidaatio), liian pitkä inkubaatioaika, liian vanhat liemet (tigesykliini herkkä, jos liemierä ei ole tarpeeksi tuoretta) ja pipetointivirheet. Michel esitti havaintojaan omasta labrasta, jossa hän havainnollisti minkälaisessa työskentelytilassa (erittäin valoisa huone, jossa suuret ikkunat) ja miten kauan avatut paneelipaketit seisovat pöydällä; heidän tulokset paranivat, kun nämä asiat otettiin huomioon. Sophie Granier (Ranskan NRL) kertoi kolistiiniresistenssistä. Kolistiinia on käytetty ihmisten lääkinnässä toistaiseksi suhteellisen vähän sen toksisuuden takia. Kuitenkin WHO luokitteli sen 2012 yhdeksi kriittisen tärkeäksi antibiootiksi ihmisten lääkinnässä. Ensimmäiset raportit hankitusta resistenssistä tehtiin vuonna 2010; tunnetut mekanismit olivat viime vuoden lopulle asti kromosomaalisissa geeneissä. Kolistiinia on käytetty Ranskassa runsaasti eläinten lääkinnässä ja viime vuoden loppupuolella, hieman ennen plasmidivälitteisestä mcr-1-geenistä tullutta kiinalaisten julkaisua, kolistiinin käytöstä käytiin keskustelua, mutta sen käyttöön ei tehty rajoituksia Ranskassa. ANSES oli jo aiemmin tehnyt WGS:a omille kannoilleen, joiden kolistiini-mic-arvot olivat selvästi kohonneet, ja todenneet, että resistenssimekanismit eivät ole kromosomaalisissa geeneissä. Kiinalaisten julkaisun jälkeen nämä kannat tutkittiin uudelleen ja osalla niistä todettiin mcr-1, tosin erilaisissa plasmideissa kuin Kiinan löydökset. Tämä viittaa, että resistenssigeeni on levittäytynyt jo laajasti ja esiintyy erilaisissa liikkuvissa elementeissä eri maissa. Sittemmin plasmidivälitteisestä kolistiiniresistenssigeenistä on tullut julkaisuja jo useita kymmeniä ja

ensimmäinen yhteenveto 3 kk kiinalaisten jutun jälkeen kokosi siihen mennessä tehdyt löydökset. EUCAST on julkaissut suositukset 22.3.2016 kolistiinin MIC-testauksesta. Daniela Ceccarelli (Alankomeiden NRL) kertoi Shewanella OXA-48 -löydöksistä. Alankomaat on tehnyt karbapenemaasia tuottavien kantojen seulontaa vuodesta 2013 erilaisissa projekteissa, mm. kaloista, tuotantoeläimistä ja vesistä. Seulonta perustuu RT-PCR-menetelmään. Useita kymmeniä näytteitä on ollut bla OXA-48-positiivisia, eniten vesinäytteet. Sekvensointi on osoittanut, että positiivisissa näytteissä on esiintynyt useita OXA-48-alatyyppejä, eniten OXA-48b. PCRpositiivisista näytteistä on yritetty eristää kantoja CARBA- ja OXA-maljojen avulla, vaikka maljat eivät ole optimoitu vesinäytteiden tutkimiseen. Noin 20 näytteestä eristettiin Shewanella spp. (tunnistus Maldi-Tofilla). OXA-48-tyypin geenit eivät sijaitse plasmideissa vaan kromosomissa. Näiden kantojen MIC-arvot karbapeneemeille olivat vain osittain R. Shewanella on osoittautunut olevan ympäristöperäinen OXA-48-geenin reservuaari, mutta niitä ei pidetä riskinä ihmisten terveydelle. Antonio Battisti (Italian NRL) kertoi moniresistenteistä (MDR) Salmonella Infantis ESBL - kannoista Italiassa. S. Infantis -serotyypin yleisyys ihmisillä Euroopassa on ollut noin 2,5 %, samoin Italiassa. Se on myös yleisin serotyyppi Euroopassa kanoilla broilerinlihassa ja kalkkunoissa. Italiassa S. Infantis on äärimmäisen resistenssi ihmisillä tällä hetkellä. Resistenssi broilereilla on Italiassa noussut vuosina 2009-2014. Esimerkiksi vuonna 2014 kefotaksiimiresistenssi tällä serotyypillä oli ihmisistä eristetyillä kannoilla 65 % ja broilereista eristetyillä 55 %. Eri lähteistä peräisin olevia kantoja vertailtiin PFGE:lla: kannat kuuluivat kahteen pääryhmään, I-ryhmään kuului 70 kaikista kannoista ja ne olivat pääasiassa MDR, II-ryhmään kuului loput noin 30 % kannoista. Kefotaksiimiresistenssi johtui yhtä kantaa lukuunottamatta CTX- M-1-ryhmän geeneistä, kannat resistenttejä myös vähintään tetrasykliinille, sulfalle, trimetopriimille, nalidiksiinihapolle ja siprofloksasiinille. Kaikilla MDR-kannoilla on IncP-megaplasmidi, kooltaan 280-320 kb. Kyseinen klooni on yleistynyt koko ketjussa ja syrjäyttänyt aiemmat kloonit. Kloonilla on useiden resistenssitekijöiden lisäksi virulenssitekijöitä ja parantunut fitness. S. Infantis - serotyyppi on yksi merkittävä uhka Euroopassa, etenkin kun kannat ovat resistenttejä myös fluorokinoleille. Ea Zankarin (EURL-AR) esitystä ei workshopissa kuultu, mm. aikataulullisista syistä, mutta materiaali jaettiin ja se tullee myöhemmin myös EURL:n nettisivuille. Päivän ja kokouksen päätteeksi Rene Hendriksen kertoi kokogenomisekvensointiin liittyvistä hankkeista ja siitä miten resistenssiseurannasta saatuja kantoja ja niiden kokogenomidataa voitaisiin jatkossa hyödyntää. ENGAGE on yksi projekteista, joka jakaa yhteisen työtilan COMPARE-projektin kanssa. Näiden tarkoitus on mm. jakaa maiden sekvenssidataa muden maiden kanssa ja vertailla kantoja eri lähteistä. Jos ei jo ole mukana projektissa, niihin voisi liittyä ns. ulkopuoliena käyttäjänä saaden oikeuden mm. yhteisiin tietokantoihin ja mahdollisuuden osallistua yhteisiin koulutuksiin (omalla rahoituksella). Vaikka kokogenomidatat ovatkin tässä yhteisesti käytössä, niiden hyödyntäminen julkaisuissa vaatii kuitenkin aina kaikkien osapuolten kirjallisen hyväksynnän. Luentomateriaalit on lähiaikoina saatavilla EURL-AR:n nettisivuilta: http://www.crl-ar.eu/146-presentations.htm