Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012 Kuvat ja teksti: Markku Koskela Mikrobiologian ylilääkäri OYS, Oulu Huom! Käyttäkää yläpalkin suurennusmahdollisuutta 100-400% pesäkekasvun yms. yksityiskohtia tarkastellessanne!
Näyte 9/2011 Välikorvaerite. 1-vuotiaalla lapsella äkillinen välikorvatulehdus Löydös: Streptococcus pneumoniae (pneumokokki), patogeeni Tehtävät: Bakteerin eristäminen, tunnistaminen ja mikrobilääkeherkkyysmääritys
Näyte 9/2012. Pneumokokki Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. ->Alfa-hemolyyttinen streptokokki
Näyte 9/2012. Pneumokokki Gram+dk Optokiinille herkkä (ts. kasvun estorengas) alfa-hemolyyttinen streptokokki eli pneumokokki. ( 1 vrk, +35 C).
Näyte 10/2012 Eritettä tk:n vuodeosaston 82-vuotiaan naispotilaan tulehtuneesta säärihaavasta. Oletettu löydös: G-ryhmän beta-hemolyyttinen streptokokki ja Pseudomonas aeruginosa, patogeeneja. Ihon normaalia floora edustamassa: Staphylococcus hominis. Tehtävät: Bakteerien eristäminen ja tunnistaminen. Tulosten tulkinta
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. Kahta erilaista pesäkettä: 1. Beta-hemolyyttinen streptokokki. 2. Matala, harmaa sauvapesäke, joka on oksidaasipositiivinen.
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 2 vrk. Kahta erilaista pesäkettä: 1. Beta-hemolyyttinen streptokokki. 2. Matala, ruskehtava, paikoin metallinhohtoinen, pistävän imelänhajuinen sauvapesäke, joka on oksidaasi posit. 3. Muuta?
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely suklaamaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. Kolme erilaista pesäkettä: 1. Harmaa, matala kokkipesäke. 2. Iso harmaa sauvapesäke, joka on oksidaasi+. 3. Valkoinen, matala, kiiltävä kokkipesäke. 4. Muuta?
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely suklaamaljalle, 5% CO 2, +35 C, 2 vrk. Kahta erilaista pesäkettä: 1. Harmaa, matala kokkipesäke. 2. Iso ruskehtava, kiiltävä, imelän hajuinen sauvapesäke, joka on oksidaasi+. Valkoinen, matala, kiiltävä kokkipesäke on jäänyt sauvakasvuston alle?!
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely streptokokkiverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. 1 vrk 2 vrk Vain beta-hemolyyttinen streptokokki kasvaa tällä maljalla. Sauvakasvu ei haittaa, mutta esim. S aureus jäisi tällä löytymättä!
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely Cled-maljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. ->Tumma yleissävy! 1 vrk 2 vrk Sauvat erottuvat hyvin. Tässä vain yhtä sauvabakteeria (pseudomonas?). Kokkikasvu erottuu pienempinä pesäkkeinä (stafylokokkeja?).
Näyte 10/2012 Sivelynäyte säärihaavasta Viljely PEA-maljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. Gram-positiiviset bakteerit kasvavat hyvin. Kahta erilaista kokkia. 1. Beta-hemolyyttinen streptokokki. Hemolyysi heikompi kuin verimaljalla! 2. Valkoinen stafylokokin näköinen kokki.
Näyte 10/2012 G-ryhmän beta-hemolyyttinen streptokokki Beta-hem.streptokokkien latex-agglutinaatiotesti G+ A- Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. Gram+ketjukokki
Näyte 10/2012 Pseudomonas aeruginosa Oksidaasi+ Viljely lampaanveri- ja suklaamaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. Metallinhohtoisia, vihertävänruskeita, imelän hajuisia ja oksidaasipositiivisia sauvapesäkkeitä ->P aeruginosa?
Näyte 10/2012. Pseudomonas aeruginosa 1 2 3 4 5 6 Pseudomonas aeruginosan sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: -/- (putken yläosassa bakteerin tuottamaa pyosyaanipigmenttiä), 2) Indoli - (väritön) 3) liikkuva (koko putki samea) 4) sitraatti + (sininen) 5) urea + (punainen) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja punainen (-)/ pohjassa ei kaasua (-) eli nonfermentatiivinen. H 2 S-reaktio on negatiivinen (ei mustaa putken keskellä).
Näyte 10/2012. Pseudomonas aeruginosa + - -, + - -, + - +, - - +, + - +, + + +, + - + API20NE 1154575 Pseudomonas aeruginosa (99,5%). Oxid Nitraatti on pelkistynyt nitraatiksi ja edelleen kaasuiksi, jolloin kaivo jää värittömäksi sinkin lisäyksenkin jälkeen. P. aeruginosa ei fermentoi glukoosia (nonfermentatiivinen) mutta käyttää sitä hapen läsnäollessa oksidatiivisesti.
Näyte 10/2012 Koagulaasinegatiivinen stafylokokki (S hominis) Stafylokokkien latexagglutinaatiotesti S hominis - S aureus + Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. Kellertävän valkoinen, kiiltävä, matala pesäke. Gram+ryhmäkokki
Näyte 11/2012 Sivelynäyte ulkomailla matkailleen opiskelijan nielurisoista. Pyydetty nielun bakteeriviljely. Löydökset: Corynebacterium ulcerans, patogeeni. Nielun normaalia flooraa: Streptococcus viridans ja Enterococcus faecalis. Tehtävät: Bakteerin eristäminen ja tunnistaminen. Tulosten tulkinta.
Näyte 11/2012 Nielunäyte Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1 vrk. 1. 2. 3. Ei beta-hemolyyttisiä streptokokkeja. Alfa-hemolyyttisten streptokokkien (1.) joukossa matalia harmaita pesäkkeitä (2.) ja mattapintaisia, korkeita vaalean harmaita pesäkkeitä (3.)
Näyte 11/2012 Nielunäyte Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 2 vrk. Kolme erilaista pesäkettä: 1. Harmaa kokkipesäke (enterokokki?) 2. Alfa-hem.streptokokki 3. Vaalea, kuivapintainen pesäke.
Näyte 11/2012 Nielunäyte Viljely suklaamaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. 1. 2. 3. Alfa-hemolyyttisten streptokokkien (1.) joukossa matalia harmaita pesäkkeitä (2.) ja kuivapintaisia, korkeita, vaalean harmaita pesäkkeitä (3.)
Näyte 11/2012 Nielunäyte Viljely streptokokkiverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. 1. 2. 3. Alfa-hemolyyttisten streptokokkien (1.) joukossa matalia harmaita pesäkkeitä (2.) ja korkeita vaalean harmaita pesäkkeitä (3.)
Näyte 11/2012 Corynebacterium ulcerans Katalaasi+ (kuohuu) Aerobi verimaljakasvu 1 vrk. Pieniä, kuivahkoja, kellertäviä, kuperia pesäkkeitä, jotka ovat katalaasipositiivisia. (Vrt. streptokokit ovat katalaasinegatiivisia!) Monimuotoinen grampositiivinen sauva
Näyte 11/2012 Corynebacterium ulcerans Katalaasi + - +, + + -, - - -, + + +, + - +, + + -, + RapID CB Plus 5307531 Corynebacterium ulcerans (100%) C.ulcerans-kanta lähetetään referenssilaboratorioon tutkittavaksi, tuottaako se toksiinia!
Näyte 11/2012 Corynebacterium ulcerans Toksiinia tuottava C. ulcerans voi aiheuttaa nielutulehduksen. C. ulcerans- tartunnan voi saada kotieläimistä, koirista, mahdollisesti ihmisestä toiseenkin. Tapaukset ovat harvinaisia, mutta mahdollisia. Kts. Tarkemmin mm tapausselostus Englannista. Eurosurveillance 15/31, 2010
Näyte 11/2012 Streptococcus viridans Aerobi verimaljakasvu, +35 C, 1vrk. Vihreä alfahemolyyttinen streptokokki, joka on optokiinille resistentti.
Näyte 11/2012 Enterococcus faecalis 1. Kasvu verimaljalla, 2. sappi-eskuliinimaljalla (BE-malja) eskuliinipositiivisena (mustana) ja 3. arabinoosimaljalla värittömänä ( ts se ei hydrolysoi arabinoosia). 1 vrk, +35 C.
Näyte 12/2012 Vatsaontelomärkänäyte. Suolistosyöpäpotilaalla vatsakalvon tulehdus. Löydökset: Citrobacter koseri (ent. C.diversus), Bacteroides ovatus ja Clostridium sporogenes, kaikki patogeeneja. Tehtävät: Bakteerin eristäminen ja tunnistaminen. Tulosten tulkinta.
Näyte 12/2012 Vatsaontelomärkänäyte. Näytteen gramvärjäys Grampositiivisa itiöllisiä sauvoja, joissa itiöt ovat terminaalisesti eli sauvan päässä. Tennismailamaisia bakteereita -> C. tetani tai jokin muu klostridi??
Näyte 12/2012 Vatsaontelomärkänäyte. Viljely lampaanverimaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. Harmaita kuperia, kiiltäviä sauvapesäkkeitä, jotka ovat oksidaasinegatiivisia.
Näyte 12/2012 Vatsaontelomärkänäyte. Viljely suklaamaljalle, 5% CO 2, +35 C, 1-2 vrk. Punertavan harmaita kuperia, kiiltäviä sauvapesäkkeitä. Muuta?
Näyte 12/2012 Citrobacter koseri Katalaasi + Harmaa, limainen sauvakasvu aerobisti verimaljalla 2 vrk:ssa Gramnegatiivinen sauva
Näyte 12/2012. Citrobacter koseri Citrobacter koserin sokerisarja: 1) Glukoosi / kaasu: +/+ 2) Indoli + (puninen) 3) liikkuva (koko putki on samea) 4) sitraatti + (sininen) 5) urea + (punainen) 6) TSI: pinta punainen (-) / pohja keltainen (+)/ pohjassa on kaasua (+) ts fermentatiivinen. H 2 S- reaktio on negatiivinen (ei mustaa putken keskellä).
Näyte 12/2012. Citrobacter koseri + + -, + + +, - - +, - - +,+ + +, + - -, + + - oxid API20E 3744713 Citrobacter koseri/amalonaticus (97 %)
Näyte 12/2012. Vatsaontelomärkänäyte. Kasvu anaerobiverimaljalla (FAA), 2 vrk, +35 C. Metronidatsolikiekon ympärillä on estorengas = anaerobeja. Aerobi sauva kasvaa kiekkoon kiinni. Todennäköiset anaerobit: 1. Valkoinen, korkea pesäke, joka voimakkaasti leviää maljalle. 2. Harmaa, tarkkarajainen, kupera pesäe.
Näyte 12/2012. Vatsaontelomärkänäyte. Kasvu anaerobiverimaljalla (FAA), 2 vrk, +35 C. Todennäköiset anaerobit: 1. Valkoinen, korkea pesäke, joka voimakkaasti leviää maljalle. 2. Harmaa, tarkkarajainen, kupera ja limainen pesäke.
Näyte 12/2012. Vatsaontelomärkänäyte. Kasvu anaerobiverimaljalla (FAA), 4 vrk, +35 C. Todennäköiset anaerobit: 1. Valkoinen, korkea pesäke, joka leviää voimakkaasti maljalla. 2. Harmaa, tarkkarajainen, kupera ja limainen pesäe.
Näyte 12/2012. Vatsaontelomärkänäyte. BBE-maljakasvu anaerobiviljelyssä (2 vrk, +35 C) BBE-maljalla kasvaa tummanrusekita BBE-positiivisia pesäkkeitä: -> Bacteroides fragilis-ryhmän anaerobi gram-negatiivinen sauva ->jatkotutkimukset: Aerotoleranssi ja gramvärjäys. (Huom! Enterokokit kasvavat myös BBE:llä tummina pesäkkeinä)
Näyte 12/2012. Vatsaontelomärkänäyte. EYA-maljakasvu anaerobiviljelyssä, 2-4 vrk, +35 C. 2 vrk 4 vrk Lipaasipositiivisia öljymäisiä pesäkkeitä
Näyte 12/2012 Aerotoleranssitesti Verimalja Suklaamalja Anaerobiverimalja (FAA) Aerotoleranssitesti: Verimalja: aerobi; suklaamalja: 5% CO 2, FAA: anaerobi. 1.Vasen yläneljännes: Tämä bakteeri kasvaa kaikilla maljoilla, koska se on aerobi mutta myös vaihtoehtoisesti (fakultatiivisesti) anaerobi. (Kanta on levinnyt tuoreella suklaamaljalla). 2.Oikea yläneljännes: Tämä bakteeri on ehdottomasti (obligatoorisesti) anaerobi, joten se ei kasva aerobisesti. 3. Alapuolisko: Tämäkin bakteeri on ehdottomasti anaerobi, joten se ei kasva aerobisti.
Näyte 12 / 2012. Aerotoleranssitestin pesäkevärjäykset 1. Citrobacter koseri Pitkä, hoikka Gram-sauva Katso 200-400% suurennosksella 2. Bacteroides ovatus Heikosti värjäytyvä Gram-sauva 3. Clostridium sporogenes Pitkä ja paksu gram+sauva, jonka päässä terminaalinen itiö.
Näyte 12/2012. Bacteroides ovatus FAA 2 vrk Anaerobien identifikaatiotesti (A I): Kanamysiini R, vankomysiini R, kolistiini R. Löydös sopii gram-negatiiviseksi Bacteroides fragilis-ryhmän anaerobiksi. Gramnegatiivinen sauva
Näyte 12/2012. Bacteroides ovatus - - +, + + +, + + +, + + +, - - -, - - + RapID ANA II 477704 Bacteroides ovatus (99,2 %)
Näyte 8 / 2009. Clostridium sporogenes Anaerobiverimalja (FAA) kasvu: Nopeakasvuinen, leviävä pesäke. Positiivinen lipaasireaktio EYA-maljalla (2) - 4 vrk:ssa : pesäkkeet ja niiden ympäristö öljymäisiä. Kts. Isommalla suurennoksella!
Näyte 8 / 2009. Clostridium sporogenes Anaerobien identifikaatiotesti (A I): Kanamysiini S, vankomysiini S, kolistiini R. Löydös sopii gram-positiiviseksi anaerobiksi, mm klostridiksi.
Näyte 12/2012. Clostridium sporogenes - - -, - + +, - - -, - - -, + - -, - + - RapID ANA II 060012 Clostridium sporogenes (100 %)
Kesähetkiä. Matarakiitäjä mesilähteillä.