Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka edellyttää perustietoja myös kliinikoilta

Samankaltaiset tiedostot
Keuhkosyövän diagnostiikka

Keuhkosyövän molekyylipatologia

Molekyyligeneettiset testit syövän hoidon suuntaajina. Laura Lahtinen Molekylibiologi, FT Patologia Keski-Suomen keskussairaala

NGS:n haasteet diagnostiikassa Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

Molekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa. Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne

Glioomien molekyylidiagnostiikkaa Maria Gardberg TYKS-Sapa Patologia / Turun Yliopisto

Keuhkosyöpien tarkentuva diagnostiikka


Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi

NGS-tutkimukset lääkärin työkaluna Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

RINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA

Muuttuva diagnostiikka avain yksilöityyn hoitoon

ylilääkäri Teijo Kuopio

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY

Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.

Tupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit eipienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa

Hyvä näytteenotto keuhkosyövän diagnostiikassa ja levinneisyyden arviossa

Teijo Kuopio NESTEBIOPSIA

IAP syyskokous 2008 Lasiseminaari

TIIMITYÖSKENTELY LYMFOOMADIAGNOSTIIKAN JA HOIDON KULMAKIVI. K Franssila & E Jantunen

Immunohistokemia HPV-muutosten ja tavallisten gynekologisten adenokarsinoomien diagnostiikassa. Elisa Lappi-Blanco OYS, patologian osasto

Tupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit ei-pienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa

Syöpäpotilaan täsmähoito on moniammatillista yhteistyötä

MITÄ PATOLOGIN LAUSUNNON IHOKASVAIMISTA PITÄISI SISÄLTÄÄ?

Molekyyligenetiikka. Arto Orpana, FT dos. apulaisylikemisti

Histopatologia ja molekyylipatologia ihomelanooman diagnostiikassa ja hoidon suunnittelussa

Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?

EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen parafiinileikkeestä FISH-menetelmän avulla adenokarsinooman diagnostiikassa

Keuhkosyövän ennuste pysyy edelleen huonona

Suoritusarvot. Sample to Insight. Myöhemmät analyysit. Puhdistetun DNA:n tuotos. Versiotiedot. QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit, Versio

Yleisimmät idiopaattiset interstitiaalipneumoniat ja tavalliset keuhkovauriot - avainasemassa moniammatillisuus

Tärkeä lääketurvatiedote terveydenhuollon ammattilaisille. RAS-villityyppistatuksen (KRAS- ja NRAS-statuksen

Verenkierron solunulkoinen DNA syövän merkkiaineena

Mitä uutta keuhkosyövän käyvässä hoidossa

Tutkimus Auria Biopankissa ja tulevaisuuden visiot Samu Kurki, FT, data-analyytikko

Kilpirauhasen kasvaimet NYKYLUOKITUS

Luutuumorit IAP Turku Tom Böhling HUSLAB/Peijas-Hyvinkää ja HY

Keuhkon ONB- ja EBUSnäytteet. Helsinki Mikko Rönty, Fimlab/Tampere

SYTOLOGIAN LABORATORION LAADUNOHJAUS JA LAADUNVARMISTUSMENETTELYT

Uroteelineoplasiat. Paula Kujala

Levinneen keuhkosyövän nykyaikainen lääkehoito mitä totunnaisten solunsalpaajien lisäksi?

Mesotelioomadiagnostiikan osuvuus ja ammattisyövän toteamisen käytännöt Suomessa. 1 Loppuraportti Sisko Anttila

Tyvisolusyöpä: mitä patologin tulee siitä lausua. Lauri Talve patologian el, LT TYKS-SAPA

Helsingin kaupunki Esityslista 9/ (5) Sosiaali- ja terveyslautakunta Sotep/

Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä

LOBULAARISET NEOPLASIAT

Syöpägeenit. prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto

Gefitinibi ei-pienisoluisen keuhkosyövän täsmähoitona?

ANTIGEENIEN PAIKANTAMINEN SOLUBLOKEISTA

Keuhkosyövän synty, epidemiologia ja seulonta

Etäpesäkkeistä emotuumorin etsintään

Keuhkosyöpä. Eeva-Maija Nieminen LT, keuhkolääkäri Keuhkosairauksien kliininen opettaja Helsingin yliopisto, HYKS Sydän ja keuhkokeskus

Kohdun sileälihaskasvaimet. Molekylaariset mekanismit ja histologiset kriteerit. Tom Böhling Haartman-instituutti, HY HUSLAB

Suomalaisen Lääkäriseuran Duodecimin, Suomen Keuhkolääkäriyhdistys ry:n ja Suomen Onkologiayhdistys ry:n asettama työryhmä.

Uusien lääkehoitojen kustannusvaikuttavuus keuhkosyövän hoidossa

EGFR-geenin Thr790Met-mutaatiotestin pystyttäminen Droplet Digital PCR -menetelmällä

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Meeri Apaja-Sarkkinen. Aineiston jatkokäyttöön tulee saada lupa oikeuksien haltijalta.

IAP Kuopio Mesenkymaalisia. kasvaimia iholla, ja vähän v n muuallakin Jyrki Parkkinen ja Tom BöhlingB

Uudet WHO-luokitukset: Virtsatiet. Marita Laurila Fimlab Laboratoriot OY

Syöpäkeskuksen tutkimusmahdollisuudet Heikki Minn

Laatunäkökulma tuberkuloosin immunodiagnostiikassa

In Situ Hybridisaatio - menetelmä patologian laboratorion työvälineenä

Syöpäsolut eroavat normaalisoluista mm. siinä,

Miten biopankkitoiminta vaikuttaa patologian osastoissa

Tuberkuloosin laboratoriotestien käytön lyhyt kertauskurssi

Keuhkosyövän molekulaarinen patologia. Sakari Knuutila HY, Haartman Instituutti

Kauanko hoitoa tulee jatkaa ALK-positiivisen NSCLC:n etenemisen jälkeen?

Histopatologian. Pirkko Hirsimäki. patologian palvelualue

ALKIODIAGNOSTIIK KA ANN-MARIE NORDSTRÖM

Rintasyövän perinnöllisyys

Rustotuumorit. IAP Turku Mikko Rönty Fimlab, Tampere

Mitä uutta DNA:sta. - koko perimän laajuiset analyysimenetelmät ja niiden sovellukset. Heidi Nousiainen, FT Erikoistuva kemisti, HUSLAB

HE4 LABQUALITY DAYS 2015 Helsinki Arto Leminen Dosentti, osastonylilääkäri Naistenklinikka

Patologia. kl Patologian professorit. Veli-Pekka Lehto Veli-Pekka Lehto Tom Böhling Ari Ristimäki Jorma Keski-Oja Leif Andersson

Viiveet keuhkosyövän diagnostiikassa ja

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

NOPEAT KUDOSPROSESSITEKNIIKAT PATOLOGIASSA

Biopankit miksi ja millä ehdoilla?

Mitä onkologi toivoo patologilta?

PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto

Ihotuumorin biopsia vai leikkaushoito

Biopankkitoiminta Suomessa. Dos. Heli Salminen

GIOTRIF (afatinibi) Monoterapiana paikallisesti edennyttä tai etäpesäkkeistä ei-pienisoluista keuhkosyöpää sairastaville aikuispotilaille

Syöpähoitojen kehitys haja- Pirkko Kellokumpu-Lehtinen Säde- ja kasvainhoidon professori, ylilääkäri, TaY/TAYS

TIEDOTE HELSINGIN JA UUDENMAAN SAIRAANHOITOPIIRI PATOLOGIAN VASTUUALUE

Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna

Uusi IAC rintanäytteiden ONB-luokitus Pia Boström LT, patologian erikoislääkäri Tyks-Sapa

Uutta lääkkeistä: Vemurafenibi

HPV-epidemiologiasta ja diagnostiikasta

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

Keuhkosyövän uudet lääkkeet

GMO analytiikka Annikki Welling Kemian tutkimusyksikkö Evira

Luuydinbiopsian valmistus ja tulkinta. Kaarle Franssila

Mitä vaikuttavuusnäytöllä tehdään? Jorma Komulainen LT, dosentti Käypä hoito suositusten päätoimittaja

keuhkosyövän uusista hoitotutkimuksista Jussi Koivunen, el dos OYS/Syöpätaudit

Neuroendokriinisten syöpien lääkehoito

Harvinaissairauksien hoito Suomessa. Heikki Lukkarinen, dosentti osastonylilääkäri Tyks Harvinaissairauksien yksikkö

Transkriptio:

KATSAUS TEEMA Elisa Lappi-Blanco, Kaisa Salmenkivi, Soili Kytölä ja Juha Kononen Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka edellyttää perustietoja myös kliinikoilta Keuhkosyöpien histologisen luokittelun ohella kasvainten molekyylibiologinen tutkiminen kuuluu keuhkosyöpien nykyaikaiseen taudinmääritykseen, ja yksilöidyt syöpähoidot perustuvat molekyyli biologiseen diagnostiikkaan. Nykyinen laboratoriotekniikka mahdollistaa monien mutaatioiden tutkimisen osana tavanomaista rutiinidiagnostiikkaa, ja tämä edellyttää hyvin toimivaa monialaista yhteistyötä. Patologin rooli näytteiden käsittelyssä on keskeinen. Tulevaisuudessa keuhkosyövän molekyylibiologisten tietojen laajaa hallitsemista tarvinnevat erityisesti patologit, keuhkolääkärit ja onkologit, mutta perustietoja tarvitsevat myös muut keuhkosyöpäpotilaiden kanssa työskentelevät lääkärit. K euhkosyöpien luokittelu ja hoito on pohjautunut tavanomaisesti morfologiaan eli histologiseen diagnoosiin, joka on edelleenkin tärkein hoitoa ohjaava tekijä. Tieto keuhkosyöpien molekyylibiologisista ominaisuuksista lisääntyy jatkuvasti, minkä vuoksi kasvainten luokittelu siirtyy kuitenkin morfologiasta niiden biologiaan, eli samankaltaisen morfologian omaavat kasvaimet voidaan nykyisin luokitella hoidollisesti tai ennusteellisesti erilaisiin alatyyppeihin niiden ilmentämien geneettisten muutosten perusteella. Geneettisillä muutoksilla tarkoitetaan kasvaimen geeneissä DNA:n yksittäisten emästen mutaatioita, kopiolukumäärän muutoksia ja geenien uudelleenjärjestymiä eli translokaatioita. Geneettiset muutokset kohdistuvat yleensä syövän kasvua edistävien onkogeenien aktivoitumiseen tai vaihtoehtoisesti syövän kasvulta suojaavien supressorigeenien vaimentumiseen. Onkogeenien aktivoitumisen vuoksi solujen toimintaa säätelevissä signaaliketjuissa tapahtuu muutoksia, joiden seurauksena syöpäsolujen lisääntyminen nopeutuu, ne kykenevät suojautumaan soluja tuhoavilta ja solujen kasvua hidastavilta mekanismeilta ja niiden kyky muodostaa uudisverisuonia ja etäpesäkkeitä lisääntyy (1). Kaikista keuhkosyöpätyypeistä on tunnistettu lukuisia geneettisiä muutoksia, ja erityisesti adenokarsinoomille ovat ominaisia yksittäiset syövän synnylle keskeiset driver- eli ajurimutaatiot (2, 3) (KUVA 1). Keuhkon adenokarsinoomille on ominaista niin sanottu onkogeeniaddiktio, eli syöpäsolujen pahanlaatuinen käyttäytyminen edellyttää syöpägeenin aktivaatiota, ja tämän vuoksi keuhkojen adenokarsinoomissa yksittäisten aktivoituvien syöpägeenien toimintaan vaikuttavilla lääkkeillä on keskeinen merkitys. Runsaasti geenimuutoksia sisältävien eli hypermutatoituneiden kasvaintyyppien hoidossa sen sijaan voidaan saada vasteita käyttämällä syöpäimmunologisia lääkkeitä (4). Levyepiteelikarsinoomat ja pienisoluiset karsinoomat liittyvät yleensä tupakointiin ja sisältävät tyypillisesti runsaasti erilaisia mutaatioita (2). Molekyylibiologisten muutosten tunnistaminen mahdollistaa signaaliketjun tietyn osan toimintaan kohdennetut yksilöidyt lääkehoidot, joista usein käytetään nimitystä täsmälääkkeet. 593 Duodecim 2016;132:593 9

Tuntematon 36,4 % NRAS 0,2 % MAP2K1 0,4 % ERBB2 1 % MET 2 % PIK3CA 3 % BRAF 3 % ALK 6 % KRAS 25 % EGFR 23 % KUVA 1. Adenokarsinoomien merkittävimpien ohjaajamutaatioiden yleisyys viitteen (3) mukaan. Niin kutsutuiden täsmälääkkeidenkin kokonaisvaikutus solujen ja elimistön toimintaan voi olla kuitenkin laajaa ja vaikeasti ennustettavissa, sillä lääkevasteet riippuvat muun muassa solunsisäisen signalointiverkoston takaisinkytkentäja muista kompensaatiomekanismeista. Keuhkosyöpänäytteen käsittely patologian laboratoriossa Keuhkosyöpää diagnosoidessaan patologi asettaa kudos- tai solunäytteen tutkimiseen perustuvan morfologisen diagnoosin ja arvioi, mitkä syöpänäytteet ohjataan molekyylipatologisiin jatkotutkimuksiin; tämä määräytyy keuhkosyövän histologisen tyypin perusteella (TAULUKKO). KUVASSA 2 on esitetty tavanomainen keuhkosyövän kudos- ja solunäytteiden diagnostinen ja molekyylipatologinen käsittely. Näytemateriaalia käytetään mahdollisimman säästeliäästi, ja immunohistokemialliset värjäykset minimoidaan. Molekyylipatologiset tutkimukset tehdään formaliinissa fiksoidusta, parafiiniin valetusta kudosnäytteestä sekä tietyin edellytyksin solunäytteistä ja erityisesti solunäytteiden parafiinin valetusta materiaalista eli solublokeista. Patologi arvioi, ovatko näytteet laadullisesti ja määrällisesti riittävän edustavia, valitsee jatkotutkimukseen parhaiten sopivan näytteen tai sen edustavan osa-alueen ja arvioi kasvainsolukon määrän. Suomessa sairaalasolubiologit tai -geneetikot tekevät molekyylipatologiset analyysit osana patologian tai genetiikan osaston toimintaa. Tutkimuksia tehdään sekä yliopistosairaaloissa että joissakin keskussairaaloissa, ja niitä voidaan tilata ostopalveluina myös ulkomailta EGFR-geenin mutaatio ja ALKgeenin translokaatio keuhkosyövän diagnostiikassa Suomessa tutkitaan nykyisin adenokarsinoomista ja muista ei-levyepiteeliperäisistä, ei-pienisoluista keuhkosyövistä somaattinen EGFR (epidermaalisen kasvutekijän reseptorin 1) geenin mutaatio ja ALK (anaplastisen lymfoomakinaasin) geenin translokaatio. Joissakin yksiköissä tutkimusta ei tehdä primaaridiagnostiikkavaiheessa potilaille, joiden kohdalla pyritään kuratiiviseen leikkaushoitoon. Sekä EGFR-mutaatio että ALK-translokaatio ovat onkogeenisia, ja niiden seurauksena solunsisäinen tyrosiinikinaasia säätelevä signaaliketju aktivoituu auttaen syövän kasvua ja leviämistä. Suomalaisessa aineistossa EGFR-mutatoituneiden adenokarsinoomien osuus on noin 10 15 % ja ALK-translokoituneiden noin 3 5 %, mikä vastaa yleistä länsimaista tasoa (2, 3)(KUVA 1). EGFR-mutaatio johtaa reseptorin solunulkoisen osan dimerisaatioon ja reseptorin jatkuvaan aktivaatioon (5). EGFR-mutaatio tunnistetaan yleensä sekvensoimalla tai käyttämällä reaaliaikaista, kvantitatiivista polymeraasiketjureaktio (PCR) menetelmää (RT-PCR), ja molempia tapoja voidaan soveltaa sekä kudosettä solunäytteisiin. Pienten näytteiden osalta voidaan käyttää myös erityisen herkkiä PCRmenetelmiä kuten kvantitatiivista, nanopisaradigitaalista PCR:ää. Rutiinikäytössä olevat menetelmät tunnistavat lähes 30 erilaista EGFRmutaatiota, joista suurin osa on prediktiivisiä eli ne ennustavat hyvää vastetta tyrosiinikinaasin estäjille (TKI). Tavallisimmat prediktiiviset EGFR-mutaatiot sijaitsevat eksoneissa 18, 19 ja 21 (5). TKI-lääkkeiden teho vaihtelee mutaatiosta riippuen. Erityisesti T790M-mutaatio E. Lappi-Blanco ym. 594

on huomionarvoinen: ensimmäisen sukupolven TKI-lääkkeille (gefitinibi, erlotinibi) tämä mutaatio on resistentti, kun taas uudemmilla TKI-lääkkeillä (afatinibi) on tehoa myös tähän mutaatioon. Yksiköissä, joissa EGFRmutaatioanalyysit tehdään omana tuotantona, tutkimukset tehdään viikoittain ja kiireellisessä tapauksessa vastaus voidaan saada kahdessa tai kolmessa työpäivässä. ALK-geenin translokaation seurauksena syntyy tyrosiinikinaasiaktivaatioon johtava fuusioproteiini, jota ei esiinny normaaleissa soluissa (6, 7). Translokaation tunnistaminen tehdään yleensä in situ hybridisaatiotutkimuksella (ISH), jolla osoitetaan ALK-geenialueen uudelleenjärjestymä ja siihen mahdollisesti liittyvä geenialueen häviäminen eli deleetio. ISH voidaan tehdä sekä fluoresenssi in situ hybridisaatiotutkimuksena (FISH) että tavanomaiseen valomikroskopiaan soveltuvana kromogeenisena in situ hybridisaatiotutkimuksena (CISH) (8). Mikäli käytettävissä on formaliinifiksoitu kudosnäyte, ALK-translokaation seulontaan voidaan käyttää fuusioproteiinin tunnistavaa immunohistokemiallista (IHK) värjäystä. Mikäli värjäys on negatiivinen, ALK-translokaatio on hyvin epätodennäköinen. Mikäli värjäys on positiivinen, löydös yleensä varmennetaan in situ hybridisaatiolla (9) (KUVA 3). Myös ALKtranslokaation vastaus voi valmistua kahdessa tai kolmessa työpäivässä. Usein näytteestä pyydetään samanaikaisesti sekä ALK-IHK että EGFR-mutaatiotesti. Jälkimmäinen usein perutaan, jos ALK-värjäys on positiivinen. On hyvin pieni mahdollisuus, että näytteessä olisi sekä EGFR-mutaatio että ALKtranslokaatio (2). Milloin näyte on riittävä? Suurin osa keuhkosyöpädiagnostiikkaan saatavista näytteistä on pieniä biopsioita tai solunäytteitä, jolloin samasta niukasta materiaalista tulee saada sekä histologinen diagnoosi että molekyylipatologinen tutkimus. Molekyylipatologisten tutkimusten toteuttamisen käytännöistä olisi hyvä sopia kussakin keskuksessa. Patologian osaston toiminta potilasnäytteiden käsittelyssä on keskeinen, ja suju- TAULUKKO. Keuhkokarsinoomien WHO 2015 luokittelu. DINPNECH = diffuusi idiopaattinen keuhkon neuroendokriinisolujen hyperplasia. Adenokarsinooma Lepidinen adenokarsinooma Asinaarinen adenokarsinooma Papillaarinen adenokarsinooma Mikropapillaarinen adenokarsinooma Solidi adenokarsinooma Invasiivinen musinoosi adenokarsinooma Kolloidinen adenokarsinooma Fetaalinen adenokarsinooma Enteerinen adenokarsinooma Minimaalisesti invasiivinen adenokarsinooma Preinvasiiviset leesiot Atyyppinen adenomatoottinen hyperplasia Adenokarsinooma in situ Levyepitelikarsinooma Keratinisoituva levyepiteelikarsinooma Ei-keratinisoituva levyepiteelikarsinoma Basaloidi levyepiteelikarsinooma Preinvasiivinen leesio Levyepiteelikarsinooma in situ Neuroendokriiniset tuumorit Pienisoluinen karsinooma Suurisoluinen neuroendokriininen karsinooma Tyypillinen karsinoidituumori Atyyppinen karsinoidituumori Preinvasiivinen leesio DIPNECH Suurisoluinen karsinooma Adenoskvamoosi karsinooma Pleomorfinen karsinooma Sukkulasoluinen karsinooma Jättisoluinen karsinooma va toiminta edellyttää hyviä lähetetietoja, hyvin toimivia hoitoketjuja, näytemateriaalin käsittelyn suunnitelmallisuutta sekä menetelmien standardointia ja jatkuvaa laadunvarmistusta. Sekä primaarikasvaimesta että etäpesäkkeistä otetut kudos- ja solunäytteet soveltuvat molekyylipatologisiin tutkimuksiin, vaikka 595 Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka

Kudos- tai solunäyte Riittämätön Uusi näyte? Riittävä PAD Tarvittaessa IHK Adenokarsinooma tai NSCLC-NOS MOPA Kudosnäyte tai solublokki, jossa on riittävästi kasvainsoluja Neuroendokriininen karsinooma tai levyepiteelikarsinooma Kudosnäyte tai solublokki, jossa kasvainsolujen määrä on riittämätön Ei jatkotutkimuksia Uusi kudos- tai solunäyte? EGFR-analyysia varten nestebiopsia? EGFR Suora sekvensointi tai RT-PCR ALK Kudosnäytteelle seulova IHK In situ hybridisaatio KUVA 2. Kaavio keuhkosyövän kudos- tai solunäytteen käsittelystä patologian laboratoriossa. Lyhenteet: PAD = patologisanatominen diagnoosi, IHK = immunohistokemia, NSCLC-NOS = tarkemmin määrittelemätön ei-pienisoluinen karsinooma, MOPA = molekyylibiologinen tai molekyylipatologinen tutkimus; RT-PCR = reaaliaikainen kvantitatiivinen PCR. optimaalisen näytteen luonteeseen liittyykin vielä avoimia kysymyksiä (10). Käytännössä sekä näytteenottopaikkaa että näytteen määrää ohjaa näytteen saatavuus; olipa kyseessä radiologinen, kirurginen tai keuhko- tai korvalääkärin suorittama näytteenotto. Tutkimustulokset kasvaimen sisäisestä ja primaarikasvaimen ja etäpesäkkeiden välisestä heterogeenisuudesta vaihtelevat, eikä toistaiseksi kumpaakaan ole voitu osoittaa toista paremmaksi näytteenottokohteeksi. Syövän geneettinen muuntuvuus on suurta. Esimerkiksi yksittäisten syöpäsolujen sekvensoinnissa on osoittautunut, että kahta geneettisesti täysin samanlaista syöpäsolua ei samankaan primaarikasvaimen sisällä ollut (11). Hoitojen aikana resistenssimutaation sisältävä, alkuvaiheessa minimaalisen pieni solupopulaatio voi saada kasvuedun ja vallitseva soluklooni voi evoluutiopaineen myötä vaihtua, minkä perusteella voidaan harkita uutta näytteenottoa esimerkiksi syövän edetessä tai hoitovasteen muuttuessa. Verenkiertoon vapautuvan syöpäsoluperäisen DNA:n analyysi eli niin kutsuttu nestebiopsia voi soveltua tautitaakan reaaliaikaiseen seurantaan ja mutaatioanalyysiin silloin, kun kudosnäytteenotto ei ole mahdollista (12). Tekninen kehitys on yllättänyt nopeudellaan Keuhkosyövän diagnostiikka on uusien hoitojen myötä muuttumassa nopeasti. Kun kasvaimesta pitää tutkia enemmän kuin kaksi geenialuetta tai mutaatiota, uuden polven sekvensointi (NGS) on ylivertainen hoidon kannalta merkittävien geenimuutosten havaitsemisessa ja tällöin myös menetelmänä edullisin (13). Menetelmällä voidaan jo diagnoosivaiheessa arvioida kasvaimen klonaalisuutta ja havai- E. Lappi-Blanco ym. 596

KUVA 3. Välikarsinan imusolmukemetastaasin tutkimus. A) Perusvärjätyssä HE-leikkeessä todetaan solidisti järjestäytyvä karsinooma, jossa on adenokarsinoomalle ominaisia sinettisormussoluja (nuolet). B) Immunohistokemiallinen TTF-1-värjäys varmistaa, että kyseessä on keuhkon adenokarsinooman metastaasi. C) Immunohistokemiallinen ALK-värjäys on vahvasti positiivinen. D) Valomikroskooppinen kromogeeninen in situ hybridisaatiotutkimus (CISH) tutkimus, jossa ALK-geenialueen uudelleenjärjestymä näkyy signaalikuvioiden erilleen siirtymisenä (nuolet). Kiitämme solubiologi, FT Timo Väisästä CISH-kuvasta. ta lääkeresistenssiä ennakoivat EGFR-geenin eksonin 20 niin sanotut resistentit mutaatiot, jotka saavat valintaedun TKI-hoidon myötä (KUVA 4). RAS (rat sarcoma) geenin mutaatioita, joita esiintyy noin neljäsosassa adenokarsinoomista, ei rutiinimaisesti tutkita muuten kuin NGS:llä. NGS-tutkimus valmistuu kahdessa viikossa, ja yhden tutkimuksen korvatessa useita perättäisiä tutkimuksia tulosten saaminen nopeutuu, ja näin potilaan hoito voidaan aloittaa mahdollisimman ajoissa oikealla, yksilöidyllä hoidolla. Lisäksi NGS säästää näytettä. Uuden polven sekvensointi tuo esiin myös EGFR-mutaatioita, joita muun muassa kvantitatiivisessa PCR:ssä käytetty kaupallinen reagenssipakkaus ei tunnista. Tutkimukset voidaan tehdä tavanomaisesta patologian laboratorioiden parafiiniin valetusta kudosmateriaalista. Laitteistojen kehittyminen, laitekustannusten halpeneminen ja bioinformaatikkojen saatavuus mahdollistavat uuden polven sekvensoinnin käytön ainakin suuremmissa genetiikan tai patologian laboratorioissa osana tavanomaista diagnostiikkaa. NGS-menetelmien yleistyessä tulee mahdolliseksi havaita harvinaisia, mutta yksittäisille potilaille merkityksellisiä syöpägeenimutaatioita, kuten keuhkosyövässä esimerkiksi BRAF- (B-Raf proto-oncogene, serine/threonine kinase) ja Her2 (human epidermal growth factor receptor 2) mutaatiot. Kattavien geenianalyysien myötä kliinikko joutuu tulevaisuudessa harkitsemaan, mitä tuloksia on valmis vastaanottamaan, millaisen tutkimusnäytön pohjalta voidaan kokeellisia hoitoja harkita, ja kuinka toimitaan tilanteissa, joissa lääkkeillä ei ole korvattavuutta. 597 Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka

p.glu746_pro753delinsvalser (60 %) p.thr790met (13 %) KUVA 4. Esimerkki EGFR-geenin tuloksesta uuden sukupolven sekvensoinnilla (NGS). Oranssilla ja sinisellä merkityt sekvenssit edustavat potilaan näytettä, ja niiden alapuolella on referenssisekvenssi, johon potilaan sekvenssejä verrataan. Valkoisella olevat emäkset puuttuvat potilaan näytteestä. Referenssisekvenssin alapuolella on esitetty aminohappojärjestys. Valtaosassa (60 %) sekvensoiduista juosteista esiintyy prediktiivinen eli suotuisaa tyrosiinikinaasivastetta ilmentävä eksonin 19 insertiodeleetio. Lisäksi todetaan alhaisemmalla frekvenssillä (13 %) eksonin 20 mutaatio, joka aiheuttaa resistenssiä ensimmäisen sukupolven tyrosiinikinaasin estäjille. Mutaatiot aminohappotasolla on esitetty sekvenssien alapuolella. Lopuksi Molekyylipatologiset tutkimukset ovat tulleet osaksi normaalia keuhkosyövän diagnostiikkaa. Potilaita hoitavilta lääkäreiltä ja erityisesti patologeilta, keuhkolääkäreiltä ja onkologeilta edellytetään yhä parempaa molekyylipatolo gian Ydinasiat Lääkärit tarvitsevat molekyylibiologista osaamista sekä diagnostiikassa että syöpäpotilaiden hoidossa. Keuhkosyöpien diagnostiikkaan kuuluu molekyylibiologisia tutkimuksia, joiden perusteella suunnitellaan yksilöityjä syöpähoitoja. Adenokarsinoomista ja muista ei-pienisoluisista, ei-levyepiteeliperäisistä keuhkosyövistä tutkitaan EGFR-geenin mutaatio ja ALK-geenialueen uudelleenjärjestymä. Nopea tekninen kehitys mahdollistaa vaativankin diagnostiikan osana rutiinimaista laboratoriotoimintaa. osaamista. Patologin tulee hallita uusien menetelmien sovellettavuus suhteessa käytettävissä olevaan näytemateriaaliin, hänen tulee voida tulkita molekyylipatologisen analyysin tulos suhteessa kasvaimen morfologiaan ja tarvittaessa tulkita tulos potilasta hoitavalle lääkärille. Onkologinen osaaminen on yhä enemmän molekyylibiologian ymmärtämistä diagnostisten tulosten tulkitsemisesta hoidon aloittamiseen ja hoitovasteen arvioimiseen. Hoitoketjujen merkitys ja monialainen yhteistyö korostuvat entisestään. ELISA LAPPI-BLANCO, LT, patologian erikoislääkäri OYS KAISA SALMENKIVI, dosentti, ylilääkäri patologian erikoislääkäri HUSLAB Patologia SOILI KYTÖLÄ, dosentti, sairaalageneetikko HUSLAB Genetiikka JUHA KONONEN, LT, syöpätauteihin erikoistuva lääkäri KSSHP/TAYS SIDONNAISUUDET Elisa Lappi-Blanco: Luentopalkkio (Eli Lilly Finland), koulutus/ kongressikuluja yrityksen tuella (Eli Lilly Finland, Pfizer) Kaisa Salmenkivi: Ei sidonnaisuuksia Soili Kytölä: Luentopalkkio (Roche, AstraZeneca) Juha Kononen: Apuraha (Roche, Amgen), asiantuntijapalkkio (GSK), luentopalkkio (GSK, Amgen, Celgene, Merck, Sanofi), patentti (NIH), lisenssitulo tai tekijänpalkkio (NIH), koulutus/kongressikuluja yrityksen tuella (Novartis, GSK, Roche, Amgen) E. Lappi-Blanco ym. 598

KIRJALLISUUTTA 1. Hanahan D, Weinberg RA. Hallmarks of cancer: the next generation. Cell 2011; 144:646 74. 2. Travis WD, Brambilla E, Burke AP, Marx A, Nicholson AG, toim. WHO classification of tumours of the lung, pleura, thymus and heart. 4. painos. Lyon: IARC, WHO 2015. 3. Cheng L, Alexander RE, MacIennan GT, ym. Molecular pathology of lung cancer: key to personalized medicine. Mod Pathol 2012;25:347 69. 4. Le DT, Uram JN, Wang H, ym. PD-1 blockade in tumors with mismatch-repair deficiency. N Engl J Med 2015;372:2509 20. 5. Jänne PA, Engelman JA, Johnson BE. Epidermal growth factor receptor mutations in non-small-cell lung cancer: implications for treatment and tumor biology. J Clin Oncol 2005;23:3227 34. 6. Soda M, Choi YL, Enomoto M, ym. Identification of the transforming EML4- ALK fusion gene in non-small-cell lung cancer. Nature 2007;448:561 6. 7. Salmenkivi K, Knuuttila A. Ei-pienisoluisen keuhkosyövän ALK-diagnostiikka. Duodecim 2014;130:701 4. 8. Schildhaus HU, Deml KF, Schmitz K, ym. Chromogenic in situ hybridization is a reliable assay for detection of ALK rearrangements in adenocarcinomas of the lung. Mod Pathol 2013;26:1468 77. 9. Thunnissen E, Bubendorf L, Dietel M, ym. EML4-ALK testing in non-small cell carcinomas of the lung: a review with recommendations. Virchows Arch 2012; 461:245 57. 10. Kim L, Tsao MS. Tumour tissue sampling for lung cancer management in the era of personalised therapy: what is good enough for molecular testing? Eur Respir J 2014;44:1011 22. 11. Wang Y, Waters J, Leung ML, ym. Clonal evolution in breast cancer revealed by single nucleus genome sequencing. Nature 2014;512:155 60. 12. Isomursu A, Kononen J, Kuopio T. Verenkierron solunulkoinen DNA syövän merkkiaineena. Duodecim 2015;131:424 32. 13. Tuononen K, Mäki-Nevala S, Sarhadi VK, ym. Comparison of targeted nextgeneration sequencing (NGS) and realtime PCR in the detection of EGFR, KRAS, and BRAF mutations on formalin-fixed, paraffin-embedded tumor material of non-small cell lung carcinoma superiority of NGS. Genes Chromosomes Cancer 2013;52:503 11. SUMMARY Molecular pathologic diagnosis of lung cancer requires basic knowledge also from clinicians Besides histological classification of lung cancers, molecular biological examination of tumors is part of modern diagnostics of lung cancers, and cancer therapies are based on molecular biological diagnosis. Current laboratory technique enables the examination of many mutations as part of standard routine diagnosis, necessitating functional multidisciplinary collaboration, with the pathologist playing a central role in the handling of the specimens. In the future, especially pathologists, pulmonary specialists and oncologists are expected to need a good command of molecular biological data on lung cancer, but basic knowledge will be required also from other physicians working with lung cancer patients. 599 Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka