Keuhkosyövän molekulaarinen patologia. Sakari Knuutila HY, Haartman Instituutti
|
|
- Kirsti Ahola
- 7 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 Keuhkosyövän molekulaarinen patologia Sakari Knuutila HY, Haartman Instituutti
2 Tänään Keuhkosyöpä: äärimmäisen komplisoituneen taudin kuvaaminen systeemibiologisella lähestymistavalla auttaa ymmärtämään, miksi pysyviä hoitotuloksia on niin vaikea saada Kaaoksen keskellä kuitenkin hoidossa hyödynnettäviä todellisia syntipukkeja: superaloittajia ja aloittajia (driver genes and super drivers) Millaisia kliinisesti hyödynnettäviä aloitusgeenejä ja niiden mutaatioita tunnetaan? EGFR- ja ALK-toimintaverkostot ja EGFR ja ALK-inhibiittorit Hoidon murentuminen: Toimintaverkoston uudelleen aktivointi: mutaatiot ja lukematon määrä muita tekijöitä Monien muutosten määrittämisen tarve edellyttää uuden teknologian hyödyntämistä erityisesti uuden polven sekvensointia. Missä ja miten mutaatiotestit tulisi tehdä Vähän omistakin tutkimustuloksista
3 Syövän systeemibiologiaa: molekyyli-, geeni-, solu- kudos-, yksilö- ja populaatiotaso (rakenne ja toiminta) ja ympäristö sekä evoluutio syövän syntyyn vaikuttavia tekijöitä jatkossa valotan vähän molekyyligeneettistä tasoa DNA DDDNA
4 Prot. Molekyylipatologian kytkentä
5 Proteiinin virheellinen toiminta Syöpä Prot.
6 Lähetti-RNA:n virheellinen toiminta Syöpä Prot. mrna
7 Säätelyn häiriö geenin luennassa Syöpä Prot. mrna EPIG Metyl./ Asetyl.
8 Geenin luennan jälkeinen säätelyn häriö Syöpä Prot. mrna EPIG Metyl./ Asetyl.
9 Geenin kopiomäärän muutos (mutaatio) Syöpä Prot. mrna EPIG Metyl./Asetyl.
10 Kromosomien uudelleen järjestyminen ja fuusiogeeni Fuusiogeeni Syöpä PROT mrna EPIG Metyl./Asetyl.
11 Emästason mutaatiot FUGE Syöpä PROT mrna EPIG Metyl./Asetyl.
12 Variaatio altistaa muutoksille FUGE Syöpä PROT mrna EPIG Metyl./Asetyl.
13 Variaatio ja sukusolumutaatiot aiheuttavat genomin instabiliteettiä FUGE Syöpä PROT mrna EPIG Metyl./Asetyl.
14 Epigeeneettiset häriöt oman lusikkkansa häriökeitokseen oravanpyörään FUGE Syöpä PROT mrna EPIG Metyl./Asetyl.
15 Tekevälle sattuu, ympäristö ja perinnöllisyys muutosten taustalla Sattuma FUGE Syöpä PROT mrna Altiste EPIG Metyl./Asetyl. Altiste
16 Populaation evoluutio synnyttänyt suojageeneja, mutta liian nopea/voimakas ympäristömuutos haitallinen Sattuma FUGE Populaatio Potilas Syöpä PROT mrna Altiste Ympäristö Kliininen kuva Patologia EPIG Metyl./Asetyl. Altiste
17 Kuvaillut tekijät mukana solun koneiston syöpään johtavissa häiriöissä Toimintaverkostojen komplisoituneisuudesta johtuen on suorastaan ihme, ettemme kaikki kuole syöpään
18
19 Solun sisäinen viestintä Vuorovaikutteista ja siis niin komplisoitunutta Miten ihmeessä yhden geenin yhdellä mutaatiolla voi olla hoidollista merkitystä? Superaloitusmutaatiot: - aktivoivat syöpägeenit (kaasuttajat) - estäjägeenit (jarrumiehet, korjaajat ja vahtikoirat) Hoidollinen merkitys toistaiseksi todettu kaasuttajilla (proteiinikinaaseilla kuten EGFR, ALK, BRAF ja RAS)
20 ligandi EGFR solukalvo RASreitti RAS P P PIP2 PI3K PIP3 PDK1/2 PTEN Ekspressio/ mutaatiot BRAF mutaatiot mutataatiot AKT1/2 mtor PI3K/AKTreitti MEK1 MEK2 p21 p27 GSK3 VEGF BAD p70s6k 4EBP1 eif4e ERK1/2 solun elinkyky angiogeneesi apoptoosi transduktio solun elinkyky proliferaatio angiogeneeesi migraatio transkriptio p53 Β-kateniini
21 Elenius K: Duodecim, 2006.
22 Elenius K: Duodecim, 2006.
23 Millaisia EGFR-mutaatioita? Kinaasialueeseen vaikuttavia
24 The distribution of activating mutations among EGFR mutation positive patients is similar in Asian and Non Asian studies Regulatory domain C-lobe ATP binding cleft N-lobe Transmembrane region Extracellular domain TK domain A-loop Chelix P-loop
25 Mihin perustuu? Kohdistettu estohoito
26 Elenius K: Duodecim, 2006.
27 EGFR-mutaatiot hoitoa ennakoivia (prediktiivisia) biomarkkereita Estohoidolla hoitotulokset merkittävästi parempia kuin kemoterapialla, jos syöpäsoluissa on aktivoiva mutaatio.
28 Tautivapaa ennuste EGFR-mutaatiopositiivisilla ja negatiivisilla EGFR-inhibiittorilla ja solusalpaajilla hoidetuilla ei-pienisoluisilla keuhkosyöpäpotilailla Tautivapaa ennuste Gefitinib EGFR M+ (n=132) Gefitinib EGFR M- (n=91) Carboplatin / paclitaxel EGFR M+ (n=129) Carboplatin / paclitaxel EGFR M- (n=85) Kuukausia Kuva muokattu: Mok et al. ESMO Abstract LBA2. Mok TS. et al. NEJM 2009;361(10):
29 Miksi hoitovastetta ei aina saada tai miksi hoitovaste hiipuu miltei kaikilla? Alavirran geenien aktivoivat mutaatiot EGFR:n resistenttimutaatiot Lukuisat muut tekijät : vrt. esitykseni johdanto: kaoottisista genomin poikkeavuuksista löytyy aina muutoksia, jotka tarjoavat solulle pakotien hoitokurimuksesta selektiopaine
30 ligandi EGFR solukalvo RASreitti RAS P P PIP2 PI3K PIP3 PDK1/2 PTEN Ekspressio/ mutaatiot BRAF mutaatiot mutataatiot AKT1/2 mtor PI3K/AKTreitti MEK1 MEK2 p21 p27 GSK3 VEGF BAD p70s6k 4EBP1 eif4e ERK1/2 solun elinkyky angiogeneesi apoptoosi transduktio solun elinkyky proliferaatio angiogeneeesi migraatio transkriptio p53 Β-kateniini
31 EGFR mutaatioiden jakautuminen geenissä Ainoastaan neljässä eksonissa: Eksonien 19 ja 21 mutaatiot kattavat noin 90 % kaikista mutaatioista EGFR Geeni Tyrosiinikinaasiaalue Eksonit Eksoni 18 Sensitiivinen Eksoni 19 Sensitiivinen Eksoni20 Resistentti Eksoni 21 Sensitiivinen G719C G719S G719A 5% Del E746-A750 Del E746_S752>V Del E746_T751>A Del E746_T751 Del L747_A750>P Del L747_E749 Del L747_P753>Q Del L747_P753>S Del L747_S752 Del L747_T751>P Del L747_T751 Del S752_I759 & muut deleetiot T790M D770_N771 (ins NPG) D770_N771 (ins SVQ) D770_N771 (insg) S768I ~5% L858R L861Q ~45% ~45%
32 Figure 4. Overall (A) and progression-free (B) survival curves in lung adenocarcinoma patients according to the mutational status of KRAS assessed by DS. Curve differences are statistically significant. All P values refer to log-rank tests. Months indicate months from the beginning of treatment. Neoplasia (2009) 11,
33 Neoplasia (2009) 11, Kuva muokattu: Mok et al. ESMO Abstract LBA2. Mok TS. et al. NEJM 2009;361(10):
34 Figure 5. Overall (A) and progression-free (B) survival curves in lung adenocarcinoma patients according to the mutational status of EGFR. Curve differences are statistically significant. All P values refer to log-rank tests. Months indicate months from the beginning of treatment. Neoplasia (2009) 11,
35 EML4-ALK -fuusio keuhkosyövässä Ei-pienisoluinen (2,3 %) Inversio kromosomin 2 lyhyessä haarassa Onkogeeninen TKfuusiokinaasi Oma tautikokonaisuus? Herkkä ALK-estäjille
36 ALK-fuusiosignalointi
37 Keuhkosyöpien aloitusmutaatioita ja estäjiä Geeni/muutos Histologia Yleisyys % Proteiini Estäjä käytössä Hoitokokeiluja meneillään Prekliinisiä tutkimuksia AKT1-mutaatiot AC < 1 Seriini-TK - Pan-AKT-estäjät ALK uudelleen AC 2,3 RTK Crizotinib, ceritinib Alectinib, PF , TSR-011, ALK estäjät järjestymät AP26113, ASP3026, X-396, Hsp90- estäjät BRAF-mutaatiot AC 1 Seriini-TK Vemurafenib, dafrafenib, MEKestäjät, dasatinib RAF-estäjät EGFR-mutaatiot AC 11,4 RTK Gefitinib, erlotinib, afatinib, icotinib CO1686, AZD9291, cetuximab + afatinib, Hsp90-estäjät Mutaatio-spesifiset EGFR-estäjät HER2 (ERBB2)- mutaatiot AC 2 RTK ERBB/HER2-estäjät, mtor/p13kestäjät HER2-estäjät, Hsp90- estäjät KRAS-mutaatiot AC 25 GTPase Sytotoksinen kemoterapia + MEKestäjät, P13K-estäjät, FAK-estäjät KRAS G12C-estäjät, KRAS-estäjät, MEK- ja P13K-estäjät, JAK/TBK1/1KK-estäjät MEK1 (MAPK2K1)- AC < 1 Seriini-TK - MEK-estäjät mutaatiot MET monistumat AC 1 RTK Crizotinib, tivantinib, onartuzumab, MET-estäjät muut MET-estäjät NRAS-mutaatiot AC 1 GTPase - MEK-estäjät NTRK1 uudelleen AC < 1 RTK Crizotinib TRKA-estäjät järjestymät RET uudelleen järjestymät AC 1 RTK Cabozantinib, vandetanib, sunitinib, ponatinib RET-estäjät, Hsp90- estäjät ROS1 uudelleen järjestymät AC 2 RTK Crizotinib, ceritinib, PF ROS-estäjät, Hsp90- estäjät DDR2-mutaatiot SCC 4 RTK Dasatinib DDR2-estäjät FGFR1 monistumat SCC 20 RTK FGFR-estäjät FGFR-estäjät FGFR2/3/4-mutaatiot SCC 7 RTK FGFR-estäjät FGFR-estäjät ja uudelleen järjestymät PIK3CA-mutaatiot SCC 7 (SCC) 1 (AC) Lipidikinaasi P13K-estäjät P13K-estäjät, mtorestäjät PTEN-mutaatiot SCC 6 (NSCLC) Lipidi/proteiini fosfataasi - P13K-estäjät
38
39 Mutaatiotestin suorittaminen Mitä halutaan selvittää? EGFR, ALK, KRAS, NRAS?, BRAF?, muita aloitusmutaatiota? Mitkä potilaat? Adenokarsinoomapotilaat, kaikki NSCLC:t vai kaikki keuhkosyövät? Miten? Yksi kerrallaan sarjassa perinteisillä menetelmillä KRAS (PCR) neg. EGFR (PCR) neg. - ALK (IHC) EGFR (PCR) neg. ALK (IHC) ALK (IHC) neg. EGFR (PCR) HUSin käytäntö ALK (IHC) pos. ALK (FISH) HUSin käytäntö Kaikki aloitusmutaatiot kohdistetulla NGS:llä
40 NGS:n edut Voidaan kohdistaa kaikkiin kliinisesti merkityksellisiin mutaatioihin; voidaan siis poimia vain etukäteen määritellyt hoitoon liittyvät mutaatiot kliiniseen käyttöön (minkäänlaiseksi ongelmaksi ei siis muodostu se, että menetelmä tuottaa valtavan määrän muuta tietoa) Luotettava Pienestä lähtömateriaalista: ng FFPE, ohutneulabiopsiat, seerumi, uloste (CRC), yskös?, hengitysilma?? Herkkä: < 1% Nopea: 2 vrk Halpa: < 200 euroa/analyysi Tuottaa samasta materiaalista tutkimuskäyttöön uutta tietoa, joka voi hyödyntää hetken päästä tutkittavaa potilasta, koska hoidollisesti uutta tietoa syntyy kiihtyvällä vauhdilla
41 Comparison of Targeted Next-Generation Sequencing (NGS) and Real-Time PCR in the Detection of EGFR, KRAS and BRAF Mutations on Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tumor Material of Non-Small Cell Lung Carcinoma Supreriority of NGS Tuononen, K., Maki-Nevala, S,. Sarhadi, V.K., Wirtanen, A., Rönty, M. J., Salmenkivi, K., Andrews, J.M., Telaranta-Keerie, A. I., Hannula, S., Lagstrom, s., Ellonen, P., Knuuttila, A. & Knuutila, S. Genes Chromosomes & Cancer. 52, 5:
42 Table 1. Comparison of EGFR, KRAS and BRAF mutation detection by targeted nextgeneration sequencing (NGS) and real-time PCR (RT-PCR) in non-small cell lung carcinoma (NSCLC) Gene No of cases compared Concordant Discordant Percentage of concordance (NGS/RT-PCR) (NGS/RT-PCR) (%) / +/+ /+ +/ EGFR s KRAS ss BRAF s No mutation detected by Sanger sequencing in 2 out of the 3 cases. Third case was not analyzed by Sanger sequencing ss No mutation detected by Sanger sequencing
43 Table 3. All non-synonymous SNVs and indels in EGFR gene (not in the panel of the PCR kit used) detected by targeted next-generation sequencing in non-small cell lung carcinoma (NSCLC) Gene Cases Protein change Exon Protein domain Variant previously described EGFR 1 NSCLC Leu62Arg 2 extracellular (receptor L domain) glioblastoma (Cancer Genome Atlas Research Network, 2008) EGFR 2 NSCLC Tyr275Phe 7 extracellular (furin-like Cys rich not previously described domain) EGFR 1 NSCLC Ala647Thr s 17 transmembrane not previously described EGFR 1 NSCLC Ala767_Ser768 ins SerValGly 20 protein kinase not previously described Our patient was resistant to erlonitinib EGFR 1 NSCLC His773Leu* 20 protein kinase lung carcinoma (Yang et al., 2005; Penzel et al., 2011) EGFR 3 NSCLC His773Pro 20 protein kinase not previously described EGFR 1 NSCLC Val774Met* 20 protein kinase lung carcinoma (Yang et al., 2005; Yokoyama et al., 2006; Zhang et al., 2006; Penzel et al., 2011) EGFR 1 NSCLC Pro848Leu ss 21 protein kinase lung carcinoma (Sequist et al., 2007; Beau-Faller et al., 2011; Chang et al., 2011; Han et al., 2011; Penzel et al., 2011; Zheng et al., 2011), salivary gland carcinoma (Clauditz et al., 2012), upper aerodigestive tract (Na et al., 2007; Szymanska et al., 2010) *2 different mutations present together on same haplotype at codons 773 and 774 in the same patient s Variant detected by Sanger sequencing in tumor and corresponding normal tissue ss Mutation validated by Sanger sequencing in tumor tissue
44 EGFR mutation: Leu858Arg in FFPE LAC sample
45 Mutaatio EGFR-eksonissa 21 ( Leu858Arg); keuhkojen adenokarsinooma; FFPE näyte; potilas hyötyi EGFR-estohoidosta
46 FFPE: KRAS GLY(12)ALA mutation in LAC
47 FFPE: BRAF mut V600E in CRC
48 Mutated Ephrin Receptor Genes in Non-Small Cell Lung Carcinoma and Their Occurrence with Driver Mutations Targeted Resequencing Study on Formalin-Fixed, Paraffin-Embedded Tumor Material of 81 Patients Satu Mäki-Nevala 1, Virinder Kaur Sarhadi 1, Katja Tuononen 1, Sonja Lagström 2, Pekka Ellonen 2, Mikko Rönty 3, Aino Wirtanen 1, Aija Knuuttila 4, Sakari Knuutila 1,3 Genes Chromosomes & Cancer (2013) 52:
49 EML4-ALK -fuusio NSCLC (2-10 %) Inversio kromosomissa 2p Onkogeeninen TK TK-estäjille sensitiivinen Oma entiteetti
50 Targeted Resequencing Reveals ALK Fusions in Non-Small Cell Lung Carcinomas Detected by FISH, Immunohistochemistry, and Real-Time RT-PCR: A Comparison of Four Methods Tuononen, K., Sarhadi, V.K., Wirtanen, A., Rönty, M. J., Salmenkivi, K., Knuuttila, A., Remes, S., Telaranta-Keerie, A. I.,Bloor, S., Ellonen, P. & Knuutila, S. Bio Med Res Int (2013)2013:
51 Concordance of the results of ALK fusions by TDS, FISH, PCR, and IHC in LAC Results from 95 formalin-fixed paraffinembedded tumor tissue specimens from 87 patients with non-small cell lung carcinoma showed 100 percent concordance: six positive and 81 negative specimens were detected. Faculty of Medicine / Haartman Institute / Department of Pathology / Sakari Knuutila
52 Käytetyt menetelmät ALK-fuusion osoittamisessa FISH: Vysis ALK Break Apart FISH probe kit PCR: AmoyDx EML4-ALK Fusion Gene Detection Kit IHC: Novocastra clone 5A4 by BenchMark XT Faculty of Medicine / Haartman Institute / Department of Pathology / Sakari Knuutila
53 Positive cases detected by FISH, IHC, RT-PCR, and targeted next-generation sequencing (NGS) Sample ID Age Sex Smoking FISH IHC RT-PCR NGS Fusion type / % of positive cells Variant type Fusion /break position in ALK LC1 46 F Non-smoker Deletion /70% Strongly positive EML4-ALK variants 1/2/3a/3b chr2: LC11 48 M Non-smoker Inversion /46% Strongly positive EML4-ALK variants 1/2/3a/3b chr2: LC14* 44 M Non-smoker Inversion/74% Not studied EML4-ALK variants 1/2/3a/3b chr2: LC74* 44 M Non-smoker Inversion/46% Strongly positive EML4-ALK variants 1/2/3a/3b chr2: LC51 51 M Non-smoker Deletion/66% Strongly positive EML4-ALK variants 1/2/3a/3b chr2: M Non-smoker Deletion /40% Strongly positive EML4-ALK variants 1/2/3a/3b Not studied *LC14 and LC74 are samples from the same patient but from a different FFPE block.
54
55 Targeted Deep Sequencing of 9p Region in Acute Lymphoblastic Leukemia Yields Concordant Results with Array CGH and Reveals Novel Genomic Alterations. Sarhadi, V.K., Lahti, L., Scheinin, I., Tyybäkinoja, A., Savola, S., Usvasalo, A., Elonen, E., Ellonen, P., Saarinen-Pihkala, UM. & Knuutila, S. Genomics 102(3):182-8, 2013
56
57 Missä NGS analyysi tulisi tehdä vaikuttavia tekijöitä Logistiikka, näytteen käsittely, DNA:n eristys ja kysymyksen asettelu ja kokonaisnäkemys biomarkkerianalytiikasta Kytkeytyy perushistopatologiseen diagnostiikkaan Laitteiston hinta Ei maksa maltaita: Euroa Sisäänrakennetut ohjelmistot Perusbioinformatiikan osaaminen riittää Molekyyligenetiikan osaaminen tarpeen
58 Mikä erityisen tärkeää pohdittaessa missä NGS? Pysyä ajan hermolla: kansainvälinen ja kansallinen monitieteinen yhteistoiminta Uudet biomarkkerit Uusi teknologia Oikea-aikainen, joustavasti ja nopeasti muuntautuva uusiman tiedon ja kliinisen tarpeen mukaan (kerran jälkijunassa aina jälkijunassa) Tutkimustoiminta olla utelias uudesta tiedosta ja sen soveltamisesta potilaiden parhaaksi
59
60 Patients Chemonaïve Age 18 years Adenocarcinoma histology Never or light ex-smokers* Life expectancy 12 weeks PS 0-2 Measurable stage IIIB / IV disease Study design Gefitinib (250 mg / day) 1:1 randomisation Carboplatin (AUC 5 or 6) / paclitaxel (200 mg / m 2 ) 3 weekly # Endpoints Primary Progression-free survival (noninferiority) Secondary Objective response rate Overall survival Quality of life Disease-related symptoms Safety and tolerability Exploratory Biomarkers EGFR mutation EGFR-gene-copy number EGFR protein expression * Never smokers, <100 cigarettes in lifetime; light ex-smokers, stopped 15 years ago and smoked 10 pack years; # limited to a maximum of 6 cycles Carboplatin / paclitaxel was offered to gefitinib patients upon progression PS, performance status; EGFR, epidermal growth factor receptor Mok et al 2008
Keuhkosyövän molekyylipatologia
Professori Sakari Knuutila Helsingin yliopisto Keuhkosyövän molekyylipatologia Keuhkosyövän tunnuspiirteenä ovat lukuisat muutokset genomin rakenteessa ja toiminnassa. Sama ilmiö liittyy kaikkiin pitkälle
LisätiedotMolekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa. Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys
Molekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys Sidonnaisuudet Taloudelliset riippuvuudet: Konsultointi: - Tutkimusrahoitus: - Honorariat:
LisätiedotMolekyyligeneettiset testit syövän hoidon suuntaajina. Laura Lahtinen Molekylibiologi, FT Patologia Keski-Suomen keskussairaala
Molekyyligeneettiset testit syövän hoidon suuntaajina Laura Lahtinen Molekylibiologi, FT Patologia Keski-Suomen keskussairaala Perinteisesti kasvaimet on luokiteltu histologian perusteella Samanlainen
LisätiedotNGS-tutkimukset lääkärin työkaluna Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio
NGS-tutkimukset lääkärin työkaluna 17.11.2016 Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio Mihin genetiikkaa tarvitaan? taudin patogeneesin ymmärtäminen diagnoosin varmentaminen/vahvistaminen
LisätiedotUusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx keystocancer.fi FI/FMI/1810/0067 Lokakuu 2018 FoundationOne CDx -geeniprofilointi FoundationOne CDx on kattava geeniprofilointipalvelu, jossa tutkitaan syöpäkasvaimen
LisätiedotRINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA
RINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA Johanna Mattson dosentti ylilääkäri, vs. toimialajohtaja HYKS Syöpäkeskus 28.11.2016 1 RINTASYÖPÄ SUOMESSA 5008 uutta tapausta vuonna 2014 Paikallinen rintasyöpä
LisätiedotUusia mahdollisuuksia FoundationOne
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne FI/FMI/1703/0019 Maaliskuu 2017 FoundationOne -palvelu FoundationOne on kattava genomianalysointipalvelu, jossa tutkitaan 315 geenistä koko koodaava alue sekä 28 geenistä
LisätiedotTupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit ei-pienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa
Tietoa työstä Tupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit ei-pienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa LOPPURAPORTTI TYÖSUOJELURAHASTOLLE Sakari Knuutila
LisätiedotNGS:n haasteet diagnostiikassa. 9.10.2014 Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio
NGS:n haasteet diagnostiikassa 9.10.2014 Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio Sidonnaisuudet Kokousmatkoja: Novartis Luentopalkkioita: AstraZeneca, Roche, Pfizer, Lilly
LisätiedotTupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit eipienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa
TYÖSUOJELURAHASTO 21.2..2015 LOPPURAPORTTI: Työterveyslaitoksen osuus Tupakointiin ja asbestialtistukseen liittyvät diagnostiset ja hoidolliset biomarkkerit eipienisoluisissa keuhkosyövissä ja mesotelioomassa
LisätiedotMuuttuva diagnostiikka avain yksilöityyn hoitoon
Muuttuva diagnostiikka avain yksilöityyn hoitoon Olli Carpén, Patologian professori, Turun yliopisto ja Patologian palvelualue, TYKS-SAPA liikelaitos ChemBio Finland 2013 EGENTLIGA HOSPITAL FINLANDS DISTRICT
LisätiedotTeijo Kuopio NESTEBIOPSIA
18.11.2016 Teijo Kuopio NESTEBIOPSIA TERMINOLOGIAA Nestebiopsia (liquid biopsy) Nestebiopsia Veren tai muiden kehon nesteiden erilaiset diagnostiset testit, jotka voi rinnastaa kiinteiden kudosten koepaloista
LisätiedotPRIMARY HPV TESTING IN ORGANIZED CERVICAL CANCER SCREENING
PRIMARY HPV TESTING IN ORGANIZED CERVICAL CANCER SCREENING Veijalainen O, Kares S, Kujala P, Vuento R, TirKkonen M, Kholová I, Osuala V, Mäenpää J University and University Hospital of Tampere, Finland,
LisätiedotSuoritusarvot. Sample to Insight. Myöhemmät analyysit. Puhdistetun DNA:n tuotos. Versiotiedot. QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit, Versio
Suoritusarvot QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit, Versio 1 60404 Versiotiedot Tässä asiakirjassa on DSP DNA FFPE Tissue -pakkauksen suoritustiedot, versio 1, R3. Tarkista ennen kokeen suorittamista uusien
LisätiedotTärkeä lääketurvatiedote terveydenhuollon ammattilaisille. RAS-villityyppistatuksen (KRAS- ja NRAS-statuksen
Tärkeä lääketurvatiedote terveydenhuollon ammattilaisille. RAS-villityyppistatuksen (KRAS- ja NRAS-statuksen eksoneissa 2, 3 ja 4) varmistaminen on tärkeää ennen Erbitux (setuksimabi) -hoidon aloittamista
LisätiedotKeuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka edellyttää perustietoja myös kliinikoilta
KATSAUS TEEMA Elisa Lappi-Blanco, Kaisa Salmenkivi, Soili Kytölä ja Juha Kononen Keuhkosyövän molekyylipatologinen diagnostiikka edellyttää perustietoja myös kliinikoilta Keuhkosyöpien histologisen luokittelun
LisätiedotMolekyyligenetiikka. Arto Orpana, FT dos. apulaisylikemisti
Molekyyligenetiikka Arto Orpana, FT dos. apulaisylikemisti Molekyyligenetiikka Pikaperusteet Miten meillä Automaation aika Geenitestien käyttö Mihin menossa Molekyyligenetiikka: pikaperusteet DNAn rakennevirheet
Lisätiedotkeuhkosyövän uusista hoitotutkimuksista Jussi Koivunen, el dos OYS/Syöpätaudit
keuhkosyövän uusista hoitotutkimuksista Jussi Koivunen, el dos OYS/Syöpätaudit 30.8.2014 Sidonnaisuudet Taloudelliset riippuvuudet: Konsultointi: - Tutkimusrahoitus: - Osakkeet: - Honorariat: Eli Lilly,
LisätiedotPaksusuolisyövän uudet tuulet ja 2014 tulleet uutuudet
Paksusuolisyövän uudet tuulet ja 2014 tulleet uutuudet Pia Österlund el, dosentti Kliininen opettaja HY/HYKS syöpätaudit 29 elokuuta 2014 Sidonnaisuudet Palkkioita ja/tai matkakorvauksia: Amgen, Bayer,
LisätiedotHoitotehoa ennustavat RAS-merkkiaineet Tärkeä apuväline kolorektaalisyövän lääkehoidon valinnassa Tämän esitteen tarkoitus Tämä esite auttaa ymmärtämään paremmin kolorektaalisyövän erilaisia lääkehoitovaihtoehtoja.
LisätiedotMitä uutta DNA:sta. - koko perimän laajuiset analyysimenetelmät ja niiden sovellukset. Heidi Nousiainen, FT Erikoistuva kemisti, HUSLAB
Mitä uutta DNA:sta - koko perimän laajuiset analyysimenetelmät ja niiden sovellukset Heidi Nousiainen, FT Erikoistuva kemisti, HUSLAB SKKY:n ja Sairaalakemistit Ry:n syyskoulutuspäivät Paasitorni, 16.11.2012
LisätiedotIstukkagonadotropiini (hcg) - enemmän kuin raskaushormoni. Kristina Hotakainen, LT. Kliinisen kemian yksikkö Helsingin yliopisto ja HUSLAB
Istukkagonadotropiini (hcg) - enemmän kuin raskaushormoni Kristina Hotakainen, LT. Kliinisen kemian yksikkö Helsingin yliopisto ja HUSLAB Istukkagonadotropiini (Human Chorionic Gonadotropin, hcg) Kuuluu
LisätiedotTutkimus Auria Biopankissa ja tulevaisuuden visiot Samu Kurki, FT, data-analyytikko
AURIA BIOPANKKI Tutkimus Auria Biopankissa ja tulevaisuuden visiot 8.3.2019 Samu Kurki, FT, data-analyytikko www.auria.fi Biopankkiprojektit vuosina 2014-2018 Akateemiset projektit 54% Yritysprojektit
LisätiedotAKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY
T043 Liite 1.05 / Appendix 1.05 Sivu / Page 1(5) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB MEDICAL LABORATORIES LTD Tunnus Code Yksikkö tai toimintoala
LisätiedotVIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Biologian DNA koodi ja sen selvittäminen Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Kuinka solut kehittyivät? Kolmenlaisia soluja
LisätiedotImmunohistokemia HPV-muutosten ja tavallisten gynekologisten adenokarsinoomien diagnostiikassa. Elisa Lappi-Blanco OYS, patologian osasto
Immunohistokemia HPV-muutosten ja tavallisten gynekologisten adenokarsinoomien diagnostiikassa Elisa Lappi-Blanco OYS, patologian osasto Gynekopatologian tavallisia ongelmia HPV-muutosten vaikeusasteen
LisätiedotEML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen parafiinileikkeestä FISH-menetelmän avulla adenokarsinooman diagnostiikassa
Emmi Hokkanen, Milja Tikkanen EML4-ALK-fuusio-onkogeenin osoittaminen parafiinileikkeestä FISH-menetelmän avulla adenokarsinooman diagnostiikassa Tulosten vertaaminen immunohistokemian avulla saatuihin
LisätiedotPERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto
PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA Robert Winqvist SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto PROFESSORILIITON SYYSSEMINAARI TUTKIMUSTA KAIKKIEN HYÖDYKSI
LisätiedotGlioomien molekyylidiagnostiikkaa Maria Gardberg TYKS-Sapa Patologia / Turun Yliopisto
Glioomien molekyylidiagnostiikkaa 30.8.2013 Maria Gardberg TYKS-Sapa Patologia / Turun Yliopisto Glioomien WHO-luokitus on morfologinen Gradusten I-IV ryhmittelyn perustana on toiminut ennusteen huononeminen
LisätiedotSyöpägeenit. prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto
Syöpägeenit prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto Mitä syöpä on? Ryhmä sairauksia, joille on ominaista: - solukasvun säätelyn häiriö - puutteet solujen erilaistumisessa
LisätiedotSuomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013
Suomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013 FIMM - Institiute for Molecular Medicine Finland Terveyden ylläpito vauvasta vanhuuteen Elintavat Taudit Terve
LisätiedotSeminoman hoito ja seuranta. S. Jyrkkiö
Seminoman hoito ja seuranta S. Jyrkkiö 17.4.2015 Kivessyöpä yleistyy Pohjoismaissa Seminoman ja non-seminoomien yleisyys Pohjoismaissa Kuolleisuus kivessyöpään Pohjoismaissa Kivessyöpä 5 v OSS Kivestuumoreiden
LisätiedotLevinneen keuhkosyövän nykyaikainen lääkehoito mitä totunnaisten solunsalpaajien lisäksi?
KATSAUS TEEMA Jussi Koivunen, Aija Knuuttila ja Pekka Mali Levinneen keuhkosyövän nykyaikainen lääkehoito mitä totunnaisten solunsalpaajien lisäksi? Ei-pienisoluisen keuhkosyövän hoitoon on tullut viime
LisätiedotExperimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii
Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of
LisätiedotSyöpäsolut eroavat normaalisoluista mm. siinä,
Katsaus Klaus Elenius Epidermaalisen kasvutekijän reseptorin estäjät syövän hoidossa Epidermaalisen kasvutekijän reseptorin (EGFR) signalointi on aktivoitunut useissa eri syövissä. Reseptorin toiminnan
LisätiedotBiopankkitoiminta Suomessa. Dos. Heli Salminen
Biopankkitoiminta Suomessa Dos. Heli Salminen Suomalaisten sairaalabiopankkien erityispiirteet ja mahdollisuudet Miten biopankit vastaavat terveydenhuollon haasteisiin Perustuslaki Biopankkilaki Henkilötietolaki
LisätiedotMiten syövän hoidon hyötyä mitataan? Olli Tenhunen LT FIMEA/PPSHP
Miten syövän hoidon hyötyä mitataan? Olli Tenhunen LT FIMEA/PPSHP Disclosures No interests in pharmaceutical industry Member of EMA Scientific Advice Working Party, Oncology Working Party, Committee for
LisätiedotFETAL FIBROBLASTS, PASSAGE 10
Double-stranded methylation patterns of a 104-bp L1 promoter in DNAs from fetal fibroblast passages 10, 14, 17, and 22 using barcoded hairpinbisulfite PCR. Fifteen L1 sequences were analyzed for passages
LisätiedotGenomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma
Genomin ilmentyminen 17.1.2013 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Genomin ilmentyminen transkription aloitus RNA:n synteesi ja muokkaus DNA:n ja RNA:n välisiä eroja
LisätiedotSomaattinen sairaus nuoruudessa ja mielenterveyden häiriön puhkeamisen riski
+ Somaattinen sairaus nuoruudessa ja mielenterveyden häiriön puhkeamisen riski LINNEA KARLSSON + Riskitekijöitä n Ulkonäköön liittyvät muutokset n Toimintakyvyn menetykset n Ikätovereista eroon joutuminen
LisätiedotDNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio
CELL 411-- replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi
Lisätiedottgg agg Supplementary Figure S1.
ttaggatattcggtgaggtgatatgtctctgtttggaaatgtctccgccattaactcaag tggaaagtgtatagtaatgaatctttcaagcacacagatcacttcaaaagactgtttcaa catcacctcaggacaaaaagatgtactctcatttggatgctgtgatgccatgggtcacag attgcaattcccaagtgcccgttcttttacaccaaaatcaaagaagaatatctccccttt
LisätiedotTEST REPORT Nro VTT-S Air tightness and strength tests for Furanflex exhaust air ducts
TEST REPORT Nro VTT-S-04515-08 19.5.008 Air tightness and strength tests for Furanflex exhaust air ducts Requested by: Hormex Oy TEST REPORT NRO VTT-S-04515-08 1 () Requested by Order Hormex Oy Linnanherrankuja
LisätiedotMiten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä
Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä Genomitiedon vaikutus terveydenhuoltoon työpaja 7.11.2014 Sitra, Helsinki Jaakko Ignatius, TYKS Kliininen genetiikka Perimän
LisätiedotMALE ADULT FIBROBLAST LINE (82-6hTERT)
Double-stranded methylation patterns of a 104-bp L1 promoter in DNAs from male and female fibroblasts, male leukocytes and female lymphoblastoid cells using hairpin-bisulfite PCR. Fifteen L1 sequences
LisätiedotGefitinibi ei-pienisoluisen keuhkosyövän täsmähoitona?
Katsaus AIJA KNUUTTILA, EEVA-MAIJA KARJALAINEN, ANNAMARI ROUHOS JA PEKKA MALI Gefitinibi ei-pienisoluisen keuhkosyövän täsmähoitona? Levinneeseen tai paikallisesti edenneeseen, leikkaukseen soveltumattomaan,
LisätiedotFunctional Genomics & Proteomics
Functional Genomics & Proteomics Genome Sequences TCACAATTTAGACATCTAGTCTTCCACTTAAGCATATTTAGATTGTTTCCAGTTTTCAGCTTTTATGACTAAATCTTCTAAAATTGTTTTTCCCTAAATGTATATTTTAATTTGTCTCAGGAGTAGAATTTCTGAGTCATAAAGCGGT CATATGTATAAATTTTAGGTGCCTCATAGCTCTTCAAATAGTCATCCCATTTTATACATCCAGGCAATATATGAGAGTTCTTGGTGCTCCACATCTTAGCTAGGATTTGATGTCAACCAGTCTCTTTAATTTAGATATTCTAGTACAT
Lisätiedotclass I T (Munz, autophagy (Argiris, 2008) 30 5 (Jemal, 2009) autophagy HLA / 4 21 (Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2008; Chikamatsu, 2009) in vitro
65 35 (Argiris, 2008)30 5 (Jemal, 2009) / 1991Boon / 4 21 (Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2008; Chikamatsu, 2009) / / (Sakakura, 2005; Sakakura, 2006; Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2007; Chikamatsu, 2008)/
LisätiedotSarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.
Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.2016 Iina.Tuominen@tyks.fi Genetiikan tutkimukset sarkoomien diagnostiikassa
LisätiedotEpigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia 21.1.2014 Epigeneettinen säätely Epigenetic: may be used for anything to do with development, but nowadays
LisätiedotNielun bakteeriviljely, näytteenotto ja virhelähteet. Hannu Sarkkinen, dos ylilääkäri, lääketieteellinen johtaja PhSotey/laboratorioliikelaitos
Nielun bakteeriviljely, näytteenotto ja virhelähteet Hannu Sarkkinen, dos ylilääkäri, lääketieteellinen johtaja PhSotey/laboratorioliikelaitos NIELUTULEHDUS Kurkkukipu ja kuume Nielurisojen peitteet ja
LisätiedotMiten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?
ChemBio Helsingin Messukeskus 27.-29.05.2009 Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa? Kristiina Aittomäki, dos. ylilääkäri HYKS Perinnöllisyyslääketieteen yksikkö Genomin tutkiminen FISH Sekvensointi
LisätiedotUutta melanoomasta. Pia Vihinen TYKS/Syöpäklinikka. Tutkimukset kun epäilet melanooman leviämistä
Uutta melanoomasta Pia Vihinen TYKS/Syöpäklinikka Tutkimukset kun epäilet melanooman leviämistä Vartalon TT tutkimus tai PET-TT Verikokeet; Hb, maksa-arvot, krea Korkea LDH huonon ennusteen merkki PAD:
LisätiedotOther approaches to restrict multipliers
Other approaches to restrict multipliers Heikki Tikanmäki Optimointiopin seminaari 10.10.2007 Contents Short revision (6.2) Another Assurance Region Model (6.3) Cone-Ratio Method (6.4) An Application of
LisätiedotKeuhkosyövän uudet lääkkeet
Keuhkosyövän uudet lääkkeet Jarkko Ahvonen Syöpätautien erikoislääkäri Tampereen yliopistollinen sairaala Sidonnaisuudet Asiantuntijapalkkio Boehringer Ingelheim, Bristol-Myers Squibb, Lilly, MSD, Roche
LisätiedotSuomalaiset vahvuudet
Suomalaiset vahvuudet Korkealaatuinen terveydenhuoltojärjestelmä Luotettavat terveydenhuollon rekisterit Väestöaineistot ja terveydenhuollon näytekokoelmat Geneettisesti homogeeninen väestö Kansainvälisesti
LisätiedotEbolasta Hannu Syrjälä
Ebolasta 3.10.2014 Hannu Syrjälä Ebola (EVD) v. 1976 tunnistettu, Filovoruksiin kuuluva RNA-virus 5 eri lajia, joista 4 aiheuttaa ihmiselle taudin Ebola ; joki Zairessa 1976-2013 : 24 epidemiaa, joissa
LisätiedotSyövät pirstaloituvat: haaste hoidon kehitykselle
Syövät pirstaloituvat: haaste hoidon kehitykselle Kimmo Porkka Professor, head of division hematology Helsinki University Central Hospital Helsinki, Finland Syövän heterogeenisyys: esimerkkinä akuutti
LisätiedotGenomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) DNA RNA 7.12.2017 Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Osaamistavoitteet Lärandemål Luennon jälkeen ymmärrät pääperiaatteet
LisätiedotDNA:n informaation kulku, koostumus
DNA:n informaation kulku, koostumus KOOSTUMUS Elävien bio-organismien koostumus. Vety, hiili, happi ja typpi muodostavat yli 99% orgaanisten molekyylien rakenneosista. Biomolekyylit voidaan pääosin jakaa
LisätiedotATMP-valmisteet ja Fimean rooli ATMP-valvonnassa Suomessa ja EU:ssa
ATMP-valmisteet ja Fimean rooli ATMP-valvonnassa Suomessa ja EU:ssa Heli Suila, FT Erikoistutkija, BIO-jaosto Farmaseuttis-biologinen-yksikkö Lääkevalmisteiden arviointi Fimea Pitkälle kehitetyn terapian
LisätiedotPTEN -ekspressio rintasyövässä
PTEN -ekspressio rintasyövässä Pro Gradu -tutkielma Tampereen yliopisto Lääketieteellisen teknologian instituutti Kesäkuu 2006 Katri Köninki PRO GRADU -TUTKIELMA Paikka: Tampereen Yliopisto, Lääketieteellisen
Lisätiedot- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,
Syöpä, osa II Syöpäkriittiset geenit - Geenejä, joiden mutaatiot usein havaitaan syöpien kanssa korreloituneena - Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan, - dominoiviin onkogeeneihin - resessiivisiin
LisätiedotMitä onkologi toivoo patologilta?
Mitä onkologi toivoo patologilta? Mikä PAD-lausunnossa vaikuttaa kilpirauhassyövän hoitoon Hanna Mäenpää, dos HUS, Syöpätautien klinikka Onkologian trendejä Entiteetit pirstoutuvat pienemmiksi: lisää tietoa
LisätiedotEturauhassyövän seulonta. Patrik Finne
Eturauhassyövän seulonta Patrik Finne Ulf-Håkan Stenman-juhlasymposiumi, 21.4.2009 Seulonnan tavoite löytää syöpä aikaisemmin, ennen kuin se on levinnyt mahdollistaa radikaalinen hoito Vähentää kuolleisuutta
LisätiedotIhmisten yksilöllisten lämpöaistimusten. vaikutukset talotekniikan suunnitteluun. Evicures, 21.1.2015
Ihmisten yksilöllisten lämpöaistimusten arviointi ja vaikutukset talotekniikan suunnitteluun Evicures, 21.1.2015 Johtava tutkija Pekka Tuomaala Teknologian tutkimuskeskus VTT Oy Ihmisen lämpöviihtyvyyden
LisätiedotMitä uutta kolorektaalisyövästä?
Mitä uutta kolorektaalisyövästä? Tapio Salminen, TAYS Valtakunnalliset onkologiapäivät 2013 Metastasoineen taudin hoidon valinnan periaatteet kolorektaalisyövässä Ryhmä 0 R0 resekoitavissa oleva maksa
LisätiedotLääketieteellinen Systeemibiologia
Lääketieteellinen Systeemibiologia Sampsa Hautaniemi Biolääketieteen laitos Genomibiologian tutkimusohjelma Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö Luentorunko Johdanto Reduktionismin rajoitteet Systeeminen
LisätiedotGenomin ilmentyminen
Kauppi 17/01/2014 Genomin ilmentyminen LH1, Molekyylibiologia 17.1.2014 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Huone C501b, Biomedicum 1 Transkriptiofaktorin mutaatio voi
LisätiedotAKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY
T070 Liite 1.05 / Appendix 1.05 Sivu / Page 1(5) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY YHTYNEET MEDIX LABORATORIOT OY UNITED MEDIX LABORATORIES LTD Tunnus Code Yksikkö tai toimintoala
LisätiedotState of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology
Functional Genomics Research Stream State of the Union... Research Meeting: February 16, 2010 Functional Genomics & Research Report III Concepts Genomics Molecular Biology Computational Biology Genome
LisätiedotBenchmarking Controlled Trial - a novel concept covering all observational effectiveness studies
Benchmarking Controlled Trial - a novel concept covering all observational effectiveness studies Antti Malmivaara, MD, PhD, Chief Physician Centre for Health and Social Economics National Institute for
LisätiedotAsiakaspalautteen merkitys laboratoriovirheiden paljastamisessa. Taustaa
Asiakaspalautteen merkitys laboratoriovirheiden paljastamisessa Paula Oja, TtT Laboratorio, Oulun yliopistollinen sairaala Potilasturvallisuustutkimuksen päivät 26. 27.1.2011 1 Taustaa Laboratorion tulee
LisätiedotGOOD WORK LONGER CAREER:
Juhani Ilmarinen, Ville Ilmarinen, Pekka Huuhtanen, Veikko Louhevaara, Ove Näsman GOOD WORK LONGER CAREER: WORK WELL-BEING IN FINNISH TECHNOLOGY INDUSTRIES 2010-2015 Background Collective agreement between
LisätiedotGIOTRIF (afatinibi) Monoterapiana paikallisesti edennyttä tai etäpesäkkeistä ei-pienisoluista keuhkosyöpää sairastaville aikuispotilaille
GIOTRIF (afatinibi) Monoterapiana paikallisesti edennyttä tai etäpesäkkeistä ei-pienisoluista keuhkosyöpää sairastaville aikuispotilaille Joita ei ole aiemmin hoidettu epidermaalisen kasvutekijän reseptorin
LisätiedotIncrease of opioid use in Finland when is there enough key indicator data to state a trend?
Increase of opioid use in Finland when is there enough key indicator data to state a trend? Martta Forsell, Finnish Focal Point 28.9.2015 Esityksen nimi / Tekijä 1 Martta Forsell Master of Social Sciences
LisätiedotProf. Marjukka Mäkelä Terveydenhuollon menetelmien arviointi priorisointipäätösten tukena. STAS seminaari 26.5.2010.
Prof. Marjukka Mäkelä Terveydenhuollon menetelmien arviointi priorisointipäätösten tukena STAS seminaari 26.5.2010 STAS Mäkelä May10 1 Finohtan tehtävä Kehittää Suomen terveydenhuollon tehokkuutta ja vaikuttavuutta
Lisätiedot10/12/12. HIV-1 O and P. HIV-1 M and N NATURE VOL 397 4 FEBRUARY 1999
1 2 3 NATURE VOL 397 4 FEBRUARY 1999 HIV-1 O and P HIV-1 M and N 4 MITEN HIV-EPIDEMIA ALKOIKAAN 1980 s 1990 s?? 1970 s 1980 s 1980 s 5 HIV Gp120 Gp41 RNA p17 p24 6 HIV 1 simpanssista ihmiseen Myron S.
LisätiedotPeptidi ---- F ----- K ----- V ----- R ----- H ----- A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 24.5.2006 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 Osa 1: Haluat selvittää -- F -- K -- V -- R -- H -- A peptidiä
LisätiedotLäpimurto ms-taudin hoidossa?
Läpimurto ms-taudin hoidossa? Läpimurto ms-taudin hoidossa? Kansainvälisen tutkijaryhmän kliiniset kokeet uudella lääkkeellä antoivat lupaavia tuloksia sekä aaltoilevan- että ensisijaisesti etenevän ms-taudin
LisätiedotFIMM Technology Services FIMM:n teknologiapalvelut 1
FIMM Technology Services FIMM:n teknologiapalvelut 1 3 Overview 6 Genomic Profiling 8 Gene Expression Analyses 9 DNA Methylation Analyses 10 smallrna Sequencing and Screening 11 Metabolomics 12 Cell-based
LisätiedotLÄÄKETIETEELLINEN OPAS PERINNÖLLINEN ALTTIUS RINTA-, MUNASARJA- JA KOHTUSYÖVÄLLE
LÄÄKETIETEELLINEN OPAS PERINNÖLLINEN ALTTIUS RINTA-, MUNASARJA- JA KOHTUSYÖVÄLLE EDUT KATTAVA Paneelin kattamien geenien on tieellisesti osoitettu liittyvän rinta-, kohtu- ja munasarjasyöpiin. Potilaan
LisätiedotHarvinaissairauksien diagnostiikan ja hoidon tulevaisuuden näkymiä
Harvinaissairauksien diagnostiikan ja hoidon tulevaisuuden näkymiä Helena Kääriäinen Perinnöllisyyslääkäri Tutkimusprofessori 19.10.2018 Geenitiedosta genomitietoon / Helena Kääriäinen 1 Sidonnaisuudet
LisätiedotKysymys 5 Compared to the workload, the number of credits awarded was (1 credits equals 27 working hours): (4)
Tilasto T1106120-s2012palaute Kyselyn T1106120+T1106120-s2012palaute yhteenveto: vastauksia (4) Kysymys 1 Degree programme: (4) TIK: TIK 1 25% ************** INF: INF 0 0% EST: EST 0 0% TLT: TLT 0 0% BIO:
LisätiedotRintasyövän perinnöllisyys
Lääketieteellisen genetiikan kurssi 17.9.2012 Rintasyövän perinnöllisyys Perinnöllinen syöpäalttius - esimerkkinä rintasyöpä Kristiina Aittomäki, dos. ylilääkäri Genetiikan vastuuyksikköryhmä/huslab/hus
LisätiedotTM ETRS-TM35FIN-ETRS89 WTG
SHADOW - Main Result Assumptions for shadow calculations Maximum distance for influence Calculate only when more than 20 % of sun is covered by the blade Please look in WTG table WindPRO version 2.8.579
Lisätiedot1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward.
START START SIT 1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward. This is a static exercise. SIT STAND 2. SIT STAND. The
LisätiedotBiopankkien hyödyntäminen terveystaloudellisessa arvioinnissa
Biopankkien hyödyntäminen terveystaloudellisessa arvioinnissa - soveltajan näkökulma Jarmo Hahl Medaffcon Oy Taloudellisen arvioinnin haasteet Terveystaloudellisen arvioinnin käyttökohteet Viranomaisvaatimukset
LisätiedotBiopankit miksi ja millä ehdoilla?
Suomalaisen Tiedeakatemian 100 v-symposium, Helsinki 4.9.2008 Biopankit miksi ja millä ehdoilla? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm, Sverige ja Helsingin yliopisto Tautien tutkimus Geeni/ valkuaisaine
LisätiedotMITÄ SITTEN, KUN MAAILMASSA ON VAIN YKSI AINOA SOPIVA VERENLUOVUTTAJA
MITÄ SITTEN, KUN MAAILMASSA ON VAIN YKSI AINOA SOPIVA VERENLUOVUTTAJA Verikeskuspäivä 12.5.2017 Susanna Sainio www.veripalvelu.fi M.O -57 sektiosynnytys -85, ps siirto 18.8.2016 OYS olkavarren trauma,
LisätiedotGliooman uusista hoitosuosituksista. Heikki Minn
Gliooman uusista hoitosuosituksista Heikki Minn Onkologiapäivät, Turku 30.8.2013 Sidonnaisuudet Konsulttina ja/tai kliinisenä tutkijana seuraavissa lääketieteellistä toimintaa harjoittavissa yrityksissä
LisätiedotMetsälamminkankaan tuulivoimapuiston osayleiskaava
VAALAN KUNTA TUULISAIMAA OY Metsälamminkankaan tuulivoimapuiston osayleiskaava Liite 3. Varjostusmallinnus FCG SUUNNITTELU JA TEKNIIKKA OY 12.5.2015 P25370 SHADOW - Main Result Assumptions for shadow calculations
LisätiedotStrain or plasmid Description a Reference or source b. 168 trpc2 Laboratory. 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC
TABLE S1 Bacterial strains and plasmids Strain or plasmid Description a Reference or source b B. subtilis 168 trpc2 Laboratory stock 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC BM1010 trpc2 htpx::pgs1582; Em r BM1302 trpc2
LisätiedotSupporting Information for
Supporting Information for Analysis of Sogatella furcifera proteome that interact with P10 protein of Southern rice black-streaked dwarf virus Win Than*, Faliang Qin*, Wenwen Liu, Xifeng Wang ** State
LisätiedotJULKAISUSARJA 6/2016 NIVOLUMABI EI- PIENISOLUISEN KEUHKO- SYÖVÄN HOIDOSSA
JULKAISUSARJA 6/2016 NIVOLUMABI EI- PIENISOLUISEN KEUHKO- SYÖVÄN HOIDOSSA NIVOLUMABI EI-PIENISOLUISEN KEUHKOSYÖVÄN HOIDOSSA Fimea kehittää, arvioi ja informoi -julkaisusarja 6/2016 Lääkealan turvallisuus-
LisätiedotSupplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell. exterior
Supplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell exterior Martin Gustavsson, David Hörnström, Susanna Lundh, Jaroslav Belotserkovsky, Gen Larsson
LisätiedotMiten ehkäistä suolisyöpää? Jukka- Pekka Mecklin Yleiskirurgian professori K- SKS ja Itä- Suomen yliopisto
Miten ehkäistä suolisyöpää? Jukka- Pekka Mecklin Yleiskirurgian professori K- SKS ja Itä- Suomen yliopisto Suolisyövän ehkäisy 1. Suolisyövän yleisyys väestössä 2. Suolisyövän riskiryhmät 3. Suolisyövän
LisätiedotTM ETRS-TM35FIN-ETRS89 WTG
SHADOW - Main Result Assumptions for shadow calculations Maximum distance for influence Calculate only when more than 20 % of sun is covered by the blade Please look in WTG table WindPRO version 2.9.269
LisätiedotInferring Trichoderma reesei gene regulatory network
Inferring Trichoderma reesei gene regulatory network Oskari Vinko 29.04.2013 Ohjaaja: Merja Oja Valvoja: Harri Ehtamo Työn saa tallentaa ja julkistaa Aalto-yliopiston avoimilla verkkosivuilla. Muilta osin
LisätiedotTM ETRS-TM35FIN-ETRS89 WTG
SHADOW - Main Result Assumptions for shadow calculations Maximum distance for influence Calculate only when more than 20 % of sun is covered by the blade Please look in WTG table 5.11.2013 16:44 / 1 Minimum
Lisätiedot