Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä? Duodecimin vuosipäivä 14.11.2014 Veikko Salomaa, LKT, tutkimusprofessori 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 1
Sidonnaisuudet Ei ole 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 2
Runsas 10 v Human Genome Projektin valmistumisen jälkeen Edistystä on tapahtunut biologisen tietämyksen alueella harvinaisten oireyhtymien kohdalla Eräissä syöpätaudeissa Muutamien lääkkeiden farmakogenetiikassa Toisaalta: tavallisten, monitekijäisten kansantautien hoidossa ja preventiossa geenitiedon merkitys on toistaiseksi jäänyt vaatimattomaksi 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 3
Suomen ikävakioitu sepelvaltimotautikuolleisuus 35-64 vuotiailla miehillä ja naisilla ajanjaksolla 1952-2011 Kuolleisuus/ 100 000 600 500 400 300 200 100 0 1952 1955 1958 1961 1964 1967 1970 1973 1976 1979 1982 1985 1988 1991 1994 1997 2000 2003 2006 2009
ESC guidelines on CVD prevention (2012) 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 5
AHA guidelines on primary prevention of stroke Genetic screening of the general population for the prevention of a first stroke is not recommended (Class III; Level of Evidence C). (Stroke 2014; doi: 10.1161/STR.0000000000000046) Joukko harvinaisempia poikkeuksia, joiden yhteydessä testausta suositellaan harkittavaksi. Pharmacogenetic dosing of vitamin K antagonists may be considered when therapy is initiated (Class IIb; Level of Evidence C). 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 6
Rintasyöpä BRCA geenien merkittävien mutaatioiden prevalenssi 0,2-0,3% valikoimattomassa väestössä (Moyer et al. Ann Intern Med 2014;160:271-281). Mutaation kantajalla on 45-64%:n riski saada rintasyöpä 70 ikävuoteen mennessä. Lisäksi BRCA1geenin mutaatioiden kantajilla on 39%:n riski ja BRCA2 geenin mutaatioiden kantajilla 10-17%:n riski saada munasarjasyöpä 70 ikävuoteen mennessä. Mutaatiot näissä geeneissä selittävät 5-10% rintasyövistä. Geenitestausta ei kuitenkaan suositella henkilöille, joiden sukuhistoria ei viittaa mutaatioihin BRCA geeneissä. 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 7
Assosiaatiot ja selitysosuudet GWAS tutkimukset ovat paljastaneet useita yhden emäksen polymorfioita, joilla on tilastollisesti merkitsevä assosiaatio keskeisiin kansantauteihin tai niiden riskitekijöihin Käytännössä selitysosuudet ovat kuitenkin jääneet vaatimattomiksi. Esim. 29 verenpaineeseen assosioituvaa SNP:tä selittävät vain n. 1-2% SBP:n ja DBP:n varianssista, vastaten n. 1 mmhg SBP:tä ja 0,5 mmhg DBP:tä (Havulinna et al. Hypertension 2013;61:987-94). Sekvenointi ja harvinaisempien varianttien löytyminen voinee parantaa selitysosuuksia myös tavallisten tautien kohdalla. 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 8
Geneettisten ja ympäristötekijöiden selitysosuudet SBP:n variaatiosta FINRISKIaineistossa* Selittäjä Selitysosuus (%) Ikä ja sukupuoli 22,4 BMI 9,4 Vapaa-ajan liikunta 1,0 Geneettinen riskiscore 0,7 Tupakointi 0.4 Alkoholin käyttö 0,4 Koulutus 0.4 Verenpainelääkkeiden käyttäjät ja prevalentti CVD poissuljettu 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 9
BMI:n jakaumat lihavuuden geneettisen riskiscoren ryhmissä <10%, 10-90% ja >90% JULKAISEMATONTA TIETOA Uusin lihavuuden geneettinen riskiscore (97 SNP:tä) sovellettuna FINRISKI -97 kohortin BMI jakaumiin 27% henkilöistä, jotka kuuluvat GRS:n ylimpään desiiliin ovat normaalipainoisia (BMI<25) 50% niistä, jotka kuuluvat GRS:n alimpaan desiiliin ovat ylipainoisia tai lihavia (BMI>25). 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 10
Heritabiliteetti Suurin osa perhe- ja kaksostutkimuksissa todetusta kansantautien heritabiliteetista on edelleen kadoksissa, t.s. vain pieni fraktio heritabiliteetistä voidaan selittää tunnetuilla geenivarianteilla. Kliinisessä työssä huolellinen sukuanamneesi antaa vähintään yhtä paljon informaatiota kuin geenitestaus. Usein ei muuta tarvitakaan. 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 11
Pituus GRS Tähän mennessä lupaavin tulos genetiikan selitysvoimasta (Rayner et al. Nat Genet 2014:46:1173-1186) GIANT projektin >250 000 henkilöä käsittävässä analyysissä 9500 vahvimmin assosioitunutta SNP:tä selittävät 29% pituuden varianssista Kaikki tavalliset variantit yhteensä selittävät n. 60% pituuden heritabiliteetista 21.11.2014 12
Yhteenveto: Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä? Genetiikka on tuottanut merkittävää uutta tietoa ihmisen biologiasta ja tautien patofysiologiasta Suurin merkitys syöpätaudeissa (rinta-, ovariaali- ja colorektaali ca). Farmakogenetiikka helpottaa joidenkin lääkkeiden valintaa ja annostusta. Lääkekehitys voi nopeutua. Geenitiedossa on potentiaalia, mutta Tavallisten, monitekijäisten kansantautien preventiossa ja hoidossa elämäntavat ovat paljon keskeisemmässä asemassa kuin genetiikka 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 13
Kiitos 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 14
From: Physical Activity and the Association of Common FTO Gene Variants With Body Mass Index and Obesity Arch Intern Med. 2008;168(16):1791-1797. doi:10.1001/archinte.168.16.1791 Figure Legend: Predicted body mass index (BMI), calculated as weight in kilograms divided by height in meters squared, as a function of residualized age- and sex-specific ln-transformed physical activity accelerometer counts according to FTO rs1861868 genotypes. On the left side of the plot (low physical activity), BMI levels are strikingly dissimilar between rs1861868 genotypes. In contrast, on the right side of the plot, similar BMI levels can be seen across genotypes, particularly in subjects with very high levels of physical activity. Copyright 2014 American Medical Date of download: 11/13/2014 Association. All rights reserved.
Human Genome Project Alkoi 1990 Ensimmäiset luonnokset valmiita vuonna 2000 Valmis 2003 21.11.2014 Esityksen nimi / Tekijä 16