Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä?

Transkriptio

1 Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä? Duodecimin vuosipäivä Veikko Salomaa, LKT, tutkimusprofessori Esityksen nimi / Tekijä 1

2 Sidonnaisuudet Ei ole Esityksen nimi / Tekijä 2

3 Runsas 10 v Human Genome Projektin valmistumisen jälkeen Edistystä on tapahtunut biologisen tietämyksen alueella harvinaisten oireyhtymien kohdalla Eräissä syöpätaudeissa Muutamien lääkkeiden farmakogenetiikassa Toisaalta: tavallisten, monitekijäisten kansantautien hoidossa ja preventiossa geenitiedon merkitys on toistaiseksi jäänyt vaatimattomaksi Esityksen nimi / Tekijä 3

4 Suomen ikävakioitu sepelvaltimotautikuolleisuus vuotiailla miehillä ja naisilla ajanjaksolla Kuolleisuus/

5 ESC guidelines on CVD prevention (2012) Esityksen nimi / Tekijä 5

6 AHA guidelines on primary prevention of stroke Genetic screening of the general population for the prevention of a first stroke is not recommended (Class III; Level of Evidence C). (Stroke 2014; doi: /STR ) Joukko harvinaisempia poikkeuksia, joiden yhteydessä testausta suositellaan harkittavaksi. Pharmacogenetic dosing of vitamin K antagonists may be considered when therapy is initiated (Class IIb; Level of Evidence C) Esityksen nimi / Tekijä 6

7 Rintasyöpä BRCA geenien merkittävien mutaatioiden prevalenssi 0,2-0,3% valikoimattomassa väestössä (Moyer et al. Ann Intern Med 2014;160: ). Mutaation kantajalla on 45-64%:n riski saada rintasyöpä 70 ikävuoteen mennessä. Lisäksi BRCA1geenin mutaatioiden kantajilla on 39%:n riski ja BRCA2 geenin mutaatioiden kantajilla 10-17%:n riski saada munasarjasyöpä 70 ikävuoteen mennessä. Mutaatiot näissä geeneissä selittävät 5-10% rintasyövistä. Geenitestausta ei kuitenkaan suositella henkilöille, joiden sukuhistoria ei viittaa mutaatioihin BRCA geeneissä Esityksen nimi / Tekijä 7

8 Assosiaatiot ja selitysosuudet GWAS tutkimukset ovat paljastaneet useita yhden emäksen polymorfioita, joilla on tilastollisesti merkitsevä assosiaatio keskeisiin kansantauteihin tai niiden riskitekijöihin Käytännössä selitysosuudet ovat kuitenkin jääneet vaatimattomiksi. Esim. 29 verenpaineeseen assosioituvaa SNP:tä selittävät vain n. 1-2% SBP:n ja DBP:n varianssista, vastaten n. 1 mmhg SBP:tä ja 0,5 mmhg DBP:tä (Havulinna et al. Hypertension 2013;61:987-94). Sekvenointi ja harvinaisempien varianttien löytyminen voinee parantaa selitysosuuksia myös tavallisten tautien kohdalla Esityksen nimi / Tekijä 8

9 Geneettisten ja ympäristötekijöiden selitysosuudet SBP:n variaatiosta FINRISKIaineistossa* Selittäjä Selitysosuus (%) Ikä ja sukupuoli 22,4 BMI 9,4 Vapaa-ajan liikunta 1,0 Geneettinen riskiscore 0,7 Tupakointi 0.4 Alkoholin käyttö 0,4 Koulutus 0.4 Verenpainelääkkeiden käyttäjät ja prevalentti CVD poissuljettu Esityksen nimi / Tekijä 9

10 BMI:n jakaumat lihavuuden geneettisen riskiscoren ryhmissä <10%, 10-90% ja >90% JULKAISEMATONTA TIETOA Uusin lihavuuden geneettinen riskiscore (97 SNP:tä) sovellettuna FINRISKI -97 kohortin BMI jakaumiin 27% henkilöistä, jotka kuuluvat GRS:n ylimpään desiiliin ovat normaalipainoisia (BMI<25) 50% niistä, jotka kuuluvat GRS:n alimpaan desiiliin ovat ylipainoisia tai lihavia (BMI>25) Esityksen nimi / Tekijä 10

11 Heritabiliteetti Suurin osa perhe- ja kaksostutkimuksissa todetusta kansantautien heritabiliteetista on edelleen kadoksissa, t.s. vain pieni fraktio heritabiliteetistä voidaan selittää tunnetuilla geenivarianteilla. Kliinisessä työssä huolellinen sukuanamneesi antaa vähintään yhtä paljon informaatiota kuin geenitestaus. Usein ei muuta tarvitakaan Esityksen nimi / Tekijä 11

12 Pituus GRS Tähän mennessä lupaavin tulos genetiikan selitysvoimasta (Rayner et al. Nat Genet 2014:46: ) GIANT projektin > henkilöä käsittävässä analyysissä 9500 vahvimmin assosioitunutta SNP:tä selittävät 29% pituuden varianssista Kaikki tavalliset variantit yhteensä selittävät n. 60% pituuden heritabiliteetista

13 Yhteenveto: Voidaanko geenitiedolla lisätä kansanterveyttä? Genetiikka on tuottanut merkittävää uutta tietoa ihmisen biologiasta ja tautien patofysiologiasta Suurin merkitys syöpätaudeissa (rinta-, ovariaali- ja colorektaali ca). Farmakogenetiikka helpottaa joidenkin lääkkeiden valintaa ja annostusta. Lääkekehitys voi nopeutua. Geenitiedossa on potentiaalia, mutta Tavallisten, monitekijäisten kansantautien preventiossa ja hoidossa elämäntavat ovat paljon keskeisemmässä asemassa kuin genetiikka Esityksen nimi / Tekijä 13

14 Kiitos Esityksen nimi / Tekijä 14

15 From: Physical Activity and the Association of Common FTO Gene Variants With Body Mass Index and Obesity Arch Intern Med. 2008;168(16): doi: /archinte Figure Legend: Predicted body mass index (BMI), calculated as weight in kilograms divided by height in meters squared, as a function of residualized age- and sex-specific ln-transformed physical activity accelerometer counts according to FTO rs genotypes. On the left side of the plot (low physical activity), BMI levels are strikingly dissimilar between rs genotypes. In contrast, on the right side of the plot, similar BMI levels can be seen across genotypes, particularly in subjects with very high levels of physical activity. Copyright 2014 American Medical Date of download: 11/13/2014 Association. All rights reserved.

16 Human Genome Project Alkoi 1990 Ensimmäiset luonnokset valmiita vuonna 2000 Valmis Esityksen nimi / Tekijä 16

17