Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi

Samankaltaiset tiedostot
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne

RINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

NGS-tutkimukset lääkärin työkaluna Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

Molekyyligeneettiset testit syövän hoidon suuntaajina. Laura Lahtinen Molekylibiologi, FT Patologia Keski-Suomen keskussairaala


Perinnöllisyyden perusteita

NGS:n haasteet diagnostiikassa Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?

Syöpägeenit. prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto

Keuhkosyövän molekyylipatologia

Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna

Katja Aktan-Collan Alkoholi ja syöpä

DNA sukututkimuksen tukena

Hyvä käyttäjä! Ystävällisin terveisin. Toimitus

DNA-testit. sukututkimuksessa Keravan kirjasto Paula Päivinen

Molekyyligenetiikka. Arto Orpana, FT dos. apulaisylikemisti

Muuttuva diagnostiikka avain yksilöityyn hoitoon

PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto

- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,

Molekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa. Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys

Genomitiedon hyödyntäminen yksilötasolla ja tiedon omistajuus

Vectibix (panitumumabi) levinneessä suolistosyövässä

Syövän synty. Esisyöpägeenit (proto-onkogeenit)

HPV-infektion ja kohdunkaulan syövän esiasteiden luonnollinen kulku

Tupakkalain muutos 2010

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Yleispatologia Johdanto

Potilasopas. 12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu?

Tutkimus Auria Biopankissa ja tulevaisuuden visiot Samu Kurki, FT, data-analyytikko

Bioteknologian perustyökaluja

9/30/2013. GMO analytiikka. Termistöä. Markkinoilla olevien GM kasvien ominaisuuksia

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Potilasesite Robottitekniikkaan perustuvaa tarkkuussädehoitoa Kuopiossa

Biopankit miksi ja millä ehdoilla?

måndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda

DNA testit sukututkimuksessa

6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi

Geeneistä genomiin, mikä muuttuu? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm

GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA

MRI ja kohdunrunkosyövän leikkauksen suunnittelu 1 GKS Helsinki. Arto Leminen

PCR - tekniikka elintarvikeanalytiikassa

Clinical impact of serum proteins on drug delivery Felix Kratz, Bakheet Elsadek Journal of Controlled Release 161 (2012)

Istukkagonadotropiini (hcg) - enemmän kuin raskaushormoni. Kristina Hotakainen, LT. Kliinisen kemian yksikkö Helsingin yliopisto ja HUSLAB

Syöpähoitojen kehitys haja- Pirkko Kellokumpu-Lehtinen Säde- ja kasvainhoidon professori, ylilääkäri, TaY/TAYS

Syöpätautien hoidoista vaikuttavia tuloksia, lisää elinvuosia, odotuksia ja pettymyksiä

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Lääketieteellinen tiedekunta Biokemia ja kehitysbiologia

Säteilyvaikutuksen synty. Erikoistuvien lääkärien päivät Kuopio

rakko ja virtsatiet (C65 68, D09.0 1, D30.1 9, D41.1)

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

Avainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla

Uuden sukupolven sekvensointimenetelmät ja diagnostiikka

Harvinaissairauksien diagnostiikan ja hoidon tulevaisuuden näkymiä

Uutta lääkkeistä: Vemurafenibi

Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä

Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä

Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi

Suomen Syöpärekisteri Syöpätautien tilastollinen ja epidemiologinen tutkimuslaitos. Syöpäpotilaiden eloonjäämisluvut alueittain

Mitä julkisen terveydenhuollon pitäisi tarjota?

DNA:n informaation kulku, koostumus

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY

Mutaatiot ovat muutoksia perimässä

Syöpä Esipuhe 2. 2 Syöpätilanne Ilmaantuvuus ja kuolleisuus 4. 4 Potilaiden elossaolo 13

Francis Crick ja James D. Watson

DNA (deoksiribonukleiinihappo)

Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio

Kirurgisen leikkauspreparaatin raportointikäyt

ENDOMETRIOOSI JA SYÖPÄRISKI Ralf Bützow

VASTAUS 1: Yhdistä oikein

Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset

Julkisen yhteenvedon osiot

Geneettisen tutkimustiedon

MUNASARJAN EI- EPITELIAALISTEN MALIGNIEN KASVAINTEN KIRURGINEN HOITO

Levinneen suolistosyövän hoito

Terveyteen liittyvät geenitestit

Säteily ja solu - solun toiminta on monimutkaista ja tarkoin säädeltyä Riitta Mustonen

GMO analytiikka Annikki Welling Kemian tutkimusyksikkö Evira

DNA (deoksiribonukleiinihappo)

Rintasyövän perinnöllisyys

Hallikaisten varhaisvaiheet ja suvun DNA-tulokset Ari Kolehmainen Suku- ja historiapalvelu Menneen jäljet

Vectibix (panitumumabi) levinneessä suolistosyövässä. Opas potilaan ohjaukseen lääkärille ja hoitajalle

Potilasopas. 2 PL 24, OYS puh (08) faksi (08)

Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.

Suoritusarvot. Sample to Insight. Myöhemmät analyysit. Puhdistetun DNA:n tuotos. Versiotiedot. QIAamp DSP DNA FFPE Tissue Kit, Versio

Lääketieteellinen Systeemibiologia

POTILASTIEDOTE JA SUOSTUMUS GEENITESTIT Hoitavan lääkärinne pyynnöstä toteutettavat ja Genzymen tarjoamat diagnostiset testit

Kromosomimuutokset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com. Huhtikuussa 2008

Glioomien molekyylidiagnostiikkaa Maria Gardberg TYKS-Sapa Patologia / Turun Yliopisto

Farmakogeneettiset testit apuna lääkehoidon arvioinnissa

Mitä uutta DNA:sta. - koko perimän laajuiset analyysimenetelmät ja niiden sovellukset. Heidi Nousiainen, FT Erikoistuva kemisti, HUSLAB

Kipu. Oleg Kambur. Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT

Mustaruoste uhkaa romahduttaa maailman vehnäsadot jälleen

BIOLOGIAN OSIO (45 p.)

BIOLOGIAN OSIO (45 p.)

PATOLOGIA PATOLOGIAN TUTKIMUSNIMIKKEET

Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30

Perinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen

Meripihka. Trilobiitti. 1. Fossiilit. Hominidin kallo. Kivettynyt metsä. Ramses Suuri. Jäätynyt mammutti. Jäämies

Transkriptio:

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx keystocancer.fi FI/FMI/1810/0067 Lokakuu 2018

FoundationOne CDx -geeniprofilointi FoundationOne CDx on kattava geeniprofilointipalvelu, jossa tutkitaan syöpäkasvaimen DNA:ssa tapahtuneita muutoksia. Syöpä syntyy, kun ihmisen solujen DNA:ssa tapahtuu muutoksia, joita elimistö ei tunnista tai pysty korjaamaan. Näitä muutoksia voivat olla esimerkiksi DNA:n ns. pistemutaatiot, insertiot, t, kopio lukumuutokset ja geenifuusiot. PERUSTEELLINEN Tunnistaa kaikentyyppiset mutaatiot OIKEA LÄÄKE OIKEA POTILAS LAAJA Analysoi kerralla 324 geeniä FoundationOne CDx tunnistaa kaikentyyppiset mutaatiot, jotka mahdollisesti vaikuttavat syöpäkasvaimen kasvuun. FoundationOne CDx -geeniprofiloinnin tuloksena syntyy kattava raportti, jonka avulla lääkäri saa kasvaimesta arvokasta lisätietoa ja pystyy arvioimaan, sopiiko joku olemassa olevista täsmälääkehoidoista potilaan kasvaimen hoitoon. KATTAVA Antaa kasvaimesta arvokasta lisätietoa Syöpäkasvainten genomimuutostyypit Insertiot ja t Deleetioissa DNA:sta irtoaa ja poistuu yksittäistä emäsparia, DNA:n tärkeintä rakenneyksikköä, isompi osa. Insertioissa vastaavasti DNA:han tulee pätkä DNA:ta lisää. Kopiolukumuutokset Kokonaisia geenejä kopioituu perimään lisää tai poistuu kokonaan. Pistemutaatiot Yksi emäspari muuttuu toiseksi. Uudelleenjärjestäytyminen Kaksi aiemmin eri geeneissä ollutta pätkää DNA:sta liittyy yhteen, jolloin syntyy niin sanottu fuusi o geeni. Y Z ZY

Miten geeniprofilointi eroaa perinteisestä syövänhoidosta? Perinteinen syövänhoidossa käytetty geenitesti tunnistaa yleensä vain yhden tai kahden tyyppiset genomimuutokset. FoundationOne CDx geeniprofilointi tunnistaa useita erityyppisiä muutoksia ja pystyy löytämään mahdollisesti hoitoon vaikuttavia mutaatioita jopa 90%:sta kasvaimia. (Lähde: Schwaederle M et al. Mol Cancer Ther 2015; 14:1488 1494). Perinteinen geenitesti uudelleenjärjestäytyminen kopiolukumuutos pistemutaatio FoundationOne CDx -geeniprofilointi uudelleenjärjestäytyminen kopiolukumuutos pistemutaatio Kokemus jo 160 000:sta potilaasta Kuvasta on nähtävissä FoundationOne CDx -geeni profilointi analyysien jakaantumisen eri syöpätyyppien kesken ensimmäisten 160 000 Foundation Medicinen analysoiman potilaan kohdalta. Tutkitut tapaukset sisältävät yli 55 erilaista kasvain tyyppiä. Yleisimmät syövät olivat keuhko-, rinta- ja paksusuolen syövät. Kuitenkin yksi kolmasosa kasvaimista oli harvinaisia kasvain tyyppejä. Näitä olivat esimerkiksi neuroendokriini-, sylkirauhas-, lisämunuaiskasvaimet, melanoomat, paksu suolen ulkopuoliset ruoansulatus kanavan kasvaimet ja neuroblastoomat. FoundationOne CDx geeni profiloinnin avulla myös harvinaisista syövistä saadaan lisätietoa, josta voi olla hoidon suunnittelussa apua. RAKKO MAHA ETURAUHANEN IHO MUNUAINEN PÄÄN ALUE MAKSA KOHTU HAIMA MUNASARJA FoundationOne- PROFILOINNIT SYÖPÄTYYPEITTÄIN PEHMYT- KUDOS AIVOT LUU KEUHKO RINTA PAKSUSUOLI

Jokainen syöpä on ainutlaatuinen miksei hoitokin? Hoitoon vaikuttavien mutaatioiden tunnistamisen kautta kohdennetuista täsmä hoidoista on saatu lupaavia tuloksia. Samalla täsmähoidot ovat muuttaneet syövän hoitoa, sillä monet tavallisetkin syövät ovat jakautuneet alatyyppeihin, joiden hoidot poikkeavat toisistaan. Esimerkiksi vuonna 2003 keuhkosyövän ajateltiin olevan yksi ja sama syöpä. Vuonna 2004 pystyttiin tunnistamaan vain 2 hoidon kannalta merkittävää geenimuutosta keuhkosyövässä. Vuonna 2016 pystyttiin tunnistamaan yli 20 hoidon kannalta mahdollisesti merkittävää geenimuutosta keuhkosyövässä, mikä on mahdollistanut keuhkosyövän yksilöllisen hoidon. Ei ole olemassa vain yhdenlaista keuhkosyöpää erilaisia keuhkosyöpiä on yhtä monta kuin potilaitakin KRAS EGFR 2004 EGFR T790M EGFR EKSONI 20 EGFR WT AMP EGFR HERKISTÄVÄ EI MUTAATIOTA 2016 MUU MARKKERI PTEN LOSS CDKN2A LOSS BRAF NON-V600E NF1 LOSS FGFR1/2 NRAS PIK3CA MAP2K1 ERBB2 MUT TSC1/2 LOSS BRCA 1/2 LOSS ERBB AMP MET AMP KRAS ALK FUUSIO MET SPLICE BRAF V600E RET FUUSIO ROS1 FUUSIO Pao ja Girard, 2011 Jordan et al. 2017 Vuonna 2004 pystyttiin tunnistamaan vain 2 hoidon kannalta merkittävää geenimuutosta keuhkosyövässä. Vuonna 2016 pystyttiin tunnistamaan jo yli 20 hoidon kannalta mahdollisesti merkittävää geenimuutosta keuhkosyövässä.

Miksi FoundationOne CDx? Kattava tutkimus tuottaa luotettavat tulokset Tunnistaa kaikki genomin muutostyypit pistemutaatiot, insertiot ja t, kopiolukumuutokset ja fuusiot. FoundationOne CDx on kiinteiden kasvainten kattava geeni profilointipalvelu, joka on validoitu vertaisarvioidussa tieteellisessä julkaisussa. * Uusia mahdollisuuksia Perinteiset geenitestit tunnistavat yleensä vain yhden tai kahden tyyppisiä genomin muutoksia. FoundationOne CDx :n avulla on mahdollista löytää enemmän hoitovaihtoehtoja. Säästä näytettä ja aikaa Analyysin tekemiseen tarvitaan vain pieni määrä näytettä biopsiat ja ohutneulanäytteet mahdollisia tietyissä tapauksissa Tuloksena kattava raportti Lääkäri saa kasvaimesta arvokasta lisätietoa ja pystyy arvioimaan, sopiiko joku olemassa olevista täsmälääkehoidoista potilaan kasvaimen hoitoon. Lääkärisi käy tulokset kanssasi henkilökohtaisesti läpi. * Frampton GM, Fichtenholtz A, Otto GA, et al., Development and validation of a clinical cancer genomic pro ling test based on massively parallel DNA sequencing. Nat Biotechnol. 2013 Oct 20.