Syöpägeenit. prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto



Samankaltaiset tiedostot
Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne

Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi

Miten ehkäistä suolisyöpää? Jukka- Pekka Mecklin Yleiskirurgian professori K- SKS ja Itä- Suomen yliopisto

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

HPV-infektion ja kohdunkaulan syövän esiasteiden luonnollinen kulku

Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet?

Monogeeniset sairaudet. Monogeeninen periytyminen. Perinnöllisten tautien prevalenssi. Monitekijäiset sairaudet. Dominantti vs.

RINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA

Etunimi: Henkilötunnus:

Perinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen

Avainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.

PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto

Perinnöllisyyden perusteita

Katja Aktan-Collan Alkoholi ja syöpä

Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15

SÄTEILYN GENEETTISET VAIKUTUKSET

Rintasyövän perinnöllisyys

Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna

Genomitiedon hyödyntäminen yksilötasolla ja tiedon omistajuus


DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.

Molekyyligeneettiset testit syövän hoidon suuntaajina. Laura Lahtinen Molekylibiologi, FT Patologia Keski-Suomen keskussairaala

Solujen viestintäjärjestelmät. Katri Koli, Solu- ja molekyylibiologian dosentti Helsingin Yliopisto

vauriotyypit Figure 5-17.mhc.restriktio 9/24/14 Autoimmuniteetti Kudosvaurion mekanismit Petteri Arstila Haartman-instituutti Patogeeniset mekanismit

Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

Mutaatiot ovat muutoksia perimässä

Parkinsonin tauti on monitekijäinen tauti, jonka synnyssä erilaisilla elämän aikana vaikuttavilla tekijöillä ja perimällä on oma osuutensa.

Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana. Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere

Munasarjojen poisto kohdunpoiston yhteydessä GKS Eija Tomás, Tays

Hyvä käyttäjä! Ystävällisin terveisin. Toimitus

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Lääketieteellinen tiedekunta Biokemia ja kehitysbiologia

Peittyvä periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

NGS-tutkimukset lääkärin työkaluna Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

Molekyyligenetiikka. Arto Orpana, FT dos. apulaisylikemisti

Sidekudosoireyhtymät. Perinnölliset sidekudosoireyhtymät. Marfanin oireyhtymä (s. 284) Luusto. Silmät. Perinnölliset sidekudoksen sairaudet 24.8.

Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

Solujen muuntumisprosessi kestää vuosia tai

Geneettinen alttius syövälle

Suomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013

S Laskennallinen systeemibiologia

Syövän synty. Esisyöpägeenit (proto-onkogeenit)

Perinnöllinen ei-polypoottinen kolorektaalisyöpä

Plasmasolukasvaimet (hematologin näkökulmasta) Eeva-Riitta Savolainen LKT, dos Os.ylilääkäri

X-kromosominen periytyminen. Potilasopas. TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, Turku puh (02) faksi (02)

Molekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa. Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys

Muuttuva diagnostiikka avain yksilöityyn hoitoon

Tietoa ja tuloksia tutkittavalle: miten ja miksi?

RAD50:N MERKITYS PERINNÖLLISESSÄ RINTASYÖPÄALTTIUDESSA

Biologia. Pakolliset kurssit. 1. Eliömaailma (BI1)

VASTAUS 1: Yhdistä oikein

Syöpähoitojen kehitys haja- Pirkko Kellokumpu-Lehtinen Säde- ja kasvainhoidon professori, ylilääkäri, TaY/TAYS

PERINNÖLLINEN ALTTIUS RINTA-, MUNASARJA- JA KOHTUSYÖVÄLLE

Levinneen suolistosyövän hoito

Symbioosi 2 VASTAUKSET

GYNEKOLOGINEN SYÖPÄ

Säteilyvaikutuksen synty. Erikoistuvien lääkärien päivät Kuopio

Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio

Vastaa lyhyesti selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Nikotiniriippuvuus. Anne Pietinalho, LKT, dos, FCCP Johtava lääkäri, Raaseporin tk Asiantuntijalääkäri, Filha ry

Autoimmuunitaudit: osa 1

Luutuumorit IAP Turku Tom Böhling HUSLAB/Peijas-Hyvinkää ja HY

DNA:n informaation kulku, koostumus

Kohdun sileälihaskasvaimet. Molekylaariset mekanismit ja histologiset kriteerit. Tom Böhling Haartman-instituutti, HY HUSLAB

A - soveltaminen B - ymmärtäminen C - tietäminen 1 - ehdottomasti osattava 2 - osattava hyvin 3 - erityisosaaminen

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

In Situ Hybridisaatio - menetelmä patologian laboratorion työvälineenä

Valmistaudu vaihdevuosiin Teija Alanko Gynekologi

Syöpä Esipuhe 2. 2 Syöpätilanne Ilmaantuvuus ja kuolleisuus 4. 4 Potilaiden elossaolo 13

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

Arvokkaiden yhdisteiden tuottaminen kasveissa ja kasvisoluviljelmissä

? LUCA (Last universal common ancestor) 3.5 miljardia v.

NGS:n haasteet diagnostiikassa Soili Kytölä, dos. sairaalageneetikko HUSLAB, genetiikan laboratorio

Narkolepsian immunologiaa ja Pandemrixiin liittyvät tutkimkset

Syöpä ja eriarvoisuus

Yoshinori Ohsumille Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology

NLRP12-geeniin liittyvä toistuva kuume

PTEN -ekspressio rintasyövässä

Mevalonaattikinaasin vajaatoiminta (MKD) ja Hyperimmunoglobulinemia D-oireyhtymä (HIDS)

Naudan perinnöllisen monimuotoisuuden tutkimus

Potilasopas. 2 PL 24, OYS puh (08) faksi (08)

Selkäydinneste vai geenitutkimus?

Evoluutio. BI Elämä ja evoluutio Leena Kangas-Järviluoma

Oppimistavoitteet. Syöpien esiintyvyys, ennuste, hoito ja tutkimus. Syöpien esiintyvyys. Suomen syöpärekisteri. Lisäksi

Kromosomimuutokset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com. Huhtikuussa 2008

Genetiikan perusteiden toisen jakson kaavailua

Hammaslääketiede Perinnöllisten tautien diagnostiikka ja perinnöllisyysneuvonta

måndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda

Perinnöllisyyden perusteita

Potilasopas. 12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu?

Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä

Keuhkosyövän molekyylipatologia

Transkriptio:

Syöpägeenit prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto

Mitä syöpä on? Ryhmä sairauksia, joille on ominaista: - solukasvun säätelyn häiriö - puutteet solujen erilaistumisessa - solujen tunkeutuminen ympäröivään kudokseen sekä muualle elimistöön

Syövän tunnusmerkit jatkuva kasvusignaali solukuoleman välttäminen kasvun estosignaalien välttäminen uusien verisuonien muodostus invaasio ja etäpesäkkeet pysyvä jakautumiskyky Hanahan and Weinberg, Cell 100:57-70, 2000

Syöpää aiheuttavat tekijät säteily kemialliset karsinogeenit esim. tupakka, ravinto virukset, bakteerit, krooninen tulehdus hormonaaliset tekijät mutaatiot perinnöllinen alttius

Mutaatiot emäsjärjestyksen muutos, joka periytyy tytärsoluille ituradan (synnynnäiset) hankitut (somaattiset) mutaatiot koko kromosomiston muutokset kromosomitason muutokset yksittäisten geenien muutokset

Geenimutaatiot pistemutaatiot deleetiot (häviämät) duplikaatiot (kahdentumat) translokaatiot (siirtymät)

Mutaatioiden seuraukset

Mutaatioiden seuraukset Koodaava alue: neutraali / hiljainen mutaatio ei vaikutusta muuntunut aminohappo proteiinin toiminta voi muuttua ennenaikainen stop tai lukukehyksen muutos ei lainkaan proteiinia tai muuntunut / toimimaton proteiini yliaktiivisesti toimiva proteiini muuntunut silmukoituminen erilainen proteiini? Ei-koodaava ja säätelyalue?

Mutaatioiden lukumäärä n. 3 / solun jakautuminen tyypillisessä kasvaimessa keskimäärin 50 mutaatiota - driver vs. passenger mutaatio kasvaimen kehittyminen vaatii 5-7 tiettyihin geeneihin / solun toimintoihin kohdistuvaa mutaatiota

Syövän synty ja eteneminen normaali hyperplasia carcinoma in situ invasiivinen syöpä

Paksusuolisyövän kehittyminen http://syscol-project.eu/about-syscol/

Syöpägeenit ja syövän estäjägeenit Figure 20-27 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Onkogeenit geenejä, jotka normaalisti edistävät mm. solukasvua mutaatiot lisäävät aktiivisuutta - lisääntynyt tuotanto - tuotanto epäasiallisessa solussa tai ajankohtana - muuntunut geenituote luonteeltaan dominantteja, yhden alleelin mutaatio riittää aiheuttamaan vaikutuksen

Onkogeenien luokittelu 1. solunulkoiset kasvutekijät 2. solukalvon reseptorit 3. signalointireittien osat 4. DNA:han sitoutuvat säätelyproteiinit 5. solusyklin tai solun eloonjäämisen säätelijät

Epäasiallinen reseptoriaktivaatio mutation or truncated ectodomain

Onkogeenien aktivaatiomekanismit pistemutaatio geenimonistuma kromosomimuutokset - säätelyalueen muutos - fuusiogeenit

Kasvaimenestäjägeenit - määritelmiä geenejä, jotka tyypillisesti säätelevät solujakautumista ja DNA-vaurioiden korjausta mutaatio johtaa toiminnan häviämiseen luonteeltaan resessiivisiä, kummankin alleelin toiminnan hävittävä ennen kuin vaikutusta - ns. Knudsonin kahden osuman malli

Kasvaimenestäjägeenien luokittelu Portinvartijat (gatekeepers) ehkäisevät kasvainten syntyä suoraan hidastamalla solukasvua tai lisäämällä solukuolemaa Huolehtijat (caretakers) ylläpitävät genomin tasapainoa; inaktivaatio johtaa lisääntyneeseen mutaatiotaajuuteen ja sitä kautta syövän syntyyn Maisemoijat (landscapers) pitävät yllä normaalia kudoksen mikroympäristöä, joka osaltaan estää syövän syntyä

Kasvaimenestäjägeenien inaktivointi tyypillisesti molemmat alleelit inaktivoitava mutaatio häviämä heterotsygotian häviäminen epigeneettiset mekanismit proteiinituotteen sitoutuminen muihin proteiineihin muut?

Hankitut mutaatiot - merkitys syöpien tarkempi luokittelu potilaan ennusteen arviointi asianmukaisen lääkehoidon valinta hoidon seuranta

Hankitut mutaatiot - diagnostiikka Pahanlaatuiset veritaudit - leukemiat ja lymfoomat - dg, ennuste, hoidon valinta, seuranta - kromosomi- ja geenimuutokset tunnetaan hyvin Kiinteän kudoksen kasvaimet - sarkoomat, aivokasvaimet: dg, ennuste - rintasyöpä: HER2 -geenin monistuma - paksunsuolensyöpä, keuhkosyöpä, melanooma: dg, hoidon valinta

Hankitut mutaatiot - diagnostiikka EGFR mutaatiot keuhkosyövässä - 28 yleistä mutaatiota: deleetiot, insertiot, aminohappomuutokset - n. 70-75 % mutaatiopositiivista reagoi hyvin EGFR tyrosiinikinaasiestäjähoitoon HER2 rintasyöpä, monistuma /yliekspressio, esiintyvyys n. 20% - prognostinen markkeri - korreloi Herceptin hoidon tehoon http://www.mun.ca/biology

Hankitut mutaatiot - diagnostiikka KRAS - paksusuolisyöpä, 7 yleisintä mutaatiota kodoneissa 12 ja 13 - mutaatiopositiiviset eivät reagoi EGFR-reseptoria vastaan kohdistuvaan hoitoon BRAF melanooma, karvasoluleukemia - V600E ja V600K mutaatiot - hyvä vaste vemurafenibi hoitoon http://www.clarientinc.com

Hankitut mutaatiot - diagnostiikka KIT onkogeeni: - mutaatio 75 % GIST kasvaimista - imatinibihoito: eksoni 11 mutaatio hyvä vaste eksoni 9 mutaatio huono vaste

Sporadinen syöpä 80 % Perheittäinen 10-15 % Periytyvä 1-10 %

Periytyvä syöpä - ominaisuuksia Useita syöpätapauksia samassa perheessä Syöpä epätavallisen nuorella iällä Useita eri syöpiä samalla henkilöllä Syöpä ei-tyypillisellä sukupuolella Syöpä liittyneenä muihin ominaisuuksiin

Syöpäalttiusgeenit tyypillisesti kasvaimenestäjägeenejä, jotka noudattavat Knudsonin mallia penetranssi = mutaation kantajien todennäköisyys sairastua tautiin (100% penetranssi kaikki sairastuvat; 50% penetranssi puolet sairastuu) mutaatio korkean penetranssin geenissä suuri syöpäriski - suhteellisen harvinaisia - väestötasolla merkitys pieni mutaatio matalan penetranssin geenissä matala syöpäriski - yleisiä väestössä selittävät ison osan sairastumisista

Periytyvä syöpäalttius Syöpäsyndroomat 1-10 % harvinaisia syöpiä tai syöpien yhdistelmiä yksilön riski sairastus korkea esimerkkejä: Li-Fraumeni syndrome: p53 perinnöllinen rintasyöpä: BRCA1, BRCA2 Perheittäin esiintyvä syöpä 10-15 % useita yleisiä syöpiä samassa perheessä yksilön riski sairastua kohtalainen tai matala

Periytyvät syöpäsyndroomat ~30 syndroomaa, joiden mutaatio tunnettu pääasiassa dominantisti periytyviä geneettinen tausta voi olla heterogeeninen, esim. HNPCC Mutaation kantajan todennäköisyys sairastua syöpään vaihtelee ja riippuu useasta tekijästä: - mutaation tyyppi ja paikka geenissä - muut mahdolliset riskiä lisäävät geenit - ympäristötekijät - muut mahdolliset tekijät

Retinoblastoma harvinainen (1:20 000) lapsilla esiintyvä kasvain, joka saa alkunsa kypsymättömistä verkkokalvon hermosoluista kaksi muotoa - perinnöllinen: useita kasvaimia, molemmissa silmissä - sporadinen: yksi kasvain, yhdessä silmässä lisääntynyt alttius muille syöville (osteosarkoma, keuhko-, rinta-, eturauhas-, rakko-, haima-, ruokatorven syöpä) aiheutuu retinoblastoma (RB1) geenin mutaatiosta - kasvaimenestäjägeeni - säätelee solusykliä

Retinoblastoman geneettinen mekanismi Knudson: kahden osuman hypoteesi Figure 20-30 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008)

Periytyvä ei-polypoottinen suolisyöpä (HNPCC / Lynch syndrooma) Amsterdam II kriteerit vähintään kolme sukulaista, joilla HNPCC syöpä vähintään yksi I asteen sukulainen tapauksia vähintään kahdessa sukupolvessa vähintään yksi potilas alle 50v FAP poissuljettu

Periytyvä ei-polypoottinen suolisyöpä (HNPCC / Lynch syndrooma) selittää 1-5 % kaikista paksusuolisyövistä tyypillinen sairastumisikä 30-50 vuotta DNA-vaurioita korjaavien MMR (mismatch repair) geenien (MSH2, MLH1, MSH6, PMS2) inaktivaatio mutaation kantajalla > 80% riski sairastua paksusuolisyöpään muut kasvaimet: kohdun runko-osa, mahalaukku, munasarjat, urologiset elimet, sappitiet, keskushermosto kolonoskopiaseuranta ja syövän esiasteiden poisto

FAP, familiaalinen adenomatoottinen polypoosi alle 1 % paksusuolisyövistä APC geeni (adenomatous polyposis coli, 5q21) satoja tuhansia polyyppejä paksu- ja peräsuolessa, muita ruoansulatuskanavan kasvaimia, kilpirauhassyöpää ensimmäiset polyypit jo lapsuudessa / nuoruudessa penetranssi lähes 100 % ilman hoitoa useimmille paksusuolisyöpä ennen 40 ikävuotta tehokas seulonta välttämätön

FAP, familiaalinen adenomatoottinen polypoosi useimmat APC geenin mutaatiot johtavat ennenaikaiseen stop-kodoniin mutaatiot geenin eri osassa erilainen ilmiasu - kodonin 1300 lähettyvillä vaikea tauti - kodoneissa 1-158 lievä tauti n. 1/3 uusia mutaatioita, perhekohtaiset mutaatiot

Muita paksusuolisyöpä syndroomia Turcot syndrome (MLH1, PMS2) HNPCC variantti Muir-Torre syndrome (MLH1, PMS2) HNPCC variantti MYH-assosioitu polypoosi (MUTYH ) Juveniili polypoosi (SMAD4, BMPR1A) Peutz-Jeghers syndrooma (STK11/LKB1) Cowden syndrooma (PTEN)

Syövänalttiusgeenit - diagnostiikka tavoite: - syöpäalttiuden syyn tunnistaminen - henkilöt, joilla lisääntynyt syöpäalttius mahdolliset toimenpiteet - vapautus suurentuneesta syöpäriskistä suku / perhe vs. yksilö perinnöllisyysneuvonta

Yhteenveto syövän synty on monimutkainen prosessi, jossa ovat osallisina sekä periytyvät että hankitut mutaatiot geenimuutosten ymmärtäminen: - syöpien syntymekanismit - diagnostiikka - hoito - ennaltaehkäisy

Tulevaisuuden näkymiä Henkilökohtainen lääketiede potilaan perimän ja taudin perusteella yksilöity hoito oikea lääke, jonka teho edeltä osoitettu lääkeannoksen valinta ja lääkeaineiden mahd. yhteisvaikutusten / sivuvaikutusten ennustaminen ja minimointi potilaskohtaisesti