Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys
|
|
- Helinä Korpela
- 7 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 Pentti Tienari, Anna Kiviharju, Miko Valori, Dan Lindholm ja Hannu Laaksovirta Amyotrofisen lateraaliskleroosin ja otsalohkodementian patogeneesi avautuu: Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys Hermoston rappeumasairauksien mekanismit ovat kantasolututkimuksen menetelmien kehityksen myötä alkaneet avautua. C9orf72-geenin toistojaksopidentymä tunnistettiin vuonna 2011 sekä amyotrofisen lateraaliskleroosin että otsalohkodementian yleisimmäksi geneettiseksi syyksi. Vain muutamaa vuotta myöhemmin tämän mutaation aiheuttamat erilaiset mekanismit ovat paljastumassa, ja hoitokokeitakin on jo tehty ihmisen kantasoluista erilaistetuissa hermosoluissa. Esittelemme C9orf72-geenin toistojaksopidentymän roolia sairauksien epidemiologiassa ja sen aiheuttamia häiriöitä hermosolujen toiminnan kannalta. A myotrofinen lateraaliskleroosi (ALS) on liikehermot tuhoava motoneuronisairaus, jonka syy on askarruttanut tutkijoita vuosikymmeniä. Tauti alkaa tyypillisesti vuotiaana ja johtaa tahdonalaisen lihaksiston surkastuessa kuolemaan keskimäärin neljän vuoden kuluttua diagnoosista. Suomessa todetaan vuosittain vajaat 200 uutta tapausta. Suomessa noin 10 % tapauksista on suvuittaisia eli familiaalisia, mutta taudin syy voi olla geneettinen, vaikka selvää sukutaustaa ei tulisikaan ilmi. Familiaalisen ALS:n taustalta on löydetty useita geenivirheitä. Vuonna 1993 kuvattiin ensimmäiset mutaatiot kromosomin 21 SOD1- geenissä (superoxide dismutase-1), josta on sittemmin löydetty yli 150 mutaatiota. SOD1- mutaatioiden tautimekanismit ovat kuitenkin edelleen epäselviä. Erityinen skandinaavinen peittyvästi periytyvä SOD1-mutaatio (D90A) on kuvattu vuonna 1995, ja se on Suomessa melko yleinen. Noin 10 %:lla suomalaisista ALS-potilaista on tämä tautimuoto. Siihen liittyy alaraajoista alkava, klassisesta ALS:sta poikkeava, hyvin hitaasti etenevä tautimuoto. ALS:n taustalta on löydetty SOD1:n lisäksi mutaatioita myös eräistä muista geeneistä (muun muassa TARDBP, FUS), mutta nämä selittävät vain pienen osan ALS:n geneettisestä taustasta. Vuonna 2011 löydettiin kansainvälisten konsortioiden voimin ALS:n yleisin geneettinen syy. Kyseessä on kromosomissa 9 sijaitseva C9orf72-geenin (chromosome 9 open reading frame 72) ei-koodaavan alueen GGGGCCtoistojakson valtava monistuma (1, 2). Kyseinen mutaatio voi aiheuttaa ALS:n lisäksi myös otsa-ohimolohkodementiaa (frontotemporaalidementia) sekä näiden yhdistelmää. Otsa-ohimolohkodementia on toiseksi yleisin nuorella iällä alkava dementoiva ja kuolemaan johtava sairaus. Myös sen keskimääräinen alkamisikä on vuotta. C9orf72-mutaatio on erityisen yleinen Suomessa ja muissa pohjoiseurooppalaisperäisissä väestöissä. Suomalaisista familiaalisista ALSpotilaista 46 % ja sporadisista (ei sukutaustaa) 21 % kantaa tätä mutaatiota, vastaavasti familiaalisista otsa-ohimolohkodementiapotilaista mutaatiota kantaa 48 % ja sporadisista 19 % (1, 3). Muualta Euroopasta ja Yhdysvalloista kerätyiltä familiaalisilta ALS-potilailta mutaatio löytyy 39 %:lta ja sporadisista 7 %:lta. Vastaavat luvut otsa-ohimolohkodementian osalta ovat 25 % ja 6 % (3, 4). 423 Duodecim 2016;132:423 31
2 C9orf72-tautien piirteet On epäselvää, miksi sama mutaatiotyyppi johtaa joillakin ALS:iin ja toisilla otsa-ohimolohkodementiaan. Kliinisesti C9orf72-mutaation aiheuttama tauti (C9-ALS) ei eroa selvästi muusta klassisesta ALS:sta. Otsa-ohimolohkodementia ilmenee C9-ALS:n liitännäissairautena %:lla. C9-ALS:n kliiniseen kuvaan voi liittyä raajojen rigiditeettiä, ja lisäksi bulbaarinen alku hieman useammin kuin ALS:ssa yleensä. C9-otsa-ohimolohkodementia alkaa tyypillisesti käyttäytymisen muutoksilla ja harhaluuloisuudella (5). C9orf72-mutaatio saattaa aiheuttaa satunnaisesti myös muita neurodegeneratiivisia tiloja siten, että kliinisenä diagnoosina on Alzheimerin tauti, Creutzfeldt Jakobin tauti, Huntingtonin taudin kaltainen sairaus tai Parkinsonin tauti (6, 7). Neuropatologisisesti C9orf72-mutaation on havaittu johtavan TARDBP-geenin koodittaman TDP43-proteiinin sytoplasmisiin kertymiin motoneuroneissa ja pikkuaivojen granulosyyttien tumien p62-proteiinin kertymiin. TDP43 sijaitsee normaalisti tumassa, jossa se sitoutuu DNA:han ja RNA:han ja säätelee muun muassa geenien transkriptiota ja silmukointia. p62 sitoutuu ubikitinoituneihin proteiineihin ja säätelee niiden kuljetusta autofagosomeihin. Geenitestauksesta Diagnostisen geenitestauksen tulee olla erittäin perusteellisesti harkittua, sillä C9-ALS on yleensä kliinisesti selkeäoireinen ja diagnoosiin päästään lähes aina ilman geenitestiäkin. Tässä on selvä ero peittyvästi periytyvään SOD1*D90A-mutaatioon, jonka aiheuttaman ALS:n diagnosointi on alkuvaiheessa vai keaa ilman geenitestausta. C9orf72-geenitesti on saatavana Suomessa Turun ja Tampereen yliopistoissa. Geenitestauksen ongelmana on positiivisen testituloksen merkitys potilaan sukulaisille: tällöin ei ainoastaan diagnosoida yhden yksilön tautia, vaan herätetään perinnöllisen sairauden pelko sukulaisissa. Koska geenitesti ei yleensä ole välttämätön diagnoosiin pääsemiseksi, on geenitestaus mielestämme perusteltua vain diagnostisesti ongelmallisissa tapauksissa, kun tehdään rajanvetoa psykiatrisen ja neurodegeneratiivisen sairauden (otsaohimolohkodementia) välillä sekä epätyypillisissä ALS-epäilyissä (joita on vain pieni osa C9-ALS-tapauksista). Terveiden sukulaisten testauksesta on syytä pidättäytyä toistaiseksi kokonaan huomioiden älä vahingoita periaate (primum est non nocere). C9orf72-mutaation erityispiirteet Tähän GGGGCC-toistojakson mutaatioon (KUVA 1) liittyy useita erityispiirteitä, jotka luonnehdimme seuraavassa lyhyesti. Mutaation osoittamisen vaikeus. Toistojaksopidentymää ei ole vielä pystytty sekvensoimaan eikä monistamaan polymeraasiketjureaktiolla (PCR). Mutaatio voidaan osoittaa melko vaativalla Southern blot menetelmällä, jossa toistojakson monistuma näkyy selkeän juovan sijasta pilvenä, joka edustaa eri soluissa esiintyviä vaihtelevan kokoisia toistojaksoja. Toinen menetelmä on niin sanottu RP-PCR (repeat-primed PCR), jossa saadaan pitenevä sarja PCR-tuotteita, kunnes monistuminen vähitellen hiipuu. Tätä menetelmää käytetään nykyisin geenidiagnostiikassa, mutta siihen liittyy vielä runsaasti epävarmuustekijöitä (esimerkiksi normaalivaihtelun laajuus), ja eri laboratorioiden tuloksissa on kiusallisen paljon eroja. Mosaikismi eli monistuman koon vaihtelu eri soluissa. Mosaikismin vuoksi mutaatio näkyy Southern blotissa pilvenä eikä juovana. Mosaikismi saattaa olla yksi syy mutaation vaihtelevaan ilmiasuun. Tämän hypoteesin mukaan joillekin tulee ALS, toisille otsa-ohimolohkodementia ja joskus harvoin jokin muu neurodegeneratiivinen tila sen mukaan, millainen toistojaksopidentymä kuhunkin solupopulaatioon päätyy sikiönkehityksen aikana. Penetranssi ei ole täydellinen eikä monistuman normaalivaihtelua vielä tunneta. Väestössä yli 90 % GGGGCC-toistojakson alleeleista sisältää 2 10 toistojaksoa. Kolmeakymmentä toistojaksoa on alustavasti pidetty normaalivaihtelun ylärajana, mutta tämä raja perustuu lähinnä RP-PCR-menetelmään liittyviin rajoitteisiin. Mutatoituessaan C9orf72- geenin toistojakso monistuu valtavaksi satoja P. Tienari ym. 424
3 C9ORF72-geeni (28 kb) ja RNA ex1 ex2 ex3 ex4 ex5 ex6 ex7 ex8 ex9 ex10 ex11 ex12 (GGGGCC) n Normaali: 2 45 toistojaksoa Ekspansio: toistojaksoa ATG Lyhyt lähetti-rna Pitkä lähetti-rna KUVA 1. C9orf72-geenin organisoituminen ja heksanukleotiditoistojakson ekspansio, joka aiheuttaa toistojakson pitenemisen ja kolmiulotteisen rakenteen muutoksen. Toistojakso tulee osaksi pre-lähetti-rna:ta useimmissa transkripteissa. tai tuhansia toistojaksoja käsittäväksi toistojaksopidentymäksi (KUVA 1). Mutaation kantajien esiintymistiheys on Suomessa noin 0,2 % (Anna Kiviharju ym., julkaisematon tieto). Brittiläisessä vuoden 1958 syntymäkohortissa se oli 0,15 % (6). Se on siten yleisimpiä vallitsevia tautimutaatioita, mutta onneksi sen penetranssi ei ole täydellinen. On esitetty, että niin sanotut keskipitkät toistojaksoalleelit (yli 20 toistojaksoa) olisivat mahdollisesti patogeenisia, mutta tämän teorian tueksi ei kuitenkaan ole vielä riittävästi todisteita (8). Samankokoisia toistojaksopidentymiä on löydetty ikääntyneiltä yksilöiltä ilman neurologista sairautta, ja esimerkiksi Suomessa toistojakson kantajien esiintymistiheys on ikääntyneessä väestössä noin 1,6 % (Kiviharju ym., julkaisematon tieto). Näiden havaintojen perusteella vielä 45 toistojaksoa saattaa kuulua normaalivaihteluun, sillä selvään neurologiseen sairauteen (kuten ALS ja otsa-ohimolohkodementia) niillä ei näytä olevan yhteyttä. Yhteys lievempiin neurologisiin tai psyykkisiin oireisiin vaatii vielä lisätutkimuksia. Perustajavaikutus. Kaikilla tutkituilla potilailla eri puolilla maailmaa monistuma esiintyy samankaltaisessa haplotyyppitaustassa ( suomalainen haplotyyppi ). Haplotyyppien rakenteen perusteella mutaation arvioidaan syntyneen muutamia tuhansia vuosia sitten (3, 4, 9). Maantieteellisen jakauman perusteella se on yleisin Euroopan pohjoisosissa ja Sardi niassa ja hyvin harvinainen Itä-Aasiassa ( Japani, Kiina, Korea). Poikkeavaa RNA:ta ja proteiinia syntyy toistojaksopidentymästä. Vaikka kyseessä on introninen toistojakso, toistojaksopidentymä muuttaa DNA:n rakennetta niin, että lähetti- RNA:n silmukointi ja proteiinin tuottaminen siitä mahdollistuu. Tämä perustuu DNA:n ja RNA:n kolmiulotteiseen rakenteeseen, josta käytetään nimitystä G-quadruplex. Muodostuvista lähetti-rna-molekyyleistä syntyy niin sanottuja abortiivisia transkripteja, eli niistä muodostuu lähetti-rna-pätkiä niin pitkälle kuin RNA-polymeraasi pystyy lähetti-rna:ta kustakin toistojaksoalleelista rakentamaan. Nämä lähetti-rna:t kulkeutuvat tuman ulkopuolelle, jossa ribosomit tuottavat niistä polypeptidejä. Ne ovat varsin monotonisia, sillä ne muodostuvat ainoastaan kodonipareista GGG- GCC (Gly-Ala), GGG-CCG (Gly-Pro), GGC- CGG (Gly-Arg) ja niitä vastaavista antisense- 425 Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys
4 kodoneista CCC-CGG (Pro-Arg), GCC-CCG (Gly-Pro), GGC-CCC (Gly-Pro). Näitä vaihtelevan pituisia dipeptidiproteiineja on pystytty osoittamaan C9-ALS- ja C9-otsa-ohimolohkodementiapotilaiden neuronien sytoplasmasta (10, 11, 12). Samanlainen proteiinisynteesiilmiö on aiemmin kuvattu spinoserebellaarisen ataksian 8 ja tyypin 1 myotonisen dystrofian ei-koodaavan alueen trinukleotidimonistumissa. Ilmiötä kutsutaan termillä RAN-translaatio (repeat-associated non-atg translation) (13). DNA:n ja RNA:n G-quadruplexrakenne Neljä guaniini- eli G-nukleotidia pystyvät liittymään toisiinsa vetysidoksin siten, että muodostuu joko saman DNA- tai RNA-säikeen molekyylinsisäisiä sekundaarirakenteita tai useamman säikeen muodostamia molekyylienvälisiä sekundaarirakenteita. C9orf72-GGGGCC-toistojakson pidentymä saa siis aikaan uudenlaisia rakenteita, eräänlaisia nukleotideista muodostuvia sykkyröitä, joita voi muodostua DNA:sta, RNA:sta ja DNA-RNA-hybrideistä. Nämä rakenteet johtavat poikkeavan lähetti-rna:n ja proteiinin muodostumiseen ei-koodaavalla alueella, vähentävät normaalin C9orf72-lähetti- RNA:n muodostumista ja synnyttävät uusia sitoutumispaikkoja tumaproteiineille. G-quadruplex-rakenteita esiintyy ihmisen genomissa muuallakin, ja niillä arvellaan olevan fysiologinen rooli geenin transkription jarruttamisessa (KUVA 2). Niitä muodostavat sekvenssit ovat säilyneet eri lajien välillä ja sijaitsevat usein toiminnallisilla alueilla, kuten transkription aloituskohdissa (14). C9orf72-proteiini Geenin proteiinituotteen C9orf72 toimintaa tunnetaan vielä huonosti. Vaihtoehtoisen silmukoinnin kautta geeni tuottaa ainakin kahta erikokoista proteiinin isoformia (25 kda ja 55 kda). Kyseessä on kaikissa kudoksissa ilmenevä evoluutiossa säilynyt liukoinen proteiini, joka alustavien tulosten perusteella paikantuu soluissa pääosin tumaan ja solulimaan ja jota mahdollisesti myös erittyy solun ulkopuolelle (1, 15). C9orf72-proteiini saattaa säädellä solun endosytoosia ja autofagiaa (15). C9orf72- proteiinin toiminnan selvittämiseksi tarvitaan vielä paljon lisätutkimuksia. Patogeneesi Helsingissä Biomedicumin kantasolukeskuksessa alettiin jo vuonna 2010, ennen C9orf72- mutaation paljastumista, tehdä indusoituja pluripotentteja kantasoluja (ips) suomalaisten Promoottori Transkription aktivaatio 5 UTR Geeni Transkription esto 5 UTR Geeni KUVA 2. Esimerkki G-quadruplex-rakenteen normaalista fysiologisesta toiminnasta. Geenin säätelyalueella olevan G-quadruplexin välittämä geenin transkription hiljentäminen. G-quad ruplexia stabiloivat proteiinit tehostavat geenin hiljentämistä (esimerkiksi nukleloliinin sitoutuminen c-myc-geenin promoottorin G-quadruplexiin). P. Tienari ym. 426
5 ALS-potilaiden ihon fibroblasteista. Todennäköiset mutaation kantajat pystyttiin tunnistamaan kromosomin 9 haplotyyppirakenteen perusteella (16). Yhteistyössä Jeffrey D. Rothsteinin ryhmän kanssa Johns Hopkins yliopistossa ja sen yhteydessä toimivassa Packard Institute of ALS Research tutkimuslaitoksessa näistä ips-soluista tehtiin motoneuroneita (C9-iPSneuroneita) ja astrosyyttejä, joissa patogeneesia mallinnettiin (17). Tumapatologioiden ilmentymiä on useita, ja niillä kaikilla voi olla oma merkityksensä taudin edetessä (KUVA 3). Glutamaattiherkkyys. C9-iPS-neuronit osoittautuivat herkistyneiksi glutamaatille. Jo 10 µm:n glutamaattipitoisuus johti 50 %:n solukuolemaan, kun verrokki-ips-neuroneista noin 10 % kuoli. Tämän glutamaattiherkkyyden syy paljastui ips-neuroneista ja ALS-vainajien neuropatologisista näytteistä tehdyillä kokeilla. Mutaation aiheuttama (GGGGCC)n-RNA kertyy saarekkeeksi tumaan ja sitoo itseensä useita tumaproteiineja. Useat ribonukleoproteiinit sitoutuvat toistojaksoja sisältäviin transkripteihin ja herkistävät solut kroonisille vaurioille. Yksi näistä proteiineista on ADARB2, joka on AMPA-tyypin glutamaattireseptorin GluR2-alayksikköä editoiva entsyymi. Editointi vaikuttaa lähetti-rna:ssa, ja siinä tapahtuu kodonin muutos siten, että Q607 muuttuu R607:ksi. Aivojen kehityksen aikana esiintyy GluR2:n editoitumatonta versiota, Q607:ää, joka on herkemmin kalsiumioneja läpäisevä. Aikuisilla taas lähes kaikki GluR2-alayksiköt ovat editoitua ja vähemmän kalsiumia läpäisevää R607-muotoa. Näyttää siis siltä, että mutaation yksi vaikutus on eräänlainen adaropatia eli ADARB2:n toiminnanvajaus ja GluR2:n editointivaje (17). Tähän sopii hyvin aiemmin kuvattu ADARB2-poistogeenisten hiirten motoneuronien surkastuminen, joka johtui editoimattomasta GluR2-alayksiköstä ja lisääntyneestä kalsiumin määrästä solussa (18). Tumapatologia. Tumakuljetuksen muutokset ovat patogeneesin toinen keskeinen piirre. Kahdessa tuoreessa artikkelissa osoitettiin banaanikärpäsmallissa, että C9orf72 (GGGGCC) n-rna:n toksisuutta säätelivät useat proteiinit, jotka toiminnaltaan liittyivät tumaliikenteeseen (tumasta ulos tai tumaan sisään) (19, 20). Yksi näistä oli RanGAP-proteiini, joka sitoutuu solulimassa C9orf72-(GGGGCC)n-RNA:n muodostamiin G-quadruplex-rakenteisiin ja estää RanGAP-kuljetuksesta riippuvaisten proteiinien kulkeutumisen solulimasta tumaan tumahuokosten kautta. Tämä ilmiö on vahvistettu banaanikärpäsen lisäksi C9-ALS-potilaiden soluista tehdyissä ips-neuroneissa. RanGAPproteiini kertyy perinukleaariseen tilaan, ja näitä kertymiä havaitaan ips-neuroneiden lisäksi ALS- ja otsa-ohimolohkodementiapotilaiden aivokudoksessa (19). Laajempaakin tuman toimintahäiriötä on kuvattu. Tumajyväsen keskeinen proteiini nukleoliini sitoutuu G-quadruplex-rakenteisiin, mikä johtaa tumajyväsen rakenteen muutoksiin ja ribosomien tuotannon häiriintymiseen (21). Yhteys TDP-43-proteiiniin. Äskettäin on osoitettu, että ADARB2:n ja GluR2:n editointi liittyy myös toisen paljon tutkitun familiaalisen ALS-tekijän TDP-43-proteiinin toimintaan. Lisääntynyt kalsiumin määrä aktivoi hermo solun sisäisiä proteinaaseja, kuten kalpaiinia, joka pilkkoo proteiinia TDP-43 (22). Syto plasmiset Ydinasiat C9orf72-geenin mutaation tutkimus on paljastunut useita hermosolun RNA:han kohdistuvia muutoksia. Mutaatio on ei-koodaavan alueen toistojakson monistuma, joka synnyttää erikoisen kolmiulotteisen rakenteen, josta muodostuu lähetti-rna:ta. Mutantti lähetti-rna sitoutuu tumassa ja tuman ulkopuolella poikkeavasti useaan proteiinin ja estää niiden normaalia toimintaa. Seurauksena on muun muassa glutamaattireseptorin yliaktiivisuus ja hermosolujen herkistyminen glutamaatin toksisille vaikutuksille sekä TDP43-proteiinin tumaan kuljetuksen estyminen. Lisäksi mutaatiosta muodostuva lähetti- RNA muuntuu poikkeavaksi proteiiniksi, jolla saattaa olla toksisia vaikutuksia. 427 Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys
6 A DNA-G-quadruplex B RNA-G-quadruplex C Proteiini-RNA-kertymät D Solupatologiset seuraukset Dipeptidiproteiinit Tumastressi Tumahuokosten kuljetushäiriö Lisääntynyt GluR Ca 2+ -virta KUVA 3. A) C9orf72-geenin GGGGCC-toistojaksoalue laskostuu G-quadruplex-sekundaarirakenteiksi, joissa saman DNA-juosteen guaniininukleotidit sitoutuvat toisiinsa vetysidoksilla. B) Toistojakson läsnäolo saa aikaan ennenaikaisesti päättyviä RNA-transkripteja, joissa toistojaksoalue laskostuu DNA:n tapaan G-quadruplex-rakenteiksi. C) RNA:ta sitovat proteiinit, kuten ADARB2 tumassa ja RanGAP sytoplasman puolella, sitoutuvat toistojakso-rna:han, jolloin niiden normaali toiminta häiriintyy. D) Toistojakso-RNA aiheuttaa lukuisia ongelmia moto neuroneissa. Glutamaattiherkkyys: ADARB2-proteiinin toimintahäiriö aiheuttaa kalsiumia herkemmin läpäisevän AMPA-reseptorimuodon ilmentymisen, mikä altistaa solut glutamaatin eksitotoksisuudelle. Tumastressi: myös muita proteiineja sitoutuu poikkeavasti toistojakso-rna:han, muun muassa nukleoliini, minkä vuoksi tumajyväsen ribosomituotanto häiriintyy. Tumakuljetuksen häiriöt: C9orf72-RNA:n sitoutuessa RanGAPproteiiniin useat hermosolun toiminnalle tärkeät proteiinit (muun muassa TDP43) eivät kulkeudu tumaan vaan kertyvät sytoplasmaan. Dipeptidiproteiinit: toistojakso-rna:n G-quadruplex-rakenne indusoi aloituskodonista riippumattoman proteiinitranslaation, jonka seurauksena soluun kertyy toistojaksoa vastaavia toksisia dipeptidiproteiineja. P. Tienari ym. 428
7 TDP-43-kertymät ovat yksi C9-ALS:n ja C9- otsa-ohimolohkodementian histopatologisista tunnusmerkeistä. TDP43 on DNA:han ja RNA:han sitoutuva proteiini, jonka tiedetään säätelevän eräiden lähetti-rna:iden silmukoitumista, stabiiliutta ja kuljetusta. TDP-43-proteiinin kuljetus tuman sisälle on RanGAPvälitteistä. RanGAP-proteiinin sitoutuminen C9orf72-(GGGGCC)n-RNA:han solulimassa estää tumahuokosten kautta tapahtuvaa kuljetusta ja aiheuttaa TDP-43-proteiinin kertymisen sytoplasmaan, mikä on C9-ALS:n ja otsa-ohimolohkodementian patologinen tunnusmerkki. Samaa ilmiötä on havaittu eräissä muissakin hermoston rappeumataudeissa, mikä viittaa siihen, että kyseessä on jokin yleisempi patologinen prosessi, joka yhdistää eri sairauksia. Dipeptidiproteiinit. Patologisten RNAsaarekkeiden lisäksi on äskettäin saatu viitteitä siitä, että myös lisääntynyt toistojakso-rna:sta syntetisoitujen dipeptidiproteiinien määrä voi johtaa neurotoksisuuteen. Tämä kävi ilmi kokeissa, joissa ilmennettiin glysiini-arginiini- tai proliini-arginiinipeptidejä banaanikärpäsen silmän soluissa, mikä johti silmän surkastumiseen ja eläimen kuolemaan (23). Tarkemmat tulokset osoittivat, että juuri emäksinen arginiinia sisältävä toistopeptidi aiheuttaa solutoksisuuden tavalla, joka on vielä tuntematon. Nämä kokeet tehtiin banaanikärpäsillä, ja tulevaisuus näyttää, ovatko samat mekanismit vallalla myös ihmisen soluissa ja etenkin motoneuroneissa. Nämä viimeaikaiset tulokset puhuvat kuitenkin sen puolesta, että sekä emäksiset arginiinitoistopeptidit että tuman RNA-saarekkeet voivat kummatkin johtaa neurotoksisuuteen ja siten mahdollisesti vahvistaa toistensa vaikutuksia. Hoito Uuden tiedon valossa on mahdollista kohdistaa hoito vielä enemmän taudin perussyihin, ja erityisen mielenkiintoinen vaikutuskohta on itse toistojaksopidentymä. ips-neuroneilla on tehty kokeita pidentymään kiinnittyvillä antisense-oligonukleotideilla (ASO). ASO:ihin liitettiin RNA:ta hajottava entsyymi (RNase H), ja näin onnistuttiin vähentämään RNA-saarekkeiden määrää ja parantamaan glutamaatin sietoa noin 30 % (17). Ihmisten ASO-hoitoa on jo kokeiltu (erästä SOD1-mutaatiota kohtaan) antamalla sitä intratekaalisesti ALS-potilaille. Tässä toksisuustutkimuksessa ei ilmennyt vakavia haittavaikutuksia (24). Farmakologisia vaikutuskeinoja saattaa olla muitakin. Myös porfyriinijohdoksella (TMPyP4) on pystytty hillitsemään RNA-G-quadruplex-rakenteiden määrää, ja toisaalta tumakuljetusta säätelevällä aineella (KPT-276) on pystytty vähentämään toksisuutta banaanikärpäsmallissa (19). Yksi mahdollinen terapian vaikutuskohta on itse glutamaattireseptori ja sen lisääntynyt aktiivisuus hermosoluissa. Ionien läpäisevyyttä sääteleviä (ionotrooppisia) glutamaattireseptoreita ovat AMPA-, kainaatti- ja NMDA-reseptorit, jotka aktivoituessaan päästävät muun muassa natrium- ja kalsiumioneja solun sisään. ALS:n hoidossa on käytetty rilutsolia jo parinkymmenen vuoden ajan, ja sen vaikutusmekanismin arvellaan perustuvan muun muassa glutamaatin vapautumisen estoon hermosoluista ja NMDA-tyypin glutamaattireseptorin osittaiseen salpaamiseen ja siten juuri solun kalsiumin määrän säätelyyn (25). C9orf72-toistojaksopidentymä vaikuttaa nimenomaan AMPAreseptorin aktiivisuuden lisääntymiseen, mikä tämän tiedon valossa näyttäytyy keskeisenä vaikutuskohteena glutamaatin aiheuttaman hermosoluvaurion eli niin sanotun eksitoksisuuden hillitsemisessä. Pitää kuitenkin muistaa, että glutamaattireseptoreita on aivoissa viljalti, eikä voitane ajatella niiden täydellistä estämistä ilman vakavia haittavaikutuksia. Näkyvissä häämöttääkin ajatus multiterapiasta, jossa hoito kohdistettaisiin glutamaattireseptoreiden lisäksi myös tumapatologiaan ja tumakuljetuksen häiriöihin. C9orf72-positiivisten ALS- ja otsaohimolohkodementiapotilaiden ips-neuronit ovat lupaavia solumalleja näille tutkimuksille ja antavat mahdollisuuden löytää uusia lääkeaineita näihin vaikeisiin tauteihin. Lopuksi C9orf72-geenin toistojaksopidentymän löytyminen ja sen vaikutusmekanismien ymmärtäminen on esimerkki tieteen nopeasta etene 429 Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys
8 misestä. Geenivirhe löydettiin vuonna 2011, ja jo kaksi vuotta tämän jälkeen patogeneesi alkoi valottua. Patogeneesin ytimessä on toistojaksopidentymän synnyttämä toksinen RNA, joka johtaa glutamaattireseptorin säätelyhäiriöön, laaja-alaiseen tuman kuljetusjärjestelmien pettämiseen sekä dipeptidiproteiinien muodostumiseen solulimaan. Taudin alkaminen vasta vuotiaana viittaa siihen, että solut pystyvät kompensoimaan näitä prosesseja hy vinkin pitkään, mikä on hoidon kannalta mielenkiintoista. Patogeneesin vielä tarkemmaksi ymmärtämiseksi tarvitaan voimakasta satsausta perustutkimukseen, ja samalla on seulottava lääke aineita, jotka kykenevät säätelemään jo havaittuja patologisia prosesseja. Jos tutkimuksen vauhti jatkuu, niin C9orf72-geenin toistojaksopidentymästä johtuvat taudit saattavat jo lähitulevaisuudessa olla perusmekanismeihin perustuvan hoidon ulottuvissa. PENTTI TIENARI, LT, professori, osastonylilääkäri MIKO VALORI, FM HANNU LAAKSOVIRTA, LL, osastonlääkäri Neurologian klinikka, HYKS Helsingin yliopisto, molekyylineurologia, tutkimusohjelmayksikkö ANNA KIVIHARJU, FM Helsingin yliopisto, molekyylineurologia, tutkimusohjelmayksikkö SIDONNAISUUDET Pentti Tienari: Apuraha (American ALS Foundation, Merck, Microsoft Research Foundation, Sigrid Juséliuksen säätiö), koulutus/kongressikuluja yrityksen tuella (Beyer-Schering, Biogen, Genzyme, Merck), luentopalkkio (Beyer-Schering, Biogen, Genzyme, Merck), patentti (C9ORF72 gene, diagnosing neurodegenerative disease) Anna Kiviharju: Apuraha (Sigrid Juséliuksen säätiö) Miko Valori: Apuraha (Sigrid Juséliuksen säätiö) Dan Lindholm, Hannu Laaksovirta: Ei sidonnaisuuksia DAN LINDHOLM, LKT, professori Helsingin yliopisto, biokemia ja kehitysbiologia, biolääketieteen laitos SUMMARY The pathogenesis of amyotrophic lateral sclerosis and frontal lobe dementia is unraveling: pathology of the nucleus and glutamate sensitivity The mechanisms of neurodegenerative diseases have begun to become unraveled, thanks to the progress in stem cell research. The repeat expansion in the C9ORF72 gene was identified in 2011 as the most common genetic cause of both ALS and frontal lobe dementia. Only over a couple of years the disease mechanisms of this mutation have been revealed and treatment trials have already been conducted in nerve cell cultures differentiated from patients stem cells. We discuss the role of the repeat expansion in the C9ORF72 gene in the epidemiology of the diseases and the resulting disturbances in nerve cell function. P. Tienari ym. 430
9 KIRJALLISUUTTA 1. Renton AE, Majounie E, Waite A, ym. A hexanucleotide repeat expansion in C9ORF72 is the cause of chromosome 9p21-linked ALS-FTD. Neuron 2011;72: DeJesus-Hernandez M, Mackenzie IR, Boeve BF, ym. Expanded GGGGCC hexanucleotide repeat in noncoding region of C9ORF72 causes chromosome 9p-linked FTD and ALS. Neuron 2011;72: Majounie E, Renton AE, Mok K, ym. Frequency of the C9orf72 hexanucleotide repeat expansion in patients with amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia: a cross-sectional study. Lancet Neurol 2012;11: Smith BN, Newhouse S, Shatunov A, ym. The C9ORF72 expansion mutation is a common cause of ALS+/-FTD in Europe and has a single founder. Eur J Hum Genet 2013;21: Kaivorinne AL, Bode MK, Paavola L, ym. Clinical characteristics of C9ORF72-linked frontotemporal lobar degeneration. Dement Geriatr Cogn Dis Extra 2013;3: Beck J, Poulter M, Hensman D, ym. Large C9orf72 hexanucleotide repeat expansions are seen in multiple neurodegenerative syndromes and are more frequent than expected in the UK population. Am J Hum Genet 2013;92: Lesage S, Le Ber I, Condroyer C, ym. C9orf72 repeat expansions are a rare genetic cause of parkinsonism. Brain 2013; 136(Pt 2): Byrne S, Heverin M, Elamin M, Walsh C, Hardiman O. Intermediate repeat expansion length in C9orf72 may be pathological in amyotrophic lateral sclerosis. Amyotroph Lateral Scler Frontotemporal Degener 2014;15: Mok K, Traynor BJ, Schymick J, ym. Chromosome 9 ALS and FTD locus is probably derived from a single founder. Neurobiol Aging 2012;33: Mori K, Weng SM, Arzberger T, ym. The C9orf72 GGGGCC repeat is translated into aggregating dipeptide-repeat proteins in FTLD/ALS. Science 2013;339: Ash PE, Bieniek KF, Gendron TF, ym. Unconventional translation of C9ORF72 GGGGCC expansion generates insoluble polypeptides specific to c9ftd/als. Neuron 2013;77: Zu T, Liu Y, Bañez-Coronel M, ym. RAN proteins and RNA foci from antisense transcripts in C9ORF72 ALS and frontotemporal dementia. Proc Natl Acad Sci U S A 2013;110:E Zu T, Gibbens B, Doty NS, ym. Non-ATG initiated translation directed by microsatellite expansions. Proc Natl Acad Sci U S A 2011;108: Bochman ML, Paeschke K, Zakian VA. DNA secondary structures: stability and function of G-quadruplex structures. Nat Rev Genet 2012;13: Farg MA, Sundaramoorthy V, Sultana JM, ym. C9ORF72, implicated in amytrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia, regulates endosomal trafficking. Hum Mol Genet 2014;23: Laaksovirta H, Peuralinna T, Schymick JC, ym. Chromosome 9p21 in amyotrophic lateral sclerosis in Finland: a genomewide association study. Lancet Neurol 2010;9: Donnelly CJ, Zhang PW, Pham JT, ym. RNA toxicity from the ALS/FTD C9ORF72 expansion is mitigated by antisense intervention. Neuron 2013;80: Hideyama T, Yamashita T, Suzuki T, ym. Induced loss of ADAR2 engenders slow death of motor neurons from Q/R site-unedited GluR2. J Neurosci 2010;30: Zhang K, Donnelly CJ, Haeusler AR, ym. The C9orf72 repeat expansion disrupts nucleocytoplasmic transport. Nature 2015;525: Freibaum BD, Lu Y, Lopez-Gonzalez R, ym. GGGGCC repeat expansion in C9orf72 compromises nucleocytoplasmic transport. Nature 2015;525: Haeusler AR, Donnelly CJ, Periz G, ym. C9orf72 nucleotide repeat structures initiate molecular cascades of disease. Nature 2014;507: Yamashita T, Hideyama T, Hachiga K, ym. A role for calpain-dependent cleavage of TDP-43 in amyotrophic lateral sclerosis pathology. Nat Commun 2012;3: Mizielinska S, Grönke S, Niccoli T, ym. C9orf72 repeat expansions cause neurodegeneration in Drosophila through arginine-rich proteins. Science 2014;345: Miller TM, Pestronk A, David W, ym. An antisense oligonucleotide against SOD1 delivered intrathecally for patients with SOD1 familial amyotrophic lateral sclerosis: a phase 1, randomised, first-in-man study. Lancet Neurol 2013;12: Bensimon G, Lacomblez L, Meininger V. A controlled trial of riluzole in amyotrophic lateral sclerosis. ALS/Riluzole study group. N Engl J Med 1994;330: Tumapatologia ja glutamaattiherkkyys
VASTAUS 1: Yhdistä oikein
KPL3 VASTAUS 1: Yhdistä oikein a) haploidi - V) ihmisen sukusolu b) diploidi - IV) ihmisen somaattinen solu c) polyploidi - VI) 5n d) iturata - III) sukusolujen muodostama solulinja sukupolvesta toiseen
6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi
6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi GENEETTINEN INFORMAATIO Geeneihin pakattu informaatio ohjaa solun toimintaa ja siirtyy
ALS-sairaus miksi motoneuroni kuolee?
Kiitos! ALS-sairaus miksi motoneuroni kuolee? LIHASTAUTIEN KEHITTYVÄ TUTKIMUS JA HOITO Konferenssi 16-17.11.2011 TAMPERE-talo Hannu Laaksovirta, neurologian erikoislääkäri HYKS Meilahden sairaala Neurologian
Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma
Genomin ilmentyminen 17.1.2013 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Genomin ilmentyminen transkription aloitus RNA:n synteesi ja muokkaus DNA:n ja RNA:n välisiä eroja
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) DNA RNA 7.12.2017 Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Osaamistavoitteet Lärandemål Luennon jälkeen ymmärrät pääperiaatteet
Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30
Tampereen yliopisto Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe 21.5.2015 Henkilötunnus - Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 30 3. a) Alla on lyhyt jakso dsdna:ta, joka koodaa muutaman aminohappotähteen
Selkäydinneste vai geenitutkimus?
Selkäydinneste vai geenitutkimus? 19.5.2016 Anne Remes, professori, ylilääkäri, Itä-Suomen yliopisto, KYS, Neurokeskus Nuorehko muistipotilas, positiivinen sukuhistoria Päästäänkö diagnostiikassa tarkastelemaan
Perinnöllisyyden perusteita
Perinnöllisyyden perusteita Eero Lukkari Tämä artikkeli kertoo perinnöllisyyden perusmekanismeista johdantona muille jalostus- ja terveysaiheisille artikkeleille. Koirien, kuten muidenkin eliöiden, perimä
Peptidi ---- F ----- K ----- V ----- R ----- H ----- A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 24.5.2006 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 Osa 1: Haluat selvittää -- F -- K -- V -- R -- H -- A peptidiä
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito SNP 14.1.2013 Tiina Immonen Biolääketieteen laitos Biokemia ja kehitysbiologia Jakson luennot Mitä on genomilääketiede? Dan Lindholm Genomin ylläpito Tiina Immonen
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia 21.1.2014 Epigeneettinen säätely Epigenetic: may be used for anything to do with development, but nowadays
Genomin ilmentyminen
Kauppi 17/01/2014 Genomin ilmentyminen LH1, Molekyylibiologia 17.1.2014 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Huone C501b, Biomedicum 1 Transkriptiofaktorin mutaatio voi
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia 12.12.2017 Epigenetic inheritance: A heritable alteration in a cell s or organism s phenotype that does
ALS amyotrofinen lateraaliskleroosi
ALS amyotrofinen lateraaliskleroosi Juha Puustinen osastonylilääkäri LT, neurologian erikoislääkäri, kliinisen lääkehoidon dosentti ALS on yleisin motoneuronitauti Motoneuronitaudit ALS ALS plus oireyhtymät
Etunimi: Henkilötunnus:
Kokonaispisteet: Lue oheinen artikkeli ja vastaa kysymyksiin 1-25. Huomaa, että artikkelista ei löydy suoraan vastausta kaikkiin kysymyksiin, vaan sinun tulee myös tuntea ja selittää tarkemmin artikkelissa
Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita
Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita 10. Valkuaisaineiden valmistaminen solussa 1. Avainsanat 2. Perinnöllinen tieto on dna:n emäsjärjestyksessä 3. Proteiinit koostuvat
ALS-potilaan monimuotoiset oireet
Tieteessä katsaus Johanna Palmio LT, neurologian dosentti, apulaisylilääkäri, kliininen opettaja Tampereen yliopisto ja TAYS, neurologian poliklinikka johanna.palmio@uta.fi Hannu Laaksovirta neurologian
DNA (deoksiribonukleiinihappo)
DNA (deoksiribonukleiinihappo) Kaksoiskierre (10 emäsparin välein täysi kierros) Kaksi sokerifosfaattirunkoa. Huomaa suunta: 5 päässä vapaana fosfaatti (kiinni sokerin 5. hiilessä) 3 päässä vapaana sokeri
Francis Crick ja James D. Watson
Francis Crick ja James D. Watson Francis Crick ja James D. Watson selvittivät DNAn rakenteen 1953 (Nobel-palkinto 1962). Rosalind Franklin ei ehtinyt saada kunniaa DNA:n rakenteen selvittämisestä. Hän
DNA (deoksiribonukleiinihappo)
DNA (deoksiribonukleiinihappo) Kaksoiskierre (10 emäsparin välein täysi kierros) Kaksi sokerifosfaattirunkoa. Huomaa suunta: 5 -päässä vapaana fosfaatti (kiinni sokerin 5. hiilessä) 3 -päässä vapaana sokeri
DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia
DNA 3.3.2015 Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia Koordinaattori, Master s Degree Programme in Translational Medicine (TRANSMED) 1 Sisältö DNA:n rakenne
Avainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.
Avainsanat: mutaatio Monitekijäinen sairaus Kromosomisairaus Sukupuu Suomalainen tautiperintö Geeniterapia Suora geeninsiirto Epäsuora geeninsiirto Kantasolut Totipotentti Pluripotentti Multipotentti Kudospankki
Yoshinori Ohsumille Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology
Lääketieteen Nobel-palkinto 2016 Yoshinori Ohsumille hänen autofagian mekanismeja koskevista löydöistään. Yoshinori Ohsumi 1945 Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology
Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio
Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio Perinnöllinen informaatio sijaitsee dna:ssa eli deoksiribonukleiinihapossa
Oligonukleotidi-lääkevalmisteet ja niiden turvallisuuden tutkiminen - Sic!
Page 1 of 5 JULKAISTU NUMEROSSA 3-4/2017 EX TEMPORE Oligonukleotidi-lääkevalmisteet ja niiden turvallisuuden tutkiminen Enni-Kaisa Mustonen / Kirjoitettu 18.12.2017 / Julkaistu Oligonukleotidit ovat nukleotideista
Parkinsonin tauti on monitekijäinen tauti, jonka synnyssä erilaisilla elämän aikana vaikuttavilla tekijöillä ja perimällä on oma osuutensa.
1 1/2011 Parkinsonin taudin perinnöllisyys Geenien ja ympäristötekijöiden vuorovaikutus sairastumisen taustalla Parkinsonin tauti on monitekijäinen tauti, jonka synnyssä erilaisilla elämän aikana vaikuttavilla
Modified Frontal Behavioral Inventory (FBI-mod) muistisairauksien arvioinnissa
Modified Frontal Behavioral Inventory (FBI-mod) muistisairauksien arvioinnissa Noora Suhonen Neuropsykologiaan erikoistuva psykologi, PsM OYS, OY, HY Neurologia-seminaari: Käytösoireet muistisairauksissa
Peittyvä periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Peittyvä periytyminen Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; and the London IDEAS Genetic
Sukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 3: Osa 1 Tumallisten solujen genomin toiminnassa sekä geenien
Neurologiset harvinaissairaudet Suomessa: Huntingtonin tauti ja geneettiset motoneuronitaudit
Neurologiset harvinaissairaudet Suomessa: Huntingtonin tauti ja geneettiset motoneuronitaudit Kansallinen neurokeskus: pilotti 4 Neurologipäivät 1.11.2018 Kari Majamaa pilotin 4 koordinaattori professori,
Geneettisen tutkimustiedon
Geneettisen tutkimustiedon omistaminen Tutkijan näkökulma Katriina Aalto-Setälä Professori, sisätautien ja kardiologian erikoislääkäri Tampereen Yliopisto ja TAYS Sydänsairaala Etiikan päivät 9.3.2016
Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia
Genomin ylläpito 14.1.2014 Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia Luennon sisältö DNA:n kahdentuminen eli replikaa8o DNA:n korjausmekanismit Replikaa8ovirheiden korjaus Emäksenpoistokorjaus
Narkolepsian immunologiaa ja Pandemrixiin liittyvät tutkimkset
Narkolepsian immunologiaa ja Pandemrixiin liittyvät tutkimkset Outi Vaarala, Immuunivasteyksikön päällikkö, THL Narkolepsian kulku - autoimmuunihypoteesiin perustuva malli Hypokretiinia Tuottavat neuronit
Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com
12 Vallitseva periytyminen Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; and the London IDEAS Genetic
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi
Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx keystocancer.fi FI/FMI/1810/0067 Lokakuu 2018 FoundationOne CDx -geeniprofilointi FoundationOne CDx on kattava geeniprofilointipalvelu, jossa tutkitaan syöpäkasvaimen
DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Lääketieteellinen tiedekunta Biokemia ja kehitysbiologia
DNA 18.4.2016 Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Lääketieteellinen tiedekunta Biokemia ja kehitysbiologia Koordinaattori, Master s Degree Programme in Translational Medicine (TRANSMED) 1 Sisältö DNA:n rakenne
Bioteknologian perustyökaluja
Bioteknologian perustyökaluja DNAn ja RNAn eristäminen helppoa. Puhdistaminen työlästä (DNA pestään lukuisilla liuottimilla). Myös lähetti-rnat voidaan eristää ja muuntaa virusten käänteiskopioijaentsyymin
NCL australiankarjakoirilla
NCL australiankarjakoirilla Yleistä NCL-ryhmään kuuluvat sairaudet ovat kuolemaan johtavia, yleensä resessiivisesti periytyviä sairauksia. Niissä mutaatiosta johtuva geenivirhe aiheuttaa sen, että hermosoluihin
X-kromosominen periytyminen. Potilasopas. TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, 20521 Turku puh (02) 3131 390 faksi (02) 3131 395
12 X-kromosominen periytyminen TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, 20521 Turku puh (02) 3131 390 faksi (02) 3131 395 FOLKHÄLSANS GENETISKA KLINIK PB 211, (Topeliusgatan 20) 00251 Helsingfors tel (09)
Biopankit miksi ja millä ehdoilla?
Suomalaisen Tiedeakatemian 100 v-symposium, Helsinki 4.9.2008 Biopankit miksi ja millä ehdoilla? Juha Kere Karolinska Institutet, Stockholm, Sverige ja Helsingin yliopisto Tautien tutkimus Geeni/ valkuaisaine
DNA:n informaation kulku, koostumus
DNA:n informaation kulku, koostumus KOOSTUMUS Elävien bio-organismien koostumus. Vety, hiili, happi ja typpi muodostavat yli 99% orgaanisten molekyylien rakenneosista. Biomolekyylit voidaan pääosin jakaa
Vastaa lyhyesti selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan
1 1) Tunnista molekyylit (1 piste) ja täytä seuraava taulukko (2 pistettä) a) b) c) d) a) Syklinen AMP (camp) (0.25) b) Beta-karoteeni (0.25 p) c) Sakkaroosi (0.25 p) d) -D-Glukopyranoosi (0.25 p) 2 Taulukko.
Farmakogeneettiset testit apuna lääkehoidon arvioinnissa
Farmakogeneettiset testit apuna lääkehoidon arvioinnissa Farmakogeneettiset testit Farmakogenetiikalla tarkoitetaan geneettisiä variaatioita, jotka vaikuttavat lääkeainevasteeseen. Geneettisen tiedon hyödyntäminen
Ma > GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING
Ma 5.12. -> GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING Cell-Surface Receptors Relay Extracellular Signals via Intracellular Signaling Pathways Some Intracellular Signaling Proteins Act as Molecular Switches
NON-CODING RNA (ncrna)
NON-CODING RNA (ncrna) 1. Yleistä NcRNA eli non-coding RNA tarkoittaa kaikkia proteiinia koodaamattomia rnamolekyylejä. Näistä yleisimmin tunnetut ovat ribosomaalinen RNA (rrna) sekä siirtäjä-rna (trna),
Kipu. Oleg Kambur. Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 23.6.2015
Katekoli-O-metyylitransferaasi ja kipu Oleg Kambur Kipu Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 1 Katekoli-O-metyylitransferaasi (COMT) proteiini tuotetaan
Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet?
Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet? Harvinaiset-seminaari TYKS 29.9.2011 Jaakko Ignatius TYKS, Perinnöllisyyspoliklinikka Miksi Harvinaiset-seminaarissa puhutaan
Farmasian tutkimuksen tulevaisuuden näkymiä. Arto Urtti Lääketutkimuksen keskus Farmasian tiedekunta Helsingin yliopisto
Farmasian tutkimuksen tulevaisuuden näkymiä Arto Urtti Lääketutkimuksen keskus Farmasian tiedekunta Helsingin yliopisto Auttaako lääkehoito? 10 potilasta 3 saa avun 3 ottaa lääkkeen miten sattuu - ei se
Reseptoripotentiaalista (RP) aktiopotentiaaliin
Haju- ja makuaisti Reseptoripotentiaalista (RP) aktiopotentiaaliin Reseptoristimulaatio lokaalinen sähköinen ärtyminen (melkein aina depolarisaatio) RP syntymekanismi vaihtelee aistimesta toiseen RP leviää
Työikäisten harvinaisemmat muistisairaudet 12.10.2011. Anne Remes Neurologian dosentti, kliininen opettaja Oulun yliopisto
Työikäisten harvinaisemmat muistisairaudet 12.10.2011 Anne Remes Neurologian dosentti, kliininen opettaja Oulun yliopisto Luonteen muuttuminen Kognition muuttuminen FTD: Frontotemporaalinen dementia Muu
PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto
PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA Robert Winqvist SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto PROFESSORILIITON SYYSSEMINAARI TUTKIMUSTA KAIKKIEN HYÖDYKSI
Neuropeptidit, opiaatit ja niihin liittyvät mekanismit. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013
Neuropeptidit, opiaatit ja niihin liittyvät mekanismit Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013 Neuroendokriinisen järjestelmän säätely elimistössä Neuropeptidit Peptidirakenteisia hermovälittäjäaineita
II Genetiikka 4.(3) Nukleiinihapot
II Genetiikka 4.(3) Nukleiinihapot Geenitekniikka - menetelmiä, joiden avulla dna:ta ja rna:ta voidaan eristää, muokata ja siirtää muihin soluihin tai eliöihin kromosomit koostuvat dna-rihmasta ja siihen
vauriotyypit Figure 5-17.mhc.restriktio 9/24/14 Autoimmuniteetti Kudosvaurion mekanismit Petteri Arstila Haartman-instituutti Patogeeniset mekanismit
vauriotyypit Kudosvaurion mekanismit Autoimmuniteetti Petteri Arstila Haartman-instituutti Antigeenin tunnistus HLA:ssa pitää sisällään autoimmuniteetin riskin: jokaisella on autoreaktiivisia lymfosyyttejä
Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15
Tampereen yliopisto Henkilötunnus - Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe 18.5.2018 Tehtävä 1 Pisteet / 15 1. Alla on esitetty urheilijan
Autoimmuunitaudit: osa 1
Autoimmuunitaudit: osa 1 Autoimmuunitaute tunnetaan yli 80. Ne ovat kroonisia sairauksia, joiden syntymekanismia eli patogeneesiä ei useimmissa tapauksissa ymmärretä. Tautien esiintyvyys vaihtelee maanosien,
Autofagia silmänpohjan ikärappeumassa. LT Niko Kivinen Silmälääkäriyhdistys Kevätkoulutuspäivät 2018
Autofagia silmänpohjan ikärappeumassa LT Niko Kivinen Silmälääkäriyhdistys Kevätkoulutuspäivät 2018 Sidonnaisuudet Apurahat Lääketieteen säätiö Silmäsäätiö Evald ja Hilda Nissin säätiö Itä-Suomen yliopisto
Läpimurto ms-taudin hoidossa?
Läpimurto ms-taudin hoidossa? Läpimurto ms-taudin hoidossa? Kansainvälisen tutkijaryhmän kliiniset kokeet uudella lääkkeellä antoivat lupaavia tuloksia sekä aaltoilevan- että ensisijaisesti etenevän ms-taudin
Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii
Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of
1.000.000.000.000 euron ongelma yksi ratkaisu Suomesta? Sijoitus Invest 2015, Helsinki 11.11.2015 Pekka Simula, toimitusjohtaja, Herantis Pharma Oyj
1.000.000.000.000 euron ongelma yksi ratkaisu Suomesta? Sijoitus Invest 2015, Helsinki 11.11.2015 Pekka Simula, toimitusjohtaja, Herantis Pharma Oyj 1 Tärkeää tietoa Herantis Pharma Oy ( Yhtiö ) on laatinut
Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1
Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1 replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA
Suomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013
Suomalainen genomitieto ja yksilöllistetty terveydenhuolto Olli Kallioniemi October 9, 2013 FIMM - Institiute for Molecular Medicine Finland Terveyden ylläpito vauvasta vanhuuteen Elintavat Taudit Terve
Yhtäläisyydet selkärankaisten aivoissa, osa II. Niko Lankinen
Yhtäläisyydet selkärankaisten aivoissa, osa II Niko Lankinen Sisältö Neuroneille tyypilliset molekyylit Suoraa jatkoa Niinan esitykseen Alkion aivojen vertailua Neuromeerinen malli Neuromeerisen mallin
Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä
Mitkä mitokondriot? Lyhyt johdatus geenitutkijoiden maailmaan Ihmisen kasvua ja kehitystä ohjaava informaatio on solun tumassa, DNA:ssa, josta se erilaisten prosessien kautta päätyy ohjaamaan elimistön,
Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana. Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere
Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere 17.11.2011 Mistä lihastauti aiheutuu? Suurin osa on perinnöllisiä Osassa perimä altistaa
DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio
CELL 411-- replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi
Kehitysvamma autismin liitännäisenä vai päinvastoin? Maria Arvio
Kehitysvamma autismin liitännäisenä vai päinvastoin? Maria Arvio Mitä yhteistä autismilla (A) ja kehitysvammalla (KV)? Elinikäiset tilat Oireita, ei sairauksia Diagnoosi tehdään sovittujen kriteereiden
GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA
GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA GEENITEKNIIKKKA ON BIOTEKNIIKAN OSA-ALUE! Biotekniikka tutkii ja kehittää elävien solujen, solun osien, biokemiallisten menetelmien sekä molekyylibiologian uusimpien menetelmien
Fabryn taudin neurologiset oireet ja löydökset. Aki Hietaharju Neurologipäivät Helsinki
Fabryn taudin neurologiset oireet ja löydökset Aki Hietaharju Neurologipäivät Helsinki 31.10.2018 Fabryn tauti Lysosomaalinen kertymäsairaus Glykosfingolipidisubstraattien kertyminen plasmaan, virtsaan
Perinnöllisyyden perusteita
Perinnöllisyyden perusteita Perinnöllisyystieteen isä on augustinolaismunkki Gregor Johann Mendel (1822-1884). Mendel kasvatti herneitä Brnon (nykyisessä Tsekissä) luostarin pihalla. 1866 julkaisu tuloksista
Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi
Tulehduksen osuus syövän synnyssä Ari Ristimäki, professori Patologia Helsingin yliopisto esiasteissa ja useissa eri syöpäkasvaintyypeissä. 1 A Mantovani, et al. NATURE Vol 454 24 July 2008 Figure 15.22d
Biopolymeerit. Biopolymeerit ovat kasveissa ja eläimissä esiintyviä polymeerejä.
Biopolymeerit Biopolymeerit ovat kasveissa ja eläimissä esiintyviä polymeerejä. Tärkeimpiä biopolymeerejä ovat hiilihydraatit, proteiinit ja nukleiinihapot. 1 Hiilihydraatit Hiilihydraatit jaetaan mono
Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla
Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla 1. Avainsanat 2. Solut lisääntyvät jakautumalla 3. Dna eli deoksiribonukleiinihappo sisältää perimän
? LUCA (Last universal common ancestor) 3.5 miljardia v.
Mitä elämä on? - Geneettinen ohjelma, joka kykenee muuttamaan ainehiukkaset ja molekyylit järjestyneeksi itseään replikoivaksi kokonaisuudeksi. (= geneettistä antientropiaa) ? LUCA (Last universal common
Likvorin biomarkkerit. diagnostiikassa. Sanna Kaisa Herukka, FM, LL, FT. Kuopion yliopistollinen sairaala
Likvorin biomarkkerit neurodegeneratiivisten sairauksien diagnostiikassa Sanna Kaisa Herukka, FM, LL, FT Itä Suomen yliopisto ja Kuopion yliopistollinen sairaala Selkäydinneste Tilavuus n. 150ml, muodostuu
"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13
"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13 Monisteen alussa on erittäin tärkeitä ohjeita turvallisuudesta Lukekaa sivu 5 huolellisesti ja usein Vaarat vaanivat: Palavia nesteitä ja liekkejä on joskus/usein
Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL Juha Partanen
Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL 19.11.2016 Juha Partanen Geenisakset 2 2 N A T U R E V O L 5 2 2 4 J U N E 2 0 1 5 Sisältö Geenimuokkaus: historiallinen perspektiivi Geenisakset
PCR - tekniikka elintarvikeanalytiikassa
PCR - tekniikka elintarvikeanalytiikassa Listerian, Salmonellan ja kampylobakteerien tunnistus elintarvikkeista ja rehuista 29.11.2012 Eva Fredriksson-Lidsle Listeria monocytogenes Salmonella (spp) Campylobacter
Biologia. Pakolliset kurssit. 1. Eliömaailma (BI1)
Biologia Pakolliset kurssit 1. Eliömaailma (BI1) tuntee elämän tunnusmerkit ja perusedellytykset sekä tietää, miten elämän ilmiöitä tutkitaan ymmärtää, mitä luonnon monimuotoisuus biosysteemien eri tasoilla
Terveyteen liittyvät geenitestit
Terveyteen liittyvät geenitestit Terveyteen liittyvät geenitestit Jokaisella meistä on vanhemmiltamme perittynä oma yksilöllinen geenivalikoimamme. Tämä geneettinen rakenteemme yhdessä erilaisten ympäristön
Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä
Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä Genomitiedon vaikutus terveydenhuoltoon työpaja 7.11.2014 Sitra, Helsinki Jaakko Ignatius, TYKS Kliininen genetiikka Perimän
Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset
Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset Ilmainen lääkiksen harjoituspääsykoe, kevät 2017 Tehtävä 2. (20 p) A. 1. EPÄTOSI. Ks. s. 4. Menetelmää käytetään geenitekniikassa geenien muokkaamisessa. 2.
Tupakkariippuvuus fyysinen riippuvuus. 9.9.2015 Annamari Rouhos LT, keuhkosairauksien erikoislääkäri Sydän- ja keuhkokeskus HYKS
Tupakkariippuvuus fyysinen riippuvuus 9.9.2015 Annamari Rouhos LT, keuhkosairauksien erikoislääkäri Sydän- ja keuhkokeskus HYKS Riippuvuuden tunnusmerkkejä voimakas halu tai pakonomainen tarve käyttää
Hoitotehoa ennustavat RAS-merkkiaineet Tärkeä apuväline kolorektaalisyövän lääkehoidon valinnassa Tämän esitteen tarkoitus Tämä esite auttaa ymmärtämään paremmin kolorektaalisyövän erilaisia lääkehoitovaihtoehtoja.
Hyvä käyttäjä! Ystävällisin terveisin. Toimitus
Hyvä käyttäjä! Tämä pdf-tiedosto on ladattu Tieteen Kuvalehden verkkosivuilta (www.tieteenkuvalehti.com). Tiedosto on tarkoitettu henkilökohtaiseen käyttöön, eikä sitä saa luovuttaa kolmannelle osapuolelle.
DNA > RNA > Proteiinit
Genetiikan perusteiden luentojen ensimmäisessä osassa tarkasteltiin transmissiogenetiikkaa eli sitä, kuinka geenit siirtyvät sukupolvesta toiseen Toisessa osassa ryhdymme tarkastelemaan sitä, mitä geenit
SELVITYS SIITÄ MITEN ERÄÄT PERINNÖLLISET SAIRAUDET (KUTEN GPRA JA FUCOSIDOSIS) PERIYTYVÄT ENGLANNINSPRINGERSPANIELEISSA
SELVITYS SIITÄ MITEN ERÄÄT PERINNÖLLISET SAIRAUDET (KUTEN GPRA JA FUCOSIDOSIS) PERIYTYVÄT ENGLANNINSPRINGERSPANIELEISSA Kaikki koiran perimät geenit sisältyvät 39 erilliseen kromosomipariin. Geenejä arvellaan
Väärin, Downin oireyhtymä johtuu ylimääräisestä kromosomista n.21 (trisomia) Geeni s. 93.
1 I) Ovatko väittämät oikein (O) vai väärin (V)? Jos väite on mielestäsi väärin, perustele se lyhyesti väittämän alla oleville riveille. O/V 1.2. Downin oireyhtymä johtuu pistemutaatista fenyylialaniinin
Solun tuman rakenne ja toiminta. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012
Solun tuman rakenne ja toiminta Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012 Hermosolun rakkulamainen tuma Monenlaisia tumia Valkosolujen tumien monimuotoisuutta Lähde: J.F.Kerr, Atlas of Functional Histology
Muistisairaus työiässä Mikkeli 3.9.2014. Anne Remes Neurologian professori, ylilääkäri Itä-Suomen yliopisto, KYS
Muistisairaus työiässä Mikkeli 3.9.2014 Anne Remes Neurologian professori, ylilääkäri Itä-Suomen yliopisto, KYS Muisti voi heikentyä monista syistä väsymys kiputilat masennus uupumus stressi MUISTI, KESKITTYMINEN
Geenitekniikan perusmenetelmät
Loppukurssikoe To klo 14-16 2 osiota: monivalintatehtäväosio ja kirjallinen osio, jossa vastataan kahteen kysymykseen viidestä. Koe on auki klo 14.05-16. Voit tehdä sen oppitunnilla, jolloin saat tarvittaessa
Nimi sosiaaliturvatunnus
Valintakoe 2013 / Biokemia Nimi sosiaaliturvatunnus 1. Selitä: (3,0 p) a) Mitä ovat eksonit ja intronit ja miten ne eroavat toisistaan? b) Mitä eläinsolulle tapahtuu, jos se laitetaan sen sisällä olevaa
Perinnöllisyysneuvonta
Lääkärin vastaanotolla Syöpäjärjestöjen poliklinikoilla perinnöllisiin tauteihin perehtyneet sairaanhoitajat Pyritään mahdollisimman tarkkaan sairaudensyyn selvittämiseen (vrt.harvinaiset sairaudet) Periytymisriskin
Potilasopas. 12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu?
12 Mitä Genetiikan Laboratoriossa Tapahtuu? ei halua, että hänen näytettään käytetään näihin tarkoituksiin. Kuten muutkin lääketieteelliset näytteet, DNA katsotaan osaksi potilaan potilasasiakirjoja, joten
Postsynaptiset tapahtumat Erityyppiset hermovälittäjät
Postsynaptiset tapahtumat Erityyppiset hermovälittäjät Pienmolekylaariset mm. asetyylikoliini, noradrenaliini, serotoniini, histamiini käytetäänuudestaan vapautumisen jälkeen ja kuljetetaan takaisin vesikkeleihin
Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA
Genomin ylläpito 5.12.2017 TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA Luennon sisältö Tuman kromosomien rakenne ja pakkautuminen Pakkautumisen säätely: histonien modifikaatiot DNA:n kahdentuminen
DNA sukututkimuksen tukena
Järvenpää 12,2,2019 Teuvo Ikonen teuvo.ikonen@welho.com DNA sukututkimuksen tukena DNA sukututkimuksessa (Peter Sjölund: Släktforska med DNA) tiesitkö, että olet kävelevä sukukirja? on kuin lukisit kirjaa
BIOLOGIAN OSIO (45 p.)
BIOLÄÄKETIETEEN KOULUTUSOHJELMA PÄÄSYKOE 17.5.2017 BIOLOGIAN OSIO (45 p.) HYVÄN VASTAUKSEN PIIRTEET I) Esseetehtävät (2 kpl) a) Selitä perustellen, miten kuvaan merkittyihin kohtiin osuvat mutaatiot voivat
BIOLOGIAN OSIO (45 p.)
BIOLÄÄKETIETEEN KOULUTUSOHJELMA PÄÄSYKOE 17.5.2017 BIOLOGIAN OSIO (45 p.) HYVÄN VASTAUKSEN PIIRTEET I) Esseetehtävät (2 kpl) a) Selitä perustellen, miten kuvaan merkittyihin kohtiin osuvat mutaatiot voivat