RINNAN NGS PANEELIEN KÄYTTÖ ONKOLOGIN NÄKÖKULMA Johanna Mattson dosentti ylilääkäri, vs. toimialajohtaja HYKS Syöpäkeskus 28.11.2016 1
RINTASYÖPÄ SUOMESSA 5008 uutta tapausta vuonna 2014 Paikallinen rintasyöpä n. 90 %:lla Paikallisesti edennyt n.5 %:lla Levinnyt rintasyöpä n. 5 %:lla 20%:lla tauti uusiutuu myöhemmin 28.11.2016 2
Paikallinen ja levinnyt rintasyöpä 1. Leikkaus 2. Lääkehoidot a) solunsalpaajat b) hormonihoito c) HER-2 hoito 3. Sädehoito 4. Seuranta 1.Lääkehoidot a) solunsalpaajat b) hormonihoito c) HER-2 hoito d) uudet lääkehoidot 2. Sädehoito 3. Leikkaus 4. Oireenmukainen hoito
Rintasyövän hoidon kehitys Nowadays Clinical Oncology Pathological Oncology Molecular Oncology Personilized Medicine New therapeutic options Disease guided approach Specific treatment for different tumour types Pathological guided approach Targeted agents Molecular approach 28.11.2016 4
Rutiinisti ei pidä tilata testejä, jos ei tiedä, mitä tehdä vastauksilla vaan osallistua (kliinisiin) tutkimusprojekteihin tai odottaa kansainvälisiä/kansallisia linjauksia uusien geenitestien sovaltamisesta kliiniseen käyttöön (ESMO 2013) Yksilöityjen lääkehoitojen off-label käyttö kliinisten tutkimusten puitteissa 28.11.2016 5
UUDEN POLVEN SEKVENOINTI NGS eli uuden polven sekvenointi - yksittäiset geenit - valitaan geenipaneeli (esim johonkin tiettyyn syöpään tai säätelytiehen liittyviä) - laajempi Cancer-relevant genome content = 0.01% of genome - eksomi = 1% genomista - koko genomi 28.11.2016 6
GENOMICS DRIVEN ONCOLOGY = SOMAATTISET MUTAATIOT Garraway J Clin Oncol 2012 31:1806-1814.
Ts-NGS hotspot syöpägeenipaneeli 1 kiinteiden kasvainten somaattisille muutoksille 4.4.2014 lähtien Ts-NGSsHS1 (480 e) Kaupallisella hotspot syöpägeenipaneelilla voidaan tutkia 50 geenistä valitut 2855 Cosmic-varianttia Tulokset 2-4 viikon kuluessa näytteen saapumisesta ABL1 EGFR GNAS KRAS PTPN11 AKT1 ERBB2 GNAQ MET RB1 ALK ERBB4 HNF1A MLH1 RET APC EZH2 HRAS MPL SMAD4 ATM FBXW7 IDH1 NOTCH1 SMARCB1 BRAF FGFR1 JAK2 NPM1 SMO CDH1 FGFR2 JAK3 NRAS SRC CDKN2A FGFR3 IDH2 PDGFRA S TK11 CSF1R FLT3 KDR PIK3CA TP53 CTNNB1 GNA11 KIT PTEN VHL
Uusi NGS-paneeli rintasyöpäkasvaimille 1.4.2015 alkaen Ts-NGSsBR1 (640 e) In House -rintasyöpägeenipaneelilla voidaan tutkia seitsemän syöpägeenin (EGFR, HER2, HER3, AKT, PIK3CA, PTEN, TP53) proteenia koodaavat eksonialueet Tulokset 4 viikon kuluessa näytteen saapumisesta Kiireellisestä tutkimuksesta (tulos kahden viikon sisällä) on ilmoitettava etukäteen laboratorioon
J 173 geeniä sekvenoitiin 28.11.2016 10
J Löytyi 40 driveria 28.11.2016 11
J 28.11.2016 12
J Löytyi 93 todennäköistä driveria 28.11.2016 13
Somaattisten mutaatioiden NGS diagnostiikka osana kliinisiä lääketutkimuksia Osassa kliinisistä lääkeainetutkimuksista edellytetään somaattisten mutaatioiden diagnostiikkaa Syöpäkeskuksen varhaisen vaiheen lääketutkimusyksikkö (Early Phase Unit) aloittaa toimintansa joulukuussa 2016 Tarkoituksena ohjata osa Kliinisen tutkimusyksikön yritysrahoituksesta somaattisten mutaatioiden NGS diagnostiikkaan Menestyksekäs toiminta edellyttää tarvittavien paneelien ripeää pystytystä ja vastausten saamista nopeasti Palveluiden tuottaminen In house vai alihankkijalta?
YHTEENVETO Rintasyövän NGS paneelien käyttö ei ole rutiinidiagnostiikkaa Niitä tarvitaan enenevästi kliinisten lääkeainetutkimusten sreeningtutkimuksina Tarvitaan paneelien ketterää kehittämistä Kliinisten tutkimuspotilaiden hoidon kannalta vastausten saaminen nopeasti keskeistä Syöpäkeskus suunnitellut ohjaavansa osan kliinisten lääkeainetutkimusten rahoituksesta NGS paneelien käytön lisääämiseen screening-tutkimuksina huomattavasti! 28.11.2016 15