Mitä käytännön lääkärin tarvitsee tietää biostatistiikasta?



Samankaltaiset tiedostot
Tutkimusasetelmat. - Oikea asetelma oikeaan paikkaan - Vaikeakin tutkimusongelma voi olla ratkaistavissa oikealla tutkimusasetelmalla

Mitä tarvitsee tietää biostatistiikasta ja miksi? Matti Uhari Lastentautien klinikka Oulun yliopisto

Mitä on näyttö vaikuttavuudesta. Matti Rautalahti Suomalainen Lääkäriseura Duodecim

Erotusdiagnostiikasta. Matti Uhari Lastentautien klinikka, Oulun yliopisto

Kokeellinen interventiotutkimus

Havaintotutkimusten kriittinen arviointi. Arja Helin-Salmivaara Dos, koulutusylilääkäri HUS, perusterveydenhuollon yksikkö

Interventiotutkimuksen arviointi

Testejä suhdeasteikollisille muuttujille

Otoskoon arviointi. Tero Vahlberg

Havainnoivat tutkimukset

Havainnoiva tutkimus. Pekka Jousilahti FT, yleislääketieteen ja terveydenhuollon erikoislääkäri, Tutkimusprofessori; THL

Mat Tilastollisen analyysin perusteet, kevät 2007

Harjoitus 7: NCSS - Tilastollinen analyysi

Sovellettu todennäköisyyslaskenta B

Aineistokoko ja voima-analyysi

Luentokalvoja tilastollisesta päättelystä. Kalvot laatinut Aki Taanila Päivitetty

ABHELSINKI UNIVERSITY OF TECHNOLOGY

¼ ¼ joten tulokset ovat muuttuneet ja nimenomaan huontontuneet eivätkä tulleet paremmiksi.

Altisteiden ja sairauksien mittaaminen. Biostatistiikan näkökulmasta EPIDEMIOLOGIAN JA BIOSTATISTIIKAN PERUSTEET. L2 kevät 2007

TAPAUS-VERROKKITUTKIMUS

TUTKIMUSAINEISTON ANALYYSI. LTKY012 Timo Törmäkangas

Estimointi. Estimointi. Estimointi: Mitä opimme? 2/4. Estimointi: Mitä opimme? 1/4. Estimointi: Mitä opimme? 3/4. Estimointi: Mitä opimme?

Ilkka Mellin Tilastolliset menetelmät. Osa 3: Tilastolliset testit. Tilastollinen testaus. TKK (c) Ilkka Mellin (2007) 1

r = n = 121 Tilastollista testausta varten määritetään aluksi hypoteesit.

54. Tehdään yhden selittäjän lineaarinen regressioanalyysi, kun selittäjänä on määrällinen muuttuja (ja selitettävä myös):

Tilastollisia peruskäsitteitä ja Monte Carlo

Geenikartoitusmenetelmät. Kytkentäanalyysin teoriaa. Suurimman uskottavuuden menetelmä ML (maximum likelihood) Uskottavuusfunktio: koko aineisto

Sisällysluettelo ESIPUHE KIRJAN 1. PAINOKSEEN...3 ESIPUHE KIRJAN 2. PAINOKSEEN...3 SISÄLLYSLUETTELO...4

Testit järjestysasteikollisille muuttujille

TUTKIMUSAINEISTON ANALYYSI. LTKY012 Timo Törmäkangas

Johdatus tilastotieteeseen Estimointi. TKK (c) Ilkka Mellin (2005) 1

Väliestimointi (jatkoa) Heliövaara 1

Sovellettu todennäköisyyslaskenta B

Sovellettu todennäköisyyslaskenta B

Johdatus tilastotieteeseen Tilastollisten aineistojen kerääminen ja mittaaminen. TKK (c) Ilkka Mellin (2005) 1

Matemaatikot ja tilastotieteilijät

TILASTOLLISTEN MENETELMIEN KIRJO JA KÄYTTÖ LÄÄKETIETEEN TUTKIMUSJULKAISUISSA. Pentti Nieminen

Seulontatutkimusten perusperiaatteet

Tekijä(t) Vuosi Nro. Arviointikriteeri K E? NA

Diagnostisten testien arviointi

MS-C2103 Koesuunnittelu ja tilastolliset mallit (5 op)

MS-C2103 Koesuunnittelu ja tilastolliset mallit (5 op)

Ongelma: Poikkeaako perusjoukon suhteellinen osuus vertailuarvosta?

Tutkimusongelmia ja tilastollisia hypoteeseja: Perunalastupussien keskimääräinen paino? Nollahypoteesi Vaihtoehtoinen hypoteesi (yksisuuntainen)

Tilastotieteen aihehakemisto

Ilkka Mellin Tilastolliset menetelmät Osa 2: Otokset, otosjakaumat ja estimointi Estimointi

Osa 2: Otokset, otosjakaumat ja estimointi

Testit laatueroasteikollisille muuttujille

Tilastollinen testaaminen tai Tilastollinen päättely. Geneettinen analyysi

Funktionaaliset elintarvikkeet

Johdatus tilastotieteeseen Testit suhdeasteikollisille muuttujille. TKK (c) Ilkka Mellin (2004) 1

10. laskuharjoituskierros, vko 14, ratkaisut

Terveydenhuollon tavoitteet

NÄYTÖN ARVIOINTI: SYSTEMAATTINEN KIRJALLISUUSKATSAUS JA META-ANALYYSI. EHL Starck Susanna & EHL Palo Katri Vaasan kaupunki 22.9.

Interventiotutkimuksen arviointi

Tilastollisten aineistojen kerääminen ja mittaaminen

Luottamisvälin avulla voidaan arvioida populaation tuntematonta parametria.

TUTKIMUSAINEISTON ANALYYSI. LTKY012 Timo Törmäkangas

Postanalytiikka ja tulosten tulkinta

Evidence based medicine näyttöön perustuva lääketiede ja sen periaatteet. Eeva Ketola, LT, Kh-päätoimittaja Suomalainen Lääkäriseura Duodecim

Sisällysluettelo ESIPUHE... 4 ALKUSANAT E-KIRJA VERSIOON... 5 SISÄLLYSLUETTELO JOHDANTO TILASTOLLISEEN PÄÄTTELYYN TODENNÄKÖISYYS...

Regressioanalyysi. Vilkkumaa / Kuusinen 1

Tilastollisen analyysin perusteet Luento 11: Epäparametrinen vastine ANOVAlle

Yleistetyistä lineaarisista malleista

MTTTA1 Tilastomenetelmien perusteet 5 op Luento , osa 1. 1 Kokonaisuudet johon opintojakso kuuluu

Lohkoasetelmat. Vilkkumaa / Kuusinen 1

MTTTA1 Tilastomenetelmien perusteet 5 op Luento Kokonaisuudet johon opintojakso kuuluu

Sovellettu todennäköisyyslaskenta B

Uskomusverkot: Lääketieteelliset sovellukset

2 k -faktorikokeet. Vilkkumaa / Kuusinen 1

Valitaan testisuure, jonka jakauma tunnetaan H 0 :n ollessa tosi.

Jos nollahypoteesi pitää paikkansa on F-testisuuren jakautunut Fisherin F-jakauman mukaan

Keuhkoahtaumataudin varhaisdiagnostiikka ja spirometria. Esko Kurttila Keuhkosairauksien ja työterveyshuollon erikoislääkäri

Lohkoasetelmat. Kuusinen/Heliövaara 1

Johdatus tilastotieteeseen Testit laatueroasteikollisille muuttujille. TKK (c) Ilkka Mellin (2004) 1

TUTKIMUSAINEISTON KVANTITATIIVINEN ANALYYSI LTKY012. Timo Törmäkangas

Mittausepävarmuudesta. Markku Viander Turun yliopisto Lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia

Tilastotieteen kertaus. Vilkkumaa / Kuusinen 1

MS-C2103 Koesuunnittelu ja tilastolliset mallit (5 op)

Kliininen arviointi ja kliininen tieto mikä riittää?

Latinalaiset neliöt. Latinalaiset neliöt. Latinalaiset neliöt. Latinalaiset neliöt: Mitä opimme? Latinalaiset neliöt

Luottamisvälin avulla voidaan arvioida populaation tuntematonta parametria.

Tilastollisen analyysin perusteet Luento 3: Epäparametriset tilastolliset testit

TUTKIMUSAINEISTON ANALYYSI. LTKY012 Timo Törmäkangas

Tilastollinen testaus. Vilkkumaa / Kuusinen 1

HAVAITUT JA ODOTETUT FREKVENSSIT

Kvantitatiiviset tutkimusmenetelmät maantieteessä

Luottamisvälin avulla voidaan arvioida populaation tuntematonta parametria.

pitkittäisaineistoissa

Kaksisuuntainen varianssianalyysi. Heliövaara 1

Tiedonhaku: miten löytää näyttöön perustuva tieto massasta Leena Lodenius

Mitä kausaalivaikutuksista voidaan päätellä havainnoivissa tutkimuksissa?

Tuberkuloosin immunodiagnostiset testit. Dosentti Tamara Tuuminen, kliinisen mikrobiologian erl HY, HUSLAB Labquality

Evidence-Based-Medicine ja kliininen epidemiologia

Sisältö. Perusteiden Kertaus. Tilastollinen analyysi. Peruskäsitteitä. Peruskäsitteitä. Kvantitatiivinen metodologia verkossa

Kaksisuuntainen varianssianalyysi. Vilkkumaa / Kuusinen 1

voidaan hylätä, pienempi vai suurempi kuin 1 %?

b6) samaan perusjoukkoon kohdistuu samanaikaisesti useampia tutkimuksia.

Laadullisen tutkimuksen luonne ja tehtävät. Pertti Alasuutari professori, Laitoksen johtaja Yhteiskuntatieteiden tutkimuslaitos

Mat Tilastollisen analyysin perusteet, kevät 2007

Transkriptio:

Mitä käytännön lääkärin tarvitsee tietää biostatistiikasta? Matti Uhari

Lääkärin ammatin harjoittaminen Akateeminen ei pelkkä suorittaja Asiantuntija potilaalle lääketieteellisestä tiedosta Biologinen/luonnontieteellinen tieto Ei ole yksiselitteistä Kaikkeen liittyy vaihtelua Vaihtelua hallitaan/kuvataan biostatistiikan avulla Kaikki tieto perustuu otantaan otannoista yleistys

Yleistäminen Tilastotiede tekee tämän mahdolliseksi Tulosten kuvaus Kuinka tarkkoja havainnot ovat? Päätösten teko testaus Mihin jakauman kohtaan saatu testisuureen arvo asettuu? Yleistämisen vuoksi operoidaan testisuureilla, ei varsinaisilla havaintoarvoilla Estimointi tulosten käyttämiseen päätöksenteossa Lasketaan luottamusvälejä Syy-seuraus suhteen todistaminen Tulokset harhattomia

Mitä käytännön lääkärin tulee tietää Diagnostiikka Normaalius Testien tunnusluvut ja niiden tuottaminen Lääketieteellisen tiedon arviointi Mitä/miten seurata tietoa Tutkimusasetelmat ja niihin liittyvät virheet Otoskoko, P-arvo, luottamusvälit Tavallisimmat tilastotieteelliset testit Meta-analyysi Ohjeistukset

Potilaan diagnostiikka/hoito Perustuu aina kullakin hetkellä olevaan parhaaseen tietoon Muuttuu tiedon lisääntymisen myötä Edellyttää elämänikäistä oppimista Diagnostiikka mikä on normaalia? Tilastotieteellinen määritelmä tavallisin Ennusteellinen Hoidollinen

Diagnostinen testi

Diagnostiikka Ymmärrettävä normaaliuden määritelmien merkitys Tunnettava diagnostisten testien tunnusluvut Sensitiivisyys, spesifisyys Ennustearvot Uskottavuusosamäärät Diagnoosi AINA todennäköisyyksiä, ei musta-valkoista totuutta

Lääketieteellisen artikkelin lukeminen Lukemisen valinta Ei pysty lukemaan kaikkia Valinta tärkeä Julkaisusarjan valinta Yleiset, laajalevikkiset tärkeitä Ohjaavat hoitokäytäntöjä Eivät takaa laatua Kaikissa huonoja töitä Oman alan julkaisusarjat

Julkaisun arviointi Aloita arviointi selvittämällä tutkimusasetelma Kliininen hoitotutkimus Altistuslähtöinen havainnoiva tutkimus Sairauslähtöinen havainnoiva tutkimus Kontrolloimattomat havainnoivat tutkimukset Potilassarjat Tapausselostukset

Tutkimusasetelmat, edut ja rajoitukset Asetelma Potilassarjat Poikkileikkaustutkimus Ekologinen Tapaus-verrokki Kohortti Kliininen koe Edut Kuvaa taudin ominaisuuksia Sairauden vallitsevuus, voi tuottaa hypoteesejä Nopea vastaus, voi tuottaa hypoteesejä Voi tutkia montaa altistusta yhtä aikaa, harvinaisia tauteja, pieni potilasmäärä riittää, loogisesti helppo ja nopea, edullinen Voi tutkia montaa vastetta yhtä aikaa, harvinaisia altistuksia, harhainen virhe hallittavissa, ilmaantuvuus voidaan laskea Vakuuttavin asetelma Rajoitukset Ei ole vertailuryhmää ei voi käyttää hypoteesin testaukseen Altistuksen ajoitusta ei voi arvioida Sekoittavan tekijän hallinta vaikeata Verrokkien valinta vaikeata, altistustieto voi olla harhainen, ilmaantuvuutta ei voi laskea Vastetieto voi olla harhainen, kallis, prospektiivisena kestää kauan, ei sovi harvinaisiin tauteihin, vähän altistuksia Kallein, keinotekoinen

Havainnoiva tutkimus Tautilähtöinen tutkimus Tutkittaviksi tautiin sairastuneet uudet tapaukset Verrataan altistumista kontrollien altistumiseen Tuloksena vetosuhde - odds ratio Altistuslähtöinen tutkimus Seurattavaksi valitaan altistuneet ja heille sopivat kontrollit altistumattomista Seurannan ei tarvitse tapahtua kalenteriajassa eteenpäin Tuloksena suhteellinen riski (relative risk)

Tautilähtöinen tutkimus Vertailu altistuneiden määrien välillä Altistuneet Altistumattomat Altistuneet Altistumattomat Sairaat Tapaukset Terveet Kontrollit

Altistuslähtöinen tutkimus Altistuneet Altistumattomat Sairastuneet Terveenä pysyneet Sairastuneet Terveenä pysyneet Vertailu sairastuneiden määrien välillä

Virheet havainnoivissa tutkimuksissa Ongelmallisin harhainen virhe = bias Valintavirhe selection bias Esim. hormonihoitoa verrataan potilasryhmissä, joiden ennuste eroaa Mittausharha measurement bias Mittavirhe erilainen eri ryhmissä (kyselyyn vastaamisen motivaatio erilainen hoidetuilla kuin kontrolleilla) Sekoittava virhe confounding bias Luokitteluvirhe misclassification bias Voi olla erottelematon (nondifferential) tai erotteleva (differential)

Kliininen hoitotutkimus Satunnaistettu, samanaikaiset kontrollit Satunnaistamalla systemaattisista virheistä satunnaisvirheitä Tämä vaatimus täytettävä Historialliset kontrollit johtavat harhaan Satunnaistaminen satunnaislukujen avulla Kaikilla tutkimukseen mukaan otetuilla täytyy olla sama todennäköisyys joutua mihin tahansa hoitoryhmään

Hoitotutkimus Tutkimukseen sopivat Tutkimukseen tulleet Satunnaistaminen Hoito A Hoito B Seuranta Hoidosta hyötyneet Ei hyötyä hoidosta Hoidosta hyötyneet Ei hyötyä hoidosta Vertailu vain hoidon loputtua kaikkien satunnaistettujen välillä

Kliininen hoitotutkimus Sokkouttaminen aina, kun mahdollista Plasmafereesi reuman hoidossa Hoitoryhmien samankaltaisuus tutkimuksen alussa Satunnaistetussa tutkimuksessa erot johtuvat vain sattumasta - ei testata Ryhmien välisten erojen suuruus merkitsee, ei niiden satunnaisuus Satunnaistaminen ei tee ryhmistä samankaltaisia, vaan vertailukelpoisia

Otoskoon laskeminen Ennen tutkimuksen suoritusta Jälkikäteen laskettu otoskoko epälooginen! Valitaan hyväksytyt virhetasot Valitaan kliinisesti merkittävä teho Lukija voi olla näistä perustellusti eri mieltä!

Virheet, joiden suuruus määrätään Tyyppi I virhe = α-virhe (P-arvo, lasketaan) Tyyppi II virhe = β-virhe (ei pidetä yhtä tärkeänä) Totuus erosta Tutkimustulos erosta + + - % alfa-virhe, p-arvo - beeta-virhe %

Ei eroa -tuloksen merkitys Virhetasoa väitettäessä eron puuttuvan ei tiedetä, jos otoskokoa ei ole laskettu Ei eroa ei ole sama kuin että ero puuttuu Vrt. länsimainen oikeuskäytäntö: Syytön kunnes toisin osoitetaan Jos halutaan uuden hoidon olevan yhtä hyvä kuin vanhan valitaan riittävän pieni otoskoko Ero puuttuu aina Tätä tehty aiemmin runsaasti

Tulosten ilmoittaminen P-arvo tulkinta yksinkertaistettu (liikaa?) Luottamusvälit enemmän informaatiota Suhteellinen riski (RR), odds ratio - arvio RR:stä Suhteellinen riskin alenema (OsuusKontrolli-OsuusHoito) OsuusKontrolli Absoluuttinen riskiero OsuusKontrolli - OsuusHoito Hoidettavien potilaiden lukumäärä (NNT) 1/(OsuusKontrolli - OsuusHoito)

P-arvon tulkinta Asetetaan nollahypoteesi ei eroa oletus hypoteesi hylätään tai hyväksytään Tulos arvioidaan kliinisesti merkittävä tulos valitaan virhetasot lasketaan testisuureen arvo P-arvo testisuureen jakaumasta saadaan sen testisuureen todennäköisyys tämä on saadun tuloksen todennäköisyys 0-hypoteesin ollessa totta

Tilastollinen merkitsevyys Tulos on merkitty tilastokas Ei tarkoita kliinisesti merkittävää Ei kerro tuloksen tärkeyttä Kliininen merkittävyys aina kliinikon harkittava Arvopäätös Ei ole yhtä oikeata Lähes aina kiinnostus vaikutuksen määrässä, ei vain vaikuttaako/ei vaikuta kysymyksessä Luottamusvälit tärkein työkalu

Luottamusvälien käyttö Hoidon tehosta halutaan määrällinen käsitys, ei vain tilastollista merkitsevyyttä Hoidon tehon arviointi mahdollista luottamusvälien avulla Yleensä annetaan 95% luottamusvälit Kyseessä väli, jonka sisälle asettuvilla arvoilla valituilla todennäköisyystasoilla kohdeväestöä voidaan kuvata otoksen avulla

Hoidon sivuvaikutusten tutkiminen Potilasmäärän tulee olla iso Aineiston koko sellainen, että ainakin 3 harvinaista tapausta pitäisi osua aineistoon Jos esiintyminen 1/3000, pitäisi potilaita olla tutkimuksessa 9000 Uudet lääkkeet näyttävät aina turvallisemmilta kuin vanhat - helposti huokutus uusien käyttämiseen

Tulosten ilmoittamisella merkitystä Bobbio M ym. Lancet 1994;343:1209-1211 Mukana 148 yleislääkäriä Moniko piti hoitoa vaikuttavana

Katsaukset Tavanomainen katsaus Narrative review Asiantuntijan subjektiivinen näkemys Voi painottua omilla töillä Halu vaikuttaa tärkeämpää kuin kattavuus Systemaattinen katsaus Näytön aste ilmoitettu (A, B, C, D) Meta-analyysi Uusi analyysi julkaistuille töille

Meta-analyysi Meta-analyysin analyysi julkaisuharhan mahdollisuus Tarkastellaan ns. funnel -plot tulostusta Tarkasteltava vastemuuttujan hajonta pienenee tarkkuuden kasvaessa Kuvattaessa tarkkuutta vastemuuttujan funktiona saadaan käänteisen suppilon kuvio

Miten välttää vääriä väittämiä Lue vain aineisto ja tulokset Vertailuhoitona hyväksytty hoito lumelääke vain kun tehokasta hoitoa ei ole Hyväksytty vertailuhoito optimaalisella tavalla Päättötapahtuma ei saisi olla usean tapahtuman yhdistelmä Hoidon tehon tulee olla riittävä isoissa tutkimuksissa pieniä P-arvoja pienillä hoitojen tehoilla Alaryhmäanalyysit epäilyttäviä tulkitse hypoteeseiksi älä lopputuloksiksi Montori ym. BMJ 2004;329:1093

Miten helpottaa tulkintaa? Muistilistoista apua, samoin arviointiohjeista, kuitenkin Mikään kliininen tutkimus ei ole täydellinen pakko tehdä kompromisseja Tulkinta ei voi olla mekaanista hylätään arvokastakin tietoa Merkitys riippuu arvoista tilastotiede ei auta Tieto ajasta riippuvaista Kullakin hetkellä paras hoitopäätös, joka huomenna voi olla täysin toinen

Tutkimuksen arviointi Vaatii perehtymistä tehtyyn tutkimukseen Vie aikaa! On hauskaa ja haastavaa!! Tehkää yhdessä Lopulta arvopäätös tätä ei kannata pohtia, jos tutkimus tehty huonosti Milloin tutkimus on tehty hyvin? Julkaisufoorumi ei takaa sitä Tekijät eivät takaa sitä Aina arvioitava koko tutkimus (julkaisu)