Lampiran 1 Komposisi media pertumbuhan yang digunakan A. Media nutrien agar (NA) - Agar 1.5% - Nutrient broth 0.8%
|
|
|
- Teija Honkanen
- 4 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 LAMPIRAN 8
2 9 Lampiran 1 Komposisi media pertumbuhan yang digunakan A. Media nutrien agar (NA) - Agar 1.5% - Nutrient broth 0.8% B. Media King s B agar - Agar 1.5% - Pepton 2% - K 2 HPO % - MgSO 4.4H 2 O 0.15% - Gliserol 1.5% C. Media luria agar (LA) - Agar 1.5% - NaCl 1% - Tripton 1% - Yeast extract 0.5%
3 10 Lampiran 2 Hasil sekuensing dan analisis bioinformatika gen aiia dan 16S rrna dengan program BLAST-N dan BLAST X A. Urutan nukleotida gen aiia isolat INT1c 1 AAAAACACACAAACCTTACGTACTATCAGTTAAACGAAGATAGTTCAAAAAAAGTTTAT AATTTATTTAAAAAAATTATTTAAACGAAAAAGTCATGAGCACGCGAACTCATGACTTTT TGCACTATATATACTCAGGGAACACTCTACAACCCTTTTCCTGCTCTATATCATGACCAA AGAAAACAATTGGTTTCTCTTTCGCCACAACTCCTTTTAAACGTTTAATTGAAGATAAAG CTAATTCTGGATCAAATCCTGCGTTAAACGGCACTTCATCTTCAAAATTCTCTTTCGTGT ACGATGCATCAATTGTTAATAAAACTGAGCCGGATTGCTCCGTCTCCAAATGAATAGCGA CTGATAGGCCTGGAGAATGAATTCCCTGGCGCGAGTATACAATTAATTGAACACCTGGTA CCACTTCATAATCCCCTTCAATAATTTTGTAGTTCAAATGCGGTAATATACATTCTTTCA TATATTCTTCTCTATG 495 B. Analisis sekuen gen aiia isolat INT1c dengan program BLAST-N > gb AE Bacillus cereus ATCC 14579, complete genome Length= Features in this part of subject sequence: hypothetical protein N-acyl homoserine lactone hydrolase Score = 798 bits (432), Expect = 0.0 Identities = 470/485 (97%), Gaps = 15/485 (3%) Strand=Plus/Plus Query 11 AAACCTTACGTACTATCAGTTAAACGAAGATAGTTCAAAAAAAGTTTATAATTTATTTAA 70 Sbjct AAACCTTACGTACTATCAGTTAAACGAAGATAGTTCAAAAAAAGTTTATAATTTATTTAA Query 71 AAAAATTATTTAAACGAAAAAGTCATGAGCACGCGAACTCATGACTTTTTGCACTATATA 130 Sbjct AAAAATTATTTAAACGAAAAAGTCATGAGCACGCGAACTCATGACTTTTTGCACTATATA Query 131 TACTCAGGGAACACTCTACAACCCTTTTCCTGCTCTATATCATGACCAAAGAAAACAATT 190 Sbjct TACTCAGGGAACACTCTACAACCCTTTTCCTGCTCTATATCATGACCAAAGAAAACAATT Query 191 GGTTTCTCTTTCGCCACAACTCCTTTTAAACGTTTAATTGAAGATAAAGCTAATTCTGGA 250 Sbjct GGTTTCTCTTTCGCCACAACTCCTTTTAAACGTTTAATTGAAGATAAAGCTAATTCTGGA Query 251 TCAAATCCTGCGTTAAACGGCACTTCATCTTCAAAATTCTCTTTCGTGTACGATGCATCA 310 Sbjct TCAAATCCTGCG--AA-CGGCACTTCATCTTCAAAATTCTCTTTCGTGTACGATGCATCA Query 311 ATTGTTAATAAAACTGAGCCGGATTGCTCCGTCTCCAAATGAATAGCGACTGATAGGCCT 370 Sbjct ATTGTTAATAAAACTGAGCCGGATTGCTCCGTCTC-AA-TGAATAGCGACTGAT-GGCCT Query 371 GGAGAATGAATTCCCTGGCGCGAGTATACAATTAATTGAACACCTGGTACCACTTCATAA 430 Sbjct GGAGAATGA---CC-TGGCG----TATACAAT-AATTGAACACCTGGTACCACTTCATAA Query 431 TCCCCTTCAATAATTTTGTAGTTCAAATGCGGTAATATACATTCTTTCATATATTCTTCT 490 Sbjct TCCCCTTCAATAATTTTGTAGTTCAAATGCGGTAATATACATTCTTTCATATATTCTTCT Query 491 CTATG 495 Sbjct CTATG
4 11 C. Urutan nukleotida gen aiia isolat SGT3g 1 CGGGATCCCATGACCAGTAAAAGAAGGCTTTTATTTTCCCCCCCCCCCC TCCCAGCAAGGTCCGTTGTATTGGTTAGATCAATTCTTTCTGTTAATTAGTACACTCCGC GCCGGGGGAATTTTATTGAACTTTACCTGTATGGTGTTATCTTTTTGGAGACAGAAGAGG GGCCTATTTTAGTAGATACAGGTATGCCAGAAAGTGCAGTTAATAATGAAGGGATTTTTA ACGGTACATTTGTTGAAGGACAGATTTTACCGAAAATGACTGAAGAAGATAGAATCGTGA ATATATTAAAGCGTGTAGGGTATGAGCCGGACGACC-TTT-TATATTATTAGTTCTCACT TACATTTTGATCATGCAGGAGGAAACGGTGCTTTTACAAATACACCGATTATTGTGCAGC GAGCGGAATATGAGGCAGCACTTCATAGAGAAGAATATATGAAAGAATGTATATTACCGC ATTTGAACTACAAAATTATTGAAGGGGATTATGAAGTGGTACCAGGTGTTCAATTATTGT ATACGCCAGGTCATTCTCCAGGCCATCAGTCGTTATTCATTGAGACGGAGCAATCCGGTT CAGTTTTATTAACAATTGATGCATCGTACACGAAAGAGAATTTTGAAGATGAAGTGCCGT TCGCAGGATTTGATCCAGAATTAGCTTTATCTTCAATCAAACGCTTAAAAGAAGTTGTGA CAAAAGAGAAATCGATTGTTTTCTTTGGTCATGATATAGAGCAGGAAAAAGGGTTGTAGA GTGTTCCCGGAGTATATATAGTGCAAAAAGTCATGAGTTCGCGTGCTCATGACTTTTTCG TTTAAATAATTTTTTTTAAATAAATTATAAACTTTTTTTCAAACTATCTTCCGTTTAACT GGATAGTACGTAAAGTTTTTACATCAATTAAGGAGTATCCTTG 930 D. Analisis sekuen gen aiia isolat SGT3g dengan program BLAST-N > gb CP Bacillus thuringiensis BMB171, complete genome Length= Features in this part of subject sequence: hypothetical protein N-acyl homoserine lactone hydrolase Score = 1404 bits (760), Expect = 0.0 Identities = 846/883 (96%), Gaps = 24/883 (3%) Strand=Plus/Minus Query 50 TCCCAGCAAGGTCCGTTGTATTGGTTAGATCAATTCTTTCTGTTAATTAGTACACTCCGC 109 Sbjct TCCCAGC-AGGT-CGTTGTA-T-GTTAGATC-ATTC-TTCTGTTAA-TGGTACACT-CGC Query 110 GCCGGGGGAATTTTATTGAACTTTACCTGTATGGTGTTATCTTTTTGGAGACAGAAGAGG 169 Sbjct GCC-GGGGAA-TTTATTGAAC-TTACCTGTATGGTGTTATC-TTTTGGAGACAGAAGAGG Query 170 GGCCTATTTTAGTAGATACAGGTATGCCAGAAAGTGCAGTTAATAATGAAGGGATTTTTA 229 Sbjct GGCCTATTTTAGTAGATACAGGTATGCCAGAAAGTGCAGTTAATAATGAAGGGCTTTTTA Query 230 ACGGTACATTTGTTGAAGGACAGATTTTACCGAAAATGACTGAAGAAGATAGAATCGTGA 289 Sbjct ACGGTACATTTGTTGAAGGACAGATTTTACCGAAAATGACTGAAGAAGATAGAATCGTGA Query 290 ATATATTAAAGCGTGTAGGGTATGAGCCGGACGACC-TTT-TATATTATTAGTTCTCACT 347 Sbjct ATATATTAAAGCGTGTAGGGTATGAGCCGGACGACCTTTTATATATTATTAGTTCTCACT Query 348 TACATTTTGATCATGCAGGAGGAAACGGTGCTTTTACAAATACACCGATTATTGTGCAGC 407 Sbjct TACATTTTGATCATGCAGGAGGAAACGGTGCTTTTACAAATACACCGATTATTGTGCAGC Query 408 GAGCGGAATATGAGGCAGCACTTCATAGAGAAGAATATATGAAAGAATGTATATTACCGC 467 Sbjct GAACGGAATATGAGGCAGCACTTCATAGAGAAGAATATATGAAAGAATGTATATTACCGC Query 468 ATTTGAACTACAAAATTATTGAAGGGGATTATGAAGTGGTACCAGGTGTTCAATTATTGT 527 Sbjct ATTTGAACTACAAAATTATTGAAGGGGATTATGAAGTGGTACCAGGTGTTCAATTATTGT
5 12 Query 528 ATACGCCAGGTCATTCTCCAGGCCATCAGTCGTTATTCATTGAGACGGAGCAATCCGGTT 587 Sbjct ATACGCCAGGTCATTCTCCAGGCCATCAGTCGTTATTCATTGAGACGGAGCAATCCGGTT Query 588 CAGTTTTATTAACAATTGATGCATCGTACACGAAAGAGAATTTTGAAGATGAAGTGCCGT 647 Sbjct CAGTTTTATTAACAATTGATGCATCGTACACGAAAGAGAATTTTGAAGATGAAGTGCCGT Query 648 TCGCAGGATTTGATCCAGAATTAGCTTTATCTTCAATCAAACGCTTAAAAGAAGTTGTGA 707 Sbjct TCGCAGGATTTGATCCAGAATTAGCTTTATCTTCAATTAAACGTTTAAAAGGAGTTGTGG Query 708 CAAAAGAGAAATCGATTGTTTTCTTTGGTCATGATATAGAGCAGGAAAAAGGGTTGTAGA 767 Sbjct CGAAAGAGAAACCAATTGTTTTCTTTGGTCATGATATAGAGCAGGAAAA-GGGTTGTAGA Query 768 GTGTTCCCGGAGTATATATAGTGCAAAAAGTCATGAGTTCGCGTGCTCATGACTTTTTCG 827 Sbjct GTGTTCCCTGAGTATATATAGTGCAAAAAGTCATGAGTTCGCGTGCTCATGACTTTTTCG Query 828 TTTAAATAATTTTTTTTAAATAAATTATAAACTTTTTTTCAAACTATCTTCCGTTTAACT 887 Sbjct TTTAAATAATTTTTTT-AAATAAATTATAAACTTTTTTTGAA-CTATCTTC-GTTTAACT Query 888 GGATAGTACGTAAAGTTTTTACATCAATTAAGGAGTATCCTTG 930 Sbjct G-ATAGTACGTAA-GTTTT-ACATCA-TCA-GGAGTATC-TTG E. Analisis sekuen gen aiia isolat INT1c dengan program BLAST-X > pdb 2BR6 A Chain A, Crystal Structure Of Quorum- Quenching N-Acyl Homoserine Lactone Lactonase Score = 197 bits (500), Expect = 3e-51 Identities = 102/123 (83%), Positives = 108/123 (88%), Gaps = 5/123 (4%) Frame = -1 Query 495 HREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVVPGVQLIVYSRQGIHSPGLSVAIHLETEQSGSVLL 316 HREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVVPGVQL+ HSPG ++ ++TEQSGSVLL Sbjct 135 HREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVVPGVQLLYTPG---HSPGHQ- SLFIKTEQSGSVLL 190 Query 315 TIDASYTKENFEDEVPFNAGFDPELALSSIKRLKGVVAKEKPIVFFGHDIEQEKGCRVFP 136 TIDASYTKENFEDEVPF AGFDPELALSSIKRLK VV KEKPI+FFGHDIEQEK CRVFP Sbjct 191 TIDASYTKENFEDEVPF- AGFDPELALSSIKRLKEVVKKEKPIIFFGHDIEQEKSCRVFP 249 Query 135 EYI 127 EYI Sbjct 250 EYI 252
6 13 F. Analisis sekuen gen aiia isolat INT1c dengan program BLAST-X > pdb 2BR6 A Chain A, Crystal Structure Of Quorum- Quenching N-Acyl Homoserine Lactone Lactonase pdb 2BTN A Chain A, Crystal Structure And Catalytic Mechanism Of The Quorum- Quenching N-Acyl Homoserine Lactone Hydrolase Length=252 Sort alignments for this subject sequence by: E value Score Percent identity Query start position Subject start position Score = 285 bits (728), Expect(4) = 1e-109 Identities = 138/143 (97%), Positives = 140/143 (98%), Gaps = 0/143 (0%) Frame = +2 Query 329 YIISSHLHFDHAGGNGAFTNTPIIVQRAEYEAALHREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVV 508 YIISSHLHFDHAGGNGAFTNTPIIVQR EYEAALHREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVV Sbjct 101 YIISSHLHFDHAGGNGAFTNTPIIVQRTEYEAALHREEYMKECILPHLNYKIIEGDYEVV 160 Query 509 PGVQLLYTPGHSPGHQSLFIETEQSGSVLLTIDASYTKENFEDEVPFAGFDPELALSSIK 688 PGVQLLYTPGHSPGHQSLFI+TEQSGSVLLTIDASYTKENFEDEVPFAGFDPELALSSIK Sbjct 161 PGVQLLYTPGHSPGHQSLFIKTEQSGSVLLTIDASYTKENFEDEVPFAGFDPELALSSIK 220 Query 689 RLKEVVTKEKSIVFFGHDIEQEK 757 RLKEVV KEK I+FFGHDIEQEK Sbjct 221 RLKEVVKKEKPIIFFGHDIEQEK 243 Score = 123 bits (308), Expect(4) = 1e-109 Identities = 59/60 (98%), Positives = 60/60 (100%), Gaps = 0/60 (0%) Frame = +1 Query 154 LETEEGPILVDTGMPESAVNNEGIFNGTFVEGQILPKMTEEDRIVNILKRVGYEPDDLLY 333 LETEEGPILVDTGMPESAVNNEG+FNGTFVEGQILPKMTEEDRIVNILKRVGYEPDDLLY Sbjct 42 LETEEGPILVDTGMPESAVNNEGLFNGTFVEGQILPKMTEEDRIVNILKRVGYEPDDLLY 101 Score = 25.4 bits (54), Expect(4) = 1e-109 Identities = 9/12 (75%), Positives = 11/12 (92%), Gaps = 0/12 (0%) Frame = +3
7 14 Query 750 RKKGCRVFPEYI K CRVFPEYI Sbjct 241 QEKSCRVFPEYI 252 Score = 24.6 bits (52), Expect(4) = 1e-109 Identities = 14/33 (42%), Positives = 16/33 (48%), Gaps = 7/33 (21%) Frame = +3 Query 90 C*LVHSA------PGEFY*TLPVWCYLFGDRRG 170 C L HS+ PG+ LPVWCYL G Sbjct 16 CMLDHSSVNSALTPGKLL-NLPVWCYLLETEEG 47 G. Urutan nukleotida gen 16S rrna isolat INT1c 1 GGAGAATGATAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGT AACCTGCCCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTT GAACCGCATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGT CGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAG AGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCCTACGGGGAAGGCAGCC AGTAGGGAATCTTCCGCAATGGAACGATAAGTTCTGACGGAGCAACCGCCGGCGTGAGTG ATGAAGGCCTTTCGGGTTCGTAAAACTCTGTTGTTTAGGGAAAGAACAAGTGCTTAGTTG AATAAGCTGGCACCTTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCA GCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCA GGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAAC TGGGGAGACTTGAGTGCAGAAGAGGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTA GAGATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGC GCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGA GTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCG GTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCG CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCG GTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTC TGAAAACCCTAGAGATAGGGCTTCTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTG TCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCT TAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGG TGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGG ACGGTACAAAGAGCTGCAAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTT CGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCA 1322 H. Analisis sekuen gen 16S rrna isolat INT1c dengan program BLAST-N > gb JF Bacillus cereus strain GM3 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Length=1363 Score = 2324 bits (1258), Expect = 0.0 Identities = 1303/1321 (99%), Gaps = 18/1321 (1%) Strand=Plus/Plus Query 4 GAAT-GA-TAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGT 61 Sbjct 49 GAATGGATTAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGT 108 Query 62 AACCTGCCCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTT 121 Sbjct 109 AACCTGCCCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTT 168 Query 122 GAACCGCATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGT 181 Sbjct 169 GAACCGCATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGT 228 Query 182 CGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAG 241 Sbjct 229 CGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAG 288 Query 242 AGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCCTACGGGGAAGGCAGCC 301
8 15 Sbjct 289 AGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACT-CCTAC-GGG-AGGCAG-C 344 Query 302 AGTAGGGAATCTTCCGCAATGGAACGATAAGTTCTGACGGAGCAACCGCCGGCGTGAGTG 361 Sbjct 345 AGTAGGGAATCTTCCGCAATGG-ACGA-AAG-TCTGACGGAGCAA-CGCC-GCGTGAGTG 399 Query 362 ATGAAGGCCTTTCGGGTTCGTAAAACTCTGTTGTTTAGGGAAAGAACAAGTGCTTAGTTG 421 Sbjct 400 ATGAAGG-CTTTCGGG-TCGTAAAACTCTGTTG-TTAGGG-AAGAACAAGTGC-TAGTTG 454 Query 422 AATAAGCTGGCACCTTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCA 481 Sbjct 455 AATAAGCTGGCACC-TTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCA 513 Query 482 GCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCA 541 Sbjct 514 GCCGCGGTAATACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCA 573 Query 542 GGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAAC 601 Sbjct 574 GGTGGTTTCTTAAGTCTGATGTGAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAAC 633 Query 602 TGGGGAGACTTGAGTGCAGAAGAGGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTA 661 Sbjct 634 T-GGGAGACTTGAGTGCAGAAGAGGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTA 692 Query 662 GAGATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGC 721 Sbjct 693 GAGATATGGAGGAACACCAGTGGCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGC 752 Query 722 GCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGA 781 Sbjct 753 GCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGA 812 Query 782 GTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCG 841 Sbjct 813 GTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCG 872 Query 842 CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCG 901 Sbjct 873 CCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCG 932 Query 902 GTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTC 961 Sbjct 933 GTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTC 992 Query 962 TGAAAACCCTAGAGATAGGGCTTCTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTG 1021 Sbjct 993 TGAAAACCCTAGAGATAGGGCTTCTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTG 1052 Query 1022 TCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCT 1081 Sbjct 1053 TCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCT 1112 Query 1082 TAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGG 1141 Sbjct 1113 TAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGG 1172 Query 1142 TGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGG 1201 Sbjct 1173 TGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGG 1232 Query 1202 ACGGTACAAAGAGCTGCAAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTT 1261 Sbjct 1233 ACGGTACAAAGAGCTGCAAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTT 1292 Query 1262 CGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGC 1321 Sbjct 1293 CGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGC 1352 Query 1322 A 1322 Sbjct 1353 A 1353
9 16 I. Urutan nukleotida gen 16S rrna isolat SGT3g 1 GGGGGGGAAGGTTAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACG TGGGTAACCTGCCCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAAC ATTTTGAACCGCATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACC CGCGTCGCATTAGCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGAC CTGAGAGGGTGATCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAG CAGTAGGGAATCTTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGA AGGCTTTCGGGTCGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCTAGTTGAATAAGCTG GCACCTTGACGGTACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAA TACGTAGGTGGCAAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTTTCT GAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAAGA GGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATATGGAGGAACACCAGTGG TAAGTCTGATGTCGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAGCGTG GGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGT TAGAGGGTTTCCGCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTA CGGCCGCAAGGCTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGT GGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGAAAACCCTA GAGATAGGGCTTCTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCG TGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATC ATTAAGTTGGGCTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATC ATTAAGTTGGGCACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAAGAAGGTGGGGATGACG TCAAATCATCATGCCCCTTAAGACCTGGGCTACCCACGTGCTACAATGGACGGTTCAAAA AGCTGCAAGACCGCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTTCGGATTGTAGG CTGCAACTCGCCTACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGNTCAGCAGCCGC 1313 J. Analisis sekuen gen 16S rrna isolat SGT3g dengan program BLAST-N > gb JF Bacillus thuringiensis strain A1-1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence Length=1411 Score = 2364 bits (1280), Expect = 0.0 Identities = 1296/1304 (99%), Gaps = 2/1304 (0%) Strand=Plus/Plus Query 12 TTAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGC 71 Sbjct 20 TTAAGAGCTTGCTCTTATGAAGTTAGCGGCGGACGGGTGAGTAACACGTGGGTAACCTGC 79 Query 72 CCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTTGAACCGC 131 Sbjct 80 CCATAAGACTGGGATAACTCCGGGAAACCGGGGCTAATACCGGATAACATTTTGAACCGC 139 Query 132 ATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGTCGCATTA 191 Sbjct 140 ATGGTTCGAAATTGAAAGGCGGCTTCGGCTGTCACTTATGGATGGACCCGCGTCGCATTA 199 Query 192 GCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGA 251 Sbjct 200 GCTAGTTGGTGAGGTAACGGCTCACCAAGGCAACGATGCGTAGCCGACCTGAGAGGGTGA 259 Query 252 TCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATC 311 Sbjct 260 TCGGCCACACTGGGACTGAGACACGGCCCAGACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATC 319 Query 312 TTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCTTTCGGGT 371 Sbjct 320 TTCCGCAATGGACGAAAGTCTGACGGAGCAACGCCGCGTGAGTGATGAAGGCTTTCGGGT 379 Query 372 CGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCTAGTTGAATAAGCTGGCACCTTGACGG 431 Sbjct 380 CGTAAAACTCTGTTGTTAGGGAAGAACAAGTGCTAGTTGAATAAGCTGGCACCTTGACGG 439 Query 432 TACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGC 491 Sbjct 440 TACCTAACCAGAAAGCCACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTGGC 499 Query 492 AAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGT 551 Sbjct 500 AAGCGTTATCCGGAATTATTGGGCGTAAAGCGCGCGCAGGTGGTTTCTTAAGTCTGATGT 559
10 17 Query 552 GAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAAGA 611 Sbjct 560 GAAAGCCCACGGCTCAACCGTGGAGGGTCATTGGAAACTGGGAGACTTGAGTGCAGAAGA 619 Query 612 GGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATATGGAGGAACACCAGTGG 671 Sbjct 620 GGAAAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGAGATATGGAGGAACACCAGTGG 679 Query 672 CGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAG 731 Sbjct 680 CGAAGGCGACTTTCTGGTCTGTAACTGACACTGAGGCGCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAG 739 Query 732 GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCC 791 Sbjct 740 GATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAAGTGTTAGAGGGTTTCC 799 Query 792 GCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGC 851 Sbjct 800 GCCCTTTAGTGCTGAAGTTAACGCATTAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGC 859 Query 852 TGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA 911 Sbjct 860 TGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGA 919 Query 912 AGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGAAAACCCTAGAGATAGGGCTT 971 Sbjct 920 AGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATCCTCTGAAAACCCTAGAGATAGGGCTT 979 Query 972 CTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG 1031 Sbjct 980 CTCCTTCGGGAGCAGAGTGACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATG 1039 Query 1032 TTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGC 1091 Sbjct 1040 TTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTGATCTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGC 1099 Query 1092 ACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAAGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCAT 1151 Sbjct 1100 ACTCTAAGGTGACTGCCGGTGACAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCAT 1159 Query 1152 GCCCCTTAAGACCTGGGCTACCCACGTGCTACAATGGACGGTTCAAAAAGCTGCAAGACC 1211 Sbjct 1160 GCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGACGGTACAAAGAGCTGCAAGACC 1219 Query 1212 GCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCC 1271 Sbjct 1220 GCGAGGTGGAGCTAATCTCATAAAACCGTTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCC 1279 Query 1272 TACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGN-TCAGCA-GCCGC 1313 Sbjct 1280 TACATGAAGCTGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCATGCCGC 1323
Table S2. S. thermophilus CRISPR spacer sequence analysis.
Table S2. S. thermophilus CRISPR analysis. 001_1_01 TGTTTGACAGCAAATCAAGATTCGAATTGT 30 AF115103 Streptococcus thermophilus bacteriophage Sfi21, compl 40 93 28 2 0 3 30 38304 38331 1 001_1_02 AATGACGAGGAGCTATTGGCACAACTTACA
lpar1 IPB004065, IPB002277, and IPB Restriction Enyzme Differences from REBASE Gained in Variant Lost from Reference
lpar1 IPB465, IPB2277, and IPB5385 Genomic Sequence Coding Sequence For help interpreting these results, view the PARSENP Introduction page. # View On Sequence Nucleotide Change Effect Restriction Enyzme
Rautalankamalleja sekvenssihakuihin STN:ssä VTT, Tietoratkaisut, Riitta Housh 6.5.2014
Rautalankamalleja sekvenssihakuihin STN:ssä VTT, Tietoratkaisut, Riitta Housh 6.5.2014 1. Sekvenssitietokannat... 2 2. BLAST... 3 2.1 REGISTRY/(H)CAplus... 3 2.2 DGENE, PCTGEN ja USGENE... 8 2.3 Koko BLAST-hakuproseduuri...
gi 161984995 gb CP000896.1 Acholeplasma laidlawii PG-8A, complete genome ATTTGATTTTTTGCTTAATTTTTATGTAATTACTTCCCCACAATTTTTGCCCACATATTGTGGATAAAT TTCCACATTTTATTCACAATGTTGATAAGTTGTGTAAGTCGACTTGTTGGCTTTATAAAGCAAATGACA
Supporting Information for
Supporting Information for Analysis of Sogatella furcifera proteome that interact with P10 protein of Southern rice black-streaked dwarf virus Win Than*, Faliang Qin*, Wenwen Liu, Xifeng Wang ** State
Functional Genomics & Proteomics
Functional Genomics & Proteomics Genome Sequences TCACAATTTAGACATCTAGTCTTCCACTTAAGCATATTTAGATTGTTTCCAGTTTTCAGCTTTTATGACTAAATCTTCTAAAATTGTTTTTCCCTAAATGTATATTTTAATTTGTCTCAGGAGTAGAATTTCTGAGTCATAAAGCGGT CATATGTATAAATTTTAGGTGCCTCATAGCTCTTCAAATAGTCATCCCATTTTATACATCCAGGCAATATATGAGAGTTCTTGGTGCTCCACATCTTAGCTAGGATTTGATGTCAACCAGTCTCTTTAATTTAGATATTCTAGTACAT
Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii
Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of
111111111111111111 II IIII II II 11111111111111111111
111111111111111111 II IIII II II 11111111111111111111 F10008 (12) PATENTTIJULKAISU PATENTSICRIFT (10) FI B (45) Patentti myönnetty - Patent beviljats 15.04.1999 (51) Kv.lk.6 - Int.k1.6 SUOMI-FINLAND (FI)
Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6.
Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6. A. Promoter Sequences Gal4 binding sites are highlighted in the color referenced in Figure 1A when possible. Site 1: red,
State of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology
Functional Genomics Research Stream State of the Union... Research Meeting: February 16, 2010 Functional Genomics & Research Report III Concepts Genomics Molecular Biology Computational Biology Genome
Eukaryotic Comparative Genomics
Eukaryotic Comparative Genomics Detecting Conserved Sequences Charles Darwin Motoo Kimura Evolution of Neutral DNA A A T C TA AT T G CT G T GA T T C A GA G T A G CA G T GA AT A GT C T T T GA T GT T G T
Sekvenssievoluutio ja fylogeniat
Sekvenssievoluutio ja fylogeniat Miksi ja miten nukleotidikorvautumiset lasketaan havaittujen sekvenssierojen perusteella? -sekvenssien linjaus -mitä eroa on eroilla ja korvautumisilla - nukleotidikorvautumisten
6.095/ Computational Biology: Genomes, Networks, Evolution. Sequence Alignment and Dynamic Programming
6.095/6.895 - Computational Biology: Genomes, Networks, Evolution Sequence lignment and Dynamic Programming Tue Sept 13, 2005 Challenges in Computational Biology 4 Genome ssembly 5 Regulatory motif discovery
tgg agg Supplementary Figure S1.
ttaggatattcggtgaggtgatatgtctctgtttggaaatgtctccgccattaactcaag tggaaagtgtatagtaatgaatctttcaagcacacagatcacttcaaaagactgtttcaa catcacctcaggacaaaaagatgtactctcatttggatgctgtgatgccatgggtcacag attgcaattcccaagtgcccgttcttttacaccaaaatcaaagaagaatatctccccttt
Plasmid Name: pmm290. Aliases: none known. Length: bp. Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson. Last updated: 17 August 2009
Plasmid Name: pmm290 Aliases: none known Length: 11707 bp Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson Last updated: 17 August 2009 Description and application: This is a mammalian expression vector for
CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology. Xiaohui S. Xie University of California, Irvine
CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology Xiaohui S. Xie University of California, Irvine Today s Goals Course information Challenges in computational biology Introduction to molecular
Genetic engineering of a temperature phage-based delivery system for CRISPR/Cas9
Genetic engineering of a temperature phage-based delivery system for CRISPR/Cas9 antimicrobials against Staphylococcus aureus Bo Youn Moon 1,2$, Joo Youn Park 1$, Juw Won Park 3, Justin A. Thornton 4,
Bioinformatics. Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding. Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute
Bioinformatics Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute Course Syllabus Jan 7 Jan 14 Jan 21 Jan 28 Feb 4 Feb 11 Feb 18
Ribosomit 1. Ribosomit 2. Ribosomit 3
Ribosomit 1 Palade & Siekevitz eristivät jaottelusentrifugaatiolla ns. mikrosomeja radioakt. aminohapot kertyivät mikrosomeihin, jotka peräisin rer:ää sisältävistä soluista proteiinisynteesi soluliman
Strain or plasmid Description a Reference or source b. 168 trpc2 Laboratory. 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC
TABLE S1 Bacterial strains and plasmids Strain or plasmid Description a Reference or source b B. subtilis 168 trpc2 Laboratory stock 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC BM1010 trpc2 htpx::pgs1582; Em r BM1302 trpc2
ARKISTOLUETTELO. päiväys 8.5.2012 Sivu 1(12) VANTAAN KOTISEUTUARKISTO ASUNTO-OSAKEYHTIÖ SAHATIE 22 PÖYTÄKIRJAT. Yhtiökokousten pöytäkirjat 1963-1991
PÖYTÄKIRJAT päiväys 8.5.202 Sivu (2) Ca Yhtiökokousten pöytäkirjat 963 99 Yhtiökokousten pöytäkirjat 963-99 PÖYTÄKIRJAT päiväys 8.5.202 Sivu 2(2) Cb Hallituksen pöytäkirjat 964 992 Hallituksen pöytäkirjat
w%i rf* meccanoindex.co.uk
&, w% r* lr,ryd* kro g ; - C +gä!! r -. ä.;'! dg+s Zt t0, y < 9 -! 8 tü;r" lun.'-y; ',ä lrl;!tä u l - 9 9! - ä 6 ^ 9 b - q - cz * ; *'a! a = ;6 f
Supplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell. exterior
Supplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell exterior Martin Gustavsson, David Hörnström, Susanna Lundh, Jaroslav Belotserkovsky, Gen Larsson
ARKISTOLUETTELO KESKUSHALLINTO VANHAT ARKISTOT HOLHOUSLAUTAKUNTA. 1 Saapuneiden kirjeiden diaarit 1976-1978. Päätearkisto.
Sivu 1(11) Aa Saapuneiden kirjeiden diaarit 1976 1978 1 Saapuneiden kirjeiden diaarit 1976-1978 Sivu 2(11) Ab Lähetettyjen kirjeiden diaarit 1959 1987 1 Lähetettyjen kirjeiden diaarit 1959-1969 2 Lähetettyjen
Valmiustaitoja biokemisteille
Valmiustaitoja biokemisteille - Power Point -ohjelman käyttö - seminaariesitelmän laatiminen ja esittäminen Tuomo Glumoff 1. Power Point -ohjelman käyttö - teksti - kuvat - tausta - valmiit pohjat * löytyy
Bacillus thuringiensis hyvä vai paha?
Bacillus thuringiensis hyvä vai paha? Annukka Markkula, erikoistutkija, ELT Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö Elintarviketurvallisuusvirasto Evira Mikrobit hyvässä ja pahassa seminaari
Ribosomit 1. Ribosomit 4. Ribosomit 2. Ribosomit 3. Proteiinisynteesin periaate 1
Ribosomit 1 Ribosomit 4 Palade & Siekevitz eristivät jaottelusentrifugaatiolla ns. mikrosomeja radioakt. aminohapot kertyivät mikrosomeihin, jotka peräisin rer:ää sisältävistä soluista proteiinisynteesi
Python Libraries 1 / 14
Python Libraries 1 / 14 Gzip, CSV https://docs.python.org/3/library/gzip.html https://docs.python.org/3/library/csv.html https://daler.github.io/pybedtools/ - PyBed tools http://biopython.org/wiki/gff_parsing
TIETOSUOJA MENESTYSTEKIJÄNÄ
Juhta/VAHTI työpaja 18.5.2018 TIETOSUOJA MENESTYSTEKIJÄNÄ Reijo Aarnio tietosuojavaltuutettu Tietosuojavaltuutetun toimisto 1 YLIKOROSTETUSTA TIETOSUOJASTA ON TULLUT TIETOTEKNIIKAN LIITO-ORAVA - Esko Aho,
!"#$%&'()$*&$(+,"+ )"##*(($(+ $-".+ #*/*(0"(+ /%.**11*2)&*.!213.'##'+
"#$%&#'()* "#$%&'()$*&$(+,"+ )"##*(($(+ $-".+ #*/*(0"(+ /%.**11*2)&*.213.'##'+ "#$%&'()$*&$(+,"+ )"##*(($(+ $-".+ #*/*(0"(+ /%.**11*2)&*.213.'##'+ "#$%&#'()* +,(##*-'&'-. /&0*'1231 4((5&'6)7$89$)$'$97:;&)
5a) TTATTTGAGGTGAGCGAGGGAGAGAGAGA GAGAGTGAGAGCGAATCAAGA----
5a) CG32582: melanogaster (above), yakuba (below) Martinez/Needleman-Wunsch DNA Alignment Minimum Match: 9; Gap Penalty: 1.10; Gap Length Penalty: 0.33 9960 9970 9980 9990 10000 10010 10020 ATCCCCAATCGCTTTTGTGCAAGAAAATATATAGACGAAATTATTTCCTACGATTAATCCTTTGTATCGG
B3206 Microbial Genetics
Prof. Fahd M. Nasr Lebanese university Faculty of sciences I Department of Natural Sciences fnasr@ul.edu.lb B3206 Microbial Genetics 1 Eukaryotic M. G. The yeast Saccharomyces cerevisiae as a genetic model
A DIAARIT JA PÄIVÄKIRJAT. Aa Saapuneiden ja lähtevien kirjeiden diaarikortit. Saapuneiden ja lähtevien kirjeiden diaarikortit
ARKISTOLUETTELO Kunta/Kuntainliitto Pääsarjan nimike Valkeakosken kaupunki A-D, F-G Arkistonmuodostaja/viranomainen Koululautakunta Hyllyn numero 361-368, 391-397, 403-404, 406-407, 409-410, 412, 414 Lukumäärä
Predicting evolutionarily conserved regions (ECRs) in the Xenopus tropicalis genome using a MultiPipMaker-based bioinformatic strategy
Predicting evolutionarily conserved regions (ECRs) in the Xenopus tropicalis genome using a MultiPipMaker-based bioinformatic strategy OVERVIEW- Method updated and written by Sarah Louie (6/19/08) Initially
Garlic yellow mosaic-associated virus
Garlic yellow mosaic-associated virus TGB3 Replicase TGB1 CP 8,209 nt TGB2 LOCUS Garlic 8209 bp RNA linear 23-MAR-2018 DEFINITION yellow mosaic-associated virus. ACCESSION Garlic VERSION KEYWORDS. SOURCE
Maa- ja metsätalousministeri
MAA- JA METSÄTALOUSMINISTERIÖ ASETUS nro 18/09 Päivämäärä Dnro 24.6.2009 1655/14/2009 Voimaantulo- ja voimassaoloaika 8.7.2009 - toistaiseksi Muuttaa Kasvinsuojeluaineen hyväksymisen hakemisesta ja hyväksymisestä
A DIAARIT JA PÄIVÄKIRJAT. Aa Saapuneiden kirjeiden diaarit. Saapuneiden kirjeiden diaarit. Ab Lähetettyjen kirjeiden diaarit
ARKISTOLUETTELO Kunta/Kuntainliitto Pääsarjan nimike Valkeakosken kaupunki A-G Arkistonmuodostaja/viranomainen Taksoituslautakunta Hyllyn numero 726-732 Lukumäärä ja laatu Arkistotunnus Asiakirjakokonaisuuden
ä 3 lr;+fä3fää äää+ r
h. /] fr ff J { 1) -* {s ;; '*J 0 K F * 4 EP f' J d {.l E *e}' -{ ä'r) * fü PE }} ä g {fr ff EW g) f< Q-O -r -l ^= F{ $ $ ä- $FF flü +ä# äf $ E& =4 äh $ F. g ääü f se L ü,,8 g gr- ä äe HSs 9 5 ;n; g Fß;
CSC:n käyttäjätunnukset - myös opiskelijoille
CSC:n käyttäjätunnukset - myös opiskelijoille http://www.csc.fi/asiakkaaksi/korkeakoulut/kayttol upahakemukset/index_html Ohjaajan nimeksi Petri Törönen Perusteluiksi opiskelu ja luentokurssin nimi (Geneettisen
Supplementary Information
Supplementary Information Supplementary Table 1. Strain table Strain name Genotype Reference CEN.PK111-27B MATa leu2 trp1 Euroscarf TC-49 TC-50 pdc5::aro4* aro10::aro7* This study TC-50 MATa leu2 trp1
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Mitä uudet DNA sekvensointimenetelmät voivat paljastaa luonnonjärjestelmästä? Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Petri
Peptidi ---- F ----- K ----- V ----- R ----- H ----- A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 24.5.2006 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 Osa 1: Haluat selvittää -- F -- K -- V -- R -- H -- A peptidiä
Alustavan Bacillus cereus -bakteerin ja itiöiden määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.
Vastuuhenkilö Tuula Johansson Sivu/sivut 1 / 5 Alustavan Bacillus cereus -bakteerin ja itiöiden määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka. 1 Menetelmäviitteet ja poikkeamat ISO 7932:2004 (Mossel 30 C / 24
2. luento Kahden sekvenssin rinnastus
2. luento Kahden sekvenssin rinnastus Miksi rinnastusta opetetaan Keskeisintä bioinformatiikkaa Voidaan päätellä: konservoituneita alueita pistemutaatioita lajien tai geenien evolutiivisia suhteita Osa
Supporting information
Supporting information Figure S1. Carotenoid biosynthesis pathway in papaya fruit which is adopted from Blas et al. (2010) (reference 4) and Nisar et al. (2015) (reference 5). Carotenoids are synthesized
SPA-ZC. Ostajan opas
Ostajan opas Julkaistu: 18.01.2006 Tila: Vastaa englanninkielistä versiota C/24.02.2004 Versio: A Pidätämme oikeuden muutoksiin ilman ennakkoilmoitusta Ominaisuudet SPA-väylään liitettävä sähköinen/optinen
g - s Eä;t;i;s!itää# EiäErE ii:ääg Eä E *läeäfiäeräsil* E sis $ä äce:;!ääfät ;1*iEs ;tää:gi g;ää*f ;ij !äef ä:e'geä;:ä Elä tä Efiäilii: ; g E
H!äf ä'gä;ä lä tä fäl ; $ä äc;!ääfät ;1* ;tääg ä;t;;!tää# är ääg ä *läääeräl* tä*äätäääägtätg B g - ü ;;*ä9äää g;ää*f ' g ;j ä u e *; t t ;; t ü t p ä; u ä; e r * g t g U ).l t r A ä O.* 6) l- C ) t n
1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward.
START START SIT 1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward. This is a static exercise. SIT STAND 2. SIT STAND. The
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito SNP 14.1.2013 Tiina Immonen Biolääketieteen laitos Biokemia ja kehitysbiologia Jakson luennot Mitä on genomilääketiede? Dan Lindholm Genomin ylläpito Tiina Immonen
Genomin ilmentyminen
Kauppi 17/01/2014 Genomin ilmentyminen LH1, Molekyylibiologia 17.1.2014 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Huone C501b, Biomedicum 1 Transkriptiofaktorin mutaatio voi
Mark Summary Form Taitaja-Mästare 2009
Form 6 Summary Form Page 1 of 1 11-03-2011 16:09:16 Skill No. 409 Skill Veneenrakennus Competitor No. Competitor Name Member Criterion Criterion Description s Day 1 Day 2 Day 3 Day 4 Total Award A B C
äi ä I i ilääiiii: i!
H q;) ri - tr H i : L v ^-1ö c/ tr V AN S n : d : F r i ;*v.1.i-,:xt rh Y l-s i \r 6 = tä Nl z - H A z : l l :, ä c iiiii;iäätäiliiiiä*i :n + E. < E t.! äa* -si ;9:-d ;,1, o
ARKISTOLUETTELO A MERKINTÄKIRJAT. Aa Luokkien päiväkirjat. sis. 5 sidosta. 1 kansio. Aa:1 1924-1926. Päiväkirjoja. Päiväkirja. 4 sidosta.
ARKISTOLUETTELO Kunta/Kuntainliitto Pääsarjan nimike Valkeakosken kaupunki A-E, G-J Arkistonmuodostaja/viranomainen Valkeakosken yhteiskoulu Hyllyn numero 146-153 Lukumäärä ja laatu Arkistotunnus Asiakirjakokonaisuuden
11/17/11. Gene Regulation. Gene Regulation. Gene Regulation. Finding Regulatory Motifs in DNA Sequences. Regulatory Proteins
Gene Regulation Finding Regulatory Motifs in DNA Sequences An experiment shows that when X is knocked out, 20 other s are not expressed How can one have such drastic effects? Regulatory Proteins Gene X
Fonte 16045SAVA 16045VAVA 16045SAVA 16045VAVA ASENNUSOHJE MONTERINGSANVISNING ASSEMBLY INSTRUCTIONS K16045VAK2 K16045SAK1 K16045K3 K16045K3
Fonte 16045SAVA 16045VAVA ASENNUSOHJE MONTERINGSANVISNING ASSEMBLY INSTRUCTIONS 16045SAVA K16045SAK1 K16045VAK2 K16045K3 16045VAVA K16045VAK1 K16045VAK2 K16045K3 1 2 900167 LE22SWL003 LE22VWL003 LE18VWL001
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Biologian DNA koodi ja sen selvittäminen Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Kuinka solut kehittyivät? Kolmenlaisia soluja
Kattoläpiviennit KATTOLÄPIVIENTISARJA VILPE. Tuote LVI-numero Pikakoodi SOLAR TIILI MUSTA TM85 SOLAR TIILI RUSKEA AD58
Kattoläpiviennit Tuote LVI-numero Pikakoodi 5289200 WF99 SOLAR TIILI MUSTA 75602 SOLAR TIILI RUSKEA 75604 SOLAR TIILI HARMAA 75607 SOLAR TIILI TIILENPUN. 75609 SOLAR PELTIMUSTA 75612 SOLAR CLASSIC MUSTA
2. Verkkosilikaattiryhmän mineraalit ja niiden kidekemiallinen rakenne.
MINERALOGIAN PERUSKURSSI (771102) 25.9.2009 a) Kiisu c) Parametrisuhde d) Ametisti e) Yhdistetty kidemuoto f) Kaksosviirukkeisuus 2. Verkkosilikaattiryhmän mineraalit ja niiden kidekemiallinen rakenne.
Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma
Genomin ilmentyminen 17.1.2013 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Genomin ilmentyminen transkription aloitus RNA:n synteesi ja muokkaus DNA:n ja RNA:n välisiä eroja
Mutaatio. PopGen Original slides by Outi Savolainen
Mutaatio PopGen 2011 17.11.2011 Original slides by Outi Savolainen Mutaatio 1. Satunnainen: spontaani ja indusoitu mutaatio 2. Mutaation luonne: erilaisia malleja 3. Mutaatiotaajuuden estimointi 4. Mutaatio
Siirtymä maisteriohjelmiin tekniikan korkeakoulujen välillä Transfer to MSc programmes between engineering schools
Siirtymä maisteriohjelmiin tekniikan korkeakoulujen välillä Transfer to MSc programmes between engineering schools Akateemisten asioiden komitea Academic Affairs Committee 11 October 2016 Eija Zitting
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman Lasaretti 29.03.2017 Helsingin, Turun ja Kuopion yliopistoissa voi opiskella elintarvikealaa Elintarvikehygienia:
111111111 1111 11111! 11 0 1111(111 11101113111111 1 11 11111111111111111
111111111 1111 11111! 11 0 1111(111 11101113111111 1 11 11111111111111111 (12) PATENTTIJULKAISU PATENTSKRIFT (10) FI B (45) Patentti myönnetty - Patent beviljats 15.07.1999 SUOMI-FINLAND (FI) (51) Kv.lk.6
Osavuosikatsaus Q JUKKA RINNEVAARA Toimitusjohtaja
Osavuosikatsaus Q3 2008 JUKKA RINNEVAARA Toimitusjohtaja Disclaimer This presentation is confidential and is intended solely for the use of the recipients of the presentation in connection with their consideration
Tomato SlDREB gene restricts leaf expansion and internode elongation by down-regulating key
Title: Tomato SlDREB gene restricts leaf expansion and internode elongation by down-regulating key genes for gibberellin biosynthesis Authors: Jinhua Li 1, Wei Sima 1, Bo Ouyang 1, Taotao Wang 1, Khurram
Supplementary Information
Supplementary Information Quantifying Absolute Addressability in DNA origami with Molecular Resolution Maximilian T. Strauss, Florian Schueder, Daniel Haas, Philipp C. Nickels, and Ralf Jungmann Supplementary
Hyväksytyt tehoaineet, valmisteille haettava lupaa
Hyväksytyt tehoaineet, valmisteille haettava lupaa 2015-2017 Biosidin suomenkielinen nimi Biosidin englanninkielinen nimi EY-numero CAS-numero Valmisteryhmä Hyv. Dir. / Asetus haettava viimeistään Hyväksymisen
Searching (Sub-)Strings. Ulf Leser
Searching (Sub-)Strings Ulf Leser This Lecture Exact substring search Naïve Boyer-Moore Searching with profiles Sequence profiles Ungapped approximate search Statistical evaluation of search results Ulf
Infrastruktuurin asemoituminen kansalliseen ja kansainväliseen kenttään Outi Ala-Honkola Tiedeasiantuntija
Infrastruktuurin asemoituminen kansalliseen ja kansainväliseen kenttään Outi Ala-Honkola Tiedeasiantuntija 1 Asemoitumisen kuvaus Hakemukset parantuneet viime vuodesta, mutta paneeli toivoi edelleen asemoitumisen
ARKISTOLUETTELO VANTAAN KOTISEUTUARKISTO MYYRMÄEN URHEILUTALOSÄÄTIÖ. 1 Hallituksen pöytäkirjat 1971-1976 4.2.1971-10.2.1976.
Sivu 1(21) Ca Säätiön hallituksen pöytäkirjat 1971 1976 4.2.1971-10.2.1976 1 Hallituksen pöytäkirjat 1971-1976 4.2.1971-10.2.1976 Sivu 2(21) Cb Säätiön isännistön pöytäkirjat 1970 1976 1 Isännistön pöytäkirjat
Toimiva myynnin ja tukitoimintojen vuoropuhelu asiakkaan parhaaksi
Toimiva myynnin ja tukitoimintojen vuoropuhelu asiakkaan parhaaksi Insert picture in this frame Insert picture in this frame Liisa Pöllänen 7.6.2011 Securitas Suomessa Perustettu vuonna 1959 (STV, Suomen
Trans_Courier_ _V4_01_07_#SF_FIN_FI_bp 19/05/ :31 TRANSIT COURIER 2 Trans_Courier_ _V4_BRO.indd FC2 04/05/ :27:07
TRANSIT COURIER 3 2 3 4 5 6 7 8 9 10 **Extended length available for vans, not the Commercial Kombi. 11 12 13 14 15 16 17 18 19 4 3 1 7 2 8 5 6 20 21 22 23 24 25 G H K O N L C J I M F E D A B 27 28 29
3 *ä;r ä:e 5ä ä{ :i. c oo) S g+;!qg *r; Er ; l[$ E ;;iä F:ä ä :E ä: a bo. =. * gäf$iery g! Eä. a is äg*!=."fl: ä; E!, \ ins:" qgg ;._ EE üg.
t AJ 1., t4 t4 \J : h J \) (.) \ ( J r ) tḡr (u (1) m * t *h& r( t{ L.C g :LA( g9; p ö m. gr iop ö O t : U 0J (U.p JJ! ä; >
AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA
T022/A19/2018 Liite 1 / Appendix 1 Sivu / Page 1(5) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA VALIO LTD, R&D, CHEMISTRY AND MICROBIOLOGY Tunnus
Hollolan Hinnasto: NSM Kartio Kartio 23. Kartio
YKSIVAIHEISET HARJATTOMAT GENERAATTORIT - 2 NAPAISET - 000 RPM - 0Hz ES0 A EA ES0 B EB ES0 D ED ES0 E EE ES0 F EF, 2,2 92,- 2,- 29,- IM B B/B 2 0 J609a 9 ----2A ----2A ----2A ----2A -#-2A 22, 2,/ -#-26
DNA > RNA > Proteiinit
Genetiikan perusteiden luentojen ensimmäisessä osassa tarkasteltiin transmissiogenetiikkaa eli sitä, kuinka geenit siirtyvät sukupolvesta toiseen Toisessa osassa ryhdymme tarkastelemaan sitä, mitä geenit
Käytännön esimerkkejä osaamiskartoituksista. Jani Munne Projektipäällikkö
Käytännön esimerkkejä osaamiskartoituksista Jani Munne Projektipäällikkö Mistä kaikki alkoi Haasteina työntekijöillä olevan osaamisen selvittäminen, jotta voitaisiin Jakaa osaamista organisaation sisällä
NON-CODING RNA (ncrna)
NON-CODING RNA (ncrna) 1. Yleistä NcRNA eli non-coding RNA tarkoittaa kaikkia proteiinia koodaamattomia rnamolekyylejä. Näistä yleisimmin tunnetut ovat ribosomaalinen RNA (rrna) sekä siirtäjä-rna (trna),
A DIAARIT JA PÄIVÄKIRJAT. Saapuneiden ja lähteneiden kirjeiden postikirja. Bb Yhtiöjärjestys, osake- ja osakasluettelot
ARKISTOLUETTELO Kunta/Kuntainliitto Pääsarjan nimike Valkeakosken kaupunki A-E, G-H, K, O, R-S, U Arkistonmuodostaja/viranomainen Valkeakosken kaupunginteatteri Hyllyn numero 874-875, 877-878, 880, 883-885,
Elintarvikkeiden mikrobiologisia ohjausarvoja viimeisenä käyttöpäivänä. Suositus 4.3.2015
Elintarvikkeiden mikrobiologisia ohjausarvoja viimeisenä käyttöpäivänä Suositus 4.3.2015 Suositus 2 (6) JOHDANTO Mikrobikriteeriasetuksessa (EY 2073/2005 muutoksineen) ja Eviran ohjeessa 10501 määritellään
The Fastest Kid on Albert Street
The Fastest Kid on Albert Street by Melanie Rook Welling 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 I m the fastest kid on Albert Street! yelled Matt. Oh, really? said Kelsey. You think so? It was Saturday afternoon.
Nukleiinihapot! Juha Klefström, Biolääketieteen laitos/biokemia ja genomibiologian tutkimusohjelma Helsingin yliopisto.
Nukleiinihapot! Juha Klefström, Biolääketieteen laitos/biokemia ja genomibiologian tutkimusohjelma Helsingin yliopisto Juha.Klefstrom@helsinki.fi Nukleiinihapot! kertausta matkan varrella, vähemmän kuitenkin
Frequencies. Frequency Table
GET FILE='C:\Documents and Settings\haukkala\My Documents\kvanti\kvanti_harjo'+ '_label.sav'. DATASET NAME DataSet WINDOW=FRONT. FREQUENCIES VARIABLES=koulv paino /ORDER= ANALYSIS. Frequencies [DataSet]
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks. David R. Kelley
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks David R. Kelley DNA codes for complex life. How? Kundaje et al. Integrative analysis of 111 reference
Kiekun arkkitehtuuri ja tekniikka. Ghita von Gerdten projektipäällikkö
Kiekun arkkitehtuuri ja tekniikka Ghita von Gerdten projektipäällikkö Järjestelmäarkkitehtuurin fyysinen viitearkkitehtuuri Käyttöliittymä, (työasema) GUI Internet Explorer Adobe Reader Esitystapa Portaali
ISSN DOI: /epp.12018
Bulletin OEPP/EPPO Bulletin (2013) 43 (1), 7 20 ISSN 0250-8052. DOI: 10.1111/epp.12018 European and Mediterranean Plant Protection Organization PM 7/110 (1) Organisation Europeenne et Mediterraneenne pour
Telecommunication Software
Telecommunication Software Final exam 21.11.2006 COMPUTER ENGINEERING LABORATORY 521265A Vastaukset englanniksi tai suomeksi. / Answers in English or in Finnish. 1. (a) Määrittele sovellusviesti, PersonnelRecord,
panna put ( panna 2000/06/19 PS panna ( panna panna panna Suomen kielen perussanakirja (1997 2, PS) panna panna panna panna (1) pan-na put-1inf
panna put ( ) 2000/06/19 1 panna panna panna panna ( ) panna Suomen kielen perussanakirja (1997 2, PS) ( panna put ) (1) pan-na put-1inf kirja-t book-pl.acc laukku-un bag-ill (PS, 1.) panna panna (3inf)
CultiPack 3001 / 4001
Tume-Agri Oy 98707704 B 10/2008/PK CultiPack 3001 / 4001 Varaosaluettelo Spare part list Oikeudet rakenteen muutoksiin pidetään The manufacturer reserves the right for changes without prior notice RUNKO
Proteiinin merkitys urheilijoiden ravitsemuksessa. Jan Verho 5.11.2014
Proteiinin merkitys urheilijoiden ravitsemuksessa Jan Verho 5.11.2014 Urheilija tarvitsee proteiinia 1. Proteiinisynteesin raaka-aineeksi Päivittäinen tarve kasvaa 2. Stimuloimaan lihasproteiinisynteesiä
Typpioksiduuli eilen tänään. 24.5.2007 jouni.ahonen@hus.fi HYKS Kätilöopiston sairaala
Typpioksiduuli eilen tänään 24.5.2007 jouni.ahonen@hus.fi HYKS Kätilöopiston sairaala Inhalaatioanesteetit synnytyskivun hoidossa eetteri 1847 (James Simpson, Skotlanti) kloroformi 1853 (John Snow, Englanti)
Characterization of clay using x-ray and neutron scattering at the University of Helsinki and ILL
Characterization of clay using x-ray and neutron scattering at the University of Helsinki and ILL Ville Liljeström, Micha Matusewicz, Kari Pirkkalainen, Jussi-Petteri Suuronen and Ritva Serimaa 13.3.2012
Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriotoiminnasta Standardisointiasiat
Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriotoiminnasta Standardisointiasiat Tuula Pirhonen Tutkimus- ja laboratorio-osasto Evira Standardisointi- ja menetelmäorganisaatiot ISO - kansainvälinen CEN - eurooppalainen
SU01\1JEL\I MAINJ[ OY
KAIRAREIÄN NO 44 SIVUSUUNAMIAUS HYVELÄSSÄ MARRASKUUSSA 98 SU0\JEL\I MAINJ[ OY FlNNEXPLORAlON & ESPOO 27..98 HANNU SILVENNOINEN,. Dl 2 KAIRAREIÄN NO 44 SIVUSUUNAMIAUS HYVELÄSSÄ MARRASKUUSSA 98. s I s Ä
REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio
Jyväskylän ympäristölaboratorio Eeronkatu 10 40720 JYVÄSKYLÄ Puh. 014 626650 EVIRAN REKISTERISSÄ OLEVAT MENETELMÄT asumisterveystutkimukset Mikrobit (homeet, hiivat, bakteerit ja aktinobakteerit) akkr
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia 12.12.2017 Epigenetic inheritance: A heritable alteration in a cell s or organism s phenotype that does
Hyväksytyt tehoaineet, valmisteille haettava lupaa Taulukko päivitetty
Hyväksytyt tehoaineet, valmisteille haettava lupaa 2016-2018 Taulukko päivitetty 27.3.2017 Biosidin suomenkielinen nimi Biosidin englanninkielinen nimi EY-numero CAS-numero Valmisteryhmä Hyv. Dir. / Asetus
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31)
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31) Juha Kahkonen Click here if your download doesn"t start automatically On instrument costs
Teollisia mineraalisia sivuvirtoja hyödyntävät vesien puhdistusratkaisut. Janne Pesonen Kestävän kemian tutkimusyksikkö Oulun yliopisto
Teollisia mineraalisia sivuvirtoja hyödyntävät vesien puhdistusratkaisut Janne Pesonen Kestävän kemian tutkimusyksikkö Kestävän kemian tutkimusyksikkö Ulla Lassi Professori Yksikön johtaja Paavo Perämäki