Valmiustaitoja biokemisteille

Koko: px

Aloita esitys sivulta:

Download "Valmiustaitoja biokemisteille"

Petri Auvinen
7 vuotta sitten
Katselukertoja:

1 Valmiustaitoja biokemisteille - Power Point -ohjelman käyttö - seminaariesitelmän laatiminen ja esittäminen Tuomo Glumoff

2 1. Power Point -ohjelman käyttö

3 - teksti - kuvat - tausta - valmiit pohjat * löytyy myös googlaamalla - fontti - piirtely - sommittelu - efektit kirjasinkoko 18 näkyykö tämä myös salin perälle? kirjasinkoko 20 näkyykö tämä myös salin perälle? kirjasinkoko 22 näkyykö tämä myös salin perälle? kirjasinkoko 24 näkyykö tämä myös salin perälle?

4 Käytä kuvia enemmän kuin tekstiä!? Vai sittenkin tekstiä enemmän kuin kuvia? usein kiteytyminen on liian nopeaa ja saadaan liian paljon liian pieniä ja ohuita kiteitä olosuhteita muuttamalla voidaan saada pienempi määrä isompia kiteitä

5 otsikko alaotsikko

7 Viimeisimmät tulokset: puhdistus: 79 kda kinetiikka: 99 kda k cat / K m (M -1 s -1 ) trans-2- decenoyl- CoA trans-2- hexadeceno yl-coa Hydratase ~1 x 10 7 ~2 x 10 5 Hydratase- SCP-2L Hydratase + SCP-2L ~1 x 10 7 ~2 x 10 5 ~1 x 10 7 ~2 x 10 5 rakenne: ihmisen MFE-2 hiivan MFE-2

8 - puhdistettu kokopitkä MFE-2 soveltuu kiteytykseen ja muihin kokeisiin 79 kda 99 kda - vähän asiaa - kuulija pysyy kärryillä - ei erikoistehosteita ihmisen MFE-2 hiivan MFE-2

9 - puhdistettu kokopitkä MFE-2 soveltuu kiteytykseen ja muihin kokeisiin 79 kda 99 kda ihmisen MFE-2 hiivan MFE-2

10 Short background on glycosyltransferases - mostly type II membrane proteins - ca. 250 known - 94 families based on DNA sequence - no structure of a full-length protein C - a lot of structures of the catalytic domain * 40 families * 11 families with a human enzyme * 3 human enzymes of terminal sugar activity galactosyltransferase fucosyltransferase sialyltransferase etc. N Tuomo Glumoff Journal club

12 Short background on glycosyltransferases - mostly type II membrane proteins - ca. 250 known - 94 families based on DNA sequence - no structure of a full-length protein C - a lot of structures of the catalytic domain * 40 families * 11 families with a human enzyme * 3 human enzymes of terminal sugar activity galactosyltransferase fucosyltransferase sialyltransferase etc. N Tuomo Glumoff Journal club

13 Human ST6Gal1 (4js1) Rat ST6Gal1 (4mps) expression HEK cells + deglycosylation HEK cells + deglycosylation molecular S. scrofa β-galactoside α-2,3- pig ST3Gal1 (seq. id. 20%) replacement ST (seq. id. 30%) unsuccessful unsuccessful structure SAD; iodide derivative SAD; Se-Met determination crystal details P6 1 ; 2.09 to 2.30 Å C2; 2.4 Å ligands CMP & acceptor glycan CMP-sialic acid & acceptor in crystal glycan docked & MD sim. other putative active site residue mutagenesis scanning Tuomo Glumoff Journal club

14 Human ST6Gal1 (4js1) Rat ST6Gal1 (4mps) expression HEK cells + deglycosylation HEK cells + deglycosylation molecular S. scrofa β-galactoside α-2,3- pig ST3Gal1 (seq. id. 20%) replacement ST (seq. id. 30%) unsuccessful unsuccessful structure SAD; iodide derivative SAD; Se-Met determination crystal details P6 1 ; 2.09 to 2.30 Å C2; 2.4 Å ligands CMP & acceptor glycan CMP-sialic acid & acceptor in crystal glycan docked & MD sim. other putative active site residue mutagenesis scanning Tuomo Glumoff Journal club

15 Kiteytysrobotti Kiteytys

16 Röntgendiffraktiomittaukset kide

17 2. Seminaariesitelmän pitäminen - miksi seminaareja? - kuka esittää, keille esitetään? - miten esitetään? Huom! Tässä esityksessä jätetty tarkoituksella huomioitavia asioita pois, koska ajatuksena on osoittaa perusjuttuja, silmällä pitäen TYYPILLISTÄ kurssien yhteydessä pidettävää LYHYTTÄ seminaaria (n min). Suullisen esittämisen asioihin palataan uudelleen 3. vuonna kandin tutkielman yhteydessä.

18 huomioitavia asioita (mm.) - kohdeyleisö / tarkoitus - (helposti) ymmärrettävä - looginen ("punainen lanka") - houkutella kuulijat mukaan, ei päästää putoamaan kärryiltä Yritä välttää: Perusasiat puhujalle: - tunne asiasi - tunne yleisösi - millainen tila? - materiaalin valmistaminen - havaintovälineet - mmm, ööö, eee, niinku, totanoin, täytyy sanoa että, jne. (näiden sijaan hetken tauko) - kynän, karttakepin tms. räpläämistä - tiheään toistuvia hokemia / maneereja - liikaa asiaa esitelmässä ja kussakin kuvassa - vähättelyä, valittelua, selittelyä - selin kuulijoihin (tarviiko tätä edes sanoa )

19 - äänenkäyttö - ei liikaa asiaa / sivu - vain n. 10% esitelmän viestinnästä on puhujan sanoja, loput n. 90% äänen käyttöä ja muuta oheisviestintää (ilmeet, eleet, liikkuminen, osoittaminen, jne.) eli sitä, miten asia esitettiin Huom! Luento on jonkin verran erilainen tilanne, kuin esitelmä/seminaari

20 asioiden sanominen selvästi ja yksinkertaisesti ei tarkoita, että yleisö pitää puhujaa yksinkertaisena, vaan muistaa puhujan myöhemmin siitä, että puheesta sentään ymmärsi jotain!

21 Muita vinkkejä: - aloitus tärkeä: esittely, puhuttelu, kysymys, väittämä, kuva- tai äänitehoste, jne. - usein sisällysluettelo on paikallaan - lopetuksena esim. yhteenveto, tulevaisuuden näkymä, kehotus, kuva, jne.

22 kevennys

23 myy asiasi mieleenpainuvasti huumori

24 autenttisen materiaalin käyttö alkunopeuden mittaus