State of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology
|
|
|
- Aarno Hämäläinen
- 5 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 Functional Genomics Research Stream State of the Union... Research Meeting: February 16, 2010 Functional Genomics & Research Report III Concepts Genomics Molecular Biology Computational Biology
2 Genome Genome Simplest Definition: Complete set of all genes contained on a single (haploid) set of chromosomes. Secondary Definition: The canonical DNA sequence across contained on a single (haploid) set of chromosomes. Genome Viewer (SGD) SGD = Saccharomyces Genome Database Genome Viewer (SGD) SGD = Saccharomyces Genome Database Image: SGD Genome Browser Image: SGD Genome Browser > Chr 3 from to CTATGTTTTGCCTCAGAGTAGCACAAAGCATGAGAAAGAGGGGTTCCTTCGAAAGAAACA AAAAGACGAGCCCATTTGGGTTTCCCCTAGCAAAATTGACTTTGCTGATCTAAGTAGGAG AACTAAAGCATTGACGCCAGAGCGTAATACTGTTCCTTTGAAAAACAACGACAGTAGAAA ATACAAATATACTGGAGAGGGATCTATCGGTAATATGACAAATATGCTGTTAACTAAAGA TGCTTCGTACGCGTACTTAAAAGATTTTGTTGCGTTGAGTGACGATGAAGATGAAGATGG GAAACAGAACTGCGCTGTTGGTGGCCCAGAGAAACTGAAATTTTATTGAGTGTTTTATTG ATTTTTTTTTTCTTTTTAATTTAATGCAATGTATACATTTACATAAAATATGGACAAATA AGAAAAAGGGGGAAAAACCTCCCACTTAAGTAAAACTGAATATATTAGATACCTTTACCT ACTATCAAAGGTGAATGCTTTTGGATCAATAGGGGTTCCATCGGGGGCAATACCATTTTG GCCGAACTTTCTTTCCATATATAATAGTCTAGCCTTATCGAAATCTACATTATCGTTTTC CATAATTTGTTTAATCTCATTCTTGGAGACATCATCCAAACCACCTCTTACGTCGTTGCT ATTCTCCGAGATAATATCGAAATTCCTGGAATGGAGACCGTTTTCTAGGTCATCAGCAAA GGAATCATTTAAACGTATATGTCTATTAAAACGTAATTGTATTCTTGAACGCAGTGCACG AAATTTGTCGGCTATTACAGCTGTTAGTAATTTGATACGGTTTGCACTTTGCATTTTCAA ATGCTTAAATATACATACCAACTTTGGTTTTCCGGTGTGCCATAAGAAGGCATAAAGACA ATAGCACAACCCAGAGGAGCAATTTGAGATAGAACAAACTCTTCATACTCGTATTTGCAA TTTTTGGAAATTAATTGTGTAGCTTTTCTTCTCTTAATTGGTGGCAGTTTTTATATATTC AGTTTAGAATACCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTCGCTTTTCGCATCTCATCGCTGGA AGTGGTGCTCTTTTACAGGGATTAAATAAGGTTATTCTTTTTGGTCAAAATGATAAATAT AACTATTAAAGTTATTTATAACCCGCCCGCTTCCTTATTATTTATACGTTATCATAAAGT ACACAGGTCATGGTTCGGTTGGTGCTTAGGAATTAATCACGTCTAGCATAAGAGATCTGT AAACTACAACCACCATAATTATAATTATTTAATTTTTGAATACAAAAATCTGCATCTACT AAATTTTCATATTCTACAACAGCAACACCAGTTGGTTGACCATTTTCCTGTGGTTTCAAT TCCGCGTTATTGATTTTGCCGATAGGCCCAAACAAGTCGAATAAATCGCTTCTTGCTGTT GAGAATGGTAAATTACTACAATAAATGAAACAGTTTCTATCCCCTCCTGGATTGACACCT TCAGTAAATTTTGCTGCAGTTTC...
3 Genomics A Definition: The study of many possible DNA sequence properties in a specific genome or across related genomes. Evolutionary relationship of conserved regions DNA sequence (coding sequence) DNA sequence motifs (regulation) DNA nucleotide frequencies... many more... Functional Genomics? Image: UCSC Genome Browser Functional genomics is a field of molecular biology that attempts to make use of the vast wealth of data produced by genomic projects (such as genome sequencing projects) to describe gene (and protein) functions and interactions. Unlike genomics and proteomics, functional genomics focuses on the dynamic aspects such as gene, translation, and protein-protein interactions, as opposed to the static aspects of the genomic information such as DNA sequence or structures. Functional genomics attempts to answer questions about the function of DNA at the levels of genes, RNA transcripts, and protein products. A key characteristic of functional genomics studies is their genome-wide approach to these questions, generally involving high-throughput methods rather than a more traditional gene-by-gene approach. Wikipedia Transcription Factors Protein that binds specific DNA sequences controlling the activation or repression of. cis-regulatory sequence start stop
4 Transcription Factors Protein that binds specific DNA sequences controlling the activation or repression of. Transcription Factors Protein that binds specific DNA sequences controlling the activation or repression of. TF start stop TF start stop cis-regulatory sequence cis-regulatory sequence mrna produced AAAAAAAAAAAA One Gene Whole Genome (Saccharomyces cerevisiae has 16 chromosomes + mitochondrial DNA) K TF start stop cis-regulatory sequence mrna produced AAAAAAAAAAAA TF start stop cis-regulatory sequence AAAAAAAAAAAA mrna produced
5 Whole Genome (Saccharomyces cerevisiae has 16 chromosomes + mitochondrial DNA) ,000 Whole Genome (Saccharomyces cerevisiae has 16 chromosomes + mitochondrial DNA) ,000 I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII XIII XIV XV XVI M I II III IV V VI VII VIII IX X XI XII XIII XIV XV XVI M Simon et al. Serial regulation of al regulators in the yeast cell cycle. Cell (2001) vol. 106 (6) pp cellular nucleus: many regulatory processes
6 Future Lecture... Next-generation highthroughput sequencing methods and technologies by ABI SOLiD. High resolution measurement of gene expression and protein to DNA interactions. Bioinformatics aka Computational Biology Many Disciplines Encompassed: mathematics, statistics algorithmic, technique data mining, machine learning databases, information storage & retrieval solving biological problems Images: Dell, IBM Corporations High Resolution Imagery Data Modeling (networks, traversals) Data Analysis & Visualization Low Resolution High Resolution
7 Recommended Reading Yeast Background Spellman et al. Comprehensive identification of cell cycle-regulated genes of the yeast Saccharomyces cerevisiae by microarray hybridization. Mol. Biol. Cell (1998) vol. 9 (12) pp Simon et al. Serial regulation of al regulators in the yeast cell cycle. Cell (2001) vol. 106 (6) pp Gasch et al. The genomics of yeast responses to environmental stress and starvation. Funct Integr Genomics (2002) vol. 2 (4-5) pp Research Progress Report III Harbison et al. Transcriptional regulatory code of a eukaryotic genome. Nature (2004) vol. 431 (7004) pp Hu et al. Genetic reconstruction of a functional al regulatory network. Nat. Genet. (2007) pp. RPR III Corrections constantly updated post on Results Central
8 III.A Reagent Production III.B Buffers & ph III.C Controlled Cellular Growth & Sample III.D Nucleic Acid Preparation... future lecture...
9 III.E Nucleic Acid Quantity & Quality Evaluation... future lecture... III.F Gel Electrophoresis... future lecture... III.G Polymerase Chain Reaction (PCR) III.H Results Central Progress Reports... future lecture...
10 Must Read! (daily)
Functional Genomics & Proteomics
Functional Genomics & Proteomics Genome Sequences TCACAATTTAGACATCTAGTCTTCCACTTAAGCATATTTAGATTGTTTCCAGTTTTCAGCTTTTATGACTAAATCTTCTAAAATTGTTTTTCCCTAAATGTATATTTTAATTTGTCTCAGGAGTAGAATTTCTGAGTCATAAAGCGGT CATATGTATAAATTTTAGGTGCCTCATAGCTCTTCAAATAGTCATCCCATTTTATACATCCAGGCAATATATGAGAGTTCTTGGTGCTCCACATCTTAGCTAGGATTTGATGTCAACCAGTCTCTTTAATTTAGATATTCTAGTACAT
CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology. Xiaohui S. Xie University of California, Irvine
CS284A Representations & Algorithms for Molecular Biology Xiaohui S. Xie University of California, Irvine Today s Goals Course information Challenges in computational biology Introduction to molecular
Inferring Trichoderma reesei gene regulatory network
Inferring Trichoderma reesei gene regulatory network Oskari Vinko 29.04.2013 Ohjaaja: Merja Oja Valvoja: Harri Ehtamo Työn saa tallentaa ja julkistaa Aalto-yliopiston avoimilla verkkosivuilla. Muilta osin
Master's Programme in Life Science Technologies (LifeTech) Prof. Juho Rousu Director of the Life Science Technologies programme 3.1.
Master's Programme in Life Science Technologies (LifeTech) Prof. Juho Rousu Director of the Life Science Technologies programme 3.1.2017 Life Science Technologies Where Life Sciences meet with Technology
arxiv: v1 [stat.ml] 27 Feb 2011
![arxiv: v1 [stat.ml] 27 Feb 2011](/thumbs/98/136670716.jpg "arxiv: v1 [stat.ml] 27 Feb 2011")
TKK Dissertations in Information and Computer Science Espoo 2010 TKK-ICS-D19 arxiv:1102.5509v1 [stat.ml] 27 Feb 2011 PROBABILISTIC ANALYSIS OF THE HUMAN TRANSCRIPTOME WITH SIDE INFORMATION Leo Lahti Dissertation
Genome 373: Genomic Informatics. Professors Elhanan Borenstein and Jay Shendure
Genome 373: Genomic Informatics Professors Elhanan Borenstein and Jay Shendure Genome 373 This course is intended to introduce students to the breadth of problems and methods in computational analysis
Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii
Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of
Viral DNA as a model for coil to globule transition
Viral DNA as a model for coil to globule transition Marina Rossi Lab. of complex fluids and molecular biophysics LITA (Segrate) UNIVERSITA DEGLI STUDI DI MILANO - PhD Workshop October 14 th, 2013 Temperature
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks. David R. Kelley
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks David R. Kelley DNA codes for complex life. How? Kundaje et al. Integrative analysis of 111 reference
Bioinformatics in Laboratory of Computer and Information Science
HELSINKI UNIVERSITY OF TECHNOLOGY LABORATORY OF COMPUTER AND INFORMATION SCIENCE Bioinformatics in Laboratory of Computer and Information Science Samuel Kaski Research Two centers of excellence of the
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Biologian DNA koodi ja sen selvittäminen Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Kuinka solut kehittyivät? Kolmenlaisia soluja
Bioinformatiikan maisteriohjelma
Bioinformatiikan maisteriohjelma Avajaiset 5.9.2006 Esa Pitkänen Ohjelma Esittelykierros Juhon ja Samin alkusanat Lukuvuoden 06-07 opetus ja käytännön asioita MBI-webbisivut Tarjoilua! Opiskelijoiden ohjaus
Eukaryotic Comparative Genomics
Eukaryotic Comparative Genomics Detecting Conserved Sequences Charles Darwin Motoo Kimura Evolution of Neutral DNA A A T C TA AT T G CT G T GA T T C A GA G T A G CA G T GA AT A GT C T T T GA T GT T G T
NBE-E4510 Special Assignment in Biophysics and Biomedical Engineering AND NBE-E4500 Special Assignment in Human. NBE-E4225 Cognitive Neuroscience
Neurotieteen ja lääketieteellisen tekniikan laitos Department of and Biomedical OPETUSOHJELMASTA POISTUNEET KURSSIT (Tfy-99, Becs-114, BECS, NBE)/päivitetty 16.5.2017 COURSES REMOVED FROM THE STUDY PROGRAMME
Manolis Kellis Piotr Indyk
6.095 / 6.895 Computational Biology: Genomes, Networks, Evolution Rapid database search Courtsey of CCRNP, The National Cancer Institute. Manolis Kellis Piotr Indyk Protein interaction network Courtesy
FETAL FIBROBLASTS, PASSAGE 10
Double-stranded methylation patterns of a 104-bp L1 promoter in DNAs from fetal fibroblast passages 10, 14, 17, and 22 using barcoded hairpinbisulfite PCR. Fifteen L1 sequences were analyzed for passages
Supporting Information for
Supporting Information for Analysis of Sogatella furcifera proteome that interact with P10 protein of Southern rice black-streaked dwarf virus Win Than*, Faliang Qin*, Wenwen Liu, Xifeng Wang ** State
tgg agg Supplementary Figure S1.
ttaggatattcggtgaggtgatatgtctctgtttggaaatgtctccgccattaactcaag tggaaagtgtatagtaatgaatctttcaagcacacagatcacttcaaaagactgtttcaa catcacctcaggacaaaaagatgtactctcatttggatgctgtgatgccatgggtcacag attgcaattcccaagtgcccgttcttttacaccaaaatcaaagaagaatatctccccttt
Predicting evolutionarily conserved regions (ECRs) in the Xenopus tropicalis genome using a MultiPipMaker-based bioinformatic strategy
Predicting evolutionarily conserved regions (ECRs) in the Xenopus tropicalis genome using a MultiPipMaker-based bioinformatic strategy OVERVIEW- Method updated and written by Sarah Louie (6/19/08) Initially
MALE ADULT FIBROBLAST LINE (82-6hTERT)
Double-stranded methylation patterns of a 104-bp L1 promoter in DNAs from male and female fibroblasts, male leukocytes and female lymphoblastoid cells using hairpin-bisulfite PCR. Fifteen L1 sequences
B3206 Microbial Genetics
Prof. Fahd M. Nasr Lebanese university Faculty of sciences I Department of Natural Sciences fnasr@ul.edu.lb B3206 Microbial Genetics 1 Eukaryotic M. G. The yeast Saccharomyces cerevisiae as a genetic model
Computational personal genomics: selection, regulation, epigenomics, disease
Computational personal genomics: selection, regulation, epigenomics, disease Manolis Kellis Broad Institute of MIT and Harvard MIT Computer Science & Artificial Intelligence Laboratory TATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCATTACCACCATATA
Bioinformatics. Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding. Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute
Bioinformatics Sequence Analysis: Part III. Pattern Searching and Gene Finding Fran Lewitter, Ph.D. Head, Biocomputing Whitehead Institute Course Syllabus Jan 7 Jan 14 Jan 21 Jan 28 Feb 4 Feb 11 Feb 18
Bioinformatiikan maisteriohjelman infotilaisuus Exactum D122
Bioinformatiikan maisteriohjelman infotilaisuus 15.11.2007 Exactum D122 Bio- ja lääketieteiden opiskelu MBImaisteriohjelmassa Outi Monni, Dos, FT Biolääketieteen laitos 15.11.2007 Bioinformatiikan maisteriohjelma
LIFE2000 rahoitettavat hankkeet
LIFE2000 rahoitettavat hankkeet Life 2000 tutkimusohjelmaan on valittu kaikkiaan 37 tutkimushanketta: 13 yksittäishanketta ja 24 konsortiota. Tekes tekee rahoituspäätöksensä sille esitetyistä projektiehdotuksista
Supporting information
Supporting information Figure S1. Carotenoid biosynthesis pathway in papaya fruit which is adopted from Blas et al. (2010) (reference 4) and Nisar et al. (2015) (reference 5). Carotenoids are synthesized
Constructive Alignment in Specialisation Studies in Industrial Pharmacy in Finland
Constructive Alignment in Specialisation Studies in Industrial Pharmacy in Finland Anne Mari Juppo, Nina Katajavuori University of Helsinki Faculty of Pharmacy 23.7.2012 1 Background Pedagogic research
Plasmid Name: pmm290. Aliases: none known. Length: bp. Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson. Last updated: 17 August 2009
Plasmid Name: pmm290 Aliases: none known Length: 11707 bp Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson Last updated: 17 August 2009 Description and application: This is a mammalian expression vector for
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman Lasaretti 29.03.2017 Helsingin, Turun ja Kuopion yliopistoissa voi opiskella elintarvikealaa Elintarvikehygienia:
HITSAUKSEN TUOTTAVUUSRATKAISUT
Kemppi ARC YOU GET WHAT YOU MEASURE OR BE CAREFUL WHAT YOU WISH FOR HITSAUKSEN TUOTTAVUUSRATKAISUT Puolitetaan hitsauskustannukset seminaari 9.4.2008 Mikko Veikkolainen, Ratkaisuliiketoimintapäällikkö
WP3 Decision Support Technologies
WP3 Decision Support Technologies 1 WP3 Decision Support Technologies WP Leader: Jarmo Laitinen Proposed budget: 185 000, VTT 100 000, TUT 85 000. WP3 focuses in utilizing decision support technologies
Page 1 of 9. Ryhmä/group: L = luento, lecture H = harjoitus, exercises A, ATK = atk-harjoitukset, computer exercises
Tietotekniikan tarjoama opetus syksyllä 2016 23.5.2016 CS course schedule in autumn 2016 Sari Salmisuo I periodi / period I 12.9. 21.10.2016 viikot/weeks 37-42 II periodi / period II 31.10. 9.12.2016 viikot/weeks
11/17/11. Gene Regulation. Gene Regulation. Gene Regulation. Finding Regulatory Motifs in DNA Sequences. Regulatory Proteins
Gene Regulation Finding Regulatory Motifs in DNA Sequences An experiment shows that when X is knocked out, 20 other s are not expressed How can one have such drastic effects? Regulatory Proteins Gene X
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Mitä uudet DNA sekvensointimenetelmät voivat paljastaa luonnonjärjestelmästä? Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Petri
Toimintamallit happamuuden ennakoimiseksi ja riskien hallitsemiseksi turvetuotantoalueilla (Sulfa II)
Toimintamallit happamuuden ennakoimiseksi ja riskien hallitsemiseksi turvetuotantoalueilla (Sulfa II) Happamuuskuormituksen ennustaminen valuma-aluetasolla Marie Korppoo ja Markus Huttunen 13.5.2019 Päämäärä
Basic Flute Technique
Herbert Lindholm Basic Flute Technique Peruskuviot huilulle op. 26 Helin & Sons, Helsinki Basic Flute Technique Foreword This book has the same goal as a teacher should have; to make himself unnecessary.
Plasmid construction PCR reactions were carried out with Pfu or Pfu turbo polymerases (Stratagene) unless otherwise stated.
Expanding the Genetic Code of Yeast for Incorporation of Diverse Unnatural Amino Acids via a Pyrrolysyl-tRNA Synthetase/tRNA Pair Susan M. Hancock 1, Rajendra Uprety 2, Alexander Deiters 2 & Jason W. Chin
ISEB/ISTQB FOUNDATION CERTIFICATE IN SOFTWARE TESTING III
KOULUTUSTIEDOTE 1(5) ISEB/ISTQB FOUNDATION CERTIFICATE IN SOFTWARE TESTING III Kuvaus ja tavoite ISEB/ISTQB Foundation Certificate in Software Testing -sertifikaattiin valmentava koulutus (2,5 pv) ja sertifikaattikoe
Strain or plasmid Description a Reference or source b. 168 trpc2 Laboratory. 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC
TABLE S1 Bacterial strains and plasmids Strain or plasmid Description a Reference or source b B. subtilis 168 trpc2 Laboratory stock 1A780 trpc2 sigb::spc BGSC BM1010 trpc2 htpx::pgs1582; Em r BM1302 trpc2
CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015
CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015 Luennot Maanantai 10.15 12.00 KE 2 Keskiviikko 13.15 15.00 KE 2 Demot (pakollinen läsnäolo) Perjantai 8.30 10.00, KE1, 25.9. ja 2.10. Osaamistavoitteet
In situ hybridization
In situ hybridization ISH Detection of DNA or RNA Single or double stranded Chromosomal or cellular nucleic acids ISH Type of a hybrid? DNA-DNA In situ renaturation of target DNA in ISH cannot be prevented
Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6.
Methods S1. Sequences relevant to the constructed strains, Related to Figures 1-6. A. Promoter Sequences Gal4 binding sites are highlighted in the color referenced in Figure 1A when possible. Site 1: red,
Collaborative & Co-Creative Design in the Semogen -projects
1 Collaborative & Co-Creative Design in the Semogen -projects Pekka Ranta Project Manager -research group, Intelligent Information Systems Laboratory 2 Semogen -project Supporting design of a machine system
CIE Division 1: Vision and Colour. MarjukkaPuolakka
CIE Division 1: Vision and Colour MarjukkaPuolakka 19.8.2009 CIE Div1 Terms of Reference: To study visual responses to light and to establish standards of response functions, models and procedures of specification
Tuberkuloosin diagnostiikka
Tuberkuloosin diagnostiikka 30. Valtakunnalliset Tartuntatautipäivät, Helsinki 13.11.2017 Jussi Eskola, dosentti (ei sidonnaisuuksia) Tuberkuloosidiagnostiikan kehittyminen 1910-luku: tuberkuliinikoe 1920-
Big datan hyödyntäminen lääkkeisiin liittyvässä viranomaistyössä Suomessa ja EU:ssa. Vesa Kiviniemi Arviointipäällikkö Fimea
Big datan hyödyntäminen lääkkeisiin liittyvässä viranomaistyössä Suomessa ja EU:ssa Vesa Kiviniemi Arviointipäällikkö Fimea 22.11.2017 Mitä on Big data? Useita määritelmiä, esimerkiksi Big data is data
Skene. Games Refueled. Muokkaa perustyyl. napsautt. @Games for Health, Kuopio. 2013 kari.korhonen@tekes.fi. www.tekes.fi/skene
Skene Muokkaa perustyyl. Games Refueled napsautt. @Games for Health, Kuopio Muokkaa alaotsikon perustyyliä napsautt. 2013 kari.korhonen@tekes.fi www.tekes.fi/skene 10.9.201 3 Muokkaa Skene boosts perustyyl.
Kurssin koodi ja nimi Ryhmä Päivä Aika Sali Viikot Henkilöt Course code and name Group Day Time Lecture Weeks Course staff
Tietotekniikan koulutusohjelman tarjoama opetus syksyllä 2015 8.6.2015 CSE course schedule in autumn 2015 Päivitetty 29.6.2015 S. Salmisuo I periodi: 7.9. 16.10.2015, viikot 37 42. Period I: 7.9. 16.10.2015,
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31)
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31) Juha Kahkonen Click here if your download doesn"t start automatically On instrument costs
Elixir of life Elixir for Mind and Body
Elixir of life Elixir for Mind and Body Session C: Horizontality of Industries and future services SHOK Summit April 20th, 2010 Katja Hatakka, PhD, Development Manager, Valio R&D Case Susan Facts about
CSC:n käyttäjätunnukset - myös opiskelijoille
CSC:n käyttäjätunnukset - myös opiskelijoille http://www.csc.fi/asiakkaaksi/korkeakoulut/kayttol upahakemukset/index_html Ohjaajan nimeksi Petri Törönen Perusteluiksi opiskelu ja luentokurssin nimi (Geneettisen
Alternative DEA Models
Mat-2.4142 Alternative DEA Models 19.9.2007 Table of Contents Banker-Charnes-Cooper Model Additive Model Example Data Home assignment BCC Model (Banker-Charnes-Cooper) production frontiers spanned by convex
MID Tour Reikäpelin SM 2017 Kilpailuformaatti. Petri Ahokas 05/2017
MID Tour Reikäpelin SM 2017 Kilpailuformaatti Petri Ahokas 05/2017 MID Reikäpelin SM 2017: kilpailuformaatti Mukaan 64 miestä, 16 naista Pelataan 4 pelaajan lohkoissa, 3x9 reiän ottelut Voitetusta ottelusta
Genomic and epigenomic signatures for interpreting complex disease
Genomic and epigenomic signatures for interpreting complex disease Manolis Kellis Broad Institute of MIT and Harvard MIT Computer Science & Artificial Intelligence Laboratory TATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCATTACCACCATATA
Tekes the Finnish Funding Agency for Technology and Innovation. Copyright Tekes
Tekes the Finnish Funding Agency for Technology and Innovation DM 607668 03-2011 Expertise and networks for innovations Tekes services Funding for innovative R&D and business Networking Finnish and global
Chapter 7. Motif finding (week 11) Chapter 8. Sequence binning (week 11)
Course organization Introduction ( Week 1) Part I: Algorithms for Sequence Analysis (Week 1-11) Chapter 1-3, Models and theories» Probability theory and Statistics (Week 2)» Algorithm complexity analysis
1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward.
START START SIT 1. SIT. The handler and dog stop with the dog sitting at heel. When the dog is sitting, the handler cues the dog to heel forward. This is a static exercise. SIT STAND 2. SIT STAND. The
Lähellä kaupungissa. Web-based learning environment relating to urban and geography studies
Lähellä kaupungissa Web-based learning environment relating to urban and geography studies Virpi Hirvensalo, Department of Geography and Geology, University of Turku GI Norden 9.6.2011 Project in a nutshell
Enseigner l'évolution
AATTTTCGTATCTGTTGGAGTTAGATAAGCCTACGCTTGATGGACCGTTGGGTGGCTTTCTAAGTGAGCTCGTGCCATCACAATTAATATAAGGAATTGTAGATGTTTCTTTCGTTATAGGTATTTCAAAAT TTATAAGAACCTACGCCCTCGTCTTTCTCCATTGGAACAGTTGCCGTTTTCGCAGTTCTTTTTGGTTCAGTCCTCATATCATGTGATTCCCCTGGCTCTCCTGATCTTTTTATACTTACTTTGAAATCGTCA
Tietojenkäsittelytieteiden koulutusohjelma. Tietojenkäsittelytieteiden laitos Department of Information Processing Science
Tietojenkäsittelytieteiden koulutusohjelma Tietojenkäsittelytieteet Laskennallinen data-analyysi Ohjelmistotekniikka, käyttöjärjestelmät, ihminen-kone -vuorovaikutus Teoreettinen tietojenkäsittelytiede
Uusi Opetussuunnitelma 2017 New Curriculum from 2017
Uusi Opetussuunnitelma 2017 New Curriculum from 2017 Department of Biological and Environmental Science Bio- ja ympäristötieteiden laitos Jari Ylänne 10.11.2015 Miksi halutaan uudistaa opetussuunnitelmaa
Tampereen yliopiston uudet tiedekunnat ja tutkimusyhteistyö
FACULTY OF MEDICINE AND LIFE SCIENCES Tampereen yliopiston uudet tiedekunnat ja tutkimusyhteistyö Seppo Nikkari Varadekaani, professori The history of the University of Tampere strongly reflects the faith
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31)
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31) Juha Kahkonen Click here if your download doesn"t start automatically On instrument costs
Co-Design Yhteissuunnittelu
Co-Design Yhteissuunnittelu Tuuli Mattelmäki DA, associate professor Aalto University School of Arts, Design and Architecture School of Arts, Design and Architecture design with and for people Codesign
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31)
On instrument costs in decentralized macroeconomic decision making (Helsingin Kauppakorkeakoulun julkaisuja ; D-31) Juha Kahkonen Click here if your download doesn"t start automatically On instrument costs
Julkaisun laji Opinnäytetyö. Sivumäärä 43
OPINNÄYTETYÖN KUVAILULEHTI Tekijä(t) SUKUNIMI, Etunimi ISOVIITA, Ilari LEHTONEN, Joni PELTOKANGAS, Johanna Työn nimi Julkaisun laji Opinnäytetyö Sivumäärä 43 Luottamuksellisuus ( ) saakka Päivämäärä 12.08.2010
7.4 Variability management
7.4 Variability management time... space software product-line should support variability in space (different products) support variability in time (maintenance, evolution) 1 Product variation Product
gi 161984995 gb CP000896.1 Acholeplasma laidlawii PG-8A, complete genome ATTTGATTTTTTGCTTAATTTTTATGTAATTACTTCCCCACAATTTTTGCCCACATATTGTGGATAAAT TTCCACATTTTATTCACAATGTTGATAAGTTGTGTAAGTCGACTTGTTGGCTTTATAAAGCAAATGACA
FROM VISION TO CRITERIA: PLANNING SUSTAINABLE TOURISM DESTINATIONS Case Ylläs Lapland
FROM VISION TO CRITERIA: PLANNING SUSTAINABLE TOURISM DESTINATIONS Case Ylläs Lapland Tiina Merikoski, Landscape Architect (M.Sc) Aalto University School of Science and Technology Department of Architecture
Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver. PT 1
Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver PT www.acolor.net 1 Outline: Part I: Why (Background) Part II: Some concrete work we have done Part III: Prospects to further
Uusi Ajatus Löytyy Luonnosta 4 (käsikirja) (Finnish Edition)
Uusi Ajatus Löytyy Luonnosta 4 (käsikirja) (Finnish Edition) Esko Jalkanen Click here if your download doesn"t start automatically Uusi Ajatus Löytyy Luonnosta 4 (käsikirja) (Finnish Edition) Esko Jalkanen
AKKREDITOITU SERTIFIOINTIELIN ACCREDITED CERTIFICATION BODY
S017 Liite 1.09 / Appendix 1.09 Sivu / Page 1(5) AKKREDITOITU SERTIFIOINTIELIN ACCREDITED CERTIFICATION BODY EUROFINS EXPERT SERVICES OY EUROFINS EXPERT SERVICES LTD. Tunnus Code Yksikkö tai toimintoala
TW- EAV510/TW- EAV510AC: PPTP- OHJEISTUS
TW- EAV510/TW- EAV510AC: PPTP- OHJEISTUS Esimerkki 1: PPTP- yhteys kahden TW- EAV510/TW- EAV510AC laitteen välille Esimerkki 2: Palvelinlaitteena TW- EAV510/TW- EAV510AC, asiakaslaitteena Windows 8 HUOM!
enzymatic families regulated in response to a short-term cytokinin treatment in root apices
A B C D Supplemental tlfigure 1. 1Mtbli Metabolic processes, hormonal pathways and dlarge enzymatic families regulated in response to a short-term cytokinin treatment in root apices The 297 transcripts
Hankkeen toiminnot työsuunnitelman laatiminen
Hankkeen toiminnot työsuunnitelman laatiminen Hanketyöpaja LLP-ohjelman keskitettyjä hankkeita (Leonardo & Poikittaisohjelma) valmisteleville11.11.2011 Työsuunnitelma Vastaa kysymykseen mitä projektissa
Results on the new polydrug use questions in the Finnish TDI data
Results on the new polydrug use questions in the Finnish TDI data Multi-drug use, polydrug use and problematic polydrug use Martta Forsell, Finnish Focal Point 28/09/2015 Martta Forsell 1 28/09/2015 Esityksen
ECSEL - Electronic Components and Systems for European Leadership
ECSEL lyhyesti 2015 ECSEL - Electronic Components and Systems for European Leadership The Public-Private Partnership keeping Europe at the Forefront of Technology Development Electronic Components and
The BaltCICA Project Climate Change: Impacts, Costs and Adaptation in the Baltic Sea Region
The BaltCICA Project Climate Change: Impacts, Costs and Adaptation in the Baltic Sea Region The BaltCICA Project is designed to focus on the most imminent problems that climate change is likely to cause
Large Scale Sequence Analysis with Applications to Genomics
Large Scale Sequence Analysis with Applications to Genomics Gunnar Rätsch, Max Planck Society Tübingen, Germany Talk at CWI, Amsterdam October 23, 2009 Gunnar Rätsch (FML, Tübingen) Large Scale Sequence
Poistuvat kurssit ja korvaavuudet (RRT ja YYT)
Poistuvat kurssit ja korvaavuudet 2016-2017 (RRT ja YYT) Rakenne- ja rakennustuotantotekniikka Rak-43.3001 Rakennuksen rungon suunnittelu I CIV-E1030 Fundamentals of Structural Design Rak-43.3111 Prestressed
Data Quality Master Data Management
Data Quality Master Data Management TDWI Finland, 28.1.2011 Johdanto: Petri Hakanen Agenda 08.30-09.00 Coffee 09.00-09.30 Welcome by IBM! Introduction by TDWI 09.30-10.30 Dario Bezzina: The Data Quality
Ostamisen muutos muutti myynnin. Technopolis Business Breakfast 21.8.2014
Ostamisen muutos muutti myynnin Technopolis Business Breakfast 21.8.2014 Taking Sales to a Higher Level Mercuri International on maailman suurin myynnin konsultointiyritys. Autamme asiakkaitamme parantamaan
NetPro projektin kokemuksia - Hajanaisia poimintoja kuuden vuoden Leonardo-projektin varrelta, ja vähän muualtakin
NetPro projektin kokemuksia - Hajanaisia poimintoja kuuden vuoden Leonardo-projektin varrelta, ja vähän muualtakin Hannu Markkanen hannu.markkanen@evitek.fi http://netpro.evitek.fi/ https://server3.hci.fi/netpro/
Kansainvälisiä tutkimus- ja kehitysprojekteja ekotehokkaan rakennetun ympäristön tuottamiseen, käyttöön ja ylläpitoon
Kansainvälisiä tutkimus- ja kehitysprojekteja ekotehokkaan rakennetun ympäristön tuottamiseen, käyttöön ja ylläpitoon ICT & ympäristönäkökulma rakennus- ja kiinteistöklusteri Pekka Huovila VTT Rakennus-
Voice Over LTE (VoLTE) By Miikka Poikselkä;Harri Holma;Jukka Hongisto
Voice Over LTE (VoLTE) By Miikka Poikselkä;Harri Holma;Jukka Hongisto If you are searched for a book by Miikka Poikselkä;Harri Holma;Jukka Hongisto Voice over LTE (VoLTE) in pdf form, then you have come
6.095/ Computational Biology: Genomes, Networks, Evolution. Sequence Alignment and Dynamic Programming
6.095/6.895 - Computational Biology: Genomes, Networks, Evolution Sequence lignment and Dynamic Programming Tue Sept 13, 2005 Challenges in Computational Biology 4 Genome ssembly 5 Regulatory motif discovery
Gap-filling methods for CH 4 data
Gap-filling methods for CH 4 data Sigrid Dengel University of Helsinki Outline - Ecosystems known for CH 4 emissions; - Why is gap-filling of CH 4 data not as easy and straight forward as CO 2 ; - Gap-filling
Rakentamisen 3D-mallit hyötykäyttöön
Rakentamisen 3D-mallit hyötykäyttöön 1 BIM mallien tutkimuksen suunnat JAO, Jyväskylä, 22.05.2013 Prof. Jarmo Laitinen, TTY rakentamisen tietotekniikka Jarmo Laitinen 23.5.2013 Jarmo Laitinen 23.5.2013
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) DNA RNA 7.12.2017 Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Osaamistavoitteet Lärandemål Luennon jälkeen ymmärrät pääperiaatteet
Näytön jäljillä CINAHL-tietokannassa
BMF, Osaamisen ytimessä -kevätseminaari 13.4.2011 Maarit Putous, informaatikko Näytön jäljillä CINAHL-tietokannassa CINAHL Cumulative index to nursing and allied health literature 1981- viitteitä yli 3000
Statistical design. Tuomas Selander
Statistical design Tuomas Selander 28.8.2014 Introduction Biostatistician Work area KYS-erva KYS, Jyväskylä, Joensuu, Mikkeli, Savonlinna Work tasks Statistical methods, selection and quiding Data analysis
Tarua vai totta: sähkön vähittäismarkkina ei toimi? 11.2.2015 Satu Viljainen Professori, sähkömarkkinat
Tarua vai totta: sähkön vähittäismarkkina ei toimi? 11.2.2015 Satu Viljainen Professori, sähkömarkkinat Esityksen sisältö: 1. EU:n energiapolitiikka on se, joka ei toimi 2. Mihin perustuu väite, etteivät
Käytännön kokemuksia osallistumisesta EU projekteihin. 7. puiteohjelman uusien hakujen infopäivät 2011
Käytännön kokemuksia osallistumisesta EU projekteihin 7. puiteohjelman uusien hakujen infopäivät 2011 15.3.2010 07.09.2011 Markku Timo Ture Nikkilä T&K yritys, 8 henkilöä Elastopoli Oy PK-yritys, omistajina
T-9 (vajaa kierros) P-7 1. Verna Huppunen 5,10 1. Ville Karppi 6,45 2. Venla Karppi 5,27 3. Eveliina 5,38 P-9 1. Henri Aava 4,49
Maastomestaruuskisat 5.5.2016 T-9 (vajaa kierros) P-7 1. Verna Huppunen 5,10 1. Ville Karppi 6,45 2. Venla Karppi 5,27 3. Eveliina 5,38 P-9 1. Henri Aava 4,49 T-11 (kierros) P-11 1. Ronja Huppunen 6,47
LAADUSTA KANSAINVÄLISTÄ KILPAILUKYKYÄETUA ESITELMÄN SISÄLTÖ: 1. SABRISCAN-TARINA 2. TULOKSET 3. YHTEENVETO
LAADUSTA KANSAINVÄLISTÄ KILPAILUKYKYÄETUA ESITELMÄN SISÄLTÖ: 1. SABRISCAN-TARINA 2. TULOKSET 3. YHTEENVETO LEAN-OPEX LEADER - koulutusohjelma on Sabriscan Oy:n 1 RATKAISULIIKETOIMINTAA LEAN-OPEX LEADER
7. Product-line architectures
7. Product-line architectures 7.1 Introduction 7.2 Product-line basics 7.3 Layered style for product-lines 7.4 Variability management 7.5 Benefits and problems with product-lines 1 Short history of software
Teknologiateollisuus ry Ympäristöosaaminen arvoketjussa -seminaari Työkaluja arvoketjun ympäristöosaamisen kehittämiseen
Teknologiateollisuus ry Ympäristöosaaminen arvoketjussa -seminaari Työkaluja arvoketjun ympäristöosaamisen kehittämiseen Mikael Niskala 20.9.2011 Lähestymistapoja arvoketjun ympäristöosaamisen hallintaan
AYYE 9/ HOUSING POLICY
AYYE 9/12 2.10.2012 HOUSING POLICY Mission for AYY Housing? What do we want to achieve by renting apartments? 1) How many apartments do we need? 2) What kind of apartments do we need? 3) To whom do we
GLP-vaatimukset ATMP-valmisteiden turvallisuustutkimuksille
GLP-vaatimukset ATMP-valmisteiden turvallisuustutkimuksille Tiina Palomäki Fimea 2.9.2015 Advanced therapy medicinal products (ATMPs) Somatic cell therapy medicinal products Tissue engineered products
ReFuel 70 % Emission Reduction Using Renewable High Cetane Number Paraffinic Diesel Fuel. Kalle Lehto, Aalto-yliopisto 5.5.
ReFuel 70 % Emission Reduction Using Renewable High Cetane Number Paraffinic Diesel Fuel Kalle Lehto, Aalto-yliopisto 5.5.2011 Otaniemi ReFuel a three year research project (2009-2011) goal utilize the