CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015

Koko: px

Aloita esitys sivulta:

Download "CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015"

Ella Järvenpää
7 vuotta sitten
Katselukertoja:

1 CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015 Luennot Maanantai KE 2 Keskiviikko KE 2 Demot (pakollinen läsnäolo) Perjantai , KE1, ja 2.10.

2 Osaamistavoitteet Kurssin suoritettuaan opiskelija osaa: luokitella pro- ja eukarioottisolujen fysiologisia, kemiallisia ja biologisia ominaisuuksia esittää rakenteiden ja toiminnan vuorovaikutuksia molekyylitasolla kuvailla geenien säätelymekanismeja, niiden vaikutuksia solujen fysiologiaan sekä genetiikan menetelmiä. nimetä biologisen työskentelyn menetelmiä (mm. aseptinen työskentely) ja solujen kasvuun vaikuttavia tekijöitä kuvailla mikrobifysiologian hyötykättöä biotaloudessa kuvailla mikrobien aiheuttamia haittoja ja niiden torjuntaa teollisessa tuotannossa.

solujen fysiologiaan sekä genetiikan menetelmiä. nimetä biologisen työskentelyn menetelmiä (mm.

3 Sisältö Mikrobi-, kasvi ja eläinsolujen solutason rakenteiden ja toiminnan vuorovaikutus. Luokittelun perusteet toiminnallisista lähtökohdista (solujen pääluokat: mm. bakteerit, sienet, levät, kasvi- ja eläinsolut). Solutason geneettisen säätelyn periaatteet ja geenitekniikan työkalut. Solujen kasvatus laboratoriossa ja eri tekijöiden vaikutukset kasvuun. Solujen ja solutuotteiden hyötykäyttö bioteollisuudessa. Mikrobiologiset haitat teollisuudessa, biofilmit ja korroosio.

bakteerit, sienet, levät, kasvi- ja eläinsolut). Solutason geneettisen säätelyn periaatteet ja geenitekniikan työkalut.

4 Learning outcomes After completing the course the student can: 1. Classify selected characteristics (physiological, chemical and biological) of pro- and eukaryotic cells 2. Present interactions of structure and function at the molecular level 3. Describe gene regulatory mechanisms, their influence on cell physiology, and methods in gene analysis 4. Name working methods in biology (e.g. aseptic technique) and factors which influence growth of cells 5. Describe industrial use of microbial physiology in the bioeconomy 6. Describe deleterious effects of microbes and their prevention in industrial production and manufacturing

Present interactions of structure and function at the molecular level 3.

5 Content Microbe, plant and animal cell structure and function Basics of classification with emphasis on function (major cell classes: e-.g. bacteria, fungi, algae, plant and animal cells) Genetic regulation at the level of the cell and methods in genetics Cultivation of cells in the laboratory and factors influencing cell growth Use of cells and products thereof in the biotechnology industry Microbial spoilage and deleterious effects in industry, biofilms and corrosion

bacteria, fungi, algae, plant and animal cells) Genetic regulation at the level of the cell and methods in genetics

6 Kurssin opettajat Katrina Nordström, professori (mikrobiologia Huone (CHEM) C304b (luentosalin Ke4 jälkeen toinen toimisto vasemmalla, orgaanisen kemian käytävä) DI Olli Natri vastaa demoista, jotka ovat: ja Dosentti Ossi Turunen opettaa luennoilla ja

katrina.nordstrom@aalto.fi DI Olli Natri vastaa demoista, jotka ovat: 25.9. ja 2.10.

7 Kurssin aineisto 1. Kurssilla käytettään Pearsonin elektronista oppimisalustaa, Mastering Microbiology 2. Opiskelijat saavat kurssikirjan elektronisena 3. Luentojen ppt materiaali on kohdassa: Manage Documents, printatkaa nämä itsellenne ennen luentoja niin voitte tehdä niihin omat muistiinpanot 4. Kurssin elektroniset harjoitukset ovat kohdassa Assignments. Näille on asetettu 3 palautusaikaa, jotka ovat (osa I), (osa II) ja (osa III). Myöhässä palauttaminen ei onnistu. Harjoitusten tekeminen vie noin 1h ja 30 min/viikko. 5. Demojen aineistot jaetaan erikseen ja jokaisella kerralla kirjaamme läsnäolot. Poissaolot vievät 0.25 pistettä /kerta

Kurssin elektroniset harjoitukset ovat kohdassa Assignments. Näille on asetettu 3 palautusaikaa, jotka ovat 21.9. (osa I), 5.10. (osa II) ja 19.10. (osa III).

8 Mastering aineisto Kurssi: C2300 s-2015 (MMBS2015) Lähetän kaikille 7.9. aikana sähköpostilla kurssin koodin, jota käyttäen voitte luoda itsellenne tunnukset ja kirjautua sisään kurssille C2300, joka on Mastering Microbiology kurssilla nimellä C2300 s-2015 (MMBS2015) Kurssikirja (elektroninen) Tortora, Funke & Case: Microbiology 11th ed. Tätä samaa oppimisalustaa on käytetty prof. Linderin kevään 2015 Biokemian A1300 kurssilla Ne jotka eivät ole aiemmin tätä alustaa käyttäneet voivat jäädä lyhyeen harjoitukseen keskiviikko 9.9. luennon jälkeen klo 15 saliin KE2

Microbiology kurssilla nimellä C2300 s-2015 (MMBS2015) Kurssikirja (elektroninen) Tortora, Funke & Case: Microbiology 11th ed.

9 Luentoaiheet (ja aikataulusuunnitelma) 2015 Opettaa: Katrina Nordström ja Ma 7.9 Introduction, The microbial world, industrial microbiology Functional anatomy of prokaryotic and eukaryotic cells (Luku 1,4 ja 28) (Nordström) Ke Functional anatomy.. (jatkuu) (Nordström) Ma ja Ke Bacteria and Archaea (luku 11) (Nordström)

9 Introduction, The microbial world, industrial microbiology Functional anatomy of

10 Luentoaiheet (ja aikataulusuunnitelma) Ma Eukaryotes Luku 12 (Ossi Turunen) Ke Viruses and Prions Luku 13 (Ossi Turunen) Ma ja Ke Mechanisms of pathogenicity (Luku 15) (Nordström) DEMO Pe 25.9 Microbial growth ja Control of microbial growth (luku 6, 7) opettaa Olli Natri

Viruses and Prions Luku 13 (Ossi Turunen) Ma 28.9.

11 Ma ja ke Innate immunity (luku 16) Nordström DEMO Pe Microbial growth ja Control of microbial growth (luku 6, 7) opettaa Olli Natri Ma ja ke Adaptive immunity (luku 17) Nordström

Innate immunity (luku 16) Nordström DEMO Pe 2.10.

12 Harjoitusten (electronic assigments) palautusaikataulu Kaikki tehtävät avautuvat ja niitä voi alkaa heti tekemään Tehtävät sulkeutuvat kolmessa ryhmässä: Ensimmäinen ryhmä tehtäviä: 21.9.klo Toinen ryhmä tehtäviä: klo Kolmas ryhmä tehtäviä: klo Sen jälkeen kun tehtävien d-line on tullut, niitä ei enää voi tehdä.

Ensimmäinen ryhmä tehtäviä: 21.9.klo 23.59 Toinen ryhmä tehtäviä: 5.10. klo 23.

13 Tenttikirjan aineisto syksy 2015 (HUOM! Luennolla ja demoissa käymme kirjaa läpi hieman eri järjestyksessä 1. The microbial world and you Observing micro-organisms through a microscope Functional anatomy of prokaryotic and eukaryotic cells Microbial Growth The control of microbial growth The prokaryotes: Domains of bacteria and Arhcaea The Eukaryotes: Fungi, algae, protozoa and helminths , ei kohdasta slime molds eteenpäin. 13. Viruses, virioids and prions Microbial mechanisms of pathogenicity Innate immunity, nonspecific defences of the host ; ei kohdasta the complement system eteenpäin 17. Adaptive immunity: specific defences of the host 28. Applied and industrial microbiology Sivuja yhteensä (noin) 350

The prokaryotes: Domains of bacteria and Arhcaea 299-328 12. The Eukaryotes: Fungi, algae, protozoa and helminths 331-353, ei kohdasta slime molds eteenpäin. 13.

14 Tenttiin Tortora et. Al. kirjasta annetut luvut ja sivut Muuta materiaalia jota mahdollisesti esitetään tai jaetaan luennolla Demojen ja elektronisten harjoitusten sisältö ja niihin liittyvä materiaali Demoissa kerätään nimilistaa; poissaolot joille ei ole mitään syytä, vähennetään tentin pisteistä 0.5/demokerta, eli jos olet poissa 2 kertaa niin vähennetään 1.0 pistettä. Ei korvaavia tehtäviä.

luennolla Demojen ja elektronisten harjoitusten sisältö ja niihin liittyvä materiaali Demoissa

15 Arviointi /arvosanan määräytyminen Tentti (75%) arvosanasta Harjoitukset ja demot (25%) arvosanasta Tenttiin tulee 5 kysymystä, joista 3 on esseetyyppisiä ( 5pist /kysymys, yht. 15 p.) ja muita lyhyitä kysymyksiä (laskuja/kuvia tms) joista 7.5. p. max Elektronisten harjoitusten yhteispistemäärä on 120 ja ne jaetaan lisäpisteinä joiden maksimi on 5 lopulliseen pistemäärään (ks. Seuraava ppt.) Demot, pakollisia ks. edellinen ppt.

) ja muita lyhyitä kysymyksiä (laskuja/kuvia tms) joista 7.5. p.

16 Arviointi/arvosana (maksimi on 30 pistettä; tentti = 22.5 ja tehtävät 7.5) Tentti max 22.5 pistettä, 3 essee kysymystä (15 pist) + muita kysymyksiä (7.5 pist) Tehtävät: (max 5 lisäpistettä) pist = 5 pistettä lisää arvosanaan pist =4 pistettä lisää arvosanaan pist = 3 pistettä lisää arvosanaan pist = 2 pistettä lisää arvosanaan pistettä =1 piste lisää arvosanaan Alle 25 pistettä = ei pisteitä lisää arvosanaan

5 pist) Tehtävät: (max 5 lisäpistettä) 110-125 pist = 5 pistettä lisää arvosanaan 86-100 pist =4 pistettä

17 Alustava arviointiasteikko = = = = =1 Alle 10 hylätty

Samankaltaiset tiedostot

CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Luento

CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Luento1 31.10.2017 Heli Viskari Tervetuloa kurssille! 1 Kurssin sisältö (Oodista) Mikrobi-, kasvi- ja eläinsolujen solutason rakenteiden ja toiminnan vuorovaikutus