Röntgentomografia. Tommi Markkanen LuK-seminaari Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta

Samankaltaiset tiedostot
Kuvantamisen matematiikka: tieteestä tuotteiksi

matematiikka Tapio Helin Nuorten akatemiaklubi Helsinki Matematiikan ja tilastotieteen laitos

Lääketieteellinen kuvantaminen. Biofysiikan kurssi Liikuntabiologian laitos Jussi Peltonen

Spektri- ja signaalianalysaattorit

Fluoresenssitomografian simulointia Loppudokumentti

Teollisuusmatematiikka. Samuli Siltanen Matematiikan ja tilastotieteen laitos Helsingin yliopisto Tieteen päivät

PHYS-C0240 Materiaalifysiikka kevät 2017

1 Johdanto. 2 Lähtökohdat

Sovelletun fysiikan laitos Marko Vauhkonen, Kuopion yliopisto, Sovelletun fysiikan laitos Slide 1

Korkean resoluution ja suuren kuva-alueen SAR

Integrointialgoritmit molekyylidynamiikassa

PIXE:n hyödyntäminen materiaalitutkimuksessa

Mitä on pätö-, näennäis-, lois-, keskimääräinen ja suora teho sekä tehokerroin? Alla hieman perustietoa koskien 3-vaihe tehomittauksia.

Deterministiset ja tilastolliset inversiomenetelmät röntgentomografiassa

Visibiliteetti ja kohteen kirkkausjakauma

Säteilevät naiset -seminaari , Säätytalo STUK SÄTEILYTURVAKESKUS STRÅLSÄKERHETSCENTRALEN RADIATION AND NUCLEAR SAFETY AUTHORITY

1.5 RÖNTGENDIFFRAKTIO Työohje, aro, snu,

Ydinfysiikka lääketieteellisissä sovelluksissa

Työssä tutustutaan hajoamislakiin ja määritetään 137 Ba:n viritystilan kev keskimääräinen elinaika ja puoliintumisaika.

Maa Fotogrammetrian erikoissovellutukset (Close-Range Photogrammetry)

Muokattu pääosin esityksestä Presentation in the Norwegian Geotechnical Society meeting, Oslo , Pauli Saksa, Geosto Oy

Fysikaalisten tieteiden esittely puolijohdesuperhiloista

Luento 10: Työ, energia ja teho. Johdanto Työ ja kineettinen energia Teho

LABORATORIOTYÖ 3 VAIHELUKITTU VAHVISTIN

23 VALON POLARISAATIO 23.1 Johdanto Valon polarisointi ja polarisaation havaitseminen

CBRNE-aineiden havaitseminen neutroniherätteen avulla

Mikroskooppisten kohteiden

Radiologisen fysiikan ja säteilysuojelun kurssi radiologiaan erikoistuville lääkäreille Ohjelma

TIES592 Monitavoiteoptimointi ja teollisten prosessien hallinta. Yliassistentti Jussi Hakanen syksy 2010

13. Ratkaisu. Kirjoitetaan tehtävän DY hieman eri muodossa: = 1 + y x + ( y ) 2 (y )

Värähtelymittaus Tämän harjoituksen jälkeen:

Työkalujen merkitys mittaamisessa

Kanavamittaus moderneja laajakaistaisia HFjärjestelmiä

Tiedonkeruu ja analysointi

IMPEDANSSITOMOGRAFIA AIVOVERENVUODON DIAGNOSOINNISSA - TARVE UUDELLE TEKNOLOGIALLE

Fysikaalisen kemian syventävät työt CCl 4 -molekyylin Ramanspektroskopia

EPMAn tarjoamat analyysimahdollisuudet

Vaiheistettu Ultraääni - Phased array

VAASAN YLIOPISTO TEKNILLINEN TIEDEKUNTA SÄHKÖTEKNIIKKA. Jouko Esko n85748 Juho Jaakkola n Dynaaminen Kenttäteoria GENERAATTORI.

Tiedonkeruu ja analysointi

S C I E N C E L I N K & A L U E

Radiologisen fysiikan ja säteilysuojelun kurssi radiologiaan erikoistuville lääkäreille Ohjelma KAHVITAUKO

DATALOGGERI DT-171 PIKAKÄYTTÖOHJE V 1.2

MS-A0103 / Syksy 2015 Harjoitus 2 / viikko 38 / Ennakot

DIGIBONUSTEHTÄVÄ: MPKJ NCC INDUSTRY OY LOPPURAPORTTI

Röntgenkuvaus, digitaalinen kuvaus ja tietokonetomografia

Magneettikenttä. Liikkuva sähkövaraus saa aikaan ympärilleen sähkökentän lisäksi myös magneettikentän

Erikoistekniikoita. Moiré - shadow-moiré - projection-moiré. Rasterifotogrammetria - yhden juovan menetelmä - monen juovan menetelmä

Gaussin lause eli divergenssilause 1

Radiologisen fysiikan ja säteilysuojelun kurssi radiologiaan erikoistuville lääkäreille Ohjelma

Miehittämättömän lennokin ottamien ilmakuvien käyttö energiakäyttöön soveltuvien biomassojen määrän nopeassa arvioinnissa

S09 04 Kohteiden tunnistaminen 3D datasta

Projektisuunnitelma ja johdanto AS Automaatio- ja systeemitekniikan projektityöt Paula Sirén

9. Polarimetria. tähtitieteessä. 1. Polarisaatio. 2. Stokesin parametrit. 3. Polarisaattorit. 4. CCD polarimetria

MS-A0305 Differentiaali- ja integraalilaskenta 3 Luento 10: Stokesin lause

Synkrotronisäteily ja elektronispektroskopia. Tutkimus Oulun yliopistossa

SWEPT SINE MITTAUSTEKNIIKKA (NOR121 ANALYSAATTORILLA)

Hajoamiskaaviot ja niiden tulkinta (PHYS-C0360)

Fysiikka 8. Aine ja säteily

JÄTEHUOLLON ERIKOISTYÖ

S C I E N C E L I N K & A L U E

FYSIIKAN LABORATORIOTYÖT 2 HILA JA PRISMA

Kojemeteorologia. Sami Haapanala syksy Fysiikan laitos, Ilmakehätieteiden osasto

Investointimahdollisuudet ja niiden ajoitus

MoveSole StepLab. Mobiili liikkumisen mittausjärjestelmä

Sähkömagneettinen induktio

RAMBOLL WATER TEKOÄLYN HYÖDYNTÄMINEN JÄTEVEDENPUHDISTAMON OPEROINNISSA

1 Perussuureiden kertausta ja esimerkkejä

Energian hallinta. Energiamittari. Malli EM23 DIN. Tuotekuvaus. Tilausohje EM23 DIN AV9 3 X O1 PF. Mallit. Tarkkuus ±0.5 RDG (virta/jännite)

LABORAATIOSELOSTUSTEN OHJE H. Honkanen

Diplomi-insinöörien ja arkkitehtien yhteisvalinta - dia-valinta 2014 Insinöörivalinnan fysiikan koe , malliratkaisut

Park systems XE-100 atomivoimamikroskoopin käyttöohje

Luento 10: Työ, energia ja teho

FYSIIKAN LABORATORIOTYÖT 2 MAGNEETTIKENTTÄTYÖ

ICP-OES JA ICP-MS TEKNIIKAT PIENTEN METALLIPITOISUUKSIEN MÄÄRITYKSESSÄ. Matti Niemelä, Oulun yliopisto, kemian laitos

SILVER LINE AKSELISTON SUUNTAUSJÄRJESTELMÄ

Kojemeteorologia. Sami Haapanala syksy Fysiikan laitos, Ilmakehätieteiden osasto

S OPTIIKKA 1/10 Laboratoriotyö: Polarisaatio POLARISAATIO. Laboratoriotyö

Havaitsevan tähtitieteen peruskurssi I, Havaintoaikahakemuksen valmistelu. Luento , V-M Pelkonen

E. Oja ja H. Mannila Datasta Tietoon: Luku 2

JOHDATUS TEKOÄLYYN TEEMU ROOS

Differentiaali- ja integraalilaskenta 1 Ratkaisut 5. viikolle /

Liikenneteorian tehtävä

Korkean resoluution ja suuren kuva-alueen SAR

Jos siis ohjausrajoitusta ei olisi, olisi ratkaisu triviaalisti x(s) = y(s). Hamiltonin funktio on. p(0) = p(s) = 0.

PHYS-C6360 Johdatus ydinenergiatekniikkaan (5op), kevät 2016

7.4 Sormenjälkitekniikka

10. Polarimetria. 1. Polarisaatio tähtitieteessä. 2. Stokesin parametrit. 3. Polarisaattorit. 4. CCD polarimetria

9. Polarimetria. 1. Stokesin parametrit 2. Polarisaatio tähtitieteessä. 3. Polarisaattorit 4. CCD polarimetria

1 Eksergia ja termodynaamiset potentiaalit

Korkean suorituskyvyn lämpökameran käyttö tulipesämittauksissa. VI Liekkipäivä, Lappeenranta Sami Siikanen, VTT

dl = F k dl. dw = F dl = F cos. Kun voima vaikuttaa kaarevalla polulla P 1 P 2, polku voidaan jakaa infinitesimaalisen pieniin siirtymiin dl

12. Differentiaaliyhtälöt

Korkeakoulujen kevään yhteishaku 2019

Fysiikan kurssit. MAOL OPS-koulutus Naantali Jukka Hatakka

Ch12 Kokeita spin-1/2 systeemillä. Yksinkertaisia mittauksia usean vuorovaikuttamattoman spin-1/2 ytimen systeemillä

Harjoitus Etsi seuraavien autonomisten yhtälöiden kriittiset pisteet ja tutki niiden stabiliteettia:

KJR-C1001 Statiikka ja dynamiikka. Luento Susanna Hurme

Tekoäly tänään , Vadim Kulikov (Helsingin Yliopisto)

Numeeriset menetelmät

Transkriptio:

Röntgentomografia Tommi Markkanen LuK-seminaari Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta

Mitä on tomografia? Leikekuvantamista Sovellettavia ilmiöitä Röntgensäteily Raakadatana läpivalaisukuvat eri Positroniemissio suunnista Magneettinen Rekonstruktio tietokoneella resonanssi Ultraääni Käytetään mm. Lääketiede Arkeologia Biologia Geofysiikka Materiaalitutkimus 2

Mittauksen suorittaminen Laitteisto: Röntgenlähde (synkrotroni tai röntgenputki) Detektori Liikuteltava jalusta näytettä varten Mittaus: 1D tai 2D kuvia säteilyn intensiteetin vaimenemisesta Näyte paikallaan ja röntgenlähde ja detektori pyörivät (lääketiede) Kohde pyörii (muu tutkimus) 3

Helsingin yliopiston tomografialaboratorio Kuvassa vasemmalta lukien detektori, siirtopenkki ja röntgenlähde 4

Mittauksen analysointi Läpivalaisukuvien lukumäärä yleensä tuhansissa Vaatii huomattavan suurta datanvarastointikapasiteettia Rekonstruoidaan data sopivaa algoritmia käyttäen Vaati huomattavaa laskentatehoa Tuloksena 2D tai 3D malli säteilyn vaimenemisesta kuvattavassa kohteeessa Mitattava kohde visualisoidaan halutulla tavalla Mahdollisuuksia lähes rajattomasti 5

Mittauksen analysointi, esimerkki Yksittäinen projektio Rekonstruoitu 2D leike vaakatasossa 6

Historiaa Röntgensäteet 1895 Kehitys nopeaa Tietokoneiden puute rajoitti Godfrey Hounsfield and Allan McLeod Cormack Lääketieteen Nobel 1979 huomattavasti Nykyaikainen tietokoneavustettu tomografia 1971 Siirtyminen 3D tomografiaan Enemmän laskentatehoa tasodetektoreita EMI-Scanner Tulevaisuudessa dynaaminen tomografia 7

Tomografian matemaattinen perusta Beerin laki: x, y ds I = I 0e x, y ds = ln I / I 0 Lähinnä yksi perusmetodi Johann Radon Projection slice theorem Toimii kaikille viivaintegraalista riippuville ilmiöille 8

Projection slice theorem P t = f t, s ds F {P t } S w = P t e 2 i wt dt 9

Projection slice theorem S w = dt = [ ] f t, s e 2 i wt f t, s ds e 2 i wt dtds ; t cos sin = s sin cos x y t, s = x, y, dtds = dxdy S w = f x, y e 2 i w xcos ysin dxdy 10

Projection slice theorem ; w = w x i w y j = w cos i sin j x = x i y j S w = f x, y e 2 i w x cos y sin dxdy = f x, y e 2 i w x d 2 x = F { f x, y } f x, y = F 1 {S w } 11

Suodatettu takaisinprojektio F 1 {S w } = S w e 2 i w x 2 d w 2 = S w e 2 i w x cos y sin w dw d 0 0 ; S w = S w f x, y = S w e 2 i w x cos ysin w dw d 0 12

Suodatettu takaisinprojektio ; t = xcos ysin Q t = [ 0 2 i wt S w w e dw S w w e 2 i wt ] dw d = 0 Q x cos ysin d = f x, y 13

Suodatettu takaisinprojektio, esimerkki Alkuperäinen 8 projektiota 15 projektiota 60 projektiota 14

Suodatettu takaisinprojektio Yleensä fysikaalisissa tilanteissa pistelähde Kuitenkin aikaisempi idea pätee Algoritmi pistelähteelle yleistettävissä helposti kolmeen ulottuvuuteen 15

Suodatettu takaisinprojektio 3D 3D-algoritmit vaativat paljon laskentatehoa Feldkamp, Davis, Kress 1984 Epäeksakti Algoritmia on sittemin muokattu paremmaksi Vilkas tutkimusala 16

Tomografia tutkimusmetodina Tomografia varteenotettava vaihtoehto kun: Halutaan tietoa pintaa Dynaaminen tomografia mahdollista tietyin rajoituksin syvemmältä Näytettä Haluttu ei saa pilkkoa resoluutio > ~100nm Kontrastiero näytteessä riittävä Olemassa lähinnä kaksi vaihtoehtoa säteilylähteiksi Röntgenputki Synkrotroni Molemmissa hyvät ja huonot puolensa 17

Tomografia synkrotronilla Hyödyt: Haitat: Suuri intensiteetti Voimakas säteliy voi Lyhyt valotusaika Mahdollistaa vaurioittaa kohdetta dynaamisten systeemien tarkastelun Mittausaikaa vähän tarjolla Koesarjojen Spektriä mahdollista muokata Eri oltava lyhytkestoisia ja tarkoin suunniteltuja aineiden tunnistaminen helpottuu 18

Tomografia röntgenputkella Hyödyt: Haitat: Ei aikarajoituksia Pieni intensiteeti Tulosten optimointi yrityksen ja erehdyksen kautta Koesarjat kestävät kauan Aikaresoluutio vähintään kymmeniä minuutteja Mahdollisuus muokata koejärjestelyjä paljonkin Polykromaattinen spektri Eri aineiden ja rajapintojen tunnistus vaikeaa 19

Helsingin yliopiston tomografialaboratorio Laitteisto: CT device nanotom, manufactured and supplied by phoenix X-ray Systems + Services GmbH Parhaimmillaan saavutettu resoluutio < µm Mitattu mm. Puita (myös eläviä) Elektronisia Ilmaviilennetty nanofokusputki, fokus ~150 nm (min), maksimienergia 180 kev, teho ~30 W (max.) komponentteja Kivimateriaaleja Harjoittelu vielä käynnissä Uudet ja mielenkiintoiset projektit tervetulleita! CMOS Flat Panel detector 20

Lähteet Greg Michael (2001) Phys. Educ. 36 442-451 http://www.owlnet.rice.edu/ ~elec431/projects96/dsp/b panalysis.html Steve Webb: From the Watching of Shadows: The Origins of Radiological Tomography A. C. Kak and Malcolm Slaney: Principles of Computerized Tomographic Imaging Nationmaster Encyclopedia: Godfrey Houndsfield Marko Peura: X-ray Microtomography Synchrotron Facilities vs. Desktop Devices (esitelmä) 21