Johdanto kliinisesti merkittäviin bakteereihin Miksi kliininen bakteriologia on tärkeää? Bakteerien luokittelusta Bakteeri-infektiot Patogeeni Tartunnanlähde Ennaltaehkäisy Bakteriologista diagnostiikkaa Kliinisesti tärkeitä bakteerilajeja Kliininen bakteriologia on tärkeää ja käytännönläheistä Kaikista niistä ihmisen sairauksista Joiden aiheuttaja tunnetaan Jotka voidaan parantaa ja Jotka voidaan ennalta ehkäistä Suurin osa on infektiotauteja Bakteeri-infektioita Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua Grampositiiviset bakteerit Gramnegatiiviset bakteerit Aerobiset Anaerobit Kokit Sauvat Aerobinen ja anaerobinen metabolia Bakteerit jaetaan hapentarpeensa mukaan Obligatorisesti aerobiset Vain happea käyttävä hengitysjärjestelmä Tarvitsevat ehdottomasti happea Obligatorisesti anaerobiset Happi on toksista Fakultatiivisesti anaerobiset Elävät sekä aerobisissa että anaerobisissa olosuhteissa Mikroaerofiiliset:Ei normaalissa mutta pienissä happipitoisuuksissa Kapnofiiliset: kasvavat hyvin jos ilmaan lisätty 10% CO2 1
Aerobiset ja anaerobiset bakteerit Bakteerien luokittelua Aerobiset bakteerit Kasvavat ilmassa tai CO2-rikastetussa ilmassa Anaerobiset bakteerit Kasvuun tarvitaan hapeton atmosfääri Aerobiset Anaerobiset Grampositiiviset Gramnegatiiviset Ravinteet Bakteerien nimet Kliinisesti merkittävät bakteerit eroavat toisistaan tarvitsemiensa ravinteiden suhteen Vaatimattomat (luonnossa ja vesissäkin säilyvät) Vaativat (isännän elimistöstä) Erittäin vaativat (voivat kasvaa vain isäntäsolun sisällä) Kasvulämpötila Useimmiten parhaiten kasvavat 35-37 C Laji (species): Enterobacter cloacae Enterobacter sp. Suku (genus): Enterobacter Heimo (Family): Enterobacteriaceae 2
Bakteerien tyypitys Bakteerikantojen tunnistus - Epidemiologiset tutkimukset - Serotyypitys Salmonella Typhimurium Salmonella Enteritidis - Genotyypitys Tavoitteet Mistä bakteeri-infektio on peräisin? Tartunnanlähde Bakteeri patogeenina Infektion oireet Mikrobiologinen diagnostiikka Ennaltaehkäisy Epidemiologiaa Mikrobilääkkeet Endogeeniset infektiot Suurin osa ihmisen bakteeri-infektioista Exogeeniset infektiot 3
Bakteeri patogeenina Aina patogeeni Ei kuulu normaalimikrobistoon Tietyissä oloissa patogeenit Monet normaalimikrobiston bakteerit Opportunisti Kochin postulaatit Osoittaa että tietty mikro-organismi aiheuttaa tietyn sairauden Patogeenin virulenssi >< Isännän ominaisuudet Barry Marshall ja Kochin postulaatit Bakteriologista diagnostiikkaa Mikroskopia (värjätyt näytteet) Bakteeriviljely Antigeeninosoitus Vasta-aineiden osoitus Molekyylibiologiset metodit 4
Hygienia Käsihygienia Elintarvikehygienia Ennaltaehkäisy (Yleinen hygienia ja elintason paraneminen) Immunoprofylaksi Passiivinen Aktiivinen Ehkäisevä mikrobilääkehoito Kontaktit, operaatiot Bakteerien Herkkyys/Resistenssi Tilastot Järkevä mikrobilääkkeiden käyttö Bakteerilääkkeet Kliinisesti tärkeitä bakteereita Grampositiiviset kokit Streptokokit & Enterokokit Stafylokokit Listeria monocytogenes Korynebakteerit Laktobasillit Bacillus Klostridit (anaerob) Mykobakteerit (ei gramvärjäys) Meningokokki Gonokokki Moraxella catarrhalis Haemophilus influenzae Bordetella pertussis Legionella pneumophila Pasteurella multocida Francisella tularensis Pseudomonas aeruginosa Enterobakteerit Vibrio cholerae Campylobacter Helicobacter pylori Anaerob gramnegat sauvat Mycoplasma pneumoniae Spirokeetat Obligat solunsisäiset bakteerit Aerobiset grampositiiviset kokit Stafylokokit Streptokokit ja enterokokit 5
Aerobisia grampositiivisia kokkeja Stafylokokit Staphylococcus aureus Koagulaasinegatiiviset stafylokokit Staphylococcus epidermidis Staphylococcus saprophyticus Aerobisia grampositiivisia kokkeja Streptokokit ja enterokokit Beetahemolyyttiset streptokokit: Streptococcus pyogenes (A) Streptococcus agalactiae (B) C-, G-ryhmä Alfahemolyyttiset streptokokit Streptococcus pneumoniae Viridans-ryhmän streptokokit Enterokokit Enterococcus faecalis Enterococcus faecium Aerobisia grampositiivisia sauvoja Mykobakteerit Corynebacterium diphtheriae Listeria monocytogenes Bacillukset Bacillus cereus Bacillus anthracis Difteroidit Mycobacterium tuberculosis Ympäristömykobakteerit 6
Aerobisia gramnegatiivisia kokkeja Neisseriat Neisseria gonorrhoeae Neisseria meningitidis Aerobisia gramnegatiivisia sauvoja Haemophilus influenzae Bordetella pertussis Moraxella catarrhalis Aerobisia gramnegatiivisia sauvoja Aerobisia gramnegatiivisia sauvoja Escherichia coli Salmonellat Zoonoottiset salmonellat Salmonella Typhi, Paratyphi A, B, C Shigellat Yersinia enterocolitica Klebsiellat Enterobacter-lajit Serratiat Proteukset Vibrio cholerae Pseudomonas aeruginosa 7
Mikroaerofiilisis gramnegatiivisia sauvoja Campylobacter Helicobacter pylori Aerobisia gramnegatiivisia sauvoja Legionella pneumophila Francisella tularensis Anaerobisia bakteereita Spirokeetat Anaerobiset grampositiiviset sauvat Klostridit: Clostridium tetani, Clostridium botulinum, Clostridium perfringens, Clostridium difficile Anaerobiset grampositiiviset kokit Anaerobiset gramnegatiiviset sauvat Bacteroides fragilis, Prevotella, Porphyromonas, Fusobacterium Anaerobiset gramnegatiiviset kokit Treponema pallidum Borrelia burgdorferi 8