Sama mutta density-based (saadaan jakaumat): (tuli aavistuksen eri klusterointi)

Transkriptio

1 1 Teht means, järjestetty data Within cluster sum of squared errors:.95 Clustered Instances 16 ( 13%) 1 33 ( 3%) 3798 ( 33%) 3 3 ( %) 5 ( %) 5 33 ( 9%) 6 37 ( %) ( 7%) 8 ( %) ( 15%) Tutkitaan sisältöä: Klusteri : suuri. Hero< eli mutanteilla geeni passiivisempi kuin terveillä. Muuttujat korreloimattomia. Klusteri 1: melko pieni. Hero 1 eli mutanteilla geeni aktiivisempi. Muuttujat korreloimattomia. Klusteri : Iso. Hero< eli eli mutanteilla geeni passiivisempi. Muuttujat korreloimattomia. Klust. 3 vain 3 alkiota! (Ucp1, Alb, Pck1) rero iso (> 15), toiset pieniä. Eli rottavanhuksilla geeni paljon aktiivisempi. Klusteri : pieni. rero>1. Rottavanhuksilla geeni aktiivisempi. r(hero,rero1)=., toiset korreloimattomia. Klusteri 5: Iso. Kaikki lähellä :aa. Jollain yhden (rero1:n) arvo hieman suurempi. Muuttujat korreloimattomia. Klusteri 6: Suuri. hero> eli mutanteilla geeni aktiivisempi. Muuttujat korreloimattomia. (suurin r(hero,rero1)=.) Klusteri 7: Keskikokoinen. Hero hieman koholla. Muuttujat korreloimattomia. Klusteri 8: Pieni ( alkiota). Erikoinen! roero1:n arvot valtavan suuria! Jopa 179 (Rrm). Toiset kaksi muuttujaa hyvin pieniä. Eli vauvarotilla geeni tosi aktiivinen ja hiljenee aikuisena. Klusteri 9: Iso. Hero koholla eli mutanteilla geeni aktiivisempi. Muuttujat korreloimattomia. Sama mutta density-based (saadaan jakaumat): (tuli aavistuksen eri klusterointi) Fitted estimators (with ML estimates of variance): Cluster: Prior probability:.173 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean = -. StdDev =.11 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.18 StdDev = 1.1 Attribute: roero Normal Distribution. Mean = -. StdDev =.16 1

2 Taulukko 1: 1-means kaikki 3 muuttujaa Attribute Full Data (1165) (16) (33) (3798) (3) (5) (33) (37) (783) () (167) hiero roero roero

3 Cluster: 1 Prior probability:.9 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean = StdDev =.199 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.1865 StdDev =.96 Attribute: roero Normal Distribution. Mean = -.61 StdDev =.13 Cluster: Prior probability:.3311 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean = StdDev =.665 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.39 StdDev = Attribute: roero Normal Distribution. Mean =.51 StdDev =.1655 Cluster: 3 Prior probability:.3 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.7 StdDev =.7 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean = StdDev =.181 Attribute: roero Normal Distribution. Mean = StdDev =.98 Cluster: Prior probability:.8 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.6 StdDev =.7 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.7131 StdDev =.777 Attribute: roero Normal Distribution. Mean =.676 StdDev = : Cluster: 5 Prior probability:.878 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.89 StdDev =.71 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.165 StdDev = 1.67 Attribute: roero Normal Distribution. Mean =.15 StdDev =.1757 Cluster: 6 Prior probability:.33 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.781 StdDev = Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean = StdDev =.3518 Attribute: roero Normal Distribution. Mean = -.7 StdDev =.171 Cluster: 7 Prior probability:.683 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.7785 StdDev =.139 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.1588 StdDev =.63 Attribute: roero Normal Distribution. Mean =.39 StdDev =.96 Cluster: 8 Prior probability:. Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.718 StdDev =.966 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean = StdDev = Attribute: roero Normal Distribution. Mean =.338 StdDev = Cluster: 9 Prior probability:.158 Attribute: hiero Normal Distribution. Mean =.3735 StdDev =.976 Attribute: roero1 Normal Distribution. Mean =.89 StdDev =.998 Attribute: roero Normal Distribution. Mean = -.6 StdDev = Vain rottamuuttujat Tulee ihan erilaisia! 3

4 Taulukko : 1-means (vain rottien attr) Attribute Full Data (1166) (8776) (36) (376) (6) (3) (81) (683) (11) (75) (35) roero roero

5 8885 ( 77%) 1 9 ( 3%) 361 ( 3%) 3 63 ( %) 39 ( 3%) 5 78 ( %) ( 6%) 7 16 ( 1%) 8 53 ( %) 9 3 ( %) Teht..1 Average-link, K = 1 Esimerkkejä: Outliereita: *sin+pi yksin huomasin, c++osasin, osasin rautaa,dataa,raapustaa shell, lähellä usein sama taivutusmuoto (jos ei muuten): tehnyt, tekemiseen/tekemisessä kauniita klustereita: koulutyö, ohjelmointikieli/-kurssi, internet, ohjelma, perus-alkuiset Toimi varsin hyvin! (Eikä juuri eroa vaikka sotki datan välillä.) Kun K=5, ei yhtä hyviä.. Ward ja K=1 Omituisia. Miksi esim. kokeilu, aiheisiin, iltana ja freehand samassa? Näyttää kuin olisi eri etäisyysmitta! (mutta ei ollut).3 Complete ja K=1 Nättejä tuloksia, samantap. kuin average, mutta ehkä jakanut joitain averagen (samankantaisia) klustereita osiin? 3 Teht.3 Mansikilla outo outlier alussa klo (Samaan an koko navetalla paljon vierailuja.) Mustikki syö harevmmin mutta enemmän. 5

6 Koko navetta h keskiarvot: iso piikki aamulla n. 8 an, seuraavat huiput eivät yhtä selviä, klo 15 ja 1 an. Klo 5 an hiljaisinta. Mansikki ja Mustikki h keskiarvot: Mansikilla paljon enemmän vierailuja ja isot erot vrk-aikojen välillä: suurin huippu n. 19 an, 6 hiljaista. Mustikilla vierailuja tasaisesti, jopa klo 1 eräs huippu. Mansikin määrissä sama kuvio, lisääntyvät klo 19 kohden ja sitten taas laskua. Mustikillakin suurin piikki illalla, mutta vasta klo? Muuallakin korkeita piikkejä. Määrien korrelogrammi: Mansikki näyttää säännöllisemmältä: selvempi piikki h kohdalla. Mustikin piikki 3h kohdalla eli vuorokausi pikemminkin 3h??? (Mutta ei selvä.) Huom! -kohdan neg. piikillä ei merkitystä. Frekvenssien korrelogrammi: Kummallakin korkea piikki h kohdalla, mutta Mustikin korkein piikki 3h kohdalla..? 6

7 5 Kuva 1: Koko navetta nimi..txt using Frekv 18 nimi..txt using Maara 7

8 3 Kuva : Frekvenssit: Mansikki ja Mustikki Mansikki Mustikki Frekv 1 Mansikki Mustikki Frekv 8

9 3 Kuva 3: Frekvenssit: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Frekv 3 nimi..txt using Frekv 9

10 1 Kuva : Määrät: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Maara 1 nimi..txt using Maara 1

11 Kuva 5: Määrät: Mansikki ja Mustikki 1 Mansikki Mustikki 1 8 kulutus

12 1 9 Kuva 6: Koko navetta nimi..txt using Fr 1 nimi..txt using Maara 1

13 5 Kuva 7: Frekvenssit: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Fr 5 nimi..txt using Fr 13

14 5 Kuva 8: Määrät: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Maara 5 nimi..txt using Maara 1

15 .5 Kuva 9: Määrien korrelogrammit: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Mansikin Korrelogrammi.15 nimi..txt using Mustikin Korrelogrammi 15

16 .3 Kuva 1: Frekvenssien korrelogrammit: Mansikki ja Mustikki nimi..txt using Mansikin Korrelogrammi.3 nimi..txt using Mustikin Korrelogrammi 16