Kliinisen mikrobiologian ja genetiikan tutkimukset. bakteriologia immunologia virologia genetiikka. UTULab

Koko: px
Aloita esitys sivulta:

Download "Kliinisen mikrobiologian ja genetiikan tutkimukset. bakteriologia immunologia virologia genetiikka. UTULab"

Transkriptio

1 Kliinisen mikrobiologian ja genetiikan tutkimukset bakteriologia immunologia virologia genetiikka UTULab

2 Toimittajat: Erkki Eerola Jukka Hytönen Merja Kuttila ISSN: Kirjapaino: Bookwell Oy, Porvoo 2012

3 UTULab:iin kuuluvat erilliset laboratoriot Turun yliopisto, lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia Turun yliopisto, virusoppi Turun yliopisto, lääketieteellinen genetiikka Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, Tartuntatautiseurannan- ja torjunnan osasto, Mikrobilääkeresistenssiyksikkö, mykobakteerilaboratorio Asiakasneuvoja Merja Kuttila puh , (02) Internet Postiosoite Kiinamyllynkatu Turku Asiakaspalaute: Turun yliopiston Lääketieteellisen mikrobiologian ja immunologian laboratorio (T148) ja Virusopin laboratorio (T255) sekä THL, mykobakteerilaboratorio (T077) täyttävät kansainvälisten standardien SFS-EN ISO/IEC asettamat pätevyysvaatimukset laboratorion toiminnalle. Finas akkreditointipalvelu (the Finnish Accreditation Service) on myöntänyt laboratorioillemme akkreditoinnin. Akkreditoinnin piiriin kuuluvat tutkimukset löytyvät Mittatekniikan keskuksen internet-sivulta 3

4 Turun yliopisto, lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia Osoite: Kiinamyllynkatu 13, Turku Puhelimet: Toimisto (02) , fax (02) Autoimmuunilaboratorio (02) Bakteerilaboratorio (02) Immunogenetiikan laboratorio (02) Immunokemiallinen laboratorio (02) Lymfosyyttilaboratorio (02) Näytteenottotarvikkeet, jakelu (02) Näytteiden käsittely (02) Näytteiden vastaanotto (02) Osastonhoitaja (02) PCR-laboratorio (02) Serologinen laboratorio (02) Suolistobakteerilaboratorio (02) Asiantuntijat: Diagnostisen palvelutoiminnan johtaja: LKT Erkki Eerola, dosentti, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, bakteeri ja PCR-tutkimukset. Puh. (02) , LT Jukka Hytönen, dosentti, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, bakteeriserologiset tutkimukset. Puh. (02) , LKT Jorma Ilonen, professori, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, immunogeneettiset tutkimukset. Puh. (02) , LKT Olli Lassila, professori, autoimmuuni-, komplementti- ja lymfosyyttitutkimukset. Puh. (02) , LT Arno Hänninen, dosentti, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, autoimmuuni-, komplementtija lymfosyyttitutkimukset. Puh. (02) , LKT Jussi Kantele, dosentti, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, autoimmuuni-, komplementtija lymfosyyttitutkimukset. Puh. (02) , 4

5 Turun yliopisto, Virusoppi Osoite: Kiinamyllynkatu Turku Puhelimet: Toimisto (02) Vastauskyselyt (02) Näytteiden vastaanotto (02) Telefax (02) Asiantuntijat: Diagnostisen palvelutoimen johtaja: LT Tytti Vuorinen, dosentti, kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri. Puh. (02) , FT Piritta Peri, erikoistuva sairaalamikrobiologi. Puh. (02) , LKT Veijo Hukkanen, professori, virusopin dosentti. Puh. (02) , FT Matti Waris, dosentti. Puh. (02) , 5

6 THL, Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, Tartuntatautiseurannan- ja torjunnan osasto, Mikrobilääkeresistenssiyksikkö, Mykobakteerilaboratorio Osoite: Kiinamyllynkatu 13, Turku Puhelimet: Vaihde Vastauskyselyt; Mykobakteerilaboratorio tai Telefax Asiantuntijat: Laboratorion johtaja: FT Hanna Soini, dosentti Puh , (privatel), FK Merja Marjamäki, erikoistutkija Puh , 6

7 Turun yliopisto, Lääketieteellinen genetiikka Osoite: Kiinamyllynkatu 10, Turku Puhelimet: Toimisto (02) Kromosomilaboratorio (02) , (02) DNA-laboratorio (02) Telefax (02) Asiantuntijat: Diagnostisen palvelutoimen johtaja: FT Johanna Schleutker, professori Puh. (02) , FT Maarit Lappalainen, sairaalageneetikko Puh. (02) , LT Marja Hietala, dosentti, perinnöllisyyslääketieteen erikoislääkäri Puh. (02) , 7

8 UTULab Mikrobiologia terveydenhuollon tarpeisiin täyden palvelun talosta Kliinisen mikrobiologian tutkimukset tähtäävät infektiotautien etiologian selvittämiseen ja elimistön immuunipuolustusjärjestelmän mittaamiseen. Molemmat alat ovat merkitykseltään lisääntyviä nykyaikaisessa terveydenhuollossa. Potilaita infektoivien mikrobien lajimäärä on suuri ja ala onkin jakautunut osa-alueisiin: bakteriologia, virologia, mykologia, parasitologia. Immunologian tietämystä tarvitaan kaikilla näillä osa-aloilla. Eri alojen tutkiminen vaatii erikoistuneita ja erillisiäkin laboratorioita, mutta asiakkaalle on tärkeää, että UTULabista saa koko mikrobiologisen tutkimusvalikoiman yhdestä lähetysosoitteesta. Tieteelliseen tutkimukseen perustuva osaamisemme immuunipuutoksista, komplementitsta ja autoimmuunitaudeista takaa hyvän diagnostiikan myös tällä osaalueella. Koska pyrimme tutkimusten korkeaan laatuun mahdollisimman edullisin kustannuksin, kehitämme jatkuvasti menetelmiämme ja keskinäistä työnjakoamme. Haluamme kehittää kaikkia mikrobiologian osa-aloja ja korostamme asiantuntijuuden ja tieteelliseen tutkimukseen perustuvan tuotekehittelyn merkitystä. UTULab vastaa siitä, että lähetty näyte tutkitaan ajanmukaisin menetelmin. Tästä UTULabin ohjekirjasta löydätte kaikki eri laboratorioiden tekemät tutkimukset. Tiedämme, että ennen kuin laboratoriotutkimus vaikuttaa potilaan tutkimus- ja hoitoprosessiin tarvitaan usein yksityiskohtaistakin tietoa tutkimuksen perusteista ja tulkinnasta. Koko UTULabin henkilökunta haluaa palvella tehokkaamman potilashoidon hyväksi luovuttamalla tietonsa ja taitonsa käytettäväksenne. UTULabin puolesta Erkki Eerola Diagnostisen palvelutoimen johtaja Turun yliopisto UTULab Lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia 8

9 Sisällysluettelo UTULab:iin kuuluvat erilliset laboratoriot...3 Turun yliopisto, lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia...4 Turun yliopisto, Virusoppi...5 THL, Terveyden ja hyvinvoinnin laitos, Tartuntatautiseurannan- ja torjunnan osasto, Mikrobilääkeresistenssiyksikkö, Mykobakteerilaboratorio...6 Turun yliopisto, Lääketieteellinen genetiikka...7 UTULab...8 Mikrobiologia terveydenhuollon tarpeisiin täyden palvelun talosta...8 Sisällysluettelo...9 Yleistä mikrobiologisista tutkimuksista...18 Näytteiden lähetysohjeet...19 Näytteiden ottaminen...20 Leukosyytti- ja lymfosyyttinäytteet...20 Bakteriologiset näytteet...20 Serologiset näytteet...21 Virologiset näytteet...23 Virologisten näytteiden säilytys ja lähettäminen...24 Virologisten tutkimusten valitseminen ja lähetteen täyttäminen...25 Oireenmukainen suositus virologisten näytteiden ottamisesta...25 Bakteeri-PCR-näyteohjeet...29 Virus-PCR-näyteohjeet...30 Tutkimusmenetelmät...31 Bakteriologiset tutkimukset...31 Autoimmuunitutkimukset...31 Immunogeneettiset tutkimukset...32 Komplementtitutkimukset...33 S-CH100 tuloksen tulkinta**...33 Lymfosyytti- ja leukosyyttitutkimukset...35 Bakteeriserologiset tutkimukset...35 Virologiset tutkimukset...36 Yleistä genetiikan tutkimuksista...39 Tutkimukset aakkosjärjesteyksessä

10 ADENOVIRUS, ANTIGEENI (NENÄNIELUERITTEESTÄ)...43 ADENOVIRUS, ANTIGEENI (ULOSTEESTA)...44 ADENOVIRUS, IgG VASTA-AINEET...44 ADENOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...45 ADENOVIRUS, PIKAVILJELY...46 Akondroplasia (ACH), FGFR3-geenin GLY380ARG-mutaation tutkimus...47 Alfasarkoglykanopatia (LGMD2D), SGCA-geenin ARG77CYS-mutaation tutkimus...47 ALFA-THALASSEMIA-MENTAL-RETARDATION (ATRX), ATRX-GEENIN OSITTAINEN SEKVENSOINTI...48 AMINOGLYKOSIDIEN AIHEUTTAMA KUUROUS, MT-RNR1-GEENIN 1555G>A-MUTAATION TUTKIMUS...49 Amyotrofinen lateraaliskleroosi (ALS), D90A-mutaation tutkimus...50 Amyotrofinen lateraaliskleroosi (ALS), SOD1-geenin sekvensointi...50 ANGELMANIN OIREYHTYMÄ (AS), 15q11-q13-ALUEEN METYLAATIO- JA KOPIOLUKUANALYYSI...51 S ANTISTAFYLOLYSIINI...52 ANTISTREPTOLYSIINI...53 ASPERGILLUS, ANTIGEENIOSOITUS...53 ASPERGILLUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS...54 BAKTEERIN LAJIMÄÄRITYS PCR-TUOTTEEN SEKVENSOINNILLA...56 BAKTEERIN LAJIMÄÄRITYS (AEROBIBAKTEERI, ANAEROBIBAKTEERI)...56 BAKTEERIN NUKLEIINIHAPON OSOITUS (BAKTEERI-PCR)...57 B-MUISTISOLUT...58 BOKAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...59 BORDETELLA PERTUSSIS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...60 BORDETELLA PERTUSSIS, VASTA-AINEET...61 BORDETELLA PERTUSSIS, VILJELY...62 BORRELIA BURGDORFERI, VASTA-AINEET...63 BORRELIA BURGDORFERI, VASTA-AINEET, jatkotutkimus...64 BORRELIA BURGDORFERI, VASTA-AINEET, laaja...65 BORRELIA, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...66 BRUCELLA, VASTA-AINEET...67 C1-ESTERAASIN INHIBIITTORI, AKTIIVISUUS...67 C1-ESTERAASIN INHIBIITTORI, PITOISUUS...69 CADASIL, Notch3-geenin Arg133Cys-, arg182cys- ja tyr1069cys-mutaatioiden tutkimus...70 CADASIL, Notch3-geenin osittainen sekvensointi...71 Charcot-Marie-Tooth 1 ja HNPP, PMP22-geenin mutaatioiden tutkimus...71 Charcot-Marie-Tooth 1 -tauti, CMT1C, LITAF-geenin mutaatioiden tutkimus..72 Charcot-Marie-Tooth 1A -tauti, 17p11.2 -alueen kopioluvun määritys...73 Charcot-Marie-Tooth 2 -tauti, CMT2A, MFN2-geenin mutaatioiden tutkimus..74 Charcot-Marie-Tooth 1 ja 2 -taudit, P0-geenin mutaatioiden tutkimus

11 Charcot-Marie-Tooth -tauti (X-kromosomaalinen), CMTX, Cx32-geenin (GJB1) mutaatioiden tutkimus...75 CHARGE-OIREYHTYMÄ, CHD7-GEENIN SEKVENSOINTI...76 CHLAMYDIA PNEUMONIAE, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...77 CHLAMYDIA PNEUMONIAE, VASTA-AINEET...78 CHLAMYDIA TRACHOMATIS, IgG VASTA-AINEET...79 CHLAMYDIA TRACHOMATIS, VILJELY...79 CLOSTRIDIUM DIFFICILE GENOTYYPITYS...80 CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE, NUKLEIINIHAPON OSOITUS...81 CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE, VASTA-AINEET...82 DNA-eristys...83 Denys-Drash-oireyhtymä, WT1-geenin yleisimpien mutaatioiden tutkimus...83 DRPLA-tauti, atrofiini 1 -geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus...84 DIFTERIAVILJELY...85 DNAd, VASTA-AINEET (DENATUROITU)...85 DNA, VASTA-AINEET (NATIIVI)...86 DOMINANTTI OPTIKUSATROFIA (doa/opa1), OPA1-geenin MUTAATIOANALYYSI...87 Duchennen ja Beckerin lihasdystrofiat, dystrofiinigeenin MLPA-tutkimus Dystrofia myotonica 1 (DM1), DMPK-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus...89 Dystrofia myotonica 2 (DM2), ZNF9-geenin PCR-seulontatutkimus...90 ENA- JA TUMAVASTA-AINEIDEN ANALYYSI...91 ENDOMYSIUM, VASTA-AINEET...92 ENTEROVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) PICORNAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR)...93 ENTEROVIRUS, VASTA-AINEET...94 ENTEROVIRUS, VILJELY katso VIRUSVILJELY (2975)...95 EPSTEIN-BARR VIRUS (EBV), NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR), KVANTITATIIVINEN...95 EPSTEIN-BARR-VIRUS, VASTA-AINEET...96 Fabryn tauti, GLA-geenin mutaatioiden tutkimus...96 FISH-tutkimus, aneuploidia...97 fish-tutkimus kroonisessa lymfaattisessa leukemiassa...98 fish-tutkimus multippelissa myeloomassa...98 Fragiili X -oireyhtymä, DNA-tutkimus...99 FRANCISELLA TULARENSIS, VASTA-AINEET Friedreichin ataksia (FRDA), frataksiinigeenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus GLIADIINIPEPTIDI, VASTA-AINEET, IgA ja IgG GLOMERULUSTYVIKALVO, VASTA-AINEET GLUTAMAATTIDEKARBOKSYLAASI (GAD), VASTA-AINEET GONOKOKKIVILJELY HAE-TUTKIMUS Haurashermo-oireyhtymä (HNPP), 17p11.2-alueen kopioluvun määritys HELICOBACTER PYLORI, ANTIGEENITESTAUS ULOSTEESTA

12 HELICOBACTER PYLORI, IgG VASTA-AINEET HELICOBACTER PYLORI, VILJELY HEMATOLOGINEN FISH-TUTKIMUS SEURANTANÄYTTEESTÄ hematologinen kromosomitutkimus verestä hematologinen tai onkologinen kromosomitutkimus kudoksesta hematologisen potilaan diagnoosivaiheen fish-tutkimus hematologisen potilaan kimerismitutkimus HEPATIITTI A-VIRUS, VASTA-AINEET HEPATIITTI B-VIRUSTUTKIMUKSET HEPATIITTI C-VIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR), KVALITATIIVINEN HEPATIITTI C-VIRUS, VASTA-AINEET HEPATIITTI C-VIRUS, VASTA-AINEET, VARMISTUS HERPES SIMPLEX-VIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) HERPES SIMPLEX-VIRUS, PIKAVILJELY HERPES SIMPLEX-VIRUS, VASTA-AINEET HERPES SIMPLEX-VIRUS 1 JA 2, VASTA-AINEET Li-HERPESVIRUKSET, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) HERPESVIRUS 6 (HHV-6), NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) HERPESVIRUS 6, VASTA-AINEET HISTONI, VASTA-AINEET HI-VIRUS, VASTA-AINEET HI-VIRUS, VASTA-AINEET, VARMISTUS (seulottu näyte) B-HLADRDQ tautiassosiaatiotutkimus HLA-TAUTIASSOSIAATIOTUTKIMUS, KELIAKIA HLA-TAUTIASSOSIAATIOTUTKIMUS, IDDM HLA-TAUTIASSOSIAATIOTUTKIMUS, NARKOLEPSIA-DR HSP-70 VASTA AINEET, IMMUNOBLOTTAUS HUMAN HERPES VIRUS 7, VASTA-AINEET HUMAN T-CELL LEUCEMIA VIRUS, VASTA-AINEET Huntingtonin tauti (HD), IT-15-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Huntingtonin tauti 2 (HDL2), JPH3-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Hyperkaleeminen periodinen paralyysi (HYPP), SCN4A-geenin mutaatioiden tutkimus Hyperornitinemia-gyrata-atrofia (HOGA), OAT-geenin Leu402Pro- ja arg180thr-mutaatioiden tutkimus HYPOKALEEMINEN PERIODINEN PARALYYSI (HOKPP), CACNA1S- JA SCN4A-GEENIEN OSITTAINEN SEKVENSOINTI Hypokondroplasia (HCH), FGFR3-geenin Asn540lys-mutaation tutkimus IBD-TUTKIMUS IHON EPITEELIN TYVIKALVON VASTA-AINEET IHON EPITEELIN VÄLIAINEEN VASTA-AINEET IMMUNOGLOBULIINI G, ALALUOKAT IMMUNOGLOBULIINI G

13 IMMUNOKOMPLEKSIT (PIPA) Incontinentia pigmenti (IP), NEMO-geenin deleetiovaltamutaation tutkimus INFLUENSSA A-VIRUS, ANTIGEENI INFLUENSSA A-VIRUS IgG, VASTA-AINEET INFLUENSSA B-VIRUS, ANTIGEENI INFLUENSSA B-VIRUS IgG, VASTA-AINEET INFLUENSSAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) INFLUENSSAVIRUS, PIKAVILJELY KAMPYLOBAKTEERI, VASTA-AINEET KAMPYLOBAKTEERIVILJELY KARDIOLIPIINI (LUES), VASTA-AINEET LIKVORISTA KELIAKIATUTKIMUS KEMOTAKSIS JA KEMILUMINESENSSI Kennedyn oireyhtymä (SBMA), AR-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus KIIRE-VZV KOMPLEMENTIN AKTIVAATIOTUTKIMUS KOMPLEMENTTI C1q, C1r, C1s, PITOISUUS KOMPLEMENTTI C1q, VASTA-AINEET KOMPLEMENTTI C2, PITOISUUS KOMPLEMENTTI C3 + AKTIVAATIOTUOTTEET (C3d) KOMPLEMENTTI C3 JA C4, PITOISUUDET KOMPLEMENTTI C4 + AKTIVAATIOTUOTTEET (C4d) KOMPLEMENTTI FAKTORI B + AKTIVAATIOTUOT-TEET (Bb) KOMPLEMENTTI FAKTORI B, PITOISUUS KOMPLEMENTTI, KOKONAISAKTIIVISUUS (KLASSINEN, VAIHTOEHTOINEN JA LEKTIINITIE) KOMPLEMENTTI C5, C6, C7, C8, C9, PITOISUUDET KOMPLEMENTIN PUUTOSTUTKIMUS KOMPLEMENTTI, SC5b-9-KOMPLEKSI KORONAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) Kraniosynostoosit, FGFR2-geenin valtamutaatioiden tutkimus KROMOSOMIEN MIKRODELEETIOIDEN FISH-tutkimus KROMOSOMIEN MIKRODELEETIO Fish-tutkimus muusta kudoksesta kuin VERESTÄ kromosomitutkimus ihonäytteestä kromosomitutkimus istukkapalanäytteestä kromosomitutkimus LUUYTIMESTÄ kromosomitutkimus verestä KUDOSANTIGEENI B KUDOSNESTEEN KOMPLEMENTTITUTKIMUKSET KUDOSTRANSGLUTAMINAASI, VASTA-AINEET KUDOSVASTA-AINEET LAKTOOSIMALABSORPTIOON LIITTYVÄ GEENI-MUUTOS

14 Leberin perinnöllinen näköhermotauti (LHON), valtamutaatioiden tutkimus LEGIONELLA PNEUMOPHILA, NUKLEIINIHAPON OSOITUS LEGIONELLA, VASTA-AINEET LEGIONELLA, VILJELY LEUKOSYYTIT, FAGOSYTOINTIKYKY JA SOLUNSISÄINEN TAPPO LISTERIA, VASTA-AINEET LISÄMUNUAINEN, VASTA-AINEET Lyhytkasvuisuusoireyhtymät, FGFR3-geenin mutaatioiden tutkimus LYMFOSYYTTIEN CMV-TETRAMEERIPOSITIIVISET SOLUT LYMFOSYYTTIEN PHA STIMULAATIO LYMFOSYYTTIEN CON-A STIMULAATIO LYMFOSYYTTIEN PWM STIMULAATIO LYMFOSYYTTIEN PINTAMARKKERIT/ALALUOKAT LYMFOSYYTTIEN PPD STIMULAATIO Lysinurinen proteiini-intoleranssi (LPI), SLC7A7-geenin sekvensointi Lysinurinen proteiini-intoleranssi (LPI), suomalaisen valtamutaation tutkimus MAKSA- JA MUNUAISMIKROSOMI, VASTA-AINEET MANNOOSIA SITOVA LEKTIINI, GEENITUTKIMUS MANNOOSIA SITOVA LEKTIINI, PITOISUUS MELAS-oireyhtymä, mitokondriaalisen DNA:n valtamutaation tutkimus MERRF-oireyhtymä, mitokondriaalisen DNA:n valtamutaation tutkimus METAPNEUMOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) METISILLIINI-RESISTENTIN STAPHYLOCOCCUS AUREUKSEN (MRSA) VILJELY Mitokondriaalinen resessiivinen ataksiaoireyhtymä (MIRAS) Mitokondriaalisen DNA:n rakennemuutosten tutkimus kudoksesta Mitokondriaaliset enkefalopatiat (MERRF, MELAS, NARP) MITOKONDRIO, VASTA-AINEET moniväri-fish-tutkimus käyttäen kaikkien kromosomien maalauskoettimia Muenken oireyhtymä, FGFR3-geenin Pro250arg-mutaation tutkimus muu fish-tutkimus synnynnäisten muutosten selvittämiseksi MxA-PROTEIININMÄÄRITYS PERIFEERISEN VEREN VALKOSOLUISTA MYCOPLASMA PNEUMONIAE, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) MYCOPLASMA PNEUMONIAE, VASTA-AINEET MYELOPEROKSIDAASI, VASTA-AINEET MYKOBAKTEERI, HERKKYYSMÄÄRITYS MYKOBAKTEERI-IDENTIFIKAATIO MYKOBAKTEERI, NUKLEIINIHAPON OSOITUS Mykobaktericum tuberculosis herkistyneet solut, gammainterferoni, ERITTÄVÄT SOLUT, VERESTÄ Mykobaktericum tuberculosis herkistyneet solut, gammainterferoni, eritys MYOSIITTITUTKIMUS

15 MÄRKÄVILJELY 1, AEROBINEN JA ANAEROBINEN VILJELY MÄRKÄVILJELY 2, AEROBINEN VILJELY NARP-oireyhtymä, mitokondriaalisen DNA:n valtamutaatioiden tutkimus NATALIZUMABI, VASTA-AINEET S-NEURO1, Li-NEURO1, VASTA-AINEET S-NEURO2, Li-NEURO2, VASTA-AINEET NEUTROFIILIEN SYTOPLASMA-ANTIGEENI, VASTA-AINEET NIELUVILJELY NOCARDIAVILJELY NOROVIRUS, ANTIGEENI (ULOSTEESTA) Okulofaryngeaalinen lihasdystrofia (OPMD) PARAINFLUENSSAVIRUS, ANTIGEENI PARAINFLUENSSAVIRUS, PIKAVILJELY PARAINFLUENSSAVIRUS 1 JA 3 IgG, VASTA-AINEET PARAINFLUENSSAVIRUS 2 IgG, VASTA-AINEET Paramyotonica congenita (PMC) PARIETAALISOLU, VASTA-AINEET PARVOROKKOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) PARVOROKKOVIRUS, VASTA-AINEET PDT, VASTA-AINEET (PERTUSSIS, DIFTERIA, TETANUS) Perinnöllinen etenevä alaraajahalvaus (SPG4), SPAST-geenin mutaatioiden tutkimus Perinnöllinen kuulovammaisuus, Cx26-geenin (GJB2) mutaatioiden tutkimus PNEUMOCYSTIS CARINII, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) PNEUMOKOKKIPOLYSAKKARIDI, VASTA-AINEET Polykystinen munuaistauti (autosomaalinen resessessiivinen, ARPKD), PKHD1-geenin SUOMALAISTEN VALTAMUTAATIOIDEN tutkimus Prader-Willi-oireyhtymä (PWS), 15q11-q13-alueen metylaatio- ja kopiolukuanalyysi prometafaasikromosomitutkimus verestä F-POLIOVIRUS, VILJELY POLYOMAVIRUS (JCV, BKV), NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) KVANTITATIIVINEN PROPERDIINI, PITOISUUS PROTEINAASI 3, VASTA-AINEET PUUMALAVIRUS, VASTA-AINEET PUUTIAISAIVOKUUMEVIRUS, VASTA-AINEET RESPIRATORISTEN VIRUSTEN ANTIGEENIT RESPIRATORISET VIRUKSET, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS, ANTIGEENI RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS, PIKAVILJELY RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS IgG, VASTA-AINEET REUMAFAKTORI, IgM REUMATUTKIMUS

16 RINOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) PICORNAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) ROTAVIRUS, ANTIGEENI SACCHAROMYCES CEREVISIAE, VASTA-AINEET SALMONELLA, VASTA-AINEET SALMONELLAVILJELY, SALMONELLATYYPITYS SARS-KORONAVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) SENTROMEERI, VASTA-AINEET SHIGELLAVILJELY sikiön kromosomitutkimus istukkanäytteestä sikiön kromosomitutkimus lapsiveden soluista SIKOTAUTIVIRUS, VASTA-AINEET SILEÄLIHAS, VASTA-AINEET SINDBIS VIRUS, VASTA-AINEET SITRULLIINIPEPTIDI, VASTA-AINEET Sotosin oireyhtymä, NSD1-geenin deleetiotutkimus (MLPA) Sotosin oireyhtymä, NSD1-geenin mutaatioiden tutkimus Spinaalinen lihasatrofia (SMA), SMN1-geenin deleetion PCR-tutkimus Spinaalinen lihasatrofia (SMA), kantajuustutkimus Spinoserebellaariataksia 1 (SCA1), ATXN1-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 10 (SCA10), ATXN10-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 12 (SCA12), PPP2R2P-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 17 (SCA17), TBP-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 2 (SCA2), ATXN2-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 3 (SCA3), ATXN3-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 6 (SCA6), CACNL14A-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 7 (SCA7), ATXN7-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus Spinoserebellaariataksia 8 (SCA8), ATXN8/ATXN8OS-geenin toistojaksoalueen ekspansion tutkimus STREPTOKOKKI DNAASI, VASTA-AINEET SYTOMEGALOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) SYTOMEGALOVIRUS NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR), KVANTITATIIVINEN SYTOMEGALOVIRUS, PIKAVILJELY SYTOMEGALOVIRUS, VASTA-AINEET Tanatoforinen dysplasia (TD), FGFR3-geenin yleisimpien mutaatioiden tutkimus TEIKKOHAPPO, VASTA-AINEET

17 telomeeri-fish-tutkimus TETANUS (CLOSTRIDIUM TETANI), VASTA-AINEET Torsiodystonia 1 (ITD), DYT1-geenin valtamutaation tutkimus TOXOPLASMA, VASTA-AINEET TREPONEMA PALLIDUM, FTA-absorptio TREPONEMA PALLIDUM HEMAGGLUTINAATIO (TPHA) LIKVORISTA TREPONEMA PALLIDUM, VASTA-AINEET SEERUMISTA trisomia PCR-tutkimus TROMBOSYYTTI, VASTA-AINEET TSH-RESEPTORI, VASTA-AINEET TUHKAROKKOVIRUS, VASTA-AINEET Tunnetun DNA-mutaation tutkimus TUMA, LIUKOISET ANTIGEENIT, VASTA-AINEET TUMA, VASTA-AINEET TUMA, VASTA-AINEET, IMMUNOBLOTTAUS TUMA, VASTA-AINEET, TYYPITYS TYREOIDEAPEROKSIDAASI (TPO), VASTA-AINEET TYREOIDEA, VASTA-AINEET 1 JA Tyrosinemia 1, FAH-geenin valtamutaatioiden tutkimus TYYPIN 1 DIABETEKSELLE ALTISTAVAN PERINNÖLLISEN RISKIN MÄÄRITYS ULOSTEEN ENTEROHEMORRAAGINEN E. COLI- TOKSIINI ULOSTEEN ENTEROHEMORRAAGINEN E. COLI- VILJELY ULOSTEVILJELY 1, ULOSTEVILJELY 2, ULOSTEVILJELY UREAPLASMA UREALYTICUM, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) VANKOMYSIINIRESISTENTIN ENTEROKOKIN (VRE) SEULONTA ULOSTEESTA VESIROKKOVIRUS, ANTIGEENI VESIROKKOVIRUS, NUKLEIINIHAPON OSOITUS (PCR) VESIROKKOVIRUS, VASTA-AINEET VIHURIROKKOVIRUS, VASTA-AINEET viljeltyjen fibroblastien pakastus solupankkiin VIRTSAVILJELY; SEULONNAN POSITIIVINEN, PORRASTETTU (TYYPITYS JA HERKKYYSMÄÄRITYS) VIRUS, VILJELY YERSINIA, VASTA-AINEET YERSINIAVILJELY Y-kromosomin mikrodeleetion tutkimus YSKÖSVILJELY Lyhenteiden mukainen aakkosjärjestys Kuntaliittonumero ja lyhenne Tutkimukset ryhmittäin

18 Yleistä mikrobiologisista tutkimuksista Päteväksi todettu laboratorio Turun yliopiston lääketieteellisen mikrobiologian ja immunologian laboratorio ja virusopin laboratorio sekä THL, mykobakteerilaboratorio ovat FINAS akkreditointipalvelun akkreditoimia laboratorioita, jotka täyttää kansainvälisen EN ISO/IEC standardin pätevyysvaatimukset laboratorion toiminnalle (http://www.finas.fi). Mikrobiologisen ja immunologisen diagnostiikan osaaminen perustuu tutkimukseen Bakteriologiset, virologiset ja immunologiset tutkimukset sekä autoimmuunitautien diagnostiikka muodostavat UTULab:iin kuuluvien laboratorioiden palvelutoiminnan rungon. Pitkät tutkimusperinteet ovat tehneet laboratorioista mikrobiologian, virologian ja immunologian alan eturivin tutkimuslaboratorioita, joiden saavutukset tunnetaan kansainvälisesti. Kattava tutkimusvalikoima Tutkimusvalikoimamme sisältää kaikki merkittävät kliiniset mikrobiologiset ja immunologiset tutkimukset. Bakteriologiset tutkimukset Virologiset tutkimukset Infektioserologiset tutkimukset Autoimmuunitutkimukset Immunogeneettiset tutkimukset Komplementtitutkimukset Lymfosyytti- ja leukosyyttitutkimukset Menetelmien kehittäminen Laboratorioiden tieteellinen tutkimustoiminta liittyy läheisesti infektiodiagnostiikkaan. Useat tutkimustoiminnan yhteydessä kehitetyt menetelmät ovat suoraan sovellettavissa kliinisten näytteiden analyysiin. Kansainvälinen laaduntarkkailu UTULab:ssa toimivat diagnostiset laboratoriot ovat kaikkien eri tutkimusalueiden osalta mukana kansainvälisissä laaduntarkkailuohjelmissa. Toistuvasti lähetettävillä sokkonäytteillä testataan tulosten oikeellisuutta. Erikoislääkäreiden koulutuslaboratorio UTULab toimii sekä lääketieteen opiskelijoiden että kliiniseen mikrobiologiaan erikoistuvien lääkäreiden koulutuspaikkana. Konsultaatiot aina saatavilla Asiakas voi kysyä minkä tahansa näytteen alustavaa tulosta tai vastauksen tulkintaa laboratorioistamme joko puhelimitse tai telefaxilla. Kustakin osa-alueesta vastaavat erikoislääkärit ovat tavoitettavissa virka-aikana joka päivä. 18

19 Näytteiden lähetysohjeet Näytteiden vastaanotto on avoinna ma pe klo Otamme näytelähetyksiä vastaan myös lauantaisin ympäri vuoden. Matkahuollon kautta Turkuun tulevat näytteet toimitetaan automaattisesti laboratorioon. Postilähetykset Kaikki näytteet voidaan lähettää ns. vastauslähetyksinä, jolloin vastaanottaja maksaa ykkösluokan postimaksun. Emme vastaa erikoislähetysten postikuluista. Tietoja laboratorionäytteiden lähettämisestä postitse löytyy Itellan nettisivuilta: Lähetteet Käytössämme on lähetteet erikseen seuraaville tutkimustyypeille: virologiset tutkimukset, bakteeritutkimukset, mykobakteeritutkimukset, immunologiset tutkimukset, genetiikan DNA- ja kromosomitutkimukset. Lähetteitä voi tilata numeroista (02) (bakteerilähetteet ja immunologiset lähetteet), (02) (virologiset lähetteet), (02) (mykobakteerilähetteet) ja (02) tai (02) (genetiikan tutkimukset). Lähetteet ovat myös tulostettavissa internet-sivuiltamme. Näytteiden lähetystarvikkeet Näytteiden ottamiseen tarvittavia maksuttomia näytteenottovälineitä ja kuljetustarvikkeita voi tiedustella puhelimitse numeroista: Lääketieteellinen mikrobiologia ja immunologia (02) kuljetusputki, bakteeriviljely - ulostepurkki - pertussis-paketti (vinoagarpurkki, PCR-putki ja tikku, ohjeet) - seerumin erotteluputki - lähetyskotelot Virusoppi (02) virusviljelyputki - sytomegaloviruksen kuljetusnesteputki - klamydiaviljelyn kuljetusnesteputki - lähetyskotelot Lääketieteellinen genetiikka (02) lähetyskotelot Tulosten ilmoittaminen Tulokset ilmoitetaan postitse lähetettävillä vastauskaavakkeilla. Kiireellistä vastaamista edellyttävät näytteet vastataan aina puhelimitse tai faxilla. Jos asiakas on pyytänyt lähetteessä ennakkovastausta, ilmoitetaan se puhelimitse. Laboratoriossamme on käytössä HL7-järjestelmä, joka mahdollistaa näytepyyntöjen ja vastausten suoran välityksen ATK:lla. 19

20 Näytteiden ottaminen Leukosyytti- ja lymfosyyttinäytteet Laskimoverinäyte otetaan normaaliin tapaan hepariiniputkeen. Useimpiin tutkimuksiin 10 ml on hyvin riittävä näytemäärä. Mm. lymfosyyttien mitogeenisti-mulaatioiden ja lymfosyyttien alaluokkatutkimusten kohdalla huomattavasti pienempikin näytemäärä (n. 1 ml) riittää mahdollistaen esim. pienten lasten tutkimukset. IgG:n alaluokkien tutkimusta varten voidaan lähettää seerumia (n. 1 ml). Hepariiniverinäytteet toimitetaan laboratorioon huoneenlämmössä. Tämä on tärkeää, koska esim. jäätyminen tuhoaa tutkittavat solut. Bakteriologiset näytteet Tapoja on kolme, jotka on esitetty paremmuusjärjestyksessä. 1. Suora viljely Menetelmä on nopein ja tehokkain. Näytteen kasvunestotekijät eivät jää häiritsemään, koska näyte laimenee viljeltäessä. Haittana on se, että suoran viljelyn käyttäminen vaatii toimivan elatusainehuollon ja viljelyjärjestelmän. Maljat säilytetään jääkaapissa ja otetaan ennen käyttöä muutamaksi tunniksi huoneenlämpöön niin, että liiallinen kosteus poistuu. Maljojen esilämmittäminen lämpökaapissa on tarpeetonta. Huoneenlämmössä maljat voivat olla vuorokauden. Tarkasta ennen viljelyä, ettei maljassa ole kasvua, ettei se ole kuivunut ja ettei se ole jäätynyt (pinta rosoinen). Näyte hajotetaan maljalle pumpulitikulla tai kertakäyttöisellä silmukalla. Kun malja on viljelty, on inkubointi aloitettava välittömästi. Esimerkkejä suoran viljelyn käyttämisestä Näyte Elatusaineet Huomattavaa Gc Silmä New York City -agar Suklaa- ja veriagar Hiilidioksidiin Suklaamalja hiilidioksidiin, ota näyte suoraan silmukalla Virtsa CLED-agar tai Uricult CLED:lle kvantitatiivinen viljely silmukalla Nielu Hinkuyskä Veriagar tai Streptocult Hiili-kefaleksiiniagar Mikäli käytät suoraa viljelyä, muista lähettää kaksi ilmakuivattua värjäyslasia, koska niitä ei voi tehdä enää jälkeenpäin viljellyistä näytteistä. 2. Näyte sellaisenaan on kohtuullisen hyvä tapa lähettää näyte. Lähettämiseen käy puhdas ja steriili, kuiva lasiputki. Edellytyksenä on, että näyte voidaan toimittaa nopeasti, käytännössä saman työpäivän aikana, laboratorioon. Yleensä näytteen jäähdyttäminen parantaa säilyvyyttä (likvor ei saa jäähtyä). Haittana on, että kasvunestotekijät jäävät vaikuttamaan näytteeseen ja bakteerien elävyys huononee koko ajan. Agaria sisältävät lagenulat (esim. Portagerm) säilyttävät myös anaerobeja bakteereja. 20

21 3. Kuljetusputki on edellisten korvike. Sitä täytyy käyttää silloin kun näytemäärä on pieni ja sopivaa suoraa viljelymenetelmää ei ole käytettävissä. Putki säilyttää useita bakteereja hyvin; ei kuitenkaan kaikkia. Neisseriat säilyvät huonosti, toisaalta enterobakteerit pyrkivät kasvamaan säilytyksen aikana. Yleensä kuljetusputki voidaan säilyttää näytteenoton jälkeen jääkaappilämpötilassa, toisaalta näyte on parempi ottaa vasta silloin kun se voidaan myös lähettää eteenpäin. Viljelemätön putki säilytetään huoneenlämmössä. Mikäli panet näytteen kuljetusputkeen, muista lähettää erillinen värjäyslasi, koska tikkunäytteistä ei voi jälkeenpäin tehdä värjäyksiä. Serologiset näytteet Vasta-ainetutkimuksia varten seerumia tarvitaan 1 ml, tarvittaessa esim. lapsilta riittää pienempikin määrä (0.5 ml). Näytteet kestävät säilytystä +4 C:ssa tai huoneenlämpötilassa useita päiviä. Ne voidaan toimittaa laboratorioon normaalia postia käyttäen. 21

Mitä virustutkimuksia lastenlääkäri haluaa? Harri Saxén HUS/LKL

Mitä virustutkimuksia lastenlääkäri haluaa? Harri Saxén HUS/LKL Mitä virustutkimuksia lastenlääkäri haluaa? Harri Saxén HUS/LKL Kuumeinen 11 v poika edellisenä iltana (23.10. 2009) alkanut korkea kuume ei nuhaa tai yskää ei matkoja väsynyt ja korkeakuumeinen (39.6C)

Lisätiedot

Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin

Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin Pu-BaktVi2 (3492) Ps-StrVi (2703) Fl-StrBVi (1729) - MRSAVi (4358) - ESBLVi (4817) - CandVI (1628) - SienVi (2631) - GcVi (1506) -MDRsVi (8589) Ts-HepyVi

Lisätiedot

Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Virukset laaja lista

Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Virukset laaja lista 1 (8) Merkintöjen selitys N:ro Nimet Lääkärin ilmoitus Mikrobin tunnus. Tunnus on luku väliltä 1000 _ 9999, lisäksi tunnukseen on liitetty kaksinumeroinen tarkistusosa. Tartuntatauti-ilmoituslomakkeeseen

Lisätiedot

TÄRKEIMMÄT AUTOVASTA-AINEET JA NIIDEN MÄÄRITTÄMINEN

TÄRKEIMMÄT AUTOVASTA-AINEET JA NIIDEN MÄÄRITTÄMINEN TÄRKEIMMÄT AUTOVASTA-AINEET JA NIIDEN MÄÄRITTÄMINEN LABORATORIOLÄÄKETIEDE 2014 AARO MIETTINEN BAKTERIOLOGIAN JA IMMUNOLOGIAN OSASTO, HAARTMAN-INSTITUUTTI, HY Mikä tutkimus on tärkeä? - Tärkeä diagnostiikassa,

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY T070 Liite 1.03 / Appendix 1.03 Sivu / Page 1(13) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY YHTYNEET MEDIX LABORATORIOT OY UNITED MEDIX LABORATORIES LTD Tunnus Code Organisaatio Organisation

Lisätiedot

SELKÄYDINNESTEEN PERUSTUTKIMUKSET

SELKÄYDINNESTEEN PERUSTUTKIMUKSET Käyttöönottopäivä: 21.11.2011 1 (5) SELKÄYDINNESTEEN PERUSTUTKIMUKSET Atk-numero ja -lyhenne 1154 Li-BaktVi 1470 Li-Gluk 2186 Li-Laktaat 2514 Li-Prot 2655 Li-Solut 4059 Li-Syto Likvorin irtosolututkimus

Lisätiedot

Jukka Hytönen Kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri UTULab Bakteeriserologia

Jukka Hytönen Kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri UTULab Bakteeriserologia Bordetella pertussis Laboratorion näkökulma Jukka Hytönen Kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri UTULab Bakteeriserologia SIDONNAISUUDET Asiantuntija Labquality Ammatinharjoittaja Mehiläinen Apurahoja:

Lisätiedot

VIERITESTI VAI SPESIFIT VASTA-AINEET Jukka Suni

VIERITESTI VAI SPESIFIT VASTA-AINEET Jukka Suni EBV-infektio VIERITESTI VAI SPESIFIT VASTA-AINEET Jukka Suni KLIINISIÄ LÖYDÖKSIÄ I SUURENTUNEET IMUSOLMUKKEET KLIINISIÄ LÖYDÖKSIÄ II KATTEISET NIELURISAT NIELUN VERENPURKAUMAT KLIINISIÄ LÖYDÖKSIÄ III

Lisätiedot

Mikrobiologian diagnostiikan uudet tuulet

Mikrobiologian diagnostiikan uudet tuulet Mikrobiologian diagnostiikan uudet tuulet Alueellinen mikrobiologian ja infektioiden torjunnan toimintayksikön koulutuspäivä 21.10.2014 Sairaalamikrobiologi Kerttu Saha Uudet PCR-tutkimukset Mikrobiologian

Lisätiedot

Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua

Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua Johdanto kliinisesti merkittäviin bakteereihin Miksi kliininen bakteriologia on tärkeää? Bakteerien luokittelusta Bakteeri-infektiot Patogeeni Tartunnanlähde Ennaltaehkäisy Bakteriologista diagnostiikkaa

Lisätiedot

Laboratorion merkitys infektioiden diagnostiikassa. Risto Vuento Laboratoriokeskus PSHP

Laboratorion merkitys infektioiden diagnostiikassa. Risto Vuento Laboratoriokeskus PSHP Laboratorion merkitys infektioiden diagnostiikassa Risto Vuento Laboratoriokeskus PSHP Mikrobin ja ihmisen suhde Hyödylliset mikrobit, henkilön oma mikrobisto (ns. normaalifloora) Käsitteellä infektiotauti

Lisätiedot

Labqualitypäivät 04.02.10 Riitta Karttunen. HUSLAB, kl. Mikrobiologia Virologian ja immunologian osasto

Labqualitypäivät 04.02.10 Riitta Karttunen. HUSLAB, kl. Mikrobiologia Virologian ja immunologian osasto Syfiliksen laboratoriodiagnostiikka ato od ag ost a Labqualitypäivät 04.02.10 Riitta Karttunen HUSLAB, kl. Mikrobiologia Virologian ja immunologian osasto Aiheet suora bakteerin osoitus tai nukleiinihappotestiosoitus

Lisätiedot

SELKÄYDINNESTEEN NÄYTTEENOTTO

SELKÄYDINNESTEEN NÄYTTEENOTTO PREANALYTIIKKA Sivu 1(5) Versio: 2.0 / 03.01.2014 Laatijat: T.Kouri, J. Lilja, A-C. Berglund, U. Tuulos-Kontio, U. Koponen, E.Alppiranta, P.Hälikkä, R. Hilla, R. Loginov 03.01.2014 Tarkastajat: L.Uotila,

Lisätiedot

VAROTOIMI- JA ERISTYSSUOSITUKSET INFEKTIOSAIRAUKSISSA¹

VAROTOIMI- JA ERISTYSSUOSITUKSET INFEKTIOSAIRAUKSISSA¹ Henkilökunta ohje/ Taulukko Varotoimi ja eristyssuositukset infektiosairauksissa ¹ VAROTOIMI- JA ERISTYSSUOSITUKSET INFEKTIOSAIRAUKSISSA¹ Absessi: - runsaasti erittävä http://ohjepankki.vsshp.fi/fi/6303/10027/

Lisätiedot

Yersinia-serologia. Markus Penttinen 041105 Lääketieteellinen mikrobiologia Turun yliopisto

Yersinia-serologia. Markus Penttinen 041105 Lääketieteellinen mikrobiologia Turun yliopisto Yersinia-serologia Markus Penttinen 041105 Lääketieteellinen mikrobiologia Turun yliopisto Yersiniainfektio Yersiniainfektio aiheuttaa mm. seuraavia tauteja: 1. Akuutteja tauteja - suolistotulehduksia

Lisätiedot

Vaikeat hengitystieinfektiot mikrobiologinen diagnostiikka

Vaikeat hengitystieinfektiot mikrobiologinen diagnostiikka Vaikeat hengitystieinfektiot mikrobiologinen diagnostiikka Tehohoidon vaikeat hengitystieinfektiot symposium 4.5.212, Helsinki Dos. Maija Lappalainen HUSLAB Infektioiden yleisyys teho-osastoilla 45-6%

Lisätiedot

Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti

Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti ETELÄ-KARJALAN SOSIAALI- JA TERVEYSPIIRI Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti 2011 Tartuntatautiraportti 2011 1/4 Infektioyksikkö 12.3.2012 Vuoden 2011

Lisätiedot

Bakteeriviljelynäytteen hyväksymiskriteerit. Primaarinäytteen värjäys ja viljely. Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia

Bakteeriviljelynäytteen hyväksymiskriteerit. Primaarinäytteen värjäys ja viljely. Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia Bakteeriviljelynäytteen hyväksymiskriteerit. Primaarinäytteen värjäys ja viljely. Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia Bakteeriviljelynäytteet Ainutkertaisia. Uutta näytettä ei saada tai se ei

Lisätiedot

Uudet tekniikat infektio- diagnostiikassa

Uudet tekniikat infektio- diagnostiikassa Uudet tekniikat infektio- diagnostiikassa Labquality Days 5.2.2015 Kaisu Rantakokko-Jalava Tyks mikrobiologia ja genetiikka VSSHP Tyks-Sapa-liikelaitos Uusia tuulia kl. mikrobiologiassa MALDI-TOF bakteerien

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB LABORATORIES LTD

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB LABORATORIES LTD T043 Liite 1.03 / Appendix 1.03 Sivu / Page 1(15) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB LABORATORIES LTD Tunnus Code Yksikkö tai toimintoala Department

Lisätiedot

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET ./ 7.0.05 /7 Ohjeen luokka Näytteenoton käsikirja Versio/pvm./ 7.0.05 Laatijat M Koskela, P Nauha, R Kursula Vastuuhenkilö M Koskela (7.0.05) Hyväksyjä J Kauppila (7.0.05) Jakelu Näyte Bakteeri- ja sieninäyte*

Lisätiedot

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY T043 Liite 1.03 / Appendix 1.03 Sivu / Page 1(15) AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB MEDICAL LABORATORIES LTD Tunnus Code Yksikkö tai toimintoala

Lisätiedot

Suojautuminen tartunta-agensseja käsiteltäessä (esim. SARS) Labquality: Mikrobiologian neuvottelupäivä 17.10.2003 Osl. Jukka Suni. A.

Suojautuminen tartunta-agensseja käsiteltäessä (esim. SARS) Labquality: Mikrobiologian neuvottelupäivä 17.10.2003 Osl. Jukka Suni. A. Suojautuminen tartunta-agensseja käsiteltäessä (esim. SARS) Labquality: Mikrobiologian neuvottelupäivä 17.10.2003 Osl. Jukka Suni A. Järvinen 031003 Valtioneuvoston päätös työntekijöiden suojelemisesta

Lisätiedot

Autoimmuunitaudit: osa 1

Autoimmuunitaudit: osa 1 Autoimmuunitaudit: osa 1 Autoimmuunitaute tunnetaan yli 80. Ne ovat kroonisia sairauksia, joiden syntymekanismia eli patogeneesiä ei useimmissa tapauksissa ymmärretä. Tautien esiintyvyys vaihtelee maanosien,

Lisätiedot

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET POHJOIS-POHJANMAAN SAIRAAN- / 8 SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET Näyte Bakteeri- ja sieninäyte* Sidekalvoerite, kyyneltiehyt-erite, enukleoidun silmän erite Kuntaliiton nro ja tutkimuspyyntö 49 Pu-BaktVi

Lisätiedot

TYÖTERVEYSHUOLLON HINNASTO 2016 PERUSMAKSU JA KELA-KORVAUS ENNALTAEHKÄISEVÄ TYÖTERVEYSHUOLTO. Perusmaksu 28,75 / työntekijä / vuosi

TYÖTERVEYSHUOLLON HINNASTO 2016 PERUSMAKSU JA KELA-KORVAUS ENNALTAEHKÄISEVÄ TYÖTERVEYSHUOLTO. Perusmaksu 28,75 / työntekijä / vuosi TYÖTERVEYSHUOLLON HINNASTO 2016 PERUSMAKSU JA KELA-KORVAUS Perusmaksu 28,75 / työntekijä / vuosi Perusmaksu laskutetaan kerran vuodessa (31.7 henkilömäärän mukaan). Perusmaksu sisältää mm. ajanvaraus-

Lisätiedot

VIERITESTIT AVOHOIDOSSA KÄYTETTÄVÄT VIROLOGISET TESTIT

VIERITESTIT AVOHOIDOSSA KÄYTETTÄVÄT VIROLOGISET TESTIT VIERITESTIT AVOHOIDOSSA KÄYTETTÄVÄT VIROLOGISET TESTIT POS POS(H) NEG JUKKA SUNI HUSLAB - VIROLOGIA Vieritestien käyttäjiä Itsehoito h koti Terveysasemat Doctor s Office Ensiapupoliklinikka Teho-osasto

Lisätiedot

Moniresistenttien mikrobien näytteenotto

Moniresistenttien mikrobien näytteenotto Moniresistenttien mikrobien näytteenotto Mika Paldanius Osastonhoitaja TtM, FT Mikrobiologian laboratorio Moniresistenttien mikrobien näytteenotto Mikrobit ovat erittäin muuntautumiskykyisiä Antibioottihoidoista

Lisätiedot

TaLO-tapaukset Virusoppi. Vastuuhenkilöt: Tapaus 1: Matti Varis Tapaus 2: Veijo Hukkanen Tapaus 3: Sisko Tauriainen Tapaus 4: Ilkka Julkunen

TaLO-tapaukset Virusoppi. Vastuuhenkilöt: Tapaus 1: Matti Varis Tapaus 2: Veijo Hukkanen Tapaus 3: Sisko Tauriainen Tapaus 4: Ilkka Julkunen TaLO-tapaukset Virusoppi Vastuuhenkilöt: Tapaus 1: Matti Varis Tapaus 2: Veijo Hukkanen Tapaus 3: Sisko Tauriainen Tapaus 4: Ilkka Julkunen TaLO-tapaus 1 Uusi uhkaava respiratorinen virusinfektio Tapaus

Lisätiedot

Nivelreuman serologiset testit: mitä ne kertovat? LT, apulaisylilääkäri Anna-Maija Haapala TAYS Laboratoriokeskus

Nivelreuman serologiset testit: mitä ne kertovat? LT, apulaisylilääkäri Anna-Maija Haapala TAYS Laboratoriokeskus Nivelreuman serologiset testit: mitä ne kertovat? LT, apulaisylilääkäri Anna-Maija Haapala TAYS Laboratoriokeskus Sisältö 1. Nivelreuma: etiologia, esiintyvyys, diagnostiikka 2. Nivelreuman serologiset

Lisätiedot

Infektioista keskosilla. Dos. Outi Tammela TAYS

Infektioista keskosilla. Dos. Outi Tammela TAYS Infektioista keskosilla Dos. Outi Tammela TAYS Käsiteltävät asiat Vastustuskyky BPD Keskosen infektioherkkyys ja vointi sairaalasta pääsyn jälkeen Tavallisimmista infektioista Infektioiden ennalta ehkäisy

Lisätiedot

PORFYRIATUTKIMUSKESKUS HELSINGIN YLIOPISTOLLINEN KESKUSSAIRAALA

PORFYRIATUTKIMUSKESKUS HELSINGIN YLIOPISTOLLINEN KESKUSSAIRAALA PORFYRIATUTKIMUSKESKUS HELSINGIN YLIOPISTOLLINEN KESKUSSAIRAALA Johtaja Dos. Raili Kauppinen, sisätautien erikoislääkäri Sähköposti: raili.kauppinen@hus.fi Puh. (09) 471 71910 Laboratorio tarjoaa analytiikka-

Lisätiedot

Immuunipuutokset. Olli Vainio OY Diagnostiikan laitos OYS Kliinisen mikrobiologian laboratorio 17.10.2008

Immuunipuutokset. Olli Vainio OY Diagnostiikan laitos OYS Kliinisen mikrobiologian laboratorio 17.10.2008 Immuunipuutokset Olli Vainio OY Diagnostiikan laitos OYS Kliinisen mikrobiologian laboratorio 17.10.2008 Immuunijärjestelm rjestelmän n toiminta Synnynnäinen immuniteetti (innate) Välitön n vaste (tunneissa)

Lisätiedot

AKKREDITOITU VERTAILUMITTAUSJÄRJESTÄJÄ ACCREDITED PROFICIENCY TESTING PROVIDER

AKKREDITOITU VERTAILUMITTAUSJÄRJESTÄJÄ ACCREDITED PROFICIENCY TESTING PROVIDER 1(10) AKKREDITOITU VERTAILUMITTAUSJÄRJESTÄJÄ ACCREDITED PROFICIENCY TESTING PROVIDER LABQUALITY OY ULKOISET LAADUNARVIOINTIPALVELUT PT02 (EN ISO/IEC 17043) LABQUALITY LTD. EXTERNAL QUALITY ASSESSMENT SERVICES

Lisätiedot

VÄLINEET MIKROBIOLOGIAN NÄYTTEIDEN OTTAMISTA, SÄILYTTÄMISTÄ JA KULJETTAMISTA VARTEN JA NIIDEN YLEISET KÄYTTÖOHJEET

VÄLINEET MIKROBIOLOGIAN NÄYTTEIDEN OTTAMISTA, SÄILYTTÄMISTÄ JA KULJETTAMISTA VARTEN JA NIIDEN YLEISET KÄYTTÖOHJEET POHJOIS-POHJANMAAN SAIRAAN- / 9 VÄLINEET MIKROBIOLOGIAN NÄYTTEIDEN OTTAMISTA, SÄILYTTÄMISTÄ JA KULJETTAMISTA VARTEN JA NIIDEN YLEISET KÄYTTÖOHJEET Sisällysluettelo Sivu Yleistä mikrobiologian näytteenottovälineistä

Lisätiedot

8/28/12. Immunologinen diagnostiikka. Infektioserologian yleisimmät menetelmät. Infektioserologia. Yleisimmät infektioserologian tutkimukset

8/28/12. Immunologinen diagnostiikka. Infektioserologian yleisimmät menetelmät. Infektioserologia. Yleisimmät infektioserologian tutkimukset Immunologinen diagnostiikka Immunologinen diagnostiikka - infektioserologia: bakteerit (parasiitit, sienet) Hanna Jarva LT, Kliininen opettaja Haartman-instituutti Bakteriologian ja immunologian osasto

Lisätiedot

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta Mikrobiologia Viljelysauvat ja -silmukat Näytteenottotikut LBM, nestemäiset kuljetusputket Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta Lasi- ja muovitarvikkeet Kuljetus Mekalasi Oy Perustamisestaan, vuodesta

Lisätiedot

Asiakastiedote 26/2014

Asiakastiedote 26/2014 Arvoisa asiakas, Asiakastiedote Sivu 1/5 Muutoksia reniini- ja aldosteronimäärityksiin sekä uusi tutkimus Aldosteroni-reniini, suhde fp-reniini, konsentraatio fp-reninm ATK 22100 P -Reniini, konsentraatio

Lisätiedot

Toimenpideohje. tutkimukset

Toimenpideohje. tutkimukset Anja Siitonen, Sakari Jokiranta, Markku Kuusi, Maija Lappalainen, Merja Roivainen SUOSITUS Toimenpideohje Ruokamyrkytysepidemian selvittäminen potilasnäytteiden mikrobiologiset tutkimukset Terveyden ja

Lisätiedot

Materiaalinäytteiden qpcr-tulosten tulkinnasta

Materiaalinäytteiden qpcr-tulosten tulkinnasta Materiaalinäytteiden qpcr-tulosten tulkinnasta Helena Rintala ja Teija Meklin Sisäilmastoseminaari 13.3.2014 Taustaa qpcr (kvantitatiivinen PCR) on nopea menetelmä mikrobien toteamiseen Käytetty paljon

Lisätiedot

Mikrobiologia. Viljelysauvat. Näytteenottotikut. Bakteerikuljetusputket. Viruskuljetusputket. Lasi- ja muovitarvikkeet. Kuljetus

Mikrobiologia. Viljelysauvat. Näytteenottotikut. Bakteerikuljetusputket. Viruskuljetusputket. Lasi- ja muovitarvikkeet. Kuljetus Mikrobiologia Viljelysauvat Näytteenottotikut Bakteerikuljetusputket Viruskuljetusputket Lasi- ja muovitarvikkeet Kuljetus Mekalasi Oy Perustamisestaan, vuodesta 1952 lähtien, Mekalasin johtotähtenä on

Lisätiedot

Avohoidon A-streptokokki-infektion torjunta, miten epidemia katkaistaan? Eeva Ruotsalainen Tartuntatautikurssi 15.4.2015

Avohoidon A-streptokokki-infektion torjunta, miten epidemia katkaistaan? Eeva Ruotsalainen Tartuntatautikurssi 15.4.2015 Avohoidon A-streptokokki-infektion torjunta, miten epidemia katkaistaan? Eeva Ruotsalainen Tartuntatautikurssi 15.4.2015 Perusasiaa Tartuntatapa Esiintyy iholla ja nielussa Pisara- ja kosketustartunta

Lisätiedot

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta Mikrobiologia Viljelysauvat ja -silmukat Näytteenottotikut LBM, nestemäiset kuljetusputket Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta Lasi- ja muovitarvikkeet Kuljetus Mekalasi Oy Perustamisestaan, vuodesta

Lisätiedot

Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio. Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti

Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio. Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti 2014 Vuoden 2014 tartuntatautiraportti on laadittu aiempaan tapaan lääkärien ja laboratorioiden tekemien tartuntatauti-ilmoitusten perusteella. Herkkyystilanteen osalta

Lisätiedot

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 3 / 2012

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 3 / 2012 VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 3 / 212 EPIDEMIOLOGINEN KATSAUS 1.1.212 2.9.212 YLEISVAARALLISIA JA ILMOITETTAVIA TARTUNTATAUTEJA kuukausittain Varsinais-Suomen

Lisätiedot

INFEKTIOIDEN TORJUNTA VARO- JA ERISTYSTOIMIEN AVULLA

INFEKTIOIDEN TORJUNTA VARO- JA ERISTYSTOIMIEN AVULLA POHJOIS-POHJANMAAN SAIRAAN- TOIMINTAOHJE 1 (6) INFEKTIOIDEN TORJUNTA VARO- JA ERISTYSTOIMIEN AVULLA Päivitetty Infektioiden torjunta sairaalassa (Suomen Kuntaliitto 5. painos 2005) kirjan mukaan. Taulukko

Lisätiedot

Moniresistentit bakteerit

Moniresistentit bakteerit 25.8.2014 1 Moniresistentit bakteerit MRSA = Metisilliini Resistentti Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus on yleinen terveiden henkilöiden nenän limakalvoilla ja iholla elävä grampositiivinen kokkibakteeri.

Lisätiedot

Diagnostisten testien arviointi

Diagnostisten testien arviointi Erkki Savilahti Diagnostisten testien arviointi Koe antaa tuloksen pos/neg Laboratoriokokeissa harvoin suoraan luokiteltavissa Testin hyvyys laskettavissa tunnuslukujen avulla Diagnostisten testien arviointi

Lisätiedot

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi!

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi! Käyttöohje Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi! Palvelun käyttämiseen tarvitset internetyhteyden esimerkiksi matkapuhelimesta ja keinon tunnis tautua sähköisesti pankkitunnuksilla tai

Lisätiedot

PIKAOHJEET Käytettäväksi vain Sofia-analysaattorin kanssa.

PIKAOHJEET Käytettäväksi vain Sofia-analysaattorin kanssa. Analysaattori ja FIA PIKAOHJEET Käytettäväksi vain Sofia-analysaattorin kanssa. Testausmenetelmä Tutki pakkausseloste ja käyttöohje huolellisesti ennen pikaohjeiden käyttöä. Tämä ei ole täydellinen pakkausseloste.

Lisätiedot

Miten rokottaminen suojaa yksilöä ja rokotuskattavuus väestöä Merit Melin Rokotusohjelmayksikkö

Miten rokottaminen suojaa yksilöä ja rokotuskattavuus väestöä Merit Melin Rokotusohjelmayksikkö Miten rokottaminen suojaa yksilöä ja rokotuskattavuus väestöä Merit Melin Rokotusohjelmayksikkö 1 ESITYKSEN SISÄLTÖ Miten rokottaminen suojaa yksilöä? Immuunijärjestelmä Taudinaiheuttajilta suojaavan immuniteetin

Lisätiedot

Penikkatauti turkiseläimillä

Penikkatauti turkiseläimillä Penikkatauti turkiseläimillä Ajankohtaista tarttuvista eläintaudeista teemapäivä 21.5.2013 Ulla-Maija Kokkonen ELT, erikoiseläinlääkäri Evira Tutkimus- ja laboratorio-osasto Eläintautivirologian tutkimusyksikkö

Lisätiedot

Ulostepatogeenien diagnostiikka. Alueellinen koulutus 28.10.2015 Kaisu Rantakokko-Jalava Tyks Mikrobiologia ja genetiikka

Ulostepatogeenien diagnostiikka. Alueellinen koulutus 28.10.2015 Kaisu Rantakokko-Jalava Tyks Mikrobiologia ja genetiikka Ulostepatogeenien diagnostiikka Alueellinen koulutus 28.10.2015 Kaisu Rantakokko-Jalava Tyks Mikrobiologia ja genetiikka Bakteeriripulit, vanhaa ja uutta diagnostiikkaa Perinteinen bakteeriripuli (turistiripuli)

Lisätiedot

Asiakastiedote 15/2015

Asiakastiedote 15/2015 Arvoisa asiakas, Sivu 1/8 Menetelmä-, viitearvo-, yksikkö-, tutkimusrakenne- ja tutkimusvalikoimamuutoksia Tiedotamme ajankohtaisista muutoksista, jotka liittyvät alihankintalaboratorioiden tutkimusmuutoksiin.

Lisätiedot

Tarttuvien eläintautien huomioiminen luonnonlintuja käsiteltäessä

Tarttuvien eläintautien huomioiminen luonnonlintuja käsiteltäessä WWF Koulutus: Öljyyntyneiden lintujen käsittely, pesu ja hoito, Tarttuvien eläintautien huomioiminen luonnonlintuja käsiteltäessä Laila Rossow Tarttuvien tautien Erikoiseläinlääkäri Tarttuva eläintauti?

Lisätiedot

BIOHIT OYJ. globaaleilla markkinoilla toimiva suomalainen bioteknologiayritys

BIOHIT OYJ. globaaleilla markkinoilla toimiva suomalainen bioteknologiayritys BIOHIT OYJ globaaleilla markkinoilla toimiva suomalainen bioteknologiayritys 1 Biohit lyhyesti Biohit Oyj on globaaleilla markkinoilla toimiva suomalainen bioteknologiayritys. Biohitin missio on "Innovating

Lisätiedot

Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio. Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti

Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio. Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti 2013 Tartuntatautiraportti 2013 3.3.2014 Vuoden 2013 tartuntatautiraportti on laadittu aiempaan tapaan lääkärien ja laboratorioiden tekemien tartuntatauti-ilmoitusten

Lisätiedot

Sidonnaisuudet. 1. Sidekudossairaudet - limittymien. Tumavasta-aineet apoptoosissa. Tuma ja tumavasta-aineet 18/04/15

Sidonnaisuudet. 1. Sidekudossairaudet - limittymien. Tumavasta-aineet apoptoosissa. Tuma ja tumavasta-aineet 18/04/15 18/04/15 l Sidonnaisuudet Vuosina 2009-2012 olen Vasta-ainemääritykset reumasairauksien diagnostiikassa l l osallistunut ulkomaisiin tieteellisiin kongresseihin 2008-2012 seuraavien lääketehtaiden kustantamana:

Lisätiedot

Sisällys. TARTUNTA 35 Tartuntatiet 35 Infektioille altistavia tekijöitä 39 Infektioiden ennaltaehkäisy 40

Sisällys. TARTUNTA 35 Tartuntatiet 35 Infektioille altistavia tekijöitä 39 Infektioiden ennaltaehkäisy 40 Sisällys 1 MIKROBIOLOGIA 11 Mikrobit mikroskoopin keksimisestä geenitekniikan työvälineiksi 11 Mikrobit ihmisen elinympäristössä 14 Mikrobit luonnon kiertokulussa 14 Mikrobit luonnonvesissä 16 Mikrobit

Lisätiedot

Preanalytiikka mikrobiologissa tutkimuksissa Risto Hilla HUSLAB Prosessivastaava, Preanalytiikan linja Helsinki ja Itä-Uusimaa

Preanalytiikka mikrobiologissa tutkimuksissa Risto Hilla HUSLAB Prosessivastaava, Preanalytiikan linja Helsinki ja Itä-Uusimaa Preanalytiikka mikrobiologissa tutkimuksissa Risto Hilla HUSLAB Prosessivastaava, Preanalytiikan linja Helsinki ja Itä-Uusimaa Esityksen sisältö Perustuu HUSLABin ohjeistukseen ja käytäntöihin. Mikrobiologisista

Lisätiedot

Laboratoriotutkimusten rooli, arviointi ja merkitys

Laboratoriotutkimusten rooli, arviointi ja merkitys Johdatus kliiniseen tutkimukseen 25.8.2011 Laboratoriotutkimusten rooli, arviointi ja merkitys Susanna Luukkonen kliinisen kemian ja kliinisen mikrobiologian erikoislääkäri, tutkimuskoordinaattori, Islab

Lisätiedot

Komplementtitutkimukset

Komplementtitutkimukset Komplementtitutkimukset Hanna Jarva HUSLAB ja Haartman-instituutti Bakteriologian ja immunologian osasto Komplementti osa luontaista immuunijärjestelmää koostuu yli 30 proteiinista aktivoituu kaskadimaisesti

Lisätiedot

MIKROBIOLOGISTEN NÄYTTEIDEN OTTAMINEN

MIKROBIOLOGISTEN NÄYTTEIDEN OTTAMINEN päivitetty 1.3.2010 MIKROBIOLOGISTEN NÄYTTEIDEN OTTAMINEN Mikrobiologisten näytteiden kohdalla tärkeää on edustavuus, ts. että näyte on otettu oikeasta paikasta. Lisäksi näytteitä otettaessa on tärkeää

Lisätiedot

Mikä on ns. multiplex-pcr tutkimus?

Mikä on ns. multiplex-pcr tutkimus? Sidonnaisuudet kahden viimeisen vuoden ajalta Multiplex-PCR ym. uudet monianalyyttimenetelmät - Laboratorion näkökulma Dos., osastonylilääkäri Maija Lappalainen HUSLAB, Virologian ja immunologian osasto

Lisätiedot

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi!

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi! Käyttöohje Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi! Palvelun käyttämiseen tarvitset internetyhteyden esimerkiksi matkapuhelimesta ja keinon tunnis tautua sähköisesti pankkitunnuksilla tai

Lisätiedot

KandiakatemiA Kandiklinikka

KandiakatemiA Kandiklinikka Kandiklinikka Kandit vastaavat Immunologia Luonnollinen ja hankittu immuniteetti IMMUNOLOGIA Ihmisen immuniteetti pohjautuu luonnolliseen ja hankittuun immuniteettiin. Immunologiasta vastaa lymfaattiset

Lisätiedot

Moderni virusdiagnostiikka pystyy vastaamaan

Moderni virusdiagnostiikka pystyy vastaamaan Virologia Mitä lääkärin on hyvä tietää virusdiagnostiikasta Raija Vainionpää, Klaus Hedman ja Timo Hyypiä Virusdiagnostiikan käyttömahdollisuudet ovat viime vuosina merkittävästi laajentuneet menetelmien

Lisätiedot

Bakteereja tunnistetaan a) muodon perusteella:

Bakteereja tunnistetaan a) muodon perusteella: Bakteereja tunnistetaan a) muodon perusteella: ja b) värjäytyvyyden perusteella: 1) Gram-positiiviset Soluseinän ulkokalvo värjäytyy 2) Gram negatiiviset Soluseinän ulkokalvo jää värjäytymättä Laborointi

Lisätiedot

Hengitysteiden virusinfektiot

Hengitysteiden virusinfektiot Hengitysteiden virusinfektiot 19.4.2012 Carita Savolainen-Kopra Virologian yksikkö Tartuntatautiseurannan ja torjunnan osasto Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Hengitysteiden virusinfektiot Hengitystieinfektiot

Lisätiedot

Allergia ja astma. Erkki Vartiainen, professori, ylijohtaja. 5.9.2012 Esityksen nimi / Tekijä 1

Allergia ja astma. Erkki Vartiainen, professori, ylijohtaja. 5.9.2012 Esityksen nimi / Tekijä 1 Allergia ja astma Erkki Vartiainen, professori, ylijohtaja 5.9.2012 Esityksen nimi / Tekijä 1 Aikuisväestön sekä lasten ja nuorten astma- ja allergiatutkimukset Pohjois- Karjalassa ja Pitkärannassa 5.9.2012

Lisätiedot

OLLI RUOHO TERVEYDENHUOLTOELÄINLÄÄKÄRI. www.ett.fi. ETT ry

OLLI RUOHO TERVEYDENHUOLTOELÄINLÄÄKÄRI. www.ett.fi. ETT ry OLLI RUOHO TERVEYDENHUOLTOELÄINLÄÄKÄRI www.ett.fi ETT ry VIRUSRIPULIT, HENGITYSTIETULEHDUKSET Ajoittain esiintyviä, erittäin helposti leviäviä V. 2012 tarttuvaa, voimakasoireista koronavirusripulia (?)

Lisätiedot

Kansanterveyslaitoksen julkaisuja KTL B 8/2001. Tartuntataudit Suomessa 2000

Kansanterveyslaitoksen julkaisuja KTL B 8/2001. Tartuntataudit Suomessa 2000 Kansanterveyslaitoksen julkaisuja KTL B 8/2001 Tartuntataudit Suomessa 2000 Mikrobilöydösten kommentoijat Hiltunen-Back, Eija Kuusi, Markku Lyytikäinen, Outi Nuorti, Pekka Ruutu, Petri Siikamäki, Heli

Lisätiedot

Tuhkarokko Euroopassa ja Yhdysvalloissa

Tuhkarokko Euroopassa ja Yhdysvalloissa Tuhkarokko Euroopassa ja Yhdysvalloissa - mikä suoja suomalaisilla? Tartuntatautikurssi 15.4.2015 15.4.2015 Virusinfektiot-yksikkö/ Mia Kontio 1 Tuhkarokko: epäíly ja varmistus Oireet 7-21 vrk tartunnasta:

Lisätiedot

Keskushermostoinfektion Nh-tutkimuksia likvorista I

Keskushermostoinfektion Nh-tutkimuksia likvorista I Keskushermostoinfektion Nh-tutkimuksia likvorista I Akuutin sairausvaiheen (yl. ensimmäinen sairausviikko) ensisijainen tutkimus on nukleiinihappo-osoitus (~PCR) HUSLABin virologian osaston tarjoamat ensilinjan

Lisätiedot

Raakamaidosta tehtävät STEC tutkimukset. Saija Hallanvuo Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö Tutkimus- ja laboratorio-osasto

Raakamaidosta tehtävät STEC tutkimukset. Saija Hallanvuo Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö Tutkimus- ja laboratorio-osasto Raakamaidosta tehtävät STEC tutkimukset Saija Hallanvuo Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö Tutkimus- ja laboratorio-osasto Raakamaidon tuotanto ja myynti koulutuspäivä viranomais- ja alan

Lisätiedot

Ruokamyrkytysepidemian selvittäminen potilasnäytteiden mikrobiologiset tutkimukset

Ruokamyrkytysepidemian selvittäminen potilasnäytteiden mikrobiologiset tutkimukset Anja Siitonen Sakari Jokiranta Markku Kuusi Maija Lappalainen Leena Maunula Merja Roivainen Ruokamyrkytysepidemian selvittäminen potilasnäytteiden mikrobiologiset tutkimukset Kansanterveyslaitoksen julkaisuja

Lisätiedot

Hevosen hengitystiesairaudet klinikkaeläinlääkärin näkökulmasta. Antti Helminen Jokilaaksojen eläinklinikka Ylivieska

Hevosen hengitystiesairaudet klinikkaeläinlääkärin näkökulmasta. Antti Helminen Jokilaaksojen eläinklinikka Ylivieska Hevosen hengitystiesairaudet klinikkaeläinlääkärin näkökulmasta Antti Helminen Jokilaaksojen eläinklinikka Ylivieska Hevosen hengitysteiden anatomiaa Hengitystietautien merkitys hevostaloudelle jalkavaivojen

Lisätiedot

OYS:N KLIINISEN KEMIAN JA HEMATOLOGIAN LABORATORION YLEISOHJEET

OYS:N KLIINISEN KEMIAN JA HEMATOLOGIAN LABORATORION YLEISOHJEET OYS:N KLIINISEN KEMIAN JA HEMATOLOGIAN LABORATORION YLEISOHJEET Sivu 1/ 5 TUTKIMUSTEN TILAAMINEN Laboratoriotutkimukset tilataan ensisijaisesti atk-järjestelmään käyttäen tietojärjestelmässä mainittuja

Lisätiedot

H1N1 2009 pandemia Helsingin perusterveydenhuollossa. Hannele Kotilainen Infektiolääkäri Kaupunginepidemiologi 15.4.2010

H1N1 2009 pandemia Helsingin perusterveydenhuollossa. Hannele Kotilainen Infektiolääkäri Kaupunginepidemiologi 15.4.2010 H1N1 2009 pandemia Helsingin perusterveydenhuollossa Infektiolääkäri Kaupunginepidemiologi 15.4.2010 Taustaa Pandemia varautumisuunnitelmaa tehty Helsingissä v 2006 lähtien STM / THL / HUS sh piirin velvoittamana

Lisätiedot

Näytteenotto-ohje alkuraskauden seulontanäytteiden (B -VRAb-Gr, S -ÄITSEUL, S -Tr1Seul) ottamiseen

Näytteenotto-ohje alkuraskauden seulontanäytteiden (B -VRAb-Gr, S -ÄITSEUL, S -Tr1Seul) ottamiseen PREANALYTIIKKA Sivu 1(5) Versio:17.10.2013 Laatija: Hannele Kangas, Teija Kaukosalmi-Virtanen Marja-Liisa Kallio-Hägg 17.10.2013 Tarkastaja: Helene Markkanen Anne Lindqvist, Maija Lappalainen, Katja Salmela

Lisätiedot

YLIOPPILAIDEN TERVEYDENHOITOSÄÄTIÖ. Laboratorio- ja konsultaatiopalvelut. Liite 6. YTHS:n tilaamat laboratoripalvelut vuonna 2014

YLIOPPILAIDEN TERVEYDENHOITOSÄÄTIÖ. Laboratorio- ja konsultaatiopalvelut. Liite 6. YTHS:n tilaamat laboratoripalvelut vuonna 2014 YLIOPPILAIDEN TERVEYDENHOITOSÄÄTIÖ Tarjouspyyntö Laboratorio- ja konsultaatiopalvelut Liite 6. YTHS:n tilaamat laboratoripalvelut vuonna 2014 Kuntaliiton numero Lyhenne Laskutettu kpl 4044 Pt-Gynekologinen

Lisätiedot

Bakteeriviljelynäyte kroonisesta haavasta

Bakteeriviljelynäyte kroonisesta haavasta Bakteeriviljelynäyte kroonisesta haavasta Alueellinen haavakoulutuspäivä 05.03.2014 Kerttu Saha Sairaalamikrobiologi, kliininen mikrobiologia Haavakontaminaatio -> kolonisaatio-> kriittinen kolonisaatio

Lisätiedot

VESIMIKROBIOLOGIA Ajankohtaista laboratoriorintamalla Workshop yhteenveto 13.10.2010 1

VESIMIKROBIOLOGIA Ajankohtaista laboratoriorintamalla Workshop yhteenveto 13.10.2010 1 VESIMIKROBIOLOGIA Ajankohtaista laboratoriorintamalla Workshop yhteenveto 13.10.2010 1 Talousveden turvallisuus Ulosteperäisen saastumisen lähteet: -Jätevesi (putkirikot, purkuvesistöihin) -Eläinten ulosteet

Lisätiedot

1.1.2012 Yleisimpiä labroja

1.1.2012 Yleisimpiä labroja 1 1026 S - ALAT Alaniiniaminotransferaasi 5,00 15,00 15,00 11,25 1028 S - Alb Albumiini 5,00 15,00 15,00 11,25 3425 du- Alb-Mi Albumiini, mikroalbuminuria 8,00 35,00 35,00 29,00 1046 S - AFOS Alkalinen

Lisätiedot

B-leuk-määritys vieritestimittauksena infektiodiagnostiikassa

B-leuk-määritys vieritestimittauksena infektiodiagnostiikassa 4.2.2009 B-leuk-määritys vieritestimittauksena infektiodiagnostiikassa Ville Peltola Dosentti, lasten infektiolääkäri TYKS Hengitystieinfektioiden lukumäärä vuosittain 7 Infektioita/ vuosi/ henkilö (keskiarvo)

Lisätiedot

Virtsan kemiallisen seulonnan kliininen käyttö. Dosentti Martti L.T. Lalla Osastonylilääkäri HUSLAB Kirurginen sairaala 4.2.2009

Virtsan kemiallisen seulonnan kliininen käyttö. Dosentti Martti L.T. Lalla Osastonylilääkäri HUSLAB Kirurginen sairaala 4.2.2009 Virtsan kemiallisen seulonnan kliininen käyttö Dosentti Martti L.T. Lalla Osastonylilääkäri HUSLAB Kirurginen sairaala Virtsa elimistön tietolähteenä Virtsa - ensimmäinen kehon aine, jonka tutkiminen yhdistettiin

Lisätiedot

BCG- rokotusmuutoksen vaikutukset lasten tuberkuloosin diagnostiikkaan. Merja Helminen Lasteninfektiotautien erikoislääkäri TaYS Lastenklinikka

BCG- rokotusmuutoksen vaikutukset lasten tuberkuloosin diagnostiikkaan. Merja Helminen Lasteninfektiotautien erikoislääkäri TaYS Lastenklinikka BCG- rokotusmuutoksen vaikutukset lasten tuberkuloosin diagnostiikkaan Merja Helminen Lasteninfektiotautien erikoislääkäri TaYS Lastenklinikka Tukholman päiväkotiepidemia 2005 Altistuneet 141 lasta

Lisätiedot

NIPT. Non-invasiivinen prenataalitutkimus

NIPT. Non-invasiivinen prenataalitutkimus NIPT Non-invasiivinen prenataalitutkimus Non-invasiivinen prenataalitutkimus, NIPT B -NIPT-D ATK 8598 Non-invasiivinen prenataalitutkimus B -NIPTlaa ATK 8599 Non-invasiivinen prenataalitutkimus, laaja

Lisätiedot

INFEKTIOIDEN SEURANTA- MÄÄRITELMÄT PITKÄAIKAIS- HOITOLAITOKSISSA

INFEKTIOIDEN SEURANTA- MÄÄRITELMÄT PITKÄAIKAIS- HOITOLAITOKSISSA Sairaalainfektio-ohjelma (SIRO) INFEKTIOIDEN SEURANTA- MÄÄRITELMÄT PITKÄAIKAIS- HOITOLAITOKSISSA Allison McGeer ym., 1991 Kansanterveyslaitoksen julkaisuja C 14/2005 Kansanterveyslaitoksen julkaisuja C11

Lisätiedot

Hengitysteiden virusinfektiot

Hengitysteiden virusinfektiot Hengitysteiden virusinfektiot 11.10.2012 Carita Savolainen-Kopra Erikoistutkija, FT Virologian yksikkö Tartuntatautiseurannan ja -torjunnan osasto Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Hengitysteiden virusinfektiot

Lisätiedot

KOLARIN TK LABORATORIO. Outi Rowe Laboratoriohoitaja, FIBMS, MSc

KOLARIN TK LABORATORIO. Outi Rowe Laboratoriohoitaja, FIBMS, MSc KOLARIN TK LABORATORIO Outi Rowe Laboratoriohoitaja, FIBMS, MSc TILAT JA TYÖNTEKIJÄT Kaksi laboratoriohoitajaa Yksi näytteenottopiste Näytteenotto sähköisellä ajanvarauksella Potilastietojärjestelmät:

Lisätiedot

SEKSITAUDIT Hiv-säätiö / Aids-tukikeskus Vaihde 0207 465 700 (ma - pe 9-16) Neuvonta ja ajanvaraus 0207 465 705 (ma - pe 10-15.30) www.aidstukikeskus.fi SEKSUAALITERVEYS Rakkaus, seksuaalisuus ja seksi

Lisätiedot

Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com

Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent www.rebeccajkent.com rebecca@rebeccajkent.com 12 Vallitseva periytyminen Muokattu allamainittujen instanssien julkaisemista vihkosista, heidän laatustandardiensa mukaan: Guy's and St Thomas' Hospital, London, United Kingdom; and the London IDEAS Genetic

Lisätiedot

Keski-Suomen Seututerveyskeskus

Keski-Suomen Seututerveyskeskus Keski-Suomen Seututerveyskeskus Ohjeet tavallisimmista lasten tartuntataudeista Päivitetty 18.10.2012 /PL Tauti Aiheuttaja ANGIINA Streptokokkibakteeri Nenän ja nielun eritteet. 2 5 vrk. ENTEROROKKO (rokotetta

Lisätiedot

Bakteeriperäisen turistiripulin diagnostiikka nukleiinihaponosoitusmenetelmillä

Bakteeriperäisen turistiripulin diagnostiikka nukleiinihaponosoitusmenetelmillä Bakteeriperäisen turistiripulin diagnostiikka nukleiinihaponosoitusmenetelmillä Sointu Mero HUSLAB 5.2.2015 Labquality Days Luennon sisältöä: matkailutaustaa ulosteen bakteeriviljely nukleiinihaponosoitusmenetelmät

Lisätiedot

Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa

Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa 27.01.2005 1 (6) Näytteiden tutkiminen elintarvike- ja talousvesivälitteisessä epidemiassa Kun kunnallinen viranomainen saa tiedon epäillystä elintarvike- tai talousvesiepidemiasta, kunnan ruokamyrkytysten

Lisätiedot

tulehduksellisten suolistosairauksien yhteydessä

tulehduksellisten suolistosairauksien yhteydessä ADACOLUMN -HOITO tulehduksellisten suolistosairauksien yhteydessä www.adacolumn.net SISÄLTÖ Maha-suolikanava...4 Haavainen paksusuolitulehdus...6 Crohnin tauti...8 Elimistön puolustusjärjestelmä ja IBD...10

Lisätiedot

Ajankohtaista asiaa vertailulaboratoriosta

Ajankohtaista asiaa vertailulaboratoriosta 24.6.2010 Ajankohtaista asiaa vertailulaboratoriosta Tähän viestiin on koottu ajankohtaisia asioita mikrobiologisia tutkimuksia tekeville laboratorioille. Aiheina tässä kirjeessä: NordValin juhlasymposium

Lisätiedot

Taulukko 1. RespiFinder RG Panel -tuotteen toteamisraja puhdistus huomioiden (QIAamp MinElute Virus Spin -sarja) 10(0,40) TCID 50 /0,2 ml

Taulukko 1. RespiFinder RG Panel -tuotteen toteamisraja puhdistus huomioiden (QIAamp MinElute Virus Spin -sarja) 10(0,40) TCID 50 /0,2 ml RespiFinder RG Panel Suorituksen ominaispiirteet RespiFinder RG Panel, versio 1, 4692163 Tarkista ennen kokeen suorittamista uusien elektronisten etikettiversioiden saatavuus osoitteesta www.qiagen.com/p/respifinder-rg-panel-ce.

Lisätiedot