Histokemia ja histologinen valmiste. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013

Samankaltaiset tiedostot
Histologinen valmiste/ Heikki Hervonen 2012/ Solubiologia ja peruskudokset-jakso/ Biolääketieteen laitos/ anatomia

SBPK info. Olet tässä. Lukujärjestys

Mikroskooppiset tekniikat käyttökohteesta

Solun tuman rakenne ja toiminta. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012

Mikroskopia 2: Verisively, sidekudos Solubiologia ja peruskudokset 2013 Heikki Hervonen/MA, Biolääketieteen laitos /Anatomia.

Epiteeli' Kateenkorva'

II. Maksa ja sappirakko Valmiste 1: Maksa Valmiste 92: Paasto-, normaali- ja rasvamaksa Valmiste 55: Sappirakko

Histologia. salasana kbkbkb

Värjäysliuokset, reagenssit ja fiksatiivit eläindiagnostiikkaan

Kateenkorvan histologiaa. Lymfanodulus (follikkeli), jossa itukeskus ja B-soluvaippa

Kateenkorvan histologiaa. Lymfanodulus (follikkeli), jossa itukeskus ja B-soluvaippa

Immunohistokemian ja tekniikan kierrosten arviointi ja ongelmakohdat värjäysmenetelmissä

Solubiologia ja peruskudokset/ Biolääketieteen laitos/ Anatomia TUMA JA SOLUSYKLI HEIKKI HERVONEN

MAYERIN JA COLEN HEMATOKSYLIINIEN VERTAILU HEMATOKSYLIINI-EOSIINIVÄR- JÄYKSESSÄ

NOPEAT KUDOSPROSESSITEKNIIKAT PATOLOGIASSA

Histopatologian. Pirkko Hirsimäki. patologian palvelualue

Tärkeimpien solutyyppien tunnistaminen kudosleikkeissä immunohistokemiallisilla värjäyksillä

SOLUT LIIKKUVAT JA MUUTTAVAT MUOTOAAN

Ruora-jakson mikroskopia II: Ruoansulatuskanava ja suu /H. Hervonen ja M. Airaksinen 2013

Mikroskopia 1: Mikroskopointi ja epiteelit/ Solubiologia ja peruskudokset 2013 Heikki Hervonen/MA Biolääketieteen laitos / Anatomia

Sidekudos. Sidekudos. Makrofagi. Makrofagit (mononukleaarinen syöjäsolujärjestelmä)

PATOLOGIA PATOLOGIAN TUTKIMUSNIMIKKEET

lisääntynyt kapillaarien läpäisevyys lymfa- l. imusuonet (umpipäätteisiä), päärungot avautuvat yläonttolaskimoon

Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset

HISTOLOGISEN NÄYTTEEN PROSESSI LABORATORIOSSA OPPIMATERIAALI

Kehitysbiologiassa käytetään lukuisia viekkaita kuvantamismenetelmiä

KONTROLLIEN KERÄÄMINEN. Työohjeistus. Fimlab Laboratoriot Oy. Histologian laboratorio

Solubiologia ja peruskudokset- jakso/ Biolääketieteen laitos/ Anatomia HEIKKI HERVONEN

Kromosomit. 1. Mitoosipreparaatti sipulin juurenkärjestä. 2. Drosophilan sylkirauhaskromosomi. monisteen sivulta 32-

Elimistö puolustautuu

Kudoskuljetusohjelmien vertailu rasvaisilla näytteillä

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

ENTSYYMIKATA- LYYSIN PERUSTEET (dos. Tuomas Haltia)

ylilääkäri Teijo Kuopio

SIDEKUDOS. Solubiologia ja peruskudokset Biolääketieteen laitos/ Anatomia HEIKKI HERVONEN

Solubiologia ja peruskudokset opintojakso Veri ja veren solut. Biolääketieteen laitos/ Anatomia, HY

Peptidi ---- F K V R H A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 3. Solujen kemiallinen rakenne

Elimistö puolustautuu

Biomolekyylit ja biomeerit

Thermo. Shandon RAPID-CHROME Iron Stain and RAPID-CHROME Nuclear Fast Red Counterstain ELECTRON CORPORATION. Rev. 5, 09/03 P/N

Eläinfysiologia ja histologia

11. Elimistö puolustautuu

BAL-menetelmä: laboratorion näkökulma. OYS Patologian osasto Sytologian laboratorio Leena Seppälä 2017

Essential Cell Biology

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

SOLUBIOLOGIAN LUENTORUNKO (syksy 2013) Seppo Saarela ;

HISTOLOGIAN OPPIMATERIAALI

HISTOLOGISTEN KUDOSTEN TUNNISTUSOPAS

Sidekudos ja rasvakudos

Hanna Järvenpää & Tanja Pohjola PATHOS DELTA -PIKAKUDOSPROSESSORIN TOIMINNAN TESTAUS

Sytosoli eli solulima. Sytosoli. Solunsisäiset rakenteet, kalvostot ja proteiinien lajittelu (Chapter 12 Alberts et al.)

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

Solubiologia ja peruskudokset- jakso/ biolääketieteen laitos/ anatomia SOLUN TUKIRANKA HEIKKI HERVONEN

In Situ Hybridisaatio - menetelmä patologian laboratorion työvälineenä

Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia

Tuma. Tuma 2. Tuma 3. Tuma 1. Hemopoiesis. solun kasvaessa tuma kasvaa DNA:n moninkertaistuminen jättisolut

KandiakatemiA Kandiklinikka

Käsitteitä. Hormones and the Endocrine System Hormonit ja sisäeritejärjestelmä. Sisäeriterauhanen

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

ANTIGEENIEN PAIKANTAMINEN SOLUBLOKEISTA

Hengityshiston itseopiskelutehtäviä

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

DNA:n informaation kulku, koostumus

Miten rokottaminen suojaa yksilöä ja rokotuskattavuus väestöä Merit Melin Rokotusohjelmayksikkö

GROCOTT- JA ZIEHL- NEELSEN-VÄRJÄYKSIEN TESTAUS ARTISAN LINK - ERIKOISVÄRJÄYS- AUTOMAATILLA

Kondensaatio ja hydrolyysi

Tuma, solusykli ja mitoosi/heikki Hervonen 2012/Biolääketieteen laitos/anatomia Solubiologia ja peruskudokset-jakso

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

Aikaerotteinen spektroskopia valokemian tutkimuksessa

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 2. Solun perusrakenne

LYMFOSYTOOSIT SANOIN JA KUVIN. Pentti Mäntymaa TAYS, Laboratoriokeskus

Bioteknologian perustyökaluja

Erilaisia soluja. Siittiösolu on ihmisen pienimpiä soluja. Tohvelieläin koostuu vain yhdestä solusta. Veren punasoluja

Tarkastele kuvaa, muistele matematiikan oppejasi, täytä tekstin aukot ja vastaa kysymyksiin.

HEIKOT VUOROVAIKUTUKSET MOLEKYYLIEN VÄLISET SIDOKSET

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

2. Täydennä seuraavat reaktioyhtälöt ja nimeä reaktiotuotteet

6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi

Anatomia ja fysiologia 1 Peruselintoiminnat

IMMUNOHISTOKEMIALLISET CD-VÄRJÄYK- SET

Itseopiskelun polttopistetehtävät 2012: 1. Solun kalvorakenteet ja kalvokierto/heikki Hervonen

TUKIMATERIAALI IMMUNOHISTOKEMIAL- LISISTA CD-VÄRJÄYKSISTÄ

IMMUUNIPUUTOKSET. Olli Vainio Turun yliopisto

Biokemian perusteet : Hemoglobiini, Entsyymikatalyysi

Ki-67-PROLIFERAATIOINDEKSIN MÄÄRITYS AIVOKASVAIMISSA

Esim. ihminen koostuu 3,72 x solusta

Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi

Genetiikan perusteiden toisen jakson kaavailua

VÄRIKÄSTÄ KEMIAA. MOTIVAATIO: Mitä tapahtuu teelle kun lisäät siihen sitruunaa? Entä mitä havaitset kun peset mustikan värjäämiä sormia saippualla?

PT-MODULI IMMUNOHISTOKEMI- ALLISTEN NÄYTTEIDEN ESIKÄ- SITTELYSSÄ

2.1 Solun rakenne - Lisämateriaalit

12 (25) KUVA 8B. Levyepiteelisoluja 400-kertaisella suurennoksella

Tilkkuilijan värit. Saana Karlsson

Tentit ja muut suoritukset. Solubiologia (5 op) Mistä löytyy tietoa? Mistä löytyy

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Solut liikkuvat ja muuttavat muotoaan. Heikki Hervonen 2012

Transkriptio:

Histokemia ja histologinen valmiste Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013

Mittakaavat: Alberts 5; s580 makroanatomia, mikroanatomia eli histologia, Silmä(lasit) Luuppi Valomikroskooppi solubiologia, molekyylibiologia, kemia, Valomikroskooppi EM-skooppi EM-skooppi (atomifysiikka) (hiukkasfysiikka) EM-skooppi Biokemia Kemia

Valomikroskooppinen histologinen kudostutkimus on edelleen tärkein patologian alan diagnostinen menetelmä Maksakudosta immunohistokemia, in situ hybridisaatio, elektronimikroskopia täydentävät ja tarkentavat diagnostiikkaa

Näytetyyppejä Traditionaalinen kudosbiopsia Leikataan irti pala kudosta Ohut- ja paksuneulabiopsiat Endoskooppisesti otetut kudosnäytteet Barretin ruokatorvi (metaplasia) Sivelyvalmisteet Papa-näyte

Histologinen valmiste Viljelty solu valomikroskoopissa Sama solu vaihevastakohta valomikroskoopissa Sama interferenssi (Nomarski)-optiikalla Solu ilman värjäystä ilman värjäystä ilman värjäystä Lähde: Alberts Solun ääriviivat erottuvat vaivoin. Solun sisällä erottuu vain jokunen jyvänen Solun ja tuman ääriviivat erottuvat selvästi. Sytoplasman rakenteita erotettavissa. Samat asiat erottuvat, mutta muodostavat korkokuvan. Elintä tai kudospalaa ei voi tarkastella sellaisenaan solukerrokset projisioituvat päällekkäin. Ratkaisu: Tehdään ohut leike ja värjätään se histologinen valmiste. Tässä kasvin juuren kärjen poikkileikkaus.

Histologisen näytteen valmistaminen 1) Kiinnittäminen - formaliiniliuos yleisin - jotta kudos kestäisi jatkokäsittelyt 2) Leikkaamisen valmistelu kudoksen kovettaminen pehmeää kudosta ei voi leikata, parafiini kovettaa kudoksen - jäädyttämällä dehydraatio saadaan - alkoholisarja kudos kovetetuksi (50%,70%, ilman 95%, alkoholia, abs, abs) xyleeniä paraffiinivalu ja parafiinia - ksyleenin jääleiketekniikka kautta on lisäksi nopea 3) Leikkaaminen - 5-10 mikronia

Histologisen näytteen valmistaminen 1) Kiinnittäminen - formaliiniliuos yleisin 2) Leikkaamisen valmistelu kudoksen kovettaminen pehmeää kudosta ei voi leikata, parafiini kovettaa kudoksen - jäädyttämällä saadaan kudos kovetetuksi ilman alkoholia, xyleeniä ja parafiinia jääleiketekniikka on lisäksi nopea 3) Leikkaaminen - 5-50 mikronia

Leikkaaminen Kuva: Karppinen

LEIKE, vielä ryppyinen Kuva: Karppinen

Histologisen näytteen valmistaminen 1) Kiinnittäminen - formaliiniliuos yleisin - jotta kudos kestäisi jatkokäsittelyt 2) Leikkaamisen valmistelu kudoksen kovettaminen pehmeää kudosta ei voi leikata, parafiini kovettaa kudoksen dehydraatio - alkoholisarja (50%,70%, 95%, abs, abs) paraffiinivalu - ksyleenin kautta 3) Leikkaaminen - 5-10 mikronia 4) Värjäyksen valmistelu = parafiinin poisto ksyleenillä ja vesiliuokseen vienti (käänteinen alkoholisarja), koska parafiini estää värin tarttumisen 5) Värjääminen tapahtuu yleensä vesiliuoksessa - esim. hematoksyliini-eosiini (HE) 6) Kestovalmisteen teko - näyte päällystetään peitinlasilla

Värjääminen Värjääminen voidaan tehdä joko käsin (vieressä) tai automaatilla (alla). Parafiini liuotetaan ensin pois ksyleenissä. Kuva: http://www.ucl.ac.uk/~rmkdhjh/autostnr.htm

Histologinen värjäys (HE) 1) Hematoksyliini on sininen väriaine. Se käyttäytyy värjäysliuoksessa kuin emäksinen väriaine, joka ionisoituu vesiliuoksessa positiiviseksi ioniksi (kationi) Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + 2) Kudoksessa erityisesti DNA ja RNA (sekä happamat yhdisteet) varautuvat negatiivisesti luovutettuaan vesiliuoksessa H + :n DNA RNA

Histologinen värjäys (HE) 1) Hematoksyliini on sininen väriaine. Se käyttäytyy värjäysliuoksessa kuin emäksinen väriaine, joka ionisoituu vesiliuoksessa positiiviseksi ioniksi (kationi) Väri + Väri + Väri + Väri + Väri + 2) Kudoksessa erityisesti DNA ja RNA (sekä happamat yhdisteet) varautuvat negatiivisesti luovutettuaan vesiliuoksessa H + :n 3) Positiivisesti varautuneet hematoksyliini-ionit sitoutuvat kudoksen negatiivisiin varauksiin 4) Näytteessä DNA ja RNA värjäytyvät siis hematoksyliinilla, emäksisellä värillä basofiilisesti Tässä näytteessä tumat värjäytyvät basofiilisesti Väri Väri Väri Väri Väri Väri Väri DNA Väri Väri Väri RNA Väri Väri Väri Väri Väri Väri + Väri Väri Väri Väri Väri Väri Väri Väri Väri Väri Kerr: Atlas of Functional Histology. 1st edition, 1999 Mosby

Nucleolus on tumma Tuman rakenteita H = Heterokromatiini on tummaa E = Eukromatiini on vaaleaa Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby TEMkuva

Nisslin jyväset Valomikroskoopissa ribosomikertymät (rer) erottuvat basofilisinä läiskinä, Nisslin jyväsinä Neuronilla on vahvasti kehittynyt RER, jossa valtava määrä ribosomeja Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby Lähde: J.F.Kerr, Atlas of Functional Histology

Histologinen värjäys (HE) 1) Eosiini on punainen väriaine. Se on hapan väriaine, joka ionisoituu negatiiviseksi ioniksi (anioni) 2) Kudoksen proteiinien aminoryhmät varautuvat vesiliuoksessa positiivisesti. Eosiini- Eosiini- Eosiini- Eosiini- Eosiini - Eosiini- Eosiini- Eosiini - Eosiini - Eosiini Eosiini- - Eosiini- Eosiini- Eosiini- Eosiini- Eosiini - Eosiini -Eosiini - Eosiini- Eosiini - Eosiini- Eosiini- Eosiini- Eosiinip r o t e i + i n i + + + + ++ + + + + + + + + + + + + Heikki Hervonen HY, BLL, 2004

Histologinen värjäys (HE) 1) Eosiini on punainen väriaine. Se on hapan väriaine, joka ionisoituu negatiiviseksi ioniksi (anioni) Eosiini - Eosiini - Eosiini- Eosiini- Eosiini- 2) Kudoksen proteiinien aminoryhmät varautuvat Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini vesiliuoksessa positiivisesti. + p r o t e i i + Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini n i Eosiini 3) Negatiivisesti varautunut eosiini sitoutuu kudoksen positiivisiin varauksiin (erik. proteiineihin) - mm.kollageenisäiket ja sytoplasmiset tukirankasäikeet + Eosiini Eosiini + + Eosiini + Eosiini Eosiini Eosiini Eosiini 4) Näytteessä siis proteiinit värjäytyvät eosinofiilisesti (=asidofiiisesti) Tässä lihassolun proteiinit värjäytyvät eosiinilla punaiseksi Tumat hematoksyliinilla siniseksi. Kerr: Atlas Heikki of Functional Hervonen HistologyHY, 1999, BLL, Mosby 2004

Proteiinipitoinen sytoplasma värjäytyy yleensä eosinofiilisesti Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby Hikirauhassolujen sytoplasma värjäytyy voimakkaan eosinofiilisesti Mahan limakalvon epitelisolujen ja rauhassolujen sytoplasma värjäytyy voimakkaan eosinofiilisesti

Sileälihassoluja HE-värjäyksessä. Proteiinirikas sytoplasma näkyy homogeenisen punaisena, kun taas perifeeriset tumat hematoksyliinillä sinertävinä Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby

Myös soluväliaineen proteiinit, tässä kollageeni, värjäytyvät eosiinilla Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby Edellinen kuva Kollageenisyiden välissä olevat fibroblastien tumat värjäytyvät kuvassa basofiilisesti

Haiman eksokriininen solu Miten tämä solu värjäytyy HE-värjäyksessä??? Eriterakkuloissa on proteiineja - solun kärkiosa värjäytyy siis.? Tuman ympärillä on runsaasti RER:a solun tyviosa värjäytyy siis.? Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby

Haiman eksokriininen solu Eriterakkuloissa on proteiineja - solun kärkiosa värjäytyy siis eosinofiilisesti Tuman ympärillä on runsaasti RER:a, solun tyviosa värjäytyy siis basofiilisesti

Eksokriinisen haiman rauhasrakenne Basofiilinen karkeapintainen endoplasmakalvosto (RER, ribosomeja!) ja eosinofiiliset eritejyväset (proteiineja) Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby Heikki Hervonen HY, BLL, 2004

Rasvapisarat ovat liuenneet pois tavallisesta näytteestä Rasvasolun sytoplasma erottuu ohuena juosteena kadonneen rasvapisaran ympärillä. Erikoismenetelmillä rasva saadaan säilymään ja voidaan värjätä = triglyseridejä Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby N = rasvasolun tuma Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby

Histokemia ja entsyymihistokemia Histokemialliset värjäykset: PAS-värjäykset hiilihydraateille, Alcian-Blue happamille mukopolysakkarideille, hopesuoloihin perustuvat värjäykset retikuliinisäikeille ja hermosoluille Entsyymihistokemiassa käytetään hyväksi solujen omia, hajottavia entsyymeitä, jotka saadaan näkyviksi: entsyymien substraattina käytetään tällöin metallisuoloja, jotka hajotessaan jäävät paikalleen sakkana ja näkyvät mikroskoopissa

Hiilihydraatit eivät värjäydy hematoksyliini-eosiini-värjäyksellä Pikarisolujen erite (hiilihydraatteja) näyttäytyy epiteelin värjäytymättömänä alueena Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby

PAS-värjäys on histokemiallinen värjäysmenetelmä hiilihydraateille PAS-värjäys värjää myös glycokalyksin ja tyvikalvon glykoproteiinit PAS värjäys värjää pikarisolun eritteen kirkkaan punaiseksi PAS = PeriodicAcid- Schiff eli perjodihappo-schiff Kerr: Atlas of Functional Histology 1999, Mosby

Immunohistokemia Kuva: Minna Takkunen: Epithelialmesenchymal transition in oral squamous carcinoma cells. Väitöskirja

Immunohistokemia Immunohistokemiassa käytetään hyväksi elimistön tuottamia vasta-aineita, humoraalista immunovastetta Koe-eläin immunisoidaan, rokotetaan halutulla (makro)molekyylillä (antigeeni). Tämä stimuloi immuunisoluja tuottamaan spesifisiä vasta-aineita ja muistisoluja. Kun rokotus toistetaan saadaan voimistuva immuunivaste 2-4 immunisaation jälkeen voidaan seerumista kerätä suurempia määriä vasta-aineita, jotka tunnistavat spesifisesti ainoastaan immunisaatiossa käytetyn proteiinin eli antigeenin Monoklonaaliset vasta-aineet tuotetaan soluviljelmissä Virtanen 2009

Vasta-aineen rakenne Kaksi identtistä raskasta ketjua ja kaksi identtistä kevyttä ketjua Y:n muodossa antigeenia sitova alue antigeenia sitova alue vaihteleva alue pysyvä alue nivelalue aminopää Y-muotoisen vastaainemolekyylin käsissä vaihteleva alue, johon vasta-aine sitoutuu Vasta-aineen raskaissa ketjuissa samanlaiset alueet kevyt ketju raskas ketju carboksyylipää komplementtia sitova alue F c -fragmentti F ab -fragmentti Ross & Pawlina: Histology. A Text and Atlas, LWW 2011

Epäsuoran immunohistokemia Antigeenissa oleva antigeeninen rakenne A Primaariset vasta-aineet: kanissa syntyneet vasta-aineet antigeeni A:ta kohtaan Esim. lampaassa syntyneet sekundaariset vasta-aineet, joihin on kiinnitetty visualisoitava markkeri kanivastaaineita kohtaan Alberts et al.: Molecular Biology of The Cell 5.ed, 2008 Garland Science markkeri 1. Ns. polyklonaalinen kanissa nostatettu vasta-aine antigeenia A kohtaan. 2. Lampaassa nostatettu antigeeni kanin vasta-ainemolekyylin Fc-osaa vastaan, joka on merkitty fluoresoivalla molekyylillä. Markkerina voi olla vasta-aineeseen kytketty fluorokromi, esim. fluoreskeiini vasta-aineeseen kytketty entsyymimolekyyli vasta-aineeseen kytketty kultapartikkeli (EM)

Immunohistokemiallinen kuva vimentiini-välikokoisista säikeistä monoklonaalisen vasta-aineen avulla. Fibroblasti Virtanen 2009

Immunovärjäys diagnostiikassa: Lupus nefriitissä (munuaistauti) munuaiskeräseen kertyy proteiineja. Virtanen 2009

Hybridisaatio, erityisesti in situ hybridisaatio Perustuu siihen, että yksinkertainen RNA tai DNA ketju (probe, koitin) sitoutuu spesifisesti vastinsekvenssiinsä kohteessa (DNA, mrna) Reaktio voi tapahtua liuoksessa, geelissä tai kudoksessa (in situ) Reaktiolla voidaan tunnistaa tietyt sekvenssit tai määrittää niiden esiintymispaikka kromosomeissa/ soluissa/ kudoksissa Kun käytetään eri värisiä fluorokromeja eri koittimien merkitsemiseen, voidaan samassa preparaatissa värjätä useita kohteita.

In situ hybridisaatio a. Peruselementit ovat DNA koitin ja kohdesekvenssi (emäsjärjestys) b. Koitin voidaan leimata suoraan fluorokromilla c. Koitin ja kohde DNA denaturoidaan, jotta saadaan aikaan yksisäikeinen (single stranded) DNA d. Nämä yksisäikeiset DNA:t saatetaan yhteen, mikä sallii vastinketjujen sitoutumisen kohdakkain e. Fluorokromilla merkitty koitin voidaan viedä mikroskopiaan.

Dongmei Cui: Atlas of Histology with Functional and Clinical Correlations, LWW, 2011 Ross & Pawlina: Histology. A Text and Atlas, LWW 2011 Jeffrey B. Kerr: Atlas of Functional Histology. Mosby 1999

Immunohistokemia Kuva: Minna Takkunen: Epithelialmesenchymal transition in oral squamous carcinoma cells. Väitöskirja