Miten letaalialleeleita käsitellään Drosophilalla? Välttämätön taito esimerkiksi alkionkehityksen alkuvaiheiden selvittämisessä

Samankaltaiset tiedostot
Genetiikan perusteet. Tafel V Baur E. (1911) Einführung in die experimentelle Vererbungslehre. Verlag von Gebrüder Borntraeger, Berlin.

Elämän tarkoitus on geenien kartoitus

a. Mustan ja lyhytkarvaisen yksilön? b. Valkean ja pitkäkarvaisen yksilön? Perustele risteytyskaavion avulla.

alleelipareja dominoiva dominoiva resessiivinen

S Laskennallinen systeemibiologia

III Perinnöllisyystieteen perusteita

Perinnöllisyyden perusteita

Perinnöllisyys. Enni Kaltiainen

Positional cloning. Pedigreessä etenevä ominaisuus kartoitetaan ensin karkeasti ja sitten tehdään yhä tarkempaa työtä molekyylimarkkereilla.

Perinnöllisyyden perusteita

Genetiikan perusteet 2009

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

Symbioosi 2 VASTAUKSET

Evoluutio. BI Elämä ja evoluutio Leena Kangas-Järviluoma

III Perinnöllisyystieteen perusteita

Sukupuolijutut 2 Kärpänen ja ihminen

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

Miten geenit elelevät populaatioissa, vieläpä pitkiä aikoja?

Geneettinen analyysi 2014, laskuharjoitukset

E. colin auksotrofiset mutantit

Darwin nuorena. Darwinin syntymästä on 201 vuotta ja "Lajien synnystä" 151 vuotta.

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

Kehitysbiologiassa käytetään lukuisia viekkaita kuvantamismenetelmiä

Kanarialinnun perintötekijät Spalt = Saksankielinen sana ja tarkoittaa perityvä mutta ei näkyvä ominaisuus

Lypusa maurella (Denis & Schiffermüller, 1775)

III GEENIKARTAT JA KROMOSOMIKARTAT

Monogeeniset sairaudet. Monogeeninen periytyminen. Perinnöllisten tautien prevalenssi. Monitekijäiset sairaudet. Dominantti vs.

This document has been downloaded from TamPub The Institutional Repository of University of Tampere

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA

Lataa Kelpoisimman synty - Andreas Wagner. Lataa

Perinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen

Diurnea fagella (Denis & Schiffermüller, 1775)

Symbioosi 2 TEHTÄVÄT

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla

Kromosomit. 1. Mitoosipreparaatti sipulin juurenkärjestä. 2. Drosophilan sylkirauhaskromosomi. monisteen sivulta 32-

Symbioosi 2 VASTAUKSET. b. Millaisia sukusoluja vanhemmat tuottavat (4 erilaista)? Vastaus: VL, vl, Vl, vl

Bioteknologian perustyökaluja

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

ax + y + 2z = 0 2x + y + az = b 2. Kuvassa alla on esitetty nesteen virtaus eräässä putkistossa.

couch potato -kandidaattigeenissä esiintyvän mutaation vaikutus Drosophila montana -naaraiden lisääntymislepokauteen

Geenitekniikan perusmenetelmät

Metsästys ja riistanhoito saaristossa

Villervalla - kaoottisen metelin ja raivon paikaksi kun luostarilaitos hävitetään vuonna 1547.

KEESHONDIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS

a) dominoivaan: esiintyy joka sukupolvessa, sairaille vanhemmille voi syntyä terveitä lapsia

VASTAUS 2a: Ruusukaijasten väri

Projekti: Photo Goldeneye 2015

Lisää matalapalkkatyötä

Lataa Tiesitkö tämän linnuista? - Pertti Koskimies. Lataa

Tehtävät 1/10. TAMPEREEN YLIOPISTO Informaatiotieteiden tiedekunta Valintakoe Matematiikka ja tilastotiede. Sukunimi (painokirjaimin)

Signalointi: kustannukseton signalointi (halpa puhe)

Toiminnanhoitajan katsaus. Vuodet

metsän kieli Luonnon aakkoset Adjektiivijahti Vastakohtien etsintä Sanakäärme Sana-arvoitus Narujuoksu Tiedän ja näen

Luentorunko 5: Limittäisten sukupolvien malli

UUSI AIKA. Sisällys NYT ON AIKA VALITA HYVÄ ELÄMÄ JA TULEVAISUUS, JOKA ON MAHDOLLINEN.

Geenikartoitusmenetelmät. Kytkentäanalyysin teoriaa. Suurimman uskottavuuden menetelmä ML (maximum likelihood) Uskottavuusfunktio: koko aineisto

Symbioosi 1. Selvitä, mikä merkitys evoluution ja luonnonvalinnan kannalta on seuraavilla asioilla:

Täpläravun levinneisyyden rajat ja kannanvaihtelut

Huomioita korkeakoulutuksesta ja mahdollisuuksien tasa-arvosta

DNA sukututkimuksen tukena

Suomen Vinttikoiraliitto ry Vinttikoirakokeiden toimihenkilökoulutus

Molekyylipopulaatiogenetiikka

Kvantitatiivinen genetiikka moniste s. 56

Lisääntyminen. BI1 Elämä ja evoluutio Leena kangas-järviluoma

Periytyvyys ja sen matematiikka

Perustunteita. Ihmisellä on paljon erilaisia tunteita. Osa niistä on perustunteita.

Evoluutiovoimat. Ydinkysymykset. Mikä on mutaation, valinnan ja sattuman merkitys evoluutiossa?

KUVIA K-PENNUISTA V HUHTIKUU 2012

Ohjelmassa on käytettävä funktiota laskeparkkimaksu laskemaan kunkin asiakkaan maksu. Funktio floor pyöristää luvun lähimmäksi kokonaisluvuksi.

Pakkaus on välttämätön hyvä ei välttämätön paha

Tuoretta tietoa Etelä-Savon taimenkannoista

Suomalaisen maatiaiskanan säilytysohjelman koulutuspäivä, Riihimäki, Pasi Hellstén

TÖYHTÖTIAINEN. Lentävä Töyhtis. Ville Arpiainen ja Venla Ylikopsa Käsityöopettajan koulutus, Helsingin yliopisto

Sukupuolijutut 3. Ihmisen (nisäkkään) seksuaalikromosomi on Y. Y-kromosomi?

PAS-tilanne ja julkaistujen opinnäytteiden pitkäaikaissäilytykseen liittyvä prosessi ja edellytykset

Lataa Kysymyksiä ja vastauksia elävästä luonnosta - Leena Aho. Lataa

TIES592 Monitavoiteoptimointi ja teollisten prosessien hallinta. Yliassistentti Jussi Hakanen syksy 2010

Tietokannan tietoturva. Heli Helskyaho Tietoturva-aamupäivä, Oracle House

Muistikysely MUUT LOMAKKEET

Amerikanakitojen geneettinen historia LUENNOITSIJA: SAIJA TENHUNEN

1. Miten peltoenergian tuotannon kestävyyttä ja energiataseita voidaan parantaa? (5 p)

Lajistoseurannat. Juha Siitonen. Metsäntutkimuslaitos, Vantaan toimintayksikkö

PERUSTIETOJA MEHILÄISTEN PERIMÄSTÄ

LUONTOA VOI SUOJELLA SYÖMÄLLÄ

Huippuyksikköseminaari Leena Vähäkylä

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

Implementation of Selected Metaheuristics to the Travelling Salesman Problem (valmiin työn esittely)

Königsbergin sillat. Königsberg 1700-luvulla. Leonhard Euler ( )

Metsähanhen metsästyksen EETTISET OHJEET

Parisuhteen vaiheet. Yleensä ajatellaan, että parisuhteessa on kolme vaihetta.

HOX. Esimerkki geeniperheestä: HOX

Virkaanastujaisesitelmä Anneli Hoikkala. Evoluutotutkimus: ekologiaa ja molekyyligenetiikkaa

PORIN AKVAARIOKERHO KUUKAUDEN KALA

Populaatiosimulaattori. Petteri Hintsanen HIIT perustutkimusyksikkö Helsingin yliopisto

"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13

Lataa Nuoruusiän alkuvaiheet - Peter Blos. Lataa

Tehtävä 1. Hypoteesi: Liikuntaneuvonta on hyvä keino vaikuttaa terveydentilaan. Onko edellinen hypoteesi hyvä tutkimushypoteesi? Kyllä.

PINSERIT RY:n VUODEN PINSERI SÄÄNNÖT

Arkkitehtuurien tutkimus Outi Räihä. OHJ-3200 Ohjelmistoarkkitehtuurit. Darwin-projekti. Johdanto

Transkriptio:

Miten letaalialleeleita käsitellään Drosophilalla? Välttämätön taito esimerkiksi alkionkehityksen alkuvaiheiden selvittämisessä

Balansoitu kanta Koejärjestely perustuu ns. balansoidun kannan käyttöön. Tällaisia kantoja on olemassa D. melanogasterilla useita, erikseen kaikkia kromosomeja varten. Balansointi tarkoittaa sitä, että letaalialleeli tasapainotetaan toisella, yhtä letaalilla, jolloin vain heterotsygootit elävät. Jotta tasapainotus ulottuisi laajalle alueelle kromosomissa, käytetään lisäksi inversioita, jotka eliminoivat crossing overit Ennenvanhaan tämä oli kurssityö, mutta se on liian vaikea nykyopiskelijoille, joten siitä on luovuttu

Alla on kannan In(2+2R)/Bl ² kakkoskromosomiparin sisältö oleellisilta osiltaan: Sentromeeri on merkitty viheriällä kuviolla ja punapalloset kuvaavat markkerien paikkoja. + Bl Bl 2 Inversio 2 Inversio 2R Bl + + Curly kiharat siivet (alkuperäinen kuvaus 1923) Bl Bristle sukasvika (alkuperäinen kuvaus 1927) obe silmä kapea, jopa puuttuu (moderni koe)

Alla on kannan In(2+2R)/Bl ² kakkoskromosomiparin sisältö oleellisilta osiltaan: Sentromeeri on merkitty viheriällä kuviolla ja punapalloset kuvaavat markkerien paikkoja. + Bl Bl 2 Inversio 2 Inversio 2R Bl + +, Bl ja ovat dominantteja, mutta homotsygoottina letaaleja alleeleita Inversiot estävät crossing overin, yhdessä koko toisen kromosomin alueella

Parasentrinen inversio "estää" crossing-overin tämän inversion alueella heterotsygoottisessa yksilössä. Ne kromosomit, joissa crossing over on tapahtunut, ovat kelvottomia ja joutuvat hukkaan. Inversiot ovat Drosophila melanogasterilla harvinaisia ja voidaan huoletta olettaa, että tutkittavat villityyppiset kromosomit ovat inversion suhteen ns. standardin mukaisia. Crossing over on aina estynyt sentromeerin lähistöllä ja kromosomin päissä (eli telomeerien lähellä).

Inversio eli kääntymä Perisentrinen Jos inversion sisällä tapahtuu crossing over, on osa syntyvistä kromosomeista vajavaisia Koska niillä on sentromeeri, ne menevät gameetteihin, jotka sitten ovat elinkelvottomia

Inversio tämäkin Parasentrinen Virheellisiä gameetteja ei edes synny, sillä crossing over -juosteissa on 2 tai 0 sentromeeria

x Balansoidun kannan ylläpito on helppoa: Homotsygootit eivät elä, vain heterotsygootti pysyy elossa Kärpäspullossa hävikki ei tunnu missään. Kettutarhalla (platinamuunnokset) tai kennelissä (rhodesianharjaselkä) villityyppejä syntyy ja ne hävitetään arvottomina! Homotsygootit kuolevat, joten tuotto on heikko.

x No miten tätä sitten käytetään esimerkiksi mutaatioiden metsästyksessä, jos halutaan löytää myös letaalialleeleita?

Otetaan normaali kärpäskanta, joka on inversion suhteen standardi (erilainen kuin kromosomi)

x EMS tms mutageeni Mutagenisoidaan kärpäsiä kovasti ja risteytetään sitten kannan kanssa (lyhenne-puhetapa)

x EMS tms mutageeni Otetaan talteen -koiraat, heitetään -kärpäset roskiin. kromosomin parina on nyt yksi mutagenisoitu kromosomi jokaisessa yksilössä

EMS tms mutageeni x Risteytytetään -koiraat yksi kerrallaan useiden -kannan naaraiden kanssa Idea: yksi koiras voi saada paljon paljon poikasia, joilla kaikilla on kopio tuosta yhdestä mutagenisoidusta kromosomista

EMS tms mutageeni x, talteen obe, roskiin /, roskiin (ei inversiota) Uusi kanta, jossa yksi mutagenisoitu kakkoskromosomi

Uusi kanta toimii näin: x Mikäli tämä on letaali, nähdään vain kiharasiipisiä, mutta tiedetään, että se nimenomainen mutantti on tuolla tallessa, :llä balansoituna

Uusi kanta toimii näin: x Mikäli tämä on näkyvä mutaatio, ollaan tyytyväisiä siihen, että se saatiin näin näppärästi homotsygoitua; perustetaan kanta ja rekisteröidään se

Näin niitä mutantteja metsästetään, ja paljon niitä on sadan vuoden aikana löydetty: FlyBase