Rakenne 2. Mitokondriot. Historiaa. Rakenne 3. Rakenne 1. Mitokondrio halkaistuna

Samankaltaiset tiedostot
Mitokondriot. Mitokondrion sisäkalvon muodostamat fragmentit. Historiaa. Mitokondrioiden hajottaminen ultraäänellä

Historiaa. Mitokondriot. Chapter Palade: rakenne

Soluhengitys + ATP-synteesi = Oksidatiivinen fosforylaatio Tuomas Haltia Elämälle (solulle) välttämättömiä asioita ovat:

Oksidatiivinen fosforylaatio = ATP:n tuotto NADH:lta ja FADH2:lta hapelle tapahtuvan elektroninsiirron ja ATP-syntaasin avulla

Elintoimintojen ylläpito

Tuma. Tuma 2. Tuma 3. Tuma 1. Hemopoiesis. solun kasvaessa tuma kasvaa DNA:n moninkertaistuminen jättisolut

Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15

Ribosomit 1. Ribosomit 2. Ribosomit 3

PROTEIINIEN MUOKKAUS JA KULJETUS

Ribosomit 1. Ribosomit 4. Ribosomit 2. Ribosomit 3. Proteiinisynteesin periaate 1

2.1 Solun rakenne - Lisämateriaalit

Peptidi ---- F K V R H A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit

GLYKOLYYSI! Glykolyyttinen metaboliareitti! LUENNON RAKENNE! ENERGIA HIILIHYDRAATEISTA. ATP:n ANAEROBINEN JA AEROBINEN UUDELLEENMUODOSTUS

Sytosoli eli solulima. Inkluusiot. Sytosoli. Solunsisäiset rakenteet, kalvostot ja proteiinien lajittelu

Poikkijuovainen lihassolu 1. Erilaistuneita soluja. Lihassolu. Poikkijuovainen lihassolu 2. Lihaskudokset. Poikkijuovainen lihassolu 3

SOLUN AINEENVAIHDUNTA Nina Peitsaro Helsingin yliopisto Lääketietellinen tiedekunta/biokemia

Tuma - nucleus. Tumahuokonen nuclear pore samanlaisia kasveilla ja eläimillä. Tuman rakenne. Solubiologian luennot 2003, kasvitiede

GLYKOLYYSI! Riikka Kivelä, LitT Tutkijatohtori Wihurin tutkimuslaitos ja Translationaalisen syöpäbiologian tutkimusohjelma Helsingin yliopisto

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi

Sytosoli eli solulima. Sytosoli. Solunsisäiset rakenteet, kalvostot ja proteiinien lajittelu (Chapter 12 Alberts et al.)

Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30

Vastaa lyhyesti selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Sukunimi Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 2. Solun perusrakenne

Supporting Information for

Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä

Solun tuman rakenne ja toiminta. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012

Bioteknologia tutkinto-ohjelma valintakoe Tehtävä 1 Pisteet / 30

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 3. Solujen kemiallinen rakenne

ALKOHOLIN VAIKUTUS MAKSAN AIN E ENVAIH DUNTAAN

-1- Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin voi vastata suomeksi, ruotsiksi tai englanniksi.

Solun toiminta. II Solun toiminta. BI2 II Solun toiminta 8. Solut tarvitsevat energiaa

Solu - perusteet. Enni Kaltiainen

NITRIFIKAATIOBAKTEERIEN TOIMINTA

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla

Solubiologian ja biokemian perusteet (4 op) ) Solun rakenne. Campbell & Reed: Biology, 9th ed., Chapter 6, A Tour of the Cell

Nimi sosiaaliturvatunnus

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

Solun toiminta. II Solun toiminta. BI2 II Solun toiminta 7. Fotosynteesi tuottaa ravintoa eliökunnalle

Tarkastele kuvaa, muistele matematiikan oppejasi, täytä tekstin aukot ja vastaa kysymyksiin.

The Plant Cell / Sytoskeleton

The Plant Cell / ER, diktyosomi ja vakuoli

Väärin, Downin oireyhtymä johtuu ylimääräisestä kromosomista n.21 (trisomia) Geeni s. 93.

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin vastataan suomeksi.

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Ma > GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING

DNA:n informaation kulku, koostumus

SOLUBIOLOGIAN LUENTORUNKO (syksy 2013) Seppo Saarela ;

NON-CODING RNA (ncrna)

Geenitekniikan perusmenetelmät

Liikunta. Terve 1 ja 2

Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe

Ketogeeninen ruokavalio aineenvaihdunta

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia

ELEC-C2210 Molekyylibiologia Proteiinisynteesi, muokkaus ja kohdentuminen

Solukalvon kerrokset. Solukalvo. Solukalvon kerrostuminen. Solukalvon tehtävät. Solunsisäiset kalvot. Dawson-Danielli-malli

Solukalvon tehtävät. Solukalvo. Solunsisäiset kalvot. Solukalvon kerrokset. Dawson-Danielli-malli. Solukalvon kerrostuminen

Kemian Nobelin palkinto Na +, K + -ATPaasin ja ATP-syntaasin tutkijoille. Moshe Finel ja Tuomas Haltia

Anatomia ja fysiologia 1 Peruselintoiminnat

Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin voi vastata suomeksi, ruotsiksi tai englanniksi.

? LUCA (Last universal common ancestor) 3.5 miljardia v.

DNA > RNA > Proteiinit

Solun kalvorakenteet ja niiden välinen kuljetus

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Etunimet Tehtävä 5 Pisteet / 20

The Plant Cell / Fotosynteesi

Ydin- ja hiukkasfysiikka: Harjoitus 1 Ratkaisut 1

Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA

Esim. ihminen koostuu 3,72 x solusta

ELÄMÄN MÄÄRITTELEMINEN. LUENTO 1 Kyösti Ryynänen Seutuviikko 2014, Jämsä MITÄ ELÄMÄ ON? EI-ELÄVÄ LUONTO ELÄVÄ LUONTO PAUL DAVIES 26.3.

ENTSYYMIKATA- LYYSIN PERUSTEET (dos. Tuomas Haltia)

YMPYROI OIKEAT VAIHTOEHDOT

Solun rakenne, jatkoa

Aineen rakenne the structure of matter

TYYPIN 1 DIABETEKSEN JA KESTÄVYYSHARJOITTELUN VAIKUTUKSET ENERGIAMETABOLIAAN LIITTYVIEN GEENIEN ILMENEMISEEN HIIRTEN RAAJALIHAKSISSA

2 c. n V. n c. m = = V. Tehtävä 1. Väkevän suolahapon massaprosenttinen HCl-pitoisuus on 37%.

Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset

Nimi sosiaaliturvatunnus. Vastaa lyhyesti, selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Ionisoiva säteily. Tapio Hansson. 20. lokakuuta 2016

Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe

Liikunnan ja ruokavalion vaikutus hiiren maksa- ja lihaskudoksen hienorakenteeseen

Metsäpatologian laboratorio tuhotutkimuksen apuna. Metsätaimitarhapäivät Anne Uimari

Biomolekyylit ja biomeerit

Perinnöllisyyden perusteita

Bioteknologian tutkinto-ohjelma. 1. a) Rastita, mitkä seuraavista väittämistä ovat oikein ja mitkä väärin. (10 p.)

Eliömaailma. BI1 Elämä ja evoluutio Leena Kangas-Järviluoma

x _ Miksi elinikä ei ole rajaton? Mediterranean fruitfly (Ceratitis capitata) Eliniän jakautuma

Hermosolu 3. Hermosolu. Hermosolu 1. Hermosolun rakenne 1. Hermosolu 2. Hermosolun rakenne 2

Erilaisia soluja. Siittiösolu on ihmisen pienimpiä soluja. Tohvelieläin koostuu vain yhdestä solusta. Veren punasoluja

Ribosomit ja valkuaisainesynteesi. Geenien tehokkuudessa eroja. RNA:n synteesi. DNA:sta proteiiniksi Geneettisen informaation kulku.

Efficient regeneration system and Agrobacteriummediated transformation of Vetiver. PT 1

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Mitokondriot ja mitokondriotaudit

Tuma. Tuma 1. Hemopoiesis

ELEC-C2210 Molekyyli- ja solubiologia

Luento Entrooppiset voimat Vapaan energian muunoksen hyötysuhde Kahden tilan systeemit

Lihaksen Fysiologia. Luurankolihas

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

Transkriptio:

Mitokondriot Rakenne Matrix (6-8 nm) mitokondrion ydin voi sis. filamentteja ja granuloita, yl. homogeenista granuloihin sit. divalentteja kationeja (Mg +, Ca + ) matrix geelimäistä, sis. runsaasti liuenneita proteiineja ja pieniä molekyylejä sooli-geeli rakenne mitonkondrion mekaaniset ominaisuudet, muodonmuutokset Historiaa ensimmäiset havainnot 1800- luvun lopulla 1913 Warburg: hengitystien entsyymit sytoplasman partikkeleissa matrix 195 Palade: rakenne krista ulkokalvo sisäkalvo Rakenne 3 Kristat sisäkalvosta työntyy poikittaisia poimuja eli kristoja (christae mitochondriales); 1/3 solun kalvoista kristojen määrä ja muoto riippuu oksidatiivisen aineenvaihdunnan vilkkaudesta lihas, munuainen runsaasti maksa harvassa kristat eläinsoluissa yhdensuuntaisia, kasvisoluissa ei aina; voivat muodostaa löyhiä silmukoita toisiinsa kiinnittyneinä Rakenne 1 Mitokondrio halkaistuna erottuvat juuri ja juuri valomikroskoopissa halkaisijaltaan 0,5-4 µm kaksinkertaisen kalvon ympäröimiä ulkokalvo 6 nm sisäkalvo 6 nm sisäkalvolla runsaasti n. 8 nm pituisia partikkeleita: F- partikkelit, 10 nm:n välein, varsi 5 nm 10 4-10 5 kpl/mitokond., sis. ATPaasia hapetusreaktiot, fosforylaatio 1

Outer membrane Mitokondrioiden sijainti Intermembrane space Matrix Cristae yl. tasaisesti solulimassa voivat akkumuloitua tuman ympärille tai perifeeriseen sytoplasmaan glykogeeni ja rasva voivat siirtää mitoosin aikana konsentroituvat tumasukkulan ympärille jakautumisessa tytärsoluihin yhtä paljon mitokondrioita keskittyvät paikkoihin, joissa tarvitaan energiaa liikkuvat eräissä soluissa vapaasti kuljettaen energiaa (ATP:tä) eräissä soluissa pysyvästi paikallaan energeettisesti tärkeässä kohdassa Muoto ja koko Mitokondriomäärä solussa tilavuus vaihtelee n. 0 % energiatilojen mukaan riippuvainen ph:sta hormonit vaikuttavat hapenpuute turpoaminen, hajoaminen osmoottisen paineen muutokset: paisuminen/supistu minen syanidi, dinitrofenoli (hapetusinhibiittoreit a) paisuminen ATP supistuminen maksasolussa solun kokonaisproteiinista 30-35 % on mitokondrioissa ja munuaissolussa 0 % hiiren maksa: 8,7x10 10 mitonkondriota/g tuorepaino, maksasolu 1000-1600 kpl määrä laskee regeneraatiossa ja syöpäkudoksessa runs. anaerobista hengitystä (glykolyysiä) määrä nousee hypertyreoosissa kasvisoluissa vähemmän k. eläinsoluissa bakteereilla ei Mitokondrioiden muoto vaihtelee (a) (b) Chronic alcoholism leads to cirrhosis, the heavy scarring of the liver: a) A normal human liver; b) a cirrhotic liver from chronic alcoholic

Mitokondrioiden synty ja geneettinen järjestelmä 1 Abnormal mitochondria formed in the liver of an alcoholic lisääntyvät jakautumalla rotan maksa: puoliintumisaika 5-10 vrk alkion mitokondriot periytyvät pääosin äidiltä (munasolussa paljon sytoplasmaa mitokondriot) mitokondrioissa oma geneettinen järjestelmä eläinsoluissa keskimäärin 1 % solun DNA:sta mitokondrioissa rakenne rengasmainen kaksoiskierre Mitokondrioiden synty ja geneettinen järjestelmä ATPase Mitochondrial matrix ihmisellä mitokondrioitten genomi 1/100 000 tuman genomista sekvenssi tunnetaan: trnageeniä, rrnageeniä, 13 proteiinia koodaavaa sekvenssiä suurin osa mitokondrion proteiineista syntyy tuman DNA:n ohjauksessa Outer membrane = rrna gene ( total) = protein-coding region (13 total) Intermembrane space (ph 7) = trna gene ( total) 16 S 1 S Origin Cytochrome b Thylakoid lumen (ph 5) NADH dehydrogenase subunits Proton Stroma (ph 8) ATP synthase subunits Cythochrome oxidase subunits 3

Mitokondrioiden alkuperä Entsyymijakauma mitokondriossa 1. Endosymbioottinen teoria mitokondrion DNA, ribosomit ja proteiinisynteesi muistuttavat enemmän bakteereiden kuin eukaryosyyttien vastaavia prosesseja Mitokondriot olisivat elämän alkuvaiheissa tumallisten solujen esimuodon fagosytoimia bakteereja, jotka ovat mukautuneet endosymbioottiseen elämään eukaryoottien kanssa Sisäkalvo hengitysketjun entsyymit ATP-syntetaasi sukkinaattidehydrogena asi (SDH) β-hydroksibutyraatti dehydrogenaasi karnitiini-rasvahappoasyylitransferaasi glyserofosfaattidehydro genaasi Matrix malaatti ja isositraatti dehydrogenaasi fumaraasi ja akonidaasi sitraatti syntetaasi α-ketohappo dehydrogenaasi β-oksidaation entsyymit Mitokondrioiden alkuperä Energia-aineenvaihdunta. Mitokondriot kehittyneet fotosynteesin purppurabakteerin kaltaisista bakteereista sytokromi c:n rakenne eräät muut biokemiall. reaktiot kyky fotosynteesiin menetetty symbioosissa hengitysketju ja sitruunahapposykli jääneet jäljelle merkittävä osa bakteerin genomista siirtynyt isäntäsolulle (vast. syanobakteeri kloroplasti) mitokondrio on oksidatiivisen ainenvaihdunnan keskus sitruunahappokierto tapahtuu matrixissa NADH:lta ja FADH :lta elektronit siirtyvät hengitysketjuun sij. sisäkalvolla kristoissa elektronit siirretään proteiinilta toiselle vapautuva energia käytetään protonien pumppaamiseen ulos matrixista Entsyymijakauma mitokondriossa 1 Ulkokalvo MAO (monoamiinioksidaa si) NADH-sytokromi c reduktaasi kynureniini hydroksylaasi rasvahappo CoA ligaasi fosfolipaasi Ulko- ja sisäkalvon välinen tila adenylaatti kinaasi nukleosididifosfokinaasi DNAaasi I 5 -endonukleaasi Electrons carried via NADH GLYCOLYSIS Glucose Pyruvate Cytosol (substrate-level phosphorylation) Mitochondrion KREBS CYCLE Electrons carried via NADH and FADH (substrate-level phosphorylation) Electron transport chain and oxidative phosphorylation (oxidative phosphorylation) 4

Pyruvate (from glycolysis, molecules per glucose CO NAD + CoA NADH + H + Acetyl CoA CoA CoA FADH FAD KREBS CYCLE ATP ADP CO 3 NAD + 3 + 3H + Lower ph (ph 7), higher [H + ] in intermembrane space Higher ph (ph 8), lower [H + ] in matrix Outer membrane Mitokondrion F-partikkeli F0-F1-partikkelit Freeze fracture TEMs of inner and outer membranes Outer membrane Cytoplasm Intermembrane space (ph 7) Intermembrane space ph7 4 H + Cytc ox CytC red CytC red H + Matrix (ph 8) Proton Matrix Complex I NADH + H + NAD + 4 H + UQH UQ ph 8 III Cytc ox IV II UGH FAD UQ FADH ½ O + H + Succinate Fumarate O H + H H 5

Mitokondrion sisäkalvon muodostamat fragmentit Codon UGA AUA CUA AGA/AG G Inside out vesicles formed from inner membrane fragments Mitochondria codes Universal code Human mitochondria Drosophila mitochondria Yeast mitochondria Plant mitochondria STOP Trp Trp Trp STOP Ile Met Met Met Ile Leu Leu Leu Thr Leu Arg STOP Ser Arg Arg Mitokondrioiden hajoittaminen ultraäänellä Primitive anaerobic Mitochondrion disrupted by ultrasound Free-living aerobic bacteria Outer membrane Phagosytosis of bacteria Stroma Thylakoid The free-living bacteria are phagocytized by the primitive anaerobe. Eventually the once free-living bacteria carry on their mitochondria-like respirations within cell. There now is an interdependent relationship. flagellated prokaryote 6

Phagosytosis of flagellated prokaryote The organism phagocytizes a flagellated organism. This will improve the organism s ability to move cyanobacterial cells Hengitysketju Time Phagosytosis of cyanobacterial cells sunlight foodstuffs high-energy electrons Then the prokaryote incorporates cyanobacterial cells. Now the prokaryote has many of the features of contemporary photosynthetic protists like Euglena. Time The only organelles that the organism lacked were the endoplasmic reticulum, and the nuclear membrane. transmembrane electrochemical proton gradient active ATP bacteria membrane synthesis flagellar transport rotation Flagellum Eye spot Mitochondrion Contractile vacuole Nucleus korkeaenergisen ATP:n synteesin periaate sama kasvisolujen kloroplasteissa, eläinsolujen mitokondrioissa ja bakteereissa tarvitaan: ioneja läpäisemätön membraani ja spesifisiä entsyymiproteiineja fotosynteesissä aurinko elektronit korkeampaan energiatilaan Choloroplast 7

UCP eli uncoupling protein mitokondrion matriksissa: org. molekyylien kemiallisten sidosten purkaminen virittyneet elektronit elektroninsiirtoketjuun entsyymijärjestelmä luovuttavat energiansa portaittain vapautuva energia siirtää protoneja (H + ) kalvon sisäpuolelta ulkopuolelle (ns. protonipumppu) elektrokemiallinen gradientti kalvon eri puolille havaittiin 1985 ruskeassa rasvakudoksessa energiatuotannossa poikkeavia soluja (UCP:tä muuallakin) irtikytkeytynyt (uncoupled) ATPsynteesistä suurin osa hapetuksessa syntyneestä energiasta hukataan lämpönä (ei siis konvergoida ATP:ksi) ruskean rasvasolun mitokondriot tavallista suurempia protonit virtaavat takaisin kalvon sisäpuolelle ATPsyntetaasientsyymin läpi protonien sisältämä potentiaalienergia sitoutuu ADP:n korkeaenergisiin fosfaattisidoksiin ATP solu kykenee siirtämää syntynyttä ATP:tä sinne missä tarvitaan energiaa mitonkondrion sisäkalvoon sitoutunut proteiini UCP (termogeniini) sallii protonien vuotamisen alas elektrokemiallisen gradientin suuntaan ATP-syntetaasi entsyymi ei aktivoidu solu hapettaa nopeasti rasvavarastonsa runsaasti HEAT, ei ATP:tä Hengitysketju ja entsyymikompleksit Rasvakudos levossa, UCP ei toimi hengitysketjun osat ja ATP-syntetaasi tarkoin järjestäytyneet kristoissa protonigradientti mitokondrion sisäkalvon sisä- ja ulkopuolen välillä ( ph=1) membraanipotentiaa li 160 mv, protonimotorinen voima (protonmotive force) 0 mv 8

Rasvakudos aktiivinen, UCP toimii lämpöä UCP-perhe UCP 1, BAT:ssa, tuottaa lämpöä, luuytimen adiposyytit 3 kd kokoinen proteiini β 3 -stimulaatio UCPH, UCP-homologit, 73 % homologia toisiinsa nähden ja 56 % UCP 1 UCP, ihmisen WAT, luustolihakset, BATmouse UCP 3, luustolihakset, BAT (jyrsijät) UCP 4, aivokudoksessa (aivojen lämmöntuotto) UCP 5 UCP a (avian) UCP:tä löytyy kasveiltakin 9