Enterobakteerien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Samankaltaiset tiedostot
Mikrobien lukumäärän määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka maljavalumenetelmällä.

Koagulaasipositiivisten stafylokokkien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Clostridium perfringens -bakteerin määrittäminen ja tunnistaminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Alustavan Bacillus cereus -bakteerin ja itiöiden määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Patogeenisten Vibrio suvun bakteerien osoittaminen elintarvikkeista

Escherichia coli bakteerin lukumäärän määrittäminen elävistä simpukoista

Clostridium perfringens -bakteerin määrittäminen ja tunnistaminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Mikrobiologisten tulosten laskeminen

Campylobacter jejuni/coli/lari- bakteerien osoittaminen siipikarjan umpisuolinäytteistä.

Streptococcus equi ssp. zooepidemicus -bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen

Listeria monocytogenes bakteerin määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Campylobacter jejuni/coli/lari bakteerien osoittaminen ja tunnistaminen.

Campylobacter jejuni/coli/lari bakteerien osoittaminen ja tunnistaminen.

Listeria monocytogenes bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen.

Campylobacter jejuni/coli/lari- bakteerien osoittaminen siipikarjan umpisuolinäytteistä.

Listeria monocytogenes bakteerin määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Yersinia pseudotuberculosis bakteerin osoittaminen

Mikrobilääkejäämien toteaminen maidosta Delvotest SP-NT - testillä

Salmonellan osoittaminen, VIDAS-menetelmä

ESBL-tuoton varmistaminen kiekkoherkkyysmenetelmällä

Listeria monocytogenes bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen

1) Maldi-Tof tunnistuksen käyttö indolitestin sijaan

2) Rikastusliemi inkuboidaan aerobisesti Stomacher-pussissa, josta ilma on tarkoin poistettu, ei anaerobisesti.

Utaretulehdusta aiheuttavien mikrobien eristäminen ja tunnistaminen

ESBL-, AmpC- ja karbapenemaasituoton tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmillä

MRSA-kantojen seulonta rikastuksen ja selektiivisen kiinteän kasvatusalustan avulla

dekantterilaseja eri kokoja, esim. 100 ml, 300 ml tiivis, kannellinen lasipurkki

MRSA-kantojen seulonta rikastusten ja selektiivisen kiinteän kasvatusalustan avulla

1) Jatkotutkimuksiin on lisätty serotyypitys sekä virulenssigeenien osoitus PCRmenetelmillä.

Salmonella. Osoittaminen elintarvikkeista, rehuista, komposteista, orgaanisista lannoitevalmisteista ja biologisista torjunta-aineista.

1) Jatkotutkimuksiin on lisätty serotyypitys sekä virulenssigeenien osoitus PCRmenetelmillä.

Mittausepävarmuuden laskeminen ISO mukaisesti. Esimerkki: Campylobacter

Elatusaineiden toimivuuden varmistamiseen käytettävien mikrobisuspensioiden (SkimMilk) valmistus

1) Siipikarjanlihaa tutkittaessa esirikastusliemen määrä on 1000 ml:n sijasta 225 ml.

Ajankohtaista mikrobiologisista menetelmistä

Salmonella. Osoittaminen eläinten elin- ja ulostenäytteistä sekä tuotantoympäristönäytteistä MSRV-menetelmällä.

ESBL-, AmpC- ja karbapenemaasituoton tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmillä

Salmonella. Osoittaminen eläinten elin- ja ulostenäytteistä, tuotantoympäristönäytteistä ja elintarvikkeista MSRVmenetelmällä.

Elatusaineiden laadunvarmistus esimerkki tulkinnasta ISOstandardimenetelmässä

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2009

Mark Summary Form. Tulospalvelu. Competitor No Competitor Name Member

Ajankohtaista referenssilaboratoriosta. Marjaana Hakkinen Evira, Elintarvike- ja rehumikrobiologian laboratoriojaosto

Taru Kariniemi ENTEROBAKTEERIEN JA KOLIMUOTOISTEN BAKTEERIEN MÄÄRITYSMENETELMIEN VALIDOINTI

Elintarvikevalvontaa varten tehtävän näytteenoton hankkiminen yksityiseltä toimijalta. Taija Rissanen

Bakteereja tunnistetaan a) muodon perusteella:

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, OES

Bakteerien antibioottiherkkyyden tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmällä

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 1/2013

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, ICP- OES

Salmonella. Osoittaminen elintarvikkeista, rehuista, komposteista, komposteista, orgaanisista lannoitevalmisteista, biologisista torjuntaaineista

Pvm/Datum/Date akkr ISO Sisäilmanäyte. akkr ISO Sisäilmanäyte

VITEK2 -käyttökokemuksia

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY NET-FOODLAB OY NET-FOODLAB LTD

Näytteen esikäsittely ja laimentaminen kvantitatiivista mikrobiologista tutkimusta varten

Normisto Asiakirja: Nimitys:

Laboratoriotoiminnassa huomioitavat standardit ja oppaat. Giselle Nick-Mäenpää, pääarvioija

Mikrobiologisten menetelmien uudistukset vuonna 2017

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

Amylaasi ja tärkkelyksen hydrolyysi Pauliina Lankinen, Antti Savin ja Sari Timonen

Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriotoiminnasta Standardisointiasiat

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Pvm/Datum/Date Viljely, Valviran Asumisterveysasetuksen soveltamisohje 8/2016, Osa IV

PCR:n laadunvarmistus. Saija Hallanvuo Elintarvike- ja rehumikrobiologian tutkimusyksikkö/ Elintarvikemikrobiologiajaosto

Salmonellan osoittaminen, ISO menetelmä, muunnos

Näytteenotto mikrobiologisiin tutkimuksiin

Tämä asiakirja on ainoastaan dokumentointitarkoituksiin. Toimielimet eivät vastaa sen sisällöstä.

REKISTERIOTE Hyväksytyt laboratoriot. Valvontaosasto Valvonnan kehittämisyksikkö. Länsi-Uudenmaan vesi ja ympäristö ry, Vesi- ja elintarvikelaboratori

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY NET-FOODLAB OY NET-FOODLAB LTD

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. Hallinto-osasto Suunnittelu- ja ohjausyksikkö. Eurofins Scientific Finland Oy, Kokkola

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2009

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. Kokemäenjoen vesistön vesiensuojeluyhdistys ry, Tampere

Keräinnäytteen tutkiminen arv STM:n Asumisterveysohje 2003 ja Asumisterveysopas 2008

Phoenix Automated Microbiology System. Terhi Miikkulainen-Lahti HUSLAB

Maanparannusaineet ja kasvualustat (CEN/TC 223) Liisa Maunuksela Rehu- ja lannoitevalvonnan yksikkö/lannoitevalmistejaosto

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 2/2012

Validoinnin suunnittelun opas

Taulukko 1. Riisinäytteiden mikrobiologisen laadun määrittämiseen käytetyt bakteerimäärien raja-arvot. Näytteen mikrobiologinen laatu.

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. SeiLab Oy, Seinäjoen elintarvike- ja ympäristölaboratorio. Vaasantie 1 C SEINÄJOKI Puh.

Ulosteen bakteeriviljely 1 (F-BaktVi1) Markku Koskela, OYS, mikrobiologia Eveliina Tarkka, Huslab, bakteriologia

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. Hallinto-osasto Suunnittelu- ja ohjausyksikkö

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Salmonellavalvontaohjelmaan kuuluvien näytteiden käsittely ja koostaminen

Liuenneen silikaatin spektrofotometrinen määritys

Salmonellavalvontaohjelmaan kuuluvien näytteiden käsittely ja koostaminen

Sieni-itiöt, materiaalit arv Asumisterveysohje 2003 ja Asumisterveysopas 2009

Rasvattoman maidon laktoosipitoisuuden määritys entsymaattisesti

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. Kymen Ympäristölaboratorio Oy. Patosillantie KUUSANKOSKI Puh.

Mikrobiologian laboratorion elatusaineiden sisäinen laadunvarmistus

Transkriptio:

Vastuuhenkilö Satu Hakola Sivu/sivut 1 / 5 1 Menetelmäviitteet ja poikkeamat ISO 21528-2:2017 (VRBG 37 C/24h, ravintoagar/tsa 37 C/24h, oksidaasikoe, glukoosiagar 37 C/24h) 1) Siirrostettava näytemäärä voi olla myös 0,1 ml. 2) Menetelmää voidaan soveltaa myös orgaanisille lannoitevalmisteille. 2 Menetelmän tarkoitus ja soveltamisala Menetelmä soveltuu enterobakteerien määrittämiseen elintarvikkeista, rehuista ja orgaanisista lannoitevalmisteista pesäkelaskentatekniikalla 37 C:ssa. 3 Määritelmä(t) Enterobakteerit ovat fakultatiivisesti anaerobeja, gramnegatiivisia ja oksidaasinegatiivisia sauvoja, jotka fermentoivat glukoosia. 4 Periaate Näyte viljellään maljavalutekniikalla käyttäen rinnakkaismaljoja. Maljoja inkuboidaan aerobisesti 37 ± 1 C / 24 ± 2 h ja pesäkkeet lasketaan. Pesäkemäärien ja laimennosten perusteella lasketaan enterobakteerien määrä millilitrassa tai grammassa näytettä. 5 Mahdolliset virhelähteet Jotkut enterobakteerit muodostavat halkaisijaltaan alle 0,5 mm olevia pesäkkeitä. Siksi maljat saa lukea aikaisintaan 22 h kuluttua. Maljoilla saattaa kasvaa oksidaasipositiivisia pesäkkeitä (Aeromonas), jotka kuitenkin karsiutuvat oksidaasitestillä. 6 Työturvallisuus Mikrobiologisessa laboratoriossa työskenneltäessä noudatetaan toimintaohjetta LAB 223. Menetelmän reagenssit ja elatusalustat eivät edellytä erityisiä varotoimenpiteitä.

Vastuuhenkilö Satu Hakola Sivu/sivut 2 / 5 7 Laitteet ja välineet 1) Mikrobiologinen perusvälineistö 2) Tasoravistelija tai Stomacher-homogenisaattori ja steriilejä Stomacher -400 pusseja 3) Lämpökaappi 37 ± 1 C 8 Elatusaineet ja reagenssit 1) Laimennusliuos: peptoni-suolaliuos (PEPSU) tai Dilucup, ellei toimintaohjeessa LAB 728 toisin mainita 2) Violettipuna-sappi-glukoosi (VRBG)-agar 100 tai 200 ml pulloissa 3) Ravintoagar-/TSA-maljat 4) Glukoosiagarputket 5) Oksidaasireagenssi 9 Kontrollikannat 1) Escherichia coli EELA 42 2) Pseudomonas aeruginosa EELA 258 10 Näytteen esikäsittely Näytemäärä on 10 g tai enemmän riippuen näytteen paloiteltavuudesta. Kovia, kuivattuja näytteitä, kuten kuivalihoja tai purutikkuja, seisotetaan 1:10 laimennoksessa 30 minuuttia + 4 C ennen laimennussarjan tekoa. Lisää näytteiden esikäsittelystä on luettavissa toimintaohjeesta LAB 702. 11 Suoritus Sulata ja temperoi tarvittava määrä VRBG-agaria (25 ml/näyte) toimintaohjeen LAB 702 mukaisesti. Tee näytteestä sopivat laimennokset esimerkiksi toimintaohjeen LAB 728 mukaisesti. Viljele laimennoksista rinnakkaiset maljat. Pipetoi tyhjiin petrimaljoihin 1 ml (0,1 ml) laimennoksia. Kaada maljoihin n. 10 ml 47-50 C:een temperoitua VRBG-agaria, sekoita hyvin ja anna jähmettyä. VRBG-agar tulee lisätä maljoille 15 min sisällä näytteiden pipetoimisesta. Kaada jähmettymisen jälkeen maljoille n. 15 ml pintakerros samaa agaria ja anna jähmettyä. Inkuboi 37 ± 1 C / 24 ± 2 h. 11.1 Pesäkkeiden laskeminen Enterobakteerit kasvavat VRBG-agarilla vaaleanpunaisina tai punaisina pesäkkeinä, joita saattaa ympäröidä saostumakehä. Pesäkkeet voivat olla myös limaisia ja värittömiä tai valkeita. Pesäkkeet ovat tyypillisesti halkaisijaltaan vähintään 0,5 mm. Vertailumittauskierroksissa on todettu pienemmäksi jääviä pesäkkeitä, mutta

Vastuuhenkilö Satu Hakola Sivu/sivut 3 / 5 näytematriiseillemme näin pienet pesäkkeet eivät ole yleisiä. Mikäli näytteessä kasvaa pieniä pesäkkeitä, poimi myös niitä jatkovarmistuksiin. Laske tyypilliset pesäkkeet maljoilta, joilla kasvaa vähemmän kuin 150 pesäkettä. 12 Varmistuskokeet 12.1 Pesäkkeiden valinta varmistuskokeisiin 12.2 Oksidaasikoe Viljele varmistettavista pesäkkeistä puhdasviljelmät varmistuskokeita varten ravintoagarille tai TSA:lle. Ellei maljalla kasva tyypillisiä pesäkkeitä, valitse valkeita pesäkkeitä varmistettavaksi. Varmista vähintään viisi pesäkettä. Jos näytematriisissa kasvaa runsaasti enterobakteereja (esim. komposti, raa at kasvikset), voit varmistaa useampia pesäkkeitä (esim. 10 kpl). Inkuboi maljoja 37 ± 1 C / 24 2 h. Tee puhdasviljelmistä varmistuskokeet. Tee oksidaasikoe työohjeen LAB 2055 mukaisesti. Käytä tarvittaessa kontrollikantoina E. coli EELA 42 -kantaa (oksidaasinegatiivinen) ja P. aeruginosa EELA 258 -kantaa (oksidaasipositiivinen). Enterobakteerit ovat oksidaasinegatiivisia. Mikäli kanta on oksidaasipositiivinen, älä jatka kantaa glukoosin fermentaatiokokeeseen. 12.3 Glukoosin fermentaatio Siirrosta pesäke pistoviljelynä glukoosiagarputken pohjalle. Inkuboi 37 ± 1 C/ 24 ± 2 h. Käytä tarvittaessa positiivisena kontrollina E. coli EELA 42 -bakteerikantaa ja negatiivisena kontrollina siirrostamatonta glukoosiagarputkea. Enterobakteerit fermentoivat glukoosia, jolloin elatusaineen väri muuttuu violetista keltaiseksi. Useimmat enterobakteerit tuottavat lisäksi kaasua. 13 Tulokset 13.1 Tulosten laskeminen Tuloksen laskeminen kuvattu toimintaohjeessa LAB 703. Laskukaava: pmy/g x oksidaasinegatiivisten lkm x glukoosipositiivisten lkm oksidaasitestin lkm x glukoositestien lkm 13.2 Tulosten ilmoittaminen Tulos ilmoitetaan enterobakteerien pitoisuutena pmy/g tai pmy/ml toimintaohjeen LAB 703 mukaisesti.

Vastuuhenkilö Satu Hakola Sivu/sivut 4 / 5 14 Menetelmän validointi Menetelmää ei ole validoitu. Menetelmä on ollut käytössä pitkään. 15 Menetelmän status Standardimenetelmä Kansainvälisen menetelmäkokoelman menetelmä Virallinen menetelmä Referenssimenetelmä Sisäinen menetelmä 16 Laadunvarmistusmenetelmät Laboratorioiden väliset vertailututkimukset Menetelmävertailut Vertailukantojen/kontrollikantojen käyttö (tarvittaessa) Siirrostetut näytteet Rinnakkaismääritykset 17 Viitteet ISO 21528-2:2017. Microbiology of food and animal feeding stuffs Horizontal methods for the detection and enumeration of Enterobacteriaceae. Part 2: Colonycount method. ISO/FDIS 7218:2007. Microbiology of food and animal feeding stuffs General requirements and guidance for microbiological examinations. 18 Muutokset edelliseen versioon 21.9.2012 Evira 3462/05 Kohta 6. Lisätty lause työturvallisuuskappaleeseen. Kohta 10. Täydennetty näytteiden esikäsittelyä kuivien näytteiden ja näytemäärän osalta. 12.1. Vähennetty varmistettavien pesäkkeiden lukumäärä viiteen (-10 kpl). 12.2. ja 12.3. Varmistustestien kontrollikantojen käyttö muutettu tarvittaessa tehtäväksi (esim. perehdytettäessä). 13.1. Lisätty laskukaava.laatija: Satu Hakola. 7.3.2018 Evira 3462/uusi6. Päivitetty menetelmäviite vuodeksi 2017. Kohta 11.1. täsmennetty pesäkkeiden tyypillinen koko, muita tarkennuksia. Ei muutoksia käytännön suoritukseen. 12.7.2018 Siirryttäessä IMS toimintajärjestelmään, versiointi aloitettu alusta (v1). Tekninen päivitys 30.11.2018 Ylätunniste päivitetty organisaatiomuutoksen (1.1.2019) mukaisesti. Tekninen päivitys.

Vastuuhenkilö Satu Hakola Sivu/sivut 5 / 5 Liite 1 Vuokaavio Evira 3462 Enterobakteerien määrittäminen ja tunnistaminen. Pesäkelaskentatekniikka. pesäkkeet imupaperilla tumma purppura ei värimuutosta violetti keltainen = ei fermentoi glukoosia = fermentoi glukoosia