Tutkimus Näytteenottoastia Näytteen säilytyspaikka ja muuta huomioitavaa BAKTEERIVILJELY- PINNALLISET. Jääkaappi Geelikuljetusputki Transsystem M40

Samankaltaiset tiedostot
Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin

Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin

Näytteenottovälineet mikrobiologisiin näytteisiin

Bakteeri- ja sieniviljelyt

VIRTSATUTKIMUKSET. Säilöntäaineellinen virtsanäyteputki (10 ml, 4 ml) (kuva 1) Lisäaineeton 10 ml muoviputki (esim. kuva 2)

VIRTSATUTKIMUKSET. Säilöntäaineellinen virtsanäyteputki (10 ml, 4 ml) (kuva 1) Lisäaineeton 10 ml muoviputki (esim. kuva 2)

VIRTSATUTKIMUKSET. Säilöntäaineellinen virtsanäyteputki (10 ml, 4 ml) (kuva 1) Lisäaineeton 10 ml muoviputki (esim. kuva 2)

Mikrobiologian diagnostiikan uudet tuulet

Miten tulkitsen mikrobiologisia laboratoriovastauksia?

Silmänäytteet 1.3 / /8 SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET VALVOMATON KOPIO. Gonokokkiviljely. Virusviljely

Major Version 2 effective on

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET

VÄLINEET MIKROBIOLOGIAN NÄYTTEIDEN OTTAMISTA, SÄILYTTÄMISTÄ JA KULJETTAMISTA VARTEN JA NIIDEN YLEISET KÄYTTÖOHJEET

PUTKIEN TARRAAMINEN. Työn suoritusta kuvaava ohje: Putkien tarraaminen 3.0/ /13

Mikrobiologian näyteenottovälineet 1.1/ /8

Geenimonistus -ongelmia

SILMÄN ALUEEN MIKROBIOLOGISET NÄYTTEET

MRSA-näytteenotto. Infektioyksikkö Ohje päivitetty

Seinäjoen keskussairaala, Kliininen mikrobiologia

Tutkimushinnasto 2018 Seinäjoen keskussairaala, Kliininen mikrobiologia

SELKÄYDINNESTEEN PERUSTUTKIMUKSET

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB LABORATORIES LTD

MIKROBIOLOGISTEN NÄYTTEIDEN OTTAMINEN

Ripulipotilaat näytteenotto ja tulosten analysointi

Mitä virustutkimuksia lastenlääkäri haluaa? Harri Saxén HUS/LKL

ITÄ-SUOMEN LABORATORIOKESKUKSEN Tiedote KU 2/2010 1(5) LIIKELAITOSKUNTAYHTYMÄ Kuopion aluelaboratorio Kliininen mikrobiologia

Uutta pikadiagnostiikkaan

Moniresistenttien mikrobien näytteenotto

SELKÄYDINNESTEEN NÄYTTEENOTTO

Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 1 / 2012

SELKÄYDINNESTEEN NÄYTTEENOTTO

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY FIMLAB LABORATORIES LTD

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

THL:n laboratoriopohjainen seuranta ja kantakokoelmaan lähetettävät bakteerikannat,

Vastaukset Paperipyynnöllä lähetetyistä näytteistä vastaukset faxataan.

Preanalytiikka mikrobiologissa tutkimuksissa Risto Hilla HUSLAB Prosessivastaava, Preanalytiikan linja Helsinki ja Itä-Uusimaa

Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti

Kliinisesti merkittävien bakteerien jaottelua

Likvorinäytteiden putkitusta täsmennetään ja Li-solut tutkimukselle lisätään uusi osatutkimus infektioselvitysten varalle (Li-Vara) 2.1.

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY FIMLAB LABORATORIOT OY

Mikrobiologia. Viljelysauvat. Näytteenottotikut. Bakteerikuljetusputket. Viruskuljetusputket. Lasi- ja muovitarvikkeet. Kuljetus

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta

Aptima Multitest Swab Specimen Collection Kit

Lyhyt yhteenveto Labqualityn bakteeriviljelykierroksilta Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia

Mikrobiologinen näytteenotto: Sieni- ja märkänäytteet

ITÄ-SUOMEN LABORATORIOKESKUKSEN ISLAB Laboratoriotiedote 17/2008 LIIKELAITOSKUNTAYHTYMÄ. Kliininen mikrobiologia (5)

Vaikeat hengitystieinfektiot mikrobiologinen diagnostiikka

Bakteeriviljelynäyte kroonisesta haavasta

Uudet tekniikat infektio- diagnostiikassa

Suojautuminen tartunta-agensseja käsiteltäessä (esim. SARS) Labquality: Mikrobiologian neuvottelupäivä Osl. Jukka Suni. A.

TYÖTERVEYSHUOLLON HINNASTO 2016 PERUSMAKSU JA KELA-KORVAUS ENNALTAEHKÄISEVÄ TYÖTERVEYSHUOLTO. Perusmaksu 28,75 / työntekijä / vuosi

Alueellinen sairaalahygieniapäivä Epidemiologinen katsaus

MONIRESISTENTTIEN BAKTEERIEN SEULONTAOHJE

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 2 / 2013

Palauttakaa tämä ohje näytteen mukana seuraavin tiedoin:

2. Tutkimuksen DNA, vasta-aineet IF (natiivi) (S -DNAnAb, 1261) nimi, menetelmä ja viitearvot muuttuvat.

Ajankohtaista laboratorionäytteistä

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 3 / 2012

Bakteeriviljelynäytteen hyväksymiskriteerit. Primaarinäytteen värjäys ja viljely. Markku Koskela, yl Nordlab Oulu, mikrobiologia

TARTUNTATAUTITAPAUKSET VARSINAIS-SUOMEN SAIRAANHOITOPIIRISSÄ KUUKAU- SITTAIN (THL Tartuntatautirekisteri)

MONIRESISTENTIT MIKROBIT (MRSA, VRE, ESBL)

Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Virukset suppea lista

TARTUNTATAUTITAPAUKSET VARSINAIS-SUOMEN SAIRAANHOITOPIIRISSÄ KUUKAUSITTAIN (THL, Tartuntatautirekisteri)

PALAUTE BAKTERIOLOGIAN LAADUNARVIOINTIKIERROKSILTA. Markku Koskela OYS/Mikrobiologian laboratorio (OML)

Milloin nieluviljely

Laadukas kl mikrobiologian laboratoriovastaus

Moniresistenttien mikrobien kantajien/altistuneiden hoito ja viljelynäytteet akuuttisairaanhoidon osastoilla ja poliklinikoilla

Mikrobiologia. Viljelysauvat ja -silmukat. Näytteenottotikut. LBM, nestemäiset kuljetusputket. Bakteerikuljetusputket, Amies-alusta

Kansanterveyslaitoksen julkaisuja KTL B 8/2001. Tartuntataudit Suomessa 2000

VAROTOIMI- JA ERISTYSSUOSITUKSET INFEKTIOSAIRAUKSISSA¹

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012

Kliinisen mikrobiologian ja genetiikan tutkimukset. bakteriologia immunologia virologia genetiikka. UTULab

Tartuntatautirekisterin mikrobiluettelo Osa: Virukset laaja lista

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi!

AKKREDITOITU VERTAILUMITTAUSJÄRJESTÄJÄ ACCREDITED PROFICIENCY TESTING PROVIDER

Käyttöohje. Tervetuloa klamydiaja tippuritestipalvelun käyttäjäksi!

WeAreMicrobiome tutkimus KOTIOHJEET. Luethan huolellisesti nämä ohjeet.

Yleisimpiä labroja

YLIOPPILAIDEN TERVEYDENHOITOSÄÄTIÖ. Laboratorio- ja konsultaatiopalvelut. Liite 6. YTHS:n tilaamat laboratoripalvelut vuonna 2014

Infektio vai kolonisaatio?

LOPPUTENTTI

Gram-värjäykset. Olli Meurman

LÄÄKÄRIEN JA LABORATORION ILMOITUKSET YLEISVAARALLISTA JA ILMOITETTA- VISTA TARTUNTATAUDEISTA THL:N TARTUNTATAUTIREKISTERIIN.

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 2/2011

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2010

Ulostepatogeenien diagnostiikka. Alueellinen koulutus Kaisu Rantakokko-Jalava Tyks Mikrobiologia ja genetiikka

EPIDEMIOLOGINEN KATSAUS (THL, tartuntatautirekisteri)

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOTIEDOTE Nro 3 / 2014

PD-hoidon komplikaatiot

Bakteeriperäisen turistiripulin diagnostiikka nukleiinihaponosoitusmenetelmillä

Infektioyksikkö Kliinisen mikrobiologian laboratorio. Etelä-Karjalan tartuntatautiraportti

KOULUTUS ANNOSTELU JA ANNOSTELULAITTEIDEN KÄYTTÖEDUT PUHTAUS- JA HYGIENIA-ALAN ALUEELLINEN KOULUTUS KSSHP

Mikrobilääkeresistenssi Pohjois-Savon sairaanhoitopiirissä 2017

MIKROBIOLOGINEN VIERITESTIANALYTIIKKA. Yl Markku Koskela OYS / Mikrobiologian laboratorio (OML)

YLEISVAARALLISIA JA ILMOITETTAVIA TARTUNTATAUTEJA kuukausittain Varsinais-Suomen sairaanhoitopiirissä (THL, tartuntatautirekisteri).

Virtsanäytteenotto. Vacuette -virtsanäytteenottojärjestelmä. Näyteputket ja -pullot. Näytepurkit. Virtsankeräysastiat ja -tarvikkeet.

VSSHP:n Sairaalahygienia- ja infektiontorjuntayksikön INFEKTIOUUTISET Nro 1 / Tuberkuloosi

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 2/2012

Akuutti maha- Syynä gynekologinen infektio

Transkriptio:

Näytteenoton Ohje 1/15 Versio 10.1 Kliininen mikrobiologia Laatija A Saarinen Tarkastaja M Metsolahti Päiväys 15.1.2019 Hyväksyjä J Kauppila mikrobiologisiin näytteisiin BAKTEERIVILJELY- PINNALLISET Geelikuljetusputki Transsystem M40 IHO- JA LIMAKALVOINFEKTIOT Pu-BaktVi2 (3492) Bakteeri, viljely 2, aerobiviljely, pintamärkä --Haavat ja ihottumat --korvakäytäinfektio --välikorvainfektio ja poskionteloinfektio HUOM! Jos suoraan ruiskuun aspiroitu näyte pyydä Pu-BaktVi1 ( näyte Portagerm anaerobipulloon) --silmän sidekalvonäytteet GcVi (1506) Neisseria gonorrhoeae, viljely NIELUINFEKTIOT Ps-StrVi (2703) ENSISIJAINEN! Streptococcus, viljely nielusta Ps-BaktVi (4290) Bakteeri, viljely nielusta, laaja CodiVi (1254) Corynebacterium diphteriae, viljely Haavanäytteet tulee puhdistaa hyvin ennen näytteenottoa! RESISTENTTIEN BAKTEERIEN SEULONTATUTKIMUKSET - MRSAVi (4358) Staphylococcus aureus, MRSA, viljely - ESBLVi (4817) Bakteeri, laajakirj.betalakt. tuottava, viljely -MDRsVi (8589) Moniresistentit gramnegat sauvat, viljely -VREVi (1788) Enterokokki, vankomysiiniresistentti, viljely Resistenttien bakteerien seulonta: Ei puhdistusta ennen näytteenottoa! Virtsanäytteet säilöntäaineelliseen virtsaputkeen Jakelu: Kemia 2 kpl, näytteen vastaanotto, mikrobiologian kotisivu T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 2/15 BAKTEERIVILJELY - SYVÄT Huoneenlämpö tai pidempään säilytettäessä jääkaappi Pu-BaktVi1 (3491) Bakteeri, viljely 1,anaer. ja aerobivilj, syvämärkä Portagem-anaerobipullo: Nestemäiset näytteet (abske ssimärkä, punktio/aspiraationäytteet). Hyvin pieni näytemäärä voidaan imeyttää dacron-vanutikkuun ja lähettää geelikuljetusputkessa. Portagerm-pulloja säilytetään jääkaapissa ja valolta suojattuna myös ennen näytteenottoa - ActiVi (1007) Actinomyces, viljely Steriilit nesteet (dialyysi-pericardium-, pleura-, ascites-, nivel- tai peritoneaalidialyysineste) laitetaan ensisijaisesti Portagerm-anaerobipulloon. Mikäli näytettä on runsaasti voidaan näytettä lähettää lisäksi myös veriviljelypulloissa. Jos näytettä ei riitä molempiin veriviljelypulloihin, laitetaan näyte aerobiveriviljelypulloon. Erittäin niukkaa näytettä ei tule laittaa veriviljelypulloon, vaan se lähetetään Portagerm-pullossa tai ruiskussa (neula poistettava). Kyrettinäyte: Krooniset säärihaavat kyretti Kudospalat: Steriili kierrekorkillinen putki tai purkki eswab-putki Puhdista pullon korkki ja ruiskuta näyte ilmattomasti agarin päälle. Kyrettinäyte: Avaa eswab-nestekuljetusputken korkki. Siirrä näyte pakkauksessa olevalla tikulla kyretistä, laita tikku putkeen ja katkaise tikku taivuttamalla putken reunaa vasten punaisella merkillä merkitystä kohdasta. Sulje korkki. Toimita eswabnestekuljetusputki 1 vrk:n sisällä laboratorioon Kudospalat: Lisää putkeen muutama pisara keittosuolaa kuivumisen estämiseksi. Steriili koeputki T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 3/15 BAKTEERIVILJELY- VIERASESINEET Huoneenlämpö tai pidempään säilytettäessä jääkaappi Ca-BaktVi (4753) Bakteeri, viljely suonikanyylistä Muut vierasesineet: esim: kierukka, ruuvi, piilolinssi Pu-BaktVi1 (3491) Bakteeri, viljely 1,anaer. ja aerobivilj, syvämär MUUT BALTEERIVILJELYTUTKIMUKSET Steriili kierrekorkillinen putki tai purkki. Lisää muutama pisara keittosuolaa kuivumisen estämiseksi. Steriili koeputki Verisuonikanyyli: Enintään 5 cm:n pituinen pala kanyylin kärjestä kuivassa tehdassteriilissä putkessa. Lisää muutama pisara keittosuolaa kuivumisen estämiseksi. Geelikuljetusputki Transsystem M40 Ts-HepyVi (4117) Helicobacter pylori, viljely Ts-HepyVi: Biopsianäyte, joka laitetaan välittömästi näytteenoton jälkeen kirkasta geeliä sisältävään bakteerien kuljetusputkeen (esim. Transsystem M40). Hiiltä sisältävät bakteerien kuljetustputket eivät sovellu. Ts-HepyVi: jääkaappi -NocaVi (2403) Nocardia, viljely Näytteiksi soveltuvat esim. abskessipunktaatti, vatsaontelomärkä, kudospala, biopsia, luuydin, märkäerite yms -NocaVi: Runsaat punktoitavat märkänäytteet toimitetaan laboratorioon sellaisenaan ruiskussa (neula poistettuna ja korkki kiinni). Niukaat näytteet: Geelikuljetusputki Transsystem M40. Tällöin on syytä ottaa erillisellä tikulla levitys objektilasille gram-värjäystä varten, koska kuljetusputken geelissä olevasta tikusta sitä ei voi tehdä. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx Kiinteät näytteet otetaan steriiliin purkkiin, johon lisätään muutama tippa fysiologista keittosuolaliuosta kuivumisen ehkäisemiseksi. -NocaVi: huoneenlämpö tai pidempiaikainen säilytys jääkaapissa

Näytteenoton Ohje 4/15 LIKVORIN VIRUS- JA BAKTEERITUTKIMUKSET Ensisijainen tutkimus on: Li-MenNhO (8879) Meningiitti, nukleiinihappo likvorista Sisältää: Bakteerit:E.coli K1, Haemophilus influenza, Listeria monocytogens, kapsellillinen Neisseria meningitidis, Str.agalactiae (B), Str.pneumoniae Virukset: HSV1 ja HSV2, HHV-6, VZV, CMV, Enterovirus, Parechovirus Sienet: Cryptococ. neoformans/c. gattii. Suklaa- ja verimalja ja tehdassteriili putki Huoneenlämpö Likvoria tiputetaan muutama tippa verija suklaamaljoille. Lisäksi näytettä otetaan steriiliin putkeen. Huom! Toimitettava välittömästi laboratorioon (päivystysaikaan kliinisen kemian laboratorioon). Shuntti-infektioissa voidaan pyytää myös pelkkä Li-BaktVi (1154) Bakteeri, viljely likvorista. Yksittäin pyydettäviä NhOtutkimuksia: HSVNhO (1860) Herpes simplex, nukleiinihappo -VZVNhO (1781) Vesirokkovirus, nukleiinihappo -EvirNhO (4392) Enterovirus, nukleiinihapon osoitus -PicoNhO (1917) Picorna virus, NhO; sis. Rino- ja EVirNhO -BorrNhO (4202) Borrelia, nukleiinihappo -ToxoNhO (1730) Toxoplasma, nukleiinihappo BaktNhO (4381) Bakteeri, nukleiinihappo (kval) -MyHeCp (9665) Mycoplasma pneumoniae ja chlamydia pneumoniae, NhO ja M. pneumoniae herkkyys Yksittäin pyydettävät NhO- tutkimukset teetetään alihankintana. Näyte otetaan steriiliin kierrekorkilliseen putkeen. Samasta näytteestä voidaan tehdä useita yksittäisiä NhO-tutkimuksia. Näytemäärä 0.5-2 ml riippuen siitä, kuinka monta yksittäistä tutkimusta pyydetään samasta näytteestä. Yksittäin pyydettävät NhO-tutkimukset: Säilytys Jääkaapissa 1-3 vrk T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 5/15 Muita likvorin tutkimuksia Li-CXCL13 (9007) CXCL13 kemokiinipitoisuus likvorista (Epäily neuroborrelioosista) : 1 ml likvor-näytettä tehdassteriilissä putkessa. Samasta tutkimuksesta voi tehdä myös Li-BorrAb-tutkimuksen RAKKULANÄYTTEEN VIRUSTUTKIMUKSET - HSVAg (1614) (Objektilasi) Herpes simplex-virus, antigeeni Alihankittavat: (UTM-putki) HSV ja VZV-virukset: Ensisijaiset tutkimukset ovat: -HSVPVi (4401) Herpes simplex- virus, viljely - VZVAg (3529) Vesirokkovirus, antigeeni Enterovirusinfektioepäilyssä: -EvirNhO (4392) Enterovirus, NhO Tarvittaessa voidaan pyytää: -VirVi (2975) Virus, viljely Objektilasi HSVAg-tutkimukseen UTM-putki: Samasta näyteputkesta voidaan tehdä HSVPVi, -VZVAg, EvirNhO ja myös virusviljely (2975 -VirVi). HSVAg: Huoneenlämpö HSV-Ag näytteenotto objektilasille: Näyte otetaan rakkulan, haavauman tai ruven pohjalta esim. steriiliin veteen tai keittosuolaan kostutetulla dacron-tikulla sitten, kun rakkulan tai ruven katto on poistettu neulalla tai pinseteillä. Levitä näyte välittömästi HSV- objektilasin molempiin kuoppiin pyörittämällä tikkua alkaen kuopan keskeltä ja edeten reunoja kohti. Anna näytteen kuivua huoneilmassa täysin kuivaksi (noin 5 min.) ja kiinnitä se tiputtamalla molempiin kuoppiin 2-3 tippaa asetonia ja anna haihtua. Jos et suorita kiinnitystä, ilmoita siitä selkeästi laboratorioon. Lähetä objektilasi suojakotelossa laboratorioon. UTM-putki: Rakkulanäytteiden otto UTM-putkeen: Puhdistamaton rakkula rikotaan kuivalla pumpulitikulla. Rakkulanesteen annetaan imeytyä pumpuliin, minkä jälkeen tikku katkaistaan UTM-viruskuljetusputkeen. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 6/15 RESPIRATORISET VIRUS- JA BAKTEERITUTKIMUKSET NIELU/NENÄNIELUNÄYTTEET Ensisijainen tutkimus influenssakaudella on: -InABRSNhO (8878) (päivystystutkimus) Influenza A, B ja RSV, NhO (kval) UTM-putki -InABRSV ja ResNhO -MyHeCp -VirVi -ResNhO sisältää: adeno, influenssa A ja B, koronavirus OC43, 229E, NL63, HKU1, metapneumovirus, parainfluenssavirus tyyppi 1-4, RS- ja rino/enterovirus. Bordetella pertussis, Chlamydia pneumoniae ja Mycoplasma pneumoniae Muita tutkimuksia: -ResNhO (8940) Resp. virukset ja bakteerit, NhO (kval) -RVirAg (2579) Respiratoristen virusten antigeeni -PicoNhO (1917) Picorna virus, NhO (sis. RinoNhO ja EVirNhO) -AdenNhO (4897) Adenovirus, NhO (kval) -MyHeCp (9665) Mycoplasma pneumoniae ja chlamydia pneumoniae, NhO ja M. pneumoniae herkkyys Tarvittaessa voidaan pyytää: -VirVi (2975) Virus, viljely - BopeVIP (9104) Bordetella pertussis, NhO ja viljely Näyte otetaan nukkatikulla syvältä nenänielusta. Tikku katkaistaan kuljetusnestettä sisältävään putkeen tai steriiliin kierrekorkilliseen tyhjään putkeen. Geelikuljetusputki Transsystem M40 sekä kuiva valkokorkillinen putki ja nukkatikku Kuiva tikkunäyte: -RVirAg -PicoNhO -AdenNhO -RVirAg sisältää: RSV-, adeno-, influenssa A ja B- ja parainfluenssa 1, 2, 3 virukset Toinen näytetikku lähetetään kuivana steriilissä putkessa, toinen geelikuljetusputkessa (Transsystem M40 tai vastaava). Hiilitikkuun otettu näyte ei sovellu tutkimukseen. Puuvartista tikkua ei myöskään suositella, koska se sisältää inhiboivia aineita. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 7/15 RESPIRATORISET VIRUS- JA BAKTEERITUTKIMUKSET YSKÖS, BAL, JA BRONKUS- NÄYTTEET Ex-BaktVi (3493) Bakteeri, viljely ysköksestä Ex-TbViVr (4027) M. tuberculosis, viljely ja värjäys ysköksestä -TbViVr (2812) M. tuberculosis, viljely ja värjäys (muut kuin yksönäytteet) -TbNhO (4490) M. tuberculosis, NhO (kval) -LegiVi (2206) Legionella, viljely -PncaNhO (4446) Pneumocystis carinii, NhO, kval -PncaAg (3998) Pneumocystis carinii, antigeeni -MyHeCp (9665) Mycoplasma pneumoniae ja chlamydia pneumoniae, NhO ja M. pneumoniae herkkyys -PicoNhO (1917) Picorna virus, NhO (sis. RinoNhO ja EVirNhO) -AdenNhO (4897) Adenovirus, NhO (kval) -ResNhO (8940) Respiratoriset virukset ja bakteerit, NhO (kval) Kapsarasia Yskösnäytteet Bronkus ja BALnäytteestä Koeputki 50 ml Yskös- ja muut hengitystienäytteet jääkaappi (myös LegiVi) T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 8/15 SIENIVILJELYTUTKIMUKSET: Geelikuljetusputki Transsystem M40 PINNALLISET: - CandVi (1628) Candida, viljely - SienVi (2631) paitsi Sk-SienVi: Sieni, pintasieniviljely - Sk-SienVi (3509) Sieni, viljely iholta, hiuksista, kynsistä SYVÄT Pu-SienVi (2631) Sieni, syväsieniviljely SYNNYTTÄJIEN B- STREPTOKOKKISEULONTA Neuvolat (kiireettömät näytteet): Fl-StrBVi (1729) Sk-SienVi: hilsenäytteet iholta, karvan ja kynsien palaset Kapsarasia Kapsarasia Pu-SienVi: Aspiraatti, ascites- BAL- ja pleuranäyte: 5-10 ml nestettä steriilissä putkessa. Likvor-näytettä noin 0.5 ml. Biopsia ja kudosnäyte: steriili tiiviskorkkinen putki tai purkki. Kudosmateriaali on varjeltava kuivumiselta lisäämällä pari tippaa steriiliä keittosuolaa.. Transsystem M40-kuljetustikkuun (Fl-StrBVi) Tikkunäyte samalla tikulla ensin emättimestä ja sitten peräaukosta Pumpulitikku ei sovellu näytteenottovälineeksi, koska sillä ei saa riittävästi näytemateriaalia ja koska puuvillasäikeet muistuttavat värjäyksessä sienirihmoja Synnytysosasto: Fl-StrBNhO (6383) Streptoccus agalactiae (B), NhO vagina- ja rectumnäytteistä Swab Collection Kit (Fl-StrBNhO) Tikkunäyte molemmilla tikuilla yhtä aikaa ensin emättimestä ja sen jälkeen peräaukosta. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 9/15 ULOSTEEN BAKTEERI- JA VIRUSTUTKIMUJKSET F-SalmVi (2608) Salmonella, viljely F-YersVi (2989) Yersinia, viljely ulosteesta F-CampVi (2021) Campylobacter, viljely F-HepyAg (3952) Helicobacter pylori, antigeeni, ulosteesta F-NoroNhO (4940) Norovirus, NhO (kval) ulosteesta F-AdRoAg (9664) F Adeno- ja rotavirus-ag:t ulosteesta F-BaktVi3 (3584) Bakt.vilj. ulosteesta ruokamyrkytysepäily -EvirNhO (4392) Enterovirus, nukleiinihappo F-CldTNhO (6141) Cl. difficile, toksiinigeeni, NhO ulosteesta F-BaktVi1 (3442) Bakteeri, viljely 1 ulosteesta F-BaktVIP ( 8592) Bakteeri, viljely ja nukleiinihappo ulosteesta F-ShigVi (2620) Shigella, Ulostenäytepurkki lusikalla Ulostenäytepurkki ja geelikuljetusputkitranssystem M40 Tiiviisti suljettu purkki lähetetään muovipussiin pakattuna. Huom! F-SalmVi vain elintarviketyöntekijöiden tarkastuksessa ja positiivisten salmonellalöydösten varmistuksessa. Tiiviisti suljettu purkki ja geelikuljetusputki lähetetään muovipussiin pakattuna. F-BaktVi1- tutkimus sisältää salmonella-, shigella-, yersinia- ja kampylobakteeriviljelyt. F-EHECVTx (9940) EHEC-viljely ja toksiininosoitus ulosteesta F-EHECVTx: Näytteeksi riittää pelkkä geeliputki.näyte tikkuun ulosteen mahdollisesti verisestä tai limaisesta kohdasta. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 10/15 ULOSTEEN PARASIITTITUTKIMUKSET F-Para-O (2455) Parasiitit, kvalitatiivinen F-CrypVr (3444) Cryptosporidium,värjäys ulosteesta -GiarVr (1852) Giardia, värjäys Formaliinipurkki Parasiitti- ja madonmunanäytteet Näyte voidaan ottaa kumpaan vain alla olevista purkeista Huoneenlämpö Formaliininäyte: Ulostenäyte tulee sekoittaa heti tuoreeltaan10 % formaliiniin, jotta parasiittien rakenteet, esim. kystat säilyvät ehjinä! Näytepurkki suljetaan huolellisesti ja laitetaan kuljetuksen ajaksi tiiviisti suljettavaan kuljetuskapseliin ja sen jälkeen muovipussiin tai sellaisenaan tiiviisti suljettavaan muovipussiin. F-ParaNhO (KL 3408) Parasiitit, nukleiinihappo ulosteesta Ulostepurkki lusikalla ilman formaliinia: (F-ParaNhO) KIHOMATOTUTKIMUS F-Enve-O ( 2053) Enterobius vermicularis, ulosteesta (kval) Kuiva kartiopohjainen putki, jossa 1 ml keittosuolaa sekä nukkatikku Tutkimus on tarkoitettu kihomadon (Enterobius vermicularis) munien etsimiseen ulosteesta. Edustavin näyte saadaan sivelemällä peräaukon ympärystä kostutetulla vanutikulla heti aamulla potilaan herättyä. Näyte on otettava ennen ulostamista. Tikun vanupää katkaistaan putkeen, jossa on noin 1 ml keittosuolaa. Toimita näyte mahdollisimman pian mikrobiologian laboratorioon. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 11/15 UROGENITAALIALUEEN NÄYTTEET -CtGcNhO (1738) C trachomatis ja N gonorrhoeae, NhO Ensisijainen näyte: miehillä: ensivirtsanäyte naisilla: cervixnäyte -HPVNhO (4075) Papilloma virus, nukleiinihappo -GenseuNhO (8880) Urogenitaalinäytteen seulonta, NhO Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Mycoplasma genitalium, Mycoplasma hominis ja Trichomonas vaginalis. TrvaAg (6308) Trichomonas vaginalis, antigeeni -CtGcNhO ENSIVIRTSANÄYTE a) Muovinen koeputki kierrekorkilla tai b) säilöntäaineeton vakuumiputki CERVIXNÄYTE c) Xpert CT/NG Vaginal/Endocervical Specimen Collection Kit d) ThinPrep purkki MUUT NÄYTELAADUT (SILMÄ, NIELU, RECTUM) c) Xpert CT/NG Vaginal/Endocervical Specimen Collection Kit -HPVNhO CERVIXNÄYTE d) ThinPrep purkki -GenseuNhO Vaginasta, cerviksistä tai uretrasta otettu näytetikku UTMkuljetusputkessa (e) -TrvaAg: Geelikuljetusputki Transsystem M40 (f) f) e) a) b) c) d) a) ja b): Potilaan tulee olla virtsaamatta vähintään 1 tunti ennen näytteenottoa. Ei alapesua. Enintään 8 ml ensivirtsaa toimitetaan laboratorioon kierrekorkillisessa, säilöntäaineettomassa putkessa tai säilöntäaineettomassa vakuumiputkessa. c) ja d): Huoneenlämpö c) Puhdista cervix huolellisesti limasta ennen näytteenottoa pakkauksessa olevalla isolla pumpulitikulla. Heitä tikku pois. Ota näyte endocervixistä toisella pakkauksessa olevalla tikulla kiertämällä sitä noin 10-30 sekunnin ajan cervixissä. Poista näytteenottotikku varovasti välttäen koskettamasta emättimen limakalvoa Aseta tikku näytteenkuljetusputkeen huolellisesti varoen kontaminaatiota ja roiskeita. Katkaise tikku ja jätä se putkeen. Sulje putki huolellisesti. d) Näyte otetaan kohdun napukasta näytteenottosetin sudilla pyörittämällä viisi täyttä kierrosta. Välittömästi painele näyte ThinPrep- purkin sisällä liuoksessa 10 kertaa siten, että harjakset eroavat toisistaan. Lopuksi huljuttele sutia vielä voimakkaasti liuoksessa. Heitä suti pois ja sulje purkki hyvin. e) Huom! Toimitettava saman päivän aikana laboratorioon. Näytteenottotikku katkaistaan kuljetusnestettä sisältävään putkeen f) T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 12/15 VERIVILJELYNÄYTTEET B-BaktVi (1153) Bakteeri, viljely verestä VIRTSANÄYTTEET U-BaktVi (1155) Bakteeri, viljely virtsasta - StpnAg (3326) Streptococcus pneumoniae, antigeeni U-LepnAg (4632) Legionella, antigeeni, osoitus virtsasta -TbViVr (2812) Mycobacterium tuberculosis, viljely -Schi-O (2611) Schistosoma, kval l virtsasta Veriviljelypullot aerobi, anaerobi, lasten veriviljelypullo Virtsaviljely putki (säilöntäaineellinen putki) tai Koeputki 50 ml (-TbViVr ja Schi-O) Huoneenlämpö Aikuisilta suositeltava näytemäärä on noin 8-10 ml kumpaankin pulloon ja lapsilta 1-3 ml. Vältettävä ilman joutumista anaerobipulloon. Huom! Toimitettava välittömästi laboratorioon (päivystysaikaan kliinisen kemian laboratorioon)! Huom! Veriviljelypullot tulisi säilyttää huoneenlämmössä pimeässä ennen näytteenottoa. Virtsan bakteeriviljely: Puhtaasti laskettu keskivirtsanäyte (suositus: rakossa ainakin 4 tuntia), pussi/tyynyvirtsanäyte tai katetrivirtsanäyte. HUOM! Kontaminaatioiden välttämiseksi näytteenottoon kiinnitettävä erityistä huomiota Pneumokokki- tai Legionella-antigeeni virtsasta: 5-10 ml virtsaa säilöntäaineellisessa tai säilöntäaineettomassa putkessa. Virtsan ei tarvitse olla steriiliä ja boorihappoa voi käyttää säilöntäaineena. Huom! TbViVr näyte on suojattava valolta (esim. foliopaperilla) Virtsanäytteistä ei tehdä Tb-värjäysta! T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 13/15 MUITA YKSITTÄISIÄ TUTKIMUKSIA -AmebVr (4088) Ameeba, värjäys EcoFix-kiinnite Huoneenlämpö Ameeba, värjäys (trofotsoiitit): Uloste, kudospala, abskessi-aspiraatti tai kauhanäyte. -TbIFNg (6173) Mycobacterium tuberculosis, herkistyneet solut, gammainterferoni, eritys verestä (IGRA) 4 erikoisputkea (harmaa- (Nil), vihreä- (TB1 Antigen), keltainen- (Tb2 Antigen) ja violetti- (Mitogen) korkkinen putki HUOM! Ota verta putkessa olevaan mustaan viivaan asti. Näytteenottojärjestys: Nil, TB1 Antigen, Tb 2 Antigen Mitogenputki. Käännä putkia 10 kertaa ylösalaisin. Antigeenit on kuivattuina putkien sisäpinnoille, joten on tärkeää, että putkien koko sisäpinta kastuu verellä. Veriputket säilytetään ja lähetetään huoneenlämmössä (+22 C ± 5 C), niitä ei saa laittaa jääkaappiin, pakastaa eikä fuugata). Ennen näytteenottoa otettava yhteys mikrobiologian laboratorioon puh. 4154667. Näytteenotto vain Seinäjoen keskussairaalassa joko maanantaisin, tai tiistaisin. Toimitetaan mikrobiologian laboratorioon saman päivän aikana (ennen klo 15.00). T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 14/15 B- TbEVi (4438) Mycobacterium, erikoisviljely verestä Bactec Myco/F Lytic, BD Huoneenlämpö Aseptiikka, ihon puhdistus ja näytteenotto kuten veren bakteeriviljelyssä, 3-5 ml/pullo NUKLEIINIHAPPOTUTKIMUKSIA SILMÄNÄYTTEET -HSVNhO (1860) Herpes simplex, nukleiinihappo -VZVNhO (1781) Vesirokkovirus, nukleiinihappo AdenNhO (KL 4897) Adenovirus, nukleiinihappo (kval) Silmänäyte otetaan nukkatikulla tehdassteriiliin putkeen. Samasta näytteestä voidaan tehdä useita (4-5) NhO-tutkimuksia. T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx

Näytteenoton Ohje 15/15 NUKLEIINIHAPPOTUTKIMUKSIA MUUT NÄYTTEENLAADUT Tehdassteriili koeputki -BorrNhO (4202) Borrelia, nukleiinihappo -ParvNhO (4620) Parvo virus, nukleiinihappo -ToxoNhO (1730) Toxoplasma, nukleiinihappo -BaktNhO (4381) Bakteeri, nukleiinihappo (kval) -MyHeCp (9665) Mycoplasma pneumoniae ja chlamydia pneumoniae, NhO ja M. pneumoniae herkkyys tai Verinäyte: 5 ml kokoverta EDTA- tai sitraattiputkessa. Likvorinäyte: 0.5-1 ml likvoria. Lapsivesinäyte: 5-10 ml lapsivettä. BAL-näyte: 5 ml BAL-nestettä. Kudospalat ja ruumiinavausnäytteet: Muutaman kuutiomillimetrin pala, hyvin pienet kudospalat voi upottaa keittosuolaliuokseen kuivumisen estämiseksi. Huom! Putkea ei saa availla eikä näytettä saa kaataa putkesta toiseen. Vastuuhenkilö(t) sairaalamikrobiologi / erikoislääkäri Korvaa ohjeen - 10 Muutokset Tutkimukset ryhmitelty näytteenlaadun mukaan F-CrypAg, F-GiarAg F-EhistAg, Sy-BaktVi,BopeNhO poistettu -GenseuNhO (8880) MyHeCp (9665) lisätty -EvirNhO (4392) ohje muuttunut F-AdRoAg (9664) Adeno- ja rotavirusantigeenitutkimukset yhdistetty yhdeksi tutkimukseksi Fl-StrBNhO (6383) Tutkimusnumero muuttunut -TbVi tutkimusnimike muuttunut TbViVr-tutkimukseksi Lisätty Vierasesineiden bakteeriviljelyt, Tarkennettu Ts-HepyVi, NocaVi ja resistenttien bakteereiden näytteenotto- ohjeita Steriilit nesteet bakteeriviljely näytteenotto-ohjetta tarkennettu (ensisijainen suositus Portagerm) T:\LAATUJÄRJESTELMÄ\OHJEET\NÄYTTEENOTTO-OHJEET\ 10.1.docx