artus C. difficile QS-RGQ Kit

Transkriptio

1 artus C. difficile QS-RGQ Kit Suorituksen ominaispiirteet artus C. difficile QS-RGQ Kit, versio 1, Versiotiedot Tämä asiakirja on: artus C. difficile QS-RGQ -sarjan suoritusominaisuudet, versio 1, R1. Tarkista ennen kokeen suorittamista uusien elektronisten etikettiversioiden saatavuus osoitteesta Toteamisraja artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toteamisraja (Limit of Detection, LOD) arvioitiin 3 toksigeenisella Clostridium difficile -kannalla: NAP-1/BI/027-kanta, toksinotyyppi III A+B+ (ATCC BAA-1870); 1470-kanta, toksinotyyppi VIII A-B+ (ATCC 43598), ja VPI kanta, toksinotyyppi 0 A+B+ (ATCC 43255). Jokaista kantaa sarjalaimennettiin kasvualustalla 2-kertaisilla laimennuksilla. Jokaisen laimennuksen alikvootti lisättiin negatiivista ulostematriisia sisältävään Buffer ATL (puskuri ATL) -puskuriin ja käsiteltiin 20 replikaatissa QIAsymphony RGQ -laitteessa. Jokaisen kannan toteamisraja määritettiin vertaamalla toteamislukua ja bakteerin tulotitteriä sekä suorittamalla probiittianalyysi (kuvat 1 3). artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toteamisraja on 7,9 CFU/ml NAP-1/BI/027-kannalle, 11,2 CFU/ml 1470-kannalle ja 2,8 CFU/ml VPI kannalle. Tämä tarkoittaa sitä, että 95 %:n todennäköisyydellä NAP-1/BI/027-kannasta detekoidaan 7,9 CFU/ml, 1470-kannasta 11,2 CFU/ml ja VPI kannasta 2,8 CFU/ml. Joulukuu 2013 Sample & Assay Technologies

2 Kuva 1. Probiittianalyysi: NAP-1/BI/027-kanta. artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toteamisraja. Kuva 2. Probiittianalyysi: 1470-kanta. artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toteamisraja. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 2 / 22

3 Kuva 3. Probiittianalyysi: VPI kanta. artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toteamisraja. Analyyttinen reaktiivisuus artus C. difficile QS-RGQ -sarjan analyyttisen reaktiivisuuden analyysin tarkoituksena oli määrittää, pystyykö sarja detekoimaan useita toksigeenisiä C. difficile -kantoja, joissa esiintyy tilapäisiä ja maantieteellisiä vaihtelevuuksia. Kantojen raportoitiin olevan peräisin 4 maasta ja vähintään 8 osavaltiosta, ja ne sisälsivät 11 toksinotyyppiä. Yhteensä 27 bakteerikantaa ja karakterisoitua kliinistä isolaattia (taulukko 1) laimennettiin TE-puskuriin viitekannan 2 3x toteamisrajaan ja testattiin artus C. difficile QS-RGQ -sarjassa. C. difficile -kohde detekoitiin kaikissa testatuissa kannoissa. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 3 / 22

4 Taulukko 1. Analyyttisissä reaktiivisuustutkimuksissa testatut C. difficile -kannat Organismin tunnus Kanta Toksinotyyppi Detekoitu C. difficile - kohde ATCC* ATCC ATCC W ATCC ATCC ATCC ATCC BDMS 18AN + + ATCC ATCC M6S ATCC BAA X + + ATCC BAA-1805 III + + ATCC BAA ATCC BAA ATCC BAA ATCC BAA ATCC BAA V + + ATCC BAA-2155 LBM ATCC BAA-2156 LBM CCUG X + + * American Type Culture Collection. : tietoa ei käytettävissä. Solutietokanta, Göteborgin yliopisto, Ruotsi. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 4 / 22

5 Taulukko 1. Jatkoa Organismin tunnus Kanta Toksinotyyppi Detekoitu C. difficile - kohde Illinois, VA-sairaalan isolaatti 278 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 464 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 4092 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 5572 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 3430 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 1753 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 5090 Illinois, VA-sairaalan isolaatti 3130 II + + IV + + VIII + + VIII + + IX + + XII + + XXI + + XXII + + = tietoa ei käytettävissä. Ristiin reagointi ja häiriöt Potilasnäytteiden mahdollisesti sisältämien mikro-organismien paneelin testauksen tarkoituksena oli määrittää, häiritsevätkö nämä mikro-organismit tcda- tai tcdb-kohteiden detekointia tai reagoivatko ne ristiin artus C. difficile QS-RGQ -sarjan kanssa. Kolme toksigeenistä C. difficile - kantaa (NAP-1/BI/027-kanta, toksinotyyppi III A+B+ (ATCC BAA-1870); 1470-kanta, toksinotyyppi VIII A-B+ (ATCC 43598), ja VPI kanta, toksinotyyppi 0 A+B+ (ATCC 43255) laimennettiin 2 3x toteamisrajaan negatiivista ulostematriisia sisältävään puskuri ATL:ään. Mahdollisesti häiritsevät organismit laimennettiin negatiivista ulostematriisia sisältävään puskuri ATL:ään ja testattiin kohdepitoisuuden ollessa noin 1 x 10 6 CFU/ml bakteereille ja sienille tai Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 5 / 22

6 1 x 10 5 yksikköä/ml viruksille (tai suurin saavutettavissa oleva pitoisuus) jokaisen C. difficile - kannan kanssa. Ristiin reagointi analysoitiin laimentamalla jokainen paneelin organismi negatiivista ulostematriisia sisältävään puskuri ATL:ään kohdepitoisuuden ollessa noin 1 x 10 6 CFU/ml bakteereille ja sienille tai 1 x 10 5 yksikköä/ml viruksille ja testaamalla artus C. difficile QS-RGQ -sarjassa. Mikään mahdollisesti häiritsevistä organismeista ei reagoinut ristiin tai häirinnyt minkään C. difficile -kannan detekointia artus C. difficile QS-RGQ -sarjassa (taulukko 2). Taulukko 2. Häiriöiden ja ristiin reagoinnin osalta testattujen organismien paneeli Häiriöt Ristireaktiviteetti Detekoitu Detekoitu C. C. Testattu Lähteen difficile - difficile - organismi tunnus kohde kohde Abiotrophia defectiva ATCC* Acinetobacter baumannii Aeromonas hydrophila Alcaligenes faecalis ssp. faecalis ATCC ATCC 7966 ATCC Bacillus cereus ATCC Bacteroides fragilis ZMC Campylobacter coli ATCC C. coli ATCC C. jejuni ssp. jejuni ATCC * American Type Culture Collection. Zeptometrix Corporation. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 6 / 22

7 Taulukko 2. Jatkoa Häiriöt Ristireaktiviteetti Detekoitu Detekoitu C. C. Testattu Lähteen difficile - difficile - organismi tunnus kohde kohde Candida albicans ATCC* Citrobacter freundii ATCC 8090 C. bifermentans ATCC 638 C. botulinum C. butyricum ATCC C. difficile (ei-toksigeeninen) C. difficile (ei-toksigeeninen) ATCC ATCC C. haemolyticum ATCC 9650 C. novyi ATCC C. orbiscindens ATCC C. perfringens ATCC C. scindens ATCC C. septicum ATCC C. sordellii ATCC 9714 C. sporogenes ATCC * American Type Culture Collection. : tietoa ei käytettävissä. In silico -analyysissä ei ilmennyt ennustettua ristiin reagointia tai mikrobihäiriöitä C. botulinum - bakteerin osalta. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 7 / 22

8 Taulukko 2. Jatkoa Häiriöt Ristireaktiviteetti Detekoitu Lähteen C. difficile - Detekoitu C. Testattu organismi tunnus kohde difficile -kohde Edwardsiella tarda ATCC* Enterobacter aerogenes ATCC E. cloacae ATCC Enterococcus faecalis (vanb) ATCC Escherichia coli ATCC E. coli O157:H7 ATCC Helicobacter pylori ATCC 43504D- 5 Klebsiella oxytoca ATCC Lactobacillus acidophilus Listeria monocytogenes Peptostreptococcus anaerobius Plesiomonas shigelloides Porphyromonas asaccharolytica ATCC 4356 ZMC ATCC ATCC ATCC * American Type Culture Collection. Zeptometrix Corporation. DNA testattiin intaktien organismien sijasta loppupitoisuudessa 1 x 10 6 kopiota/ml. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 8 / 22

9 Taulukko 2. Jatkoa Häiriöt Ristireaktiviteetti Detekoitu Detekoitu C. difficile - C. difficile - Testattu organismi Lähteen tunnus kohde kohde Prevotella melaninogenica ATCC* Proteus mirabilis ATCC Providencia alcalifaciens Pseudomonas aeruginosa Salmonella choleraesuis (Typhimurium) S. enterica ssp. arizonae S. enterica ssp. enterica ATCC 9886 ATCC ATCC ATCC ATCC 7001 Serratia liquefaciens ATCC S. marcescens ATCC Shigella boydii ATCC 9207 S. dysenteriae ATCC S. sonnei ATCC Staphylococcus aureus ATCC S. epidermidis ATCC * American Type Culture Collection. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 9 / 22

10 Taulukko 2. Jatkoa Häiriöt Ristireaktiviteetti Detekoitu Detekoitu C. C. Testattu Lähteen difficile - difficile - organismi tunnus kohde kohde Streptococcus agalactiae Vibrio parahaemolyticus ATCC* ATCC Adenovirus Coxsackievirus Sytomegalovirus Echovirus Enterovirus Norovirus Rotavirus Ihmisen genominen DNA ZMC CF ZMC CF ZMC CF ZMC CF ZMC CF ZMC CF ZMC CF Promega G3041 * American Type Culture Collection. Zeptometrix Corporation. DNA testattiin loppupitoisuudessa 1 x 10 6 kopiota/ml. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 10 / 22

11 Tarkkuus artus C. difficile QS-RGQ -sarjan tarkkuus arvioitiin 7-jäsenisellä paneelilla, joka koostui 2 C. difficile -kannasta: NAP-1/BI/027-kanta, toksinotyyppi III A+B+ (ATCC BAA-1870), ja 1470-kanta, toksinotyyppi VIII A-B+ (ATCC 43598). Paneelin jäsenet laimennettiin ensin TE-puskuriin ja testattiin sitten negatiivista ulostematriisia sisältävässä puskuri ATL:ssä yhdellä kannalla (NAP-1/BI/027 tai 1470) 3 pitoisuutena; positiivinen (noin 2 3x LOD), matala positiivinen (1x LOD) ja korkea negatiivinen (<1x LOD). Seitsemäs paneelin jäsen (negatiivinen) valmisteltiin käyttämällä ainoastaan TE-puskuria ja testattiin sitten myös negatiivista ulostematriisia sisältävässä puskuri ATL:ssä. Saatujen tietojen perusteella määritettiin, vakio poikkeama () ja variaatiokerroin () jokaiselle kohteelle ja sisäiselle lle. Laboratorion sisäistä toistettavuutta koskevassa tutkimuksessa 7-jäseninen paneeli testattiin kolmen replikaatissa kerran päivässä yhteensä 12 päivän ajan. 2 eri käyttäjää suoritti kokeen yhdellä laitteella (QIAsymphony RGQ) ja yhdellä artus C. difficile QS-RGQ -sarjan erällä. Taulukko 3. Yhteenveto artus C. difficile QS-RGQ -sarjan laboratorion sisäisestä toistettavuudesta tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen NAP-1/BI/027 Positiivinen 29,78 0,49 1,64 30,84 0,47 1,52 33,58 0,64 1,91 Matala 30,07 0,55 1,82 32,19 0,99 3,08 34,92 0,68 1,94 positiivinen Korkea negatiivinen 29,99 0,72 2,41 34,21 0,91 2,66 36,18 0,23 0,64 Positiivinen 29,85 0,52 1,73 30,95 0,55 1,78 33,72 0,45 1, Matala positiivinen 29,89 0,41 1,39 32,14 0,65 2,03 35,13 0,63 1,80 Korkea negatiivinen 29,92 0,53 1,76 34,14 0,66 1,92 36,39 0,03 0,07 Negatiivinen 30,00 0,44 1,46 * * : tietoa ei käytettävissä. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 11 / 22

12 Erien välisen toistettavuuden arvioinnissa käytettiin kolmea eri artus C. difficile QS-RGQ -sarjan erää. Yksi käyttäjä käsitteli kaikki kolme erää yhden kerran (yhteensä 3 käsittelykertaa) yhdellä laitteella (QIAsymphony RGQ). Jokaisen erän jokainen paneelin jäsen testattiin kuuden replikaattina (taulukko 4). Taulukko 4. Yhteenveto artus C. difficile QS-RGQ -sarjan erien välisestä toistettavuudesta tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen Erä Positiivinen NAP-1/BI/ ,07 0,56 1,86 31,13 0,37 1,20 33,74 0,58 1, ,88 0,59 1,90 31,25 0,33 1,07 34,16 0,46 1, ,62 0,35 1,13 32,04 0,53 1,64 35,10 0,74 2,11 Kokonais- 30,52 0,59 1,94 31,47 0,57 1,81 34,33 0,81 2,37 Matala positiivinen Korkea negatiivinen 1 29,81 0,36 1,21 32,12 0,22 0,69 35,97 0,21 0, ,81 0,27 0,88 32,38 0,29 0,91 34,86 0,57 1, ,89 0,38 1,24 33,23 0,26 0,78 36,05 0,55 1,52 Kokonais- 30,50 0,60 1,97 32,57 0,55 1,69 35,56 0,71 2, ,90 0,47 1,59 34,58 0,09 0,26 * 2 30,82 0,29 0,94 34,10 0,49 1, ,13 0,46 1,47 35,39 0,38 1,08 Kokonais- 30,62 0,66 2,17 34,74 0,63 1, ,95 0,38 1,28 31,12 0,52 1,68 33,90 0,52 1, Positiivinen 2 30,83 0,36 1,17 30,96 0,52 1,67 34,21 0,78 2, ,33 0,27 0,85 32,30 0,60 1,87 35,75 0,46 1,28 Kokonais- 30,70 0,67 2,17 31,46 0,80 2,55 34,48 0,96 2,79 * : tietoa ei käytettävissä. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 12 / 22

13 Taulukko 4. Jatkoa tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen 1470 Matala positiivinen Erä Korkea negatiivinen 1 30,05 0,26 0,88 32,23 0,47 1,47 35,16 0,11 0, ,78 0,34 1,11 32,60 0,44 1,35 35,64 0,55 1, ,63 0,92 2,99 33,17 0,46 1,38 * Kokonais- 30,48 0,64 2,09 32,67 0,58 1,79 35,45 0,47 1, ,70 0,45 1,50 34,51 0,10 0, ,03 0,28 0,89 34,34 0,73 2, ,23 1,21 3,87 Kokonais- 30,65 1,00 3,26 34,41 0,36 1, ,14 0,33 1,09 Negatiivinen 2 30,62 0,36 1, ,53 0,89 2,59 Kokonais- 31,77 2,10 6,61 * : tietoa ei käytettävissä. Laitteen toistettavuutta mitattiin käsittelemällä seitsenjäseninen paneeli kolmessa eri QIAsymphony RGQ -laitteessa. Yksi käyttäjä testasi paneelin jäsenet kuuden replikaatteina yhdellä artus C. difficile QS-RGQ -sarjan erällä (katso taulukko 5). Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 13 / 22

14 Taulukko 5. Yhteenveto artus C. difficile QS-RGQ -sarjan instrumenttien välisestä toistettavuudesta tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen Laite 1 30,33 0,36 1,18 31,70 0,36 1,14 35,48 0,27 0,76 Positiivinen 2 29,89 0,33 1,10 31,07 0,67 2,15 33,54 0,84 2, ,34 0,40 1,33 31,16 0,38 1,21 33,64 0,84 2,49 Kokonais- 30,19 0,41 1,35 31,31 0,54 1,72 34,22 1,13 3,31 NAP-1/BI/027 Matala positiivinen 1 30,33 0,31 1,03 32,97 0,35 1,05 35,62 0,28 0, ,83 0,43 1,45 31,66 0,31 0,97 35,07 0,92 2, ,50 0,96 3,16 32,61 0,52 1,60 35,05 0,67 1,90 Kokonais- 30,22 0,67 2,20 32,41 0,68 2,10 35,14 0,74 2, ,59 0,45 1,47 35,79 0,28 0,79 * Korkea negatiivinen 2 30,02 0,27 0,90 34,05 1,02 3,00 35, ,30 0,37 1,21 33,20 Kokonais- 30,30 0,42 1,40 34,49 1,25 3,62 35, ,47 0,22 0,72 32,13 0,59 1,84 34,69 0,46 1, Positiivinen 2 29,41 0,37 1,25 30,38 0,40 1,33 33,73 0,95 2, ,27 0,32 1,07 31,61 0,37 1,17 34,14 0,62 1,83 Kokonais- 30,05 0,55 1,85 31,38 0,87 2,78 34,19 0,78 2,27 * : tietoa ei käytettävissä. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 14 / 22

15 Taulukko 5. Jatkoa tcda tcdb 1470 Matala positiivinen Kanta Korkea negatiivinen Paneelin jäsen Laite 1 30,78 0,39 1,27 33,34 0,32 0,97 35,34 0,28 0, ,58 0,31 1,04 31,88 0,96 3,01 34,72 0,41 1, ,06 0,53 1,78 32,22 0,62 1,91 35,39 0,40 1,14 Kokonais- 30,14 0,64 2,14 32,48 0,91 2,80 35,11 0,48 1, ,55 0,27 0,87 35,82 0,25 0,71 * 2 29,40 0,21 0,71 33,51 0,95 2,83 35, ,41 0,34 1,11 35,44 0,73 2,07 Kokonais- 30,12 0,59 1,95 35,01 1,20 3,43 35, ,45 0,32 1,06 Negatiivinen 2 29,71 0,28 0, ,59 0,39 1,28 Kokonais- 30,25 0,51 1,68 * : tietoa ei käytettävissä. Tutkimuspaikkojen välistä toistettavuutta mitattiin siten, että 2 käyttäjää käsitteli 7-jäsenisen paneelin kaikissa 3 tutkimuspaikassa (IMDx ja 2 ulkoista tutkimuspaikkaa). Kumpikin käyttäjä käsitteli paneelin 5 kertaa eri testauspäivinä. Paneelin jäsenet testattiin 3 replikaatteina, jotka satunnaistettiin ja sokkoutettiin käyttäjälle. Tutkimukseen käytettiin yhtä QIAsymphony RGQ -laitetta ja yhtä artus C. difficile QS-RGQ -sarjan erää jokaisessa tutkimuspaikassa (taulukko 6). Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 15 / 22

16 Taulukko 6. Yhteenveto artus C. difficile QS-RGQ -sarjan tutkimuspaikkojen välisestä toistettavuudesta tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen Paikka 1 30,61 0,42 1,38 31,85 0,73 2,30 34,32 0,69 2,02 Positiivinen 2 30,58 0,51 1,65 32,16 0,80 2,50 34,43 0,71 2, ,55 0,32 1,05 31,97 0,85 2,65 34,87 0,78 2,25 Kokonais- 30,58 0,42 1,37 32,00 0,80 2,49 34,53 0,76 2,19 NAP-1/BI/027 Matala positiivinen Korkea negatiivinen 1 30,63 0,40 1,30 33,38 0,71 2,14 35,58 0,55 1, ,73 0,60 1,94 33,27 0,81 2,45 35,01 0,53 1, ,86 0,62 2,00 33,07 0,84 2,53 35,45 0,69 1,96 Kokonais- 30,74 0,55 1,78 33,24 0,79 2,38 35,36 0,62 1, ,71 0,35 1,15 34,21 0,54 1,58 35,88 * 2 30,59 0,33 1,09 34,21 0,29 0,86 35, ,64 0,47 1,53 34,17 0,57 1,68 Kokonais- 30,65 0,39 1,27 34,19 0,45 1,32 35,91 0,16 0, ,67 0,49 1,58 32,22 0,86 2,67 34,74 0,61 1, Positiivinen 2 30,69 0,41 1,32 31,74 0,95 2,99 34,66 0,74 2, ,86 0,33 1,06 31,81 0,78 2,45 34,95 0,70 2,01 Kokonais- 30,74 0,42 1,35 31,92 0,88 2,77 34,78 0,69 1,99 * : tietoa ei käytettävissä. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 16 / 22

17 Taulukko 6. Jatkoa tcda tcdb Kanta Paneelin jäsen Paikka Matala positiivinen 1 30,74 0,42 1,37 33,17 0,94 2,83 35,61 0,49 1, ,51 0,42 1,38 33,06 0,89 2,70 35,62 0,60 1, ,70 0,33 1,08 33,41 1,08 3,22 35,77 0,46 1,29 Kokonais- 30,65 0,40 1,31 33,20 0,96 2,90 35,65 0,53 1, Korkea negatiivinen 1 30,76 0,46 1,50 34,64 0,14 0,40 36, ,55 0,45 1,46 34,15 0,28 0,83 35, ,44 0,42 1,38 34,63 0,27 0,77 * Kokonais- 30,58 0,46 1,49 34,49 0,31 0,91 36,12 0,42 1, ,68 0,37 1,20 Negatiivinen 2 30,66 0,47 1, ,67 0,42 1,37 33,58 Kokonais- 30,67 0,42 1,36 33,58 * : tietoa ei käytettävissä. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 17 / 22

18 Siirtyminen Näytteiden välisen siirtymisen (ristikontaminaatio) mahdollisuus suljettiin pois koko työnkulussa osoittamalla, että kaikki korkean positiiviset ja negatiiviset näytteet detekoitiin oikein kaikissa vaihtoehtoisissa paikoissa. Keinotekoiset positiiviset ja negatiiviset näytteet valmisteltiin negatiivista ulostematriisia sisältävässä puskuri ATL:ssä. Korkean positiiviset näytteet muodostettiin pitoisuudella 4, CFU/ml, joka oli korkeampi kuin 95 %:ssa käyttökohderyhmän sairastuneiden potilaiden näytteistä löytyneiden organismien pitoisuus. Näytteet käsiteltiin koko artus C. difficile QS-RGQ - työnkululla. Kaikkien näytteiden detekointi tapahtui oikein. Häiritsevät aineet Potilasnäytteiden mahdollisesti sisältämistä 23 aineesta koostuva paneeli testattiin tarkoituksena määrittää, häiritsevätkö nämä aineet artus C. difficile QS-RGQ -sarjan toimintaa. Kolme toksigeenistä C. difficile -kantaa: NAP-1/BI/027-kanta, toksinotyyppi III A+B+ (ATCC BAA-1870); 1470-kanta, toksinotyyppi VIII A-B+ (ATCC 43598), ja VPI kanta, toksinotyyppi 0 A+B+ (ATCC 43255) laimennettiin noin 2 3x toteamisrajaan negatiivista ulostematriisia sisältävään puskuri ATL:ään. Jokaiseen organismiin lisättiin jokaista mahdollisesti estävää ainetta, ja ne testattiin triplikaatteina artus C. difficile QS-RGQ -sarjalla. Näytteet ja merkit esitetään taulukossa 7. Millään aineella ei havaittu olevan estävää vaikutusta C. difficile -bakteerin detekointiin artus C. difficile QS-RGQ -sarjassa. Taulukko 7. Mahdollisten häiriöiden osalta testatut aineet Aine Mahdollinen häiritsevä aine Testattu pitoisuus* Aleve Naprokseeninatrium 14 mg/ml Bariumsulfaatti Bariumsulfaatti 5 mg/ml Kondomit Nonoksinoli-9 7 % ExLax Sennosidit 0,1 mg/ml Gaviscon Alumiinihydroksidi ja magnesiumkarbonaatti 0,1 mg/ml Peräpukamageeni Fenyyliefriinihydrokloridi 2 % w/v * Ilmaisee aineen fysiologisesti olennaisen pitoisuuden. Taulukko jatkuu seuraavalla sivulla Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 18 / 22

19 Taulukko 7. Jatkoa Aine Mahdollinen häiritsevä aine Testattu pitoisuus* Imodium Loperamidi-HCl 0,00667 mg/ml Metronidatsoli Metronidatsoli 14 mg/ml Mikonatsolinitraattivoide Mikonatsolinitraatti 2 % w/v Mineraaliöljy Mineraaliöljy 2 % v/v Useimmat kosteuspyyhkeet Bentsalkoniumkloridi 0,12% w/v Lima Musiini 3 mg/ml Palmitiinihappo Palmitiinihappo 2 mg/ml Pepto Bismol Vismuttisubsalisylaatti 0,87 mg/ml Preparation H Hydrokortisoni 2 % w/v Prilosec vapautuminen) (viiveellinen Omepratsolimagnesium 0,5 mg/ml Steariinihappo Steariinihappo 4 mg/ml Tagamet ` Simetidiini 0,5 mg/ml Tums Kalsiumkarbonaatti 0,5 mg/ml Vankomysiini-HCl Vankomysiini 12,5 mg/ml Vaseline Vaseliini 100 % Kokoveri Glukoosi, hormonit, entsyylit, rauta jne. 5 % v/v Sinkkioksidi Sinkkioksidi 40 % w/v * Ilmaisee aineen fysiologisesti olennaisen pitoisuuden. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 19 / 22

20 Diagnostisen suorituksen arviointi artus C. difficile QS-RGQ -sarjan suorituskyky arvioitiin 3 ulkoisessa tutkimuspaikassa C. difficile - potilasnäytteillä, jotka olivat peräisin Yhdysvalloista 5 maantieteellisesti eri paikasta vuonna Arviointiin käytettiin yhteensä 699 nestemäistä tai löysää ulostenäytettä. artus C. difficile QS-RGQ - sarjalla saatuja tuloksia verrattiin suorasta viljelystä saatuihin tuloksiin. Kliinisiä näytteitä pidettiin positiivisina, jos tcda:n arvo oli 38,3 ja tcdb:n vastaava arvo 36,5. Testatuilla kliinisillä näytteillä artus C. difficile QS-RGQ -sarjan diagnostinen kokonaisherkkyys oli 99 % (positiivinen ennustearvo 80 %) ja spesifisyys 97 % (negatiivinen ennustearvo 100 %) C. difficile -bakteerille suoraan viljelyyn verrattuna (taulukot 8 ja 9). Taulukko 8. C. difficile -bakteerin kliinistä yhtäpitävyyttä koskevan tutkimuksen tulokset Suora viljely + Yhteensä artus C. difficile QS-RGQ -sarja * Yhteensä * 19 raportoitua diskordanttia näytettä (artus C. difficile QS-RGQ -testi positiivinen, suora viljely negatiivinen) analysoitiin vaihtoehtoisella PCR:llä ja sen jälkeen kaksisuuntaisella sekventoinnilla. Tämä osoitti, että 19 näytteestä 14 näytettä oli positiivisia toksigeeniselle C. difficile -bakteerille. Tulos on yhtäpitävä artus C. difficile QS-RGQ -sarjan tuloksen kanssa. 2 jäljelle jäänyttä diskordanttia näytettä eivät olleet käytettävissä testaukseen. Yksi diskordantti näyte (artus C. difficile QS-RGQ -testi negatiivinen, suora viljely positiivinen) ei ollut käytettävissä testaukseen. Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 20 / 22

21 Taulukko 9. C. difficile -bakteerin kliinistä yhtäpitävyyttä koskevan tutkimuksen tulokset 95 % CI Herkkyys 99 % % Tarkkuus 97 % % Positiivinen ennustearvo 80 % % Negatiivinen ennustearvo 100 % % Esiintyminen (%) 12 % % Yhtäpitävyys 97 % Suorituksen ominaispiirteet: artus C. difficile QS-RGQ -sarja Sivu 21 / 22

22 Katso päivitetyt lisenssitiedot ja tuotekohtaiset vastuuvapauslausekkeet vastaavan QIAGEN-sarjan käsikirjasta tai käyttöoppaasta. QIAGEN-sarjojen käsikirjat ja käyttöoppaat ovat saatavina osoitteessa tai ne voi tilata QIAGENin teknisestä palvelupisteestä tai paikalliselta jälleenmyyjältä. Tavaramerkit: QIAGEN, QIAsymphony, artus, Rotor-Gene (QIAGEN Group); Aleve (Bayer HealthCare LLC); ATCC (American Type Culture Collection Corporation); ExLax (Sandoz Pharmaceuticals Corporation); Gaviscon (Aventis Holdings Inc); Imodium (Johnson & Johnson Corporation); Preparation H (American Home Products Corporation); Prilosec (AstraZeneca AB Corporation); Tagamet, Tums (SmithKline Beecham Pharmaceuticals Co.); Vaseline (Unilever Supply Chain, Inc.). Tässä asiakirjassa mainittuja rekisteröityjä nimiä, tavaramerkkejä jne. on pidettävä lain suojaamina, vaikkei niitä olisi erityisesti sellaisiksi merkitty. Jou QIAGEN, kaikki oikeudet pidätetään. Tanska Italia Singapore Australia Suomi Japani Espanja Itävalta Ranska Etelä-Korea Ruotsi Belgia Saksa Luxemburg Sveitsi Brasilia Hongkong Meksiko Taiwan Kanada Intia Alankomaat UK Kiina Irlanti Norja USA Sample & Assay Technologies