- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,

Samankaltaiset tiedostot
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?

Syöpägeenit. prof. Anne Kallioniemi Lääketieteellisen bioteknologian yksikkö Tampereen yliopisto

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

Genetiikan perusteiden toisen jakson kaavailua

HPV-infektion ja kohdunkaulan syövän esiasteiden luonnollinen kulku

PERINNÖLLISET TEKIJÄT JA NIIDEN MERKITYS RINTASYÖPÄSAIRASTUMISESSA. Robert Winqvist. SyöpägeneCikan ja tuumoribiologian professori Oulun yliopisto

Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehduksen osuus syövän synnyssä. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi. Tulehdus ja karsinogeneesi

Syövän synty. Esisyöpägeenit (proto-onkogeenit)

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

Mutaatiot ovat muutoksia perimässä

Etunimi: Henkilötunnus:

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

Perinnöllisyyden perusteita

Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna

Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1

Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

Avainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.

DNA:n informaation kulku, koostumus

Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15

Perinnöllisyys. Enni Kaltiainen

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla

DNA > RNA > Proteiinit

Perinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen

"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13

Conflict of interest: No! VH has no association with companies mentioned! VH has authored reviews on virus vectors in Suomen Lääkärilehti and

a. Mustan ja lyhytkarvaisen yksilön? b. Valkean ja pitkäkarvaisen yksilön? Perustele risteytyskaavion avulla.

Perinnöllisyyden perusteita

Solujen viestintäjärjestelmät. Katri Koli, Solu- ja molekyylibiologian dosentti Helsingin Yliopisto

Syöpä ja eriarvoisuus

Molekyylidiagnostiikka keuhkosyövän hoidossa. Jussi Koivunen, el, dos. Syöpätautien ja sädehoidon klinikka/oys

Genetiikan perusteiden toisen jakson kaavailua

S Laskennallinen systeemibiologia

- Extra: PCR-alukkeiden suunnittelutehtävä haluttaessa

Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA

Miten on mahdollista, että meillä on vasta-aineet (antibodit) aivan kaikkea mahdollista sisääntunkeutuvaa vierasmateriaalia vastaan?

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.

Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio

Solujen muuntumisprosessi kestää vuosia tai

SÄTEILYN GENEETTISET VAIKUTUKSET

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

Symbioosi 2 VASTAUKSET


Alkoholi. lisää syövän vaaraa. Niillä, jotka kuluttavat säännöllisesi neljä alkoholiannosta päivässä, on. Alkoholi voi aiheuttaa ainakin

Genomi- ilmentymisen säätely

måndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda

Hyvä käyttäjä! Ystävällisin terveisin. Toimitus

Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä

Peittyvä periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

DNA:n korjausmekanismien häiriöt ja niiden lääketieteellinen merkitys

Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet?

Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana. Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere

Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30

Syöpä. Karsinogeneesi. Karsinogeenien identifiointi. Karsinogeenit voidaan identifioida

Geenitekniikan perusmenetelmät

Monogeeniset sairaudet. Monogeeninen periytyminen. Perinnöllisten tautien prevalenssi. Monitekijäiset sairaudet. Dominantti vs.

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Lääketieteellinen tiedekunta Biokemia ja kehitysbiologia

Toisessa osassa ryhdymme tarkastelemaan sitä, mitä geenit ovat, miten ne toimivat ja miten ne tuottavat meille tuttuja elämänilmiöitä

Miten letaalialleeleita käsitellään Drosophilalla? Välttämätön taito esimerkiksi alkionkehityksen alkuvaiheiden selvittämisessä

GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA

Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

Biologia. Pakolliset kurssit. 1. Eliömaailma (BI1)

Tervekudosten huomiointi rinnan sädehoidossa

RAD50:N MERKITYS PERINNÖLLISESSÄ RINTASYÖPÄALTTIUDESSA

Tarkastele kuvaa, muistele matematiikan oppejasi, täytä tekstin aukot ja vastaa kysymyksiin.

Laskuharjoitus 4 selitykset Juha-Matti Alakoskela, jmalakos@cc.helsinki.fi

Glioomien molekyylidiagnostiikkaa Maria Gardberg TYKS-Sapa Patologia / Turun Yliopisto

VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki

X-kromosominen periytyminen. Potilasopas. TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, Turku puh (02) faksi (02)

Terveyteen liittyvät geenitestit

III Perinnöllisyystieteen perusteita

Geenitutkimuksista. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

Suunnitelma Perinnöllisyys T9

Bioteknologia BI5. Mikrobit

DNA-testit. sukututkimuksessa Keravan kirjasto Paula Päivinen

VASTAUS 2a: Ruusukaijasten väri

Solun tuman rakenne ja toiminta. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012

KOE 6 Biotekniikka. 1. Geenien kloonaus plasmidien avulla.

KOULUTUSOHJELMA Sukunimi: Etunimet: Nimikirjoitus: BIOLOGIA (45 p) Valintakoe klo

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia

Yoshinori Ohsumille Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

a) dominoivaan: esiintyy joka sukupolvessa, sairaille vanhemmille voi syntyä terveitä lapsia

Mustaruoste uhkaa romahduttaa maailman vehnäsadot jälleen

Taistoon T-solut! Syöstään syöpä vallasta! Yliopistonlehtori FT Kirsi Granberg Tampereen yliopisto

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

Miten genomitieto on muuttanut ja tulee muuttamaan erikoissairaanhoidon käytäntöjä

Käänteentekevä brittiläinen syöpätutkimus kertoo, että lasten akuutti lymfoplastileukemia on ehkä ehkäistävissä!

E. colin auksotrofiset mutantit

Kromosomimuutokset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com. Huhtikuussa 2008

Kipu. Oleg Kambur. Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT

PTEN -ekspressio rintasyövässä

Transkriptio:

Syöpä, osa II

Syöpäkriittiset geenit - Geenejä, joiden mutaatiot usein havaitaan syöpien kanssa korreloituneena - Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan, - dominoiviin onkogeeneihin - resessiivisiin tuumorin supressoreihin - Nämä erot johtuvat geenin normaalitoiminnasta: oliko se solusyklissä jarruna (supressori) vai kiihdyttäjänä (onkogeeni) CELL 1242-

SOLUSYKLIN KIIHDYTTÄJÄT

CELL 1232

Onkogeenit CELL 1334

Onkogeenit Ensimmäiset onkogeenit löydettiin viruksista, jotka transformoivat eläinsoluja viljelmissä ikuisesti eläviksi eli syöviksi Miksi nämä kaikki ovat eläinviruksia? No siksi, ettei ole oikein tehdä ihmisillä kokeita, joissa syöpä yritetään istuttaa terveeseen vastaanottajaan. Kaikki nuo geenit kuitenkin löytyvät (tietysti) myös ihmiseltä, ja niiden syöpäkrittiisyys on todettu.

Proto-onkogeenien pääluokat ja toimialueet. Kaikki ovat geenejä, joiden tehtävänä normaalisti on edistää solunjakautumisia. Jos niiden säätely ryöstäytyy (yliekspressio), alkavat solu lisääntyä liikaa. Yliekspression (tai hyperaktiivisen proteiinin) voivat aiheuttaa monet erilaiset syyt

ras raf CELL 1243

Retrovirus voi ottaa mukaansa isännän proto-onkogeenin. Huomatkaapa, että se tulee silputtuna mrna-versiona CELL 1233

Muutamia tapoja, jotka voivat johtaa geenin yliekspressioon Proto-onkogeenin proteiinin ylituotanto johtaa solunjakautumisen harkinnan katoamiseen ja solu syöksyy S-faasiin, vaikka edellytykset eivät olisi täyttyneet CELL 1237

Kromosomimuutoksia syöpäsoluissa onkogeeni myc on värjätty keltaiseksi. A) pieniä myc-lisäkromosominpätkiä runsaasti tai B) myc-lisät ovat peräkkäin tandemtoistoina CELL 1238

CELL 1238

CELL 1238

Geenin amplifikaation kaavio, joka selittää edelliset kuvat. Jostakin syystä DNA on replikoitunut solusyklistä riippumatta (kuin Drosophilan sylkirauhasen solussa) ja sitten jotenkin vielä järjestäytynyt CELL 1238

Philadelphia-kromosomi aiheuttaa syövän siten, että syntyy uusi promoottoriyhdistelmä Jostakin syystä translokaatio tapahtuu aika helposti, kenties joidenkin toistojaksojen takia CELL 1208

Hiirelle voidaan istuttaa vialliset geenit Syöpä syntyy

Philadelphia myc CELL 1237

Onkogeenit (normaalimuoto: proto-onkogeenit) - ovat solusyklin edistäjiä (siis S-faasiin siirtymisen eli proliferaation) - yli- tai väärä-aikainen expressio aiheuttaa solujen jakautumista - mutaatiot dominoivia (gain-of-function) - mutaatiot usein geenin säätelyalueella tai -järjestelmässä - virus voi aiheuttaa yliekspression - tunnetaan vaikka kuinka paljon, yli sata

Tuumorin suppressorit

Syöpään liittyviä geeniluokkia Onkogeenit (normaali: proto-onkogeenit) - ovat solusyklin edistäjiä (siis proliferaation) - yli- tai väärä-aikainen expressio aiheuttaa solujen jakautumista - mutaatiot dominoivia (gain-of-function) - mutaatiot usein geenin säätelyalueella tai -järjestelmässä - virus voi aiheuttaa yliekspression - tunnetaan vaikka kuinka paljon Tuumorin suppressorit - ovat solusyklin varmistusjarruja - viat loss-of-function tyyppiä - mutaatiot resessiivisiä - heterotsygooteilla predispositio - vain muutamia, kuten p53 ja Rb

Wait Go SOLUSYKLIN JARRUT

Rb p53 CELL 1243

Tuumorin sup(p)ressorit p53 Rb retinoblastooma p53 ja Rb ovat solusyklin jarruja. Niissä tapahtuvat mutaatiot ovat syöpänäkökulmasta resessiivisiä. Jos toinen alleeli jo on viallinen, sairastumisriski on moninkertainen. Viallisen kopion mukana periytyy alttius: periytyvä syöpä

CELL 1235

CELL 1236

CELL 1237

Seisontajarrujen toimintakaavio. E2F aktivoi joukoittain geenejä, joita solunjakautumisprosessissa, siis aluksi S-vaiheessa tarvitaan: replikaatio, histonit, kaikki tuo. Jopa solun energiantuotto pitää tietenkin monikertaistaa CELL 1244

p53 geeniä vaurioittavat mutaatiot sallivat syöpäsolujen elää ja monistua huolimatta DNA-vahingoista Seurauksena on yhä lisää vahinkoja p53-mutaatioita on yli puolessa ihmisten syöpiä! p53 liittyy solun DNA:n laatukontrolliin ja korjaukseen, ja siihen assosioituvia muita tekijöitä on myös paikannettu syöpäkriittisinä:

BRCA1 ja BRCA2 ovat tunnistettuja rinta- ja ovariosyövän periytyviä riskitekijöitä, joilla on kuitenkin osuus vain noin 1/20 rintasyövistä. Heterotsygootin riski sairastua 80 ikävuoteen mennessä rintasyöpään on 82% (BRCA1=2), ja ovariosyöpäriski on 54/23% (BRCA1>2) Homotsygotia aiheuttaa Fanconin anemiana tunnetun taudin, jossa lapsella on monenlaisia syöpiä, ei kuitenkaan noita aikuisten syöpiä. Fanconi voi aiheutua myös noin 7 muun geenin mutaation takia BRCA:n komponentti, jolla ne osallistuvat DNA:n vaurioiden korjaamiseen tai ainakin p53 viestiketjuun (CELL 280) Science 24 Oct 2003

Nature 8 Feb 2007 Oululaisten työtä! Pääosin Linkki DNA:n korjausvirhe recurrent = toistuva

Nucleotide excision repair (NER) systeemin virhe ihmisellä: Xeroderma pigmentosum CELL 267 Klug & Cummings 479

p53 osallistuu DNA:n vahinkojen korjaamiseen vaatimalla sitä, ikään kuin laaduntarkkailijana, mutta ei se aina pysty.

p53 on myös ohjaamassa solua apoptoosiin useissa eri tilanteissa, tässä aistiessaan kohtuutonta mitogeenista painetta CELL 1246

Vahingoittuneen DNA:n replikaatio voi johtaa kromosomien epäsäännnöllisyyteen, geenien monistumiseen (amplification) ja hukkaamiseen. CELL 1247

Duesberg (2007) Chromosomal chaos and cancer. Scientific American, May 2007 Duesberg löysi ensimmäisen onkogeenin (Rous' sarcoma viruksessa olleen) noin 1970 CELL 1254

CELL 1254 2006

Paradoksaalisesti, vioittunut p53 estää sädehoidon tehon

Virukset voivat aiheuttaa syöpiä muutenkin kuin kuljettamalla onkogeenejä, ehkä jopa 15 % kaikista Virus voi aktivoida solun replikaatiokoneiston ja ohittaa säätelyn hoidellakseen omaa lisääntymistään (DNA-virukset) Virus aiheuttaa solun proto-onkogeenin ylituotantoa istahtaessaa sopimattomaan kohtaan (Integroituvat retrot) Mutkikkaampiakin konsteja on

Kuinka DNA-virus voi aiheuttaa syöpää CELL 1248

CELL 1249

Erehdys, syövän aiheuttaakin herpes Kaposin sarkooma oli HIVepidemian paljastumisen ensimmäinen johtolanka

Onkogeenit Tuumorin supressorit

Syöpien vaikeus johtuu diversiteetistä: - lähtösolun tyyppi ratkaisee suurimman osan kasvaimen ominaisuuksista, solutyyppejä on yli 200 - jokainen tapaus voi olla hiukan erilainen, vaikka muutamia avaingeenejä onkin löydetty (onko 100 onkogeenia enää muutamia!) - solut ovat joka tapauksessa elimistön omia; siirrettynä toiseen kudostyyppiin ne kuolisivat - oma immuunisysteemi ei niitä tuhoa; yksi idea on sijoittaa niihin kavaltaja, joka ilmaisisi solut T-soluille

Evoluutio kehitti ihmisen kestämään tuollaiset 35 vuotta, naiset ehkä 50 (isoäitiefekti). Savanni on ankara paikka, aro vielä pahempi. Lisääntymisiän jälkeiset vaivat eivät evoluutiota häiritse, ainostaan jotkut monimutkaiset mallit sukulaisvalinnasta voisivat selittää pitkäikäisyysgeenien menestystä Sitä kauemmin se koneisto ei sitten oikein kunnolla kestäkään. Kuvitelma, että ihmiset voisivat vakiona elää esimerkiksi 120 vuotta on ns. kaupallista houkutuspuhetta. Sellaista voidetta ei ole eikä tule.

2006 Sopiva uusi kirja, jos haluat lukea kaiken