Lääketieteellinen kirjallisuus: MEDLINE-tietokannan käyttö

Samankaltaiset tiedostot
Lääketieteellinen kirjallisuus: MEDLINE-tietokannan käyttö

Lääketieteellinen kirjallisuus: MEDLINE-tietokannan käyttö

MEDLINEn hakuohjelma OvidSP

Ovid Medline käyttöohjeita (10/2010)

PubMed lääketieteellinen kokoteksti- ja viitetietokanta

Tietokanta löytyy kirjaston sähköisistä aineistoista ja NELLI-portaalin kautta.

PIKAOHJE Web of Science tietokantojen käyttöön

CINAHL(EBSCO) käyttöohjeita (10/2010)

Web of ScienceTM Core Collection (1987-present)

Lääketieteen tietokannat ja OVID

Aleksi ja ARTO artikkeliviitetietokannat

ProQuest Dissertations & Thesis: The Humanities and Social Sciences Collection

Hakuohjeet Haku Tiedonhaun tulokset

PubMed-opas. kesäkuu 2012

Aihe: Kannattaako korkeaa verenpainetta hoitaa ace-estäjillä? Löytyykö aiheesta näyttöön perustuvia tutkimuksia (EBM)?

Terveysportti: Lääkärin tietokannat WWW-muodossa

PubMed-opas. Itä-Suomen yliopiston kirjasto KYSin tieteellinen kirjasto helmikuu

Ebrary-palvelun e-kirjojen lukeminen selaimessa

Lappeenrannan tiedekirjasto Nelli-tiedonhakuportaalin käyttöopas

Tiedonlähteille NELLIn kautta -

Medical Subject Headings

TIEDONHAKU INTERNETISTÄ

Tiedonhaku: miten löytää näyttöön perustuva tieto massasta Leena Lodenius

Etsi aineistoa, uusi lainoja, tee varauksia. Onnistuneita hetkiä Juolukan parissa!

SportDiscus with Full Text -tietokannan hakuohjeet Anitta Pälvimäki

Nelli kaukopalvelutyössä

Dawsonera e-kirjaportaalin käyttöohje

Tiedonhaku Nelli-portaalissa

Chemical Abstracts - SciFinder Scholar

Tiedonhaku kliinisessä potilastyössä tietokannat lääkärin käytössä

NELLI PORTAALIN KÄYTTÖOPAS

Tarvitsetko kansainvälisiä tutkimuksia yhteiskuntatieteiden aloilta? klo 9:00-10:00 Maarit Putous & Tuula Rissanen

Porin tiedekirjasto ja TTY:n verkkoaineistot

Octo käyttöohje 1. Sisältö

MeSH-asiasanoitus ja NLM-luokitus

Lukkarikoneen käyttöohje

KiMeWebin käyttöohjeet

Monihaku ja sähköiset aineistot tutuksi. Jyväskylän kaupunginkirjaston tiedonhaun koulutus

Porin tiedekirjasto ja TTY:n verkkoaineistot

Uudet EU-asetukset. EUR-Lexin tarkennetun haun käyttöohje

TIEDONHANKINNAN PERUSTEET (1 op) harjoitus 2 (TaY Pori syksy 2014)

Ohje: Miten haen artikkeleita Aleksista

Tiedonhaku korkeakouluopinnoissa

TIEDONHANKINNAN PERUSTEET (1 op) harjoitus 1 (TaY Pori syksy 2014)

Toimittajaportaalin rekisteröityminen Toimittajaportaalin sisäänkirjautuminen Laskun luonti Liitteen lisääminen laskulle Asiakkaiden hallinta Uuden

CV-kannan käyttöohje 2017

Tietotekniikkaa lääketieteen opiskelijalle: TVT-ajokortti & tieteen tietolähteet 2014

1.1. Fysioterapiaan liittyviä hyllyluokkia Kuntokadun kirjastossa esim.

Opas administraattori-tason käyttäjille. MANAGERIX -ohjelman esittely... 2 Kirjautuminen... 2

Digi.kansalliskirjasto.fi:n käyttöohje

Lumme-verkkokirjaston tiedonhaun opas Pieksämäen kaupunginkirjasto

Toimittajaportaalin pikaohje

Tiedonhaku. Esim. kymenlaakso muutosjohtami* Laila Hirvisaari Tuntematon sotilas Ruksi tyhjentää hakukentän.

VERKKOVELHO-YLLÄPITOTYÖKALUN KÄYTTÖOHJE

Tietotekniikkaa lääketieteen opiskelijalle: TVT-ajokortti & tieteen tietolähteet 2015

Älykäs laskenta, diplomityöseminaari. Lappeenrannan Tiedekirjasto Iris Tahvanainen

Toimittajaportaalin pikaohje

HSE:n lehtihakuun on tarjolla HSE:n kirjaston Journals-portaali, os.

Tiedonhaku kliinisessä potilastyössä tietokannat lääkärin käytössä

Tervetuloa HK Shop:in käyttäjäksi!

Kirjastoinfo TuKKK Pori Porin tiedekirjasto

Send-It ilmoittautumisjärjestelmä (judotapahtumat Suomessa)

BioNordika Webshop Pikaohjeet

Miten SumSearch haku eroaa Terkon OVIDssa suoritetusta Medline-hausta?

RATKI 1.0 Käyttäjän ohje

Keravan karttapalvelun käyttöohje

UUDEN NETTIJÄSENREKISTERIN OHJEET. Kirjaudu sisään antamalla käyttäjätunnus ja salasana

Iltalehti Kauppalehti Aamulehti Lapin Kansa Satakunnan Kansa Kainuun Sanomat Pohjolan Sanomat

Kangasniemen yrityshakemisto KÄYTTÖOHJE YRITTÄJÄLLE. KANGASNIEMEN KUNTA yrityshakemisto.kangasniemi.fi

ejuttu ohjeet kuinka sitä käytetään.

Oppilaan opas. Visuaaliviestinnän Instituutti VVI Oy. Versio 0.2 ( )

KÄYTTÖOHJE. Sisällysluettelo. Huom! Tämä käyttöohje koskee seuraavia verkkokirjoja ja verkkopalveluja:

Moodle-oppimisympäristö

Tiedonhaku ja varaaminen

Pauliina Munter/Suvi Junes Tampereen yliopisto / Tietohallinto Valitse muokkaustila päälle kurssialueen etusivun oikean yläkulman painikkeesta.

Kuukauden kuvat kerhon galleriaan lähtien kuukaudenkuvaajan kuvagalleria on siirretty uudelle palvelimelle osoitteeseen:

aloita kirjautumalla Nelliin Diakin verkkotunnuksilla Diak kirjasto MF/2010 DIAKIN NELLI-PORTAALIN KÄYTTÖOHJE

Outlook Web Access 1(7) OUTLOOK WEB ACCESS (OWA) SÄHKÖPOSTIN KÄYTTÖ

Kun valitset Raportit, Lisää uusi, voit ryhtyä rakentamaan uutta raporttia alusta alkaen itse.

Fingridin säätösähkötarjousohje. Vaksin käyttöohjeet

Ohje internetkarttapalveluun

EBM-TIEDONLÄHTEITÄ JA SYSTEMAATTISESTA TIEDONHAUSTA. EBM-KURSSI terkko.helsinki.fi Terkko syksy 2018

DriveGate -ohjeet. DriveGate-käyttöohjeet: Rekisteröityminen palveluun. Rekisteröitymisohjeet ja rekisteröitymisprosessin kuvaus

KANSALAISOPISTON INTERNET-ILMOITTAUTUMISEN OHJEET TUNNUKSEN JA SALASANAN HANKKIMINEN

RefWorks (scienceport.tut.fi/newrefworks)

Vinkkejä musiikin tiedonhakuun OUTI-verkkokirjastossa

5. Sijainnin määrittäminen olemassa olevalle liikuntapaikalle

SMT / SUOMEN MATKATOIMISTO OY Y-TUNNUS / FO-NUMMER / BUSINESS ID

Automaster tai MBS. 2. ODBC - ajurin asennus (jos ei ole jo asennettu)

Avaa sovellus (PERUSAURORA)

SciFinder Web Version

Sisäänkirjaus Uloskirjaus. Yritystieto

TIMMI-TILAVARAUSOHJELMISTO

HAKU LASTU-VERKKOKIRJASTOSTA LASTU-verkkokirjastosta voi toistaiseksi hakea vain Lahden aineistotietokannasta.

Kirjastoinfo TaY Pori Porin tiedekirjasto

Työvälineohjelmistot KSAO Liiketalous 1

EVTEK-PROJEKTORI KÄYTTÖOHJE Tekijä: Teemu Tammivaara VBP04S

Hyperlinkin tekeminen artikkeliin

1. JOHDANTO Rekisteröityminen Henkilökohtaiset asetukset Salasanan muuttaminen ja uuden salasanan tilaaminen...

Toimiala Valmis toimiala listaus helpottaa hakua. Valitse toimiala ja hae tietoja.

Transkriptio:

Lääketieteellinen kirjallisuus: MEDLINE-tietokannan käyttö 010900 1. Johdanto Miksi tieteellisten tietokantojen käyttöä opetetaan? Käsitys lääketieteen opiskelusta saattaa aloittavalle opiskelijalle olla osin hämärä. Legendojen mukaan tentteihin päntätään ulkoa metrin korkuisia kirjapinkkoja. Ja tenttien välillä bailataan ankarasti ja lihaa säästämättä. Ehkäpä tämä osin pitääkin paikkansa... Mutta: lääketieteen opiskelemisen tavoitteena on myös ymmärtää tieteellisen ajattelun logiikkaa. Tähän tarvitaan tietolähteeksi (paksujen oppikirjojen lisäksi) koko lääketieteen tietomassa, joka on lisäksi tarpeellinen oman tutkielmasi laatimisessa ja oman lääketieteellisen erityisosaamisesi kehittämisessä. 2. Mikä on MEDLINEn perusidea ja missä sitä voin käyttää? A. Sen avulla voit suorittaa tiedonhakuja, jolloin lääketieteellisestä tietomassasta etsitään tiettyyn aiheeseen liittyvät tieteellisten artikkelien avaintiedot (varsinaiset artikkelikirjoitukset - etenkin muutamaa vuotta vanhemmat - joutuu usein erikseen hakemaan tieteellisistä kirjastoista). Medlinen sisältö on tieteellistä informaatiota ja on yleensä läpäissyt melkoisen tarkan seulan. Sen sisältämä informaatio on siis aivan erilaista verrattuna WWW:n tietosisältöön. B. Haku perustuu MeSH-hakutermeihin (kts. kohta 3.3), joiden avulla saalistetaan esille halutut artikkelit. C. Lääketieteen opiskelija pääsee käyttämään Medlinea parhaiten Terkko kirjaston web-palvelimen kautta, ohjeet käytöstä tämän Medline-ohjeen kohdassa 5. D. (1) Hakuistunnon aikana voit selata tulosjoukon artikkeleita ja poimia sieltä omaksi tiedostoksi tarpeelliset artikkelit (tulosjoukko sisältää väistämättä aina lukuisia turhia artikkeleita) TAI (2) hakusaaliin voi e-maililla lähettää omaan sähköpostiosoitteeseen, josta voi sitten tuloksen tulostaa paperille tarkempaa tarkastelua varten. 3. Käsitteitä 3.1. Mikä on Medline-tietokanta? Kyseessä on tietokanta, joka sisältää tietoa aihepiiriinsä kuuluvista miljoonista tekstidokumenteista, jotka kaikki on luokiteltu asiantuntijoiden toimesta niin että niistä voidaan suorittaa hakuehtojen mukaisia tietohakuja. Hakusaalis sisältää tiedot tieteellistä artikkeleista (jotka on julkaistu esim. jossakin tieteellisessä lehdessä). Haluttaessa löytää ajankohtaisia ja tuoreita tieteellisiä tietolähteitä koskien esim. jotakin lääketieteellistä kysymystä ensikädessä yleensä käytetään siis Medline-tietokantaa, joka sisältää tieteellisten artikkeleiden keskeiset bibliograafiset tiedot (kts. kohta 3.2). Tiedonhaku perustuu englanninkielisiin MeSH-avainsanoihin (kts. kohta 3.3). MeSH-hakusanoja voidaan käyttää nykyään myös Lääkärin CD-ROM hakuteoksessa.

3.2. Mitä ovat bibliograafiset tiedot Medlinessa? Medline-tietokantaan on jokaisesta tieteellisestä artikkelista tallennettu mm. seuraavat tiedot: ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1. Author(s) artikkelin kirjoitta(jat) 2. Title artikkelin nimi 3. Source julkaisusarja + lehden numero + artikkelin kattamat sivut julkaisusarjassa 4. MeSH indeksoidut hakusanat, jotka ohjaavat aiheenmukaiseen hakuun 5. Abstract artikkelin tiivistelmä ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 1. Authors Smith A.E, Roberts E.F. 2. Title Life events and depression among Taiwanese female homemakers. 3. Source Journal of Social Psychology. 135(2):185-90, 1995. 4. MeSH Subject Headings Depression/di [Diagnosis] *Depression/px Psychology] Human *Life Change Events Social Environment *Social Support MeSH-hakusanat, joilla artikkeli on luokiteltu, tähdellä merkityt hakusanat ovat ns. avainhakusanoja 5. Abstract 85 homemakers in a Taiwanese city were surveyed. Analysis indicated that age, life events, and social support were related to depression symptomatology. Younger homemakers reported more symptoms than others. Life events were related to depression. 3.3. Mitä ovat MeSH- hakusanat? MeSH = Medical subject headings (aihepiirin mukaiset hakusanat) MeSH-järjestelmä on asiasanasto, joka Yhdysvaltojen National Library of Medicinen järjestelmä lääketieteellisten hakusanojen systematisoinniksi. Sen avulla tietohakujen tekeminen onnistuu parhaalla mahdollisella kattavuudella. Medlinen artikkelien sisällönkuvailussa käytetään asiasanastoja. Tällaisella thesauruksella tarkoitetaan sanastoa, johon on valittu yksi termi käytettäväksi kaikista samaa asiaa tarkoittavista sanoista eli synonyymeista. Tällainen kontrolloitu sanasto helpottaa tiedonhakijaa siten, että hänen ei tarvitse hakea tietoa kaikilla mahdollisilla synonyymeilla. 3.3.1 MeSH-sanojen käyttö tieteellisten artikkeleiden luokittelussa Kunkin artikkelin perusteella laaditaan kirjallisuusviite Medline-tietokantaan, jonka ylläpitäjä National Library of Medicine (USA) hyväksyy artikkelin (kokousabstrakteja ei kelpuuteta mukaan), sen sisältö analysoidaan ja luettelosta valitaan siihen parhaiten sopivat MeSH-termit (asiasanat) kuvaamaan artikkelin keskeistä sisältöä. Artikkelin otsikon sanat kelpaavat harvoin, sillä joku syöpätutkija käyttää samaa cancer, toinen neoplasm, kolmas malignancy tai tumor tai tumour ja vielä yksikössä tai monikossa Asiasanat valitaankin tiettyjen sääntöjen mukaan mm. ruumiinosan, sairauden, fysiologian tms perusteella. Esimerkiksi jos artikkeli käsittelee lääketieteen opiskelun ensimmäistä vuotta, niin - sitä ei indeksoida EDUCATION termin alle, - eikä edes EDUCATION, MEDICAL termin alle, - vaan MeSH-asiasanaksi annetaan EDUCATION, MEDICAL, PRECLINICAL. Artikkelien indeksointimenettely riippuu siitä missä julkaisusarjassa jokin tietty artikkeli on ilmestynyt. Tutkimuspainotteisten lehtien artikkelien indeksointi on perusteellisempaa kuin käytännön lääketieteen lehtien aineiston. Mikäli hakua tehdessä asetat villin hakutermin (joka siis on lääketieteellinen termi, mutta ei MeSH termi) muuntaa OVID-haku sen automaattisesti sopivaksi MeSH termiksi. Tämän toiminnon käyttäminen tai käyttämättä jättäminen vaikuttaa suuresti hakutulokseen, joten valinnan tulee olla harkittu (tarkempia tietoja luvussa 6.6).

3.3.2 Artikkelin avainhakusanojen käyttö ( focusing ) Yksittäisessä artikkelissa jotkut käsitteet ja asiat ovat tärkeämpiä kuin toiset. Indeksoinnissa tämä otetaan huomioon MeSH-termeissä. Avainasemassa olevat artikkelien MeSH termit merkitään tähdellä (*). Kts. edellä Smith & Roberts esimerkkiartikkelin avainhakusanat ovat *Depression *Life Change Events *Social Support. Avainhakusanoja voi soveltaa myös Medline-hakuun, hakutermin eteen asetetaan tällöin tähti (*). Esimerkiksi *migreeni => Tällä hakutavalla saadaan migreeni termiin erityisesti kohdistuneet artikkelit, tosin samalla otetaan riski että jotkin merkitykselliset artikkelit rajautuvat pois hakusaaliista. 3.3.3 MeSH:in rakenne koostuu 15 pääotsikosta ja niiden alaotsikoista: A. Anatomy B. Organisms C. Diseases D. Chemicals and Drugs E. Analytical, Diagnostic and Therapeutic Techniques and Equipment F. Psychiatry and Psychology G. Biological Sciences H. Physical Sciences I. Anthropology, Education, Sociology and Social Phenomena J. Technology, Industry, Agriculture K. Humanities L. Information Science M. Named Groups N. Health Care Z. Geographicals Category C. Diseases C1. Bacterial and Fungal Diseases C2. Virus Diseases C3. Parasitic Diseases C4. Neoplasms C5. Musculoskeletal Diseases C6. Digestive System Diseases C7. Stomatognathic Diseases C8. Respiratory Tract Diseases C9. Otorhinolaryngologic Diseases C10. Nervous System Diseases C11. Eye Diseases C12. Urologic and Male Genital Diseases C13. Female Genital Diseases and Pregnancy Complications C14. Cardiovascular Diseases C15. Hemic and Lymphatic Diseases C16. Neonatal Diseases and Abnormalities C17. Skin and Connective Tissue Diseases C18. Nutritional and Metabolic Diseases C19. Endocrine Diseases C20. Immunologic Diseases C21. Injury, Occupational Dis, Poisoning C22. Animal Diseases C23. Symptoms and General Pathology

3.3.4 MeSHin pääluokka C. Diseases (sairaudet): sen rakenne pääotsikosta tasolta alemmalle siirtyen suolistokasvaimiin: Pääluokat Sairaudet Kasvaimet Kasvaimet sijainnin mukaan Ruoansulatuselimistön kasvaimet Ruoansulatuskanavan kasvaimet Suolistokasvaimet 3.4 Suolistokasvaimien rakennehierarkia eli puusto ( tree ). MeSH-järjestelmä luokittelee kasvaimet pääsääntöisesti sen sijainnin mukaan (intestinal neoplasm = suolistokasvain). (Huomaa: neoplasm tarkoittaa kasvainta, mutta vain osa kasvaimista on syöpiä, osa on sen sijaan varsin harmittomia limakalvon kyhmyjä tai näppylöitä). 3.5 Subheadings (alaotsikot) Kuhunkin MeSH-hakutermiin voi liittyä suuri joukko alaotsikoita. Näitä on erilaisia n. 60 kpl, esim. lääkehoito, leikkaushoito, patofysiologia (=tautioppi), ennaltaehkäisy, diagnostiikka, hoidon sivu- ja haittavaikutukset yms. MeSH-termeillä voisi hakea esim. peräsuolen kasvainten leikkaushoitoa ja sen haittavaikutuksia. Yllä olevan kuvan MeSH-termien suomennoksia: neoplasm = kasvain, cecal = umpisuolen, colonic = paksusuolen, duodenal = pohjukaissuolen, ileal/jejunal = ohutsuolen, rectal = peräsuolen, colorectal = paksusuolen+peräsuolen, sigmoid = vemmelsuolen (osa paksusuolta).

3.6 Miten perushaku ja laajennettu (exploded) haku eroavat toisistaan? Perushaku hakee tiettyä MeSH-termiä ja siihen mahdollisesti yhdistettyä alaotsikkoa (subheading), kuten paksunsuolen kasvaimet (colonic neoplasms) ja siihen kenties yhdistäen esimerkiksi alaotsikon ennaltaehkäisy (prevention). Exploded haku yhdistää hakutermiin siihen liittyvät alemman hierarkian hakutermit: 3.7 Mitä on haun fokusointi? (focus) Tällöin haku rajataan koskemaan artikkeleita, joissa kyseinen hakutermi on painotettu avainhakutermiksi. Avainsanahaku määritetään asettamalla hakusanan eteen * tai hakuohjelma (Terkon webbipalvelimessa OVID) asettaa sen automaattisesti kun käyttäjä toteuttaa haun focused tyyppisenä.

4. BOOLEN LOGIIKKA Haku tietokannasta perustuu Boolen logiikkaan, jossa MeSH hakutermien avulla suoritettujen hakujen tuloksia voidaan yhdistellä ja rajata loogisten operaattoreiden avulla, näitä ovat AND, OR sekä AND NOT. AND Tietohaku, jolla haetaan artikkeleita, joissa on aiheena haimasyöpä (pancreatic cancer) ja sen riskitekijät (risk factors). Pancreatic cancer AND Risk factors OR Tietohaku, jolla haetaan artikkeleita, joissa on aiheena joko yskänhillitsijänä käytetty lääkeaine kodeiini (codeine) tai samaan tarkoitukseen soveltuva dextrometorfaani (dextrometorphan) Codeine OR dextrometorphan AND NOT Tietohaku, jolla haetaan artikkeleita, joissa on aiheena vanha kiinalainen lääketiede (Ancient Chinese medicine) mutta poislukien akupunktio ja siihen liittyvä lääketiede (acupuncture). Ancient Chinese medicine AND NOT acupuncture

5. Medline-haku webin kautta Tietokanta löytyy Terkon (Terveystieteiden kirjaston) web-palvelimesta http://www.terkko.helsinki.fi/, josta mene Vertex linkin ja Ovid Web Gateway:n kautta IP-tarkistukseen, jolloin yliopistoverkossa ei tunnuksia tarvita (käyttäjätunnus on hystude ja salasana on proba5). Valitse sitten ilmaantuvassa valintaikkunassa koko Medline tietokanta käyttöösi (alkaen vuodesta 1966). 5.1 Medlinen hakuohjelma OVID ja sen päävalikon eräitä keskeisiä toimintoja Author = haku artikkelin kirjoittajan nimen perusteella Title = haku artikkelin otsikon perusteella Journal = haku tieteellisen julkaisusarjan perusteella Search fields =haku määritellystä tietokentästä, kuten artikkelin tiivistelmästä tai otsikosta tms. Tools=hakutermin laajennus, kavennus, MeSH-hierarkia Combine = hakujen yhdistely Change database= tietokannan vaihto Haku tapahtuu MeSH termien mukaisesti, sen merkkinä on rasti kohdassa Map Term.. Haku voidaan tehdä myös ilman tuota rastia tekstihakuna, jolloin haetaan artikkelien otsikoista tiettyä sanaa. Tällöin ei siis MeSH termi ole käytössä; tämä hakutapa sopii aivan uusiin termeihin, joille ei vielä ole MeSH luokitusta tehty (uusi lääke, hoitotoimenpide tms) mutta joita jo esiintyy tietokannassa. Aikarajausta voi käyttää myös kesken hakua, mutta vain supistaen hakua. Siis jos aluksi otat Medlinen tietokannan vuosilta 1994-98, voit kaventaa sitä vaikkapa vuoteen 1995. Vuosirajojen laajentamiseen käytä Change Database -toimintoa. Limit rajaustoimintoja: Full text Human Haku rajataan artikkeleihin joista on saatavissa koko artikkeliteksti (Terkosta) elektronisen lehden muodossa (siis ei pelkkää viitettä + tiivistelmää eli abstraktia) Rajaus ihmisiä koskeviin tutkimuksiin (Medline-haku tuottaa paljon myös eläin- ja biokemiallisia yms. tutkimuksia). English Rajaus englanninkielisiin artikkeleihin

Review Abstracts Rajaus yleiskatsausartikkeleihin Rajaus artikkeleihin, joissa on tiivistelmä (mielipide- yms. jutut jäävät pois).

6. Medline-hakujen suorttaminen: käyttöohjeita ja esimerkkejä 6.1 Etsitään kirjallisuutta peräsuolen sigmaosan kasvaimista ja niiden riskitekijöistä (ts. seikoista jotka altistavat henkilön sairastumaan ko. kasvaimeen). Ensitöiksi on pääteltävä mitä englanninkielisiä hakusanoja on käytettävä. Hakutermien MeSH luokituksen takaa, että haku on kattava. Käyttäjän antama hakutermi ei välttämättä ole MeSH luokiteltu, mutta OVID usein muuntaa termin sopivaksi automaattisesti. Suolistokasvain = intestinal neoplasm Riskitekijä = risk factor Hakutermi kirjoitetaan hakukenttään (kohdista hiiri kenttään ja paina hiiren vasenta nappia). Haku käynnistyy painamalla Perform search Focus rajauksella haku kaventuisi kohdistuen vain artikkeleihin joissa MeSH-hakutermi on tähdellä merkitty avaintermi.

6.2 Hakutermin alaotsikot ja niiden käyttö (subheadings) Hakua jatkettaessa tulevat esille hakutermin käytettävissä olevat alaotsikot (subheadings), joilla voisi rajata hakua. Käyttämällä vaihtoehtoa Include All Subheadings hakuun otetaan mukaan kaikki alaotsikkoryhmät. Tässä haussa kohteena ovat sairauden riskitekijät, hakua ei rajata mihinkään alaryhmään, jos sen sijaan haku kohdistettaisiin vaikkapa vain synnynnäisiin kasvaimiin, olisi subheading congenital syytä määritellä hakuehtona. 6.3 Haun suorittaminen Saaliiksi saadaan runsas 71000 viitettä saaliiksi. Sinistä Display -sanaa näpäyttämällä ruutuun saadaan näkyviin hakusaaliin ensimmäiset 10 kirjallisuusviitettä. Exp tarkoittaa, että hakutermiä laajennettiin kattamaan mahdollisimman kattavasti kaikki suolistokasvaimiin liittyvät viitteet. Huomautus: jos muilta osin samanlainen haku olisi rajattu focus komennolla vain keskeisiin viitteisiin, olisi saalis ollut noin neljänneksen pienempi.

MeSH-hierarkiassa sigman kasvaimet ovat alemmalla tasolla kuin suolistokasvaimet, johon sigma siis sisältyy. Tämän voi havaita myös tekemällä suoraan haku sigmoid neoplasm termillä. Haussa otetaan kaikki alaotsikot mukaan: Tulos: molemmilla tavoilla on hakusaalis sama, koska set 1 sisältää kaikki suolistokasvaimet, ja sen alahierarkiana set 2 jo sigman kasvaimet. Tässä ovat seuraavat hakutulokset, sigmoid neoplasm on alaryhmä hierarkian ylemmästä hakuaiheesta. Tämän osoittaa set 3 :ssa sama hakusaalis (2400) kun haetaan molemmilla ehdoilla yhtäaikaa. Set = yksittäinen haku numeroituu 6.4 Miten haku tarjoaa sopivia MeSHhakusanoja? Halutaan selvittää, mitkä seikat altistavat (tai ovat riski) sigman kasvaintautiin sairastumiseen. Haetaan sanalla risk, vielä ei ole tietoa onko se Medlinen virallinen hakutermi. Katso kelpuuttaako OVID sen suoraan hakutermiksi vai tuleeko tilalle jokin muu MeSH kelpoinen termi.

OVID tarjoaa risk hakutermille muitakin sopivia termejä, valitaan risk ja risk factors Risk sana on mahdollista ottaa myös ei-mesh hakusanana, jolloin sitä haetaan viitteiden otsikoista (title) ja tiivistelmästä (abstract) = Search as Keyword Tässä hakusaalis Sitten yhdistetään kaksi hakua, jotta saadaan saaliiksi ne viitteet, jotka täyttävät molemmat ehdot. Tämän haun voi tehdä AND ehtoa käyttäen Saalis on 56 artikkeliviitettä, niitä pääsee lukemaan Display komennolla. 6.5 Hakusaaliin tarkasteleminen Tutki saalista. Yhdestä ruudullisesta saalisartikkeleita pääsee seuraavaan painonapilla Next Citations. Saaliin artikkeleissa näyttää lukevan sinisellä Complete Reference, Abstract, tai Full Text. Tarkastele saalistasi ja selvitä mitä nuo termit tarkoittavat = > kirjaa vastaus tehtäväsivulle. 56 artikkeliviitteen hakusaaliin ensimmäinen ruudullinen näyttää seuraavalta: Artikkelin kirjoittajat (authors) Artikkelin otsikko (title) Bibliograafiset tiedot (julkaisusarjan nimi yms). Artikkelin abstrakti eli tiivistelmä: antaa tutkimuksen sisällöstä tietoa, joka on ymmärrettävissä myös ilman alkuperäistekstiä. Tiivistelmästä käy ilmi tutkimuksen tarkoitus ja kohde, tutkimusmenetelmät sekä tärkeimmät tutkimustulokset ja johtopäätökset. Esimerkki abstraktista kappaleessa 3.2.

6.6 Harhateille johtava hakutekniikka Jos käyttäjä suorittaa haun siten että jättää ruksaamatta kohdan Map to Subject Headings käyttää haku hakusanana käyttäjän antamaa sanaa ja tulos on harhaanjohtava. Vaara piilee siinä, että systeemi ei anna varoituksia, jos käyttäjä tekee tällaisen harhaanjohtavan haun. Esimerkiksi jos hakukohteena on sydäninfarkti ja hakuterminä käytetään suoraan englanniksi käännettyä ilmaisua heart infarct tai heart infarction eikä MeSH-mappausta käytetä (ruksi puuttuu) ovat tulokset hyvin erilaiset kuin samaa sanaa käyttäen MeSHsanaston kautta 1 Heart infarct, ei MeSH 2 Heart infarction, ei MeSH 3 Heart infarct mappautuu MeSH termiin Myocardial infarction 6.6.1 Milloin keyword haku on parhaimmillaan? Haettaessa aivan uutta käsitettä, jolla ei ole vielä Medline-termiä taas tulisi käyttää keyword-hakua kaikilla mahdollisilla synonyymeillä ja etenkin uusien lääkeaineiden osalta myös katkaisumerkkiä, jotta erilaiset sanamuodot tulisivat mukaan hakuun.

Eräitä ohjeita OVIDin käytön osalta web-selaimessa, esim. Netscapessa Liikkuminen eri hakuvaiheiden välillä (joskus joutuu menemään taaksepäinkin) sujuu näppärästi Netscapen Back (Taakse) ja Forward (Eteen) painikkeilla. Huomaa lisäksi Netscapen kätevä Go -toiminto, jolla saat esille luettelon OVIDin hakuvaiheista, jotka olet hetkeä aiemmin nähnyt ruudulla. Eteen ja taaksepäin liikkuminen sujuu selaisemessa myös näppärästi painikeyhdistelmillä: Taaksepäin Eteenpäin: Ota hiirellä auki valikosta Go, ruutuun tulee numeroitu luettelo läpikäymistäsi vaiheista. Vastaavaa numeroa painamalla pääset helposti kyseiseen näyttötilaan. Mene seuraavaksi luettelossa sivulle: OVID: Search Form, jotta tämä monisteen seuraavan sivun kokeilu sujuu helposti.

8. MEDLINE: Harjoitustehtävät Medline kattaa kansainväliset lääketieteelliset tietolähteet, joten suomenkielellä ei hakua ole mielekästä toteuttaa. Kunkin tehtävä osalta on tarjolla joitakin ideoita hakutermeiksi. Hakua suorittaessasi saat käsityksen, soveltuvatko ne MeSH termeinä käytettäviksi. Tehtävä 1. Hakusaaliin artikkeleissa näyttää lukevan sinisellä Complete Record/Reference, Abstract, tai Full Text. Tarkastele hakusaalista ja selvitä mitä nuo termit tarkoittavat: Complete reference = Abstract = Full Text = Tehtävä 2. Suorita Medline haku, jolla selvität missä määrin on alkaen vuodesta 1997 ilmestynyt tutkimuksia Alzheimerin taudin riskitekijöistä. Montako viitettä saat? Paljon saaliissa on yleiskatsausartikkeleita (review)? Hakuun soveltuvia hakusanoja: Alzheimer, risk factors Montako viitettä kaikkiaan löysit? kpl Entä jos rajaat hakua vain yleiskatsauksiin (review)? kpl Tehtävä 3. Olet saanut vinkin hyvästä artikkelista joka käsittelee veren kolesterolipitoisuuden alentamista sitostanolimargariinilla. Mutta bibliograafiset tiedot ovat kovin puutteelliset, juttu on kuulemma ilmestynyt vuonna 1995, yksi tutkijoista on nimeltään Miettinen T tai Miettinen TA, ja artikkeli on julkaisu New England Journal of Medicine nimisessä lehdessä. Tarvitset kiiruusti artikkelista ainakin abstraktin käsiisi, miten etenet? Löytämäsi artikkelin nimi ja bibliograafiset tiedot:

Miten saan hakusaaliin itselleni: Citation Manager Hakusaaliin tuottamien kirjallisuusviitteiden tarkastelun yhteydessä toimii OVIDin Citation Manager, jonka avulla voi sähköpostitse saada käyttöönsä hakusaaliin kokonaan tai valikoiduin osin. Hakusaaliista valitaan kiintoisat viitteet jo OVID istunnon aikana ja hyväksikatsotut viitteet postitetaan e-mailin avulla Terkon palvelimesta omaan sähköpostiosoitteeseen. Toisaalta voi lähettää koko hakusaaliin omaan sähköpostiosoitteeseen ja kaikessa rauhassa myöhemmin poimia sieltä tiedon kultajyvät esille. Viite valitaan tällä boxilla Citations Fields Citation Format Save Format Mitkä kaikki viitteet (=citation) postitetaan Mitä tietoa kustakin viitteestä postitetaan Missä muodossa tiedot postitetaan Mikä tiedostomuoto valitaan Paina E-mail ja seuraavaksi OVID kysyy sähköpostiosoittettasi

Automaattinen uutuusvalvonta Auto-Alert Medlinen voi automatisoida lähettämään tietokannan päivityksestä uusien artikkelien hakusaaliin omaan sähköpostiosoitteeseesi, näin voi siis tehdä uutuusvalvontaa mitä tuoreita artikkeleita on ilmestynyt aihepiiristä. Tee haku Medlinessa (tai muissa Vertexin tietokannoissa), esimerkiksi sanalla Alzheimer (joka mappautuu termiin Alzheimer disease). Koska alaotsikot (Subheadings) ovat mukana on explode siis hakuehtona mukana, tämä näkyy haussa exp koodina. Rajaa se lopuksi toiminnolla Latest Update ja suorita haku No2 (saalis supistuu 97%). Talleta hakuhistoriasi palvelimelle ns. SDI-hakuna (haku tallentuu sen käyttäjätunnuksen alle, jolla kirjoittaudit sisään Vertexiin). Klikkaa hakuhistorian alapuolella komentoa Save Search History. Esille tulee sivu Save Current Search: Täytä tarpeelliset tiedot lomakkeeseen: -Valitse as an AutoAlert (SDI) Service -Anna haulle nimi (aakkosia tai kirjaimia, ei erikoismerkkejä) -Täytä tarvittaessa kohta Comments -Laita e-mail osoitteesi sille varattuun kohtaan (Recipient s Email Address) -Vaihda halutessasi viestin otsikko (Email Subject) Kun tietokanta päivitetään seuraavan kerran SDImuodossa talletetun haut tehdään automaattisesti ja hakutuloksena saadut viitteet lähettyvät emailosoitteeseen. Automaattisen haun poistaminen: Kirjoittaudu Vertex-palveluun samalla tunnuksella jolla talletit hakusi. Valitse haluamasi tietokanta Klikkaa Run Saved Search, sijaitsee ruudussa hakuhistorian alapuolella Saat esille sivun jossa ovat kaikki ne haut jotka on talletettu kyseisellä käyttäjätunnuksella (kymmeniä tai satoja kpl, aakkostettuna eri ryhmissä hakuehdoista riippuen). Valitse oma hakusi ja valitse haluamasi toiminto (Delete saved search). Älä poista vahingossa muiden laatimia hakuja!

Lisätoimintoja: Medline-haku dokumentin yksittäisestä kentistä Mene Medlinen perusvalikkoon ja sieltä edelleen toimintoon Search Fields. Sieltä voidaan suorittaa tietohaku, joka kohdistuu artikkeleiden tiettyyn kenttään (=field), esimerkiksi artikkelin otsikko (title) tai tiivistelmä (abstract). Tämä on sangen käyttökelpoinen toiminto, kun haettava artikkeli on mielessäsi vain hämäränä muistikuvana. (Hmm... oliko kirjoittaja (author) joku G. Ferrari.olikos sen artikkelin nimi (title) oli jotakin Crazy behavior of medical students... ). Tutustu eri Search Fields-rajausvaihtoehtoihin, joita on lukuisia. OVIDin perusvalikon Tools-toiminto myös mahdollistaa hakutoiminnon nopean rajauksen. MeSH hierarkia Ko. hakusanan esiintyminen eri hakuaiheissa Luokittelukriteerit Alaotsikot

Tools -valikosta voi myös tarkistaa, miten hakutermi luokitellaan MeSH-hierarkiassa (Tree eli puusto ). Esimerkiksi jos haluat katsoa mitä haku sisältää termillä Euthanasia, Passive => saat näytttö taulukon Subheadings for: Euthanasia, Passive, jossa näkyy eri alaotsikoiden sisältämien viitteiden lukumäärä.

TUOREIMPIEN TIETEELLISTEN HAVAINTOJEN SEURAAMINEN: CURRENT CONTENTS -HAKUJÄRJESTELMÄ (CC) Lääketieteen piirissä viikottain ilmestyy tuhansia uusia tieteellisiä artikkeleita sadoissa eri julkaisusarjoissa. Current Contents on erityisen sopiva tämän ilmestyvän kirjallisuuden seurantaan eli uutuusvalvontaan. CC tietopaketti ilmestyy joka viikko ja sen sisältämä materiaali on siis tuoreinta mahdollista. Artikkelin tiedothan kertyvät Medline-tietokantaan vasta pitkähkön viiven kuluessa. CC hakujen toistuva suorittaminen on oleellista, jotta hyöty olisi paras mahdollinen. CC ei hae tiedelehtien tietokantojen ulkopuolelta, se ei siis kohdistu lainkaan www-aineistoihin. CC sisältää pääasiassa englanninkielisten lääketieteellisten aikakauslehtien sisällysluetteloita sekä jonkin verran tietoja em. alojen uutuuskirjoista. CC:iin on usein sisällytetty abstrakti (= lyhyt tiivistelmä, 100-200 sanaa) artikkelista, joten siten saa pikaisesti käsityksen artikkelin kiinnostavuudesta. CC mahdollistaa yhteydenoton kirjeitse sinua kiinnostavan artikkelin kirjoittajaan, jota varten CCOD tulostaa halutessasi valmiin kirjeen, jolla voi pyytää eripainosta po. artikkelista, jonka siten saa postitse itselleen (sen sijaan, että laukkaa kirjastosta toiseen etsimässä ko. artikkelin julkaissutta lehtisarjaa). Mitkä ovat Current Contentsin perusperiaatteet: 1. Sen avulla voit suorittaa tietohaun, jolloin lääketieteellisestä tietokannasta etsitään tiettyyn aiheeseen liittyvät tieteelliset artikkelit, jotka ovat ilmestyneet edellisellä viikolla. 2. CC käsittää useita tietokantoja, mm. Life Science (biolääketiede ja lääketieteelliset perustieteet) Clinical Science (tautien diagnostiikka ja hoito), myös muita tietokantoja julkaistaan. 3. Haku perustuu hakusanoihin, joiden avulla poimitaan tulosjoukoksi (CC:ssä esillä nimikkeellä SET tai Search Result) kriteerit täyttävät artikkelit. Huomaa, että CC ei perustu MeSH-termeihin! Hakusanoja haetaan artikkeleista, ja niitä ei ole indeksoitu asiantuntijoiden toimesta. Ne ovat vain sanoja, joiden esiintymistä haku selvittää. Sanojen haku kohdistuu artikkeleiden otsikkoon (title), tiivistelmään (abstract) tai artikkelin kirjoittajan (tutkijan) laatijan määrittämiin avainsanoihin (keywords) 4. CC:n avulla voi selata tulosjoukon artikkeleita ja poimia sieltä omaksi tiedostoksi tarpeelliset artikkelit (tulosjoukko sisältää väistämättä aina lukuisia turhia artikkeleita).

CC-haku Uutuusvalvonta tulee rajoittaa yhteen tai muutamaan viikkoon. CC on parhaimmillaan, kun sitä käytetään toistuvasti ja uusimpiin viikkoihin keskittyen. 1. Ohjelman käynnistys tapahtuu samalla tavalla kuten Medline. 2. Haun rajaus ajallisesti, CC sisältää siis 12 kk:n tieteelliset julkaisut. Yksi viikko sisältää n. 5000 artikkelia. Jotta voi hakea uusinta tietoa viimeisen viikon ajalta, on haku rajattava laittamalla ruksi kohtaan Latest Update tämä rajaa haun koskemaan viimeisintä tietokantaan lisättyä artikkeleiden viikkokertymää. 3. Haun toteuttaminen Alla on haku toteutettu sanalla Blood ja rajaus on suoritettu viimeisimpään viikkoon.