MEDLINEn hakuohjelma OvidSP

Transkriptio

1 MEDLINEn hakuohjelma OvidSP Terkon Ovid- tietokannat Terkon kautta käytettävissä on laaja valikoima erilisia tietokantoja Vertex -palvelimella. Yliopistoverkosta pääsee järjestelmään ilman tunnuksia, kotoa käsin tulee käyttää joko ns. erillistä opiskelijatunnusta ja salasanaa tai Nelliportaalia > lisensoidut aineistot. Opiskelijatunnus lukuvuonna on helsu02 ja salasana on ra75we On syytä huomata että MEDLINEstä on tarjolla kaksi eri versiota, kts kuva alla. Kun suoritetaan perushakua koko Medline tietokannasta, tulee ottaa käyttöön laajin versio. Mikäli haetaan aivan uusia artikkeleita, valitaan aineisto joka on uusinta ja osittain indeksoimatonta (MeSH-termit puuttuvat) ja näin ollen hakusanoina käytetäänkin vain tekstisanoja (in-process - tietokannat) Tietokannan valintaikkuna avautuu kun Vertex-palvelimelle kirjaudutaan, ohessa yleisimmin käytetyt tietokannat: Perushaku indeksoidusta MEDLINEsta "in-process: viitteiden " MeSH-indeksointia ei ole vielä tehty tietokannan artikkeleista. Kannattaa käyttää kun hakee viitteitä jotka ovat hyvin tuoreita ja eivät todennäköisesti vielä ole indeksoidussa muodossa MEDLINEssa 14

2 OvidSP ja sen päävalikon eräitä keskeisiä toimintoja Haku voidaan tehdä Advanced Search muodossa (oletusarvo), jolloin käytetään MeSHtermejä ja yleistä hakusyntaksia (hakuehtoja määrittäviä komentoja). Author = Title = Journal = Keyword = haku artikkelin kirjoittajan nimen perusteella haku artikkelin otsikon perusteella haku tieteellisen julkaisusarjan perusteella haku hakusanalla, joka joko tekstisana tai MeSH-asiasana (kun ruksivalinta kuten kuvassa alla) Limits -linkistä avautuu pikavalikko hakurajauksia varten: Haku tapahtuu MeSH asiasanojen mukaisesti, sen merkkinä on rasti kohdassa Map Term.. Haku voidaan tehdä myös ilman tuota rastia tekstihakuna, jolloin haetaan artikkelien otsikoista tiettyä sanaa. Tällöin ei siis MeSH asiasanat eivät ole käytössä; tämä hakutapa sopii aivan uusiin termeihin, joille ei vielä ole MeSH luokitusta tehty mutta joita jo esiintyy tietokannassa. Tools=hakutermin laajennus, Pikavalikon rajauksia: Full text -haku rajataan artikkeleihin joista on saatavissa koko artikkeliteksti (Terkosta) elektronisen lehden muodossa (siis ei pelkkää viitettä + tiivistelmää eli abstraktia) Humans -rajaus ihmisiä koskeviin tutkimuksiin (MEDLINE-haku tuottaa paljon myös eläin- ja biokemiallisia yms. tutkimuksia). English language -rajaus englanninkielisiin artikkeleihin Review Articles - rajaus yleiskatsausartikkeleihin Abstracts - rajaus artikkeleihin, joissa on tiivistelmä (mielipide- yms. jutut jäävät pois) Latest Update -tuoreimmat lisäykset MEDLINEen Core Clinical Journals - haun rajaus n. 120 keskeiseen kliiniseen julkaisusarjaan (AIM) 15

3 Additional Limits -edellisen kuvan alareunassa oleva painike avaa usean valintakentän ikkunan: Samasta valintaruudusta voi useita valintoja ottaa käyttöön pitämällä samalla CTRL-näppäin pohjassa Valintaruutujen yläpuolella ovat jo toteutetut hakusetit, käyttäjän tulee määrittää (select) mihin niistä asetetut rajaukset kohdistetaan 16

4 Medline-hakujen suorittaminen: käyttöohjeita ja esimerkkejä Etsitään kirjallisuutta peräsuolen sigmaosan kasvaimista ja niiden riskitekijöistä (ts. seikoista jotka altistavat henkilön sairastumaan ko. kasvaimeen). Ensitöiksi on pääteltävä mitä englanninkielisiä hakusanoja on käytettävä. MeSH-asiasanojen käytöllä voidaan varmistaa, että haku kattaa eri synonyymit yms. Käyttäjän antama hakutermi ei välttämättä ole MeSH asiasana, mutta OVID useimmiten listaa esille siihen todennäköisesti liittyvät asiasanat (ns mapping), joista käyttäjä valitsee yhden tai useamman. Suolistokasvain = intestinal neoplasm Kuvassa alla OVID ehdottaa MeSH-sanastosta löytyviä esittämääsi hakutermiin liittyviä/soveltuvia asiasanoja, joista voi valita yhden tai useamman. Tässä tapauksessa tulee tarjolle vain kaksi; (1) käytetty asiasana, joka on myös varsinainen MeSH-asiasana ja myös tarjotaan (2) kyseisen hakutermin käyttö tekstisanana: "intestinal neoplasm.mp. search as Keyword" Autoexplode valinnalla (poista oletusarvoinen ruksi) voi estää explode toiminnon. Focus mahdollistaa haun kohdistamisen avainhakuna. Scope kuvakkeesta voi lukea asiasanan taustatiedot. Search as Keyword tarkoittaa sitä, että haku toteutuu pelkkänä tekstihakuna (Ei MeSH-asiasanan käyttöä) Tämä vaihtoehto on haussa mukana MeSH-listan viimeisenä, OWGn automaattisesti asettamana. Hakutermin alaotsikot ja niiden käyttö (subheadings) Jos ei oteta valintaa "Include all subheadings" tulevat esille hakutermin käytettävissä olevat alaotsikot (subheadings), joilla voisi rajata hakua. Tässä haussa kohteena ovat sairauden riskitekijät, hakua ei rajata mihinkään alaryhmään, jos sen sijaan haku kohdistettaisiin vaikkapa vain synnynnäisiin kasvaimiin, olisi subheading congenital* syytä määritellä hakuehtona. *synnynnäinen, kongenitaalinen 17

5 Haun suorittaminen Saaliiksi saadaan viitettä.. Display - sanaa näpäyttämällä ruutuun saadaan näkyviin hakusaaliin ensimmäiset 10 kirjallisuusviitettä. Hakutermin edessä näkyvä Exp tarkoittaa, että hakutermiä laajennettiin kattamaan mahdollisimman kattavasti kaikki suolistokasvaimiin liittyvät viitteet (explode). Huomautus: jos muilta osin samanlainen haku olisi rajattu focus komennolla vain keskeisiin viitteisiin, olisi saalis ollut noin neljänneksen pienempi. Tällöin hakutermi näkyisi ruudussa muodossa exp *Intestinal Neoplasms (tähti on focus:n symboli) Mitä jos hakusana onkin yhdistettävissä useisiin erilaisiin MeSH-termeihin? Jos käyttämäsi hakusana "mappautuu" OWGssa moniin eri MeSH-.asiasanoihin, tulevat ne kaikki listana näkyviin. Esimerkiksi hakusana anemia tuottaa listan erilaisia anemiaan liittyviä MeSH-asiasanoja valittavaksi. Niistä voi valita yhden tai useampia samalla kun voi määrittää käytetäänkö Explode ja/tai Focus toimintoja Scope: tästä saa esille ko. MeSH-termin määritelmän Miten OVID- haku tarjoaa sopivia MeSH-hakusanoja? Mapping Tehdään haku jossa halutaan selvittää, mitkä seikat altistavat (tai ovat riskitekijä) sigman kasvaimien suhteen. Haetaan hakusanalla risk, ja saadaan lista siihen OVIDissa liitetyistä MeSH-asiasanoista. Alunperin siis ei ole tietoa onko risk MEDLINEn vakiintunut hakutermi. Oheisessa kuvassa näkyy että se löytyy MeSH-asiasanana, lisäksi tarjolla on monia muita risk käsitteeseen liittyviä MeSH-asasanoja. Ruksivalinnalla voidaan hakuehtoon ottaa yksi tai useampia tarjolla olevista. 18

6 Valitaan riskiä kuvaaviksi asiasanoiksi risk ja risk factors Tämän haun voi tehdä AND ehtoa käyttäen kirjoittamalla hakukentään suoraan "4 AND1 " tai käyttämällä hakutoiminto Combine Kuvassa yllä hakusaaliis eri vaiheissa, kukin vaihe on oma "setttinsä". Set #4 haetaan riskitekijöitä yhdistämällä kaksi lähekkäistä MeSH-asiasanaa samaan hakuun Set #5:ssä yhdistetään kaksi hakua, jotta saadaan saaliiksi ne viitteet, jotka täyttävät molemmat ehdot. Osassa viitteistä ei ole saatavilla kokotekstiä, joten artikkelin teksti on hankittava muulla tavalla (lehti voi tulla suoraan hyllyyn johonkin kirjastoon tms.) Find Citing hakee OVID-Journals tietokannasta tähän viittaavat artikkelit. Kattavuus on suppeampi kuin varsinaisessa sitaatiotietokannassa Complete reference: viitteet keskeiset tiedot Find Similar hakee artikkeleita joissa esiintyy samoja sanoja ja niiden synonyymejä otsikossa (title) Käytä näiden Full Text linkkien sijaan HY-linkityspalvelua! HY:n linkityspalvelu: avaa artikkeli kokotekstinä 19

7 Hakusaaliin tarkasteleminen: artikkelin linkit Complete reference (Ovid) Full Text Full Text* - HTML Full Text* Links -artikkelin täydelliset bibliografiset tiedot (mm. MeSH-sanat) tiivistelmä (abstrakti) -vie artikkelin kokotekstiin Ovid-tietokannassa -vie artikkelin kokotekstiin Ovidin ulkopuolelle, esim. sarjan julkaisijan www-sivulle, jossa artikkeli PDF-muodossa -osa kokoteksteistä on vain HTML -muodossa -tämän kautta voi tarkistaa esim löytyykö Helka-tietokannasta viitteessä oleva lehti HY:n kirjastojen kokoelmista Terkko External Link - tämän takaa löytyvät mm. linkit: Medic, PubMed Related Articles, PubMed Books Harhateille johtava hakutekniikka Jos käyttäjä suorittaa haun siten että jättää ruksaamatta kohdan Map to Subject Headings käyttää haku hakusanana käyttäjän antamaa sanaa ja tulos on harhaanjohtava. Vaara piilee siinä, että systeemi ei anna varoituksia, jos käyttäjä tekee tällaisen harhaanjohtavan haun. Kattavin hakutekniikka on sellainen että haku tehdään sekä MeSH -hakusanana että myös tekstisanana, jonka voi vielä tarvittaessa katkaista sanakatakaisulla - tähän käytetään jokerimerkkinä $ merkkiä - esimerkiksi intesti$ Esimerkiksi jos hakukohteena on sydäninfarkti ja hakuterminä käytetään suoraan englanniksi käännettyä ilmaisua heart infarct tai heart infarction eikä MeSH-mappausta käytetä (ruksi puuttuu) ovat tulokset hyvin erilaiset kuin samaa sanaa käyttäen MeSH-sanaston kautta 478 vs hakuosumaa Milloin keyword haku on parhaimmillaan? Haettaessa aivan uutta käsitettä, jolla ei ole vielä Medline-termiä MeSH-hakusanana tulisi käyttää keyword-hakua kaikilla mahdollisilla synonyymeillä ja etenkin uusien lääkeaineiden osalta myös käyttäen katkaisumerkkiä, jotta erilaiset sanamuodot tulisivat mukaan hakuun. *Full Text linkkien sijaan kannattaa käyttää HY:n linkityspalvelua, kts s

8 Hakujen kehittyneempi rajaaminen: Limit Haettaessa voidaan perusnäkymän alareunan pikarajausten (Limits) sijaan käyttää monipuolista rajausta, joka löytyy kuvakkeesta More Limits Clinical Queries vastaava toiminto kuin PubMed: kliinisen kysymyksen kohdentaminen: etiologia, hoito, diagnoosi, prognoosi Samasta valintaruudusta voi useita valintoja ottaa käyttöön pitämällä samalla CTRL-näppäin pohjassa Näistä voidaan yhdestä tai useammasta pudotusvalikosta määrittää hakuehtojen yhdistelmä. Esimerkiksi rajaus englanninkielisiin, yli 65-vuotiaisiinn kohdistuneisiin RCT* -tutkimuksiin jotka on julkaistu bioetiikan julkaisusarjaryhmässä. * RCT = randomized controlled trial 21

9 Miten saan hakusaaliin itselleni? Hakusaaliin tuottamien kirjallisuusviitteiden tarkastelun yhteydessä on toiminnot, joiden avulla voi sähköpostitse saada käyttöönsä hakusaaliin kokonaan tai valikoiduin osin. Hakusaaliista valitaan kiintoisat viitteet jo istunnon aikana ja hyväksikatsotut viitteet postitetaan in avulla Terkon palvelimesta omaan sähköpostiosoitteeseen. Toisaalta voi lähettää koko hakusaaliin omaan sähköpostiosoitteeseen ja kaikessa rauhassa myöhemmin poimia sieltä tiedon kultajyvät esille. Artikkelien maksullinen tilauspalvelu Tulokset itselle mailina Haluttujen artikkelien valinta Paperitulostus Tulosten siirto mm. viitteidenhallintaohjelmaan (RefWorks) 22