Eläinmuseo, TY. Taksonomian ja systematiikan opetus Turun yliopistossa

Transkriptio

1 Turun digitoinnit ja biodiversiteetti- informatiikan opetus Ilari E. Sääksjärvi, Eläinmuseo, TY 1

2 Turun yliopiston luonnontieteelliset museot Eläinmuseo, Kasvimuseo, Kasvitieteellinen puutarha Biodiversiteetti- ja ympäristötieteen osasto (Biologian laitos) Taksonomian oppiaine vuoteen 1999 asti Tutkimus, opetus, yhteiskunnallinen vuorovaikutus Kasvimuseo, TY Yli miljoona tieteellistä näytettä ttä (putkilokasvit k it noin 50%); + Åbo Akademin kasvikokoelma Edward August Vainion jäkäläkokoelma (yli näytettä, 4000 tyyppinäytettä) t ttä) Sienisystematiikka, trooppinen kasvitiede, kasvimakrofossiilit 2

3 Eläinmuseo, TY Noin 3,5 miljoonaa näytettä; + Åbo Akademin eläinkokoelma; + opintokokoelma Historiallisesti arvokkaita hyönteiskokoelmia (mm. Sahlbergit, Montell, Forsius); laajat munakokoelmat Hämähäkkieläimet, maaperäeläimet, trooppinen hyönteistiede, Suomen luteet, pistiäiset, perhoset, kaksisiipiset Taksonomian ja systematiikan opetus Turun yliopistossa Museot osana Biologian laitosta (+ mielenkiinto opetusta kohtaan) Osastojen välinen yhteistyö y vahvassa nousussa (Biodiversiteetti, Ekologia, Genetiikka) Uusia taksonomian ja systematiikan tutkimushankkeita (mm. Wahlberg, Lehtonen, Tuomisto, Sääksjärvi) Taksonomisen tutkimustyön peruskurssi (Sääksjärvi, Tuomisto); Taksonomian ja systematiikan opintopiiri (Lehtonen, Sääksjärvi); Molekyylisystematiikka (Wahlberg); Biodiversiteetti-informatiikka (Tuomisto, Ruokolainen); Eläinkunnan fylogenia (Sääksjärvi); Kasvikunnan fylogenia (Tuomisto); Sienisystematiikan työpaja (Huhtinen) Tukevat kurssit (Huhtinen, Sääksjärvi, Penttinen, Koponen, Ruokolainen): perus- ja jatkotuntemuskurssit, eläinmorfologia, kasviorganologia, sienimikroskopia Paljon erikoiskursseja (museot): esim. punkkikurssi, muurahaiskurssi, hämähäkkieläinkurssi, (merinilviäiskurssi, pistiäiskurssi) Taksonomian ja systematiikan harjoitusprojektit (mm. maaperäpunkit, trooppiset loispistiäiset) 3

4 Biodiversiteetti-informatiikka EKOL3135 Biodiversity Informatics 2 ECTS Tuomisto, Ruokolainen Introduction to the tools, procedures and analysis techniques developed for handling large amounts of information on species. Lectures on informatics tools, metadata, data sharing and the use of museum and observational data bases in research. Practicals on data base design and species distribution modelling. Viime vuosien graduaiheita osastolla mm. biodiversiteettitiedon repatriaatio, tutkimusluvat (keräysja maastavientiluvat), parataksonomia, tyyppitietokannat normaalien taksonomisten ja systemaattisten aiheiden rinnalla Digiprojektin tavoitteet Turussa Eläinmuseon tyyppinäytteet (+ÅA) tyyppinäytteet (+ÅA) Edward August Vainion jäkäläkokoelma (tyypit) Eläinmuseon historiallisesti merkittävät kokoelmat ja kladikirjat (mm. Sahlberg, Forsius) Kasvimuseon putkilokasvit 4

5 Digiprojektin edistyminen Turussa 6 tutkimusteknikkoa Eläinmuseo: Puhakka (7kk), Elo (5kk), Salmela (7kk) Kasvimuseo: Toivonen (7kk), Rantanen (7kk), Llerena (2kk) hyvä tiimi Projekti alkoi virallisesti lokakuun alussa Laitteistot kuntoon Jatkorahoitus? Tavoite: korkealaatuinen aineisto (Turun museot yhtenä kokonaisuutena) 5

6 Kasvimuseon tulokset Vainion tyyppiluettelo (500 s.) skannattu ja korjattu odottaa pilkkomista tietokannaksi, jonka jälkeen Vainion tyyppinäytteet ovat valmiina nettikäyttöä varten Kerroskuvauslaitteisto valmiina (kymmeniä tyyppinäytteitä kuvattu) Putkilokasvinäytteiden tallennusta jatkettu Eläinmuseon tulokset Yli 200 tyyppinäytettä kerroskuvattu (5-7 kerroskuvaa / yksilö) + etiketit skannattu (+tulkittu) Historiallisesti merkittävien kladikirjojen skannaus edistyy (mm. Sahlbergit, Forsius, Montell) 6

7 5-7 kerroskuvaa / yksilö (korkea resoluutio; julkaisukelpoisia) Eliöryhmäkohtaiset kuvakulmat 7

8 8

9 9