Kehitysbiologiassa käytetään lukuisia viekkaita kuvantamismenetelmiä

Samankaltaiset tiedostot
Genetiikan perusteiden harjoitustyöt

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

Geenitekniikan perusmenetelmät

Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1

DNA > RNA > Proteiinit

Kromosomit. 1. Mitoosipreparaatti sipulin juurenkärjestä. 2. Drosophilan sylkirauhaskromosomi. monisteen sivulta 32-

epiteeli endodermi Nisäkkään hampaan kehitys nisäkkään alkio:

Genomin ilmentyminen

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia

Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma

Genetiikan perusteiden toisen jakson kaavailua

1. STEREOKUVAPARIN OTTAMINEN ANAGLYFIKUVIA VARTEN. Hyvien stereokuvien ottaminen edellyttää kahden perusasian ymmärtämistä.

Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL Juha Partanen

Miten letaalialleeleita käsitellään Drosophilalla? Välttämätön taito esimerkiksi alkionkehityksen alkuvaiheiden selvittämisessä

In Situ Hybridisaatio - menetelmä patologian laboratorion työvälineenä

"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13

ELAHEH MORADI ARABINOOSIPROMOOTTORIN TRANSKRIPTIODYNAMIIKKA KOLIBAKTEERISSA. Kandidaatintyö

DNA:n informaation kulku, koostumus

Ekologiset ympäristöongelmat. 10. Geeniteknologia. BI5 II Geeniteknologia 4. Geenitekniikan perusmenetelmiä

ALKIODIAGNOSTIIK KA ANN-MARIE NORDSTRÖM

Diagrammeja ja tunnuslukuja luokkani oppilaista

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

GMO analytiikka Annikki Welling Kemian tutkimusyksikkö Evira

Käänteistransfektio primäärisiin hermosoluihin

9/30/2013. GMO analytiikka. Termistöä. Markkinoilla olevien GM kasvien ominaisuuksia

a. Mustan ja lyhytkarvaisen yksilön? b. Valkean ja pitkäkarvaisen yksilön? Perustele risteytyskaavion avulla.

MAIDON PROTEIININ MÄÄRÄN SELVITTÄMINEN (OSA 1)

VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki

Väärin, Downin oireyhtymä johtuu ylimääräisestä kromosomista n.21 (trisomia) Geeni s. 93.

E. colin auksotrofiset mutantit

Biologian tehtävien vastaukset ja selitykset

Ma > GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING

Peptidi ---- F K V R H A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit

T Digitaalinen signaalinkäsittely ja suodatus Tutkielma Signaalinkäsittely DNA-mikrosiruteknologiassa

Ribosomit 1. Ribosomit 2. Ribosomit 3

Toisessa osassa ryhdymme tarkastelemaan sitä, mitä geenit ovat, miten ne toimivat ja miten ne tuottavat meille tuttuja elämänilmiöitä

ROMUMETALLIA OSTAMASSA (OSA 1)

INDUKTIIVISEN PÄÄTTELYN HARJOITUSPAKETTI TOISELLE LUOKALLE

NON-CODING RNA (ncrna)

6.4. Genomin koon evoluutio Genomin koko vaihtelee

Solun tuman rakenne ja toiminta. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2012

Genomi- ilmentymisen säätely

muistijärjestelmä Ympäröivä aisti-informaatio Tiedon valikoiminen tarkkaavaisuuden avulla taustatietoa muistista MUISTI 7

Biokemian menetelmät I kurssi, työselostukset, kevät 2016.

kappaleiden ominaisuuksien ja suhteiden vertailuun Kognitiivinen taso: IR: Ominaisuuksien ja suhteiden vertailu Tavoiteltava toiminta:

Metsäpatologian laboratorio tuhotutkimuksen apuna. Metsätaimitarhapäivät Anne Uimari

INDUKTIIVISEN PÄÄTTELYN HARJOITUSPAKETTI ENSIMMÄISELLE LUOKALLE

Geeninsiirron peruskäsitteet

ARVO - verkkomateriaalien arviointiin


Laura Peltonen & Juho Tervonen E-KADHERIININ ILMENTYMISEN HAVAINNOINTI EUKARYOOTTISOLUISSA FLUORESOIVAN REPORTTERIN AVULLA

Oligonukleotidi-lääkevalmisteet ja niiden turvallisuuden tutkiminen - Sic!

VÄRI ON: Fysiikkaa: valon osatekijä (syntyy valosta, yhdistyy valoon)

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi


Mikrosirut ja niiden data-analyysi

Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio

Determinantti. Määritelmä

focus PATOLOGIA Immunohistokemia Tissue Micro Array Biopankit Molekyylibiologia

Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna

MIKRO-RNA -MOLEKYYLIEN KOHDELÄHETTI-RNA - VAIKUTUSTEN TODENTAMINEN FLUORESENSSI- REPORTTERILLA

Gimp alkeet XIII 9 luokan ATK-työt/HaJa Sivu 1 / 8. Tasot ja kanavat. Jynkänlahden koulu. Yleistä

Tärkeimpien solutyyppien tunnistaminen kudosleikkeissä immunohistokemiallisilla värjäyksillä

Molekyylibiologian perusmenetelmät

Molekyylibiologian perusmenetelmät P Biokemian menetelmät I Juha Kerätär / BMTK

Farmasian tutkimuksen tulevaisuuden näkymiä. Arto Urtti Lääketutkimuksen keskus Farmasian tiedekunta Helsingin yliopisto

I.Thesleff: Hampaan kehitys ja sen säätely

Lääketieteellisen tiedekunnan uudistuneet biolääketieteen koulutusvaihtoehdot

Nimi sosiaaliturvatunnus. Vastaa lyhyesti, selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Elämän synty. Matti Leisola

Perinnöllisyyden perusteita

Anatomia ja fysiologia 1 Peruselintoiminnat

- Jakautuvat kahteen selvästi erottuvaan luokkaan,

Bioteknologian perustyökaluja

MESSUMARKKINAT JA POISTOMYYNTI to 1.10 la

GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA

Saana-Mari Jänkälä CDNA-KIRJASTON VALMISTUKSESSA KÄYTETTÄVIÄ GEENITEKNIIKAN MENETELMIÄ

Esim. ihminen koostuu 3,72 x solusta

3 Lineaariset yhtälöryhmät ja Gaussin eliminointimenetelmä

Virus-mediated gene delivery for human gene therapy KURT NURMI

Symbioosi 2 VASTAUKSET. b. Millaisia sukusoluja vanhemmat tuottavat (4 erilaista)? Vastaus: VL, vl, Vl, vl

Kun olet valmis tekemään tilauksen, rekisteröidy sovellukseen seuraavasti:

Myytävänä olevat tölkinvedin kukkarot

INDUKTIIVISEN PÄÄTTELYN HARJOITUSPAKETTI ESIOPETUKSEEN

Positional cloning. Pedigreessä etenevä ominaisuus kartoitetaan ensin karkeasti ja sitten tehdään yhä tarkempaa työtä molekyylimarkkereilla.

Virukset lääketieteen apuvälineinä. Veijo Hukkanen, Veli-Matti Kähäri ja Timo Hyypiä

måndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda

DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio

VASTAUS 1: Yhdistä oikein

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Avainsanat: BI5 III Biotekniikan sovelluksia 9. Perimä ja terveys.

Histokemia ja histologinen valmiste. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013

LUENTO 3 Kyösti Ryynänen Seutuviikko 2014, Jämsä

Taulukkolaskennan perusteet Taulukkolaskentaohjelmat

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30

Luku 20. Biotekniikka

Datatähti 2019 loppu

Transkriptio:

Kehitysbiologiassa käytetään lukuisia viekkaita kuvantamismenetelmiä

Reportterigeenit ja reportterikonstruktiot? Monissa tilanteissa tarvitaan ilmaisinta (proobi, luotain, reportteri) kertomaan, mitä/missä/milloin solussa/alkiossa tapahtuu jotakin Vallankin kehitysbiologiassa käytetään usein lacz -reportteria lacz on varsinaisesti E. colin laktoosioperonista "varastettu" beta-galaktosidaasigeeni, jollaista ei eläimillä eikä kai kasveillakaan ole lainkaan lacz on monissa kloonausvektoreissa vakiovarusteena

Hieno nykyaikainen kloonausvektori, kaksi mallia saatavana Antibioottiresistenssigeenit: jos solu pysyy elossa antibioottiliemessä, on transformaatio onnistunut Invitrogen 1999 p. 6

Promoottorit, jos halutaan käyttää ekspressiovektorina lacz -reportteri: jos se toimii, ei tässä välissä ole mitään (eli intergrointi ei onnistunut, klooni hylätään) Invitrogen 1999 p. 6

Siniset pesäkkeet ovat pysyneet elossa, mistä päätellen ne on transformoitu, mutta sininen lacz -reportterin tuote paljastaa, ettei vektorissa ole insertiota Siis: Valkeat pesäkkeet ovat niitä toivottuja tässä tapauksessa, niihin on siirtynyt jotain

Invitrogen 2002 p. 150 Ekspressiovektorissa lacz pidetään toimimassa, jolloin sininen väri saadaan näkymään vaikka Drosophila alkiossa

Ubx proximal promoter GAGA ZESTE sitoutumismotiiveja NTF-1 Polycomb repressorit Trithorax aktivaattorit Development March 2002 p. 1340

GFP Green Fluorescent Protein on toinen usein käytetty reportteri Drosophilan siiven aihe eli imaginaalilevy CELL 592-596 Development March 2002 p. 1371

GFP "varastettiin" Aequorea victoria meduusalta Kemian Nobel 2008: Osamu Shimomura Martin Chalfie Roger Y. Tsien "for the discovery and development of the green fluorescent protein, GFP". CELL 593

Elävän kärpäsembryon neuronit hohtavat vihreänä GFP istutettiin neuronispesifiseen promoottoriin ja pantiin sitten geeninsiirrolla kärpäseen Nämä neuronit on kutikulan alla ja tunnustelee ympäristöä CELL 593

Lituruohon trikomit (karvat)

Elävän tupakkasolun spliseosomit hohtaa tumassa (Cajalin kappaleissa)

Fluoresenssimikroskopian idea ja muutamia käytettävissä olevia värejä. Kuviin voidaan valottaa yksi väri kerrallaan

mikrotubulukset vihreä sentomeerit punainen kromosomiaine (DNA) sininen

Purkinjen solu pikkuaivoissa Ca 2+ konsentraatio ilmaistu fluoresenssilla CELL 597

Ampiphysin Actin molemmat Drosophilan silmä Development Dec 2001, 5010

In situ hybridisaatio: RNA/RNA, RNA/DNA Digoksygeniinillä (tms) merkitään tietyn geenin mrna:ta vastaava proobi, tehdään kudos läpäiseväksi ja hybridisoidaan. Liika pestään pois ja voilá... nähdään, missä mrna on sijainnut = ko. geeni toiminut Sopivissa oloissa proobi saadaan sitoutumaan myös vastaavaan DNA:han, esimerkiksi sylkirauhaskromosomissa

LM, Col ja MMP geenien mrna:n kuvantaminen, in situ hybridisaatio Hydran epiteelimorfogeneesi Development March 2002 p. 1525

Pax6A mrna laakamato Girardia tigrina Työn tarkoitus: Pax6 geeniperhe on kaikkien silmien kehityksen takana, olivatpa ne millaisia tahansa. Planarialla on simppeli kuppisilmä, joka aistii valon suunnan Se regeneroituu niinkuin pääkin Development March 2002 p. 1427

Hiiren alkiokin voidaan läpivärjätä vasen sarake: villi oikea: mutantti rivit: eri geenien ilmenemiskuvio Development Dec 2001, 4986

Development Dec 2001, 4986

Olipa nuo edelliset köyhiä aikoja! Pelkkää sinistä. Nyt RNA-hybridisaatiokin voidaan tehdä värillisenä CELL 956

Immunologiset osoitusmenetelmät Tehdään proteiinille monoklonaalinen vasta-aine Merkitään se sopivasti, vaikkapa fluoresoivaksi tms

Hybridomasoluilla voidaan tuottaa monoklonaalisia antibodeja, jotka on sitten hyvin spesifisiä (Esimerkki: nykyiset veriryhmien määritysreagenssit) CELL 509

CELL 509

CELL 509

Tällaista käsityötaitoa arvostettaisiin monella alalla, mutta taitajia on niukasti