PUBLICATION LIST

Samankaltaiset tiedostot
Pakolaisseminaari of Ecology 2011 in Joensuu

Parhaat lohikalojen istutuspoikasten kasvatusmenetelmät

Hopotusta* kokeellisista tutkimuksista* Kainuun kalantutkimuksessa Ari Huusko

Kuhakannan hoito ja kalastuksen säätely Kokemuksia Oulujärveltä

Constructive Alignment in Specialisation Studies in Industrial Pharmacy in Finland

Järvien kuhakannoissa on eroja kuinka kuhan kalastusta pitäisi ohjata?

Ekologisesti ja evolutiivisesti kestävä kuhan kalastus Oulujärvessä

muutos *) %-yks. % 2016

APA-tyyli. Petri Nokelainen

GEENEISTÄ SOSIAALISEEN KÄYTTÄYTYMISEEN. Markus Jokela, Psykologian laitos, HY

MANAGING NORTHERN BALTIC SALMON FISHERIES UNDER SOCIAL-ECOLOGICAL COMPLEXITY. Maatalous-metsätieteellinen tiedekunta

Naisnäkökulma sijoittamiseen Vesa Puttonen

Socio-cultural valuation of ecosystem services provided by Baltic Salmon. Timo P. Karjalainen Thule Institute/University of Oulu Oulun yliopisto

Suomi innovaatioympäristönä maailman paras?

Oulujärven kuha. Pasi Korhonen, Metsähallitus Kuhaseminaari Tampere. Luonnonvarakeskus Eräluvat

Liite 1. Hankkeen tuotokset

Kalavedenhoito tulevaisuudessa Esimerkkinä Oulujärven kuhakanta: istutukset - kalastus - säätely

Market Report / October 2015

Yhteenvetoa merimetson vaikutuksista kalakantoihin

Isot emokalat tärkeitä kalakantojen uusiutumiselle, mutta herkkiä ympäristöpaineille

Pedot ja muikku. Outi Heikinheimo Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos. 100 vuotta suomalaista muikkututkimusta Jyväskylä 2.12.

Master's Programme in Life Science Technologies (LifeTech) Prof. Juho Rousu Director of the Life Science Technologies programme 3.1.

ProAgria. Opportunities For Success

*) %-yks. % 2018*)

1. Koskinen S, Koskenniemi J, Leino-Kilpi H & Suhonen R Ikääntyneiden osallisuus palveluiden kehittämisessä. Pro terveys 41 (2),

muutos *) %-yks. % 2017*)

Prognos Julkaisusuunnitelmat

Efficiency change over time

Mitä tiedetään Oulujärven kuhasta tänään?

BIOENV Laitoskokous Departmental Meeting

Market Report / August 2015

Uusilla kasvatusmenetelmillä parempia istukkaita Vaelluskalaseminaari, Keminmaa, Pekka Hyvärinen, RKTL

Carlin-merkittyjen järvitaimenten istutus Oulujärveen vuosina Istutusajankohdan ja koon vertailu

ICES: 110 vuotta tiedettä ja merentutkimusta: Mitä ja miksi? Dr. Kai Myrberg ICES Delegaatti Helsinki

Taimenkantojen tulevaisuus on kappalepeliä mallinnus säätelyn avuksi

Market Report / September 2015

Market Report / November 2015

Huleveden pitoisuuksien ajallinen ja alueellinen vaihtelu Maija Taka University of Helsinki 1

Faculty of Agriculture and Forestry. Forestry

Benchmarking Controlled Trial - a novel concept covering all observational effectiveness studies

Market Report / December 2015

Paradoxes of educational improvement: The Finnish experience

Capacity Utilization

Matti Sarvimäki. July /2009 Senior Researcher Government Institute for Economic Research, Helsinki

5 Yksityiskohtaiset laskentatulokset Aurajoelle

Gap-filling methods for CH 4 data

Markkinaraportti / elokuu 2015

Liiku Terveemmäksi LiikuTe Yleiset periaatteet vuoden 2010 järjestelyille

Market Report / January 2015

Market Report / August 2014

Market Report / April 2015

Finland, Data Sources Last revision:

7.4 Variability management

Karelia ENI CBC-ohjelma/ PÄÄTÖSLUETTELO 1 Pohjois-Pohjanmaan liitto

Dowstream passage at hydropower dams First steps in Finland

Market Report / December 2013

Kansaianvälinen aikuistutkimus PIAAC 2012

MATKAILUALAN TIETEELLISIÄ LEHTIÄ julkaisufoorumin tasoluokittain

Market Report / July 2014

Teollisuustuotannon määrä kuukausittain

VANTAA Matkailun tunnuslukuja

Meritaimenen taudit ja laatu poikaslaitoksilla. Päivi Rintamäki PRIK-palvelut

KOTKAN-HAMINAN SEUTU. MATKAILUN TUNNUSLUKUJA Huhtikuu. Kotka venäläisyöpymisissä Jonsuun ja Jyväskylän. Alkuvuoden yöpymiset + 11 %

Täplärapu siian ja muikun mädin saalistajana

Students Experiences of Workplace Learning Marja Samppala, Med, doctoral student

VÄITÖSKIRJA TIETEELLISET JULKAISUT

Istutukset muuttavat kuhakantojen perimää

Market Report / August 2005

Sähköjärjestelmän käyttövarmuus & teknologia Käyttövarmuuspäivä

Market Report / October 2014

Publications/Julkaisut (Lauri Urho)

Markkinaraportti / elokuu 2014

Market Report / December 2014

ECONOMICS AND CONSERVATION OF THE BALTIC SALMON ITÄMEREN LOHEN SUOJELU TALOUSTIETEEN NÄKÖKULMASTA. Soile Kulmala

Market Report / July 2015

Fungi infecting cultivated moss can also cause diseases in crop plants

Market Report 2015 HELSINKI TOURISM STATISTICS. Overnight stays down 3.5% Monthly bednights in Helsinki

XML-tutkimus Jyväskylän yliopistossa

Tutkimuksen huippuyksiköt. Maiju Gyran tiedeasiantuntija

Markkinaraportti / syyskuu 2015

16. Allocation Models

Aalto University School of Engineering Ongelmaperusteisen oppimisen innovatiivinen soveltaminen yliopisto-opetuksessa

Kuhan ala- ja ylämittasäätely kestävän kalastuksen välineenä

Markkinaraportti / toukokuu

Export Demand for Technology Industry in Finland Will Grow by 2.0% in 2016 GDP growth 2016/2015, %

Ajatuksia ohjelmistoliiketoiminnan nykytilasta

Market Report / June 2015

TIEKE Verkottaja Service Tools for electronic data interchange utilizers. Heikki Laaksamo

ELEMET- MOCASTRO. Effect of grain size on A 3 temperatures in C-Mn and low alloyed steels - Gleeble tests and predictions. Period

Kuinka tiedeosaamista kasvatetaan?

Markkinaraportti / huhtikuu 2014

Markkinaraportti / syyskuu 2012

Merimetsojen vaikutus kalakantoihin

Market Report / March 2015

Mitä mielen hyvinvoinnilla tarkoitetaan? Katja Kokko Gerontologian tutkimuskeskus ja terveystieteiden laitos, Jyväskylän yliopisto

Skene. Games Refueled. Muokkaa perustyyl. for Health, Kuopio

Fighting diffuse nutrient load: Multifunctional water management concept in natural reed beds

Markkinaraportti / lokakuu 2014

Markkinaraportti / lokakuu 2015

Ohjelmien kehittämisstudiot varmistavat laadukkaat ja linjakkaat maisteriohjelmat Maire Syrjäkari ja Riikka Rissanen

Transkriptio:

PUBLICATION LIST 24.04.2017 Anssi Vainikka A) Peer-reviewed publications (65) 65. Härkönen, L., Hyvärinen, P., Mehtätalo, L. & Vainikka, A. 2017: Growth, survival and social learning in the first hatchery generation of Eurasian perch (Perca fluviatilis). Aquaculture, 466: 64-71. 64. Huusko, A., Vainikka, A., Syrjänen, J.T., Orell, P., Louhi, P. & Vehanen, T. 2017: Life-history of the adfluvial brown trout (Salmo trutta L.) in eastern Fennoscandia. In: Brown trout. Biology, Ecology and Management (Eds. Lobón-Cerviá, J. & Sanz, N.) Elsevier, in press. ISBN: 978-1-119-26831-4 63. Syrjänen, J.T., Vainikka, A., Louhi, P. Huusko, A., Orell, P. & Vehanen, T. 2017: History, conservation and management of adfluvial brown trout stocks in Finland. In: Brown trout. Biology, Ecology and Management (Eds. Lobón- Cerviá, J. & Sanz, N.) Elsevier, in press. ISBN: 978-1-119-26831-4 62. Vainikka, A., Olin, M., Ruuhijärvi, J., Huuskonen, H., Eronen, R. & Hyvärinen, P. 2017: Model-based evaluation of the management of pikeperch (Sander lucioperca) stocks using minimum and maximum size limits. Boreal Environment Research, 22: 187-212. 61. Härkönen, L., Hyvärinen, P., Niemelä, P.T., Vainikka, A. 2016: Behavioural variation in Eurasian perch populations with respect to relative catchability. Acta Ethologica, 19: 21-31. 60. Jussila, J., Kokko, H., Makkonen, J., Westerbacka, A., Vainikka, A. & Kortet R. 2016: Rapuruttoloinen monimuotoinen ja muuntautumiskykyinen taudinaiheuttaja. Luonnon Tutkija, 120: 4-12. 59. Vainikka, A., Tammela, I., Hyvärinen, P. 2016: Does boldness explain vulnerability to angling in Eurasian perch Perca fluviatilis? Current Zoology, 62: 109-115. 58. DiRienzo, N., Niemelä, P.T., Skog, A., Vainikka, A., Kortet, R. 2015: Juvenile pathogen exposure affects the presence of personality in adult field crickets. Frontiers in Ecology and Evolution, 3: 36. doi: 10.3389/fevo.2015.00036. 57. Jussila, J., Ruokonen, T., Syväranta, J., Kokko, H., Vainikka, A., Makkonen, J. & Kortet, R. 2015: It takes time to see the menu from the body: an experiment on stable isotope composition of freshwater crayfishes. Knowledge and Management of Aquatic Ecosystems, 416: 25. doi: 10.1051/kmae/2015021. 56. Kokkonen, E., Vainikka, A. & Heikinheimo, O. 2015: Probabilistic maturation reaction norm trends reveal decreased size and age at maturation in an intensively harvested stock of pikeperch Sander lucioperca. Fisheries Research, 167: 1-12. 55. Kortet, R., Sirkka, I, Lai Y-T., Vainikka, A. & Kekäläinen, J. 2015: Personality differences in two minnow populations that differ in their parasitism and predation risk. Frontiers in Ecology and Evolution, 3: 9. doi: 10.3389/fevo.2015.00009. 54. Gruber, C., Vainikka, A., Hirvonen, H., Rantala, M.J. & Kortet, R. 2014: Endogenous seasonal variation in the encapsulation response of the noble crayfish (Astacus astacus). Annales Zoologici Fennici, 51: 433-444. 53. Gruber, C., Kortet, R., Vainikka, A., Hyvärinen, P., Rantala, M.J., Pikkarainen, A., Jussila, J., Makkonen, J., Kokko, H. & Hirvonen, H. 2014: Variation in 1

resistance to the invasive crayfish plague and immune defence in the native noble crayfish. Annales Zoologici Fennici, 51: 371-389. 52. Härkönen, L., Hyvärinen, P., Paappanen, J. & Vainikka, A. 2014: Explorative behavior increases vulnerability to angling in hatchery-reared brown trout Salmo trutta. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 71: 1900-1909. 51. Huuskonen, H., Suhonen, A., Gruber, C., Vainikka, A., Hirvonen, H. & Kortet, R. 2014: Metabolic rate in the signal crayfish (Pacifastacus leniusculus) is temporally consistent and elevated at molting. Marine and Freshwater Behaviour and Physiology, 47: 205-209. 50. Jussila, J., Makkonen, J., Vainikka, A., Kortet, R. & Kokko, H. 2014: Crayfish plague dilemma: how to be a courteous killer? Boreal Environment Research, 19: 235-244. 49. Kekäläinen, J., Lai, Y.-T., Vainikka, A., Sirkka, I. & Kortet, R. 2014: Do brain parasites alter host personality? Experimental study in minnows. Behavioral Ecology and Sociobiology, 68: 197-204. 48. Kekäläinen, J., Podgorniak, T., Puolakka, T., Hyvärinen, P. & Vainikka, A. 2014: Invidually assessed boldness predicts European perch's Perca fluviatilis behaviour in shoals, but is not associated with the capture order or angling method. Journal of Fish Biology, 85: 1603-1616. 47. Kortet, R., Vainikka, A., Janhunen, M., Piironen, J. & Hyvärinen, P. 2014: Behavioral variation shows heritability in juvenile brown trout Salmo trutta. Behavioral Ecology and Sociobiology, 68: 927-934. 46. Laugen, A.T., Engelhard, G.H., Whitlock, R., Arlinghaus, R., Dankel, D., Dunlop, E.S., Eikeset, A.M., Enberg, K., Jørgensen, C., Matsumura, S., Nusslé, S., Urbach, D., Baulier, L., Boukal, D.S., Ernande, B., Johnston, F., Mollet, F., Pardoe, H., Therkildsen, N.O., Uusi-Heikkila, S., Vainikka, A., Heino, M., Rijnsdorp, A.D. & Dieckmann, U. 2014: Evolutionary impact assessment: Accounting for evolutionary consequences of fishing in an ecosystem approach to fisheries management. Fish & Fisheries, 15: 65-96. 45. Makkonen, J., Kokko, H., Vainikka, A., Kortet, R., Jussila, J. 2014: Dose-dependent mortality of the noble crayfish (Astacus astacus) to different strains of the crayfish plague (Aphanomyces astaci). Journal of Invertebrate Pathology, 115: 86-91. 44. Heino, M., Baulier, L, Boukal, D.S., Ernande, B., Johnston, F.D., Mollet, F., Pardoe, H., Therkildsen, N.O., Uusi-Heikkilä, S., Vainikka, A., Arlinghaus, R., Dankel, D.J., Dunlop, E.S., Eikeset, A.M., Enberg, K., Engelhard, G.H., Jørgensen, C., Laugen, A.T., Matsumura, S., Nusslé, S., Urbach, D., Whitlock, R., Rinjnsdrop, A.D. & Dieckmann, U. 2013: Can fisheriesinduced evolution shift reference points for fisheries management? ICES Journal of Marine Science, 70: 707-721. 43. Mollet, F.M., Engelhard, G.H., Vainikka, A., Laugen, A.T., Rijnsdorp, A.D. & Ernande, B. 2013: Spatial variation in growth, maturation schedules and reproductive investment of female sole Solea solea in the Northeast Atlantic. Journal of Sea Research, 84: 109-121. 42. Niemelä, P.T., Dingemanse, N.J., Alioravainen, N., Vainikka, A., Kortet, R. 2013: Personality pace-of-life hypothesis: testing genetic associations among personality and life history. Behavioral Ecology, 24: 935-941. 41. Niemelä, P.T., Vainikka, A., Forsman, J.T., Loukola, O.J. & Kortet, R. 2013: How does variation in the environment and individual cognition explain the 2

existence of consistent behavioural differences? Ecology and Evolution, 3: 457-464. 40. Kortet, R., Niemelä, P.T., Vainikka, A. & Laakso, J. 2012: Females prefer bold males; an analysis of boldness, mate choice and bacterial resistance in the field cricket, Gryllus integer. Ecological Immunology and Parasitology, 1: 235580. doi:10.4303/epi/235580. 39. Niemelä, P.T., Vainikka, A., Hedrick, A.V. & Kortet, R. 2012: Integrating behavior with life history: boldness of the field cricket, Gryllus integer, during ontogeny. Functional Ecology, 26: 450-456. 38. Niemelä, P.T., Vainikka, A., Lahdenperä, S. & Kortet, R. 2012: Nymphal density, behavioral development, and life history in a field cricket. Behavioural Ecology and Sociobiology, 66: 645-652. 37. Pulkkinen, K. & Vainikka, A. 2012: Epidemiologia ja vesieliöiden loisten torjunta. In Suomen kalojen loiset (eds. Valtonen, E.T., Hakalahti, T., Karvonen, A., Pulkkinen, K.) Gaudeamus, Helsinki, pp. 419-432. 36. Vainikka, A., Huusko, R., Hyvärinen, P., Korhonen, P.K., Laaksonen, T., Koskela, J., Vielma, J., Hirvonen, H. & Salminen, M. 2012: Food restriction prior to release reduces precocious maturity and improves migration tendency of Atlantic salmon smolts. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 69: 1981-1993. 35. Vainikka, A. & Hyvärinen, P. 2012: Ecologically and evolutionarily sustainable fishing of the pikeperch Sander lucioperca: Lake Oulujärvi as an example. Fisheries Research, 113: 8-20. 34. Vainikka, A., Koskimäki, J., Niemelä, P.T. & Kortet, R. 2012: Composition of the Eurasian perch (Perca fluviatilis) catches in ice fishing: Does capture order predict body size? Fisheries Research, 115-116: 24-30. 33. Vainikka, A. & Seppälä, O. 2012: Isäntä-loissuhteiden mallinnus: teoriaa, menetelmiä ja vesiviljelysovelluksia. In Suomen kalojen loiset (eds. Valtonen, E.T., Hakalahti, T., Karvonen, A., Pulkkinen, K.) Gaudeamus, Helsinki, pp. 433-450. 32. Jussila, J., Makkonen, J., Vainikka, A., Kortet, R. & Kokko, H. 2011: Latent crayfish plague (Aphanomyces astaci) infection in a robust wild noble crayfish (Astacus astacus) population. Aquaculture, 321: 17-20. 31. Vainikka, A., Rantala, M.J., Niemelä, P., Hirvonen, H. & Kortet, R. 2011: Boldness as a consistent personality trait in the noble crayfish, Astacus astacus. Acta Ethologica, 14: 17-25. 30. Kortet, R., Hedrick, A.V. & Vainikka, A. 2010: Parasitism, predation and the evolution of animal personalities. Ecology Letters, 13: 1449-1458. 29. Vainikka, A., Kallio-Nyberg, I., Heino, M. & Koljonen, M-L. 2010: Divergent trends in life-history traits between Atlantic salmon, Salmo salar of wild and hatchery origin in the Baltic Sea. Journal of Fish Biology, 76: 622-640. 28. Pardoe, H., Vainikka, A., Thórdarson, G., Marteinsdóttir, G. & Heino, M. 2009: Temporal trends in probabilistic maturation reaction norms and growth of Atlantic cod (Gadus morhua L.) on the Icelandic shelf. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences, 66: 1719-1733. 27. Vainikka, A., Gårdmark, A., Bland, B. & Hjelm, J. 2009: Two- and threedimensional maturation reaction norms for the eastern Baltic cod, Gadus morhua. ICES Journal of Marine Science, 66: 248-257. 26. Vainikka, A., Mollet, F., Casini, M., Gårdmark, A. 2009: Spatial variation in growth, condition and maturation reaction norms of the Baltic herring (Clupea harengus membras). Marine Ecology Progress Series, 383: 285-294. 3

25. Vainikka, A., Taskinen, J., Löytynoja, K., Jokinen, I. & Kortet, R. 2009: Measured immunocompetence relates to the proportion of dead parasites in a wild roach population. Functional Ecology, 23: 187-195. 24. Jørgensen, C., Enberg, K., Dunlop, E.S., Arlinghaus, R., Boukal, D.S., Brander, K., Ernande, B., Gårdmark, A., Johnston, F., Matsumura, S., Pardoe, H., Raab, K., Silva, A., Vainikka, A., Dieckmann, U., Heino, M. & Rijnsdorp, A.D. 2008: The role of fisheries-induced evolution response. Science 320: 48-50. 23. Korkea-aho, T.L., Vainikka, A., Kortet, R. & Taskinen, J. 2008: Factors affecting between-lake variation in the occurrence of epidermal papillomatosis in roach, Rutilus rutilus (L.). Journal of Fish Diseases, 31: 263-270. 22. Kortet, R. & Vainikka, A. 2008: Seasonality of innate immunity; evolutionary aspects and latest updates. In New Research on Innate Immunity (eds. Durand M. & Morel C.V.) Nova Science Publishers, NY, pp 13-45. ISBN 978-1-60456-549-2. 21. Jørgensen, C., Enberg, K., Dunlop, E.S., Arlinghaus, R., Boukal, D.S., Brander, K., Ernande, B., Gårdmark, A., Johnston, F., Matsumura, S., Pardoe, H., Raab, K., Silva, A., Vainikka, A., Dieckmann, U., Heino, M. & Rijnsdorp, A.D. 2007: Managing Evolving Fish Stocks. Science, 318: 1247-1248. 20. Vainikka, A., Rantala, M.J. Seppälä, O. & Suhonen, J. 2007: Do male mealworm beetles, Tenebrio molitor, sustain the honesty of pheromone signals under immune challenge? Acta Ethologica, 10: 63-72. 19. Ylönen, H., Kortet, R., Myntti, J. & Vainikka, A. 2007: Predator odour recognition and antipredatory response in fish: Does the prey know the predator diel rhythm? Acta Oecologia, 31: 1-7. 18. Korkea-aho, T.L., Partanen, J.M., Kiviniemi, V., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2006: Association between environmental stress and epidermal papillomatosis of roach Rutilus rutilus. Diseases of Aquatic Organisms, 72: 1-8. 17. Korkea-Aho, T., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2006: Factors affecting the intensity of epidermal papillomatosis in populations of roach, Rutilus rutilus L., estimated as scale coverage. Journal of Fish Diseases, 29: 115-122. 16. Rantala, M.J., Eriksson, C.J.P., Vainikka, A. & Kortet R. 2006: Male steroid hormones and female preference for male body odor. Evolution and Human Behavior, 27: 259-269. 15. Vainikka, A. Seppälä, O., Löytynoja, K. & Rantala, M.J. 2006: Fitness consequences of female preference for male pheromones in Tenebrio molitor. Evolutionary Ecology Research, 8: 943-957. 14. Vainikka, A., Jokinen, E.I., Kortet, R., Paukku, S., Pirhonen, J., Rantala, M.J. & Taskinen, J. 2005: Effects of testosterone and -glucan on immune functions in tench Tinca tinca (L.). Journal of Fish Biology, 66: 348-361. 13. Vainikka, A., Kortet, R., Paukku, S., Rantala, M.J. & Pirhonen, J. 2005: What do male tench, Tinca tinca, advertise with morphological ornaments? Acta Ethologica, 8: 70-78. 12. Vainikka, A., Ylönen, H., Jokelainen, T. & Kortet, R. 2005: Predation risk allocation or direct vigilance response in the predator interaction between perch (Perca fluviatilis) and pike (Esox lucius)? Ecology of Freshwater Fish, 14: 225-232. 11. Kortet, R., Taskinen, J., Vainikka, A. & Ylönen, H. 2004: Breeding tubercles, papillomatosis and dominance behaviour of male roach (Rutilus rutilus) during the spawning period. Ethology, 110: 591-601. 10. Kortet, R., Vainikka, A., Rantala, M.J., Myntti, J. & Taskinen, J. 2004: In vitro embryo survival and early viability of larvae in relation to male sexual 4

ornaments and parasite resistance in roach, Rutilus rutilus L. Journal of Evolutionary Biology, 17: 1337-1344. 9. Kortet, R., Vainikka, A., Rantala, M.J. & Taskinen, J. 2004: Sperm quality, secondary sexual characters and parasitism in roach (Rutilus rutilus). Biological Journal of the Linnean Society, 81: 111-117. 8. Vainikka, A., Jokinen, E.I., Kortet, R. & Taskinen J. 2004: Gender- and seasondependent relationships between testosterone, oestradiol and immune functions in wild roach Rutilus rutilus L. Journal of Fish Biology. 64: 227-240. 7. Vainikka, A. Kortet, R. & Taskinen, J. 2004: Epizootic cutaneous papillomatosis, cortisol and male ornamentation during and after breeding in roach Rutilus rutilus. Diseases of Aquatic Organisms, 60: 189-195. 6. Kortet, R., Vainikka, A., Rantala, M.J., Jokinen, I., Taskinen, J. 2003: Sexual ornamentation, androgens and papillomatosis in male roach (Rutilus rutilus). Evolutionary Ecology Research, 5: 411-419. 5. Kortet, R., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2003: Experimental study on the effect of epidermic papillomatosis on survival of the freshwater fish Rutilus rutilus. Diseases of Aquatic Organisms, 57: 163-165. 4. Rantala, M.J., Kortet, R., Kotiaho, J.S., Vainikka, A. & Suhonen, J. 2003: Condition dependence of pheromones and immune function in the grain beetle Tenebrio molitor. Functional Ecology 17: 534-540. 3. Rantala, M.J., Vainikka, A. & Kortet, R. 2003: The role of juvenile hormone in immune function and pheromone production trade-offs: a test of the immunocompetence handicap principle. Proceedings of the Royal Society of London, Series B, 270: 2257-2261. 2. Kortet, R., Taskinen, J., Vainikka, A. 2002: Epizootic cutaneous papillomatosis in roach Rutilus rutilus: sex and size dependence, seasonal occurrence and between populations differences. Diseases of Aquatic Organisms, 52: 179-184. 1. Rantala, M.J., Jokinen, I., Kortet, R., Vainikka, A. & Suhonen, J. 2002: Do pheromones reveal male immunocompetence? Proceedings of the Royal Society of London, Series B, 269: 1681-1685. Submitted manuscripts currently under evaluation (3) Alioravainen, N., Hyvärinen, P., Kortet, R., Härkönen, L. & Vainikka, A. 2017: Using controlled crossing with wild fish against domestication: behaviour, growth and survival of F1-hybrids. Submitted to Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. Lemopoulos, A., Uusi-Heikkilä, S., Vasemägi, A., Huusko, A., Kokko, H. & Vainikka, A. 2017: Genome-wide divergence patterns support fine-scaled genetic structuring associated with migration tendency in brown trout. Submitted to Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences. Vainikka, A., Jakubaviciute, E. & Hyvärinen, P. 2017: Synchronous decline of three morphologically distinct whitefish (Coregonus lavaretus) stocks in Lake Oulujärvi with concurrent changes in the fish community. Revision submitted to Fisheries Research. B) Non-refereed scientific publications (81) Full articles and a book preface (8) 5

8. Hyvärinen, P., Jakubaviciute, E. &Vainikka, A. 2016: Oulujärveen istutettujen planktonsiikojen istutustulokseen vaikuttavat tekijät. Liite 7. In: Oulujärven kalataloustarkkailu v. 2015. Fortum Power and Heat Oy, UPM-Kymmene Oyj, Kajaanin Kaupunki, Paltamon Kunta, Vapo Oy, Luke/Kainuun Kalantutkimus. Taskila, E. Pöyry Finland Oy. 7. Vainikka, A. 2015: Preface in Biological Invasions in Changing Ecosystems. Vectors, Ecological Impacts, Management and Predictions. Edited by João Canning- Clode. 488 pp. De Gruyter Open, Warsaw, Poland. 6. Härkönen, L., Hyvärinen, P., Aro, V., Eela, L., Eronen, A., Strandberg, U. & Vainikka, A. 2015: Laitosviljelyyn soveltuvan ahvenen emokalaston tuotanto. Loppuraportti, Lapin ELY-keskus. http://docplayer.fi/9838010- Laitosviljelyyn-soveltuvan-ahvenen-emokalaston-tuotanto.html 5. Vainikka, A., Härkönen, L. & Hyvärinen, P. 2015: Ahvenen viljelyn mahdollisuudet Suomessa. Loppuraportti, Kainuun ELY-keskus. http://docplayer.fi/5993707- Ahvenen-viljelyn-mahdollisuudet-suomessa.html 4. Hyvärinen, P., Laaksonen, T., Korhonen, P., Moilanen, J., Karvonen, P., Rodewald, P., Hirvonen, H., Vainikka, A. 2011. Merilohen vaelluspoikastutkimukset Oulujärvellä v. 2010. Kainuun vaelluskalahanke. Tutkimusraportti. Riista- ja kalatalouden tutkimuslaitos. 14 s. 3. Arlinghaus, R., Boukal, D., Dieckmann, U., Dunlop, E., Enberg, K., Ernande, B., Gårdmark, A., Heino, M., Johnston, F., Jørgensen, C., Matsumura, S., Pardoe, H., Raab, K., Rijnsdorp, A., Silva, A. & Vainikka, A. (group members in alphabetical order) 2007: Report of the Study Group on Fisheries-Induced Adaptive Change (SGFIAC). International Council for the Exploration of the Sea. 2. Olsson, J., Aho, T., Florin, A.-B., Vainikka, A., Bekkevold, D., Dannewitz, J., Hindar, K., Koljonen, M.-L., Laikre, L., Magnussen, E. & Pálsson, S. 2007: Genetic research on commercially exploited fish species in Nordic Countries. TemaNord 2007: 542. 1. Vainikka, A., Gårdmark, A., Bland, B. & Hjelm. J. 2006: Fishing-induced early reproduction at the cost of growth in the Baltic cod Gadus morhua? ICES CM 2006/H:09. Conference abstracts (76) 76. Alioravainen, N., Hyvärinen, P., Kortet, R., Härkönen, L. & Vainikka, A. 2017: Behaviour and survival of crossbred hatchery-reared brown trout Salmo trutta. NowPaS, Salmonid research network, Shaftesbury, England, 7 th -10 th March 2017. Book of abstracts. 75. Alioravainen, N., Hyvärinen, P., Kortet, R., Härkönen, L. & Vainikka, A. 2017: Behaviour and survival of outbred hatchery-reared brown trout Salmo trutta. OIKOS Finland conference for Ecologists and Evolutionary Biologists, 31 st January to 1 st February 2017, Helsinki, Finland. Abstract book. 74. Härkönen, L., Hyvärinen, P. & Vainikka, A. 2017: Angling-induced selection in Eurasian perch Perca fluviatilis and brown trout Salmo trutta. Cal-Neva Chapter of the American Fisheries Society 51 st Annual Meeting, April 5-7, 2017, Eureka, CA. 73. Prokkola, J.M., Lemopoulos, A., Hyvärinen, P., Koskiniemi, J., Uusi-Heikkilä, S., Koljonen, M-L., Vainikka, A. 2017: More is more? A comparison of 16 microsatellites and 3500 SNPs for elucidating the genetic structure and 6

diversity of small populations of brown trout. NowPaS, Salmonid research network, Shaftesbury, England, 7 th -10 th March 2017. Book of abstracts. 72. Härkönen, L., Hyvärinen, P., Alioravainen, N. & Vainikka, A. 2016: Anglinginduced selection mediated by fish behaviour implications for reproductive potential in Eurasian perch (Perca fluviatilis). ICES ASC, Riga, Latvia, 19-23 September 2016. 71. Lemopoulos, A., Uusi-Heikkilä, S., Huusko, A., Hyvärinen, P. & Vainikka, A. 2016: RADSeq genetics of resident and migratory brown trout within and among rivers. Nordic OIKOS Conference for Ecologists and Evolutionary Biologists, 2 nd -4 th February 2016, Turku, Finland. Abstract book. 70. Lemopoulos, A., Uusi-Heikkilä, S., Vasemägi, A., Huusko, A., Hyvärinen, P. & Vainikka, A. 2016: Understanding genetic population structure is a necessity for sustainable harvesting of fish and game species. 2 nd Finnish Molecular Ecology & Evolution Symposium. Abstract book. 69. Vainikka, A., Härkönen, L., Hyvärinen, P., Kekäläinen, J. & Väätäinen, R. 2016: Angling-induced selection in Eurasian perch Perca fluviatilis and brown trout Salmo trutta. Nordic OIKOS Conference for Ecologists and Evolutionary Biologists, 2 nd -4 th February 2016, Turku, Finland. Abstract book. 68. Eronen, R., Vainikka, A., Huuskonen, H., Kiljunen, M., Syväranta, J. & Kortet, R. 2015: Diet of pikeperch (Sander lucioperca) in Lake Höytiäinen: stomach contents vs. stable isotope analysis. 4 th European Large Lakes Symposium, August 24-28, 2015, Joensuu, Finland, p. 42. 67. Makkonen, J., Jussila, J., Gökmen, G., Ward, J., Umek, J., Kortet, R., Vainikka, A. & Kokko, H. 2015: Novel Aphanomyces sp. isolates from Lake Tahoe (USA) signal crayfish (Pacifastacus leniusculus) Oomycete molecular genetics network. Pacific Grove, California, USA 14-17 March 2015. p.15 66. Makkonen, J., Kokko, H., Gökmen, G., Ward, J., Umek, J., Vainikka, A., Kortet, R., Jussila, J. 2015: Novel Aphanomyces sp. isolates from Lake Tahoe (USA) signal crayfish (Pacifastacus leniusculus). European Crayfish Conference: Research and Management, April 8 12, 2015, Landau, Germany. Abstract proceedings, p 24. 65. Makkonen, J., Kokko, H., Vainikka, A., Kortet, R., Jussila, J. 2015: Finnish noble crayfish (Astacus astacus) represent a single haplotype lineage. The Oikos Finland Meeting for Ecologists and Evolutionary Biologists, February 10-11, 2015, Joensuu, Finland. Abstract proceedings, p 112. 64. Jussila, J., Vainikka, A., Kortet, R., Kokko, H. & Makkonen, J. 2015: Active spreading of an invasive species challenges ecosystem-based management of crayfisheries. EIFAAC Symposium, Recreational Fisheries in an Era of Change, Lillehammer, Norway, 14-17 June. p. 19. 63. Vainikka, A., Huuskonen, H., Eronen, R., Hyvärinen, P., Olin, M. & Ruuhijärvi, J. 2015: Size limit -based management of pikeperch (Sander lucioperca) in Finnish lakes with respect to life-history variation. 4 th European Large Lakes Symposium, August 24-28, 2015, Joensuu, Finland, p. 34. 62. Vainikka, A., Väätäinen, R., Härkönen, L., Kortet, R. & Hyvärinen, P. 2015: Selectivity of angling for behaviour in Eurasian perch Perca fluviatilis. EIFAAC Symposium, Recreational Fisheries In An Era of Change, Lillehammer, Norway, 14-17 June, p 55. 61. Härkönen L, Hyvärinen, P., Paappanen, J., Vainikka A. 2014: Explorative personality and standard hatchery rearing increase vulnerability to angling in brown trout (Salmo trutta). Ecology of fish in lakes and reservoirs 2014. Ceske Budejovice, Czech Republic, September 2014. 7

60. Jakubaviciute, E., Vainikka, A. & Hyvärinen, P. 2014: Fisheries impacts on different whitefish (Coregonus lavaretus) morphs in Lake Oulujärvi. World Conference on Natural Resource Modelling, July 8-11, Vilnius, Lithuania. Abstracts and conference program. 59. Makkonen, J., Kokko, H., Gökmen, G., Vainikka, A., Kortet, R. & Jussila, J. 2014: Novel Aphanomyces sp. isolates from Lake Tahoe (USA) signal crayfish (Pacifastacus leniusculus). International Association of Astacology - Biennial Symposium, Sapporo, Hokkaido, Japan, September 22-26, 2014. 58. Vesterbacka, A., Martin, F., Jussila, J., Diéguez-Uribeondo, J., Tyler, B., Rush, C., van West, P., Makkonen, J., Vainikka, A., Kortet, R., & Kokko, H. 2014: Assembly and comparison of Aphanomyces astaci mt-genomes illustrate high diversity among genotypes. Oomycete Molecular Genetics Network Meeting, 2 nd July 2014 4 th July 2014. Carrow Road, Norwich, NR1 1JE, UK. Book of abstracts. 57. Väätäinen, R., Torrellas Arnedo, M., Huuskonen, H., Kekäläinen, J., Kortet, R. & Vainikka, A. 2014: Does standard metabolic rate explain personality variation in Eurasian perch (Perca fluviatilis L.)? 7 th World Recreational Fishing Conference, September 1 to 4 2014, Campinas, State of Sao Paolo, Brazil. Book of abstracts. 56. Kokko, H., Vesterbacka, A., Blande, D., Makkonen, J., Kortet, R., Vainikka, A. & Jussila, J. 2013: Transcriptomes of Aphanomyces astacis isolates express a broad array of RxLR-effector genes. 16th International Conference on Diseases of Fish and Shellfish, Tampere, Finland, September 2 6, 2013. 55. Kortet, R., Hedrick, A.V. & Vainikka, A. 2013: The effect of parasitism in the evolution of consistent individual behavioural differences. Behaviour 2013, Joint meeting of the 33rd International Ethological Conference (IEC) & the Association for the Study of Animal Behaviour (ASAB), Abstract Book, 4th - 8th August 2013, The Sage, Newcastle-Gateshead UK. 54. Niemelä, P., Vainikka, A., Forsman, J., Loukola, O. & Kortet, R. 2013: How does variation in the environment and individual cognition explain the existence of consistent behavioral differences? Behaviour 2013, Joint meeting of the 33rd International Ethological Conference (IEC) & the Association for the Study of Animal Behaviour (ASAB), Abstract Book, 4th - 8th August 2013, The Sage, Newcastle-Gateshead UK. 53. Kortet, R., Niemelä, P.T., Vainikka, A. & Laakso, J. 2012: Boldness, mate choice and bacterial resistance in the field cricket Gryllus integer. XXIV International Congress of Entomology. August 19-25, 2012, Daegu. Abstract CD, Abstract #PS3M269. 52. Makkonen, J., Kokko, H., Vainikka, A., Kortet, R., Jussila, J. 2012: Differences in the virulence of crayfish plague (Aphanomyces astaci) strains confirmed with infection trials. IAA 19, 2012 Insbruck, Austria, Book of Abstracts, p. 36. 51. Niemelä, P.T., Dingemanse, J.N., Alioravainen, N., Vainikka, A. & Kortet, R. 2012: Genetic associations between immune defence, boldness and life-history. 14 th International Behavioral Ecology Congress (ISBE), 12.8.-17.8.2012, Lund, Sweden. The Abstract book, p. 103. 50. Vainikka, A., Hyvärinen, P., Olin, M. & Ruuhijärvi, J. 2012: How do alternative minimum size limits perform in the management of pikeperch Sander lucioperca stocks differing in growth and maturation patterns? EIFAAC Symposium 2012, 22-24 October, Hämeenlinna, Finland. Abstract. 49. Kokko, H., Makkonen, J., Vainikka, A., Kortet, R. & Jussila, J. 2011: Host-pathogen interactions: the search of oomycete effectors by next generation sequencing 8

of transcriptomes. Coevolution symposium, Jyväskylä, 4-7 October 2011. p. 17. 48. Kortet, R., Hedrick, A. & Vainikka, A. 2011: Parasites and pathogens are important players in evolution of animal personality traits? The 86 th Annual Meeting of the American Society of Parasitologists, 1-4 th June, Anchorage, Alaska, USA. Program & Abstracts, p. 25-26. 47. Kortet, R., Hedrick, A.V. & Vainikka, A. 2011: Parasites and pathogens as players in the evolution of animal personality traits. Behavior 2011 Joint meeting of the IEC and the ABS, July 25-30, 2011. Program & Abstracts, p. 128-129. 46. Kortet, R., Hedrick, A.V. & Vainikka, A. 2011: How important are parasites and pathogens in the evolution of animal personality traits? Coevolution Symposium, Jyväskylä, 4-7 October 2011, p. 14. 45. Makkonen, J., Kokko, H., Vainikka, A., Jussila, J. & Kortet, R. 2011: Noble crayfish (Astacus astacus) resistance against crayfish plague (Aphanomyces astaci). IX National Crayfish Seminar, Helsinki, 16.11.2011. CraySeminar Abstracts, p. 2-3. 44. Mollet, F., Engelhard, G.H., Ernande, B., Vainikka, A. & Rijnsdorp, A.D. 2011: Geographic variation in growth and maturation schedules of female sole. The 8th International Flatfish Symposium, Netherlands, IJmuiden, 5-11 th November 2011. 43. Niemelä, P., Vainikka, A., Hedrick, A.V. & Kortet, R. 2011: Integrating behavior with life-history: behavior of field cricket (Gryllus integer) during ontogeny. Behavior 2011 Joint meeting of the IEC and the ABS, July 25-30, 2011. Program & Abstracts, p. 173. 42. Niemelä, P., Vainikka, A., Lahdenperä, S. & Kortet, R. 2011: Effect of larval density on the behavioural development and life-history in a field cricket. XIII th ESEB Congress Tuebingen, 20-25 August 2011. All abstracts, p. 443. 41. Niemelä, P., Vainikka, A., Lahdenperä, S. & Kortet, R. 2011: Nymphal density, behavioral development and life-history in a field cricket. 15 th Kaamos Symposium, 7.-8.12.2011, The Abstract Book, Oulu, p. 12-13. 40. Vainikka, A., Gruber, C., Rantala, M.J., Kääriäinen, P., Hyvärinen, P., Hirvonen, H., Makkonen, J., Kokko, H., Jussila, J. & Kortet, R. 2011: What do simple measures of immunity tell and how they change with environment? IX National Crayfish Seminar, Helsinki, 16.11.2011. CraySeminar Abstracts, p. 2-3. 39. Vainikka, A. & Hyvärinen, P. 2011: Ecologically and evolutionarily sustainable fishing of the pikeperch Sander lucioperca. 6 th World Recreational Fishing Conference. Berlin, 1.-4.8.2011. 38. Vainikka, A., Kortet, R. & Hedrick, A.V. 2011: Behavioural consistency arising from the state-dependent costs of parasitism and predation. XIII th ESEB Congress Tuebingen, 20-25 August 2011. All abstracts, p. 1036. 37. Vainikka, A., Kortet, R. & Hedrick, A.V. 2011: Behavioural consistency arising from the state-dependent costs of parasitism and predation. Coevolution Symposium 4-7 October 2011, Jyväskylä. p. 3. 36. Kortet, R., Hedrick, A, Niemelä, P., Lahdenperä, S., Gruber, C. & Vainikka, A. 2010: Personality in field crickets. ISBE2010, 13 th International Behavioral Ecology Congress. Perth, Australia. p. 100. 35. Laugen, A.T., Engelhard, G.H., Whitlock, R., Arlinghaus, R., Dankel, D., Dunlop, E.S., Eikeset, A.M., Enberg, K., Jørgensen, C., Matsumura, S., Nusslé, S., Urbach, D., Baulier, L., Boukal, D.S., Ernande, B., Johnston, F., Mollet, F., Pardoe, F., Therkildsen, N.O., Uuqsi-Heikkilä, S., Vainikka, A., Heino, M., 9

Rijnsdorp, A.D. & Dieckmann, U. 2010: Evolutionary impact assessment: Accounting for evolutionary consequences of fishing in an ecosystem approach to fisheries management. Nordic Marine Sciences Conference in Strömstad, Sweden, in September 2010. 34. Niemelä, P., Vainikka, A., Hedrick, A. & Kortet R. 2010: Consistency of hiding behavior in relation to ontogeny and life-history variables in the field cricket, Gryllus integer. 14 th Kaamos Symposium, 7.-8.12.2012. The Abstract Book, p. 14. 33. Vainikka, A., Koskimäki, J. & Kortet, R. 2010: Implications of animal personalities for recreational fisheries. DINFISH symposium, Ceske Budejovice, Czech Republic, 13.-16.9.2010. 32. Kortet, R., Vainikka, A., Rantala, M., Niemelä, P. & Hedrick, A.V. 2009: Behavioral variation in field crickets. 46th Annual Meeting of the ABS, 22-26 June, 2009. Brazil. p. 97. 31. Koskimäki, J., Vainikka, A. & Kortet, R. 2009: Big fish strike first- angling-induced selection against bold foraging behavior. 13 th Kaamos Symposium, 7.-8.12. 2009, Program & Abstracts, Oulu, p.15. 30. Laugen, A.L., Engelhard, G.H., Whitlock, R., Arlinghaus, R., Baulier, L., Boukal, D.S., Dankel, R., Dunlop, E.S., Eikeset, A.M., Enberg, K., Ernande, B., Johnston, F., Jørgensen, C., Matsumura, S., Mollet, F., Nusslé, S., Pardoe, H., Therkildsen, N.O., Urbach, D., Uusi-Heikkilä, S., Vainikka, A., Heino, M., Rijnsdorp, A.D. & Dieckmann, U. 2009: Evolutionary impact assessment: Integrating evolutionary consequences of fishing into the ecosystem-approach to fisheries management. The 12 th Congress of the European Society for Evolutionary Biology. Turin, Italy, 24-29 August. 7-15. p. 83. Abstract. 29. Niemelä, P., Vainikka, A. & Kortet R. 2009: Sources of behavioural syndromes. 13 th Kaamos Symposium, Oulu, Finland. 7.12.2009. Program & Abstracts, Oulu, p. 19. 28. Vainikka, A. & Kortet, R. 2009: Evolutionary effects of mortality on the investment into immunity in crayfishes. The 12 th Congress of the European Society for Evolutionary Biology. Turin, Italy, 24-29 August. 7-15. Poster abstracts CD: 7-15. 27. Vainikka, A., Gårdmark, A., Hirvonen, H. & Kortet, R. 2009: How much should a crayfish invest in immune function? 13 th Kaamos Symposium, Oulu, Finland. 7.12.2009. Program & Abstracts, Oulu, p. 33. 26. Engelhard, G., Ernande, B., Mollet, F., Vainikka, A., Kell, L. & Rijnsdorp, A.D. 2008: Geographic variation in growth and maturation schedules of female sole. The 7 th International Flatfish Symposium. Sesimbra, Portugal, 2-7 November. 25. Pardoe, H., Dunlop, E.S., Vainikka, A., Heino, M. Þórðarson, G., Dieckmann, U. & Marteinsdóttir, G. 2008: Evolutionary effects of fishing on age and size at maturation of Icelandic cod: what role has stock structure played? 5th World Fisheries Congress Fisheries for Global Welfare and Environmental Conservation, Yokohama, Japan, October 20-24, 2008. 24. Pardoe, H., Dunlop, E.S., Vainikka, A., Heino, M., Dieckmann, U. & Marteinsdóttir, G. 2008: Fisheries-induced evolution in maturation of Icelandic cod, and the influence of stock structure. Annual Meeting of American Fisheries Society, Ottawa, Canada, 17 th -21 st August. 23. Vainikka, A., Gårdmark, A., Brännström, Å., Boukal, D. & Dieckmann, U. 2008: Direct and indirect fisheries-induced evolution in a three-species community. 38 th Annual Meeting of American Fisheries Society, Ottawa, 10

Canada, 17-21 August. 22. Taskinen, J., Vainikka, A., Jokinen, E.I., Löytynoja, K. & Kortet, R. 2007: Do measures of immunocompetence measure immunocompetence? 11th Congress of European Society for Evolutionary Biology, Uppsala, Sweden, 20-25 August 2007. 28-10 p. 539. 21. Svedäng, H., Vitale, F. & Vainikka, A. 2007: Trends in age and size based probabilistic maturation reaction norms of cod (Gadus morhua L.) in the Kattegat and Sound correlate with variability in juvenile growth. Reproductive and Recruitment Processes of Exploited Marine Fish Stocks. 1-3 October, Lisbon, Portugal. 20. Vainikka, A., Gårdmark, A., Brännström, Å., Boukal, D. & Dieckmann, U. 2007: Population-level consequences of evolution in size at maturation in herring-like fishes utilizing one or two resource niches. 11th Congress of European Society for Evolutionary Biology, Uppsala, Sweden, 20-25 August 2007. 05-06 p. 103. 19. Vainikka, A., Gårdmark, A., Brännström, Å., Boukal, D. & Dieckmann, U. 2007: Evolution of the size at maturation in herring-like fishes utilizing one or two resource niches. Workshop on Size-structured Population Models. Umeå, Sweden, 17-19 October 2007. 18. Vainikka, A. 2007: Evolutionarily sustainable fishing - Is it possible? 11 th Kaamos Symposium. Oulu, Finland. 10.12.2007. Book of abstracts. 17. Korkea-Aho, T.L., Partanen, J.M., Kortet, R., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2006: Papilloma disease of fish in pollution monitoring. European Large Lakes Symposium 2006, ecosystem changes and their ecological and socioeconomical impacts. 11-15 September, 2006, Tartu, Estonia. Programme and abstracts, p. 70. 16. Korkea-Aho, T., Partainen, M., Vainikka, A., Kortet, R. & Taskinen, J. 2006: Kalojen papilloomatauti suurten järvien tilan ilmentäjänä. Suurjärviseminaari, Joensuu, 20-22.3.2006, Book of abstracts, p. 9. 15. Taskinen, J., Korkea-Aho, T., Partanen, M., Kiviniemi, V., Vainikka, A., & Kortet R. 2006: Kalojen loiset ja taudit: suurten ja pienten järvien välinen vertailu. Suurjärviseminaari, Joensuu, 20-22.3.2006, Book of abstracts, p. 20. 14. Taskinen, J., Korkea-Aho, T., Partanen, J.M., Kiviniemi, V., Vainikka, A. & Kortet, R. 2006: Fish parasites and diseases in relation to lake size. European Large Lakes Symposium 2006, ecosystem changes and their ecological and socioeconomical impacts. 11-15 September, 2006, Tartu, Estonia. Programme and abstracts, p 43. 13. Vainikka, A., Gårdmark, A., Bland, B. & Hjelm, J. 2006: Fisheries-induced changes in the condition-dependent maturation of the Baltic cod, Gadus morhua. 41st European Marine Biology Symposium, 4-8 September 2006, Cork, Ireland. 12. Vainikka, A., Gårdmark, A., Bland, B. & Hjelm, J. 2006: Fishing-induced early reproduction at the cost of growth in the Baltic cod Gadus morhua? ICES Annual Science Conference, 19-23 September 2006, Maastricht, The Netherlands. H:09. p. 165. 11. Korkea-Aho, T.L., Partanen, J.M., Kortet, R., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2005: Papilloma disease of roach (Rutilus rutilus L.): an indicator of environmental stress. Seventh Finnish Conference of Environmental Sciences, Jyväskylä 12-13.5.2005. 10. Korkea-Aho, T.L., Partanen, J.M., Kortet, R., Vainikka, A. & Taskinen, J. 2005: Papilloma disease of fish in pollution monitoring. Society of Environmental 11

Toxicology and Chemistry (SETAC) Europe 15th Annual Meeting, 22-26 May 2005, Lille, France. Book of Abstracts p. 472. 9. Vainikka, A., Kortet, R., Pirhonen, J. & Taskinen, J. 2005: Endocrine-mediated lifehistory trade-offs in cyprinid fishes. 10th Congress of European Society for Evolutionary Biology, Cracow, Poland, 15-20 August 2005. p. 476. 8. Kortet, R., Vainikka, A., Rantala, M.J. & Taskinen J. 2004: Parasitism, reproduction and sexual selection of roach, Rutilus rutilus L. 10 th Jubilee Congress of the International Society of Behavioural Ecology, Jyväskylä, Finland 10-15 July 2004. p. 243. 7. Rantala, M.J., Kortet, R. & Vainikka, A. 2004: A mechanism for immunocompetence handicap in insects. 10 th Jubilee Congress of the International Society of Behavioural Ecology, Jyväskylä, Finland 10-15 July 2004. p. 176. 6. Taskinen, J., Kortet, R. & Vainikka, A. 2004: Condition, sex hormones, sexual ornaments and parasite resistance in a fish. 10 th Jubilee Congress of the International Society of Behavioural Ecology, Jyväskylä, Finland 10-15 July 2004. p. 215. 5. Taskinen, J., Korkea-Aho, T., Partanen, J.M., Kortet, R. & Vainikka, A. 2004: Papilloma disease of roach (Rutilus rutilus): a tool for ecosystem health assesment in large lakes? XXIX Congress of the International Association of Theoretical and Applied Limnology SIL, 8-14 August 2004, Lahti, Finland. Book of Abstracts, p. 271. 4. Vainikka, A., Kortet, R., Pirhonen, J. & Taskinen, J. 2004: Condition dependent sexual traits in tench (Tinca tinca L.). 10 th Jubilee Congress of the International Society of Behavioural Ecology, Jyväskylä, Finland 10-15 July 2004. p. 249. 3. Kortet, R., Vainikka, A. and Taskinen, J., 2002: Epidermic spawning papillomatosis in roach (Rutilus rutilus): sex and size dependence and between population differences. ICOPA X, Parasitology in a New World. Vancouver, Canada 4-9 August, p. 196. 2. Rantala, M.J., Jokinen, I., Kortet, R. Vainikka A. & Suhonen, J. 2002: Pheromones and immunocompetence. First European Conference on Behavioral Biology, Conflict & Resolution. Münster, Germany July 31 st - August 4 th, p. 91. 1. Kortet, R., Taskinen, J., Vainikka, A. & Ylönen, H. 2001: Role of breeding tubercles in intrasexual competition in male roach (Rutilus rutilus). XXVII International Ethological Conference, Tübingen, Germany 22-29 August 2001. - Advances in Ethology 36. Supplements to Ethology. p. 194. E) Popularization of science (31) 31. Vainikka, A. 2017: Tutkittua (research news). Vapaa-ajan Kalastaja, nro 3. in press. 30. Vainikka, A. & Olin, M. 2017: Tutkittua. Vapaa-ajan Kalastaja, nro 2. 32-33. 29. Vainikka, A. 2017: Tutkittua. Vapaa-ajan Kalastaja, nro 1: 30-31. 28. Eronen, A., Strandberg, U., Hyvärinen, P., Härkönen, L. & Vainikka A. 2016: Viljelty ahven olisi terveellistä. Suomen Kalastuslehti, 123, 28-30. 27. Kotakorpi, M. & Vainikka A. 2016: Istutuksille on paikkansa kalavesien hoidossa. Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaa-ajankalastaja.fi/?svk=80217 26. Virkkunen, A., Kotakorpi, M. & Vainikka A. 2016: Kestävä hoitokalastus. Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaa-ajankalastaja.fi/?lang=fi&svk=78460 25. Heikinheimo, O. & Vainikka, A. 2015: Saaristomeren kuhat kutistuneet. Kalastaja, 39, 7. 12

24. Kuparinen, A., Uusi-Heikkilä, S. & Vainikka, A. 2015: Isoja emokaloja tarvitaan. Suomen Kalastuslehti, 122, 20-22. 23. Vainikka, A. & Heikinheimo, O. 2015: Saaristomeren kuha kutistuu. Suomen Kalastuslehti, 122, 28-30. 22. Heinonen, M., Vainikka, A. & Huuskonen, H. 2014: Kuha - Kiitollinen istutuskala vai troijalainen? Suomen Kalastuslehti, 121, 28-29. 21. Jussila, J. & Vainikka, A. 2014: RapuKamu suojelee jokirapua - Rapurutto on pahin vihollinen. Vapaa-ajankalastaja, nro 3: 54-55. 20. Vainikka, A. 2014: Kalan vapauttaminen osana ekologisesti kestävää vapakalastusta. Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaa-ajankalastaja.fi/?lang=fi&svk=77684. 19. Vainikka, A. & Hyvärinen, P. 2014: Oulujärven taimenella on kasvupotentiaalia. Hauki-EM -lehti 2014. 18. Vainikka, A., Kortet, R., Hyvärinen, P. & Piironen, J. 2014: Parhaat istukkaat ovat villien kaltaisia. Suomen Kalastuslehti, 121, 22-24. 17. Vainikka, A. & Saari, O. 2014: Kuhan monet kasvot: ylikalastettu arvokala vai yliarvostettu arvokalojen surma? Vapaa-ajan Kalastaja, nro 3: 46-49. 16. Ojaharju, J. & Vainikka, A. 2013: Merimetso ja kalakannat. Suomen Vapaa-ajan Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaa-ajankalastaja.fi/?lang=fi&svk=76945. 15. Vainikka, A. & Ojaharju, J. 2013: Ei kala merestä kalastamalla lopu, vai loppuuko? Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaa-ajankalastaja.fi/?lang=fi&svk=76852 14. Vihtonen, M. & Vainikka, A. 2013: Vapaa-ajankalastaja virtavesien kunnostajana. Vapaa-ajan Kalastaja, nro 7. 13. Vainikka, A. & Hyvärinen, P. 2012: Kuhan alamitta - kädenvääntöä saaliin ja kuhan lisääntymisen välillä. Apaja nro 1, 18-19. 12. Hyvärinen, P. & Vainikka, A. 2012: Alamittaperusteinen kuhankalastus Oulujärvellä. Kalastaja 36 (nro 2): 6-7. 11. Vainikka, A. 2012: Tulisiko alamittoja nostaa vai poistaa ne kokonaan? Vapaa-ajan Kalastaja. Nro 1. 10. Vainikka, A. 2011: Vapaa-ajan kalastuksen järjestämisessä kalastajat ovat yhtä tärkeitä kuin kalat. Vapaa-ajan Kalastaja. Nro 6. 9. Vainikka, A. 2011: Uhanalaiset kalakannat Suomessa. Online article at web pages of Finnish Federation for Recreational Fishing: http://www.vapaaajankalastaja.fi/?lang=fi&svk=75497 8. Vainikka, A. 2010: Ovatko kaikki kalat yhtä helppoja pyydettäviä? Erä-lehti, nro 13. 7. Jussila, J., Kortet, R., Kokko, H., Henttonen, P., Makkonen, J. & Vainikka, A. 2010: Raputaudit haasteena. Suomen Kalastuslehti, 117: nro. 6 6. Kotakorpi, M., Kumpulainen, A. & Vainikka, A. 2007: Kalastusvalinta suosii vähätuottoisia kalakantoja - tulisiko isot kalat säästää? Suomen Kalastuslehti, 114: nro 6. 5. Vainikka, A., Korkea-aho, T., Kortet, R. & Taskinen, J. 2006: Särjen papillomatoosi vesistöjen tilan ilmentäjänä. Suomen Kalastuslehti, 113: nro 5. 4. Vainikka, A. 2005: Suutari vähän hyödynnetty arvokas luonnonvara. Suomen Kalastuslehti, 112: nro 6. 3. Vainikka, A. & Heikkilä J.J. 2005: Mateen pilkintää Pohjois-Päijänteellä 1999-2005. Suomen kalastuslehti, 112: nro 3. 2. Vainikka, A. 2001: Unohdetut onkikalamme - esittelyssä suutari ja sorva. Kalamies nro 8. 1. Vainikka, A. 2000: Jokivesistön kunnostuksen mutkat ja tavoitteet. Uutis-Vainikkala 13

nro 9, s.10. G) Theses (2) 2. Vainikka, A. 2005: Mechanisms of honest sexual selection and life history trade-offs in three cyprinid fishes. PhD. thesis. Jyväskylä University Printing House, Jyväskylä. 53 p. 1. Vainikka, A. 2001: Testosteronin, estradiolin ja kortisolin pitoisuuden vuodenaikaisvaihtelu sekä suhde immuunipuolustukseen, lisääntymiseen ja kasvuun särjellä (Rutilus rutilus) MSc. thesis. University of Jyväskylä. I) Published computer software (1) 1. Vainikka, A. 2002-2017: AV Bio-Statistics software package for biologists. Freely available at http://www.kotikone.fi/ansvain/ 14