Koagulaasipositiivisten stafylokokkien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.



Samankaltaiset tiedostot
Mikrobien lukumäärän määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka maljavalumenetelmällä.

Enterobakteerien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Clostridium perfringens -bakteerin määrittäminen ja tunnistaminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Alustavan Bacillus cereus -bakteerin ja itiöiden määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Campylobacter jejuni/coli/lari bakteerien osoittaminen ja tunnistaminen.

Yersinia pseudotuberculosis bakteerin osoittaminen

Mikrobiologisten tulosten laskeminen

Escherichia coli bakteerin lukumäärän määrittäminen elävistä simpukoista

Streptococcus equi ssp. zooepidemicus -bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen

Patogeenisten Vibrio suvun bakteerien osoittaminen elintarvikkeista

MRSA-kantojen seulonta rikastusten ja selektiivisen kiinteän kasvatusalustan avulla

Mikrobilääkejäämien toteaminen maidosta Delvotest SP-NT - testillä

Listeria monocytogenes bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen.

Clostridium perfringens -bakteerin määrittäminen ja tunnistaminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Listeria monocytogenes bakteerin määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

Listeria monocytogenes bakteerin määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka.

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

Ajankohtaista Eviran vertailulaboratoriotoiminnasta Standardisointiasiat

Ajankohtaista referenssilaboratoriosta. Marjaana Hakkinen Evira, Elintarvike- ja rehumikrobiologian laboratoriojaosto

Campylobacter jejuni/coli/lari- bakteerien osoittaminen siipikarjan umpisuolinäytteistä.

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2010

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY NET-FOODLAB OY NET-FOODLAB LTD

Utaretulehdusta aiheuttavien mikrobien eristäminen ja tunnistaminen

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 2/2012

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

MRSA-kantojen seulonta rikastuksen ja selektiivisen kiinteän kasvatusalustan avulla

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY NET-FOODLAB OY NET-FOODLAB LTD

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY NET-FOODLAB OY NET-FOODLAB LTD

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY VALIO OY, T&K, KEMIA JA MIKROBIOLOGIA

Listeria monocytogenes bakteerin osoittaminen ja tunnistaminen

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely1 1/2011. Kuvat ja teksti: Markku Koskela, ylilääkäri OYS, mikrobiologian laboratorio Oulu

ESBL-, AmpC- ja karbapenemaasituoton tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmillä

Elintarvikevalvontaa varten tehtävän näytteenoton hankkiminen yksityiseltä toimijalta. Taija Rissanen

Elatusaineiden laadunvarmistus esimerkki tulkinnasta ISOstandardimenetelmässä

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Pihkauutteen mikrobiologiaa

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2014

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2012

Elatusaineiden toimivuuden varmistamiseen käytettävien mikrobisuspensioiden (SkimMilk) valmistus

dekantterilaseja eri kokoja, esim. 100 ml, 300 ml tiivis, kannellinen lasipurkki

Kuiva-aine/kosteus Dry matter/moisture Tuhka Ash Hiilihydraatit ja energiasisältö Carbohydrate and energy content

VITEK2 -käyttökokemuksia

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Pihkauutteen mikrobiologiaa. Perusselvitys pihkajalosteen antimikrobisista ominaisuuksista

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY

Kasvatusajat mikrobiologisissa asumisterveystutkimuksissa

Pvm/Datum/Date Viljely, Valviran Asumisterveysasetuksen soveltamisohje 8/2016, Osa IV

Myymälässä pakattujen juustojen mikrobiologinen laatu ja käsittelyhygienia

Labquality Kudos- ja märkänäytteiden bakteeriviljely

Yersinioiden laboratoriodiagnostiikka: viljely ja fenotyypitys

REKISTERIOTE Hyväksytyt laboratoriot. Valvontaosasto Valvonnan kehittämisyksikkö

Ajankohtaista mikrobiologisista menetelmistä

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Sieni-itiöt, materiaalit arv Asumisterveysohje 2003 ja Asumisterveysopas 2009

Campylobacter jejuni/coli/lari- bakteerien osoittaminen siipikarjan umpisuolinäytteistä.

Mittausepävarmuuden laskeminen ISO mukaisesti. Esimerkki: Campylobacter

Bakteerien antibioottiherkkyyden tutkiminen kiekkoherkkyysmenetelmällä

Laboratoriotoiminnassa huomioitavat standardit ja oppaat. Giselle Nick-Mäenpää, pääarvioija

LIITE 1. REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

MEPA Soft Spray D. Suihkutettava kosmeettinen emulsio vedinten suojaamiseen lypsyn jälkeen. Kuvaus. Ominaisuudet

1) Maldi-Tof tunnistuksen käyttö indolitestin sijaan

Campylobacter jejuni/coli/lari bakteerien osoittaminen ja tunnistaminen.

Salmonella. Osoittaminen elintarvikkeista, rehuista, komposteista, orgaanisista lannoitevalmisteista ja biologisista torjunta-aineista.

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. Savo-Karjalan Ympäristötutkimus Oy, Kuopion laboratorio. Yrittäjäntie KUOPIO Puh.

Keräinnäytteen tutkiminen arv STM:n Asumisterveysohje 2003 ja Asumisterveysopas 2008

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, OES

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 1/2010

REKISTERIOTE Hyväksytty laboratorio

Elintarvikelaboratorioiden koulutuspäivät Workshop mikrobiologiset ohjearvot

Ajankohtaista asiaa vertailulaboratoriosta

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 4/2009

Bakteeriviljelystä löytyi sieni mitä tehdään?

Salmonella. Osoittaminen eläinten elin- ja ulostenäytteistä, tuotantoympäristönäytteistä ja elintarvikkeista MSRVmenetelmällä.

Olli Meurman Labquality-päivät

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2014

Laboratoriopalveluiden saatavuus, riittävyys ja käyttö elintarvikkeiden viranomais- ja omavalvonnassa

2) Rikastusliemi inkuboidaan aerobisesti Stomacher-pussissa, josta ilma on tarkoin poistettu, ei anaerobisesti.

ESBL-tuoton varmistaminen kiekkoherkkyysmenetelmällä

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 1/2012

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros

Asia MIKROBILÄÄKEAINEIDEN OSOITTAMINEN LIHANTARKASTUKSESSA MIKROBIOLOGISELLA MENETELMÄLLÄ. Asetuksen soveltamisala

Pvm/Datum/Date Viljely, Valviran Asumisterveysasetuksen soveltamisohje 8/2016, Osa IV. akkr NMKL 184:2006, muunneltu.

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 3/2013

Original Elche antimicrobi TM desinfiointiaineen testaus Legionella lajeille

Pvm/Datum/Date Aerobiset mikro-organismit akkr ISO :2013 Myös rohdosvalmisteet ja ravintolisät. Sisäinen menetelmä, ICP- OES

1) Jatkotutkimuksiin on lisätty serotyypitys sekä virulenssigeenien osoitus PCRmenetelmillä.

metallianalytiikan työkalu

FOSFORIPITOISUUS PESUAINEESSA

1) Siipikarjanlihaa tutkittaessa esirikastusliemen määrä on 1000 ml:n sijasta 225 ml.

AKKREDITOITU TESTAUSLABORATORIO ACCREDITED TESTING LABORATORY SEILAB OY SEILAB OY

Kvantitatiivisen PCR:n käyttö mikrobivaurion toteamisessa

Mikrobiologisten menetelmien uudistukset vuonna 2017

REKISTERIOTE Hyväksytty tai rekisteröity laboratorio. SeiLab Oy, Seinäjoen elintarvike- ja ympäristölaboratorio. Vaasantie 1 C SEINÄJOKI Puh.

Labquality Ulkoinen laadunarviointikierros Bakteeriviljely 1 2/2011

Elatusaineiden laadunvarmistus. Tuula Pirhonen

Transkriptio:

Vastuuhenkilöt Hakola Satu, Sivu/sivut 1 / 5 Koagulaasipositiivisten stafylokokkien määrittäminen. Pesäkelaskentatekniikka. 1 Menetelmäviitteet ja poikkeamat ISO 6888-1:1999,/ Amd 1:2003, muunnos. (Baird-Parker 37 C / 24 48 h, naudanveriagar 37 C / 24 h, koagulaasikoe) 1) Varmistettavista pesäkkeistä viljellään puhdasviljelmät veriagarille. 2) Tulokset ilmoitetaan toimintaohjeen LAB 703 mukaisesti. 2 Menetelmän tarkoitus ja soveltamisala Menetelmä soveltuu koagulaasipositiivisten stafylokokkien määrittämiseen elintarvikkeista ja rehuista. 3 Määritelmä(t) Staphylococcus-sukuun kuuluu fakultatiivisesti anaerobisia, gram- ja katalaasipositiivisia, kokkimuotoisia bakteereita. Osa lajeista on koagulaasipositiivisia. Koagulaasipositiivisten stafylokokkien joukossa on kantoja, jotka voivat tuottaa stafylokokkienterotoksiinia. Pääasiassa tällainen on S. aureus, mutta eräät S. intermedius ja S. hyicus kannat voivat myös muodostaa enterotoksiineja. 4 Periaate Koagulaasipositiiviset stafylokokit määritetään kvantitatiivisesti viljelemällä tunnettu määrä näytettä selektiiviselle alustalle. Inkuboinnin jälkeen lasketaan erikseen tyypillisen näköiset ja epätyypilliset pesäkkeet. Osa pesäkkeistä varmistetaan tutkimalla vapaan koagulaasin muodostus putkikoagulaasikokeella. 5 Mahdolliset virhelähteet Baird-Parkerilla voi kasvaa epätyypillisiä pesäkkeitä tai muuta häiritsevää kasvustoa. Koagulaasikokeen tuloksen tulkinta voi joskus olla vaikeaa, jos tulkinta suoritetaan suositusajan jälkeen.

Vastuuhenkilöt Hakola Satu, Sivu/sivut 2 / 5 6 Työturvallisuus Mikrobiologisessa laboratoriossa työskenneltäessä noudatetaan toimintaohjetta LAB 223. 7 Laitteet ja välineet 1) Mikrobiologinen perusvälineistö 2) Lämpökaappi 37 ± 1 C 3) Stomacher-homogenisaattori ja steriilejä Stomacher-400 pusseja tai tasoravistelija 8 Elatusaineet ja reagenssit 1) Peptonisuolaliuos, peptoni 0,1%, suola 0,85% (PEPSU) tai Dilucup, mikäli toimintaohjeessa LAB 703 ei toisin mainita 2) Baird Parker -agar (BP) maljoina tai pulloissa 3) Munankeltuais telluriitti -emulsio 4) Veriagar 5) Koagulaasi-putket 9 Kontrollikannat 1) Staphylococcus aureus EELA 6 10 Näytteen esikäsittely Esikäsittele näyte tarvittaessa toimintaohjeen LAB 702 mukaisesti. 11 Suoritus 11.1 Agarin sulatus ja temperointi 11.2 Viljely Sulata tarvittaessa Baird Parker -agar ja jäähdytä se 45 C:een ennen valamista toimintaohjeen LAB 702 mukaisesti. Lisää jäähtyneeseen agariin munankeltuais telluriitti -emulsiota 5 ml/100 ml agaria, ja vala maljoiksi. Kuivata maljoja ennen siirrostusta laminaarikaapissa 20 30 minuuttia. Tee näytteestä tarvittavat laimennokset toimintaohjeen LAB 728 mukaisesti. Siirrosta laimennoksista pintalevityksenä 0,1 ml Baird Parker -agarille (maljan halkaisija 90 mm), viljele rinnakkaiset maljat. Jos on tarpeen määrittää pieniä pitoisuuksia, voit siirrostaa näytteestä tai ensimmäisestä laimennoksesta 1,0 ml isolle (halkaisija 140 mm) Baird Parker -maljalle tai jakaa 1,0 ml kolmelle tavalliselle maljalle.

Vastuuhenkilöt Hakola Satu, Sivu/sivut 3 / 5 Inkuboi maljoja 37 C / 24 ± 2 h ja 48 ± 2 h. 11.3 Pesäkkeiden laskeminen Tarkastele maljoja sekä 24 h että 48 h inkuboinnin jälkeen Merkitse maljan pohjaan kaikki tyypilliset pesäkkeet 24 h kasvatuksen jälkeen. Merkitse 48 h kasvatuksen jälkeen uudet tyypilliset ja erikseen mahdolliset epätyypilliset pesäkkeet. Laske pesäkkeet maljoilta, joilla on korkeintaan150 tyypillistä pesäkettä. Tyypilliset pesäkkeet ovat mustia tai harmaita, kiiltäviä ja kuperia. Halkaisija on 1 1,5 mm 1 vrk jälkeen ja 1,5 2,5 mm 2 vuorokauden jälkeen. Pesäkkeitä ympäröi kirkas vyöhyke. Aivan pesäkkeen ympärillä kirkkaassa vyöhykkeessä näkyy usein kapea, läpinäkymätön rengas. Epätyypillisiä pesäkkeitä muodostavia koagulaasipositiivisia stafylokokkeja esiintyy esim. maitovalmisteissa ja katkaravuissa. Epätyypilliset stafylokokkipesäkkeet ovat kiiltävän mustia ja niitä voi ympäröidä kapea valkoinen rengas. Kirkastunut vyöhyke on tuskin nähtävissä tai sitä ei ole lainkaan. Samoin läpinäkymätön rengas puuttuu tai on heikosti näkyvä. Vaihtoehtoisesti epätyypilliset pesäkkeet voivat olla väriltään harmaita; näiltä pesäkkeiltä kirkastunut vyöhyke puuttuu. 12 Varmistuskokeet 12.1 Pesäkkeiden valinta varmistuskokeisiin Viljele tyypillisistä ja epätyypillisistä pesäkkeistä puhdasviljelmät veriagarille. Jos mahdollista, varmista vähintään viisi tyypillistä ja viisi epätyypillistä pesäkettä jokaiselta laskettavalta maljalta. Inkuboi 37 C 24 ± 2 h. Tee puhdasviljelmistä varmistuskokeet. Käytä positiivisena kontrollina S.aureus EELA 6 -kantaa. 12.2 Puhdasviljelmien tarkastelu Tarkastele puhdasviljelmän hemolyysiä ja pesäkemorfologiaa. Stafylokokit kasvavat veriagarilla sileinä, läpinäkymättöminä ja kuperina harmaanvalkoisina tai heikosti keltaoransseina pesäkkeinä. Pesäkkeiden halkaisija on 1 2 mm. Useimmat koagulaasipositiiviset kannat ovat hemolyyttisiä, mutta ei-hemolyyttisiäkin kantoja esiintyy. 12.3 Koagulaasipositiivisten stafylokokkien varmistaminen Varmista kantojen vapaan koagulaasin tuotto putkiagglutinaatiokokeella työohjeen LAB 2051 mukaisesti. S. aureuksen lisäksi ainoastaan S. intermedius ja osa S. hyicus subsp. hyicus - kannoista tuottavat vapaata koagulaasia. Toisin kuin S. aureus ja S. intermedius,

Vastuuhenkilöt Hakola Satu, Sivu/sivut 4 / 5 useimpien S. hyicus subsp. hyicus -kantojen koagulaasireaktio on kuitenkin myöhäinen ja heikko. 13 Tulokset 13.1 Tulosten laskeminen Laske tulos toimintaohjeen LAB 703 mukaisesti. 13.2 Tulosten ilmoittaminen Tulos ilmoitetaan koagulaasipositiivisten stafylokokkien määränä pmy/g tai ml näytettä toimintaohjeen LAB 703 mukaisesti. 14 Menetelmän validointi Koagulaasipositiivisten stafylokokkien määritysmenetelmän validointitulokset (De Buyser et al. 2003) on esitetty viitemenetelmän lisälehdessä 1 (Amendment 1, 2003). 15 Menetelmän status Standardimenetelmä Kansainvälisen menetelmäkokoelman menetelmä Virallinen menetelmä Referenssimenetelmä Sisäinen menetelmä 16 Laadunvarmistusmenetelmät Laboratorioiden väliset vertailututkimukset Menetelmävertailut Vertailukantojen/kontrollikantojen käyttö elintarvikemikrobiologiassa Siirrostetut näytteet Rinnakkaismääritykset 17 Viitteet ISO 6888-1 (1999) Microbiology of food and animal feeding stuffs Horizontal method for the enumeration of coagulase positive staphylococci (Staphylococcus aureus and other species) Part 1: Technique using Baird-Parker agar medium. Amendment 1 (2003) Inclusion of precision data. Alkuperäisen menetelmäohjeen liitteenä huoneessa B214 De Buyser, M.L., Lombard, B., Shulten, S.M., In t Veld, P.H., Scotter, S.L., Rollier, R., Lahellec, C. (2003) Validation of EN ISO standard methods 6888 part 1 and 2:1999,

Vastuuhenkilöt Hakola Satu, Sivu/sivut 5 / 5 Enumeration of coagulase-positive staphylococci in foods. Int. J. Food Microbiol., 83(2), 185-194. 18 Muutokset edelliseen versioon 17.2.2014 Evira 3466/5. Menetelmästä poistettu Staphylococcus aureus bakteerin määrittäminen ja muutoksen myötä toinen kontrollikanta Staphylococcus epidermidis EELA 40. Työturvallisuuden toimintaohjeen numero korjattu. Toiseksi vastuuhenkilöksi vaihdettu Hakkisen tilalle Annukka Markkula. Ohjeen laatijat: Satu Hakola ja Annukka Markkula.