Hapettuneiden ja nitrattujen rasvahappojen aktivoimat signaalitiet
|
|
- Ritva Rantanen
- 9 vuotta sitten
- Katselukertoja:
Transkriptio
1 Henna-Kaisa Jyrkkänen Itä-Suomen yliopisto Lääketieteen syventävien tutkielma Hapettuneiden ja nitrattujen rasvahappojen aktivoimat signaalitiet Johdanto Tyydyttymättömät, fosfoglyseroliryhmästään esteröityneet sekä vapaat rasvahapot reagoivat soluissa reaktiivisten hapen tai typen yhdisteiden (reactive oxygen species; ROS, reactive nitrogen species; RNS) kanssa, esimerkiksi tulehdustiloissa, kuten ateroskleroosissa. Muodostuvat hapen ja typen reaktiiviset yhdisteet ovat elektrofiilisiä molekyylejä, joilla on rakenteessaan elektronivajaus uloimmalla sidosorbitaalilla, mikä tekee yhdisteistä voimakkaasti reagoivia [1]. Elektrofiiliset rasvahapot reagoivat edelleen nukleofiilisten molekyylien tai niiden osien, kuten proteiinien kysteiinitähteiden kanssa. Nukleofiilisillä molekyyleillä on uloimmalla sidosorbitaalilla vapaa elektronipari, jonka ne pyrkivät luovuttamaan muodostaen kovalenttisen sidoksen. Elektrofiilit osallistuvat kemiallisiin reaktioihin, joissa muokataan signalointiteiden aktivaatiossa ja solun hapetustasapainon säätelyssä tärkeitä proteiineja näiden translaation jälkeen. Proteiinien kysteiinitähteet ovat fysiologisessa ph:ssa ionisoituneessa muodossaan, jolloin ne voivat reagoida elektrofiilisten rasvahappojen tyydyttymättömättömien karbonyyliryhmien kysteiinitähteiden kanssa Michaelin additioreaktiolla, johtaen proteiinin rakenteen ja toiminnan muovautumiseen [2]. Tämän työn tarkoituksena on esitellä ja tehdä yhteenveto kolmesta signaalitiestä, jotka aktivoituvat elektrofiilisten rasvahappojen vaikutuksesta edellä kuvattujen reaktioiden kautta sekä lisäksi mahdollisesti vaikuttavat toinen toistensa toimintaan. Nämä signalointitiet ovat Keap1- Nrf2-signalointitie (Kelch-like-ECH-associated protein 1-Nuclear Factor E2-Related Factor 2-signaling pathway), lämpöshokkivaste (heat shock response; HSR) ja laskostumattomien proteiinien aktivoima vaste (unfolded protein response, UPR). Elektrofiilisten rasvahappojen muodostuminen On havaittu, että hapen ja typen reaktiivisten yhdisteiden lisäksi näiden reaktiotuotteina syntyneet tyydyttymättömät rasvahapot voivat reagoida edelleen muiden molekyylien kanssa tulehdustiloissa aktivoiden signalointiteitä esimerkiksi ateroskleroosin patogeneesissä. Reagoivia rasvahappoja ovat esimerkiksi solukalvojen rakenteeseen kuuluvat monityydyttymättömät rasvahapot (PUFA), joista muodostuu useiden patologisten tilojen yhteydessä aktiivisesti reagoivia molekyylejä. Ateroskleroosissa biologisesti aktiiviset rasvahapot syntyvät pääasiassa tulehdussoluissa. Michaelin additioreaktioiden lisäksi hapettumisen aiheuttama molekyylien pilkkoutuminen johtaa esimerkiksi biologisesti aktiivisten hydroperoksidien, isoprostaanien ja lyhytketjuisten aldehydien, kuten 4-hydroksyylinonenaali (HNE), muodostumiseen monityydyttömättömistä rasvahapoista [3,4]. Tärkeitä ovat myös arakidonihapon eientsymaattisessa hapettumisessa muodostuvat prostaanirenkaat. J 2 -sarjan prostaglandiinit ovat prostaglandiini D 2 :n dehydraatiotuotteita, joista muodostuu esimerkiksi 15-d-PGJ 2 - molekyyli, jolla tiedetään olevan vaikutuksia useisiin signalointiteihin [5]. Samankaltaisia rakenteita esiintyy myös minimaalisesti modifioidun matalatiheyksisen lipoproteiinipartikkelin (mmldl) rasvahapoissa. Yksi näistä
2 on 1-palmityyli-2-(5,6-epoksi-isoprostaani e2-)-sn-glysero-3-fosfokoliini (PEIPC), jonka tiedetään aktivoivan UPR- ja Keap1-Nrf2-signaaliteitä [6-8]. Hapettuneiden fosfolipidien tiedetään olevan mukana ateroskleroosin varhaisvaiheissa ohjaamassa signaaliteiden aktivoitumista [9]. Rasvahappojen hapettumisen loppuvaiheen tuote, HNE, sen sijaan esiintyy ateroskleroottisissa leesioissa ja hapettuneessa LDL:ssä [10]. Hapettumisen lisäksi rasvahapot voivat reagoida typpioksidin kanssa, jolloin muodostuu nitrattuja rasvahappoja, kuten nitrattua öljyhappoa (OA-NO 2 ). Nitratut rasvahapot reagoivat nukleofiilisten aminohappojen, kuten tioliryhmien, kanssa johtaen signalointiteiden aktivaatioon [11]. Fysiologisesti näitä yhdisteitä syntyy esimerkiksi iskemia-reperfuusiovauriossa [12]. Keap1-Nrf2-signalointitie Keap1-Nrf2-signalointitie säätelee soluja suojaavien geenien ilmentymistä vasteena hapetus- ja elektrofiiliselle stressille. Keap1 on solun hapetustasapainolle herkkä proteiini, jonka modifioituminen johtaa Nrf2-transkriptiotekijän aktivoitumiseen. Aktivoiduttuaan Nrf2 kulkeutuu tumaan, jossa se sitoutuu antioksidanttivaste-elementtiin (ARE) kohdegeeniensä säätelyalueilla, aktivoiden geenien luennan. Keap1 proteiini sisältää viisi aluetta, jotka ohjaavat sen toimintaa. tramttrack and bric-a- brac domain (BTB)- alueen välityksellä kaksi Keap1-molekyyliä sitoutuvat toisiinsa ja muodostavat cherry-bob rakenteen [13]. Samalta alueelta Keap1 on myös sitoutuneena ubikitiiniligaasi Cullin3:n, joka liittää ubikitiinin Nrf2:een. Nrf2 sitoutuu Keap1:n c-terminaalisessa päässä olevaan Kelch-alueeseen [14]. Fysiologisissa olosuhteissa Keap1 sitoo Nrf2:n itseensä, toimien adapterina Cullin3-ligaasin ja Nrf2:n välillä. Cullin3-ligaasi ubikitinoi Nrf2:n ja Nrf2 ohjautuu proteosomaalisesti hajotettavaksi. Keap1:ssä on BTB- ja Kelch-alueiden välissä IVR (intervening region), joka sisältää useita kysteiinitähteitä. Kysteiinitähteet ovat herkkiä reagoimaan elektrofiilisten yhdisteiden, kuten hapettuneiden tai nitrattujen rasvahappojen kanssa [15,16]. Kysteiinitähteen reaktio johtaa Keap1:n konformaation muutokseen sekä edelleen Nrf2:n ubikitinaation ja hajotuksen estymiseen. Kaksi toisiinsa sitoutunutta Keap1-molekyyliä sitovat Kelch-alueillaan yhden Nrf2- molekyylin kahdesta eri kohdasta. Keap1:n kysteiinitähteen modifikaation seurauksena toisen Keap1:n sidos irtoaa, johtaen Nrf2:n orientaation muutokseen ja ubikitinaation epäonnistumiseen [17]. Nykykäsityksen mukaan Nrf2 ei kuitenkaan irtoa kompleksista vaan antaa mahdollisuuden uudistuotetuille Nrf2-molekyyleille kulkeutua tumaan ja aktivoida kohdegeenien ilmentyminen [18]. Tumassa Nrf2 muodostaa kompleksin pienten Maf-proteiinien kanssa ja tämä kompleksi edelleen sitoutuu ARE:n kohdegeenien säätelyalueella [19]. Nrf2:n kohdegeenit on identifioitu profiloimalla Nrf2-poistogeenisten hiirten geenien ilmentymistä. Kohdegeenit voidaan luokitella useisiin kategorioihin, joista tärkeimpiä ovat vierasaineiden metaboliaan osallistuvia proteiineja koodaavat geenit, kuten glutationi-s-transferaasi (GST), NAD(P)H-kinoni oksidoreduktaasi (NQO1), hemioksygenaasi-1 (HO1) ja glutationin synteesiä säätelevä glutationikysteiiniligaasi (GCL). Lisäksi Nrf2 aktivoi proteosomaalisia geenejä ja chaperoniproteiineja osoittaen Nrf2:n tärkeän roolin vaurioituneiden proteiinien korjaamisessa ja poistamisessa [20,21]. Keap1 elektrofiilien sensorina Kemiallisista aineista monet, jotka johtavat ARE-välitteisten geenien luennan aktivoitumiseen, on identifioitu tutkimalla NQO1-geenin säätelyalueen aktivaatiota [22]. Tulokset osoittivat aktivaation tapahtuvan useiden, keskenään kemiallisesti hyvin erilaisten aineiden vaikutuksesta. Yhteistä näille aineille on, että ne kaikki reagoivat kysteiinitähteiden kanssa [23]. On myös havaittu, että ARE:a aktivoivat yhdisteet sitoutuvat Keap1:een, osoittaen Keap1:n roolin ARE:n aktivaatiossa ekso- ja endogeenisten
3 yhdisteiden vaikutuksesta. Keap1:n 27 kysteiinitähdettä ovat reaktiovoimakkuuksilta erilaisia ja kysteiinien välillä on herkkyyseroja erilaisille kemiallisille aineille. ARE-aktivaation kannalta tärkeimmiksi kysteiinitähteiksi (Cys) ovat osoittautuneet Cys151, Cys273 ja Cys288 [15,24]. Kysteiinitähteiden funktionaalisuus on osoitettu reportterigeenimenetelmällä ja koe-eläinmalleissa mutatoimalla Keap1:n kysteiinejä yksi kerrallaan. Reportterigeenimenetelmää käytettäessä Keap1-proteiinin toiminnan kannalta merkityksellisen kysteiinin mutaatio estää tai vähentää reportterikonstruktin aktivoitumista. Kysteiinien roolissa voi olla myös eroja fysiologisten olosuhteiden ja solujen stressitilanteen välillä siten, että eri kysteiineillä on erilainen tai erisuuruinen vaikutus olosuhteista riippuen. Reportterimenetelmän lisäksi kysteiinien merkitys on myös osoitettu eläinmallissa, jossa siirtogeenisen hiiren genomista on mutatoitu Cys273 ja Cys288 [25]. Mutaatio johtaa Keap1:n kyvyttömyyteen ohjata Nrf2 hajotettavaksi sekä jatkuvaan Nrf2:n aktivaatioon, mikä ilmeni lisääntyneenä kohdegeenien ilmentymisenä. Cys273 ja Cys288 vaikuttavat olevan tärkeitä fysiologisissa olosuhteissa tapahtuvassa Keap1:n säätelyssä. Sen sijaan Cys151 on tärkeä elektrofiilisten yhdisteiden vaikutuksesta tapahtuvassa aktivaatiossa. Reportterigeenimenetelmällä ja seeprakaloissa tehdyissä mutaatiokokeissa on osoitettu, että paljon käytetyt ARE-aktivaattorit, kuten sulforafaani ja tertbutyylihydrokinoni, aktivoivat ARE-geenien ilmentymistä Keap1:n Cys151-riippuvaisesti [17,24]. Fysiologiseen geenien ilmentymistasoon Cys151:n mutaatiolla sen sijaan ei ole osoitettu olevan vaikutusta. Cys151:n modifioituminen häiritsee Cullin3-ubikitiiniligaasin toimintaa, mahdollisesti muuttamalla molekyylikompleksin konformaatiota [26]. Nrf2:n aktivaatiomekanismi Tutkimustulokset ovat osoittaneet, että Keap1:n kysteiinien modifikaatio johtaa Nrf2:n kertymiseen tumaan ja Nrf2:n kohdegeenien ilmentymisen lisääntymiseen. Aikaisemmin oletettiin, että Keap1 fysiologisissa olosuhteissa sitoo Nrf2:n sytoplasmaan ja, että elektrofiilinen stressi johtaa Nrf2:n vapautumiseen, ohjautumiseen tumaan ja kohdegeenien luennan aktivaatioon. Sittemmin on kuitenkin osoitettu, että Keap1 ja Nrf2 eivät irtoa toisistaan ja uusia malleja aktivaatiomekanismeista on esitetty. Fysiologisissa olosuhteissa Keap1 toimii adapterina Cullin3-ubikitiiniligaasille, johtaen nopeaan Nrf2:n ubikitinaatioon ja hajotukseen [27]. Nrf2 on sitoutuneena Keap1:n kahdelta alueelta (DLG ja ETGE) ja lysiinitähteet, joihin ubikiitiini kiinnittyy, sijaitsevat näiden sitoutumisalueiden välissä. Elektrofiilisessä stressissä, Keap1:n kysteiinit modifioituvat ja konformaatio muuttuu, johtaen sidoksista heikomman katkeamiseen Keap1:n ja Nrf2:n DLG-alueiden välillä [28]. Nrf2:n ETGE-alueen ja Keap1:n välinen sidos säilyy, mutta ubikitinaatio estyy. On myös osoitettu, että tietyt ARE-aktivaattorit, kuten sulforaani, häiritsevät Keap1:n ja Cullin3-ligaasin välistä sidosta [29]. Myös Keap1:n kulkemista sytoplasman ja tuman välillä on ehdotettu Nrf2-aktivaation malliksi [30]. Hypoteesin mukaan Keap1 toimisi fysiologisissa olosuhteissa Nrf2:n kuljettajaproteiinina tumasta pois ja elektrofiiliset yhdisteet vaikuttaisivat estämällä Keap1:n tumalokalisaation. Hypoteesia vastaan puhuu kuitenkin osoitus siitä, että vain pieni osa Keap1:n kokonaismäärästä on tumassa, joten hypoteesin mukainen säätely voisi olla vain marginaalista. Aktivoivien aineiden on myös esitetty vaikuttavan ohjaamalla ubikitinaation kohdentumisen Keap1:teen Nrf2:n sijaan [31]. Useiden proteiinikinaasien on myös osoitettu vaikuttavan Nrf2:n säätelyyn. Proteiinikinaasi C fosforyloi Nrf2:n seriini 40:tä, mikä johtaa Nrf2:n ja Keap1:n välisen sidoksen katkeamiseen [32]. Myös proteiinikinaasin RNAn kaltaisen ER-kinaasin (PERK) on osoitettu forforyloivan Nrf2:n johtaen Nrf2:n kertymiseen tumaan [33]. Hiljattain on myös osoitettu p21- ja sequestosome-1 proteiinien kilpailevan sitoutumisesta Keap1:n ja Nrf2:n kanssa häiriten Keap1-Nrf2-kompleksin muodostusta [34].
4 Lämpöshokkivaste ARE-välitteisen geenien säätelyn lisäksi soluilla on myös muita signalointiteitä, jotka aktivoituvat vasteena endogeeniselle tai eksogeeniselle stressille. HSR on ohjelmoitu vaste monille erilaisille akuuteille ja kroonisille tiloille, kuten lämmölle, metabolisille säätelyhäiriöille, elektrofiileille ja tulehdusta edistäville reaktiivisille yhdisteille [35]. HSR on säädelty transkriptionaalisella tasolla lämpöshokkitekijöiden kautta ja merkittävin rooli on lämpöshokkitekijä 1:llä (heat shock factor 1, HSF1) [36]. HSF1:n aktivaatiomekanismia ei vielä täysin tunneta. Tiedetään, että HSF1 on inaktiivisena solulimassa muodostaen kompleksin lämpöshokkiproteiini 90:n kanssa. Lämpöshokkivasteen aktivoituessa HSF1 käy läpi moniportaisen muokkausketjun, siirtyy tumaan ja muodostaa toisten HSF1-molekyylien kanssa trimeerin, joka sitoutuu kohdegeenin säätelyalueella olevaan lämpöshokkivaste-elementtiin (heat shock element, HSE) käynnistäen kohdegeenien luennan. HSF1:n kohdegeenejä ovat esimerkiksi chaperonit, proteaasit ja monet muut proteiinit, jotka suojaavat soluja proteotoksista stressiä vastaan [36]. Elektrofiilisten rasvahappojen, kuten HNE:n [37], 15d-PGJ 2 :n [38] ja OA-NO 2 :n [39], on osoitettu aktivoivat HSF1-riippuvaisesti lämpöshokkivasteen geenejä. Elektrofiilisten rasvahappojen tiedetään häiritsevän solulimassa HSF1:n ja sen toimintaa estävien proteiinien välistä sidosta, johtaen sidoksen katkeamiseen [37]. On myös osoitettu, että elektrofiiliset rasvahapot voivat sitoutua HSP90:n kysteiinitähteisiin, mikä johtaa HSP90:n ja HSF1:n välisen kompleksin rikkoutumiseen ja HSF1:n aktivaatioon [40]. Sekä HSR- että Keap1-Nrf2-signaalitiet aktivoituvat samojen elektrofiilisten rasvahappojen vaikutuksesta, mutta näiden kahden signaalitien vaikutuksista toisiinsa ei ole selkeää käsitystä. Geenien ilmentymisen genominlaajuinen profilointi endoteelisoluista, joista Nrf2 on hiljennetty pieniä häiritseviä RNA-molekyylejä hyödyntämällä ja jotka lisäksi on käsitelty OA-NO 2 :lla, on osoittanut, että Nrf2:lla ei ole vaikutusta HSF1:n kohdegeenien ilmentymiseen [39]. Myös HSF1-poistogeenisiä fibroblasteja tutkimalla on osoitettu, ettei HSF1:n puutteella ole vaikutusta Nrf2:n kohdegeenien ilmentymiseen [41]. Havainnot osoittavat, että signaalitiet ovat suurelta osin itsenäisiä ja toisistaan riippumattomia. Toisaalta on myös osoitettu, että lämpöshokki johtaa HSP90:n ja Nrf2:n inhibiittorin, Keap1:n, interaktioon ja siten Nrf2:n irtautumiseen Keap1-Cullin3-kompleksista sekä aktivaatioon [42]. Lisäksi myös vaihtoehtoisesti pilkkoutunut eukaryoottien elongaatiotekijä 1B -proteiini voi aktivoida sekä HSR- että Keap1-Nrf2-signaaliteitä [43]. Tulokset antavat siten viitettä siitä, että nämä kaksi signaalitietä jakaisivat yhteisiä signalointiproteiineja reittien alkuosissa, mikä voisi selittää signaaliteiden aktivoitumisen samojen aktivoivien aineiden vaikutuksesta. Laskostumattomien proteiinien aktivoima signaalitie (unfolded protein response, UPR) Solulimakalvostolla muodostetaan eritettävät ja solukalvon läpäisevät proteiinit, minkä vuoksi solulimakalvoston toiminta on tarkoin säädeltyä ja herkkä toiminnan häiriöille. Väärin laskostuneiden tai laskostumattomien proteiinien kerääntyminen solulimakalvostoon aktivoi mukauttavan signalointitien, UPR:n, joka tunnetaan myös nimellä solulimakalvoston stressivaste [44]. UPR modifioi geenien ilmentymistä ja proteiinien translaatiota, tarkoituksena säilyttää ja tukea solulimakalvoston kykyä ylläpitää proteiinien laskostusta ja tasapainoa. Pitkittynyt solulimakalvoston stressi johtaa apoptoosin aktivoitumiseen solujen korjauskapasiteetin ylittyessä. Solujen sopeutumista lisäävät ja apoptoosiin johtavat signalointitiet ovat tärkeitä ateroskleroosin synnyssä. UPR koostuu kolmesta signalointireitistä, jotka alkutilanteessa aktivoituvat saman säätelyproteiinin, solulimakalvoston chaperoniproteiini GRP78:n, kautta. GRP78 sitoo signalointireittejä ohjaavat säätelytekijät solulimakalvostolle fysiologisissa olosuhteissa. Aktivoituvat säätelytekijät ovat ATF6 (activating transcription factor-6), IRE1 (inositol requiring factor-1) ja
5 PERK. Signalointiteiden aktivoituminen johtaa säätelyproteiinien ja GRP78:n välisen kompleksin purkautumiseen ja välivaiheiden kautta kohdegeenien luennan aktivoitumiseen signalointireitin aktivoimien säätelytekijöiden välityksellä. ATF6 kuljetetaan GRP78:sta vapautumisen jälkeen golgin laitteelle, jossa proteaasit pilkkovat sen lyhyempään muotoon. ATF6:sta muodostunut lyhyt muoto kulkeutuu tumaan ja sitoutuu kohdegeeniensä säätelyalueelle [44]. ATF6:n kohdegeenejä ovat monet apoptoosin säätelyyn osallistuvat geenit sekä verisuonikasvutekijät. IRE1 on solulimassa toimiva proteiini, joka muokkaa XBP1-proteiinin (X-box binding protein-1) aktiiviseen muotoon. Lyhyt XBP1 siirtyy tumaan ja aktivoi proteiinien muovautumiseen ja hajotukseen osallistuvien kohdegeeniensä luennan [44]. PERK aktivoi fosforyloimalla kaksi säätelytekijää, Nrf2:n ja ATF4:n [33,45]. Molemmilla säätelytekijöillä on omat sitoutumispaikkansa ja kohdegeeniensä. Nrf2:n toiminta on ollut esillä aikaisemmin tässä yhteenvedossa. ATF4 säätelee erityisesti pitkittyneissä stressiolosuhteissa apoptoosia edistävien geenien ilmentymistä [46]. Solujen transkriptionaalisella profiloinnilla on havaittu UPR:n kohdegeenien aktivoituvan HNE ja hapettuneen 1-palmityyli-2-arakinoni-sn-glysero-3-fosfokoliini (oxpapc) altistusten jälkeen [47,48]. OxPAPC on yhdiste, joka sisältää kemialliselta rakenteeltaan hyvin erilaisia molekyylejä ja UPR-aktivaation kannalta oleellisin näyttää olevan PEIPC, joka sisältää rakenteellisesti prostaglandiinien kaltaisen rengasrakenteen [49]. Keskenään hyvin erilaiset elektrofiiliset rasvahapot pystyvät aktivoimaan UPR:n ja toistaiseksi rasvahappojen vaikutusmekanismi on jäänyt epäselväksi. Käyttämällä fluoresoivalla merkkiaineella leimattuja molekyylejä, on osoitettu joidenkin elektrofiilisten rasvahappojen sitoutuvan GRP78:n ja kerääntyvän solulimakalvostolle [40,50]. Näiden tulosten perusteella on esitetty, että UPR:n aktivaation taustalla voisi olla GRP78:n suora modifikaatio elektrofiilisten yhdisteiden vaikutuksesta, mikä johtaisi signaaliteiden aktivoitumiseen [51]. Hapettuneiden fosfolipidien on toisaalta myös osoitettu vaikuttavan solulimakalvoston biofysikaalisiin ominaisuuksiin kerääntymällä kalvoille vastaavalla tavalla kuin vapaa kolesteroli kerääntyy makrofaageihin. Solukalvoilla sijaitsevien fosfolipidien hapettuminen aiheuttaa kalvon laajenemisen ja muuttaa orientaatiota huonommaksi, siten että hapettuneet ryhmät kääntyvät vesifaasiin päin [52]. Nämä muutokset solulimakalvoston ominaisuuksissa vaikuttavat kalvoproteiinien rakenteeseen ja toimintaan, ja on spekuloitu, että solukalvon läpi kulkevat proteiinit, kuten GRP78, voisivat aktivoitua tätä kautta. Hypoteesia tukee havainto, että fosfatidyylietanoliamiinilla modifioitu ketoaldehydi kerääntyy solulimakalvostolle ja aktivoi UPR:n vaikuttamatta yhdenkään proteiinin prosessointiin tai reaktiivisuuteen [53]. UPR:llä ja Keap1-Nrf2-signaaliteillä on yhtymäkohtia. UPR-aktivaattorit aktivoivat Nrf2:n PERK-välitteisen fosforylaation kautta [33]. Huolimatta siitä, että oxpapc aktivoi sekä UPR:n että Nrf2:n, ei PERK-välitteisellä fosforylaatiolla näytä olevan suurta merkitystä Nrf2:n aktivaation kannalta [8]. Tämä on osoitettu mittaamalla Nrf2-kohdegeenien ilmentymistä PERK-poistogeenisten hiirten fibroblasteista oxpapc käsittelyn jälkeen ja tulokset osoittivat, että kohdegeenien ilmentyminen oli hieman vähentynyt, mutta ei täysin estynyt soluissa, joista PERK:iä ei ilmennetty lainkaan. ATF4:n on myös osoitettu olevan Nrf2:n kohdegeeni, hiljentämällä Nrf2 ihmisen verisuonen endoteelisoluissa. Lisäksi on osoitettu kromatiiniimmunopresipitaatiolla, että Nrf2 sitoutuu ATF4:n säätelyalueelle [54].
6 Yhteenveto Tämän työn tarkoituksena on vetää yhteen nykytietämystä elektrofiilisten rasvahappojen roolista stressisignalointiteiden aktivoitumisessa. Kolme vastetta: Keap1-Nrf2, lämpöshokkivaste ja UPR, ovat pääasiallisesti itsenäisesti vaikuttavia signalointiteitä, jotka aktivoituvat samojen yhdisteiden vaikutuksesta ja osittain samankaltaisin mekanismein. Signalointiteiden välillä on yhteyksiä ja ne mahdollisesti hienosäätävät toinen toistensa toimintaa. Kaikilla on merkitystä inflammaatioprosesseissa, kuten ateroskleroosissa, mutta spesifisistä rasvahappoyhdisteistä, niiden muodostumisesta in vivo ja biologisen merkityksen tärkeydestä ei ole vielä muodostunut yhtenäistä käsitystä. Meidän ehdotuksemme on, että yksittäisen rasvahapon vaikutus voi olla vähäinen, mutta merkitykselliseksi nousee useiden toimijoiden samanaikainen ja samansuuntainen vaikutus usean signaalitien aktivaation kautta. Molekulaaristen mekanismien selvittäminen on tärkeää ja yksityiskohtien tuntemisen myötä voidaan löytää terapeuttisia vaikutuskohtia, joiden kautta voidaan vaikuttaa signaaliteiden aktivoitumiseen tai hiljenemiseen. Tulevaisuudessa uudet biolääketieteen menetelmät, kuten massaspektrometria ja proteomiikka, toimivat merkittävinä työkaluina tutkittaessa elektrofiilisten rasvahappojen roolia solujen toiminnassa. REFERENCES 1 Rudolph, T. K. and Freeman, B. A. (2009) Transduction of redox signaling by electrophile-protein reactions. Sci. Signal. 2, re7. doi: /scisignal.290re7; /scisignal.290re7 2 Winterbourn, C. C. and Hampton, M. B. (2008) Thiol chemistry and specificity in redox signaling. Free Radic. Biol. Med. 45, doi: /j.freeradbiomed ; /j.freeradbiomed Bochkov, V. N., Philippova, M., Oskolkova, O., Kadl, A., Furnkranz, A., Karabeg, E., Afonyushkin, T., Gruber, F., Breuss, J., Minchenko, A., Mechtcheriakova, D., Hohensinner, P., Rychli, K., Wojta, J., Resink, T., Erne, P., Binder, B. R. and Leitinger, N. (2006) Oxidized phospholipids stimulate angiogenesis via autocrine mechanisms, implicating a novel role for lipid oxidation in the evolution of atherosclerotic lesions. Circ. Res. 99, doi: /01.res ee 4 Bochkov, V. N., Oskolkova, O. V., Birukov, K. G., Levonen, A. L., Binder, C. J. and Stockl, J. (2010) Generation and biological activities of oxidized phospholipids. Antioxid. Redox Signal. 12, doi: /ars Kansanen, E., Kivela, A. M. and Levonen, A. L. (2009) Regulation of Nrf2-dependent gene expression by 15-deoxy-Delta12,14-prostaglandin J2. Free Radic. Biol. Med. 47, doi: /j.freeradbiomed Gargalovic, P. S., Gharavi, N. M., Clark, M. J., Pagnon, J., Yang, W. P., He, A., Truong, A., Baruch-Oren, T., Berliner, J. A., Kirchgessner, T. G. and Lusis, A. J. (2006) The unfolded protein response is an important regulator of inflammatory genes in endothelial cells. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 26, doi: /01.atv a1 7 Oskolkova, O. V., Afonyushkin, T., Leitner, A., von Schlieffen, E., Gargalovic, P. S., Lusis, A. J., Binder, B. R. and Bochkov, V. N. (2008) ATF4-dependent transcription is a key mechanism in VEGF up-regulation by
7 oxidized phospholipids: Critical role of oxidized sn-2 residues in activation of unfolded protein response. Blood. 112, doi: /blood Jyrkkanen, H. K., Kansanen, E., Inkala, M., Kivela, A. M., Hurttila, H., Heinonen, S. E., Goldsteins, G., Jauhiainen, S., Tiainen, S., Makkonen, H., Oskolkova, O., Afonyushkin, T., Koistinaho, J., Yamamoto, M., Bochkov, V. N., Yla-Herttuala, S. and Levonen, A. L. (2008) Nrf2 regulates antioxidant gene expression evoked by oxidized phospholipids in endothelial cells and murine arteries in vivo. Circ. Res. 103, e1-9. doi: /circresaha Navab, M., Ananthramaiah, G. M., Reddy, S. T., Van Lenten, B. J., Ansell, B. J., Fonarow, G. C., Vahabzadeh, K., Hama, S., Hough, G., Kamranpour, N., Berliner, J. A., Lusis, A. J. and Fogelman, A. M. (2004) The oxidation hypothesis of atherogenesis: The role of oxidized phospholipids and HDL. J. Lipid Res. 45, doi: /jlr.r jlr Napoli, C., D'Armiento, F. P., Mancini, F. P., Postiglione, A., Witztum, J. L., Palumbo, G. and Palinski, W. (1997) Fatty streak formation occurs in human fetal aortas and is greatly enhanced by maternal hypercholesterolemia. intimal accumulation of low density lipoprotein and its oxidation precede monocyte recruitment into early atherosclerotic lesions. J. Clin. Invest. 100, doi: /jci Freeman, B. A., Baker, P. R., Schopfer, F. J., Woodcock, S. R., Napolitano, A. and d'ischia, M. (2008) Nitro-fatty acid formation and signaling. J. Biol. Chem. 283, doi: /jbc.r ; /jbc.R Rudolph, V., Rudolph, T. K., Schopfer, F. J., Bonacci, G., Woodcock, S. R., Cole, M. P., Baker, P. R., Ramani, R. and Freeman, B. A. (2010) Endogenous generation and protective effects of nitro-fatty acids in a murine model of focal cardiac ischaemia and reperfusion. Cardiovasc. Res. 85, doi: /cvr/cvp Ogura, T., Tong, K. I., Mio, K., Maruyama, Y., Kurokawa, H., Sato, C. and Yamamoto, M. (2010) Keap1 is a forked-stem dimer structure with two large spheres enclosing the intervening, double glycine repeat, and C-terminal domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 107, doi: /pnas ; /pnas Itoh, K., Wakabayashi, N., Katoh, Y., Ishii, T., Igarashi, K., Engel, J. D. and Yamamoto, M. (1999) Keap1 represses nuclear activation of antioxidant responsive elements by Nrf2 through binding to the aminoterminal Neh2 domain. Genes Dev. 13, Kansanen, E., Bonacci, G., Schopfer, F. J., Kuosmanen, S. M., Tong, K. I., Leinonen, H., Woodcock, S. R., Yamamoto, M., Carlberg, C., Yla-Herttuala, S., Freeman, B. A. and Levonen, A. L. (2011) Electrophilic nitrofatty acids activate NRF2 by a KEAP1 cysteine 151-independent mechanism. J. Biol. Chem. 286, doi: /jbc.m Levonen, A. L., Landar, A., Ramachandran, A., Ceaser, E. K., Dickinson, D. A., Zanoni, G., Morrow, J. D. and Darley-Usmar, V. M. (2004) Cellular mechanisms of redox cell signalling: Role of cysteine modification in controlling antioxidant defences in response to electrophilic lipid oxidation products. Biochem. J. 378, doi: /bj
8 17 Zhang, D. D. and Hannink, M. (2003) Distinct cysteine residues in Keap1 are required for Keap1- dependent ubiquitination of Nrf2 and for stabilization of Nrf2 by chemopreventive agents and oxidative stress. Mol. Cell. Biol. 23, Eggler, A. L., Liu, G., Pezzuto, J. M., van Breemen, R. B. and Mesecar, A. D. (2005) Modifying specific cysteines of the electrophile-sensing human Keap1 protein is insufficient to disrupt binding to the Nrf2 domain Neh2. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 102, doi: /pnas Itoh, K., Chiba, T., Takahashi, S., Ishii, T., Igarashi, K., Katoh, Y., Oyake, T., Hayashi, N., Satoh, K., Hatayama, I., Yamamoto, M. and Nabeshima, Y. (1997) An Nrf2/small maf heterodimer mediates the induction of phase II detoxifying enzyme genes through antioxidant response elements. Biochem. Biophys. Res. Commun. 236, Kensler, T. W., Wakabayashi, N. and Biswal, S. (2007) Cell survival responses to environmental stresses via the Keap1-Nrf2-ARE pathway. Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol. 47, doi: /annurev.pharmtox Lee, J. M., Calkins, M. J., Chan, K., Kan, Y. W. and Johnson, J. A. (2003) Identification of the NF-E2- related factor-2-dependent genes conferring protection against oxidative stress in primary cortical astrocytes using oligonucleotide microarray analysis. J. Biol. Chem. 278, doi: /jbc.m Prestera, T., Holtzclaw, W. D., Zhang, Y. and Talalay, P. (1993) Chemical and molecular regulation of enzymes that detoxify carcinogens. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 90, Itoh, K., Mimura, J. and Yamamoto, M. (2010) Discovery of the negative regulator of Nrf2, Keap1: A historical overview. Antioxid. Redox Signal. 13, doi: /ars ; /ars Kobayashi, M., Li, L., Iwamoto, N., Nakajima-Takagi, Y., Kaneko, H., Nakayama, Y., Eguchi, M., Wada, Y., Kumagai, Y. and Yamamoto, M. (2009) The antioxidant defense system Keap1-Nrf2 comprises a multiple sensing mechanism for responding to a wide range of chemical compounds. Mol. Cell. Biol. 29, doi: /mcb Yamamoto, T., Suzuki, T., Kobayashi, A., Wakabayashi, J., Maher, J., Motohashi, H. and Yamamoto, M. (2008) Physiological significance of reactive cysteine residues of Keap1 in determining Nrf2 activity. Mol. Cell. Biol. 28, doi: /mcb ; /MCB Eggler, A. L., Small, E., Hannink, M. and Mesecar, A. D. (2009) Cul3-mediated Nrf2 ubiquitination and antioxidant response element (ARE) activation are dependent on the partial molar volume at position 151 of Keap1. Biochem. J. 422, doi: /bj Kobayashi, A., Kang, M. I., Okawa, H., Ohtsuji, M., Zenke, Y., Chiba, T., Igarashi, K. and Yamamoto, M. (2004) Oxidative stress sensor Keap1 functions as an adaptor for Cul3-based E3 ligase to regulate proteasomal degradation of Nrf2. Mol. Cell. Biol. 24, doi: /mcb Tong, K. I., Padmanabhan, B., Kobayashi, A., Shang, C., Hirotsu, Y., Yokoyama, S. and Yamamoto, M. (2007) Different electrostatic potentials define ETGE and DLG motifs as hinge and latch in oxidative stress response. Mol. Cell. Biol. 27, doi: /mcb
9 29 Zhang, D. D., Lo, S. C., Cross, J. V., Templeton, D. J. and Hannink, M. (2004) Keap1 is a redox-regulated substrate adaptor protein for a Cul3-dependent ubiquitin ligase complex. Mol. Cell. Biol. 24, doi: /mcb Sun, Z., Zhang, S., Chan, J. Y. and Zhang, D. D. (2007) Keap1 controls postinduction repression of the Nrf2-mediated antioxidant response by escorting nuclear export of Nrf2. Mol. Cell. Biol. 27, doi: /mcb Zhang, D. D., Lo, S. C., Sun, Z., Habib, G. M., Lieberman, M. W. and Hannink, M. (2005) Ubiquitination of Keap1, a BTB-kelch substrate adaptor protein for Cul3, targets Keap1 for degradation by a proteasomeindependent pathway. J. Biol. Chem. 280, doi: /jbc.m Bloom, D. A. and Jaiswal, A. K. (2003) Phosphorylation of Nrf2 at Ser40 by protein kinase C in response to antioxidants leads to the release of Nrf2 from INrf2, but is not required for Nrf2 stabilization/accumulation in the nucleus and transcriptional activation of antioxidant response elementmediated NAD(P)H:Quinone oxidoreductase-1 gene expression. J. Biol. Chem. 278, doi: /jbc.m Cullinan, S. B., Zhang, D., Hannink, M., Arvisais, E., Kaufman, R. J. and Diehl, J. A. (2003) Nrf2 is a direct PERK substrate and effector of PERK-dependent cell survival. Mol. Cell. Biol. 23, Jain, A., Lamark, T., Sjottem, E., Larsen, K. B., Awuh, J. A., Overvatn, A., McMahon, M., Hayes, J. D. and Johansen, T. (2010) p62/sqstm1 is a target gene for transcription factor NRF2 and creates a positive feedback loop by inducing antioxidant response element-driven gene transcription. J. Biol. Chem. 285, doi: /jbc.m Akerfelt, M., Morimoto, R. I. and Sistonen, L. (2010) Heat shock factors: Integrators of cell stress, development and lifespan. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 11, doi: /nrm Anckar, J. and Sistonen, L. (2011) Regulation of HSF1 function in the heat stress response: Implications in aging and disease. Annu. Rev. Biochem. 80, doi: /annurev-biochem ; /annurev-biochem Jacobs, A. T. and Marnett, L. J. (2007) Heat shock factor 1 attenuates 4-hydroxynonenal-mediated apoptosis: Critical role for heat shock protein 70 induction and stabilization of bcl-xl. J. Biol. Chem. 282, doi: /jbc.m Zingarelli, B., Hake, P. W., Mangeshkar, P., O'Connor, M., Burroughs, T. J., Piraino, G., Denenberg, A. and Wong, H. R. (2007) Diverse cardioprotective signaling mechanisms of peroxisome proliferator-activated receptor-gamma ligands, 15-deoxy-Delta12,14-prostaglandin J2 and ciglitazone, in reperfusion injury: Role of nuclear factor-kappab, heat shock factor 1, and akt. Shock. 28, doi: /shk.0b013e31804f56b9 39 Kansanen, E., Jyrkkanen, H. K., Volger, O. L., Leinonen, H., Kivela, A. M., Hakkinen, S. K., Woodcock, S. R., Schopfer, F. J., Horrevoets, A. J., Yla-Herttuala, S., Freeman, B. A. and Levonen, A. L. (2009) Nrf2- dependent and -independent responses to nitro-fatty acids in human endothelial cells: Identification of heat shock response as the major pathway activated by nitro-oleic acid. J. Biol. Chem. 284, doi: /jbc.m
10 40 Vila, A., Tallman, K. A., Jacobs, A. T., Liebler, D. C., Porter, N. A. and Marnett, L. J. (2008) Identification of protein targets of 4-hydroxynonenal using click chemistry for ex vivo biotinylation of azido and alkynyl derivatives. Chem. Res. Toxicol. 21, doi: /tx700347w; /tx700347w 41 Trinklein, N. D., Murray, J. I., Hartman, S. J., Botstein, D. and Myers, R. M. (2004) The role of heat shock transcription factor 1 in the genome-wide regulation of the mammalian heat shock response. Mol. Biol. Cell. 15, doi: /mbc.e Niture, S. K. and Jaiswal, A. K. (2010) Hsp90 interaction with INrf2(Keap1) mediates stress-induced Nrf2 activation. J. Biol. Chem. 285, doi: /jbc.m Kaitsuka, T., Tomizawa, K. and Matsushita, M. (2011) Transformation of eef1bdelta into heat-shock response transcription factor by alternative splicing. EMBO Rep. 12, doi: /embor ; /embor Ron, D. and Walter, P. (2007) Signal integration in the endoplasmic reticulum unfolded protein response. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 8, doi: /nrm Harding, H. P., Zhang, Y., Zeng, H., Novoa, I., Lu, P. D., Calfon, M., Sadri, N., Yun, C., Popko, B., Paules, R., Stojdl, D. F., Bell, J. C., Hettmann, T., Leiden, J. M. and Ron, D. (2003) An integrated stress response regulates amino acid metabolism and resistance to oxidative stress. Mol. Cell. 11, Fawcett, T. W., Martindale, J. L., Guyton, K. Z., Hai, T. and Holbrook, N. J. (1999) Complexes containing activating transcription factor (ATF)/cAMP-responsive-element-binding protein (CREB) interact with the CCAAT/enhancer-binding protein (C/EBP)-ATF composite site to regulate Gadd153 expression during the stress response. Biochem. J. 339 ( Pt 1), Gargalovic, P. S., Imura, M., Zhang, B., Gharavi, N. M., Clark, M. J., Pagnon, J., Yang, W. P., He, A., Truong, A., Patel, S., Nelson, S. F., Horvath, S., Berliner, J. A., Kirchgessner, T. G. and Lusis, A. J. (2006) Identification of inflammatory gene modules based on variations of human endothelial cell responses to oxidized lipids. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 103, doi: /pnas West, J. D. and Marnett, L. J. (2005) Alterations in gene expression induced by the lipid peroxidation product, 4-hydroxy-2-nonenal. Chem. Res. Toxicol. 18, doi: /tx050211n 49 Gharavi, N. M., Gargalovic, P. S., Chang, I., Araujo, J. A., Clark, M. J., Szeto, W. L., Watson, A. D., Lusis, A. J. and Berliner, J. A. (2007) High-density lipoprotein modulates oxidized phospholipid signaling in human endothelial cells from proinflammatory to anti-inflammatory. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 27, doi: /atvbaha Gugiu, B. G., Mouillesseaux, K., Duong, V., Herzog, T., Hekimian, A., Koroniak, L., Vondriska, T. M. and Watson, A. D. (2008) Protein targets of oxidized phospholipids in endothelial cells. J. Lipid Res. 49, doi: /jlr.m jlr Feng, B., Yao, P. M., Li, Y., Devlin, C. M., Zhang, D., Harding, H. P., Sweeney, M., Rong, J. X., Kuriakose, G., Fisher, E. A., Marks, A. R., Ron, D. and Tabas, I. (2003) The endoplasmic reticulum is the site of cholesterol-induced cytotoxicity in macrophages. Nat. Cell Biol. 5, doi: /ncb1035
11 52 Sabatini, K., Mattila, J. P., Megli, F. M. and Kinnunen, P. K. (2006) Characterization of two oxidatively modified phospholipids in mixed monolayers with DPPC. Biophys. J. 90, doi: /biophysj Guo, L., Chen, Z., Cox, B. E., Amarnath, V., Epand, R. F., Epand, R. M. and Davies, S. S. (2011) Phosphatidylethanolamines modified by {gamma}-ketoaldehyde ({gamma}ka) induce endoplasmic recticulum stress and endothelial activation. J. Biol. Chem.. doi: /jbc.m Afonyushkin, T., Oskolkova, O. V., Philippova, M., Resink, T. J., Erne, P., Binder, B. R. and Bochkov, V. N. (2010) Oxidized phospholipids regulate expression of ATF4 and VEGF in endothelial cells via NRF2- dependent mechanism: Novel point of convergence between electrophilic and unfolded protein stress pathways. Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 30, doi: /atvbaha
Ma > GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING
Ma 5.12. -> GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING Cell-Surface Receptors Relay Extracellular Signals via Intracellular Signaling Pathways Some Intracellular Signaling Proteins Act as Molecular Switches
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia 21.1.2014 Epigeneettinen säätely Epigenetic: may be used for anything to do with development, but nowadays
ANNA-KAISA RUOTSALAINEN THE ROLE OF TRANSCRIPTION FACTOR NRF2 IN ATHEROGENESIS AND HEPATIC STEATOSIS IN HYPERCHOLESTEROLEMIC MOUSE MODELS
PUBLICATIONS OF THE UNIVERSITY OF EASTERN FINLAND Dissertations in Health Sciences ANNA-KAISA RUOTSALAINEN THE ROLE OF TRANSCRIPTION FACTOR NRF2 IN ATHEROGENESIS AND HEPATIC STEATOSIS IN HYPERCHOLESTEROLEMIC
Genomin ilmentyminen Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma
Genomin ilmentyminen 17.1.2013 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Genomin ilmentyminen transkription aloitus RNA:n synteesi ja muokkaus DNA:n ja RNA:n välisiä eroja
PROTEIINIEN MUOKKAUS JA KULJETUS
PROTEIINIEN MUOKKAUS JA KULJETUS 1.1 Endoplasmakalvosto Endoplasmakalvosto on organelli joka sijaitsee tumakalvossa kiinni. Se on topologisesti siis yhtä tumakotelon kanssa. Se koostuu kahdesta osasta:
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia
Genomi-ilmentyminen Genom expression (uttryckning) DNA RNA 7.12.2017 Nina Peitsaro, yliopistonlehtori, Medicum, Biokemia ja Kehitysbiologia Osaamistavoitteet Lärandemål Luennon jälkeen ymmärrät pääperiaatteet
Kurssiin sisältyvät kappaleet kirjasta Tortora et al. (Microbiology) ja Alberts et al. (Essential Cell Biology), 1/2
Kurssiin sisältyvät kappaleet kirjasta Tortora et al. (Microbiology) ja Alberts et al. (Essential Cell Biology), 1/2 Luento 1: Yleisten asioiden jälkeen: MB, luku 1 (s. 28-49) Luento 2: Luku 1 jatkuu +
Essential Cell Biology
Alberts Bray Hopkin Johnson Lewis Raff Roberts Walter Essential Cell Biology FOURTH EDITION Chapter 18 The Cell-Division Cycle Copyright Garland Science 2014 CHAPTER CONTENTS OVERVIEW OF THE CELL CYCLE
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia
Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia 12.12.2017 Epigenetic inheritance: A heritable alteration in a cell s or organism s phenotype that does
NRF2-TRANSKRIPTIOFAKTORIN VAIKUTUKSET ATEROGENEESIIN
NRF2-TRANSKRIPTIOFAKTORIN VAIKUTUKSET ATEROGENEESIIN Emmi Tapper Tutkielma Lääketieteen koulutusohjelma Itä-Suomen yliopisto Terveystieteiden tiedekunta A.I. Virtanen -instituutti Tammikuu 2013 ITÄ-SUOMEN
Soluhengitys + ATP-synteesi = Oksidatiivinen fosforylaatio Tuomas Haltia Elämälle (solulle) välttämättömiä asioita ovat:
Soluhengitys + ATP-synteesi = Oksidatiivinen fosforylaatio Tuomas Haltia 3.12.2012 Soluhengitys = Mitokondrioissa tapahtuva (ATP:tä tuottava) prosessi, jossa happi toimii pelkistyneiden ravintomolekyylien
Oksidatiivinen fosforylaatio = ATP:n tuotto NADH:lta ja FADH2:lta hapelle tapahtuvan elektroninsiirron ja ATP-syntaasin avulla
Soluhengitys + ATP-synteesi = Oksidatiivinen fosforylaatio Soluhengitys = Mitokondrioissa tapahtuva (ATP:tä tuottava) prosessi, jossa happi toimii pelkistyneiden ravintomolekyylien elektronien vastaanottajana
Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30
Tampereen yliopisto Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe 21.5.2015 Henkilötunnus - Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 30 3. a) Alla on lyhyt jakso dsdna:ta, joka koodaa muutaman aminohappotähteen
DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi translaatio regulaatio
CELL 411-- replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA proteiinit transkriptio prosessointi
State of the Union... Functional Genomics Research Stream. Molecular Biology. Genomics. Computational Biology
Functional Genomics Research Stream State of the Union... Research Meeting: February 16, 2010 Functional Genomics & Research Report III Concepts Genomics Molecular Biology Computational Biology Genome
Yoshinori Ohsumille Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology
Lääketieteen Nobel-palkinto 2016 Yoshinori Ohsumille hänen autofagian mekanismeja koskevista löydöistään. Yoshinori Ohsumi 1945 Syntymäpaikka Fukuoka, Japani 2009 Professori, Tokyo Institute of Technology
Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL Juha Partanen
Geenisakset (CRISPR)- Geeniterapian vallankumousko? BMOL 19.11.2016 Juha Partanen Geenisakset 2 2 N A T U R E V O L 5 2 2 4 J U N E 2 0 1 5 Sisältö Geenimuokkaus: historiallinen perspektiivi Geenisakset
Essential Cell Biology
Alberts Bray Hopkin Johnson Lewis Raff Roberts Walter Essential Cell Biology FOURTH EDITION Chapter 16 Cell Signaling Copyright Garland Science 2014 1 GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING Signals Can Act
DNA:n informaation kulku, koostumus
DNA:n informaation kulku, koostumus KOOSTUMUS Elävien bio-organismien koostumus. Vety, hiili, happi ja typpi muodostavat yli 99% orgaanisten molekyylien rakenneosista. Biomolekyylit voidaan pääosin jakaa
ENTSYYMIKATA- LYYSIN PERUSTEET (dos. Tuomas Haltia)
ENTSYYMIKATA- LYYSIN PERUSTEET (dos. Tuomas Haltia) Elämän edellytykset: Solun täytyy pystyä (a) replikoitumaan (B) katalysoimaan tarvitsemiaan reaktioita tehokkaasti ja selektiivisesti eli sillä on oltava
6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi
6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi GENEETTINEN INFORMAATIO Geeneihin pakattu informaatio ohjaa solun toimintaa ja siirtyy
Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15
Tampereen yliopisto Henkilötunnus - Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe 18.5.2018 Tehtävä 1 Pisteet / 15 1. Alla on esitetty urheilijan
Sytosoli eli solulima. Sytosoli. Solunsisäiset rakenteet, kalvostot ja proteiinien lajittelu (Chapter 12 Alberts et al.)
Solunsisäiset rakenteet, kalvostot ja proteiinien lajittelu (Chapter 12 Alberts et al.) Figure 12-1 Molecular Biology of the Cell ( Garland Science 2008) Sytosoli eli solulima Sytosoli määritellään operatiivisesti
2.1 Solun rakenne - Lisämateriaalit
2.1 Solun rakenne - Lisämateriaalit Tiivistelmä Esitumaisiset eli alkeistumalliset solut ovat pieniä (n.1-10µm), niissä on vähän soluelimiä, eikä tumaa (esim. arkeonit, bakteerit) Tumalliset eli aitotumalliset
? LUCA (Last universal common ancestor) 3.5 miljardia v.
Mitä elämä on? - Geneettinen ohjelma, joka kykenee muuttamaan ainehiukkaset ja molekyylit järjestyneeksi itseään replikoivaksi kokonaisuudeksi. (= geneettistä antientropiaa) ? LUCA (Last universal common
Genomin ilmentyminen
Kauppi 17/01/2014 Genomin ilmentyminen LH1, Molekyylibiologia 17.1.2014 Liisa Kauppi, Genomibiologian tutkimusohjelma liisa.kauppi@helsinki.fi Huone C501b, Biomedicum 1 Transkriptiofaktorin mutaatio voi
Kipu. Oleg Kambur. Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 23.6.2015
Katekoli-O-metyylitransferaasi ja kipu Oleg Kambur Kipu Geneettisillä tekijöillä suuri merkitys Yksittäisiä geenejä on löydetty vain vähän COMT 1 Katekoli-O-metyylitransferaasi (COMT) proteiini tuotetaan
ELINPATOLOGIAN RYHMÄOPETUS MUNUAINEN
ELINPATOLOGIAN RYHMÄOPETUS MUNUAINEN KYSYMYKSET: 1. Glomeruluksen rakenne. Mihin seikkoihin perustuu valikoiva läpäiseväisyys veri- ja virtsatilan välillä? 2. Glomerulusvaurion mekanismit A. Immunologiset
BI4 IHMISEN BIOLOGIA
BI4 IHMISEN BIOLOGIA 5 HORMONIT OVAT ELIMISTÖN TOIMINTAA SÄÄTELEVIÄ VIESTIAINEITA Avainsanat aivolisäke hormoni hypotalamus kasvuhormoni kortisoli palautesäätely rasvaliukoinen hormoni reseptori stressi
Säteilyvaikutuksen synty. Erikoistuvien lääkärien päivät 25 26.1.2013 Kuopio
Säteilyvaikutuksen synty Erikoistuvien lääkärien päivät 25 26.1.2013 Kuopio Säteilyn ja biologisen materian vuorovaikutus Koska ihmisestä 70% on vettä, todennäköisin (ja tärkein) säteilyn ja biologisen
class I T (Munz, autophagy (Argiris, 2008) 30 5 (Jemal, 2009) autophagy HLA / 4 21 (Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2008; Chikamatsu, 2009) in vitro
65 35 (Argiris, 2008)30 5 (Jemal, 2009) / 1991Boon / 4 21 (Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2008; Chikamatsu, 2009) / / (Sakakura, 2005; Sakakura, 2006; Sakakura, 2007; Chikamatsu, 2007; Chikamatsu, 2008)/
Vastaa lyhyesti selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan
1 1) Tunnista molekyylit (1 piste) ja täytä seuraava taulukko (2 pistettä) a) b) c) d) a) Syklinen AMP (camp) (0.25) b) Beta-karoteeni (0.25 p) c) Sakkaroosi (0.25 p) d) -D-Glukopyranoosi (0.25 p) 2 Taulukko.
Käsitteitä. Hormones and the Endocrine System Hormonit ja sisäeritejärjestelmä. Sisäeriterauhanen
Käsitteitä Hormones and the Endocrine System Hormonit ja sisäeritejärjestelmä 1/2 Umpirauhanen vs. sisäeriterauhanen Endokrinologia Parakriininen Autokriininen Neurotransmitteri Reseptori Sisäeriterauhanen
Sukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 3: Osa 1 Tumallisten solujen genomin toiminnassa sekä geenien
Tietokoneavusteinen ongelmanratkaisu biologiselle datalle ATK-harjoitus
1 Tietokoneavusteinen ongelmanratkaisu biologiselle datalle ATK-harjoitus MEO EKROOS, 15.2.2017 KURSSIASSISTENTTI ELEC-A8720 - BIOLOGISTEN ILMIÖIDEN MITTAAMINEN COPASI 2 Complex Pathway Simulator (COPASI)
Inferring Trichoderma reesei gene regulatory network
Inferring Trichoderma reesei gene regulatory network Oskari Vinko 29.04.2013 Ohjaaja: Merja Oja Valvoja: Harri Ehtamo Työn saa tallentaa ja julkistaa Aalto-yliopiston avoimilla verkkosivuilla. Muilta osin
Sukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20
elsingin yliopisto/tampereen yliopisto enkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe ukunimi 26. 05. 2005 Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20 olujen kalvorakenteiden perusrakenteen muodostavat amfipaattiset
PULLO PÄIVÄSSÄ RIITTÄÄ. Tee tilaa. kolesterolia alentavalle täydennykselle potilaittesi ruokavalioon
PULLO PÄIVÄSSÄ RIITTÄÄ Tee tilaa kolesterolia alentavalle täydennykselle potilaittesi ruokavalioon Lähteet 1. Catapano et al. ESC/EAS Guidelines for the management of dyslipidaemias. Atherosclerosis 2016;
Mikä puuttuu. potilaasi kolesterolia alentavasta ruokavaliosta?
Mikä puuttuu potilaasi kolesterolia alentavasta ruokavaliosta? Alentaa 1-4 kolesterolia todistetun tehokkaasti Terveysvaikutteiset elintarvikkeet, joihin on lisätty kasvistanolia*, tarjoavat tehokkaan
NON-CODING RNA (ncrna)
NON-CODING RNA (ncrna) 1. Yleistä NcRNA eli non-coding RNA tarkoittaa kaikkia proteiinia koodaamattomia rnamolekyylejä. Näistä yleisimmin tunnetut ovat ribosomaalinen RNA (rrna) sekä siirtäjä-rna (trna),
Peptidi ---- F ----- K ----- V ----- R ----- H ----- A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit
Helsingin yliopisto/tampereen yliopisto Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 24.5.2006 Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20 Osa 1: Haluat selvittää -- F -- K -- V -- R -- H -- A peptidiä
Oksisterolien merkitys rasva-aineenvaihdunnassa
Katsaus VESA OLKKONEN JA MARKKU LEHTO Oksisterolien merkitys rasva-aineenvaihdunnassa ja valtimonkovettumistaudin kehittymisessä Hapettuneita kolesterolijohdoksia oksisteroleita on tutkittu useiden vuosikymmenien
Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1
Drosophila on kehitysgenetiikan mallilaji nro 1 replikaatio repair mitoosi meioosi fertilisaatio rekombinaatio repair mendelistinen genetiikka DNA-huusholli Geenien toiminta molekyyligenetiikka DNA RNA
Syöpä. Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka. EGF-kasvutekijä. reseptori. tuma. dna
Ihmisen keho muodostuu miljardeista soluista. Vaikka nämä solut ovat tietyssä mielessä meidän omiamme, ne polveutuvat itsenäisistä yksisoluisista elämänmuodoista, jotka ovat säilyttäneet monia itsenäisen
Autofagia silmänpohjan ikärappeumassa. LT Niko Kivinen Silmälääkäriyhdistys Kevätkoulutuspäivät 2018
Autofagia silmänpohjan ikärappeumassa LT Niko Kivinen Silmälääkäriyhdistys Kevätkoulutuspäivät 2018 Sidonnaisuudet Apurahat Lääketieteen säätiö Silmäsäätiö Evald ja Hilda Nissin säätiö Itä-Suomen yliopisto
KandiakatemiA Kandiklinikka
Kandiklinikka Kandit vastaavat Immunologia Luonnollinen ja hankittu immuniteetti IMMUNOLOGIA Ihmisen immuniteetti pohjautuu luonnolliseen ja hankittuun immuniteettiin. Immunologiasta vastaa lymfaattiset
Ribosomit 1. Ribosomit 4. Ribosomit 2. Ribosomit 3. Proteiinisynteesin periaate 1
Ribosomit 1 Ribosomit 4 Palade & Siekevitz eristivät jaottelusentrifugaatiolla ns. mikrosomeja radioakt. aminohapot kertyivät mikrosomeihin, jotka peräisin rer:ää sisältävistä soluista proteiinisynteesi
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks. David R. Kelley
Basset: Learning the regulatory code of the accessible genome with deep convolutional neural networks David R. Kelley DNA codes for complex life. How? Kundaje et al. Integrative analysis of 111 reference
Insuliini on anabolinen hormoni, joka säätelee
Kuvat kertovat n vaikutukset Veikko Koivisto ja Pertti Ebeling lla on keskeinen osuus glukoosi, lipidi ja proteiiniaineenvaihdunnan säätelyssä. Sen lisäksi insuliini vaikuttaa geenien ilmentymiseen, solujen
Hoitotehoa ennustavat RAS-merkkiaineet Tärkeä apuväline kolorektaalisyövän lääkehoidon valinnassa Tämän esitteen tarkoitus Tämä esite auttaa ymmärtämään paremmin kolorektaalisyövän erilaisia lääkehoitovaihtoehtoja.
Supporting Information for
Supporting Information for Analysis of Sogatella furcifera proteome that interact with P10 protein of Southern rice black-streaked dwarf virus Win Than*, Faliang Qin*, Wenwen Liu, Xifeng Wang ** State
Nimi sosiaaliturvatunnus. Vastaa lyhyesti, selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan
1. Valitse listasta kunkin yhdisteen yleiskielessä käytettävä ei-systemaattinen nimi. (pisteet yht. 5p) a) C-vitamiini b) glukoosi c) etikkahappo d) salisyylihappo e) beta-karoteeni a. b. c. d. e. ksylitoli
T-61.246 Digitaalinen signaalinkäsittely ja suodatus Tutkielma Signaalinkäsittely DNA-mikrosiruteknologiassa
T-61.246 Digitaalinen signaalinkäsittely ja suodatus Tutkielma Signaalinkäsittely DNA-mikrosiruteknologiassa Liisa-Ida Sorsa, 58714E Sisällysluettelo i SISÄLLYSLUETTELO 1JOHDANTO... 1 2BIOLOGIAA DNA-MIKROSIRUTEKNOLOGIALLA...
Experimental Identification and Computational Characterization of a Novel. Extracellular Metalloproteinase Produced by Clostridium sordellii
Electronic Supplementary Material (ESI) for RSC Advances. This journal is The Royal Society of Chemistry 207 Supplementary Information Experimental Identification and Computational Characterization of
-1- Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin voi vastata suomeksi, ruotsiksi tai englanniksi.
Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe 21.5.2014 Nimi: Henkilötunnus: Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin voi vastata suomeksi, ruotsiksi tai englanniksi.
LIFE2000 rahoitettavat hankkeet
LIFE2000 rahoitettavat hankkeet Life 2000 tutkimusohjelmaan on valittu kaikkiaan 37 tutkimushanketta: 13 yksittäishanketta ja 24 konsortiota. Tekes tekee rahoituspäätöksensä sille esitetyistä projektiehdotuksista
5.2.2010 Labquality-päivät / Jaana Leiviskä 1
Apolipoproteiinit p p metabolisen häiriön ennustajina Jaana Leiviskä, THL Labquality-päivät 5.2.2010 5.2.2010 Labquality-päivät / Jaana Leiviskä 1 Energiatasapaino i Energian saanti = energian kulutus
Luennon 5 oppimistavoitteet. Soluseinän biosynteesi. Puu-19.210 Puun rakenne ja kemia. Solun organelleja. Elävä kasvisolu
Luennon 5 oppimistavoitteet Soluseinän biosynteesi Puu-19.210 Puun rakenne ja kemia saat listata puuaineksen muodostumisen vaiheet. Ymmärrät, kuinka soluseinän tapahtuu. saat lyhyesti kuvata soluseinän
Biomolekyylit ja biomeerit
Biomolekyylit ja biomeerit Polymeerit ovat hyvin suurikokoisia, pitkäketjuisia molekyylejä, jotka muodostuvat monomeereista joko polyadditio- tai polykondensaatioreaktiolla. Polymeerit Synteettiset polymeerit
Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.
Sarkoomien syto- ja molekyyligenetiikkaa Iina Tuominen, FT Erikoistuva sairaalasolubiologi Tyks-Sapa-liikelaitos IAP:n kevätkokous 12.5.2016 Iina.Tuominen@tyks.fi Genetiikan tutkimukset sarkoomien diagnostiikassa
Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe 22.5.2015
Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe 22.5.2015 Nimi: Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin vastataan suomeksi. Osa 1 Aineistotehtävä. Vastaa vain varattuun
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman
Elintarvikealan tutkimus, kehitys ja innovointi Oulun yliopistossa biotieteen näkökulma Hely Häggman Lasaretti 29.03.2017 Helsingin, Turun ja Kuopion yliopistoissa voi opiskella elintarvikealaa Elintarvikehygienia:
Essential Cell Biology
Alberts Bray Hopkin Johnson Lewis Raff Roberts Walter Essential Cell Biology FOURTH EDITION Chapter 18 The Cell-Division Cycle Copyright Garland Science 2014 4.12.2017: 1 CHAPTER CONTENTS OVERVIEW OF THE
ELEC-C2210 Molekyyli- ja solubiologia
ELEC-C2210 Molekyyli- ja solubiologia Entsyymikatalyysi Vuento & Heino ss. 66-75 ECB: Luku 3, s. 90-93 & luku 4, s. 144- Dos. Tuomas Haltia, Biotieteiden laitos, biokemia ja biotekniikka Miten entsyymit
REGULATION OF MYC ACTIVITY BY POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONS. Xi Qiao
REGULATION OF MYC ACTIVITY BY POST-TRANSLATIONAL MODIFICATIONS Xi Qiao TURUN YLIOPISTON JULKAISUJA ANNALES UNIVERSITATIS TURKUENSIS Sarja - ser. D osa - tom. 1382 Medica - Odontologica Turku 2018 REGULATION
Oligonukleotidi-lääkevalmisteet ja niiden turvallisuuden tutkiminen - Sic!
Page 1 of 5 JULKAISTU NUMEROSSA 3-4/2017 EX TEMPORE Oligonukleotidi-lääkevalmisteet ja niiden turvallisuuden tutkiminen Enni-Kaisa Mustonen / Kirjoitettu 18.12.2017 / Julkaistu Oligonukleotidit ovat nukleotideista
Tietokoneavusteinen ongelmanratkaisu biologiselle datalle Luento
1 Tietokoneavusteinen ongelmanratkaisu biologiselle datalle Luento 31.1.2017 MEO EKROOS KURSSIASSISTENTTI ELEC-A8720 - BIOLOGISTEN ILMIÖIDEN MITTAAMINEN Harjoitukset ja deadlinet 2 Luento + ATK-harjoitus
"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13
"Geenin toiminnan säätely" Moniste sivu 13 Monisteen alussa on erittäin tärkeitä ohjeita turvallisuudesta Lukekaa sivu 5 huolellisesti ja usein Vaarat vaanivat: Palavia nesteitä ja liekkejä on joskus/usein
Plasmid Name: pmm290. Aliases: none known. Length: bp. Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson. Last updated: 17 August 2009
Plasmid Name: pmm290 Aliases: none known Length: 11707 bp Constructed by: Mike Moser/Cristina Swanson Last updated: 17 August 2009 Description and application: This is a mammalian expression vector for
KE-4.1100 Orgaaninen kemia 1
KE-4.1100 rgaaninen kemia 1 Tentti 27.10.2005, malliratkaisu ja mallipisteytys Kokeessa sallitut apuvälineet: Molekyylimallisarja, taskulaskin. Mikäli vastaat koepaperiin, palauta paperi nimelläsi ja opiskelijanumerollasi
Viral DNA as a model for coil to globule transition
Viral DNA as a model for coil to globule transition Marina Rossi Lab. of complex fluids and molecular biophysics LITA (Segrate) UNIVERSITA DEGLI STUDI DI MILANO - PhD Workshop October 14 th, 2013 Temperature
Ribosomit 1. Ribosomit 2. Ribosomit 3
Ribosomit 1 Palade & Siekevitz eristivät jaottelusentrifugaatiolla ns. mikrosomeja radioakt. aminohapot kertyivät mikrosomeihin, jotka peräisin rer:ää sisältävistä soluista proteiinisynteesi soluliman
SUKLAA JA SYDÄNTERVEYS
SUKLAA JA SYDÄNTERVEYS terveystuote vai haitallinen herkku? Jaakko Mursu, TtM,, ravitsemusterapeutti Ravitsemusepidemiologian jatko opiskelija opiskelija Kansanterveyden tutkimuslaitos, Kuopion yliopisto
STEMOXYDINE, AKTIIVIAINESOSA, JOKA HERÄTTÄÄ LEPOTILASSA OLEVAT HIUKSET JA LISÄÄ HIUSTIHEYTTÄ
STEMOXYDINE, AKTIIVIAINESOSA, JOKA HERÄTTÄÄ LEPOTILASSA OLEVAT HIUKSET JA LISÄÄ HIUSTIHEYTTÄ Yli 20. vuoden mittainen aikuisen ihon ja hiusten kantasolujen tutkimus yhteistyössä arvostettujen kansainvälisten
CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015
CHEM-C2300 Solu- ja molekyylibiologia Syksy 2015 Luennot Maanantai 10.15 12.00 KE 2 Keskiviikko 13.15 15.00 KE 2 Demot (pakollinen läsnäolo) Perjantai 8.30 10.00, KE1, 25.9. ja 2.10. Osaamistavoitteet
Etunimi: Henkilötunnus:
Kokonaispisteet: Lue oheinen artikkeli ja vastaa kysymyksiin 1-25. Huomaa, että artikkelista ei löydy suoraan vastausta kaikkiin kysymyksiin, vaan sinun tulee myös tuntea ja selittää tarkemmin artikkelissa
DNA > RNA > Proteiinit
Genetiikan perusteiden luentojen ensimmäisessä osassa tarkasteltiin transmissiogenetiikkaa eli sitä, kuinka geenit siirtyvät sukupolvesta toiseen Toisessa osassa ryhdymme tarkastelemaan sitä, mitä geenit
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO
Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito SNP 14.1.2013 Tiina Immonen Biolääketieteen laitos Biokemia ja kehitysbiologia Jakson luennot Mitä on genomilääketiede? Dan Lindholm Genomin ylläpito Tiina Immonen
Master's Programme in Life Science Technologies (LifeTech) Prof. Juho Rousu Director of the Life Science Technologies programme 3.1.
Master's Programme in Life Science Technologies (LifeTech) Prof. Juho Rousu Director of the Life Science Technologies programme 3.1.2017 Life Science Technologies Where Life Sciences meet with Technology
x _ Miksi elinikä ei ole rajaton? Mediterranean fruitfly (Ceratitis capitata) Eliniän jakautuma
Vanhenemisen fysiologia 1 Elinikä ja vanheneminen Käsitteet Elinikä - yksilön elinikä Eliniän odotusarvo, aktuaarinen (kirjanpidollinen) elinikä - keskimääräinen odotettavissa oleva elinikä tietylle lajille,
Happi solujen toimintojen säätelijänä Mikko Nikinmaa
Happi solujen toimintojen säätelijänä Mikko Nikinmaa Elämä maapallolla nykymuotoisena olisi mahdotonta ilman happea. Happi osallistuu mitokondrioiden energiantuotantoon vastaanottamalla elektroninsiirtoketjun
ALKOHOLIN VAIKUTUS MAKSAN AIN E ENVAIH DUNTAAN
ALKOHOLPOLTKKA 71 PE KKA MAE N PAA ALKOHOLN VAKUTUS MAKSAN AN E ENVAH DUNTAAN Joutuessaan elimistöön vaikuttaa alkoholi kahdella periaatteessa toisistaan eroavalla tavalla. Ensinnäkin sillä on keskushermostoon
NUORET TUTKIJAT 2014 -OHJELMA
NUORET TUTKIJAT 2014 -OHJELMA VIIKON AVAUS TIISTAI 18.3.2014 kello 12 15 Arcanum Arc1-sali NUORET TUTKIJAT 2014 -ESITELMÄT TIISTAI 18.3.2014 - PERJANTAI 21.3.2014 alkaen kello 12 15 Arcanum Arc1-sali NUORET
Functional Genomics & Proteomics
Functional Genomics & Proteomics Genome Sequences TCACAATTTAGACATCTAGTCTTCCACTTAAGCATATTTAGATTGTTTCCAGTTTTCAGCTTTTATGACTAAATCTTCTAAAATTGTTTTTCCCTAAATGTATATTTTAATTTGTCTCAGGAGTAGAATTTCTGAGTCATAAAGCGGT CATATGTATAAATTTTAGGTGCCTCATAGCTCTTCAAATAGTCATCCCATTTTATACATCCAGGCAATATATGAGAGTTCTTGGTGCTCCACATCTTAGCTAGGATTTGATGTCAACCAGTCTCTTTAATTTAGATATTCTAGTACAT
Farmaseuttisen kemian oppiaine
Farmaseuttisen kemian oppiaine FARMASEUTTINEN KEMIA Tällä hetkellä noin 45 henkilöä työskentelee oppiaineessa farmaseuttinen kemia Professoreita (7) Senioritutkijoita (20) Tutkijoita (10) Teknistä henkilökuntaa
Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia
Genomin ylläpito 14.1.2014 Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia Luennon sisältö DNA:n kahdentuminen eli replikaa8o DNA:n korjausmekanismit Replikaa8ovirheiden korjaus Emäksenpoistokorjaus
KE1 - Kemiaa kaikkialla on pakollinen kurssi, joka on päästävä läpi lukion läpäisemiseksi
KE1 - Kemiaa kaikkialla on pakollinen kurssi, joka on päästävä läpi lukion läpäisemiseksi Kurssin tavoitteena on, että opiskelija saa kokemuksia kemiasta kehittää valmiuksia osallistua kemiaan liittyvään
Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe. Sukunimi Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20
elsingin yliopisto/tampereen yliopisto enkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe Sukunimi 24. 5. 2004 Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20 Solujen kalvorakenteet rajaavat solut niiden ulkoisesta ympäristöstä
Neuropeptidit, opiaatit ja niihin liittyvät mekanismit. Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013
Neuropeptidit, opiaatit ja niihin liittyvät mekanismit Pertti Panula Biolääketieteen laitos 2013 Neuroendokriinisen järjestelmän säätely elimistössä Neuropeptidit Peptidirakenteisia hermovälittäjäaineita
DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia
DNA 3.3.2015 Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia Koordinaattori, Master s Degree Programme in Translational Medicine (TRANSMED) 1 Sisältö DNA:n rakenne
PET:n uusimmat diagnostiset mahdollisuudet sydänpotilailla
:n uusimmat diagnostiset Kotka 1 Juhani Knuuti Nuclear perfusion imaging Diagnosis and prognosis of CAD Annual cardiac event rate % 1 8 6 normal P
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki
VIIKKI BIOCENTER University of Helsinki Biologian DNA koodi ja sen selvittäminen Petri Auvinen DNA Sequencing and Genomics Laboratory Institute of Biotechnology Kuinka solut kehittyivät? Kolmenlaisia soluja
Supplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell. exterior
Supplementary information: Biocatalysis on the surface of Escherichia coli: melanin pigmentation of the cell exterior Martin Gustavsson, David Hörnström, Susanna Lundh, Jaroslav Belotserkovsky, Gen Larsson
VASTAUS 1: Yhdistä oikein
KPL3 VASTAUS 1: Yhdistä oikein a) haploidi - V) ihmisen sukusolu b) diploidi - IV) ihmisen somaattinen solu c) polyploidi - VI) 5n d) iturata - III) sukusolujen muodostama solulinja sukupolvesta toiseen
Geenitekniikan perusmenetelmät
Loppukurssikoe To klo 14-16 2 osiota: monivalintatehtäväosio ja kirjallinen osio, jossa vastataan kahteen kysymykseen viidestä. Koe on auki klo 14.05-16. Voit tehdä sen oppitunnilla, jolloin saat tarvittaessa
7. Product-line architectures
7. Product-line architectures 7.1 Introduction 7.2 Product-line basics 7.3 Layered style for product-lines 7.4 Variability management 7.5 Benefits and problems with product-lines 1 Short history of software
Reseptoripotentiaalista (RP) aktiopotentiaaliin
Haju- ja makuaisti Reseptoripotentiaalista (RP) aktiopotentiaaliin Reseptoristimulaatio lokaalinen sähköinen ärtyminen (melkein aina depolarisaatio) RP syntymekanismi vaihtelee aistimesta toiseen RP leviää
enzymatic families regulated in response to a short-term cytokinin treatment in root apices
A B C D Supplemental tlfigure 1. 1Mtbli Metabolic processes, hormonal pathways and dlarge enzymatic families regulated in response to a short-term cytokinin treatment in root apices The 297 transcripts
Solun Kalvot. Kalvot muodostuvat spontaanisti. Biologiset kalvot koostuvat tuhansista erilaisista molekyyleistä
Solun Kalvot (ja Mallikalvot) Biologiset kalvot koostuvat tuhansista erilaisista molekyyleistä Biokemian ja Farmakologian erusteet 2012 Kalvot muodostuvat spontaanisti Veden rakenne => ydrofobinen vuorovaikutus
Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe
Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe 22.5.2015 Nimi: Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin vastataan suomeksi. Osa 1 Aineistotehtävä. Vastaa vain varattuun