Pohjoismaisen geenipankin informaatiojärjestelmä on nimeltään SESTO (=Seed store) ja se sisältää tietoja lähes kaikista geenipankin omista

Koko: px

Aloita esitys sivulta:

Download "Pohjoismaisen geenipankin informaatiojärjestelmä on nimeltään SESTO (=Seed store) ja se sisältää tietoja lähes kaikista geenipankin omista"

Elisabet Hovinen
8 vuotta sitten
Katselukertoja:

1 Pohjoismaisen geenipankin informaatiojärjestelmä on nimeltään SESTO (=Seed store) ja se sisältää tietoja lähes kaikista geenipankin omista siemennäytteistä ja jossain tapauksissa myös suvullisesti lisättävien lajien näytteistä (esim. peruna). SESTO:oon pääsee geenipankin kotisivuilta sivupalkin Databases kautta

siemennäytteistä ja jossain tapauksissa myös suvullisesti lisättävien lajien

2 SESTO-tietokanta toimii joko katselu- tai hakuperiaatteella.katselun voi aloittaa valitsemalla yläpalkista [genus], [taxon], [culton], [accession] tai [sub-collection] tason. Kutakin tasoa klikatessa esiin tulee ko. lista aakkosellisessa järjestyksessä.listasta voi jatkaa katselua seuraavalle tasolle SANASELITYKSIÄ TÄLTÄ SIVULTA Genus = suku Taxon = taksoni (taksonominen yksikkö esim. laji) Culton = näyteryhmä, esim. lajikkeet, jalostuslinjat Accession = yksittäinen geenipankkinäyte (Huom! samasta lajikkeesta voi geenipankissa olla useita eri näytteitä) Sub-collection = Geenipankin erikoiskokolemat, joiden tietoja voi katsella erillistietokannoista

3 Esimerkki taksonilistasta (taxon): Vasemmalla näet listan kasvien tieteellisistä nimistä. Voit selata listaa valitsemalla ylävalikosta ko. kirjaimen tai siirtymällä seuraavalle sivulle valitsemalla sivun alareunasta 'Next 25'. Klikkaamalla 'select' saat listan geenipankissa säilytettävistä ko. lajin kaikista näytteistä.

kirjaimen tai siirtymällä seuraavalle sivulle valitsemalla sivun alareunasta

4 SANASELITYKSIÄ TÄLTÄ SIVULTA Cul = Culton type (B = jalostuslinja, CC = lajike - kasvullisesti lisättävät lajit, CV = lajike, I = ei-pohjoismainen näyte, L = maatiainen/paikalliskanta, LC = maatiainen/paikalliskanta - kasvulliseti lisättävät, LP = primitiivinen lajike, P = uusi tai tunnistamaton näyte, W = villi/villiintynyt) Rsp = Resposibility (ACC = näyte, joka hyväksytty pitkäaikaissäilytykseen, PEN = näyte jonka säilytysarvo tutkimusten alla, TEM = näyte, jota säilytetään vain väliaikaisesti, REJ = hylätty, tiedot säilytetään) Esimerkki geenipankin näytelistasta: Rönsyröllinäyteet(Agrostis stolonifera L.) luetteloitu aakkosjärjestyksessä. Klikkaamalla 'select' saat esille kunkin näytteen yksityiskohtaiset tiedot: lajike- tai keräystiedot.

hyväksytty pitkäaikaissäilytykseen, PEN = näyte jonka säilytysarvo tutkimusten alla, TEM = näyte, jota säilytetään vain väliaikaisesti, REJ = hylätty, tiedot säilytetään) Esimerkki

5 Esimerkki yksittäisistä näytetiedoista: NGB854 'Akujärvi ME0103' Klikkaamalla alavalikoista voit saada lähempiä tietoja näytteestä.

6 Näytteen NGB854 keräystiedot (maantieteellinen sijainti, keräysajankohta, keräysnumero ja keräyspaikkatiedot) ja keräyspaikka kartalla. Mikäli näytteestä on tehty morfologisia tai agronomisia mittauksia, löytyvät tiedot valikosta 'Evaluation'. Valikosta 'Stored material' löydät tiedot säilytetyistä siemenistä. MUISTA! Aina, kun tilaat materiaalia geenipankista, käytä näytteen geenipankkinumeroa. Tässä tapauksessa NGB854. Näin näyte löytyy helposti varastosta ja sen toimitus etenee nopeasti.

Mikäli näytteestä on tehty morfologisia tai agronomisia mittauksia, löytyvät tiedot valikosta 'Evaluation'.

7 Mikäli haluat tehdä yksinkertaisen haun SESTO-tietokannsta, klikkaa ylävalikosta 'search'. Ponnahdusvalikosta voit valita hakukriteerin esim. accnum (geenipankkinumero kuten NGB854). Voit myös hakea suomenkielisellä lajinimellä 'finnish name', jolloin saat näkyvviin taksonilistan. Kun haluat löytää jonkin tietyn lajikkeen, valitse ponnahdusvalikosta 'accession name' ja toiseksi hakukriteeriksi 'contains'.

Voit myös hakea suomenkielisellä lajinimellä 'finnish name', jolloin saat näkyvviin taksonilistan.

8 Esimerkki hausta 'Otra': Tuloksena lista kaikista näytenimistä, joissa sana Otra. Nyt voit valita select-toiminnolla yksityiskohtaiset tiedot kustakin näytteestä ja päättää, minkä näytteen/näytteet haluat tilata geenipankista.

9 Näkymä NGB291 'Otra':n evaluointitiedoista: Näytteen rengaslaikunkestävyys. Klikkaamalla linkkiä koskien evaluoitua ominaisuutta (Scald infection %), tulee esille näkymä, jossa kerrotaan arviointiasteikko ja koko evaluointikokeen tiedot.

10 Rengaslaikkuevaluoinnin tuloksia: Taulukosta selviää verkkolaikkuinfektion jakauma ryhmittäin (pylväskuvio), sekä keskiarvo (x), hajonnat (SD ja CV), havaintojen lukumäärä (n) sekä minimi (Min) ja maksimi (Max) arvot. Yksittäisiin näytteisiin pääset klikkaamalla esim. 'Variation by culton'-otsikon alla haluaamaasi näyteryhmää.

havaintojen lukumäärä (n) sekä minimi (Min) ja maksimi (Max) arvot.

Samankaltaiset tiedostot

Octo käyttöohje 1. Sisältö

Octo käyttöohje 1. Sisältö Octo käyttöohje 1 Sisältö Sisältö...1 Sisäänkirjautuminen...2 Etusivu...2 Uimarihaku...3 Uimariryhmät...4 Seurahaku...4 Kilpailutilastot...5 Ilmoittautuminen kilpailuun...6 Kilpailuun ilmoittautuminen...7