Sukusiitosprosentin laskeminen

Samankaltaiset tiedostot
Sukusiitoksesta sukulaistumiseen - jalostustietojärjestelmä työkaluna. Rovaniemi Susanna Back, Suomen Hippos ry

MATEMATIIKKA. Matematiikkaa pintakäsittelijöille. Ongelmanratkaisu. Isto Jokinen 2017

TERVEYSRISKILASKURI v. 2014

Hakuohje -Näin haet tietoja NF-kannasta

Valokuvien matematiikkaa

Urokset: Jalostustoimikunta ei suosittele käytettäväksi jalostukseen urosta, joka on alle 1 vuoden ikäinen.

Esitys Yorkshirenterrieri ry:n kevätkokoukseen

Todennäköisyyslaskenta I, kesä 2017 Helsingin yliopisto/avoin Yliopisto Harjoitus 1, ratkaisuehdotukset

Hippoksen Jalostuspäivät Kuopio Antti Karhila

(1) refleksiivinen, (2) symmetrinen ja (3) transitiivinen.

PERUSLASKUJA. Kirjoita muuten sama, mutta ota välilyönti 4:n jälkeen 3/4 +5^2

Matematiikassa ja muuallakin joudutaan usein tekemisiin sellaisten relaatioiden kanssa, joiden lakina on tietyn ominaisuuden samuus.

LIITE 1 VIRHEEN ARVIOINNISTA

Sukulaisuussuhteesta sukusiitokseen

2.1. Tehtävänä on osoittaa induktiolla, että kaikille n N pätee n = 1 n(n + 1). (1)

Kolmannen ja neljännen asteen yhtälöistä

PERUSLASKUJA. Kirjoita muuten sama, mutta ota välilyönti 4:n jälkeen 3/4 +5^2 3

polveutumistodistus sivu 1/2

ESITYS SUOMEN LAIKAJÄRJESTÖ RY:N HALLITUKSELLE

APH.YaguarET HfN 4282 FIN Kantakirjatodistus sivu 1/2

Fibonaccin luvut ja kultainen leikkaus

1.1 Funktion määritelmä

Miltä näyttää kotimaisten rotujemme perinnöllinen monimuotoisuus? Jalostusvalinta on merkittävin koirarotujen monimuotoisuutta vähentävä tekijä

polveutumistodistus sivu 1/2

polveutumistodistus sivu 1/2

Matematiikan tukikurssi

Laskentaa kirjaimilla

polveutumistodistus sivu 1/2

4 Yleinen potenssifunktio ja polynomifunktio

LIITE 1 VIRHEEN ARVIOINNISTA

Tehtävä 3: Ongelmanratkaisutehtävä

polveutumistodistus sivu 1/2

Siitoskoiran valinta. Katariina Mäki 2010

Erilaisia tapoja tuottaa sukukirjoja

Oletetaan, että virhetermit eivät korreloi toistensa eikä faktorin f kanssa. Toisin sanoen

LIITE 1 VIRHEEN ARVIOINNISTA

polveutumistodistus sivu 1/2

Suomen Ajokoirajärjestön jalostusneuvojan toimintaohje

Laskun vaiheet ja matemaattiset mallit

Suomen Kettuterrierit ry

Karkeakarvainen narttu Europe N.1. du Clos des Amourex, om. Ville Kuronen & Mervi Ihantola

TA7, Ekonometrian johdantokurssi HARJOITUS 4 1 RATKAISUEHDOTUKSET

Miltä näyttää kotimaisten rotujemme perinnöllinen monimuotoisuus?

Merkitse kertolasku potenssin avulla ja laske sen arvo.

alleelipareja dominoiva dominoiva resessiivinen

Johdatus lukuteoriaan Harjoitus 2 syksy 2008 Eemeli Blåsten. Ratkaisuehdotelma

(x, y) 2. heiton tulos y

Keeshondien JTO Mitä jäi käteen? Johdanto. Sukusiitosprosentti Suomen Keeshond ry. Outi Hälli

MITÄ RODULLEMME ON TAPAHTUNUT VIIME VUOSINA! (Tämän artikkelin on laatinut Tarmo Välimäki SDJ.n ja sen jäsenistön käyttöön)

Seguinin lauta A: 11-19

y + 4y = 0 (1) λ = 0

KASVATTAJAKOLLEGION SÄÄNNÖT Voimaan KASVATTAJAKOLLEGION SÄÄNNÖT Voimaan Muutos Muutos

Matematiikan tukikurssi, kurssikerta 3

MAY1 Tehtävien ratkaisut Kustannusosakeyhtiö Otava päivitetty Julkaiseminen sallittu vain koulun suljetussa verkossa.

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Luku 8. Aluekyselyt. 8.1 Summataulukko

Johdatus diskreettiin matematiikkaan Harjoitus 2, Osoita että A on hyvin määritelty. Tee tämä osoittamalla

Järvitesti Ympäristöteknologia T571SA

Approbatur 3, demo 1, ratkaisut A sanoo: Vähintään yksi meistä on retku. Tehtävänä on päätellä, mitä tyyppiä A ja B ovat.

Sekalaiset tehtävät, 11. syyskuuta 2005, sivu 1 / 13. Tehtäviä

Genetiikan perusteet 2009

ESPANJANVESIKOIRIEN ROTUPALAVERI 2014 / ASIALISTA

Vaihtoehtoinen tapa määritellä funktioita f : N R on

Kennelliiton lonkkaindeksilaskentaan 11 uutta rotua

BLUP-indeksejä lasketaan jo 17 rodulle

Kenguru 2010 Benjamin (6. ja 7. luokka) sivu 1 / 5

x 4 e 2x dx Γ(r) = x r 1 e x dx (1)

Rekursio. Funktio f : N R määritellään yleensä antamalla lauseke funktion arvolle f (n). Vaihtoehtoinen tapa määritellä funktioita f : N R on

} {{ } kertaa jotain

RANTA-ALUEEN JA KUIVANMAAN MITOITUS- JA EMÄTILATARKASTELU

Vuoden kettuterrieri & metsästysterrieri 2012 skn Woodborne Golden Horn om. Emilia Hakamäki ja Marko Männikkö

polveutumistodistus sivu 1/2

polveutumistodistus sivu 1/2

Terveempien koirarotujen puolesta - sukusiitosdepressiota ja matadorijalostusta vastaan

OHJELMOINNIN POHJUSTUSTA PÄÄTTELYÄ JA ERI VAIHTOEHTOJEN TUTKIMISTA

Populaatiosimulaattori. Petteri Hintsanen HIIT perustutkimusyksikkö Helsingin yliopisto

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Laskun vaiheet ja matemaattiset mallit

Öljysäiliö maan alla

Diskreetin matematiikan perusteet Laskuharjoitus 1 / vko 8

Excel syventävät harjoitukset

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

4 LUKUJONOT JA SUMMAT

JALOSTUSTOIMIKUNNAN VUOSIKERTOMUS 2014

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Juuri 10 Tehtävien ratkaisut Kustannusosakeyhtiö Otava päivitetty

MAB3 - Harjoitustehtävien ratkaisut:

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

MATP153 Approbatur 1B Ohjaus 2 Keskiviikko torstai

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

LABORAATIOSELOSTUSTEN OHJE H. Honkanen

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

ORMS2020 Päätöksenteko epävarmuuden vallitessa Syksy Tehtävissä 1, 2, ja 3 tarkastelemme seuraavaa tilannetta:

Latinalaiset neliöt ja taikaneliöt

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

Jalostustarkastuksen pöytäkirja

KASVATTAJAKOLLEGION SÄÄNNÖT Voimaan KASVATTAJAKOLLEGION SÄÄNNÖT Voimaan Muutos Muutos

Transkriptio:

-Teoriasta käytäntöön- Sukusiitosprosentin laskeminen Tyhjästä on paha nyhjästä, koiranpentuakaan. Siispä ollen voimmekin hyvällä omallatunnolla sanoa, että jokaisella koiralla on olemassa kaksi varsin läheistä sukulaista; isä ja emä. Näillä taas molemmilla on luonnollisesti omat vanhempansa. Kun sukutaulussa esiintyy sama koira useampaan kertaan, puhutaan suku- tai linjasiitoksesta. Se, kuinka voimakasta tai lievää linjaus on, ilmaistaan sukusiitosprosenttina tai sukusiitosasteena. Muistettava on kuitenkin, ettei sukusiitos ole yksinomaan hyvä tai huono asia: jokaisen rodun synty ja kehitys on tapahtunut tietynasteisella sukusiitoksella. Tähän perustuu se, että ylipäänsä on olemassa keskenään erinäköisiä koirarotuja. Jokaisella koiralla on tuhansia erilaisia perintötekijäpareja, joiden siirtyminen yksilön jälkeläiseen on luonnon lakien säätelemänä sattumanvaraista. Siispä ollen täyssisarukset saattavat olla genomiltaan jopa täysin erilailla muotoutuneet (jolloin ne eivät ole geneettisessä mielessä lainkaan sukua toisilleen!) ja toisaalta taas hyvinkin lähekkäistä perua (samamunaisilla kaksosilla sukulaisaste on 100%). Teoriassa kuitenkin molempien todennäköisyys on suuruusluokkaa nolla. Per-Erik Sundgren kirjassaan "Koiranjalostus" kertookin, että on mahdotonta seurata, miten yksityiset geenit periytyvät sukupolvelta toiselle ja siten sen perusteella laskea, mikä on kahden yksilön välinen todellinen sukulaisuusaste. Laskukaavan mukainen sukusiitosaste on siis summittainen, mutta se kertoo kuitenkin suuntaanantavasti jalostuksellisesti arvokasta tietoa sikäli, että se on korkein mahdollinen arvo (!), jonka jalostusyhdistelmä sisällään pitää. Korkein mahdollinen sukulaisaste kahden koirayksilön välillä on normaalitilanteessa 50%, sillä sukulaisuusaste puoliutuu jokaisessa sukupolvessa; 5%, 1,5%, 6,5%,,15% jne. Isä-tytärparitus: sukusiitosaste on 5% täyssisarusten paritus: 5% puolisisarukset 1,5 % jne.

Huomiotavaa on kuitenkin, että isä-tytär-paritus on käytännössä kuitenkin lievempää, kuin täyssisarparitus; tuleehan tällöin neljäsosa genomista täyssisarparitukseen verrattuna 'ulkopuolelta'. Kaikkia koiranomistajia varmaankin kiinnostaa oman koiransa sukusiitosprosentti ja toisaalta kasvattajaa suunnittelemansa yhdistelmän prosentuaalinen lukuarvo. Laskukaavoja on usempia, alla esitetyn on laatinut S. Wright ja se on esitetty perinteikkäässä ja arvostetussa L. Vuolasvirran teoksessa: "Koiranjalostuksen opas". F x =Σ[(0,5) n + n + 1 * (1 + F A )] Ei pidä säikähtää kaavan kammottavaa ulkomuotoa! Käydään kohta kohdalta läpi, kuinka lasku suoritetaan. Ensin termistöön: F x on se arvo, jonka haluamme selvittää = sukusiitoskerroin (josta saa sukusiitosprosentin kertomalla saadun tuloksen 100:lla). Σ on matematiikassa käytetty summan merkki, joka tarkoittaa että kaikki seuraavien hakasulkeiden sisällä olevat eri vaihtoehtojen arvot lasketaan yhteen. n ja n (luetaan N-pilkku) merkitsevät niiden sukupolvien lukumäärää, jotka e r o t t a v a t yhteisen esivanhemman ko. koiran isästä ja emästä. F A on yhteisen esivanhemman oma sukusiitoskerroin. Se lasketaan kuten F x. Aloitettaessa laskemaan sukusiitosprosenttia, kannattaa ensimmäiseksi tehdä normaalin näköinen neljän polven sukutaulu alkaen koiran vanhemmista (ei koirasta itsestään!). isä ii ie iii iie iei iee iiii iiie iiei iiee ieii ieie ieei

ieee emä ei ee eii eie eei eee eiii eiie eiei eiee eeii eeie eeei eeee Tähän sukutauluun merkitset vain nimet vain, jos löydät yhteisen nimen sekä isän, että emän puolelta (Jos nimi kertaantuu pelkästään esim. isän puolella, ei sitä oteta huomioon ko. yhdistelmän sukusiitosprosenttia laskettaessa). Voit tarkastaa koiran rekisterinumerosta, onko yksilö todella sama, vai pelkästään vain samanniminen. Kuvitellulle sukutaululle saisimme vaikka seuraavat yhteiset nimet: Peni Musti Nisse Musti Omppu Peni Musti Nisse

Simo Peni Omppu Omppu Musti Nisse Simo Huomaamme, että tässä sukutaulusta löytyy jo tällaiselta aikaa runsaasti yhteisiä nimiä eli yhdistelmä on varsin sukusiitetty. Poimimme nimet nyt erilleen: Peni Omppu Simo Nisse Musti PENIN OSUUS Otamme jokaisen yksitellen käsittelyyn, ensin Penin. Peni tulee koiran molemmilta puolilta, toiselta kerran, toiselta kaksi kertaa. Sijoitamme kaavioon seuraavat arvot: Peni: n= (eli kaksi hyppyä on otettava, jotta pääsemme isästä isän isän isään) n = (eli kaksi hyppyä on myös otettava, että pääsemme emästä => emän isän isään). tulos: n=, n =. Peni saa myös toiset arvot, koska emän puolella on myös emän emän isänä Peni. Tarvitsemme sille jälleen parin isän puolelta, niin ollen laskennassa kertaantuu uudelleen

n= (eli kaksi hyppyä isästä => isän isän isään) ja n = (kaksi hyppyä emästä => emän emän isään). tulos: n=, n =. Teemme näistä kaksi erillistä lauseketta, joihin täytämme n ja n -kohdat 1) F x =[(0,5) + + 1 * (1 + FA)] = [(0,5) 5 * (1 + F A )] ) F x =[(0,5) + + 1 * (1 + FA)] = [(0,5) 5 * (1 + F A )] Olemme jo aika pitkällä. Lauseke on nyt muodossa 0,5 potenssiin viisi (joka kerrotaan yksilön omalla sukusiitosprosentilla). Ja koska lausekkeita on kaksi, laskemme nämä yhteen. Eli 0,5 potenssiin viisi on (laskukoneella helppoa!) 0,015 ja se kertaa kaksi on 0,065. Jos muita yhteisiä koiria ei olisi suvussa, eikä Peni olisi itse linja- tai sukusiitetty, olisi lopullinen arvo 0,065 eli prosenttiluvuksi muutettuna (kerrotaan sadalla) 6,5%. Mutta esimerkkimme onkin tarkoituksella otettu hieman vaikemmaksi. Nyt täytyy tarkastella Penin oma sukusiitosaste, jota varten joudumme tekemään uuden neljän polven taulukon Penille (aloitetaan siis Penin isästä ja emästä) ja sijoittamaan taas siihen yhteiset koirat. Toteamme, että niitä vain yksi, nekin kolmannessa polvessa. Sijoitamme siis kakkoset (koska lasku, eli "hypyt" aletaan vanhemmista ei yksilöstä itsestään) tähän samaan kaavioon ja saamme täsmälleen ylläolevan lausekkeen kaltaisen: ) F x =[(0,5) + + 1 * (1 + F A )] = [(0,5) 5 * (1 + F A )]= 0,015 Penin oma sukusiitosaste on siis,15% ja näin lopullinen lauseke muuntuu muotoon 6,5% * 1,015 = 6,445% OMPUN OSUUS Omppu esiintyy sukutaulussa kolme kertaa. Laskennallisesti huomaamme, että nimi on neljännessä, neljännessä ja kolmannessa polvessa. Lukuarvoiksi tulee siis taas kaksi lauseketta: 1) F x =[(0,5) + + 1 * (1 + F A )] = [(0,5) 7 * (1 + F A )]= 0,007815 ) F x =[(0,5) + + 1 * (1 + F A )] = [(0,5) 6 * (1 + F A )]= 0,01565 Arvot lasketaan yhteen: tulos on 0,007815 + 0,01565 = 0,0475 eli prosenteiksi muutettuna,4%. Ajatellaan nyt, ettei Omppu itse omaa kertautuvia koiria, joten F a = nolla ja lopullinen luku on siis,4%.

SIMON OSUUS Huomioitavaa! Simo EI TULE tässä neljän polven sukutaulussa molemmilta puolilta, vaan vain emän kautta, joten se ei laskennallisesti tule mukaan. (Jos määritettäisiin pelkästään koiran emälle sukusiitosprosenttia, silloin Simo tietty vaikuttaisi, koska emälle se tulee sekä emän emän että emän isän puolelta.) Tässä on siis selitys sille, miten täydellisen sukusiitetystä koirasta saadaan sen suoraan alenevalle jälkeläiselle sukusiitosprosentiksi nolla; käytetään tällaiselle koiralle täyttä ulkosiitosta, sillä perintötekijät tulevat koiran molemmilta vanhemmilta. (Tarkkanäköisemmät huomannevat, että tosiasiassa Simo tulee yhdistelmän molemmilta puolilta, koska se on Ompun isä... mutta jotta laskukaavan selvitystyö ei vaatisi koko Lapinkoiralehteä, teemme nyt oletuksen, ettei Ompun isä olisikaan Simo... ja jatketaan eteenpäin. Tosiasiassa lopullinen laskettu arvo on siis alakanttiin tästä syystä.) NISSEN OSUUS Nisse tulee Penin takaa kolmesti, mutta jätetään laskennassa huomiotta, koska Peni on jo huomioitu ja Penille oma F A. MUSTI Sitä vastoin Musti Musti saa kaksi lukuarvoa: 1) n=, n = (iiei-eiii): F x =[(0,5) + + 1 * (1 + F A )] = [(0,5) 7 x (1 + F A )]= 0,007815 ) n=, n = (iiei-eeii): samoin 0,007815 yht. 0,001565 = 1,565% Lopulliset arvot tulevat näiden kerrattujen koirien prosenteiden yhteenlaskemisesta: Peni: 6,445 % Omppu:,4 %

Nisse: 0 % Musti: 1,565 % --------------- yht. 10,5 % VIELÄ KAIKKI YKSINKERTAISTETUSTI Niille, jotka kadottivat ajatuksen tähän laskentaan, on lopuksi tarjolla vielä erittäin yksinkertaisettu tapa selvittää koiransa sukusiitosprosentti. Tehdään koiran sukutaulu seuraavanlaiseen "numeeriseen muotoon" 0 0 1 1 1 1

Nyt merkitse väreillä ne numerot, joiden kohdassa sukutaulussa on sama koira. Jos kaksi koiraa kertaantuu, merkitse toiset eri väreillä jne. (Siltä varalta, etteivät värit erotu näytössä, olen kirjoittanut sulkuihin värin perään) (punainen) (vihreä) (sininen) (musta) (punainen) (punainen) (musta) (sininen) (vihreä) (maroon) (musta) (sininen) (vihreä) (maroon) Nyt kirjoita ylös ympyröiden sisään jäävät luvut ja katso vastaava arvo seuraavasta taulukosta: 0+1 5%

1+0 0+ +0 1+1 0+ +0 1+ +1 + 1+ +1 0+4 4+0 + + 1+4 4+1 0+5 5+0 + +4 4+ 1+5 5+1 6+0 0+6 1,5% 6,5%,15% 1,565% 0,7815% Ottamatta vielä huomioon F A -arvoa, saadaan: Peni (punainen): + + Nisse (vihreä): laskettu Penin oman siitosprosentin takaa, ei oteta huomioon) Omppu (musta) + + Musti (sininen): + + Simo (maroon): Ei tule kuin emän takaa, jätetään huomiotta.

Ja lukuarvot muutettuna taulukon prosenteiksi: Peni:,15 +,15 Omppu: 0,7815 + 1,565 Musti: 0,7815 + 0,7815 yhteensä: 10,16% Jos halutaan saavuttaa todellinen tarkkuus, on otettava huomioon jokaiselle linjatulle koiralle myös niiden oma sukusiitosprosentti. Se tapahtuu seuraavasti: Jos ympyröity koira on itse linja- tai sukusiitoksen tulos, tee sille oma "numeroitu sukutaulu" ja laske sen prosentti aivan niinkuin edellä. Jos arvoksi tulee,15%, jaat tämän luvun sadalla (=0,015) ja lisään saatuun lukuun numeron YKSI (=1,015). Nyt kun kerrot ympyröidylle koiralle alunperin saadun prosentin 6,5% tällä luvulla, saat (6,5% kertaa 1,015) = 6,445%. Näin teet jokaiselle linjatulle koiralle ja saat lopulliset prosentit yhteenlaskua varten: Peni = 6,5% * 1,015 = 6,445% Omppu=,4% * 1,0 =,4% Musti: 1,565% * 1,0 = 1,565% yhteensä: 10,475% Mukavia laskuhetkiä! teksti Salme Mujunen Pääsivulle