DNA sukututkimuksen tukena

Samankaltaiset tiedostot
DNA-testit. sukututkimuksessa Keravan kirjasto Paula Päivinen

DNA testit sukututkimuksessa

Hallikaisten varhaisvaiheet ja suvun DNA-tulokset Ari Kolehmainen Suku- ja historiapalvelu Menneen jäljet

Sukukokous TERVETULOA! Järvisydän, Rantasalmi

Riekkisten suvun alkuvaiheet ja DNA-tulokset

Niskaset ja DNA-avusteinen sukututkimus sekä sukututkimuksen jatko Suku- ja historiapalvelu Menneen jäljet

2 vielä yleisimmin käytetty on 67 markkerin tutkimus, jolla testattavien välille löytyy yleensä jo eroja.

Marttisten sukuhaarojen Y- DNA tutkimus

Y-DNA ja sukututkimus

TIMO LÖNNMARKIN ISÄLINJAN GENEETTINEN TUTKIMUS

Sukulaisuutta setvimässä

Sukulaisuutta setvimässä

Perinnöllisyyden perusteita

KUMPULAISTEN ISÄLINJAN DNA

Sukulaisuutta setvimässä Ilmestynyt Wanha Tuomas -lehdessä 2019

S Laskennallinen systeemibiologia

måndag 10 februari 14 Jaana Ohtonen Kielikoulu/Språkskolan Haparanda

Perinnöllisyys harvinaisten lihastautien aiheuttajana. Helena Kääriäinen Terveyden ja hyvinvoinnin laitos Tampere

Millä oksalla istut? Teuvo Ikonen

Perinnöllisyys. Enni Kaltiainen

Euromit2014-konferenssin tausta-aineistoa Tuottaja Tampereen yliopiston viestintä

DNA-kartoitus sukututkimuksen apuna

Mulikka-Keisari-Roivanen (MKR) sukujen DNA-projekti

1/2017. Sukuseura Tynys ry:n lehti

X-kromosominen periytyminen. Potilasopas. TYKS Perinnöllisyyspoliklinikka PL 52, Turku puh (02) faksi (02)

Ensiksikin suuri kiitos kaikille mukana olleille, jotka antoivat näytteensä tätä tutkimusta varten!

LEHIKOISTEN VARHAISVAIHEET

O H J E L M A. 39. Valtakunnallisten sukututkimuspäivien. Muista mist oot kotoosin!

DNA:n informaation kulku, koostumus

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen BLL Biokemia ja kehitysbiologia

Vartiaisten. Viesti. Yhteys sukuumme

Perinnöllisyys 2. Enni Kaltiainen

Epigeneettinen säätely ja genomin leimautuminen. Tiina Immonen Medicum, Biokemia ja kehitysbiologia

Kymmenen kärjessä mitkä ovat suomalaisten yleisimmät perinnölliset sairaudet?

PikkuKakkonen KAKKOSTEN SUKUYHDISTYKSEN KAHDESKYMMENES LEHTI

Sukusiitoksesta sukulaistumiseen - jalostustietojärjestelmä työkaluna. Rovaniemi Susanna Back, Suomen Hippos ry

Uusia mahdollisuuksia FoundationOne CDx. keystocancer.fi

TUTKIMUSSUUNNITELMA PIIRA-HEIMON GENEETTINEN TAUSTA. Jorma Piirainen Eskil Piira Sukuseura ry. syyskuu 2012

Peittyvä periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

Jokaisesta sairausgeenistä saa lisätietoa klikkaamalla kyseisen sairauden kohtaa ohjelmassa.

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi

Sukupuuhun liittyy monia pappissukuja ovat mm. Hoffren- Hoffrenius- Houru, Porthan-Portanus, Costian- Costiander-Kostilainen, Silania-Silanus.

GEENITEKNIIKAN PERUSASIOITA

Suomalaisten monet juuret

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

Suomalaisuuden alkuperä, mitä geenit kertovat?

Populaatiosimulaattori. Petteri Hintsanen HIIT perustutkimusyksikkö Helsingin yliopisto

Symbioosi 2 VASTAUKSET

Sukuseuran ensimmäinen kokous Puolangalla oli kerännyt kokoon runsaasti kansaa, useita satoja.

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita. BI2 III Perinnöllisyystieteen perusteita 9. Solut lisääntyvät jakautumalla

Korhosten sukuhistorian tarkentaminen geenisukututkimuksen avulla Jaakko Häkkinen

Arkkitehtuurien tutkimus Outi Räihä. OHJ-3200 Ohjelmistoarkkitehtuurit. Darwin-projekti. Johdanto

1/2019 Räsästen Sukuyhdistys ry Perustettu v. 1945

Kalmin Sukuseura. Pääkirjoitus

a) dominoivaan: esiintyy joka sukupolvessa, sairaille vanhemmille voi syntyä terveitä lapsia

Kromosomimuutokset. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com. Huhtikuussa 2008

Mistä suomalaisten geneettinen ydna N-haploryhmä on peräisin? Milloin suomensukuinen vaaleaihoinen väestö on saanut alkunsa?

Vihavaisten suvun varhaisvaiheita. Ari Kolehmainen

Huono-osaisuuden periytyminen: Mitä annettavaa on geneettiset tekijät huomioivilla tutkimusmenetelmillä?

VASTAUS 1: Yhdistä oikein

Muuttumaton genomi? Genomin ylläpito. Jakson luennot. Luennon sisältö DNA:N KAHDENTUMINEN ELI REPLIKAATIO

Genin käytön lyhyt opastus Huttusten sukukokouksessa

Lataa Homo Europaeus - Karin Bojs. Lataa

Lataa Homo europaeus : Eurooppalaisen ihmisen pitkä historia - Karin Bojs. Lataa

Erilaisia tapoja tuottaa sukukirjoja

Terveyteen liittyvät geenitestit

Geenitekniikan perusmenetelmät

Naudan perinnöllisen monimuotoisuuden tutkimus

alleelipareja dominoiva dominoiva resessiivinen

Digihyvinvointi perheissä

Kaukosten suvun synty ja alkuvaiheet

Miten geenitestin tulos muuttaa syövän hoitoa?

Biopolymeerit. Biopolymeerit ovat kasveissa ja eläimissä esiintyviä polymeerejä.

Opiskelijoiden nimet, s-postit ja palautus pvm. Kemikaalin tai aineen nimi. CAS N:o. Kemikaalin ja aineen olomuoto Valitse: Kiinteä / nestemäinen

III Perinnöllisyystieteen perusteita

NCL australiankarjakoirilla

Genomin ylläpito Tiina Immonen BLL Lääke8eteellinen biokemia ja kehitysbiologia

suomalaisten esihistoriaa DNA - tutkimuksen avulla VANTAAN ROTARYKLUBI Seppo Liukko

Tiedonalaperustaisen osaamisen vahvistamista ja sukututkimusta oman geenitestin avulla: miten opettaja voi hankkia ja käyttää tietoa opetuksessaan

Avainsanat: perimä dna rna 5`-ja 3`-päät replikaatio polymeraasientsyymi eksoni introni promoottori tehostajajakso silmukointi mutaatio

YLEISIÄ KYSYMYKSIÄ Kieliä koskevia olettamuksia nostraattiteoria

PAGANUKSEN SUKUSEURA RY. Jäsentiedote 1/2017/ HYVÄ SUKULAINEN

Metsägenetiikan sovellukset: Metsägenetiikan haasteet: geenit, geenivarat ja metsänjalostus

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

KEESHONDIEN MONIMUOTOISUUSKARTOITUS

1 of :11

TESTITULOSTEN YHTEENVETO

Miltä näyttää kotimaisten rotujemme perinnöllinen monimuotoisuus? Jalostusvalinta on merkittävin koirarotujen monimuotoisuutta vähentävä tekijä

Peptidi ---- F K V R H A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit

Koiran periytyvä persoonallisuus

Tiedonjyväsiä cavalierien geenitestauksista imuroituna maailmalta

Vallitseva periytyminen. Potilasopas. Kuvat: Rebecca J Kent rebecca@rebeccajkent.com

DNA Tiina Immonen, FT, yo-lehtori HY Biolääketieteen laitos, Biokemia ja kehitysbiologia

Biologia ylioppilaskoe

Eri väestöjen sukujuuria ei voida selvittää. Idästä vai lännestä? Suomalaisten geneettiset sukujuuret. Katsaus

AS Automaation signaalinkäsittelymenetelmät. Tehtävä 1. Käynnistä fuzzy-toolboxi matlabin komentoikkunasta käskyllä fuzzy.

Genomin ylläpito TIINA IMMONEN MEDICUM BIOKEMIA JA KEHITYSBIOLOGIA

Rintasyövän perinnöllisyys

Transkriptio:

Järvenpää 12,2,2019 Teuvo Ikonen teuvo.ikonen@welho.com DNA sukututkimuksen tukena DNA sukututkimuksessa (Peter Sjölund: Släktforska med DNA) tiesitkö, että olet kävelevä sukukirja? on kuin lukisit kirjaa omasta alkuperästäsi saat omasta alkuperästäsi selville asioita, joista aiemmat sukututkijasukupolvet ovat voineet vain uneksia ei anna vastauksia kaikkiin kysymyksiin, mutta se on vahva työkalu yhdistettynä perinteiseen sukututkimukseen takuu: tulet löytämään uusia sukulaisia Mistä tutkitaan? DNA:n osat (Peter Sjölund) autosomaali DNA kromosomiparit naisilla ja miehillä 1 22 Y-DNA Y-kromosomi vain miehillä mtdna mitokondriot naisilla ja miehillä X-DNA X-kromosomi naisilla ja miehillä, naisilla kaksi ja miehillä yksi X-kromosomi 1

Neljä DNA-tyyppiä (Peter Sjölund) DNA:n tyyppi Kenellä on Keneltä periytyy autosomaali DNA (adna) naisilla ja miehillä molemmilta vanhemmilta 50/50 Y-kromosomi (YDNA) vain miehillä aina isältä mitokondrio-dna (mtdna) naisilla ja miehillä aina äidiltä X-kromosomi (XDNA) naisilla kaksi ja miehillä yksi X- kromosomi Mitä DNA-tutkimuksella voidaan selvittää? kahden yksilön keskinäistä sukulaisuutta saman sukunimen kantajien keskinäistä sukulaisuutta yksilön isä- tai äitilinjaa yksilön biomaantieteellistä ja etnistä taustaa kansojen muuttoliikkeitä ja geneettistä historiaa äidiltä ja isältä, mutta ei koskaan kahdelle miehelle peräkkäin Y-DNA tutkitaan henkilön isälinjaa hänen Y-kromosominsa perusteella Y-kromosomin DNA periytyy isältä pojalle lähes muuttumattomana markkereissa tapahtuu kuitenkin sattumanvaraisia pomppimisiia Y-kromosomien geeneissä tapahtuu ajoittain mutaatioita (SNP), joka periytyy isälinjaisesti eteenpäin -> haploryhmät on määritelty näiden perusteella mtdna tutkitaan äitilinjaa, jossa mitokondrion DNA periytyy biologiselta äidiltä lähes muuttumattomana kaikille äitilinjaisille jälkeläisille, siis sekä pojille että tyttärille mutaatioita tapahtuu suhteellisen harvoin eli mitokondrion kello käy hitaasti Autosomaali DNA käytetään sukulaisuuksien selvittämiseen sekä biologisen isän että biologisen äidin sukujen eri sukuhaaroista, ns. etäserkuista kertoo myös etnisestä alkuperästä Minkä yrityksen valitsisin? Suomalaisten eniten käyttämä yritys on amerikkalainen Family Tree DNA (FTDNA), jonka laboratoria sijaitsee Houstonissa. Tämä yritys on sitoutunut noudattamaan Euroopan Unionin tietototurvalainsäädäntöä eikä se myöskään luovuta testituloksia kolmannelle osapuolelle. www.familytreedna.com Minkä Y-DNA-testin valitsisin? Testi Hinta (dollaria) Hinta (euroa) Y-37 169 noin 148 Y-67 268 noin 235 Y-111 359 noin 315 Big Y-500 649 noin 568 2

Minkä mtdna-testin valitsisin? Testi Hinta Hinta (euroa) (dollaria) mtdna Plus 89 78,50 mtfull Sequence 199 175,50 Minkä autosomaalitestin valitsisin? Testi Hinta Hinta (euroa) (dollaria) Family Finder 79,00 70,00 Family Finder 1 59,00 52,00 1. Ystävänpäivän tarjous 14.2.2019 saakka FTDNA järjestää vuosittain useita kampanjoita, jolloin hinnat ovat merkittävästi listahintoja edullisempia. Suomi DNA-sivustolta saat tietoja mm. testien tilaamisesta. https://www.familytreedna.com/groups/finland/about/background Muutamia käsitteitä Markkeri on määriteltävissä oleva kohta geenissä. Sen periytymistä voidaan tarkkailla. Yleisimmät testit ovat 67 ja 111 markkerin testejä, joilla haetaan yksilöiden välisiä sukulaisuuksia. Haploryhmä on erilaisten markkereiden kokonaisuuden perusteella määritelty yhdistelmä. Uusi haploryhmä syntyy mutaatioiden seurauksena ja se siirtyy sukupolvelta toiselle. SNP eli snippi tarkoittaa mutaatiota ja sitä käytetään yksilöiden antropologisen alkuperän tunnistamiseen. Mutaatio on perintöaineksen muuttuminen jossakin vaiheessa solun jakautumista.. Lapsen DNA kopioituu äidin ja isän DNA:sta. Kokonaisuudessaan yli kolme miljardia aminohappoa siirtyy lapselle. Tässä prosessia tapahtuu kuitenkin aika ajoin ja sattumanvaraisesti virhekopiointeja. DNA:ssa olevat emäkset ovat seuraavat. A = Adeniini G = Guaniini C = Sytoosi T = Tymiini 3

Kumulatiivinen taulukko Kun kumulatiivisessa taulukossa on luku 95 % ja siihen liittyvä sukupolvien tai vuosien määrän ilmoittava piste, se tarkoittaa, että siihen pisteeseen mennessä 95 % tapauksista on löytänyt lähimmän yhteisen esilinjaisen esi-isänsä. Se ei missään tapauksessa tarkoita, että lähin yhteinen esi-isä löytyisi 95 %:n todennäköisyydellä juuri siitä sukupolvesta tai vuodesta. Esimerkiksi jos 111 markkerin testissä kahdelle miehelle tulee yhden markkerin ero, noin puolet löytää lähimmän yhteisen esi-isän kolmanteen sukupolveen mennessä ja 95 % seitsemänteen sukupolveen mennessä. Lähde: Marja Pirttivaara, uuresi näkyvät Geneettisen sukututkimuksen ABC, Siltala 2017, sivut 88-89 TMRCA = aika yhteiseen lähimpään esivanhempaan Tehtävä Mikä painovirhe on edellisessä taulukossa? 4

FamilyTreeDNA 111 markkeria Sukupolvet numeroina Luotettavuus Geneettinen etäisyys Sukulaisuus Tulkinta 50% 90% 95% 99% 0 Erittäin vahvasti samaa sukua 111/111 osuma osoittaa erittäin läheistä tai välitöntä sukulaisuutta. Useimmat tarkat osumat ovat 2. tai sitä läheisempiä serkkuja ja yli puolet ovat samaa sukua kahden sukupolven sisällä (1. serkut). 2 4 5 6 1 Vahvasti samaa sukua 110/111 osuma osoittaa läheistä sukulaisuutta. Useimmat tällaiset osumat ovat 5. tai sitä läheisimpiä serkkuja ja yli puolet ovat 2. tai läheisimpiä serkkuja. 3 6 7 9 2 Vahvasti samaa sukua 3 Samaa sukua 109/111 osuma osoittaa läheistä sukulaisuutta. Useimmat osumat ovat 7. tai läheisimpiä serkkuja ja yli puolet ovat 4. tai läheisimpiä serkkuja. 108/111 osoittaa geneettistä sukulaisuutta. Useimmat tämän tason osumat ovat 9. tai läheisimpiä serkkuja ja yli puolet ovat 5. tai läheisempiä serkkuja. Tämä on hyvin perinteisen sukututkimuksen rajoissa. 5 8 9 11 6 10 11 14 4 Samaa sukua 107/111 osuma osoittaa geneettistä sukulaisuutta. Useimmat tämän tason osumat ovat 10. tai sitä läheisempiä serkkuja ja yli puolet ovat 6. tai sitä läheisempiä serkkuja. Tämä on hyvin perinteisen sukututkimuksen rajoissa. 7 11 13 16 5 Samaa sukua 106/111 osuma osoittaa geneettistä sukulaisuutta. Useimmat tämän tason osumat ovat 12. tai läheisimpiä serkkuja ja yli puolet ovat 7. tai läheisempiä serkkuja. Tämä on hyvin perinteisen sukututkimuksen rajoissa. 8 13 15 18 Mitä geneettinen sukututkimus ei ole? Geneettinen sukututkimus on lisäys perinteiseen sukututkimukseen, ei sen korvaaja. Geneettisen sukututkimuksen testi tuo ilmi vain pienen prosentuaalisen osuuden ihmisen perimästä. Kymmenen sukupolven puussa on 1024 esivanhempaa, mutta Y-DNA testi tai mtdna testi edustaa vain yhtä yksilöä näistä 1024:stä. 5

N-haploryhmän migraatio Nettiosoitteita sukututkijalle HuMo-gen, Sukututkimus, seikkailu omaan historiaan Mygrations, haploryhmägrafikkaa Suomenkuvalehden erinomainen juttu Helsingin seudun geneettisen sukututkimuksen ystävät http://www.humogen.net/ https://phylogeographer.com/mygrations/ Olenko sittenkin rasisti? Kuusi kysymystä rodusta - Suomenkuvalehti.fi Yhdistys on perustettu 5.2.2019. ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- 6

I-haploryhmän migraatio 7

Suomalaisten naisten yleisimmät haploryhmät H ja U 8

9

10

11