BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA

Transkriptio

1 BIOKEMIAN KOULUTUSOHJELMA Biokemian linja Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan linja Elintarvikekemian linja Koulutusohjelman tavoitteet Biokemia on biologian ja kemian välimaastoon sijoittuva luonnontieteisiin kuuluva itsenäinen tieteenala. Se tutkii elävissä soluissa tapahtuvia kemiallisia reaktioita ja niiden säätelyä sekä solun kemiallista hienorakennetta. Viime vuosina tapahtunut biokemian ja varsinkin sen erään osa-alueen, molekyylibiologian, nopea kehittyminen on entisestään lisännyt biokemiassa hankitun tiedon merkitystä elävän luonnon tutkimisessa, suojelussa ja hyödyntämisessä. Biokemia perehdyttää opiskelijat biologista alkuperää olevien molekyylien rakenteeseen ja toimintaan sekä erillisten biokemiallisten tapahtumien merkitykseen yksityisille soluille ja koko organismille. Erityisesti opiskelijalle pyritään antamaan tutkimuksessa tarvittava tietotaito sekä valmiudet soveltaa opittua tieteellisten ja käytännön ongelmien ratkaisemiseen. Elintarvikekemia tutkii biologisten materiaalien ja elintarvikkeiden kemiallista koostumusta, rakennetta ja ominaisuuksia sekä elintarvikkeissa tapahtuvia kemiallisia ja biokemiallisia muutoksia. Elintarvikekemia sijoittuu täten myös ravitsemustieteen lähialueelle sekä nojautuu läheisesti muihin luonnontieteisiin, erityisesti kemiaan ja biokemiaan. Elintarvikekemia on soveltava tieteenala, jonka laajan perustutkimuksen tuloksia sovelletaan käytännönläheisten ongelmien ratkaisemiseen. Elintarvikekemistin koulutuksen tavoitteena on antaa laaja-alainen näkemys elintarvikekemian kentästä sekä taata valmiudet toteuttaa elintarvikekemistin työsarkaa niin tutkimustyön, tuotekehityksen, valvonnan kuin hallinnonkin piirissä. Erityinen paino opetuksessa ja opiskelussa on elintarvikekemialliseen tutkimukseen perehtymisessä ja tämän tiedon soveltamisessa elintarvikealaa kehitettäessä. Biotekniikka tutkii ja kehittää elävien solujen, solun osien, biokemiallisten menetelmien sekä molekyylibiologian uusimpien menetelmien käyttösovellutuksia. Opiskelijat perehdytetään biotekniikan menetelmiin, joilla solujen ja yksittäisten molekyylien rakenteita ja ominaisuuksia kyetään tutkimaan ja muuntamaan sekä biotekniikkaa soveltaviin prosesseihin. Biotekniikalla on yhteyksiä useisiin eri tieteenaloihin ja sen merkitys on 22

2 jatkuvasti lisääntynyt. Opetuksen tarkoituksena on perehdyttää opiskelijat biotekniikan menetelmiin, erityisesti molekulaariseen biotekniikkaan ja in vitro -diagnostiikkaan sekä biotekniikkaa soveltaviin ja hyödyntäviin prosesseihin. Sijoittuminen eri ammattialoille Koulutusohjelmasta valmistuneet filosofian maisterit sijoittuvat hyvin monenlaisiin tehtäviin. Yleisimmin työpaikka löytyy tutkimuksen, opetuksen, laadunvalvonnan, tuotekehityksen, informaatiopalvelun, ympäristönsuojelun, markkinoinnin sekä hallinnon parista. Yhteenveto opintojen rakenteesta Opinnot Biokemian linja Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro - diagnostiikan linja Elintarvikekemian linja LuK FM LuK FM LuK FM Perusopinnot Biokemia 51,5 81,5 25,5 25,5 9,5 9,5 Biotekniikka Elintarvikekemia Gradu Kemia Tilastotiede 3 3 Vaihtoehtoiset sivuaineiden opinnot Kieli- ja 3,5 3,5 3,5 3,5 3,5 3,5 viestintäopinnot Yhteensä LuK = Luonnontieteiden kandidaatin tutkinto FM = Filosofian maisterin tutkinto LuK-tutkielma ja seminaarin laajuus kullakin linjalla. 23

3 Biokemian linja, opintojen ohjeellinen ajoitus (FM) Ensimmäinen vuosi 1. syksy 1. kevät Toinen vuosi 2.syksy 2. kevät Kolmas vuosi 3. syksy 3. kevät Neljäs vuosi 4. syksy 4. kevät Viides vuosi 5.syksy 5.kevät Pakolliset kemian opinnot 8 ov Pakolliset kemian opinnot 7 ov Geeniteknologian menetelmät Biokemian perusharjoitustyöt 7 ov Äidinkielen opinnot LuKtutkielma ja seminaari Entsyymi- ja proteiini kemian luennot 4 ov Erikoistyöseminaari Molekyylibiologian harjoitustyöt 5 ov Erikoistyö 15 ov Erikoistyö 5 ov Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II Biokemian perustyömenetemät Mikrobiologian perusteet Geenien ilmeneminen Äidinkielen opinnot 0,5 ov Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt Bioinformatiikkaa biokemisteille Loppukuu lustelu 4-8 ov Elintarvikekemian perusteet Ruotsi Mikrobiologian harjoitustyöt Geenien säätely Lopputentti (aineopinnot) 5 ov Syventävien opintojen harjoitustyöt 8 ov Tutkielma 8 ov Mitä biotekniikka on? Immunologian perusteet Vieras kieli Laatujärjestelmät Tieteellinen viestintä 0,5 ov Vaihtoehtoiset biokemian syventävät opinnot 5-9 ov Vaihtoehtoiset kemian aineopinnot 20 ov Vaihtoehtoiset sivuaineopinnot 17 ov 24

4 Molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan linja, opintojen ohjeellinen aloitus (FM) Ensimmäinen vuosi Toinen vuosi Kolmas vuosi Neljäs vuosi 1. syksy 1. kevät 2.syksy 2. kevät 3. syksy 3. kevät 4. syksy Pakolliset kemian opinnot 8 ov Mitä biotekniikka on? Tieteellinen viestintä 0,5 ov Biokemian perusharjoitustyöt 7 ov Aineopintojen harjoitustyöt 8 ov Molekyylibiologian harjoitustyöt perusosa Entsyymi- ja proteiinikemian luennot 4 ov Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I Pakolliset kemian opinnot 7 ov Molekulaarinen biotekniikka Mikrobiologian perusteet Geenien säätely Äidinkielen opinnot 0,5 ov Ruotsin kieli Elintarvikekemian perusteet Laatujärjestelmät Mikrobiologian harjoitustyöt Geenien ilmeneminen LuKtutkielma ja seminaari Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II Biokemian perustyömenetelmät In vitro diagnostiikka Geeniteknologian menetelmät Aineopintojen lopputentti Vieras kieli Immunologian perusteet Äidinkielen opinnot Biotekniikan syventävät opinnot 1 Vaihtoehtoiset sivuaineopinnot 10 ov Vaihtoehtoiset kemian opinnot 17 ov 4. kevät Syventävien opintojen harjoitustyöt 6 ov Viides vuosi 5.syksy 5.kevät Erikoistyö 15 ov Erikoistyö 5 ov Loppukuulustelu 4 ov Erikoistyöseminaari Tutkielma 8 ov 25

5 Elintarvikekemian linja, opintojen ohjeellinen ajoitus (FM) Ensimmäinen vuosi Toinen vuosi Kolmas vuosi 1. syksy 1. kevät 2.syksy 2. kevät 3. syksy 3. kevät Pakolliset kemian opinnot 8 ov Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I Ruotsin kieli Pakolliset kemian opinnot 7 ov Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II Mitä biotekniikka on? Elintarvikekemian perusteet Biokemian perustyömenetelmät Kasviperäiset elintarvikkeet Laatujärjestelmät Tilastotiede Biokemian perusharjoitustyöt 7 ov Mikrobiologian perusteet Eläinperäiset elintarvikkeet Mikrobiologian harjoitustyöt Äidinkielen opinnot Kaasukromatogratia ja ylikriittinen kromatografia Tieteellinen viestintä 0,5 ov Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät Elintarvikekemian aineopintojen harjoitustyöt 5 ov Elintarviketeknologia n perusteet LuKtutkielma, seminaari Loppukuulustelu Vieras kieli Nestekro matografia Äidinkielen opinnot 0,5 ov Vaihtoehtoiset kemian opinnot 15 ov Vaihtoehtoiset sivuaineopinnot 1 Neljäs vuosi Viides vuosi 4. syksy 4. kevät 5.syksy 5.kevät Elintarvikelain säädäntö Elintarvikkeiden tuotetutkimus Erikoistyö 15 ov Erikoistyö 5 ov Ravitsemuksen biokemia Elintarvikemikrobiologia ja hygenia Loppukuulustelu 4 ov Erikostyö seminaari Elintarvikkeiden laadunohjaus Elintarvikkeiden lisäaineet Lipidit I Syventävät harjoitustyöt 4 ov Tutkielma 8 ov Aromit Hiilihydraatit Proteiinit Vaihtoehtoiset elintarvikekemian syventävät opinnot 8 ov 26

6 OPINTOJEN RAKENNE BIOKEMIAN LINJA Pääaineen opinnot BIOKEMIAN ALAN PERUSOPINNOT 15 ov BKEM1001 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I BKEM1002 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II BKEM3767 Biokemian perustyömenetelmät, tentti BKEM3768 Biokemian perustyömenetelmät, harjoitustyöt BKEM3521 Mikrobiologian perusteet FOOD3507 Elintarvikekemian perusteet BTEK4010 Mitä biotekniikka on FOOD3752 Laatujärjestelmät BIOKEMIAN AINEOPINNOT 25,5 ov Aineopinnot antavat opiskelijalle tiedot solun sisältämien yhdisteiden kemiallisesta rakenteesta ja reaktioista sekä solun synteettisistä, hajottavista ja energiaa tuottavista reaktioteistä. Opiskelija tutustuu erilaisiin biokemiallisiin analyysimenetelmiin ja oppii itsenäisesti analysoimaan ja eristämään biokemiallisesti tärkeitä yhdisteitä biologisesta materiaalista. BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt BKEM3535 Geeniteknologian menetelmät BKEM3759 Geenien ilmeneminen BKEM3760 Geenien säätely BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt BKEM3748 Immunologian perusteet BKEM8903 Tieteellinen viestintä BKEM3597 LuK-tutkielma ja seminaari. BKEM3111 Lopputentti 7 ov 0.5 ov 5 ov BIOKEMIAN SYVENTÄVÄT OPINNOT 56 ov Syventäviin opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikois-kursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen sekä loppukuulusteluihin. Opiskelijat saavat perusvalmiudet toimia biokemian asiantuntijatehtävissä sekä sellaiset tiedot ja taidot, jotka mahdollistavat yhteistyön biokemian lähialojen asiantuntijoiden kanssa. Biokemian syventävät opinnot antavat myös perustiedot ja -taidot biokemian alan tutkimustyöhön. Pakolliset opintojaksot 47-5 BKEM3134 Enzyme and Protein Chemistry, Lectures BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harj.työt 4 ov 27

7 BKEM3753 Bioinformatiikkaa biokemisteille BKEM3585 Molekyylibiologian harj.työt perusosa BKEM3586 Molekyylibiologian harj.työt jatko-osa BKEM3136 Syventävien opintojen harjoitustyöt I BKEM3133 Syventävien opintojen harjoitustyöt II BKEM3742 Erikoistyö BKEM3593 Erikoistyöseminaari BKEM3598 Loppukuulustelu BKEM3599 Loppukuulustelu osa 1 BKEM3600 Loppukuulustelu osa 2 Vaihtoehtoiset opintojaksot 5-9 ov BKEM3135 Eukaryoottigenomit ja monimuotoiset geenit BTEK3561 Analyyttinen biokemia BKEM9510 Immunologian harjoitustyöt BKEM3547 Immunologian menetelmät BKEM3102 Opetusharjoittelu FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia FOOD3586 Nestekromatografia BKEM3527 Työskentely tutkimusryhmässä BTEK3531 Applied Biotechnology BTEK3108 Biotechnical Diagnostics BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka BTEK3137 Fermentaatio- ja downstreamtekniikat sekä proteiininen puhdistus BKEM3123 Ympäristö- ja soveltavan mikrobiologian perusteet FOOD3673 Ravitsemuksen biokemia BTEK3109 Trends in Biotechnology BTEK3111 Recombinant DNA Technologies BKEM3540 Työharjoittelu 4 ov 4 ov 20 ov 4-8 ov 4 ov 1-4 ov 1- Muita biokemian erikoiskursseja. BKEM3764 PRO GRADU -TUTKIELMA 8 ov Sivuaineiden opinnot PAKOLLISET SIVUAINEET KEMIA 35 ov Kemian opintojen tavoitteena on antaa opiskelijalle vankka kemiallinen perusta, jota biokemian opiskelu vaatii ja jota biokemisti ammatissaan tarvitsee. KEMIAN PERUSOPINNOT 15 ov Kemian perusteet (1. sl.) Työturvallisuus (1. sl.) Kemian perusharjoitustyöt I (1. sl.). Orgaaninen kemia/perusopinnot (1. kl.) Fysikaalinen kemia/perusopinnot (1. kl.) Kemian perusharjoitustyöt II (1. kl.) 5 ov 28

8 KEMIAN AINEOPINNOT 20 ov Kemian opintoihin tulee sisällyttää yksi opintokokonaisuus kokonaan, eli luennot, työmenetelmäluennot ja harjoitustyöt sekä muita vähintään aineopintotasoisia luentoja. Harjoitustöihin pääsy edellyttää aina ko. alan luentojen ja työmenetelmäluentojen suorittamisen. Orgaaninen kemia/aineopinnot Orgaaninen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät Fysikaalinen kemia/aineopinnot (A+B) Fysikaalinen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät Analyyttinen kemia/aineopinnot Analyyttinen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät Epäorgaaninen kemia/aineopinnot Epäorgaaninen kemia/harjoitustyöt ja työmenetelmät Spektroskopian perusteet Ympäristökemia 4 ov 5 ov 7 ov 4 ov 4,5 ov 3,5 ov 3,5 ov 1,5 ov VAIHTOEHTOISET SIVUAINEOPINNOT 17 ov Vaihtoehtoisiksi sivuaineopinnoiksi voi valita lähes kaikkea sitä, mikä jollain tavoin laajentaa tai rikastuttaa pääaineen opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opintojaksoja voi ottaa elintarvikekemiasta, biotekniikasta, mikrobiologiasta, biologiasta, fysiikasta, matematiikasta, tietojenkäsittelyopista, tilastotieteestä, ympäristötieteestä, kemiasta sekä lääketieteen ja terveyden biotieteiden koulutusohjelmista. Sivuaineopinnoiksi voi valita myös kieli- ja viestintäopintoja sekä kaupallisen alan opintoja. Sivuaineopinnot voi pyrkiä keskittämään vain yhteen tai kahteen tieteenalaan tai sitten ottaa opintojaksoja useilta eri tieteenaloilta. KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT 3,5 ov Äidinkielen opinnot KISU3321 Kirjallinen viestintä KISU3322 Kirjallisen työn laatimiseen liittyvä opetus Toisen kotimaisen kielen opinnot KIRU3001 Ruotsin kieli/matemaattis-luonnontieteellinen Vieraan kielen opinnot 0.5 ov 29

9 MOLEKULAARINEN BIOTEKNIIKKA JA IN VITRO -DIAGNOSTIIKKA Pääaineen opinnot BIOKEMIAN ALAN PERUSOPINNOT 15 ov Ks. biokemian linja. BIOTEKNIIKAN AINEOPINNOT 18 ov Aineopinnot antavat perustiedot solujen ja biomolekyylien mahdollisuuksista erilaisiin teknologisiin sovellutuksiin. BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka BTEK1026 In vitro -Diagnostics BTEK4023 Aineopintojen harjoitustyöt 8 ov BTEK4024 Aineopintojen lopputentti BTEK4026 LuK-tutkielma ja seminaari BIOTEKNIIKAN SYVENTÄVÄT OPINNOT 48 ov Syventäviin opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikoiskursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opiskelijoille annetaan perustiedot ja -taidot biotekniikan alan tutkimustyöhön, sekä asiantuntijatehtävissä toimimiseen. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen sekä loppukuulusteluihin. Pakolliset opinnot 3 BTEK4025 Syventävien opintojen harjoitustyöt BTEK4027 Erikoistyö BTEK4028 Erikoistyöseminaari BTEK4046 Loppukuulustelu BTEK4047 Loppukuulustelu osa 1 BTEK4048 Loppukuulustelu osa 2 Vaihtoehtoiset opinnot 17 ov BTEK3111 Recombinant DNA Technologies BTEK3137 Fermentaatio- ja downstreamtekniikka sekä proteiinien puhdistus BTEK3108 Biotechnical Diagnostics BTEK1025 Trends in Clinical Chemistry BTEK3110 Possibilities of Diagnostics BTEK1024 Syventävien opintojen harjoitustyöt BTEK3135 Molekyylibiologian harjoitustyöt, jatko-osa biotekniikan opiskelijoille BTEK3531 Applied Biotechnology BTEK3107 Biotechnical Applications of Nucleic Acids. BTEK4021 Opetusharjoittelu BTEK1017 Työharjoittelu BTEK3109 Trends in Biotechnology BTEK4020 Työskentely tutkimusprojekteissa BTEK4049 Aikakauslehtikerho (Journal Club) BTEK3573 Lopputentti (erikoisteos) 6 ov 20 ov 4 ov 1-4 ov 30

10 BTEK4007 PRO GRADU -TUTKIELMA 8 ov Sivuaineiden opinnot PAKOLLISET SIVUAINEET KEMIA 3 Perusopinnot 15 ov ja aineopinnot 17 ov. Katso biokemian linja. BIOKEMIA 25.5 ov BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt BKEM3759 Geenien ilmeneminen BKEM3760 Geenien säätely BKEM3535 Geeniteknologian menetelmät BKEM3754 Molekyylibiologian harjoitustyöt, perus BKEM3134 Enzyme and Protein Chemistry BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt BKEM3748 Immunologian perusteet FOOD3752 Laatujärjestelmät BKEM8903 Tieteellinen viestintä 7 ov 4 ov 0.5 ov VAIHTOEHTOISET SIVUAINEOPINNOT 10 ov Ks. teksti biokemian linjan kohdalta. Suositeltavia sivuaineopintoja ovat myös: Kasvibiotekniikka (5 ov): Luennot (), harjoitukset () ja uusinta alan kirjallisuutta (2 ov). KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT 3.5 ov Ks. biokemian linjan kohdalta. ELINTARVIKEKEMIAN LINJA Pääaineen opinnot BIOKEMIAN ALAN PERUSOPINNOT 15 ov Ks. biokemian linja. ELINTARVIKEKEMIAN AINEOPINNOT 26 ov Aineopinnot antavat opiskelijalle perustiedot raaka-aineiden koostumuksesta ja näiden teollisesta jalostamisesta elintarvikevalmisteiksi, laatuun vaikuttavista kemiallisista, biokemiallisista ja fysikaalisista muutoksista sekä säilyvyydestä. Harjoitustöiden yhteydessä opiskelija perehtyy elintarvikeanalytiikassa käytettäviin menetelmiin ja laitteisiin. FOOD3803 Kasviperäiset elintarvikkeet FOOD3804 Eläinperäiset elintarvikkeet FOOD3750 Elintarvikekemian harjoitustyöt 5 ov 31

11 FOOD3672 Elintarviketeknologian perusteet FOOD3673 Ravitsemuksen biokemia FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia FOOD3586 Nestekromatografia FOOD3630 Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari FOOD3511 Loppukuulustelu ELINTARVIKEKEMIAN SYVENTÄVÄT OPINNOT 5 Syventäviin opintoihin kuuluu luentoja, harjoitustöitä, seminaareja, erikoiskursseja, kirjallisia harjoituksia sekä oma-aloitteisuutta ja tieteellistä ajattelutapaa kehittävää tutkimustyötä. Opintojen loppuvaiheessa keskitytään tutkielman kirjoittamiseen sekä loppukuulusteluihin. Opiskelijat saavat perusvalmiudet asiantuntijatehtäviin, joita tuotantoelämä elintarvikekemistiltä edellyttää sekä sellaiset tiedot ja taidot, jotka mahdollistavat yhteistyön elintarvikekemian lähialojen erikoistuntijoiden kanssa. Lisäksi opiskelijat saavat myös perustiedot ja -taidot elintarvikekemian alan tutkimustyöhön. Pakolliset opintojaksot 44 ov FOOD8904 Hiilihydraatit FOOD8905 Proteiinit FOOD3813 Aromit FOOD3526 Lipidit I FOOD3824 Elintarvikekemian syventävät harj.työt FOOD8822 Elintarvikkeiden lisäaineet FOOD3683 Elintarvikkeiden laadunohjaus FOOD3684 Elintarvikkeiden tuotetutkimus FOOD3685 Elintarvikemikrobiologia ja -hygienia FOOD3504 Elintarvikelainsäädäntö FOOD3816 Erikoistyö FOOD3817 Erikoistyöseminaari FOOD3607 Loppukuulustelu, yleisteos, Fennema, osa 1 FOOD3617 Loppukuulustelu, yleisteos, Fennema, osa 2 FOOD3618 Loppukuulustelu, erikoisteos Vaihtoehtoiset opinnot 8 ov FOOD3823 Luonnon värit (FOOD3570) Natural Colours) FOOD3517 Kalatuotteiden biokemia FOOD8814 Massaspektrometrian sovellutuksia elintarvikekemiassa (FOOD3569) Mass Spectrometry on Food Analysis) FOOD8824 Ylikriittiset uuttoteknologiat (FOOD3568) Supercritical Fluid Technologies) FOOD3810 Pakkausteknologia FOOD8823 Elintarvikkeiden vieraat aineet FOOD8813 Työskentely tutkimusprojekteissa FOOD3809 Kalatuotteiden valmistus ja laadunvalvonta, harj.työt FOOD8815 Opetusharjoittelu FOOD3515 Näytteen esikäsittely FOOD8903 Työharjoittelu 4 ov 20 ov 1-4 ov 32

12 FOOD3516 Elintarvikkeiden kivennäisaineet BKEM3760 Geenien säätely BKEM3760 Geenien ilmeneminen BTEK3561 Analyyttinen biokemia TBIO2024 Funktionaaliset elintarvikkeet 4 ov TBIO2025 Sairauksien ehkäisy ja kliininen ravitsemus I TBIO2026 Sairauksien ehkäisy ja kliininen ravitsemus II TBIO2029 Ravitsemus ja ruoansulatuskanavan sairaudet TBIO2033 Challenges in Food Development TBIO2031 Probiootit, prebiootit ja synbiootit 4 ov TBIO2032 Ravitsemustieteen tutkimusmenetelmät BKEM3748 Immunologian perusteet FOOD3566 Lipidit II: Lipidit ja niiden funktiot (FOOD3567) Lipids II: Lipids and their Functions) FOOD3808 PRO GRADU -TUTKIELMA 8 ov Sivuaineiden opinnot PAKOLLISET SIVUAINEET KEMIA 30 ov Kemian perusopinnot 15 ov ja kemian aineopinnot 15 ov. Katso biokemian linja. BIOKEMIA 9.5 ov BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt BKEM8903 Tieteellinen viestintä 7 ov 0.5 ov TILASTOTIEDE EKOL2401 Biostatistiikka Biostatistiikan (kevätlukukaudella) sijaan voi suorittaa ao tilastotieteen johdantokurssin 5 ov (syyslukukaudella), josta kolme viikkoa lasketaan pakollisiin sivuaineisiin ja vaihtoehtoisiin sivuaineopintoihin. VAIHTOEHTOISET SIVUAINEOPINNOT 1 Sivuaineopinnoiksi voi valita lähes kaikkea sitä, mikä jollain tavoin laajentaa tai rikastuttaa pääaineen opintoja ja auttaa opiskelijaa avartamaan näkemystään luonnontieteistä sekä lisää hänen menetelmällisiä valmiuksiaan. Opiskelija voi valintansa mukaan suuntautua joko kemiaan, biokemiaan tai kaupalliselle alalle, jolloin hän valitsee ko. alan opintoja enemmän ja muita vastaavasti vähemmän. Sivuaineiksi voi valita myös kieli- ja viestintäopintoja, kaupallisia opintoja sekä sellaisten aineiden opintoja, jotka eivät muuten kuuluisi suositeltujen sivuaineiden joukkoon. KIELI- JA VIESTINTÄOPINNOT 3.5 ov Ks. biokemian linjan kohdalta. 33

13 OPINTOJEN SUORITTAMINEN Opetukseen osallistuminen Filosofian maisterin tai luonnontieteiden kandidaatin tutkinnon suorittamiseksi biokemian koulutusohjelmassa opiskelijan on 1) osallistuttava koulutusohjelman opintojaksoihin kuuluvaan opetukseen 2) osoitettava saavuttaneensa koulutusohjelmaan kuuluvissa opinnoissa vaaditut tiedot, taidot ja valmiudet sekä 3) suoritettava kirjallinen kypsyysnäyte tai mikäli sen on tehnyt LuK-tutkielman yhteydessä, kirjoituskoe. Opintojakson suorittamista varten järjestetään kuulusteluja, jotka suoritetaan määrättyinä tenttipäivinä tai erikseen sovittuina aikoina. Virallisista tenttiajoista ilmoitetaan opinto-oppaassa sekä laitoksen ilmoitustaululla. Joihinkin kuulusteluihin voi osallistua vain tiettyinä tenttipäivinä. Näistä tenttikohtaisista rajoituksista ilmoitetaan myös laitoksen ilmoitustaululla. Kuulusteluihin ilmoittaudutaan kirjallisesti tarkoitusta varten laadittua lomaketta käyttäen. Lomake palautetaan täytettynä tenttiin ilmoittautumislaatikkoihin, joista toinen on Arcanumin 2. kerroksen ilmoitustaulun vieressä ja toinen BioCityn ilmoitustaulun vieressä. Kuulusteluun ilmoittaudutaan viimeistään kuulustelua edeltävänä maanantaina klo mennessä. Kuhunkin kuulusteluun voi ilmoittautua enintään kolme kertaa. Mikäli opiskelija ei vielä tällöin ole läpäissyt ko. tenttiä, tulee kuulustelija tarvittaessa keskustelemaan hänen kanssaan ennen seuraavaa ilmoittautumista. Opetuksesta ja opiskelusta annetun johtosäännön mukaan luentosarjan tai kurssin päätyttyä pidettävä kuulustelu on järjestettävä vähintään kolme kertaa yhden vuoden aikana luentosarjan tai kurssin päättymisestä. Mikäli opiskelija ei ole tullut hyväksytyksi biokemian, elintarvikekemian tai biotekniikan edellä tarkoitetussa kolmessa kuulustelussa, ei häneltä vaadita luentosarjan tai kurssin uudelleen seuraamista, vaan hän voi osallistua seuraaviin kuulusteluihin. Kuulustelussa vaaditaan kuitenkin viimeksi kokonaan luennoidun kirjan tai kurssin asiat. Opiskelu ulkomailla Laajentaakseen ja monipuolistaakseen opintojaan opiskelija voi suorittaa osan tutkinnostaan myös ulkomailla osallistumalla laitoksen, tiedekunnan tai yliopiston tarjoamiin opiskelijavaihto-ohjelmiin. Laitoksen kaikki kolme linjaa hyväksyvät ulkomailla suoritetut opinnot soveltuvin osin. SOKRATES/ERASMUS ohjelman yhteistyöyliopistot ovat Italiassa, Englannissa, Espanjassa, Portugalissa, Ranskassa ja Saksassa. NORDPLUS ohjelma tarjoaa opiskelupaikkoja Skandinavian maissa ja varsinkin Ruotsissa. Suositus on, että opiskelija lähtee ulkomaille aikaisintaan kolmannen opiskeluvuoden jälkeen. Laitoksen yhteyshenkilöt ovat professori Timo Lövgren (Nordplus) ja professori Rainer Huopalahti (Sokrates/Erasmus). Opiskelu ulkomailla on todellinen vaihtoehto. Opintojen arvostelu Ks. opinto-oppaan johdanto-osa. 34

14 Linjavalinnat Valinta biokemian koulutusohjelman eri linjoille tapahtuu toisen opiskeluvuoden syyslukukauden alussa seuraavin ehdoin: 1. Opintojaksot biomolekyylit ja aineenvaihdunta I (), elintarvikekemian perusteet (2 ov) ja mitä biotekniikka on () tulee olla suoritettuna niin, että niiden keskiarvo on vähintään Opiskelija on suorittanut sen linjan opintojakson, johon hän pyrkii, vähintään arvosanalla 2-. Biokemian linjan sisäänotto on 15, elintarvikekemian 10 ja molekulaarisen biotekniikan ja in vitro -diagnostiikan 15. Mikäli jollekin linjalle on enemmän hakijoita kuin mitä kiintiö on, suoritetaan valinta ko. linjan opintojakson arvosanan perusteella. Tarkemmat ilmoittautumisohjeet annetaan laitoksen ilmoitustaululla. Suoritusmerkinnät ja vastuuhenkilöt Hyväksytyt opintosuoritukset viedään opintosuoritusrekisteriin. Lisätietoja saa oppiainekansliasta. Opintojaksojen vastuuhenkilöt Luentokurssi: luennoitsija tai opintojaksosta vastaava opettaja Harjoitustyöt: yliassistentti tai harjoitustöistä vastaava opettaja LuK-tutkielma ja seminaari: ao. linjan professori Erikoistyö : Työn vastuullinen ohjaaja Erikoistyöseminaari: Erikoistyötapahtumasta vastaava opettaja Pro gradu tutkielma: ao. linjan professori Sivuainekokonaisuus: kanslia vie kokonaisuuden rekisteriin Pääaineen kokonaisuus: kanslia vie kokonaisuuden rekisteriin OHJEITA OPISKELUA VARTEN Biokemian koulutusohjelman opiskelijat Opiskelija noudattaa opinnoissaan joko sitä opetussuunnitelmaa, joka on ollut voimassa hänen aloittaessaan opiskelunsa koulutusohjelmassa tai kulloinkin voimassa olevaa opetussuunnitelmaa. Opiskelun suunnitteluun ja suorittamiseen liittyviä ohjeita antavat koulutusohjelman neuvonta-assistentit sekä biokemian, elintarvikekemian ja biotekniikan opettajat. Sivuaineoikeuden saaminen biokemian koulutusohjelmasta Ei kuulustelua. Sivuaineoikeus on hakemuksetta niillä opiskelijoilla, joiden oman koulutusohjelman tutkintovaatimuksiin sisältyy pakollisia biokemian, elintarvikekemian tai biotekniikan opintoja. Vaihtoehtoisia opintoja suorittavat opiskelijat voivat osallistua niihin opintojaksoihin, joiden osanottajamäärä ei ole rajoitettu (lähinnä luennot). Harjoitustyökursseille etusija on biokemian ko:n opiskelijoilla sekä pakollisia sivuaineopintoja 35

15 suorittavilla toisten koulutusohjelmien opiskelijoilla. Karsintaa suoritetaan, mikäli halukkaiden lukumäärä ylittää käytettävissä olevat resurssit. Lopullinen varmuus pääsystä harjoitustyökurssille selviää vasta kaikkia opiskelijoita koskevan ennakkoilmoittautumisen jälkeen. Ilmoittautuminen suoritetaan biokemian koulutusohjelman ilmoitustauluilla oleviin listoihin hyvissä ajoin ennen kurssien alkamista. Mikäli opintojaksojen suorittamiselle on asetettu ennakkoehtoja, kuten sisäänpääsykoe tai aiemmat opintojaksot, vaaditaan ne myös kaikilta sivuaineopiskelijoilta. OPINTOJAKSOJEN TAVOITTEET JA SISÄLTÖ Perusopinnot Perusopinnot ovat yhteiset kaikille kolmelle linjalle. BKEM1001 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I () Tavoitteet ja sisältö: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I luentosarja perehdyttää opiskelijat keskeisten biomolekyylien, kuten hiilihydraattien, lipidien, proteiinien ja nukleiinihappojen rakenteisiin, toiminnallisiin ominaisuuksiin ja biokemialliseen merkitykseen, biologisten membraanien toimintaan ja signaalinvälitykseen. Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemstry, 3. painos, kappaleet 2, 4, 5, 6 (osin, 8 (osin), 9 (osin), 10, 11, 12, 13. Suoritustavat: Luentoihin ja oppikirjaan perustuva tentti. Jarmo Niemi. BKEM1002 Biomolekyylit ja aineenvaihdunta II () Tavoitteet ja sisältö: Luentosarjan toinen osa keskittyy aineenvaihduntaan, erityisesti energian tuottoon, sekä keskeisiin anabolisiin ja katabolisiin reaktioteihin. Kirjallisuus: Nelson ja Cox: Lehninger Principles of Biochemistry, 3. painos, kappaleet 14, 15, 16, 17, 18, 19 (osin), 20, 21, 22. Suoritustavat: Luentoihin ja oppikirjaan perustuva tentti. Biokemian lehtori. Esitiedot: Edellyttää Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I kurssin tietojen omaksumista. BTEK4010 Mitä biotekniikka on? () Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksossa selvitetään mitä biotekniikka on käsittelemällä mm. biotekniikan mahdollisuuksia ja saavutuksia lääketieteessä, maanviljelyksessä ja ympäristötutkimuksessa. Lisäksi selvitetään geenitekniikan merkitystä uuden biotekniikan kehityksessä. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Ville Santala Kirjallisuus: Luentomoniste. FOOD3507 Elintarvikekemian perusteet () Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle yleiskuva elintarvikekemian eri osa-alueista ja niiden liittymisistä muihin tieteisiin. Kurssi antaa perustiedot elintarviketieteen suomen- ja englanninkielisestä sanastosta. Opintojaksolla perehdytään elintarvikkeiden ja niiden raaka-aineiden tärkeimpien yhdisteryhmien kemialliseen koostumukseen ja tarkastellaan näiden vaikutusta elintarvikkeiden ominaisuuksiin. Kurssilla tutustutaan myös keskeisten elintarvikeanalyysien kemiallisiin ja fysikaalisiin perusteisiin sekä analyysien suoritukseen. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Heikki Kallio, Rainer Huopalahti. 36

16 Kirjallisuus: Luentomoniste. Luentojen lähdekirjallisuutena voi käyttää aineopintojen loppukuulustelukirjoja: Coultate, T.P., 2002 Food The Chemistry of its Components, 4 th ed., James C.S Analytical Chemistry of Foods. ss BKEM3521 Mikrobiologian perusteet () Tavoitteet ja sisältö: Opintojakso tutustuttaa opiskelijat mikrobiologian perusteisiin kuten mikroskopointiin ja solumorfologiaan, prokaryoottisolujen rakenteeseen, mikrobien kasvuun ja ravintovaatimuksiin, mikrobien torjuntaan kemiallisin ja fysikaalisin menetelmin, energia-aineenvaihduntaan, mikrobien luokitteluun, hiivoihin ja homeisiin, arkkibakteereihin sekä bakteeriviruksiin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Biokemian lehtori. Kirjallisuus: Luennoilla jaettava materiaali (luennot) tai jokin mikrobiologian oppikirja, esim. Prescott, Harley, Klein: Microbiology, 5.painos, valituilta osin sopimuksen mukaan (itseopiskelu). BKEM3767 Biokemian perustyömenetelmät, tentti () BKEM3768 Biokemian perustyömenetelmät, harjoitustyöt () Tavoitteet ja sisältö: Tarkoitus on perehdyttää opiskelija biokemiallisten perusmenetelmien teoreettiseen taustaan sekä niissä käytettävien laitteistojen toimintaan. Käsiteltäviä asioita ovat mm. fotometria, kromatografia, elektroforeesi ja radioisotooppitekniikat. Suoritustavat: Experimental Biochemistry-kirjan sivut 1-83 ja tenttiminen siten, että kirja voi olla mukana tentissä. Tentti on suoritettava elokuun, syyskuun tai lokakuun tenttipäivinä. Hyväksytty tenttisuoritus on edellytyksenä harjoitustöihin osallistumiselle. Harjoitustyöt suoritetaan pareittain kurssimaisesti marras - joulukuun aikana. Työselostukset tehdään pareittain välittömästi kunkin harjoitustyön jälkeen. Työselostusten tulee olla hyväksytty ennen perusharjoitustöiden aloittamista. Esa-Matti Lilius. Kirjallisuus: Switzer, R., Garrity, L.: Experimental Biochemistry, 3. Painos. Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä kemian perusharjoitustyöt tai kemian kurssi biologeille harjoitustöineen on oltava täysin suoritettuja ennen kuin voi osallistua perustyömenetelmät kurssille. FOOD3752 Laatujärjestelmät (+ vaihtoehtoisesti ) Tavoitteet ja sisältö: Laatujärjestelmä-toimintatapa on käytössä eri toimialoilla. Lääketeollisuudessa laatujärjestelmän mukaan toimiminen on viranomaisvaatimus ja elintarviketeollisuudessa välttämättömyys. Kurssi antaa perustiedot laatujärjestelmistä, valmiuksia laatujärjestelmän rakentamiseen ja ylläpitämiseen erilaisissa organisaatioissa. Kurssilla esitellään myös ulkopuolisen tahon suorittamia arviointeja ja vaatimuksia. Asiaan liittyvä terminologia ja käsitteistö esitellään kurssilla. Lisäksi tehdään harjoitustöitä. Suoritustavat: Luennot, harjoitustyöt ja loppukuulustelu. Toteutetaan syyslukukaudella. Opintojakson vastuuhenkilönä on dosentti Linnéa Linko, laadunvarmistusyksikön johtaja. Kirjallisuus: Luentomonisteet. Aineopinnot BIOKEMIAN LINJA BKEM3758 Biokemian perusharjoitustyöt (7 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa opiskelijalle käytännön peruskoulutus biokemiallisessa laboratoriotyöskentelyssä ja ensikosketus biologisen materiaalin tutkimiseen 37

17 biokemiallisin menetelmin. Harjoitustyöt sisältävät kokeellisia töitä eri biomolekyyleistä kuten entsyymeistä, lipideistä ja nukleiinihapoista. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä osallistuminen työt ulos -kuulusteluun. Biokemian assistentit. Kirjallisuus: Harjoitustyömonisteet ja osia kirjasta Switzer, R., Garrity, L. (1999): Experimental biochemistry, 3. painos. Esitiedot: Biokemian perustyömenetelmät oltava täysin suoritettu.. BKEM3535 Geeniteknologian menetelmät () Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla tutustutaan geenien siirtoon ja karakterisointiin liittyviin menetelmiin kuten esim. geenipankkien valmistukseen, kloonausstrategioihin ja - vektoreihin, geeniteknologiassa tarvittaviin entsyymeihin ja nukleiinihappojen hybridisaatioihin sekä mutageneesitekniikoihin. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja päättökuulusteluun. Opintojakson suorittaminen on edellytys molekyylibiologian harjoitustöihin pääsemiselle. Matti Karp BKEM3759 Geenien ilmeneminen () Tavoitteet ja sisältö: Tutustutaan mm. pro- ja eukaryoottien perintöaineisiin, geeneihin, geeniperheisiin ja niiden evoluutioon, geneettiseen koodiin, proteiinisynteesikoneistoon ja translaation tapahtumiin molekyylitasolla sekä proteiinien kuljetusmekanismeihin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, itseopiskelua ja kirjallinen kuulustelu. Reijo Lahti Kirjallisuus: Lewin, B. (2000): Genes VII-kirja/kappaleet 1-8 sekä luennoilla jaettava informaatio ja muu oheismateriaali. Esitiedot: Edellyttää perustietoja varsinkin proteiineista ja nukleiinihapoista sekä niiden rakennekomponenteista. Siksi osallistujan oletetaan suorittaneen opintojaksot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä Geeniteknologian menetelmät. BKEM3760 Geenien säätely () Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla tutustutaan mm. RNA- ja DNA-synteesikoneistoihin, transkription ja replikaation tapahtumiin, operonikäsitteeseen, geenien toiminnan säätelymekanismeihin, DNA vaurioiden korjausmekanismeihin ja hyppiviin geeneihin. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, itseopiskelua ja kirjallinen kuulustelu. Reijo Lahti. Kirjallisuus: Lewin, B (2000): Genes VII/kappaleet 9-16 sekä luennoilla jaettava informaatio ja muu oheismateriaali. Esitiedot: Edellyttää perustietoja varsinkin proteiineista ja nukleiinihapoista sekä niiden rakennekomponenteista. Siksi osallistujan oletetaan suorittaneen opintojaksot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä Geeniteknologian menetelmät. Lisäksi osallistujien oletetaan kuunnelleen luentosarjan Geenien ilmeneminen. BKEM3522 Mikrobiologian harjoitustyöt () Tavoitteet ja sisältö: Opintojakson tavoitteena on antaa opiskelijoille perusvalmiudet mikrobiologiseen laboratoriotyöskentelyyn. Harjoitustöissä perehdytään mm. aseptiseen työskentelyyn, siirrostusmenetelmiin, puhdasviljelmien valmistamiseen, erilaisiin ravintoalustoihin, mikroskopointiin, mikrobien värjäysmenetelmiin, mikrobien tunnistamiseen ja antibioottiherkkyyden määrittämiseen. Suoritustavat: Osallistuminen aamupalavereihin ja harjoitustöihin, töiden raportointiin ja päättökuulusteluun. Biokemian lehtori. Kirjallisuus: Harjoitustyömoniste ja töiden yhteydessä jaettava lisämateriaali. 38

18 Esitiedot: Opintojakso mikrobiologian luennot on suoritettava ennen harjoitustöihin osallistumista. BKEM3748 Immunologian perusteet () Sisältö: Opintojakso kuvaa immuunijärjestelmän sekä sellulaaristen että liukoisten tekijöiden rakennetta, toimintaa, säätelyä ja evoluutiota. Immuunijärjestelmän tehtävä on erottaa vieras rakenne isännän omasta rakenteesta. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja päättökuulusteluun. Esa-Matti Lilius. Esitiedot: Kemian ja biokemian perusteet tunnettava. BKEM8903 Tieteellinen viestintä (0.5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla kerrotaan millaisia menetelmiä käytetään, kun julkaistaan tutkimustuloksia ja -katsauksia sekä opetetaan lukemaan tieteellisiä julkaisuja ja hyödyntämään niiden sisältöjä. Erityistä huomiota kiinnitetään kirjallisuuden hakuun ja hakukoneiden käyttöön. Tavoitteena on johdattaa opiskelijat laatimaan tieteellinen katsausartikkeli, joka vaaditaan jo LuK-tutkinnossa. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille (läsnäolopakko) sekä virtuaalisurfailua netissä. Matti Karp. BKEM3597, BTEK4026, FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari () Tavoitteet ja sisältö: Opiskelijan tulee perehtyä oman linjansa erityiskysymykseen osoitetun kirjallisuuden avulla. Hänen tulee laatia aiheesta tieteellinen, n. 15 sivun mittainen LuK-tutkielma sekä pitää noin 30 min. pituinen esitelmä. Tavoitteena on perehdyttää opiskelija kirjallisen tiedon julkistamiseen sekä harjaannuttaa hänen suullista esitystaitoaan, havaintovälineiden käyttämistään sekä keskustelutaitoaan. Suoritustavat: Annetusta aiheesta kirjoitetaan LuK-tutkielma, joka jätetään aiheen antajalle viimeistään viikkoa ennen seminaarin pitämistä. Tutkielman kieliasun tarkistaa äidinkielen opettaja. Itse pitämänsä seminaarin lisäksi opiskelijan tulee osallistua muiden pitämiin seminaareihin yhden lukukauden ajan (suositus 2/3). Tutkielmasta kirjoitetaan kypsyysnäyte, jonka tarkistaa professori. Tutkielman hyväksyy laitosneuvosto tai laitoksen johtaja. Kirjallisuus: Biokemian oppikirjat, kokooma-artikkelit ja osittain myös alkuperäisjulkaisut. BKEM3111 Lopputentti (5 ov) Suoritustapa: Opiskelija tenttii kirjasta Nelson, D.L. & Cox, M.M. (2000): Lehninger Principles of Biochemistry (3. painos) kappaleet Biokemian professori. MOLEKULAARISEN BIOTEKNIIKAN JA IN VITRO -DIAGNOSTIIKAN LINJA BTEK4044 Molekulaarinen biotekniikka () Kurssi järjestetään siten, että opiskelijat pitävät kurssin aikana 4-6 Journal Club -tyyppistä esitelmää suomeksi Glick & Pasternak Molecular Biotechnology 2 nd ed. -kirjan pohjalta ja siihen liittyvistä valituista julkaisuista. Kahden tunnin jakson aikana esiintyy neljä opiskelijaa. Esitysten jälkeen käydään keskustelu aiheeseen liittyvistä kysymyksistä, esiintymistavoista ja -menetelmistä. Jokaisella tunnilla on läsnäolopakko. Ei kuulustelua. Jukka Hellman. BTEK1020 In vitro-diagnostiikka () BTEK1026 In vitro- Diagnostics (2 cu) 39

19 Tavoitteet ja sisältö: Luodaan katsaus in vitro diagnostiikkaan ja diagnostisten menetelmien ja käsitteiden määrittelyyn. Erityisesti kuvataan humaani laboratoriodiagnostiikan kehitystä ja nykytilaa teknologisten mahdollisuuksien ja kliinisten tarpeiden valosssa. Vaativien rutiinikäyttöön soveltuvien bioaffiniteettimääritysten (immuno- ja nukleiinihappomääritykset) ja niitä mahdollistavien perusteknologioiden kuvaukseen kiinnitetään erityistä huomiota. Pieni määrä keskeisiä kliinisiä sovellusalueita kuvataan tarkemmin. Suoritustapa: Luennot, loppukuulustelu. Luennoidaan englanniksi. Kim Pettersson. Kirjallisuus: Pääasiallisesti powerpoint esityksistä koottu luentomoniste ja suositeltu oheiskirjallisuus (kokooma-artikkelit, kliinistä kemiaa ja immunomääritysteknologiaa käsittelevien monografioiden osia). BTEK4023 Aineopintojen harjoitustyöt (8 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehdyttää opiskelijat käytännön tasolla osaan aiheista, joita on käsitelty Molekulaarinen biotekniikka luennoilla. Kurssi sisältää viisi erillistä työkokonaisuutta, jotka käsittelevät mm. eläinsoluviljelytekniikoita, bioluminesenssia, nukleiinihappohybridisaatiota sekä immunomääritysmenetelmiä. Suoritustavat: Osallistuminen pareittain tai pienryhmissä tehtäviin harjoitustöihin, show and tell tilaisuuksiin sekä hyväksyttävät työselostukset. Ville Santala, Mari Hakala. Esitiedot: Ennakkoilmoittautuminen biotekniikan assistentti Ville Santalalle loppukeväällä. Opintojakso tulee suorittaa opintojen ohjeellisena ajankohtana (3. opiskeluvuoden syksy), muulloin suoritetaan karsintaa. BTEK4024 Lopputentti () Suoritustapa: Opiskelija tenttii professorin kanssa sovitun kirjan, joka voi olla esim. Glick, Pasternak: Molecular Biotechnology. Jukka Hellman. BTEK4026 LuK- tutkielma, ja seminaari () Katso biokemian linjan ao kohta. ELINTARVIKEKEMIAN LINJA FOOD3803 Kasviperäiset elintarvikkeet () FOOD3804 Eläinperäiset elintarvikkeet () Tavoitteet ja sisältö: Opintojaksojen tarkoituksena on antaa perustiedot elintarvikeryhmien koostumuksesta, ominaisuuksista ja elintarvikkeissa tapahtuvista kemiallisista reaktioista. Opintojaksolla käsitellään elintarvikkeiden eri aineosien suhdetta rakenteeseen sekä kemiallisiin ja fysikaalisiin muutoksiin. Lisäksi tarkastellaan ko. elintarvikeryhmien kulutuslukuja ja niiden mahdollisia vaikutuksia ravitsemukseen. Kurssilla käsitellään myös kalan biokemiaa. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin, demonstraatioihin sekä väli- ja päättökuulusteluun. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Beliz & Brosch, 1999: Food Chemistry, 2 nd ed., kappaleet 10-12, 14-18, 21, 22. Alais, C. & Linden, G Food Biochemistry, Part II: Biochemistry of the Principal Foods, ss Esitiedot: Elintarvikekemian perusteet ja biomolekyylit ja aineenvaihdunta I-II. 40

20 FOOD3750 Elintarvikekemian harjoitustyöt (5 ov) Tavoitteet ja sisältö: Harjoitustöiden tarkoituksena on perehdyttää opiskelija tavanomaisiin elintarvikeanalytiikassa käytettäviin menetelmiin ja laitteisiin. Harjoitustyöt sisältävät kvalitatiivisia ja kvantitatiivisia määrityksiä eri elintarvikeryhmistä kuten kalasta, viljasta, marjoista, lihavalmisteista ja makeisista. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, työselostukset ja päättökuulustelu. Raija Tahvonen Esitiedot: Ennen töiden aloittamista on biokemian perusharjoitustyöt ja mikrobiologian kurssi oltava suoritettuina ja kasvi- ja eläinperäisten elintarvikkeiden luentojen kuuntelu aloitettu. Lisäksi on suotavaa, että seuraavat opintojaksot olisi suoritettu ennen töihin tuloa: kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia, nestekromatografia sekä näytteen esikäsittely. FOOD3672 Elintarviketeknologian perusteet () Tavoitteet ja sisältö: Luentojen tarkoituksena on selvittää elintarvikkeiden teollista valmistusta erilaisiksi tuotteiksi. Pääsisältönä ovat teolliset käsittely- ja valmistusmenetelmät. Kurssilla käsitellään myös kalateknologian prosesseja. Mahdollisuuksien mukaan järjestetään ekskursioita. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, ekskursioille ja päättökuulusteluun. Kirjallisuus: Fellows, 1988: Food Processing. Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet suoritettu. FOOD3673 Ravitsemuksen biokemia () Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on perehtyä ihmisen ravitsemuksen biokemiaan. Opintojaksossa keskitytään erityisesti hiilihydraattien, lipidien ja proteiinien ruuansulatukseen, imeytymiseen, kuljetukseen ja varastointiin. Luennoilla ja oheismateriaalien avulla selvitetään ravintoaineiden tehtäviä ja merkitystä ihmisen biokemiallisissa reaktioissa ja fysiologiassa. Oppijaksossa on englanninkielisiä osioita. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille kirjallisiin harjoituksiin ja päättökuulusteluun. Raija Tahvonen. Kirjallisuus: Luennoilla jaettava materiaali ( Aro et al., 2000: Ravitsemustiede (Duodecim); T.M. Devlin, ed., 1997: Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations 4 th ed (Wiley-Liss). Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I-II sekä kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet tai vastaavat tiedot. FOOD3529 Kaasukromatografia ja ylikriittinen kromatografia () Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla opitaan käyttämään kapillaarikromato-grafiatekniikkaa elintarvikkeiden ja muun biologista alkuperää olevan mate-riaalin haihtuvien (GLC) ja haihtumattomien (SFC) aineosien tunnistamiseen ja määrälliseen analysointiin. Erityisesti tutustutaan menetelmien käyttöalueisiin ja rajoituksiin. Kurssiin kuuluvien harjoitustöiden avulla opetellaan analyysien tekninen suoritus vaiheittain sekä yleisimpien suoritusvirheiden eliminointi. Harjoitustyöosan sisäänotto rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen ja päättökuulustelu. Heikki Kallio. Kirjallisuus: Kallio, H. Kapillaarikaasukromatografian perusteista ja sovellutuksista (luentomoniste), Riekkola ja Hyötyläinen 2002: Kolonnikromatografia ja kapillaarielektromigraatiotekniikat. Esitiedot: Kemian perusopinnot ja biokemian perusharjoitustyöt tai vastaavat tiedot. 41

21 FOOD3586 Nestekromatografia () Tavoitteet ja sisältö: Luennoilla käsitellään modernin nestekromatografian (HPLC) laitteistoa, työskentelytekniikkaa sekä HPLC-analytiikassa esiintyviä yleisimpiä käytännön ongelmia. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille ja harjoitustöihin sekä työselostusten laatiminen ja päättökuulustelun suorittaminen. Harjoitustöiden osanottajamäärä on rajoitettu, etusija on linjan opiskelijoilla. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi ennen elintarvikekemian harjoitustöitä siten, että esim. kaikki kemian opinnot ja biokemian perusharjoitustyöt tai vastaavat tiedot on suoritettu. Rainer Huopalahti. Kirjallisuus: Moniste sekä Riekkola ja Hyötyläinen 2002: Kolonnikromatografia ja kapillaarielektromigraatiotekniikat. FOOD3630 Aistittavan laadun tutkimusmenetelmät () Tavoitteet ja sisältö: Kurssin tavoitteena on antaa perustiedot elintarvikkeiden aistittavien ominaisuuksien - ulkonäön, rakenteen, hajun ja maun analysoin-nista. Kurssin pääpaino on erilaisten analyyttisten menetelmien, kuten erotustestien ja kuvailevien menetelmien esittelyllä. Lisäksi kurssilla käsitellään ihmisten aistimekanismeja. Opiskelijoille pyritään antamaan perusvalmiudet arviointiryhmien kokoamiseen ja harjaannuttamiseen sekä asianmukaisten laboratoriotilojen suunnitteluun. Kuluttaja- ja mieltymystestien hyväksikäyttöä käsitellään suppeasti. Kurssin oleellisena osana ovat harjoitustyöt, joissa opiskelijat toimivat arviointiryhmänä ja perehtyvät näin käytännössä eri arviointimenetelmien hyväksikäyttöön. Harjoitustyökurssin sisäänotto on rajoitettu. Suoritustavat: Osallistuminen luentoihin ja harjoitustöihin, työselostusten laatiminen sekä päättökuulustelu. Kirjallisuus: Lawless, H.T. & Heymann, H, 1998 Sensory Evaluation of Food Principles and Practices, Chapman & Hall, Tuorila, H. & Hellemann, U. (toim.), 1993 Elintarvikkeet aistien puntarissa, Yliopistopaino Esitiedot: Kasvi- ja eläinperäiset elintarvikkeet, elintarvikekemian harjoitustyöt sekä biostatistiikka tai tilastotieteen johdantokurssi on oltava suoritettuina ennen kurssille osallistumista. Opintojakso suositellaan ajoitettavaksi opintojen loppuvaiheeseen siten, ettei muita työkursseja ole samanaikaisesti suoritettavana. FOOD8801 Kalan biokemia () Ne opiskelijat, joille tämä opintojakso on vielä pakollinen, suorittavat sen kirjatenttinä. Tentin ottaa vastaan Rainer Huopalahti. Opintojakson asiat on siirretty eläinperäiset elintarvikkeet opintojaksoon. Kirjallisuus: Love, 1980: The Chemical Biology of Fishes, Hochachka & Mommsen, 1991: Biochemistry and molecular biology of fishes, vol. 1. Phylogenetic and biochemical perspectives soveltuvin osin. FOOD3511 Loppukuulustelu () Tentittävät kirjat: Coultate, T.P Food The Chemistry of its Components 4th ed., James, C.S., Analytical Chemisty of Foods, ss FOOD3615 LuK-tutkielma ja seminaari () Katso biokemian linjan ao. kohta. 42

22 Syventävät opinnot BIOKEMIAN LINJA BKEM8904 Entsyymi- ja proteiinikemia (4 ov) BKEM3134 Enzyme and protein chemistry (4 credits) Tavoitteet ja sisältö: Kurssilla perehdytään entsyymien katalyysin ja proteiinien rakennekemian perusteisiin sekä käydään läpi yleisimmät rakennetutkimusmenetelmät. Kurssi järjestetään yhdessä Åbo Akademin biokemian ja farmasian laitoksen kanssa ja se luennoidaan englanniksi. Suoritustavat: Osallistuminen luennoille, demonstraatioihin ja päättökuulusteluun. Pirkko Heikinheimo ja Anu Salminen. Esitiedot: Biomolekyylit ja aineenvaihdunta I ja II sekä biokemian perusharjoitustyöt. BKEM3752 Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt () Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään proteiinien tuottosysteemeihin sekä tavallisimpiin proteiinien puhdistusmenetelmiin. Lisäksi tutustutaan entsyymikinetiikkaan sekä tietokoneiden käyttöön entsyymikinetiikassa. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja laskuharjoituksiin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Biokemian assistentit. Esitiedot: Biokemian perusharjoitustyöt täysin suoritettu. BKEM3585 Molekyylibiologian harjoitustyöt, perusosa () BKEM3586 Molekyylibiologian harjoitustyöt, jatko-osa () Tavoitteet ja sisältö: Perehdytään molekyylibiologian menetelmiin. Jatko-osa on tarkoitettu vain biokemian linjan opiskelijoille. Suoritustavat: Osallistuminen harjoitustöihin, luentoihin ja keskusteluihin. Kurssin päätyttyä on siihen liittyvä kuulustelu. Esitiedot: Biokemian perusharjoitustyöt, Geenien ilmeneminen, ja Geeniteknologian menetelmät täysin suoritettu. BKEM3753 Bioinformatiikkaa biokemisteille () Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on antaa yleiskuva bioinformatiikan käytöstä tutkimuksessa (teoriaosa, ) ja perustaidot nukleotidi- ja proteiinisekvenssien analysointiin (käytäntöosa, ). Teoriaosa koostuu vierailuluennoista ja on kaikille avoin. Käytäntöosa koostuu sekä ohjatuista että omalla ajalla tehtävistä tietokoneharjoituksista ja on tarkoitettu vain biokemian linjan opiskelijoille, joille kurssi on suunniteltu suoritettavaksi heti molekyylibiologian harjoitustöiden jälkeen. Biokemian linjan opiskelijoiden pitää suorittaa sekä teoria- että käytäntöosa saadakseen kurssista merkinnän. Suoritustavat. Osallistuminen luennoille (teoriaosa). Osallistuminen tietokoneharjoituksiin ja kurssin lopussa annettujen tehtävien suorittaminen (käytäntöosa). Pekka Rappu. Esitiedot. Käytäntöosaa varten molekyylibiologian harjoitustyöt perusosa () ja jatkoosa () suoritettu. BKEM3136 Syventävien opintojen harjoitustyöt I (4 ov) BKEM3133 Syventävien opintojen harjoitustyöt II (4 ov) Tavoitteet ja sisältö: Syventävien opintojen harjoitustyöt koostuvat kahdesta neljän viikon pituisesta työstä, jotka tehdään ennen erikoistyötä ja eri tutkimusryhmissä kuin erikoistyö. Harjoitustöiden tavoitteena on opettaa itsenäistä työskentelyä sekä tutustuttaa opiskelija biokemian tutkimuksessa käytettäviin menetelmiin. Opiskelija voi tehdä harjoitustyöt 43

23 itselleen sopivana aikana joko syys- tai kevätlukukaudella heti kun entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt ja molekyylibiologian harjoitustyöt on suoritettu. Harjoitustöitä koordinoi biokemian yliassistentti. Suoritustavat: Työskentely tutkimusryhmissä, työselostus. Esitiedot: Entsyymi- ja proteiinikemian harjoitustyöt ja molekyylibiologian harjoitustyöt suoritettu. BKEM3742 Erikoistyö (20) Tavoitteet ja sisältö: Erikoistyö on ohjaajan valvonnassa tehty noin viiden kuukauden mittainen intensiivinen tutkimustyö, jonka tarkoituksena on perehdyttää opiskelija tieteellisen tutkimuksen suunnitteluun, toteuttamiseen ja kriittiseen tarkasteluun. Erikoistyöaiheen valinta suoritetaan kevätlukukaudella maalis-huhtikuussa syventävien opintojen harjoitustöiden päätyttyä. Erikoistöiden aiheista päättävät töiden ohjaajat. Opiskelijoiden jakaantumisesta tutkimusryhmiin päättää ohjaajien työryhmä opiskelijoiden toivomusten pohjalta, ottaen kuitenkin huomioon myös koulutusohjelman intressit. Suoritustavat: Osallistuminen tutkimuksen suunnitteluun ja toteuttamiseen sekä käytettyjen menetelmien, tulosten ja johtopäätösten kirjaaminen. Erikoistyöselostus laaditaan tarvittaessa. Erikoistyön ohjaaja. Esitiedot: Biokemian syventävät harjoitustyöt. BKEM3593 Erikoistyöseminaari () Tavoitteet ja sisältö: Opintojakson tarkoitus on perehdyttää opiskelija omien tutkimustulostensa esittämiseen julkisesti tavoilla, jotka ovat käytössä tieteellisissä kokouksissa. Suoritustavat: Erikoistyössään saamiensa tulosten pohjalta opiskelija laatii ns. tieteellisen julisteen eli posterin sekä pitää tiiviin, 20 min. pituisen esitelmän. Hän kirjoittaa työstään myös Iyhennelmän eli abstraktin, joka julkaistaan. Esitiedot: Erikoistyö tehty tai se on loppuvaiheessa. BKEM3764 Pro gradu -tutkielma (8 ov) Tavoitteet ja sisältö: Laboratoriotyön lisäksi erikoistyöhön kuuluu aiheeseen liittyvään kirjallisuuteen perehtyminen. Tutkielma, johon kuuluu sekä kirjallisuusosa että kokeellinen osa, laaditaan erikoistyön ja siihen liittyvän kirjallisuuden perusteella. Tutkielman aiheen antaa erikoistyön ohjaaja. Tutkielman ohjeellinen laajuus on koneella kirjoitettua sivua. Tutkielma luovutetaan kahtena kappaleena professorille. Tutkielman aiheesta kirjoitetaan aine, ns. kirjoituskoe, jonka tarkistaa linjan professori. Tämän jälkeen linjan professorin ehdottamat tarkastajat ehdottavat arvolauseen sekä esittävät tutkielman laitosneuvoston tai laitoksen johtajan hyväksyttäväksi. Suoritustavat: Perehtyminen tutkielman aiheeseen liittyvään kirjallisuuteen, kokeellisen työn ja sen tulosten tiivistäminen julkaisutyyppiseksi kokonaisuudeksi ja tutkielman kirjoittaminen. BKEM3598 Loppukuulustelu (4-8 ov) Biokemian loppukuulustelulla tarkoitetaan laajaa kirjatenttiä. Opiskelija valitsee tentittävän teoksen keskusteltuaan asiasta Reijo Lahden kanssa. BKEM3135 Eukaryoottigenomit ja monimuotoiset geenit (4 ov) Tavoitteet ja sisältö: Tavoitteena on tutustuttaa opiskelijat kromosomien rakenteeseen ja eukaryoottigeenien ilmenemiseen ja säätelyyn. Lisäksi tutustutaan mm. vasta-aineiden 44