Enterovirukset. Laboratorionjohtaja Dos Merja Roivainen HEV- A CV-A2-8, 10, 12, 14,16, EV-71, EV-76, EV-89, EV-90, EV-91

Koko: px

Aloita esitys sivulta:

Download "Enterovirukset. Laboratorionjohtaja Dos Merja Roivainen HEV- A CV-A2-8, 10, 12, 14,16, EV-71, EV-76, EV-89, EV-90, EV-91"

Elli Elisabet Keskinen
8 vuotta sitten
Katselukertoja:

1 Enterovirukset Laboratorionjohtaja Dos Merja Roivainen LabQuality -päivät 1 Human enteroviruses Species Serotype HEV- A CV-A2-8, 10, 12, 14,16, EV-71, EV-76, EV-89, EV-90, EV-91 HEV B HEV C HEV D CV-A9, CV-B1-6, E-1-7, 9, 11-21, 24-27, 29-33, EV-69, EV-73-75, EV-77-88, EV-93, EV-97-98, EV , EV PV-1-3, CV-A1, 11, 13, 17, 19-22, 24, EV-95-96, EV-99, EV-102, EV , EV-109 EV-68, EV-70, EV-94, EV-111 1

EV-89, EV-90, EV-91 HEV B HEV C HEV D CV-A9, CV-B1-6, E-1-7, 9, 11-21, 24-27, 29-33, EV-69, EV-73-75,

2 ENTEROVIRUS TAXONOMY HRV-C HRV-B HEV-C HRV-A HEV-B HEV-A 0,1 HEV-D Different enterovirus types have <70 % nt (<85 % aa) similarities in VP1 region Enterovirusinfektio central nervous system heart Oropharynx Lymphatic tissue Intestine Lymphatic tissue skeletal muscle liver lung pancreas skin 2

region Enterovirusinfektio central nervous system heart Oropharynx

3 Enterovirusten aiheuttamat tauditons Causative agent Disease PV CAV CBV ECV NEV Poliomyelitis +++ (+) + Meningitis Encephalitis Carditis (+) ++ (+) Sepsis in neonates (+) ++ + Respiratory illnesses Conjunctivitis + + Hand-foot-and-mouth disease + + Herpangina + Pleurodynia + Diarrhea + T1D Polion ym. enterovirusten seuranta Suomessa EV-seuranta (TTR-kantakokoelma) - kaikki EV-positiiviset ulosteet THL:ään tutkittavaksi Epidemiaseuranta (lokakuu 2008 alkaen) - sairastumisryppäistä 3-5 epidemianäytettä (ulostetta) THL:ään tutkittavaksi Meningiittiseuranta (aseptinen meningiitti, enkefaliitti ja Guillan-Barr) (lokakuu 2008 alkaen) - ulosteet (ja likvor) THL:ään tutkittavaksi Jätevesiseuranta - koko vuoden Hki, Espoo, Turku, Tampere, edustaa noin 20 % västöstä - enteroviruskaudella lisäksi 4:sta muusta kaupungista 3

enterovirusten seuranta Suomessa EV-seuranta (TTR-kantakokoelma) - kaikki EV-positiiviset ulosteet THL:ään tutkittavaksi Epidemiaseuranta (lokakuu 2008 alkaen) - sairastumisryppäistä 3-5

4 Enterovirusepidemiat Suomessa 2010 enterovirusepidemiat: echovirus 30 ja CV-A meningiittiepidemia Aiheuttaja: echovirus enterorokkoepidemia Aiheuttajat: CV-A6 ja CV-A10 HFMD OUTBREAK IN 2008 HFMD cases reported to THL during August 2008 March 2009 Province HFMD cases Positive for HEV CV-A6 (% of typed) CV-A10 (% of typed) Southern Finland (65%) 35 (78%) 10 (22%) Eastern Finland (72%) 13 (62%) 8 (38%) Western Finland (64%) 19 (70%) 8 (30%) Oulu (69%) 13 (72%) 5 (28%) Lapland 16 9 (57%) 3 (60%) 2 (40%) Total (67%) 83 (71%) 33 (28%) 4

cases Positive for HEV CV-A6 (% of typed) CV-A10 (% of typed) Southern Finland 121 79 (65%) 35 (78%) 10 (22%) Eastern Finland 92 66 (72%) 13

5 HFMD OUTBREAK IN 2008 Enterovirus type vs. age of patient Number of patients Negative CV-A6 Age in years Untyped EV CV-A10 Phylogenetic clustering of CV-A6 strains isolated in nucleotides from 5 part of VP1 capsid protein coding region, Neighbour-joining algorithm, Kimura-2 parameter substitution model, 1000 replicates 5

75 80 Negative CV-A6 Age in years Untyped EV CV-A10 Phylogenetic clustering of CV-A6 strains isolated

6 Meningiittiepidemiat 2009 Echovirus 30 löydökset v E30 detections PATIENTS SEWAGE 5 0 January February March April May June July August September October November December TTR:iin ilmoitetut echovirus 30 vuonna 2010 Jalava ym SLL 20 6

February March April May June July August September October

7 Epidemioita aiheuttaneet echovirus 30 kannat VP1 nukleotidisekvensseihin perustuva fylogeneettinen puu (266 nt VP1:n 5 päässä; Neighbour-joining algoritmi Maximum Composite Likelihood mallissa. Jalava ym., SLL 2012 Enteroviruslöydökset 2010 THL: tutkittu 131 potilasta (meningiitti ja/tai enterorokko), tyypitetty (79%) echovirus (16%)CV-A6 2 CV-A4 1 CV-A10 1 echovirus 25 EV-kantakokoelmaan tullut 48 näytettä ja virusisolaattia, tyypitetty (65%) echovirus 30 2 CV-B2 2 CV-B4 2 CV-B5 2 CV-A24 1 CV-A16 1 enterovirus 71 1 enterovirus 96 7

, SLL 2012 Enteroviruslöydökset 2010 THL: tutkittu 131 potilasta (meningiitti ja/tai enterorokko), tyypitetty 75 59 (79%) echovirus 30 12

8 Prospektiivinen INDIS-tutkimus; Tyypitetyt EV-infektioepisodit / vuosi 2010 CV-A2 CV-A5 15% 8% 23% CV-A6 CV-A10 38% 8% 8% EV-68 HRV-49 Roivainen, Simell, Simonen-Tikka ym, Enteroviruslöydökset 2011 THL: tutkittu 52 potilasta (enkefaliitti, meningiitti ja/tai epäselvä kuumeinen infektio), 5 enteroviruspositiivista, tyypitetty 5 enterovirusta 1 CV-A2 1 CV-B3 1 echovirus 6 1 echovirus 18 1 enterovirus 71 EV-kantakokoelmaan tullut 19 näytettä, tyypitetty 16 3 (19%) coxsackievirus A16 1 CV-B5 2 coxsackievirus A6 1 echovirus 6 2 CV-B2 1 echovirus 7 2 CV-B3 1 echovirus 19 2 echovirus 9 1 echovirus 30 8

enteroviruspositiivista, tyypitetty 5 enterovirusta 1 CV-A2 1 CV-B3 1 echovirus 6 1 echovirus 18 1 enterovirus 71 EV-kantakokoelmaan tullut 19

9 Suomen jätevesistä eristetyt ja tyypitetyt enterovirukset v 2011 Rovaniemi Echo 6 Echo 25 Echo 3 CV-B1 Echo 63 Echo 76 Kajaani Echo 11 7 Echo Echo Echo 3 Echo Echo 6 Echo Echo 7 Echo 25 Echo Echo 11 CV-B1 PV1-SL Echo Echo 18 CV-B2 PV2-VDPV Echo Echo 19 Echo 3 Rinovirus CV-A2 CV-B1 Echo 30 Echo 25 Echo 30 CV-B2 Echo 33 CV-B3 Tampere CV-B2 Imatra Echo 30 CV-B3 CV-A2 CV-A4 Tampere CV-B5 CV-B4 Echo 25 Imatra CV-A9 EV-76 CV-B5 CV-B2 Turku PV2/Sabin EV-75 Lappeenranta CV-B3 CV-B4 CV-B5 Echo 3 Turku Helsinki Kotka EV-76 Echo 11 Espoo Helsinki Echo 30 HRV-1A/B CV-B3 CV-B3 HRV-51 Rinovirus CV-B4 Wild Polio Virus Cases 2010 Monovalenttiset ja bivalenttiset tyypin 1 ja 3 rokotteet New WPV1 Outbreak with cases in 4 countries in Euro (KAZ, RUS, TJK, TKM) 2 new WPV1 outbreaks In Africa (CNG, SEN) 3 countries with re-established transmission (ANG, CHA, RDC) Cases for > 12 months Total of 1349 cases with ratio for WPV1: WPV3 of 14:1 4 countries have never interrupted WPV transmission and 16 countries had cases following WPV importation 9

CV-B3 CV-A2 CV-A4 Tampere CV-B5 CV-B4 Echo 25 Imatra CV-A9 EV-76 CV-B5 CV-B2 Turku PV2/Sabin EV-75 Lappeenranta CV-B3 CV-B4 CV-B5 Echo 3 Turku Helsinki Kotka EV-76 Echo 11 Espoo Helsinki Echo 30

10 Wild Poliovirus, Previous 12 Months WPV1 outbreak in China No WPV in India for > 11 months WPV3 outbreaks In West Africa New WPV1 in Kenya Wild virus type 1 Wild virus type 3 Endemic country Total number of cases in 2010: 753 Total number of cases in 2011: 644 Data in WHO HQ as of 27 Dec 2011 VDPV:t (= vaccine derived poliovirus) Syntyvät ihmisen suolistossa RNA-viruksille tyypillinen nopea evoluutio: pistemutaatioita, rekombinaatio VDPV: VP1-nukelotidisekvenssi eroaa > 1% Sabin 1 tai Sabin 3-kannasta = noin 1 vuoden replikaatioaika > 0, 6 % Sabin 2-kannasta Merja Roivainen 10

2011 VDPV:t (= vaccine derived poliovirus) Syntyvät ihmisen suolistossa RNA-viruksille tyypillinen nopea evoluutio: pistemutaatioita, rekombinaatio

11 POLIOVIRUS IN FINNISH SEWAGE SAMPLES Polio cases with WPV years without any PV detected WPV3 OPV A S O N D J F M A M J J A S O N Helsinki PV3S Jyväskylä PV2S,PV3S Kajaani PV2S Kajaani PV3S Helsinki, PV1S, PV2S, PV3S PV1, PV2 15 Dec 08 PV1, PV3 15 Jun 09 PV1, PV2, PV3 06 Jul 09 Tampere VDPVs PV1, PV3 14 Sep 09 S = Sabin vaccine virus PV1, PV3 1 Feb 2010 PV1, PV2 22 Mar 2010 PV1, PV2, PV3 May 2010 PV1, PV2, PV3 June 2010 VDPV isolations from Tampere sewage PV1-VDPV PV2-VDPV PV3-VDPV week Yhteensä yli 70 VDPV-kantaa eristetty 11

PV3 14 Sep 09 S = Sabin vaccine virus PV1, PV3 1 Feb 2010 PV1, PV2 22 Mar 2010 PV1, PV2, PV3 May 2010 PV1, PV2, PV3 June 2010 VDPV isolations from Tampere sewage PV1-VDPV PV2-VDPV

12 VDPV-kantojen perimän tutkimus paljasti - viruksilla yhteys toisiinsa - syntyneet yli 12 v sitten OPV-rokotteesta - lisääntyneet siitä lähtien ihmisen suolistossa Villejä viruksia Intia 1999 PV1-Sabin Tampere Tampere Tampere Chad 1999 Tampere Tampere PV3-Sabin Tampere Egypti 2002 PV1 PV3 Nigeria 1999 Pakistan 1991 PV2 USOL-d-bac MEF-1 Suomi 1984 Egypti 1979 Tampere PV2-Sabin Tampere Tampere Villejä viruksia Villejä viruksia 0.05 Tampereen poliovirukset Virusten perimässä paljon muutoksia virusten taudinaiheuttamiskyky palautunut virusten antigeeniset ominaisuudet muuttuneet => IPV-rokotteen indusoima vasta-ainetaso? Virukset peräisin pitkäaikaiselta viruksen erittäjältä? - Erittäjän tunnistus? Virusten kierto Suomessa mahdollinen 12

Egypti 1979 Tampere060709 PV2-Sabin Tampere151208 Tampere0607 09 Villejä viruksia Villejä viruksia 0.

13 Vuonna 2011 Tutkimus immuunipuutteisten potilaiden keskuudessa viruksen erittäjän tunnistamiseksi Kerätään ulostenäytteet Tutkitaan poliovirus => Krooninen polioviruksen erittäjä Lopuksi - polion eradikaatio vie vielä pitkään - lopullinen eradikaatio on mahdollista vasta kun OPV-virukset on eradikoitu tuskin sen helpompaa kuin villin viruksen eradikaatio => Polion valvontaa ja rokotuksia on jatkettava, niin kauan kun poliota esiintyy ja OPV-viruksia kiertää jossakin päin maailmaa ja vielä vuosia senkin jälkeen => IPV:n käyttö jatkuu vielä tämänkin jälkeen maissa, joilla on siihen varaa 13

eradikoitu tuskin sen helpompaa kuin villin viruksen eradikaatio => Polion valvontaa ja rokotuksia on jatkettava, niin kauan kun poliota esiintyy ja

14 THL Merja Roivainen Soile Blomqvist Anja Paananen Haider Al-hello Päivi Hirttiö Eija Penttilä Johanna Rintamäki Mervi Eskelinen Alena Kaijalainen Svetlana Kaijalainen Päivi Klemola Marja-Leena Simonen-Tikka TY /Virusoppi Tytti Vuorinen HUSLAB Maija Lappalainen Markku Kuusi Outi Lyytikäinen Katri Jalava 14

Svetlana Kaijalainen Päivi Klemola Marja-Leena Simonen-Tikka TY /Virusoppi

Samankaltaiset tiedostot

Polion seuranta Suomessa perustuu

Polion seuranta Suomessa perustuu jätevesinäytteiden analysointiin Merja Roivainen, Dos Laboratorionjohtaja j Suolistovirusyksikkö Tartuntatautiseurannan ja -torjunnan osasto Terveyden ja hyvinvoinnin