Rakennetaan eliöiden sukupuu



Samankaltaiset tiedostot
Kalenterimerkintöjen siirtäminen Notesista

Kuvapankki Imagebank Independent

Sivu 1 / Viikin kirjasto / Roni Rauramo

SSH Secure Shell & SSH File Transfer

Windows Live SkyDrive - esittely

Huomaathan, että ohjeessa olevat näytöistä otetut kuvat voivat poiketa sinun koulutuksesi vastaavien sivujen kuvista.

Epooqin perusominaisuudet

Ohje hakulomakkeen täyttämiseen yliopistohaku.fi -palvelussa

Älä vielä sulje vanhoja


Taulukkolaskenta II. Taulukkolaskennan edistyneempiä piirteitä

Tärkeimmät toiminnot. Kertausta ja uusia toimintoja Wordistä sekä tiedostonhallinnasta. Tärkeimmät toiminnot jatkuu...

Muuttujien määrittely

Työtapaturman ilmoittaminen 2016-> Uusi sähköinen lomake, täyttäminen esimies ja palkkahallinto

Sähköpostitilin käyttöönotto. Versio 2.0

KUVAN TUOMINEN, MUOKKAAMINEN, KOON MUUTTAMINEN JA TALLENTAMINEN PAINTISSA

LUPAOSAKASLUETTELO (ns. yhteislupa) Liite hirvieläinten pyyntilupahakemukseen Sivu 1

1 Asentaminen. 2 Yleistä ja simuloinnin aloitus 12/

Pysäytettyjen töiden tulostus ja poisto Kun tulostuksessa ilmenee asetteluvirheitä Verify print -työt Reserve print -työt

1. Lomakkeet löytyvät asiointiportaalista osoitteesta

Videokuvan siirtäminen kamerasta tietokoneelle Windows Movie Maker -ohjelman avulla

Maisema-arkkitehtuurin perusteet 1A, syksy 2015 Pinnanmuodot-tehtävään ArcMap-ohjeet

Ohjeet asiakirjan lisäämiseen arkistoon

Hae Opiskelija käyttöohje

Ylläpitoalue - Etusivu

My easyfairs -palvelun käyttö

Written by Administrator Monday, 05 September :14 - Last Updated Thursday, 23 February :36

elearning Salpaus Elsa-tutuksi

RATKI 1.0 Käyttäjän ohje

Nuorten hyvinvointi tilastotietokannan käyttöohjeet Tieke

Office_365_loppukäyttäjän ohje Esa Väistö

Verkkojulkaisuesittely

Muistitikun liittäminen tietokoneeseen

Visma Nova. Visma Nova ASP käyttö ja ohjeet

Ajokorttimoduuli Moduuli 2. - Laitteenkäyttö ja tiedonhallinta. Harjoitus 1

Provet Pet ohjelmisto ja tulostus PDF-tiedostoon.

SoleMOVE lähtevän harjoittelijan ohje

Exchange alustan asetukset Outlook 2003, RPC over HTTPS. Alue: Suomi / Käyttöjärjestelmä: Windows XP

Ohjelmisto on tietokanta pohjainen tiedostojärjestelmä, joka sisältää virtuaalisen hakemisto rakenteen.

ESR-Henkilö. Tunnistautuminen ESR-Henkilö -järjestelmässä

Kopioi cd-levyt kiintolevylle, niin fyysiset levyt joutavat eläkkeelle.

zotero

Opi kuvin: By Choice v.1.4 asennus Asennus järjestelmänvalvojan oikeuksin

Kerro kuvin: InPrint 2.8 asennus Asennus järjestelmänvalvojan oikeuksin

Asko Ikävalko, k TP02S-D. Ohjelmointi (C-kieli) Projektityö. Työn valvoja: Olli Hämäläinen

lizengo Asennusopas Windows: in kopioiminen

STS Uuden Tapahtuma-dokumentin teko

Ohjeet kirjautumiseen ja materiaalin lisäämiseen

CV-kannan käyttöohje 2017

Henkilö- ja koulutusrekisterin asennusohje

DL SOFTWARE Uumajankatu 2 Umeågatan FIN VAASA/VASA FINLAND +358-(0) Fax +358-(0)

Ohjelmistopohjaisen lisenssin käyttö

Paperiton näyttösuunnitelma

Adobe Premiere Elements ohjeet

Ulkoiset mediakortit Käyttöopas

4.1 Frekvenssijakauman muodostaminen tietokoneohjelmilla

Kuvien lisääminen ja käsittely

Käyttöpaneelin käyttäminen

Käyttöjärjestelmämme on Windows XP, kaikki tietokoneemme ovat kytketty lähiverkkoon ja Internettiin.

Ohjeita kirjan tekemiseen

Uuden lukuvuoden aloitus ViLLEssa

Käyttöpaneelin käyttäminen

Mendeley-viitteidenhallinta

Ubuntu tunkkausta En US / Helsinki asennuksen jälkeen jotta loki5ac toimisi oikein Winen päällä.

Mendeley-viitteidenhallinta

VINKKEJÄ CV-NETIN KÄYTTÖÖN.

3M Online Center sivuston käyttöopas

Lähettäjä ja vastaanottaja

Ksenos Prime Käyttäjän opas

Moodle opiskelijan opas. Verkko oppimisympäristön käyttö

Jos haluat uuden Share-työkalun, valitse Pods -> Share -> Add New Share tai jos sinulla on jo auki Share-työkalu, näyttää se tältä:

Visma Econet -ohjelmat ActiveX on epävakaa -virheilmoituksen korjausohjeet

Mikä on RSS-syöte? RSS -syötteen tilaaminen sähköpostiin

1. Kalenterin omistajan käyttöohje

Windows Vistan varmuuskopiointi

Lue ohjeet huolellisesti ennen laitteen käyttöä.

Päivitysohje Opus Dental

Massaeditorikoulutus KANSALLISKIRJASTO - Kirjastoverkkopalvelut

UpdateIT 2010: Uutisten päivitys

Postien siirto Koivusta Puruun Macin Mail-ohjelmalla Sivu 1

2013 -merkistä tunnistat uudet ominaisuudet

Student Engeering & Design Community

Kun tulostuksessa ilmenee muotoiluvirheitä

Asteri Palkanmaksu Dos Vuosipäivitys

TALLENNETAAN MUISTITIKULLE JA MUISTIKORTILLE

Matkahuolto lisäosa WooCommerce alustalle (c) Webbisivut.org

Ohje sisävesien pohjaeläimistön luokittelumuuttujien Excellaskupohjiin

Asteri Kirjanpito Dos ALV% nousu 1 %-yksiköllä Vuosipäivitys

Varmuuskopiointi ja palauttaminen Käyttöopas

Automaattitilausten hallinta. Automaattitilauksien uudistettu käsittely

Connect-harjoituksia. Ratkaisumallit seuraavilla sivuilla!

Oy Oticon Ab. Korvakappale.fi. Käyttöohje

Sen jälkeen Microsoft Office ja sen alta löytyy ohjelmat. Ensin käynnistä-valikosta kaikki ohjelmat

Ohjeistus yhdistysten internetpäivittäjille

NTG CMS. Julkaisujärjestelm. rjestelmä

Ohjelmistopäivitykset Käyttöopas

A. Peruskäyttöohje Digilehtiö

MultiBoot. Oppaan osanumero:

Ohjeistus hankkeen sivujen tekemiseen julkaisujärjestelmällä

Transkriptio:

Rakennetaan eliöiden sukupuu Jouko Rikkinen Internetissä on monia eliöiden luokittelua esitteleviä sivustoja. Joissakin niistä on tarjolla verkkotyökaluja, joiden avulla voit tutkia itseäsi kiinnostavien eliöiden sukulaisuussuhteita ja selvittää niiden aseman eliökunnan sukupuussa. Yksi mainio verkkoresurssi on yhdysvaltalainen National Center for Biotechnology Information -sivusto, ja erityisesti sen helppokäyttöinen Taxonomy common tree -verkkotyökalu (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/commontree/wwwcmt.cgi). Tässä on ohjeet Taxonomy common tree -verkkotyökalun käyttämiseksi. Työkalulla voi rakentaa sukupuita mistä tahansa eliöistä, josta on tietoa geenipankin tietokannassa. Laajassa tietokannassa on tietoa jo lähes 250 000 eliölajista (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/taxonomy/txstat.cgi). Verkkotyökaluun voi syöttää tieteellisiä lajinimiä, mutta myös lajia korkeampien taksonien nimiä (esim. suku, heimo, jne.). Eliöiden tieteellisiä nimiä voi etsiä esimerkiksi eläin- ja kasvikirjoista tai Internetistä. Tämän ohjeen tueksi on koottu kaksi valmista aineistoa tutuista ja vähän vieraammista eliöistä: toinen eläimistä ja toinen kasveista. Kustakin eliöstä on kuva ja tieteellinen nimi, jonka voi kopioida Taxonomy common tree - sivun yläreunassa olevaan Enter name or id -laatikkoon. Paina sen jälkeen Enter name or id -laatikkon vieressä olevaa Add -painiketta (tai näppäimistön Enter-näppäintä), jolloin eliön nimi tulee näkyviin sinisellä tekstillä. Eliöiden nimiä lisätään yksi kerrallaan, kunnes koko halutun valikoiman luokittelu ja sukulaisuussuhteet on saatu selville. Jos haluat rakentaa suuren sukupuun, eliöiden nimet kannattaa ensin kirjoittaa tekstinkäsittelyohjelmassa luetteloksi ja tallentaa tekstitiedostoksi. Tämän tiedoston voi syöttää verkkotyökaluun Add from file -toiminnon avulla. Etsi ensin tekstitiedosto omalta koneeltasi Selaa -painikkeen avulla ja syötä se tietokantaan Add from file -painikkeen avulla. BioPop:in sivuilla olevista kasveista ja eläimistä on ohessa valmiit tekstitiedostot, joita voit halutessasi käyttää (kopioi ne ensin omalle tietokoneelle).

Sudenkorennon (Anisoptera) ja traakkipuun (Dracaena) tieteellinen nimi on annettu sekä eläimelle että kasville. Niitä syötettäessä tietokanta pyytääkin selventämään, kummasta eliöstä olet kiinnostunut. Esimerkiksi traakkipuun nimen syöttäminen tuottaa tekstin Multiple nodes found for name 'Dracaena' check needed and push Add button again. Kahdesta vaihtoehdoista (Dracaena <Squamata> ja Dracaena <angiosperm>) rastitetaan oikea, eli Dracaena <angiosperm>, ja kyseinen valinta vahvistetaan painamalla Add - painiketta. Kimalaisen (Bombus) ja männyn (Pinus) nimiä syötettäessä tietokanta haluaa vahvistuksen siihen, onko kyseessä suvun (genus) vai alasuvun (subgenus) nimi. Voit rastittaa kumman haluat. Taxonomy common tree -verkkotyökalulla rakennetut sukupuut voi tallentaa tietokoneen muistiin. Niiden tarkasteluun ja muokkaukseen tarvitaan erityinen ohjelma esimerkiksi Internetistä ilmaiseksi saatava TreeView X -ohjelma käy tarkoitukseen mainiosti. Näillä sivuilla olevat, BioPop:in esimerkkieliöistä laaditut sukupuut on tuotettu Taxonomy common tree -verkkotyökalulla, tallennettu omalle tietokoneelle Phylip tree -muodossa ( Save as phylip tree ), avattu ja muokattu TreeView X -ohjelmalla, siirretty Copy/Pastekomennoilla piirrosohjelmaan (Microsoft Paint -apuohjelma) ja tallennettu siellä kuvatiedostoiksi (tallenna nimellä). Kaikkien BioPop:in sivuilla olevien esimerkkieliöiden sukupuu (Sukupuu A).

Kaikkien BioPop:in sivuilla olevien esimerkkieliöiden sukupuu, johon on merkitty myös sukua korkeampien taksonomisen hierarkian kategorioiden nimiä (sukupuu B). BioPop:in sivuilla olevien eläinten sukupuu (sukupuu C).

BioPop:in sivuilla olevien eläinten sukupuu, johon on merkitty myös sukua korkeampien taksonomisen hierarkian kategorioiden nimiä (sukupuu D). BioPop:in sivuilla olevien kasvien sukupuu (sukupuu E).

BioPop:in sivuilla olevien kasvien sukupuu, johon on merkitty myös sukua korkeampien taksonomisen hierarkian kategorioiden nimiä (sukupuu F).