Pohjois-Suomen biopankki

Transkriptio

1 Pohjois-Suomen biopankki Pia Nyberg, FT FinnTrials Tools- Vaativat biologiset näytteet, Tekes-hanke PPSHP

2 Biopankkilaki Diagnostisten näytteiden kohdalla kudoslain poikkeussäännöstä voi soveltaa 5 vuoden siirtymäajan, jos lääketieteelliseen tutkimukseen tarvittavia näytteitä ei ole saatavissa biopankista, mutta pääsääntöisesti siirto biopankkiin Tutkimusnäytteet: jos ei ole tarvetta näytteiden ja tietojen käyttöön primääritutkimuksen jälkeen, yksittäisen tutkimuksen osalta ei mikään muutu näytteiden laajemman jatkokäytön turvaaminen edellyttää biopankkisuostumusta (ja siis olemassa olevaa biopankkia) Valviran valvonta ja ohjaus

3 Biopankit apuna from bench to bedside - prosessissa

4 Mitä sairaalabiopankki tarkoittaa? Carpen & Kosma Duodecim 2012

5 Suomalaisten biopankkien vahvuuksia Homogeeninen väestöpohja (erityisesti Pohjois-Suomessa!) Kansalaisten myönteinen suhtautuminen tutkimukseen Korkealaatuinen julkinen terveydenhuolto Kansalliset rekisterit

6 Hyödyt terveydenhuollolle Oikea hoito oikealle potilaalle Uusien tutkimustulosten tehokkaampi siirto terveydenhoitoon

7 Hyödyt tutkijoille Diagnostisten näytteiden tutkimuksellinen hyöty vähäinen ilman niihin liitettävää terveystietoa Uudet tekniikat mahdollistavat FFPE näytteiden monipuolisemman käytön, esim morfologian ja profiloinnin yhdistäminen Näytteiden ja niihin liittyvän kliinisen datan sekä kertyvän tutkimusdatan saatavuus Näytteiden laadukkuus (ammattimainen näytteiden ja tietojen säilytys) Vältetään päällekkäiset näytekeräykset Meriaux et al. J Proteomics 2010

8 Yritykset ja biopankki Kliiniset lääketutkimukset ovat vähentyneet Suomessa: trendi halutaan pysäyttää Public-private-partnership

9 Sairaalabiopankkien periaate Tutkija Tieto näytteestä Palautuva tutkimusdata Näytteen- hallintajärjes telmä Yhdistäminen rekisteritietoihin Suostumuk- sen hallinta Biopankki Poimittu ja yhdistetty tieto Potilastiedot tietovarastosta TAI suoraan eri järjestelmistä (qpati, Oberon, Esko jne) Koodi- rekisteri Yhdistettyä potilasdataa voitaisiin käyttää sekä biopankkitutkimukseen että sairaan omiin tilastointeihin

10 Perustettavat sairaalabiopankit Auria (Turku) Omistus TY 6/12 VSSHP 4/12 SaSHP 1/12 VSHP 1/12 Helsinki Tampere Kuopio Jyväskylä Oulu HUS (valtuustopäätös perustamises ta) PSHP 40% TaY 30% Muut ERVA- SHP:t 30% ISY KYS KSSHP 70% JY 30% PPSHP (tai PPSHP+ OY yhdessä?) Organisaatio Hlökunta TYKS-SAPA liikelaitoksen patologian palvelualue Professori, johtaja, laatuvastaava, 2 ITasiantuntijaa, tutkimusassistentti =Auria pankki: toteutuma Patologian arkistosta pankki tai erillinen pankki arkiston yhteyteen Koordinaatt ori (aloittaa kesällä), prosessi-, IT ja tieteellinen työryhmä Oikeushlö PSHP: tiedekeskukseen erillinen taseyksikkö Johtaja, koordinaatt ori, IThenkilö, 1-2 tutkimushoi tajaa PSSHP:n alle? Projektipäällikkö, ohjaus- ja projektiryhmät KSSHP:n alle (patologia) Johtaja, Projektipäällikkö, sihteeri, työryhmä MRC:n alle Projektipääl likkö, projektiryhmä, ohjausryhmä, 5/13-> 20% IT-hlö =muut biopankit: suunnitelma ja/tai väliaikainen ratkaisu

11 Pohjois-Suomen biopankin tavoitteet Nostaa kliinisen tutkimuksen profiilia ja tasoa Mahdollisuus hyödyntää ainutlaatuisia pohjoissuomalaisia näytemateriaaleja Lisätä ihmisperäisten näytteiden keräystä ja käyttöä perusja soveltavassa tutkimuksessa Patologian näytearkistot Prospektiivinen keräys vaativille biologisille näytteille

12 P-S biopankin infra ja organisaatio OY:n strategiarahaa biopankkiinfraan Yhteistyö: biopankki, Pohjois-Suomen syntymäkohortit, DIPP-diabetestutkimus Näytesäilytys ja tiedonhallinta yhteistyössä OY:n tietojenkäsittelyopin laitoksen Center for Advanced System Studies CASS:n kanssa Oulun biopankki kytkeytyy 2013 aloittaneeseen Medical Research Centeriin (MRC) ERVA-alueen shp:t voivat halutessaan liittyä mukaan

13 Patologian kudosarkisto biopankin perusmateriaaliksi: pilotti 2013 Turku ja Oulu myöhemmin muut shp:t OYS:n patologian kudosarkistossa diagnostiikkaa varten otettuja näytteitä vuodesta 1973 Patologian kudosarkistossa n. 2,2 milj kudosblokkia noin potilaasta Vuosittain noin biopsianäytettä (totaalimäärä ) Sähköinen järjestelmä käytössä 1999 Myöhemmin mukaan voidaan ottaa myös: Tuorekudosnäytteitä verinäytteitä (n. 0,5 milj/v)

14 OYS:n patologian arkiston pilotti: SNOMED koodien erot eri shp:eissa -> Harmonisointi: laadunparannus sekä biopankkidatalle että myös diagnostiikalle

15 Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Pahanlaatuiset kasvaimet elintyypeittäin Olli Carpen, TYKS & TY

16 Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: histologiset alatyypit ja esimerkkejä ennusteellisista/hoitoa ohjaavista tekijöistä Olli Carpen TYKS & TY

17 Mitä tietoa biopankkiaineistosta: Rintasyöpänäytteet: erilaistumisasteen korrelaatio kasvaimen kokoon Olli Carpen TYKS & TY

18 Kiitokset Aino-Liisa Oukka Juha Korpelainen Minna Mäkiniemi Paavo Pääkkö Petri Lehenkari Pekka Mattila Pasi Parkkila Eeva-Riitta Savolainen Pirjo Koistinen Merja Möttönen Roberto Blanco Kari Majamaa Johanna Uusimaa Juha Auvinen Et al.. Turku: Tarja Laitinen, Heli Salminen- Mankonen, Olli Carpen, Panu Jaakkola, Päivi Rautava, Perttu Terho, Samu Kurki Kuopio: Veli-Matti Kosma, Arto Mannermaa, Hanna Tuhkanen Hki: Tuomas Mirtti Tampere: Kimmo Savinainen, Jarkko Penttinen Jkylä: Marjukka Friman, Markku Kallajoki FIMM: Juha Muilu, Kimmo Pitkänen THL: Anu Jalanko, Sirpa Soini, Helena Kääriäinen Et al.