Peptidisynteesi. Kiinteän faasin peptidisynteesi. SPPS:n Periaate Aminohappo kytketää. synthesis (SPPS) Suuret peptidiainemää

Samankaltaiset tiedostot
Peptidisynteesi. SPPS:n Periaate

lähde:

Julkaistu Helsingissä 24 päivänä helmikuuta /2014 Maa- ja metsätalousministeriön asetus

Peptidi ---- F K V R H A ---- A. Siirtäjä-RNA:n (trna:n) (3 ) AAG UUC CAC GCA GUG CGU (5 ) antikodonit

Valtuuskunnille toimitetaan oheisena asiakirja C(2017) 3664 final LIITTEET 1 2.

Solun kemiallinen peruskoostumus eläinsolu. Solun kemia. Solun kemiallinen peruskoostumus bakteerisolu. Vesi 1

VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI. Vaminolac infuusioneste 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT ml sisältää:

UTLAGGNINGSSKRIFT A 61K 39/104, 35/74 //(A 61K 39/104, C 12R 1:385) (32) (33) (31) Etuoikeus - Prioritet

Euroopan unionin neuvosto Bryssel, 12. toukokuuta 2016 (OR. en)

Päähaku, molekyylibiotieteiden kandiohjelma Valintakoe klo

VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI. Aminoplasmal 16 N/l infuusioneste, liuos 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT. Infuusioneste sisältää:

BIOMOLEKYYLIEN VISUALISOINTI KEMIAN OPETUKSESSA

SISÄLLYS. N:o 218. Valtioneuvoston asetus. kolttalain muuttamisesta annetun lain eräiden säännösten voimaantulosta

PAKKAUSSELOSTE. VAMINOLAC infuusioneste, liuos. aminohappoja

Aminohapot ja proteiinit

Sinisimpukkajauhon (Mytilus edulis) aminohappojen sulavuus porsailla

VASTAUS 1: Yhdistä oikein

PAKKAUSSELOSTE. AMINOPLASMAL 16 N/l infuusioneste, liuos

Sukunimi Etunimet Tehtävä 3 Pisteet / 20

Bioteknologian tutkinto-ohjelma Valintakoe Tehtävä 3 Pisteet / 30

URN: NBN:fi-fe

Mustasotilaskärpäsen toukkajauhon (Hermetia illucens) aminohappojen sulavuus porsailla

13. Biomolekyylit. 1. Hiilihydraatit

PLASMAN AMINOHAPPOPITOISUUKSIEN MUUTOKSET NAUTITTAESSA SUUN KAUTTA GLUTAMIINIA JA ARGINIINIA LEVON JA VOIMAHARJOITUKSEN YHTEYDESSÄ

TUTKIMUSTULOKSIA FINOLA-SIEMENHAMPUN (FIN-314) VILJELYKOKEESTA MTT:N POHJOIS-SAVON TUTKIMUSASEMALLA

KOMISSION ASETUS (EY)

PAKKAUSSELOSTE. VAMINOLAC infuusioneste, liuos. aminohappoja

KOMISSION DIREKTIIVI 96/8/EY, annettu 26 päivänä helmikuuta 1996, laihdutukseen tarkoitetuista vähäenergiaisista elintarvikkeista

Broilerivehnän viljelypäivä Essi Tuomola

10. Karbonyyliyhdisteet. Karboksyylihapot ja niiden johdannaiset

VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI. Glavamin infuusioneste 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT ml infuusionestettä sisältää:

VALMISTEYHTEENVETO 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI. Aminoplasmal 16 N/l infuusioneste, liuos 2. VAIKUTTAVAT AINEET JA NIIDEN MÄÄRÄT. Infuusioneste sisältää:

(ETA:n kannalta merkityksellinen teksti)

Biomolekyylit 2. Nukleotidit, aminohapot ja proteiinit

KUULUTUSJULKAISU r 7. Patentti MY'jnr1.2'_ ty 10 Cl 193 (45) 1i. (go) KvA?mit.a3. (21) Patenttlhakemus Patemensökning (n) HaltemispIllvi AmoöknIquelag

Rehu lisääntymiskautena. EP rehupäivät 2016 Essi Tuomola

luonnollinen kasviravinne

Aminohapot ja proteiinit

Työ- ja elinkeinoministeriön asetus

Kasvisruokaa erilaisille asiakasryhmille

(12) PATENTTIJULKAISU PATENTSKRIFT (10) FI B. (45) Patentti myönnetty - Patent beviljats (51) Kv.Ik.7 - Intk1.7

GLP-1 analogit lihavuuden hoidossa. Aila Rissanen Lihavuustutkimusyksikkö ja Syömishäiriöklinikka HYKS

Maidon ja proteiinien merkitys lasten ravitsemuksessa ja terveydessä

Kaiken hyvän alku ja juuri On siinä, että vatsa voi hyvin. Siitä riippuu myös viisaus ja Kaikki hyvä, mitä ihmiskunta Saa aikaan.

Uuden valkuaisarvojärjestelmän toimivuus kolmirotulihasioilla

Biomolekyylit ja biomeerit

VALMISTEYHTEENVETO. 9,88 mg (8,80 mg) 1,30 mg (1,06 mg) 0,700 mg (0,520 mg)

FI Euroopan unionin virallinen lehti L 312/843 LIITE 4

sosiaaliturvatunnus Tehtävissä tarvittavia atomipainoja: hiili 12,01; vety 1,008; happi 16,00. Toisen asteen yhtälön ratkaisukaava: ax 2 + bx + c = 0;

GMO analytiikka Annikki Welling Kemian tutkimusyksikkö Evira

BIOLOGIAN PRELIMINÄÄRIKOE 2008

Proteiinin rakenteen selvittämisestä ja visualisoinnista

Perinnöllisyystieteen perusteita III Perinnöllisyystieteen perusteita

ICOPP hanke Uusien luomuvalkuaisrehujen sulavuus sioilla: Sinisimpukkajauho Mustasotilaskärpäsen toukkajauho

Hakukohteen nimi: Päähaku, elintarviketieteiden kandiohjelma

KEMIA HYVÄN VASTAUKSEN PIIRTEET

VALMISTEYHTEENVETO. Elektrolyyttejä sisältävä aminohappoliuos, 5,9 g/100ml. 300 ml 80 ml 160 ml 60 ml

Mitä ovat ioniset nesteet eli suolasulat?

VALMISTEYHTEENVETO. 1. LÄÄKEVALMISTEEN NIMI Numeta G19E infuusioneste, emulsio

Käyttövalmiin infuusionesteen sisältö kammioiden sekoittamisen jälkeen:

URHEILUSSA KÄYTETTÄVIEN LISÄRAVINTEIDEN VAIKUTUS SUUNTERVEYTEEN

Solubiologian ja biokemian perusteiden luennot. Elina Oksanen. Itä-Suomen yliopisto Biologian laitos. Campbell, Biology, 9th ed, luento 1-2

Antibody-Drug conjugates: Basic consepts, examples and future perspectives

VALMISTEYHTEENVETO. Käyttövalmiin infuusionesteen sisältö kammioiden sekoittamisen jälkeen:

YMPYROI OIKEAT VAIHTOEHDOT

Proteiinien muuntuminen energiaksi ihmiselimistössä

Sydänhormonit, niiden esiasteet ja pilkkoontumistuotteet sydämen vajaatoiminnan diagnostiikassa

Reaktiomekanismi. Tänä päivänä hyödynnetään laskennallista kemiaa reaktiomekanismien määrittämisessä/selvittämisessä!

Kemian perusteet farmasiassa osa II: orgaaniset yhdisteet/tapio Nevalainen Loppukuulustelu b) ketoni

EPIONEN Kemia EPIONEN Kemia 2015

Lisäravinteet. Viikko 7 / Moduuli 7. #Lisäravinteet

Tehtävän eri osat arvostellaan 1/3 pisteen tarkkuudella, ja loppusumma pyöristetään kokonaisiksi

Rehuanalyysien tulokset. Petra Tuunainen, MTT Kotieläintuotannon tutkimus Johdanto

132 mmol/l 1,25 mmol/l 0,25 mmol/l 105 mmol/l 40 mmol/l

Lotta Wennäkoski. Soiva ilo. Sopraanolle ja pianolle. (Marjo Heiskanen)

HELSINGIN YLIOPISTO. Vetyfosfonaattimenetelmä oligonukleotidisynteesissä

Törmäysteoria. Törmäysteorian mukaan kemiallinen reaktio tapahtuu, jos reagoivat hiukkaset törmäävät toisiinsa

VALMISTEYHTEENVETO. Vaikuttavien aineiden määrät 1000 ml:n ja 2000 ml:n pakkauskoossa esitetään alla olevassa taulukossa.

(FI) (41) Tullut julkiseksi - Blivit offentlig

LIITTEET. asiakirjaan KOMISSION DELEGOITU ASETUS (EU) /...,

Ohjeita FZVD2PMU Flex maavalokaapelin päättämiseen ODF-telineisiin ja kytkentäkaappeihin

MITÄ SIDOKSILLE TAPAHTUU KEMIALLISESSA REAKTIOSSA

LIGNIINI yleisesti käytettyjä termejä

2. Täydennä seuraavat reaktioyhtälöt ja nimeä reaktiotuotteet

Bentseeni on vaikeasti reagoiva yhdiste. Bentseeni on avaruusrakenteeltaan tasomainen. Bentseenin

HELSINGIN YLIOPISTO. Elintarvike- ja ympäristötieteiden laitos EKT-1582 OHRAN HORDEIINIEN UUTTUMINEN JA METALLIKATALYSOITU OKSIDAATIO.

Sikojen Rehutaulukko Soile Kyntäjä MTT Kotieläintuotannon tutkimus Viikki

Mustasotilaskärpäsen toukkajauhon (Hermetia illucens) aminohappojen sulavuus porsailla

Joensuun yliopisto Kemian valintakoe/

Soiva ilo. lotta. wennäkoski. sopraanolle ja pianolle runo marjo heiskanen. Soiva ilo. Tila pisteiden välissä: ääni. Valtaa pisteissä, luulit,

SEMINAARI SFS:SSÄ UUDET YHTEISET STANDARDIT YMPÄRISTÖANALYTIIKKAAN? PENTTI MANNINEN

( II ) ( 1 1 ) KUULUTUSJULKA I SU. UTLAGGN I NG S SKR I FT C ( " r) (51) Kv.lk.5 - Int.c1.5. (24) Alkupäivä - Löpdag

Supporting Information

VALMISTEYHTEENVETO ml 2053 ml 1540 ml 1026 ml Glukoosi (glukoosi 19 %) 1316 ml 1053 ml 790 ml 526 ml Aminohapot ja elektrolyytit (Vamin 18

NÄIN OTAT F-SECURE SAFEN KÄYTTÖÖN

Biopolymeerit. Biopolymeerit ovat kasveissa ja eläimissä esiintyviä polymeerejä.

Helsingin, Jyväskylän, Oulun ja Turun yliopistojen kemian valintakoe tiistaina klo 9-12

Terveyden biotieteiden valintakoe / kemia 1 (10) Henkilötunnus - Sukunimi Etunimet. Allekirjoitus KEMIAN KYSYMYKSET

Nimi sosiaaliturvatunnus. Vastaa lyhyesti, selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Luento V. IV Sisäisen ympäristön säätely. Ravitsemus. Ravitsemus - Välttämättömät ravintoaineet. Ravintoon ainetta ja energiaa ylläpitoon, kasvuun ja

Transkriptio:

eptidisynteesi uoritetaan yleensä kiinteän n faasin pinnalla; solid phase peptide synthesis () uuret peptidiainemää äärät t valmistetaan liuosfaasissa.. B. Merrifield: ribonukleaasientsyymin synteesi vuonna 1969 (obel 1984) :n eriaate Aminohappo kytketää ään linkkerin avulla kovalenttisesti karboksyylipää äästään liukenemattomaan polymeeriin. ivuketjut suojataan pysyvästi iitettävän aminohapon t. peptidin -terminaaliin kiinnitetään väliaikainen suojaryhmä iitettävän n aminohapon t. peptidin karboksyyliterminaali aktivoidaan Kunkin reaktiovaiheen jälkeen j peptidin sisält ltävä polymeeri suodatetaan ja pestää ään n sopivilla pesuliuottimilla. Valmis peptidi irrotetaan polymeeristä reagensseilla, joka katkaisee peptidin ja polymeerin välisen v kovalenttisen sidoksen. Kiinteän faasin peptidisynteesi olid phase peptide synthesis () 1) olymeeriin liitetään linkkeri () johon ensimmäinen suojattu aminohappo liitetään. 2 2 n n 1) uojaryhmä ()( ) poistetaan terminaalisesta aminoryhmästä. 2) isätään seuraava aminohappo ja muodostetaan peptidisidos. 3) Toistetaan vaiheet 2 ja 3 (n- kertaa) kunnes saadaan haluttu peptidi 4) oistetaan viimeinen - terminaalinen suojaryhmä sekä sivuketjujen suojaryhmät ja peptidi irrotetaan linkkeristä. 1

Aktivointireagensseja Disykloheksyylikarbodi-imidi imidi (D) eptidisidoksen muodostamiseen tarvitaan karboksyyliterminaalin aktivointi. D muodostaa -asyyliurea- rakenteen,, joka aktivoi karbonyylihiilen aminoryhmän nukleofiiliselle hyökkäykselle; peptidisidos muodostuu ja kiinteä disykloheksyyliurea (DU) saostuu. D AA AA 2 DU Muita aktivointireagensseja 3 3 DI di-isopropyylikarbodi-imidi 3 3 3 3 3 ED; EDI; EDA -(3-dimethylaminopropyl)- '-ethylcarbodiimide u -hydroksisukkini-imidi Bt -hydroksibentsotriatsoli DI,'-karbonyylidiimidatsoli 3 3 2 DMA p-nitrofenoli,-dimetyyliaminopyridiini Fosfoniumsuolat: esim. B (Bentsotriatsol-1- yylioksitris(dimetyyliamino)-fosfoniumheksafluorofosfaatti) F - 6 Me 2 Me 2 Me 2 AA F - 6 Me 2 Me 2 Me 2 AA AA 2 2

Aminoryhmän suojaryhmät D-koplauksessa aminoryhmä suojataan polymeroitumisen estämiseksi. leisimmät t suojaryhmät t ovat karbamaatteja AA benzyloxycarbonyl (bz) AA t-butyloxycarbonyl (tboc) AA 9-fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) Kullakin suojaryhmällä on oma poistomenetelmänsä Fmoc tboc bz aq. 3 tai 20% piperidiini 100%, rt, 1 h 2 /d- uojaryhmän poisto-olosuhteet on valittava sellaisiksi, etteivät ne poista sivuryhmien suojaryhmiä. Bentsyylioksikarbonyyli (bz tai Z) 3 Bz (benxyloxycarbonyl chloride) a Bz-AA (carbobenzyloxy) Emässtabiili Voidaan poistaa hydraamalla ( 2,d/) tai voimakkaalla hapolla Kysteiini ja metioniini voivat myrkyttää d/- katalyytin, joten sen sijaan käytetään Boc- ja Fmoc-suojaryhmiä Käytetään edelleen sivuryhmien suojauksessa Useimpia Bz, Boc ja Fmoc-aminohappoja on kaupallisesti saatavissa. 3

Tert-butyylioksikarbonyyli (Boc) Boc-suojaryhmä voidaan liittää Boc-anhydridillä tai Boc-n -reagenssilla (Boc) 2 tai 3 a tai Et 3 Boc-AA (Butyloxycarbonyl) Boc-n (t-butoxycarbonyloximinophenylacetonitrile) Boc on emässtabiili ja kestää vedytyksen Boc-suoja poistetaan hapolla (, Br,,, F) Boc-AA F 3 1 2 2 Merrifield-peptidisynteesi aminohapon amiinipää suojataan Boc-ryhmällä sivuketjut suojataan bentsyyliryhmillä (Bn( Bn) Boc-suojan poisto 50% /DM Fenyyliasetamidometyyli (AM) AM)-linkkeri ivuketjujen suojaryhmät poistetaan vahvalla hapolla (F tai Br/) F s Boc-asparagiinihapon cesium suola F AM-linkkeri Merrifield-hartsi 4

9-(fluorenyylimetyylioksi)karbonyyli (Fmoc) Et 3 leisin suojausmenetelmä Kestää happoja ja vedytystä oistetaan miedolla emäksellä (esim. piperidiinillä tai morfoliinilla) Muita Fmoc-reagensseja: X = X = Fmoc-AA (fluorenylmethyloxycarbonyl) X = X Fmoc- Fmoc- Fmoc-bt Fmoc-peptidisynteesi Wanghartsi ivuketjut suojataan tert- butyyliryhmillä 4-Bentsyylioksibentsyyli- alkoholi (Wang) Wang)-linkkeri Amiinipään Fmoc-ryhmä poistetaan piperidiinillä ivuketjujen suojaryhmät poistetaan :lla ja samalla peptidi irtoaa hartsista. 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 Fmoc-u (fluorenylmethyloxycarbonyloxysuccinimide) 5

ivuryhmien suojaus Gly (glysiini) glysiini)-,, Ala (alaniini)( alaniini)-, Val (valiini) valiini)-, e (fenyylialaniini) fenyylialaniini)-, eu (leusiini) leusiini)- Ile (isoleusiini)( isoleusiini)-, Met (metioniini) metioniini)-,, ro (proliini)( proliini)-, Trp (tryptofaani) tryptofaani)-, Asn (asparagiini) asparagiini)- ja Gln (glutamiini) glutamiini)- aminohappoja ei yleensä tarvitse suojata ysiinin ε-aminoryhmä ja kysteiinin -ryhmä on suojattava aina Muiden ryhmien suojaus vähentää sivureaktioden määrää ivuryhmien suojaus Fmoc-kemiassa Fmoc-kemiassa käytettyjä suojaryhmiä, jotka voidaan poistaa :lla tai trimetyylisilyylibromdilla (TMBr) Arginiini: Me 2 Arginine or TMBr or TMBr Arg(Boc)2,'-bis(t-butyloxycarbonyl)-Arg Arg(Mtr) -γ -4-methoxy-2,3,6-trimethylbenzenesulfonyl--arginine Arg(bf) -γ - (2,2,4,6,7-pentamethyldihydrobenzofuran-5-sulfonyl) -- arginine Arg(mc) -γ-(2,2,5,7,8- pentamethylchroman-6-sulfonyl)--arginine 6

ivuryhmien suojaus Fmoc-kemiassa ysiini: 2 Kysteiini: ysine ystein or TMBr ys(boc) -(t-butyloxycarbonyl)-ys ys(mtt) -ε-4-methyltrityl--lysine ys(trt) -trityl--cystein ivuryhmien suojaus Fmoc-kemiassa istidiini: is(boc) is(trt) eriini, treoniini ja tyrosiini: erine er(tbu) -t-butyl--serine Thr(tBu) Tyr(tBu) 7

ivuryhmien suojaus Fmoc-kemiassa Asparagiini- ja glutamiinihappo Aspartic acid Asp(tBu) -aspartic acid 4-tert-butyl ester Glu(tBu) eptidit lääkeaineina Aivolisäkkeen takalohko tuottaa peptidihormoneja mm. vasopressiinia ja oksitosiinia. iklosporiini lisää kudossiirränn nnäisten pysyvyyttä. iklosporiinia käytetään n myös nivelreuman ja vaikean psoriaasin hoidossa. Monet AE-est estäjät ovat peptidirakenteisia, esim. enalapriili enalapriili 2 ksitosiini 2 2 Gly eu ro ys Asn Gln 2 2 ys Tyr Ile siklosporiini 8

Kirjallisuutta ouben-weyl Weyl Methods of rganic hemistry. ynthesis of eptides and eptidomimetics; ; M. Goodman, A. Felix,. ; M. Moroder and. Toniolo Ed.; Georg Thieme Verlag: : tuttgart, 2001; Vols.. E22a- d.. kada,, ynthesis of eptides by olution Methods. urr. rg. hem.. 2001, 5, 1. Aimoto,, ontemporary methods for peptide and protein synthesis. urr. rg. hem.. 2001, 5, 45 M. A. Walker,, rotein synthesis by chemical ligation of unprotected peptides in aqueous solution. Angew. hem., Int.. Ed. Engl. 1997, 36, 1069 loyd-williams, F. Albericio,, E. Giralt, hemical Approaches to the ynthesis of eptides and roteins.; : Boca aton, Florida, 1997. 9