Luennon 5 oppimistavoitteet. Soluseinän biosynteesi. Puu-19.210 Puun rakenne ja kemia. Solun organelleja. Elävä kasvisolu



Samankaltaiset tiedostot
Selluloosan rakenne ja ominaisuudet

LIGNIINI yleisesti käytettyjä termejä

SOLUSEINÄN KOOSTUMUS Puukuitujen soluseinät koostuvat lähinnä selluloosasta, hemiselluloosista ja ligniinistä.

2.1 Solun rakenne - Lisämateriaalit

The Plant Cell / Soluseinä

PROTEIINIEN MUOKKAUS JA KULJETUS

Luennon 2 oppimistavoitteet RUNGON RAKENNE PUU. Elävä puu ja puuaineksen muodostuminen. Puu Puun rakenne ja kemia

ENTSYYMIKATA- LYYSIN PERUSTEET (dos. Tuomas Haltia)

BIOMOLEKYYLEJÄ. fruktoosi

Kuoren rakenne ja kemia

Solun toiminta. II Solun toiminta. BI2 II Solun toiminta 7. Fotosynteesi tuottaa ravintoa eliökunnalle

Luennon 3 oppimistavoitteet. Solulajit PUUSOLUT. Luennon 3 oppimistavoitteet. Puu Puun rakenne ja kemia

The Plant Cell / ER, diktyosomi ja vakuoli

Luennon 8 oppimistavoitteet I. Puun hemiselluloosien rakenne ja ominaisuudet. Puun koostumus. Luennon 8 oppimistavoitteet II

The Plant Cell / Sytoskeleton

Henkilötunnus - Biokemian/bioteknologian valintakoe. Sukunimi Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20

A - soveltaminen B - ymmärtäminen C - tietäminen 1 - ehdottomasti osattava 2 - osattava hyvin 3 - erityisosaaminen

Puun ominaisuudet. Luennon 13 oppimistavoitteet I. Luennon 13 oppimistavoitteet II PUUAINEKSEN OMINAISUUDET. Puu Puun rakenne ja kemia

ELEC-C2210 Molekyyli- ja solubiologia

Uusia mahdollisuuksia suuren ja pienen yhteistyöstä

Puun uuteaineet UUTEAINEET. Puu Puun rakenne ja kemia

Käsitteitä. Hormones and the Endocrine System Hormonit ja sisäeritejärjestelmä. Sisäeriterauhanen

-1- Ota henkilötodistus mukaasi jättäessäsi vastauspaperin. Kysymyksiin voi vastata suomeksi, ruotsiksi tai englanniksi.

Puusolut ja solukot. Puu Puun rakenne ja kemia 2007 Henna Sundqvist, VTT

Biopolymeerit. Biopolymeerit ovat kasveissa ja eläimissä esiintyviä polymeerejä.

Ma > GENERAL PRINCIPLES OF CELL SIGNALING

Solun Kalvot. Kalvot muodostuvat spontaanisti. Biologiset kalvot koostuvat tuhansista erilaisista molekyyleistä

Ravintoaineiden Digestio ja Imeytyminen

Ravintoaineiden Digestio ja Imeytyminen. RuoRa 2013 Pentti Somerharju

Puuaineksen tuhoutuminen, lahoaminen ja puun väri

782630S Pintakemia I, 3 op

Nimi: Orgaaninen kemia. orgaanista.wordpress.com. 9. luokan kurssi

MAOL:n pistesuositus kemian reaalikokeen tehtäviin syksyllä 2011.

Itä-Suomen yliopisto/metsätieteiden osasto Valintakoe 2012/MALLIVASTAUKSET

Teesi, antiteesi, fotosynteesi

Biokemian perusteet : Hemoglobiini, Entsyymikatalyysi

ELÄMÄN MÄÄRITTELEMINEN. LUENTO 1 Kyösti Ryynänen Seutuviikko 2014, Jämsä MITÄ ELÄMÄ ON? EI-ELÄVÄ LUONTO ELÄVÄ LUONTO PAUL DAVIES 26.3.

Mitä elämä on? Astrobiologian luento Kirsi

vi) Oheinen käyrä kuvaa reaktiosysteemin energian muutosta reaktion (1) etenemisen funktiona.

Anatomia ja fysiologia 1

Kuusen kasvu muuttuvassa ilmastossa

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 3. Solujen kemiallinen rakenne

Nimi sosiaaliturvatunnus. Vastaa lyhyesti, selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Kotitehtävä. Ruokapäiväkirja kolmelta vuorokaudelta (normi reenipäivä, lepopäivä, kisapäivä) Huomioita, havaintoja?

Oulun yliopiston biokemian koulutusohjelman valintakoe

High Definition Body Lift selluliittigeeli

Workshop: Tekniikan kemia OAMK:ssa

Solun perusrakenne I Solun perusrakenne. BI2 I Solun perusrakenne 2. Solun perusrakenne

Puun kosteuskäyttäytyminen

NON-CODING RNA (ncrna)

Lääketieteen ja biotieteiden tiedekunta Sukunimi Bioteknologia tutkinto-ohjelma Etunimet valintakoe pe Tehtävä 1 Pisteet / 15

Vastaa lyhyesti selkeällä käsialalla. Vain vastausruudun sisällä olevat tekstit, kuvat jne huomioidaan

Solun kalvorakenteet ja niiden välinen kuljetus

Selluloosatutkimuksen tuoreimmat suuntaukset Suomessa ja Japanissa

Tuma - nucleus. Tumahuokonen nuclear pore samanlaisia kasveilla ja eläimillä. Tuman rakenne. Solubiologian luennot 2003, kasvitiede

Sukunimi Etunimet Tehtävä 1 Pisteet / 20

Jätteillä energiatehokkaaksi kunnaksi - luovia ratkaisuja ilmastonmuutoksen

KEMIA HYVÄN VASTAUKSEN PIIRTEET

Mind Master. Matti Vire

Puun kuitujen hyödyntäminen

CMC:N TOIMIVUUDEN TUTKIMINEN LABORATORIO-OLOSUHTEISSA

DNA:n informaation kulku, koostumus

Esim. ihminen koostuu 3,72 x solusta

Luonnonkuidusta lujitteeksi. Kumi-instituutin ja TTY:n Luomaprojektin kevätseminaari Päivi Lehtiniemi,TTY

Solubiologian ja biokemian perusteet (4 op) ) Solun rakenne. Campbell & Reed: Biology, 9th ed., Chapter 6, A Tour of the Cell

BETONIHARKKO, BETONIVALU, LECA-HARKKO JA SIPOREX Rappausohje

Liikunta. Terve 1 ja 2

Määritelmä, metallisidos, metallihila:

Erilaisia soluja. Siittiösolu on ihmisen pienimpiä soluja. Tohvelieläin koostuu vain yhdestä solusta. Veren punasoluja

KONTRASTIN LISÄÄMINEN PUUKUIDUN RAKENTEEN SELVITTÄMISEKSI JA PAIKALLISTAMISEKSI PAPERIARKISTA RÖNTGENTOMOGRAFIALLA

Kemiallinen reaktio

BI4 IHMISEN BIOLOGIA

Laastin halkeamien korjaus

Konkretiaa puuhun perustuvilla ratkaisuilla PÄÄTTÄJIEN 43. METSÄAKATEMIA EVELIINA POKELA

Amylaasi ja tärkkelyksen hydrolyysi Pauliina Lankinen, Antti Savin ja Sari Timonen

EUROOPAN PARLAMENTTI

Biomolekyylit ja biomeerit

6 GEENIT OHJAAVAT SOLUN TOIMINTAA nukleiinihapot DNA ja RNA Geenin rakenne Geneettinen informaatio Proteiinisynteesi

Seismiset luotaukset Jyväskylän m1k:n ja Toivakan kunnan alueella syksyllä Paikka Karttalehti Luotauslinjoja Sijantikuva Tulokset.

Maito ravitsemuksessa

Tekijä lehtori Zofia Bazia-Hietikko

Tunne puuraaka-aineen lahoviat

Solun toiminta. II Solun toiminta. BI2 II Solun toiminta 8. Solut tarvitsevat energiaa

Kierrätämme hiiltä tuottamalla puuta

Puumateriaalin kemiallinen käyttäytyminen sulfaattikeiton alkalisessa etanoliesikäsittelyssä

Hanna Heikinheimo. Koivu- ja kuusiuutteen puhdistaminen lakkaasientsyymillä

5 Kehittämistutkimus Tutkimuskysymykset Tutkimuksen toteuttaminen... 55

Solu - perusteet. Enni Kaltiainen

ATOMIHILAT. Määritelmä, hila: Hilaksi sanotaan järjestelmää, jossa kiinteän aineen rakenneosat ovat pakkautuneet säännöllisesti.

Kuinka entsyymit toimivat?

2.2. Fotosynteesipotentiaalin vaihtelu

K Metodi. eli neliötossut ilman ompelua

FyKe 7 9 Kemia ja OPS 2016

KUUROMYKKÄIN LEHTI SUONEN KUUROMYKKÄINLIITON ÄÄNENKANNATTAJA

Luettelo tunnusnumeroista 1801 (1) Huom. (2)

- eliöistä peräisin olevien, osittain hajonneiden hiilipitoisten aineiden seos 1p - lista max 4p, á 0.5 p/kohta - kieli ja selkeys 1p

Luonnonkuitukomposiitit

Pellettien ja puunkuivauksessa syntyneiden kondenssivesien biohajoavuustutkimus

TW- EAV510/TW- EAV510AC: GRE- OHJEISTUS

Ravintoaineiden Digestio ja Imeytyminen

Transkriptio:

Luennon 5 oppimistavoitteet Soluseinän biosynteesi Puu-19.210 Puun rakenne ja kemia saat listata puuaineksen muodostumisen vaiheet. Ymmärrät, kuinka soluseinän tapahtuu. saat lyhyesti kuvata soluseinän biosynteesin päävaiheet. saat kuvata soluseinän rakennetta soluseinän biosynteesin pohjalta. Elävä kasvisolu Solun organelleja RGANELLI Mitokondria TETÄVÄ Sisältää solun genomin ja toimii solun keskuksena apettaa ravintoaineita ilman hapen avulla tuottaen hiilidioksidia, vettä ja ATP:tä Kloroplasti eli viherhiukkanen Muuttaa aurinkoenergiaa kemialliseksi energiaksi (fotosynteesi). Golgin laite Prosessoi ja lajittelee proteiineja. Endoplastinen kalvosto Solun pinnalle ja ulkopuolelle tulevien proteiinien ja lipidien valmistuspaikka. (Lehninger et al. 2000)

I II IV V VI Solun biosynteesin päävaiheet Solu jakautuu ja välilamellin v esiaste muodostuu. kerrostuu välilamellin molemmilla puolin. Solun laajeneminen (pidentyminen ja säteensuuntainen kasvu). n kasvu päättyy. Solun kulmissa ja välilamellin alueella tapahtuu lignifioitumista. Sekundaariseinän alkaa kerrostua. n lignifioituminen etenee. I Solu jakautuu ja välilamellin esiaste muodostuu Solun jakautuminen alkaa tuman jakautuessa. Golgin laitteen erittämät Golgin rakkulat eli vesikkelit yhdistyvät muodostaen välilamellia tai oikeastaan sen esiasteen (eng. cell plate). Pääosa tästä soluseinämästä muodostuu pektiinistä, mikä on verkottunut kalsiumin kanssa. Joustava primaariseinä esiaste VII VIII Sekundaariseinän kasvu päättyy ja lignifioituminen etenee soluseinässä. Solu on täysin lignifioitunut ja kuolee. Mikäli kyseessä on parenkyymisolu, solu kuolee vasta sydänpuun muodostumisen yhteydessä, mikäli puuhun muodostuu sydänpuuta. alkaa. jakautuu. kehittyminen. II kerrostuu välilamellin esiasteen pinnalle esiaste Elävä puusolu II kerrostuu välilamellin esiasteen pinnalle alkaa kehittyminen Solu on jakautunut. ympäröi koko solua Selluloosa ja hemiselluloosat kerrostuvat välilamellin kummallakin puolella muodostaen primaariseinän. Suurennettu alue Golgin vesikkeli l. rakkula, joka sisältää hemiselluloosia Tässä vaiheessa primaarinen soluseinä sisältää selluloosamikrofibrilleja, hemisellulooseja (erityisesti arabinoosia ja galaktoosia). esiaste ssa olevat päätekompleksit aikaansaavat selluloosamikrofibrillien muodostumisen. emiselluloosat kerrostuvat samanaikaisesti mikrofibrillien kanssa ja ne erottavat ohuet mikrofibrillit tasaisin välimatkoin toisistaan.

biosynteesi emiselluloosien biosynteesi Selluloosamikrofibrillit rakentuvat glukoosista, ja niitä alkaa muodostua päätekomplekseissa biosynteesin aikana. Päätekompleksit ovat muodostuneet syntetaasientsyymista, ja ne ovat näkyvissä fibrillien kärjissä niiden muodostumisen aikana. Päätekompleksit liikkuvat solukalvossa muodostaen selluloosamikrofibrillejä. Uudet fibrillikerrokset asettuvat peräkkäin solukalvon ja aiemmin muodostuneiden selluloosamikrofibrillien väliin. Selluloosamikrofibrillien orientaatiot leikkaavat toisensa, mikäli päätekompleksien liikkeen suunta muuttuu seuraavassa kerroksessa. emiselluloosat kulkeutuvat soluseinään Golgin rakkuloiden välityksellä. emiselluloosat kerrostuvat samanaikaisesti selluloosamikrofibrillien kanssa. Turvonnut hemiselluloosageeli erottaa ohuet selluloosamikrofibrillit tasaisin välimatkoin toisistaan. Rakenne tunnetaan nimellä ristikkäinen hunajakenno rakenne. Ristikkäinen hemiselluloosa-selluloosakennorakenne. emiselluloosien biosynteesi sa hemiselluloosista järjestyy selluloosamikrofibrillien kanssa samansuuntaisesti ja ne sitoutuvat selluloosiin vetysidoksin. emiselluloosien kiinnittyminen häiritsee selluloosamikrofibrillien uloimpien osien konformaatiota keskimääräinen kiteisyys alenee esiaste III Solun laajeneminen alkaa esiaste kehittyminen Mikäli hemiselluloosat eivät kerrostu samanaikaisesti eivätkä häiritse ohuiden selluloosamikrofibrillien kerrostumista, seurauksena on paksumpien selluloosamikrofibrillien muodostuminen. Solu on jakautunut. ympäröi koko solua Solu kasvaa ja saavuttaa lopullisen kokonsa.

Sekundaariseinän Sekundaarisen soluseinän muodostumisvaiheessa säännöllisesti järjestäytyneet päätekompleksit liikkuvat solukalvossa muodostaen selluloosamikrofibrillejä. Näin ollen mikrofibrilleille muodostuu tietyt fibrillikulmat kuituun nähden: S 1 -kerros : n. 90º S 2 -kerros : 0º-15º (mikrofibrillit lähes kuidunsuuntaisesti) S 3 -kerros : 50-90º Toisin kuin sekundaariseinissä, primaariseinässä selluloosamikrofibrillit eivät ole säännöllisesti järjestäytyneitä. n lignifioituminen Ligniinin prekursoreita eli esimuotoja on läsnä jälsikerroksessa. Glukosidaasi-entsyymi vapauttaa näitä ligniinin monomeerejä. n pinnalla oleva peroksidaasientsyymi muuttaa ligniinimonomeerit fenoksiradikaaleiksi. Radikaalit kulkeutuvat soluseinään ja polymeroituvat. Ferulihapot liittyvät hemiselluloosiin ja ne toimivat ligniinin kasvupisteinä. Ferulihapot Ferulihapot ovat läsnä erityisesti pektiinisissä polysakkarideissa. Ferulihapot sitovat soluseinän polysakkarideja (erityisesti arabinoksylaania) ligniiniin ja toisiin polysakkarideihin. Ferulaatti voi kiinnittyä ligniiniin kahdella mekanismilla: passiivinen ja aktiivinen mekanismi, joista aktiivinen on vallitseva binoxylan Me Peroxidase + Lignin Monomers binoxylan Lignin Passive Me, binoxylan Lignin-Ferulate Complex Active Ferulihapot Aktiivinen mekanismi: ferulaatti osallistuu aktiivisesti hapettavaan kiinnitysreaktioon, mikä on tunnusomaista lignifioitumiselle. Tämän seurauksena syntyy useita yhdisteitä. Me Me L L Me Ristisitoutuneita ferulaatin ja guajasyylin alkurakenteita. Me Me Ferulate/Guaiacyl Crossed Dimers Me Me L Me Me Me Me Me

n lignifioituminen - ligniinimonomeerien kulkeutuminen soluseinään Elävä puusolu n lignifioituminen - ligniinin polymeroituminen soluseinässä Elävä puusolu Suurennettu alue Golgin vesikkeli l. rakkula Suurennettu alue Golgin vesikkeli l. rakkula Peroksidaasi Glukosidaasi esiaste Glukosidaasi-entsyymi vapauttaa ligniinin monomeerejä (SY= syringyylialkoholi, GU= guajasyylialkoholi). Ligniinimonomeerit kulkeutuvat soluseinään Golgin rakkuloiden välityksellä FA = ferulihappo Glukosidaasi Välilamelli Peroksidaasi-entsyyli muuttaa ligniinimonomeerit radikaaleiksi ja ligniinin polymeroituminen alkaa. Ferulihappo (FA) sitoo soluseinän polysakkaridit ligniiniin tai muihin polysakkaridiketjuihin. n lignifioituminen Sidosten muodostuminen hiilihydraattien ja oligolignolien välille vapauttaa hiilihydraatteihin kiinnittynyttä kalsiumia ja peroksidaasia. Ligniinin muuttaa hydrofiililisen ligniinihiilihydraattigeelin hydrofobiseksi. Näin ollen kalsium ja peroksidaasi kulkeutuvat veden mukana lignifioituneelta alueelta solun vielä lignifioitumattomiin sisäosiin (eli sekundaariseinä). Veden poistumisen seurauksena ligniini-hiilihydraattigeeli kutistuu. emiselluloosat ovat sitoutuneet vetysidoksin jäykkiin selluloosamikrofibrilleihin, jotka ovat järjestäytyneet kohtisuoraan soluseinän pintaan nähden. Näin ollen ligniini-hiilihydraattigeelin kutistumisen seurauksena sekundaariseinän kutistuminen on suurempaa kohtisuorasti soluseinänpintaa vasten. Ligniinin aromaattiset renkaat järjestäytyvät mielellään samansuuntaisesti soluseinän pintaan nähden tämä saattaa johtua anisotrooppisesta kutistumisesta. Välilamelli n lignifioituminen - veden poistuminen Golgin vesikkeli l. rakkula Peroksidaasi Glukosidaasi Ligniini muuttuu vähitellen hydrofiilisesta geelistä hydrofobiseksi geeliksi. Veden poistuminen johtaa turvonneen ligniini-hiilihydraattigeelin kutistumiseen.

Lignifioituminen etenee soluseinässä Lignifioituminen etenee soluseinässä Lignifioitumisen ensimmäinen vaihe alkaa solujen kulmauksissa ja yhdistetyn välilamellin alueella (välilamelli ja primaarinen soluseinä) pektiinisen aineksen muodostumisen loppuessa ja kun S 1 seinän muodostus on alkanut. Pektiinin syntetaasi-entsyymin aktiivisuus alenee sekundaariseinän paksuuntuessa ja lopulta pektiinin muodostuminen loppuu. Toisaalta sekä ksylaanin että glukomannaanin syntetaasit lisääntyvät nopeasti. Toinen lignifioitumisvaihe on hidas ja sen aikana selluloosamikrofibrillit, mannaani ja ksylaani kerrostuvat S 2 -kerrokseen. Pääosa lignifioitumisesta tapahtuu sen jälkeen, kun S 3 -kerroksen mikrofibrillien on alkanut. Ligniiniä ei koskaan muodostu, jos hiilihydraatteja ei ole läsnä. Soluseinän ligniin rakenne Soluseinän ligniinin molekyylipaino ja hienorakenne riippuvat selluloosamikrofibrilleista ja muista hiilihydraateista, jossa ligniinin polymeroituminen tapahtuu. ligniinin molekyylipaino on suuri ja se muodostaa paksun kerroksen, kun taas sekundaariseinän ligniini muodostaa komplekseja hiilihydraattien kanssa ja tuloksena on ohut kalvo, jota ympäröi selluloosamikrofibrilli. Kokonaisuus muodostaa ns. ristikkäisen kennorakenteen. hut kalvo sisältää 4-7 ligniinimonomeerikerrosta. esiaste Solu on jakautunut PUUSLUN JAKAUTUMINEN alkaa Solu kasvaa ja saavuttaa lopullisen kokonsa. esiaste kehittyminen Sekundaariseinä Lumen Sekundaariseinän ja solun lignifioituminen l. puutuminen. Solu kuolee.

Soluseinän rakentumisen aikataulu Solukulma (CC) Ligniini (L) Vetysidos (*) Selluloosamikrofibrilli (CMF) JÄLSI Soluseinän komponenttien VALMIS SLUSEINÄ Päätekompleksi (TC) Soluseinän kerrosten muodostuminen iilihydraattien Fenolihappojen Ligniinin M, kulmat P S 1 Pektiiniset ainekset S 2 S3 binogalaktaani Ksylaani Mannaani Selluloosa Ferulihapot Ligniini p-kumaryylialkoholi Koniferyylialkoholi Sinapyylialkoholi Aika (Tereshima, N., Formation and ultrastructure of lignified plant cell walls, 7th symposium on Wood and Pulping Chemistry, Beijing, China 25-28 May 1993, vol 1, pp. 24-33) Pektiininen aines emiselluloosat (C) (Tereshima, N., Formation and ultrastructure of lignified plant cell walls, 7th symposium on Wood and Pulping Chemistry, Beijing, China 25-28 May 1993, vol 1, pp. 24-33) FA=ferulihappo,G,S = ligniinin prekursorit P = peroksidaasientsyymi Ca 2+ = kalsiumioni Lignifioituneen soluseinän rakenne Eräs malli lignifioituneen kasvisoluseinän rakenteesta. (Tereshima, N., Formation and ultrastructure of lignified plant cell walls, 7th symposium on Wood and Pulping Chemistry, Beijing, China 25-28 May 1993, vol 1, pp. 24-33)